4H86A

Crystal structure of ahp1 from saccharomyces cerevisiae in reduced form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
GLVPRGSHMASMSDLVNKKFPAGDYKFQYIAISQSDADSESCKMPQTVEWSKLISENKKVIITGAPAAFSPTCTVSHIPGYINYLDELVKEKEVDQVIVVTVDNPFANQAWAKSLGVKDTTHIKFASDPGCAFTKSIGFELAVGDGVYWSGRWAMVVENGIVTYAAKETNPGTDVTVSSVESVLAHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Ahp1 from Saccharomyces cerevisiae in reduced form
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Peroxiredoxin type-2
total genus 57
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4h86A00
3WYWA 3GN3A 2GSSA 2RUEA 3US3A 4TXOB 2DJ3A 1EV9A 3WD6A 2HI7A 2BMXA 4ECBA 2VCTA 4JZQA 1GTIA 2B5YA 2YWOA 3DEXA 3TGZA 4D73B 2WGRA 4I5QA 3KM6A 4NMUA 1VF3A 4G9HA 1OKDA 5LD0A 1RW1A 2PVQA 1GUHA 2GVPA 3HJPA 4ULXA 5AN1A 1JHBA 3DRNA 5D9TA 3IA1A 1ZGNA 3GURA 1MDIA 3RHBA 1OC3A 4MH2A 3UARA 1MDKA 1TOFA 3F9UA 1T1VA 1M0UA 2CAIA 4O7HA 3P90A 2PBJA 2F3MA 2VCQA 4PGTA 2PPTA 3W8SA 4WF4A 3KH9A 1NHOA 2GSRA 5FT3A 1ABAA 2L5OA 3KZQA 5D73A 4BA7A 4WR5A 2YCDA 5ECNB 2H70A 4XTSA 4O32A 1R26A 1JZDA 3RPPA 1FW1A 4IP1A 3RHCA 3P8WA 4PX1A 3IOSA 4LMVA 1TW9A 1XWKA 4IBPA 1DE2A 4MF5A 2MMAA 2P0GA 2OE1A 2JZRA 2HFDA 3TB2A 1SL1B 1XOBA 2HRNA 4HZ4A 5H5RA 1PD21 1YJ6A 3LORA 1THXA 1R5AA 3IAM2 2DC5A 2MZCA 2PGTA 4ECCA 2H1BA 1Q4JA 2AYTA 4GSSA 4ZB8A 4O92A 3D6IA 2PERA 4V1Ap 4OO4A 2B3SA 2V32A 3VFIA 2YANA 5ECHB 5ELGA 4MCUA 3TKSA 3Q19A 5DALA 2HE3A 5D93A 3GL3A 2JACA 2YWMA 3F4SA 4GQFA 5IMVA 2LRTA 2B7KA 2LJKA 2LJAA 2K8SA 2FNOA 5ECKB 3EMXA 5DVBA 2GZZA 4O5RA 4PUFC 4CW9A 2HSHA 4XS6A 2IMKA 5C04A 2FCHA 3LXTA 2F51A 1V98A 2VUPA 3UMAA 5KN1A 5KN3A 3EVIA 1YF1A 3TOUA 3N5OA 1HQOA 3GTUB 3D5JA 2H8LA 5JCGA 3C73A 1PX6A 1PL1A 1UVZA 2GZYA 5ECRB 4IELA 3P7XA 3GRXA 1M9BA 2O87A 4KB3A 4Q5RA 2E2MA 1GNWA 3RPNA 2CA8A 3ZFBA 2WFCA 2EIQA 4WKWA 5IO0A 3KP8A 4K7NA 3F63A 1GSDA 1GTUA 3FZ9A 3WGXA 3O3TA 1GH2A 1T00A 2H1GA 5H5QA 1SJZA 4LLRA 1KNGA 3SWLA 2R6KA 1J9BA 4HUAA 3KP9A 1U88A 5D9XA 2WCIA 2GSTA 1XWAA 1A2LA 4K0NA 4PQHA 4IJ3A 3M1GA 1X5CA 1WP0A 5IQYA 3F6DA 3LJRA 1M7TA 4YQMA 4KGIA 1ZYEA 2LV3A 11GSA 3QAGA 5IMAA 3KJYA 5G1KA 2LUSA 1A8LA 3MDKA 5IOXA 1VF4A 5AIXA 1EP8A 3DD3A 4AGSA 4EL1A 3APQA 2D2ZA 1DSBA 5D8IA 2NDOA 2FGXA 2OE3A 2GQMA 5COHA 2DBCA 5J5NA 1RQMA 1R7HA 4OMVA 3QD9A 3HVSA 3SBCA 12GSA 1I5GA 1SD9A 1YDKA 1XVQA 4ZBAA 2X8CA 4IW9A 2OBKA 5A4VA 3APSA 2RUFA 4IVFA 1PKWA 1K0CA 1OKTA 2HZEB 1QUWA 4ML1A 2PUKC 2DJ0A 3L0HA 4WF5A 3TRPA 2I4AA 1K3LA 5DAKA 4EUYA 3G7JA 4Z7XA 5IOWA 1AQVA 4MF7A 1S3CA 1QQ2A 2MMNA 4XIHA 1OC9A 3ED3A 1B4QA 1VRSD 1E6BA 2LNSA 3ZLPA 3APOA 1MDJA 2WRTA 4N11A 2AAWA 3M9JA 1FO5A 1CQHA 1NHYA 3TKSC 3LQ7A 2P5QA 3VI5A 5ECIB 1B8XA 4IHUA 4EXJA 2CVDA 3U5RE 1GNEA 3GUSA 3KMOA 3IK7A 4K9ZA 3EURA 3ZYWA 5KN2A 4GRFA 1GTAA 3VI7A 4EC0A 2N5FA 4TOPA 2WZ9A 1SENA 3ZMKA 1G7OA 5ECOB 2H1DA 5HFGA 1EEMA 4L5OA 3LWAA 2WULA 5IPHA 1SJIA 2YP6A 4IQAA 4IS0A 1M2BA 3LYKA 2B5XA 2L4CA 1FB0A 1A0RP 1MD4A 4HOJA 3DYRA 3BD2A 4X43A 1F3AA 2GS3A 3O76A 2J23A 2C3QA 1K0OA 3CMIA 4ZB6A 5J9CA 3IPZA 3D0ZA 1CQGA 3PINA 4ECJA 1QFNA 1T4YA 3GH6A 4OWYA 4DSSA 1TP9A 2XBQA 3GIXA 5DQYA 4K7OA 1BEDA 2N5AA 4MZCA 4K7IA 1EGOA 4H86A 2X8GA 1PMTA 1XFLA 1TRSA 3CRUA 4K8MA 4NHZA 4QQ7A 5LCZA 3EE2A 2P31A 4WBRD 1XW5A 2VL3A 3PR8A 3E3EA 3KD0A 3UVHA 2HYXA 3VPTA 4CHSA 3S9FA 4LL4B 2K9FA 2HSYA 1GRXA 2B1LA 3IAS2 5GAND 3GNJA 3C71A 4PQ1A 3K8NA 2CQ9A 4V2LA 1GSUA 1FVJA 4GSNA 1UC7A 19GSA 5KN0A 3ZIVA 5CRHA 1TKDB 3BJ5A 2LEGA 3ERFA 1BQ7A 4N10A 2VOCA 3UAPA 3F6FA 4L5LA 4F2IA 3DKSA 3FY7A 1HD2A 1WRYA 5A4WA 5G1LA 3L4NA 5E59A 2H0IA 1X5DA 3TCOA 2PVOC 1PSQA 4KE3A 3TJKA 3DIEA 3LXZA 1VF1A 3IDVA 1FAAA 2AB6A 1M9AA 4KDYA 3J7Yk 1Z7RA 1YKCA 2EC4A 3EU4A 7GSSA 5J41A 1EOGA 1TRUA 2ZUPA 1PRXA 1ST9A 1SYXA 1BX9A 5HFIA 3KTLA 4ZL7A 1X5EA 2CT6A 3UVTA 3QAVA 2CZ2A 5ABRA 3FRCA 3CTGA 20GSA 3L9UA 3HY2A 1FOVA 4IN0A 3H1NA 17GSA 2ZCTA 5F06A 1XBSA 1A2MA 1SK2A 1PKZA 4KNDA 4ZL9A 3TKRA 1VF2A 3FZ5A 3TJFA 5HFKA 3MNGA 4KH7A 1EV4A 4MJAA 2NTOA 3V1WA 1ZL9A 4IGJA 2MBSA 2HT9A 5GZZB 4ISDA 2LQOA 3EU3A 1ZZYA 1TRVA 4ILFA 4GF0A 3HXSA 5F07A 1GTBA 2IJYA 2VIMA 5H5SA 2V6OA 1Z5YE 4QL9A 1LBKA 1YEXA 5EPFA 4HQZA 6GSXA 4FO5A 3U6VA 2BTOT 3CYNA 4BVXA 3GFKA 1U6TA 4ZL8A 3HJOA 1XWBA 2FWGA 2V6KA 2LS5A 2H76A 4Q5NA 2O7KA 2HRFA 2R3XA 3IR4A 1GL8A 2FWFA 4JEDA 5C00A 1I9DA 4I6XA 1V58A 1Y6EA 3FW2A 2YOIA 3J7Yb 1UA5A 1GULA 5HQPA 3VK9A 2H72A 2LJRA 3L78A 4GTUA 10GSA 1DBYA 1GSSA 3GX0A 6GSWA 3CBUA 3ZMLA 3E0UA 4KA0A 4L0WA 4KSMA 2KLXA 1Q98A 2EIOA 2YNXA 4Q5QA 2C3NA 3HZ4A 5J3RA 1U87A 1XPVA 2WB9A 4F0CA 2NPBA 4XS4B 5IMDA 3KIJA 3IE3A 2DJKA 3CSHA 4G2EA 2Z9SA 4OFTA 1WIKA 2P5RA 1WMJA 4WR4A 3G7YA 4JBBA 3M9KA 4JR6A 4OO5A 5ID2A 4G10A 4EKZA 3GL5A 5CNWA 1G6YA 1GUKA 3KGKA 2OE0A 2X64A 3WT2A 2FD3A 3L9VA 4TVEA 3MSZA 4MPFA 2JSZA 2CAQA 4MDCA 3ME8A 4KCAA 1HNCA 3WT1A 2H75A 3KXOA 4TN8A 4WETA 3NOFA 2DIYA 3TRXA 3ZITA 5F05A 1EWXA 2HZFA 5EVOA 3UBLA 4FYBA 3GKXA 4TXVA 3IXRA 1SK1A 2LTKA 4BWSA 5ELAA 2H66A 1M99A 4POMA 2F8AA 5IMCA 4PNFA 1TK8B 1EP7A 3QDNA 4YAPA 1W4VA 1A2JA 4XHMA 4OFMA 2FA8A 4TR3A 8GSSA 2IMIA 5IMZA 4J2FA 1GSFA 4K2DA 3UBKA 4N30A 1T3BA 3FR6A 1BYEA 4J56E 2AV4A 4EDZA 4GSTA 1U3IA 2CX3A 2YV9A 4MZBA 1NM3A 3HHVA 2HLSA 4HI7A 1MD3A 2KOKA 1J08A 1XZOA 1AQWA 5CREA 4MJBA 2H6ZA 3CTFA 1GSQA 5DALB 2VAFA 3I43A 5GSTA 4LA1A 1TTZA 4TKYA 3EWLA 5AIVA 3ZL5A 2A4VA 5G2ZA 2FUG2 2RLIA 4G19A 1K0AA 5AGYA 2F8FA 2IFQA 1Z6MA 3IV4A 4MA9A 1H4OA 3NIVA 3D4MA 2H0HA 1Y25A 3TDGA 2XHFA 1W89A 2OBIA 3ZZXA 2E0QA 1PN9A 3W6GA 4ZBDA 4XRDA 2VLTA 3GHAA 1GSEA 1O73A 2VM2A 5DJMA 1K3OA 3VWUA 1O8XA 3FK8A 3HZ8A 1K0BA 2G2QA 5ECQB 1QMVA 1BAYA 2G0FA 3VWWA 4EE0A 5INYA 3TKSE 1LJRA 5GSSA 2O8VB 4N0VA 1SKRB 2H74A 3EC3A 4IQ1A 1AUCA 4KDXA 1ON4A 5JWQB 3UL3A 4BWQA 3QMXA 4MMMA 3FHKA 2FHEA 3FEUA 4K0GA 3H8QA 4P3YB 2GGTA 1AQXA 5A5KA 3Q6OA 4WXTA 3FZAA 3GKKA 5D9WA 3ZRDA 1SK0A 3PGTA 2VD1A 3TJGA 4L8EA 5J9BA 1DE1A 5G5EA 1YZXA 3MWHA 5D96A 1M2AA 2GTUA 4KSOA 2K18A 1IYIA 3BOAA 2R2JA 3M8NA 2BJXA 4QL7A 3GSSA 4FIWA 4OD7A 4FYUA 13GSA 1M2DA 5EL8A 1MTCA 3R2QA 2LRCA 2VM1A 2B6MA 4KW6A 1QK8A 1EOHA 4AF2A 3F8UA 2MMOA 4TR1A 2CV4A 2C0FA 5HR2A 1KEBA 1SD8A 4MPGA 5DCHA 2GT6A 4HU9A 4RI7A 5CRGA 3TUEA 4TXOA 5DQSA 1WJKA 4F9ZA 2CVKA 2FWEA 3QCPA 4TR4A 4JU5A 4DSQA 1V57A 2PMTA 5DAKB 2YJ7A 5ECLB 4EF0A 3ZIJA 1PGTA 2GLRA 3VURA 4D73A 5DCGA 4KX4A 2H1AA 3UIWA 4MABA 1B4PA 4TW5A 1OC9B 4ID0A 1EEJA 4YH2A 2JZSA 4X0XA 1YY7A 2V41A 1NW2A 2DJJA 3PH9A 3CXGA 1LU4A 3HCZA 3ZFLA 3QFBC 1SL0B 5LNKe 1K0MA 1XWGA 1GLPA 2DJ2A 2PN8A 2QKEA 2C0GA 5HR1A 1R4WA 2IMFA 3GV1A 4MF6A 3JCML 2DMLA 2IMDA 3TJBA 1K0DA 2WJUA 2B5EA 1S3AA 3KMNA 2XPEA 4ML6A 1ZMAA 4RQXA 1N2AA 1O8WA 5G31A 2VL2A 2TIRA 4V1Ag 3CSJA 2ES7A 4HDEA 3M0FA 2TRCP 5FHIA 1JLWA 2YJHA 3F0IA 1ERWA 5HR0A 2YWNA 4NAXA 2AUVA 3UOMA 5CP1A 3FR9A 1K0NA 3HKRA 3I9V2 1JLVA 1PL2A 2CVBA 1IYHA 4NWYA 5L71A 2JSYA 2VCZA 3C7MA 1TDIA 5DBQA 2GT5A 5ECSA 1F2EA 2H01A 1KTEA 4N0ZA 4I97A 2L59A 5F8BA 1SL2B 2IL3A 3N9JA 3IBHA 3Q18A 1XW6A 1GSYA 5J4UA 4POBA 1AC1A 3VWVA 4GQCA 4NV2A 1TXXA 22GSA 3ZTLA 2PWJA 2C0EA 4MJCA 4OFNA 2L5LA 4DEJA 1XWCA 3CRTA 1S3DA 5IMFA 4DSSB 4OCFA 4GCIA 3IHQA 3UJ1A 4JRRA 4NXIA 2V1MA 1FG4A 3RBTA 2XPDA 3Q74A 3RAZA 4HQSA 3E9JB 1THOA 2FY6A 3H79A 2QGVA 2EIRA 4HJ2A 4LL1B 3LSZA 4PNGA 3HVXA 1O6JA 4ZBBA 4IJIA 4OCEA 4MH3A 3VWXA 2CX4A 5GAPD 2OA7A 2C4JA 4EDYA 1VGLA 2R4VA 3GKMA 3GTUA 5JCUA 1OYJA 3TRQA 3IK9A 2REMA 1AIUA 3A2VA 4HU7A 2OJLA 4MP4A 2YPMA 2FLSA 4HZ2A 1WE0A 2H6XA 3TOTA 2LQQA 3C1RA 5B8AA 2NVLA 3A3TA 1SU9A 3D4TA 1A0FA 2O89A 5E4WA 1TK0B 3QOUA 1B9YC 2KP1A 1MEKA 2WDUA 1JZOA 3KEBA 5ECPB 5IM9A 6GSTA 1Z7PA 3NZNA 3C1SA 1NSWA 4LMWA 1A24A 1FVKA 4WBJA 3TKQA 2J9HA 2KP2A 1DUGA 4TRXA 3CSIA 3QAWA 2XC2A 4HEA2 4Q5FA 4HJMA 5B6MA 2IN3A 1BJXA 2ON5A 3TJJA 1XOAA 1ERUA 2LRNA 4ZIJA 2KUCA 5ECMB 3G9BA 4I2UA 14GSA 5EY6A 4PUAA 3A2XA 1V40A 1XCCA 1EZKA 4RI6A 4I8BA 3A5WA 2VLUA 2H30A 3F3QA 4RUVA 4ECIA 2RM6A 1X9MB 3ZREA 3A2WA 2OKAA 4BPYA 3D21A 3G7IA 3I6AA 2VL2C 2MYGA 3AY8A 1PQNA 3GSTA 3IC4A 2HZEA 2I9HA 1PX7A 2QC7A 2VCVA 4JE1A 1GUMA 3EYTA 2L57A 1AW9A 1F37A 2M72A 4MZWA 1TU8A 1U3AA 3UEMA 3IRAA 16GSA 4HS1A 2YWIA 2KHPA 3EMPA 3QPMA 1QGVA 4NHWA 1RK4A 2C80A 2LNTA 1H75A 1G6WA 3RDWA 2I81A 3HVVA 5DDLA 2QSIA 3LEFA 4GWRA 2H71A 2DIZA 1ZCPA 3DVWA 1JFUA 2B1KA 5CRDA 3OR5A 2DJ1A 1A23A 1JZWA 1FHEA 3GA4A 1JZRA 3FYGA 2HXKA 3HYPA 2JU5A 3ME7A 3LG6A 1URMA 2A2SA 4POLA 1X0RA 3M3MA 2NBSA 2DSAA 1WOUA 4YQUA 3C8EA 1KBNA 5AISA 3FKFA 2HNLA 1ZOFA 2YZUA 2DMMA 3FR3A 3HDCA 1YF0A 2VCWA 4JR4A 1AXDA 1F9MA 4I2TA 2LSTA 3P2AA 2VCXA 4RQRA 5F0GA 2ALBA 1T7PB 3KCMA 1OE7A 1GWCA 4POKA 2IIYA 4BVYA 3TKPA 3ERWA 4DVCA 3HA9A 2R5GA 4MJEA 2ZNMA 4ZILA 2WS2A 3DMLA 4PQIA 3KH7A 5ID2B 4ACSA 1F3BA 3BCIA 3LYPA 1XXUA 3BCKA 4ZB9A 5A4UA 4ZXGA 2I3YA 3F4TA 3DVXA 1XIYA 3W8JA 4K6XA 3GYKA 3ZVJA 2JZTA 1V9WA 1USBA 1J0FA 2AHEA 1N8JA 2X99A 1TI1A 4KCEA 5JWRB 3GH9A 3ISOA 1O81A 5HR3A 1TRWA 4X1UA 5D9VA 2A2RA 1SKSB 5B6NA 1ERTA 1EGRA 18GSA 4KDUA 4NPBA 2TRXA 3BBYA 4E8EA 2C8UA 1TI3A 3WGDA 1SJ6A 3FZ4A 2RM5A 2O85A 1YKAA 3EINA 4XS1A 5B7CA 1B48A 1ACVA 3O6TA 4V2MA 1OVNA 1T4ZA 1WPIA 4GLTA 4DSRA 2MMZA 4EO3A 4F0BA 1YQ1A 3D22A 2M80A 5IO2A 3DGQA 5FWGA 1X9SB 1GLQA 2JADA 3H4KA 4YAVA 2FWHA 1ILOA 1G0TA 3L9SA 3HJMA 3GMFA 4KAEA 3GKNA 2VO4A 2V2GA 2YV7A 2ON7A 5B8BA 2N5BA 3QFAC 1WWJA 5IIZA 2K6VA 2L4QA 5CO3A 3HD5A 2OACA 2VD0A 3MAKA 1OC8A 2E2GA 3LGCA 1SKWB 1SYRA 1XW9A 2DLXA 4AJ8A 4MLYA 5IPGA 1AAZA 5KEJA 2C3TA 2IFQB 3QR6A 5DJLA 6GSYA 2GQLA 2E7PA 2GSQA 1O85A 3ZVJD 1ZYQB 1XVWA 2L6CA 2GDRA 4AJ7A 2VL9A 4K1FA 1UN2A 3I69A 1G7EA 9GSSA 4J57E 1HNAA 4TR0A 5ENUA 1Z6NA 2GZPA 1HNBA 1ML6A 1O7UA 1R5PA 1B9XC 2H6YA 1Z9HA 5JWOB 2B7JA 2MBTA 4FYCA 1GP1A 2LKUA 4WEYA 2RIIA 2PU9C 4XCSA 4F82A 1X9WB 4F03A 6GSSA 2H19A 2H73A 3GX8A 2L6DA 4IKHA 2K8VA 3KTBA 2FA4A 2GQKA 4EVMA 3ERGA 4GXZA 4NV5A 2VLVA 3WGEA 4KUNA 1Z3EA 3DXBA 5CAXA 1TU7A 2YZHA 5G30A 3H93A 1YEPA 4IP6A 1T8EB 3F4RA 2X8HA 1ERVA 3F3RA 1F6MC 1TK5B 2JL4A 1V2AA 1OAZA 4V2NA 1C72A 1TJDA 4CDOA 3VPQA 3VLNA 2CZ3A 2XBIA 1BG5A 2F9SA 1OE8A 5JCWA 5CRWA 4XRAA 4L0UA 2H0GA 2C0DA 6GSVA 3DWVA 4FH8A 6GSUA 2I1UA 2OADA 4E8HA 2IWTA 1QXHA 2IPAA 2R37A 2C1YA 4AJ6A 1PA3A 1FB6A 3LFLA 2IMEA 2AJQB 5CYYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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