4H86A

Crystal structure of ahp1 from saccharomyces cerevisiae in reduced form
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
GLVPRGSHMASMSDLVNKKFPAGDYKFQYIAISQSDADSESCKMPQTVEWSKLISENKKVIITGAPAAFSPTCTVSHIPGYINYLDELVKEKEVDQVIVVTVDNPFANQAWAKSLGVKDTTHIKFASDPGCAFTKSIGFELAVGDGVYWSGRWAMVVENGIVTYAAKETNPGTDVTVSSVESVLAHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin type-2
publication title Crystal structure of Ahp1 from Saccharomyces cerevisiae in reduced form
rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 57
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4h86A00
2IN3A 1BQ7A 4ML6A 2TIRA 2GGTA 1XFLA 3GSTA 2R5GA 3FKFA 1OC9A 1AAZA 1DUGA 5DVBA 1X5CA 1MDJA 4WBRD 4O92A 3TKSA 5E59A 2MBSA 1ZYQB 1TJDA 3D5JA 1XWGA 1DE1A 4MJCA 3LEFA 4XRDA 4WKWA 2OE1A 3KH9A 4OO5A 5G31A 2V6KA 2HE3A 3IHQA 2FWHA 1N2AA 4FIWA 5J41A 1K0MA 2N5AA 1FOVA 1TKDB 1EP8A 1YF0A 3FK8A 1JZOA 6GSSA 1A2MA 2F51A 4TN8A 2GSRA 2C3NA 5B6NA 3A5WA 4IN0A 4CHSA 3VLNA 4NV5A 2WJUA 4TXVA 4KW6A 2GZYA 2MMOA 1VF1A 1KTEA 2PMTA 1EEMA 3WT2A 3DMLA 3IBHA 3DYRA 2PUKC 3ME8A 1UC7A 1TTZA 2GSQA 3KJYA 5IMDA 1B4QA 3ERFA 3TKPA 4MJBA 2LRTA 1Z5YE 1XOAA 4IELA 4MP4A 3F0IA 2C8UA 1XPVA 3QR6A 2LJRA 3A2XA 2N5FA 3GUSA 3C7MA 2GLRA 5ELAA 1SK1A 6GSVA 3GKMA 3IA1A 2CAIA 4ZBAA 2NDOA 4E8EA 1SD8A 3CSJA 1BEDA 4TR3A 1EOHA 3IDVA 3M0FA 1FVKA 1I5GA 5DJMA 4ZBDA 5GAPD 3HZ4A 1NW2A 5ECPB 1O6JA 3Q18A 4NXIA 3LYKA 1WP0A 4LL1B 1OKTA 4GF0A 1GSFA 1F9MA 3HJPA 2HT9A 2JSZA 3N5OA 6GSWA 3VK9A 5IOXA 1OE7A 1ERUA 2L4QA 4TR0A 2MYGA 5AN1A 4EDYA 3TKQA 1PRXA 3IE3A 4ZB8A 4ACSA 1EOGA 5LD0A 4ZILA 3ZMKA 4NV2A 3GX8A 3H8QA 3WGEA 1A0RP 1TRSA 1HNAA 2KP2A 1GRXA 4XS1A 3D6IA 1OC9B 3NZNA 3L9VA 2YNXA 1GNWA 1THXA 5ID2B 3LWAA 3MNGA 1OYJA 3U5RE 3US3A 1FO5A 1A2LA 3F63A 1K0NA 3O3TA 4RQRA 1TP9A 4KSMA 2YV7A 1YY7A 1NHOA 2IWTA 16GSA 1QK8A 4HQZA 3WT1A 3C71A 4L0WA 2GQMA 4Q5NA 2VCQA 1V9WA 3GRXA 5ECNB 4POBA 3HD5A 4BVXA 1EEJA 4JU5A 4RUVA 2FUG2 2ZUPA 9GSSA 2A4VA 3PGTA 5KN3A 4RI7A 3BOAA 5F07A 4MF5A 1TXXA 2H0GA 1GSDA 3BCIA 4LMWA 1WMJA 2DJ0A 3R2QA 4NWYA 2YV9A 2J23A 3HZ8A 2H71A 3CSHA 5D9XA 1MD3A 2I1UA 3I6AA 3IRAA 4K7IA 2E7PA 2K9FA 3CTFA 2NBSA 1VF3A 2FWGA 3F4RA 3TRPA 2H8LA 1YJ6A 2FA4A 14GSA 3KCMA 2VCVA 4ECJA 4XIHA 3TUEA 2HNLA 2YANA 2X99A 1PX7A 4BWQA 2HI7A 1ZCPA 2RM6A 3HHVA 4E8HA 1M99A 2BTOT 2WGRA 3A2WA 4N0ZA 4NHZA 4X43A 1YKAA 1T1VA 5GAND 3JCML 3VURA 4TR1B 1GLPA 2DJ1A 3MDKA 1X9WB 3ISOA 1FHEA 3KM6A 2O89A 3ZREA 3O6TA 1F37A 5DCHA 1SKWB 4G10A 3TCOA 4KH7A 1GL8A 4X1UA 3TJBA 2LJAA 4KGIA 3L78A 1YEXA 1HD2A 2LNTA 5G5EA 1KBNA 5CRHA 3LSZA 3PH9A 4HJMA 3HDCA 2A2RA 1XCCA 2DJJA 3SWLA 20GSA 5JWQB 1QQ2A 2RUFA 2WRTA 1K0AA 2L6DA 5A5KA 3QMXA 2HZEA 2VCZA 3GTUB 4DSSA 2OBKA 3GIXA 1T4YA 3UBLA 1OC8A 4WF5A 4I5QA 1O81A 1PX6A 5CRDA 2BMXA 4GRFA 1A8YA 22GSA 1OE8A 4I97A 1OAZA 2VCXA 3HKRA 4LMVA 2NPBA 4L0UA 5DBQA 2C3TA 3LXZA 4YH2A 1ACVA 3J7Yb 1M9AA 1TRUA 4Q5FA 2R4VA 4RI6A 2H6YA 1ZL9A 1ZOFA 3L9UA 4PNFA 3F6FA 4MMMA 1V2AA 4LLRA 3AY8A 4F2IA 3GA4A 1TU8A 3KEBA 2VLTA 5CYYA 5D96A 3VPQA 3P7XA 1SL1B 5E4WA 1TW9A 4NHWA 5B6MA 4BVYA 3IOSA 2HRNA 5JWOB 5B8AA 2R37A 3UEMA 2EC4A 3H93A 2AAWA 3EINA 1Y25A 2H1DA 2H73A 4K7OA 4N30A 2P5QA 2GDRA 1MD4A 3ZFBA 5IMVA 1R7HA 3DVXA 2L59A 2LV3A 1XWKA 3LFLA 3F8UA 2C0GA 1JFUA 2REMA 5ECRB 3TKSC 1O8WA 3TJKA 3G7IA 3PINA 1LJRA 1TRVA 4H86A 4NPBA 5HQPA 3M9JA 3KXOA 3P8WA 2H01A 4JRRA 4J56E 2IMDA 3TRQA 3GH9A 2PBJA 1DSBA 2DMMA 4F0CA 2K8SA 2NTOA 2EIRA 2IMIA 4K1FA 1X9MB 1PA3A 4ECBA 2VLVA 1T3BA 1GSSA 2CAQA 4ECCA 2GSTA 4K0NA 3H79A 4DSRA 4AJ7A 2C0DA 5HR1A 2I4AA 1YEPA 2IFQA 4IQAA 4EC0A 2DC5A 2G2QA 3EE2A 4DVCA 3LYPA 3DRNA 2E2MA 1OVNA 1DE2A 2RIIA 2HXKA 3P90A 3DWVA 4IVFA 1FG4A 3UIWA 2LEGA 3QAGA 1K3YA 1IYHA 2LNSA 2ES7A 4PUFC 4TW5A 2PVOC 1AW9A 3TDGA 3F4TA 3GNJA 2AHEA 3ZTLA 1PKWA 3QPMA 4WEYA 1SYRA 1NHYA 3VI7A 2V6OA 2H0HA 3RPNA 4KUNA 3FW2A 4EDZA 3FR3A 3RBTA 5JWRB 1GUKA 1XWBA 4HUAA 3APQA 3HJOA 5J4UA 4O5RA 12GSA 4XRAA 2O87A 5HFKA 5ECHB 1WIKA 2E0QA 5CAXA 3QFBC 3ERGA 3UARA 1X5DA 4MH3A 2E2GA 3APOA 1O8XA 1M2AA 1V58A 3D21A 6GSUA 4O7HA 2I81A 2XBIA 3RAZA 1Z6MA 1ON4A 1FAAA 2HLSA 1ILOA 3ZVJD 2OA7A 4ID0A 4WR4A 4D73A 5F05A 3HVVA 5KN1A 1O85A 2KP1A 2VL9A 4IQ1A 4KSOA 4K6XA 1QFNA 2QGVA 5AIXA 1ZMAA 5L71A 4EL1A 4FYCA 2HYXA 6GSYA 1UVZA 5FT3A 2K18A 2WZ9A 5CRGA 4EVMA 4L5OA 3QCPA 3DVWA 2V2GA 1ZZYA 4XS6A 2OJLA 2JACA 2DJ3A 5DJLA 4ZB6A 5DDLA 4V2NA 19GSA 2C3QA 3CYNA 5IIZA 5GSSA 2HZFA 3VWXA 4NAXA 1MTCA 4XS4B 1R4WA 1KNGA 4X0XA 2YWMA 3KZQA 2VUPA 4POKA 1JHBA 2KOKA 3IK9A 6GSXA 5KEJA 2YCDA 3IC4A 1T4ZA 5ECMB 2KLXA 1ZGNA 2GT5A 2CZ2A 4KDYA 5FHIA 1JZDA 1PL1A 1SU9A 2XBQA 3GKNA 3H4KA 2FHEA 1WPIA 1YF1A 2L4CA 3V1WA 1MDKA 1A8LA 4G2EA 4MCUA 3ZLPA 3ED3A 1JZWA 4HOJA 2OE0A 1GSEA 3FRCA 2DSAA 1K3OA 3I9V2 1VGLA 3VFIA 3HCZA 4KNDA 1EV9A 1YZXA 2AJQB 2V1MA 5DQYA 5IO0A 2GTUA 3UVTA 5G5FA 1WWJA 4WR5A 4YQVA 2IMKA 1W4VA 2VLUA 2F9SA 1X0RA 2YWIA 3LXTA 3KP9A 2DLXA 2WULA 5IMFA 1PD21 2P31A 4HEA2 2G0FA 3W8JA 1AXDA 2C1YA 4GSTA 4Q5QA 4Z7XA 10GSA 3TKSE 5GSTA 1PQNA 2HRFA 4N0VA 1AUCA 1Z6NA 2R3XA 3GX0A 4HZ4A 3DIEA 5FWGA 1SJIA 1X5EA 3VWWA 2H70A 2HSYA 2RUEA 2FNOA 3F3QA 1R5PA 1XIYA 1WRYA 4OMVA 4ML1A 5AGYA 3KIJA 2TRXA 1TU7A 4GSSA 5EPFA 3QFAC 4N11A 1THOA 3C73A 1AQWA 3ZFLA 2QC7A 4MJEA 3A3TA 3RHCA 3Q19A 1M7TA 2K6VA 3VWUA 3TOTA 3MWHA 1TK5B 1M2BA 1HNCA 3L0HA 1F3BA 2OKAA 3FYGA 2MMNA 5DAKA 1SKRB 4HQSA 4ZL7A 3UOMA 1SJ6A 5A4VA 1K0OA 1PKZA 4ILFA 2OACA 4P3YB 2F8AA 4HI7A 3DD3A 3N9JA 4ULXA 4JR6A 5IPHA 3KD0A 2YWNA 4IW9A 3F4SA 2L5OA 1RW1A 1SL0B 4IP1A 3CSIA 4GWRA 3C1SA 3ZYWA 1B9XC 5D8IA 3EURA 2IJYA 3UJ1A 4TXOA 1F3AA 4N10A 3ZRDA 3FEUA 3SBCA 4HU9A 3FHKA 3CXGA 3BD2A 2OBIA 3M1GA 5HR2A 5F8BA 1EWXA 2JU5A 4FH8A 4BWSA 2CVBA 2KHPA 2DJKA 3HY2A 2LQOA 2YN1A 4GTUA 2ZNMA 3K8NA 2K8VA 1WJKA 4PQHA 5DQSA 5EL8A 2B1LA 1G0TA 3CMIA 1FW1A 2X8GA 4AJ6A 1J08A 1U87A 2JSYA 1PL2A 4IGJA 4PURA 4LL4B 4FO5A 1BAYA 1T00A 3WGXA 4ZIJA 1OKDA 3QAVA 2DJ2A 2LTKA 1ZYEA 3M3MA 2IMFA 5ECIB 1RQMA 4AJ8A 1H75A 4TKYA 4XCSA 5G1KA 3DEXA 4I8BA 2QSIA 2Z9SA 4XTSA 4WF4A 3BCKA 1AQXA 2R6KA 3GYKA 4GCIA 2YJ7A 3CTGA 1U6TA 3GHAA 3TJFA 2AYTA 2H76A 1UN2A 5J3RA 1Z7RA 1U3IA 1Y6EA 5IQYA 2BJXA 4HS1A 4KE3A 3W6GA 3GURA 3M8NA 4JZQA 2NVLA 4POMA 4V1Ap 3TKRA 2LQQA 11GSA 4OCFA 2VL2C 1A0FA 4MLYA 2GZPA 4WBJA 3WYWA 3QDNA 5B7CA 1B48A 3J7Yk 2H19A 1Q4JA 3DKSA 1T8EB 2C0EA 1B9YC 2CT6A 18GSA 1GSYA 2H30A 4KB3A 2F8FA 2CVKA 4POLA 1QMVA 2GS3A 3HYPA 4Q5RA 1TK0B 4NMUA 1M2DA 2B6MA 3ZIVA 3GSSA 4OFNA 3UL3A 2D2ZA 2XC2A 5HFIA 3IV4A 5ECOB 4MABA 4IBPA 4MF7A 2C0FA 5ELGA 3TB2A 2VCWA 1UA5A 3CRUA 4PQ1A 3IXRA 1Z9HA 5ECKB 2VO4A 1ABAA 4YQUA 4AF2A 4K0GA 4KCEA 1PGTA 2ZCTA 5H5QA 2FWEA 1NSWA 2VM2A 2H66A 1EGRA 5J9CA 5G1LA 5CRWA 2L5LA 1X9SB 1W89A 3HXSA 1PSQA 3ZIJA 4TXOB 4EXJA 4WETA 2B5XA 2PPTA 4TRXA 4JEDA 1G7EA 4OFTA 2V41A 3I69A 3O76A 4K8MA 1GLQA 5A4UA 3RHBA 4MZBA 1EV4A 1K0BA 3G7YA 3EMPA 1H4OA 2RLIA 4V1Ag 1M9BA 4F82A 1JLWA 2HZEB 3KH7A 4K7NA 3GN3A 4QQ7A 1TRWA 4DSSB 4MDCA 1BJXA 2ON7A 1GTIA 1ERTA 1SYXA 3GFKA 4MZWA 2WDUA 3F6DA 3TRXA 2H1AA 1K0DA 2LSTA 1M0UA 4HDEA 2CQ9A 1Q98A 4QL7A 1WE0A 5IMZA 3UVHA 4I2TA 4ZL8A 3WD6A 3G9BA 5AIVA 2AV4A 5ID2A 2WB9A 1A2JA 2H75A 1B4PA 4HZ2A 3KTLA 2M72A 4BL7A 2CVDA 13GSA 1AC1A 5J5NA 2VM1A 1Z7PA 2O7KA 3LG6A 3GKKA 3C1RA 5F0GA 4V2MA 4PGTA 3BJ5A 2B3SA 1LU4A 4ZL9A 1BYEA 1QXHA 2H6ZA 2B5YA 3CBUA 4LA1A 3FR6A 3D4TA 4OFMA 1GNEA 1JZRA 2XPDA 1G7OA 3Q74A 2FGXA 1R5AA 2H1BA 1TDIA 2JADA 2VL3A 3ZITA 2CA8A 4PX1A 1OC3A 1K3LA 2LKUA 3ERWA 2CZ3A 2DBCA 3D0ZA 3IR4A 4MA9A 1GTBA 1B8XA 4FYBA 5IM9A 1SD9A 4GXZA 5IOWA 2MZCA 4I6XA 3H1NA 4EE0A 1TK8B 4J2FA 2H6XA 3HVSA 5JCUA 4HU7A 2XHFA 4KX4A 2LUSA 2L6CA 4OO4A 3D4MA 2LJKA 3C8EA 1K0CA 1GP1A 2GQKA 1V40A 1XW5A 3LJRA 1EGOA 1E6BA 1FVJA 3TJGA 2GZZA 4MPFA 2XPEA 1CQGA 2AB6A 2FD3A 4G19A 4HJ2A 1VRSD 4I2UA 1AQVA 1GWCA 5KN0A 1XXUA 2P5RA 2VD0A 4IP6A 4TOPA 4TR1A 4BPYA 1C72A 1F2EA 2GSSA 4F9ZA 5CNWA 2CV4A 3OR5A 2H0IA 1MEKA 2YJHA 4PQIA 1T7PB 2YOIA 4MPGA 5G30A 5J9BA 2IFQB 2MBTA 1SL2B 1EZKA 4IJIA 2LS5A 3KMOA 3EU4A 4K9ZA 2QKEA 2CX4A 2ALBA 4MJAA 2MMAA 1IYIA 4J57E 3E3EA 3L4NA 4EF0A 1AIUA 1URMA 4OWYA 5IPGA 1WOUA 3QAWA 3FR9A 3TGZA 3ME7A 2ON5A 1KEBA 3HA9A 3GV1A 3GTUA 1V98A 2DIYA 1XZOA 5G2ZA 2KUCA 5JCGA 4ECIA 1QUWA 5LNKe 4V2LA 1HQOA 1PMTA 1HYUA 5DCGA 5DALA 4EKZA 2B7JA 1EP7A 3RDWA 2YWOA 2JZSA 5CO3A 2WS2A 4PUAA 2RM5A 3IAM2 1QGVA 3NOFA 2VCTA 2FA8A 2M80A 2YZUA 1GSQA 4DEJA 1SENA 3TJJA 4D73B 2VIMA 4IHUA 3G7JA 2IIYA 1VF2A 2V32A 3E0UA 3EWLA 2PERA 1N8JA 3VPTA 1XVQA 4F0BA 3CRTA 4IKHA 2I3YA 2X8HA 2YP6A 4RQXA 3MAKA 1BX9A 5HR3A 3ZMLA 4JBBA 4EO3A 3F3RA 4MF6A 2GQLA 5EY6A 2JL4A 2DMLA 4XHMA 1TI3A 1FB0A 5IMAA 4ZB9A 5KN2A 5D73A 1YQ1A 3DGQA 3TOUA 2EIOA 3GL5A 3UAPA 3EMXA 3F9UA 3BBYA 5C00A 4L8EA 2PGTA 3L9SA 3EYTA 2JZTA 5ECQB 5ECLB 3M9KA 1A23A 1RK4A 1DBYA 2TRCP 3VI5A 1PN9A 4IJ3A 1FB6A 2VAFA 4G9HA 1GTUA 2OE3A 3PR8A 1ST9A 1ERVA 3FZ9A 6GSTA 1TI1A 4KCAA 1XWAA 2A2SA 3QOUA 2CX3A 2I9HA 5INYA 4QL9A 1XW9A 4DSQA 4ZXGA 2B5EA 3ZVJA 3FZAA 4F03A 3HJMA 4K2DA 3RPPA 2MMZA 5ECSA 3EU3A 2F3MA 3APSA 5COHA 5F06A 4CW9A 1SK2A 1HNBA 2HSHA 1GUMA 3EVIA 1YKCA 3WGDA 1BG5A 4ZBBA 1SK0A 5JCWA 5D9VA 3LORA 4WXTA 1S3DA 3W8SA 4AGSA 1U3AA 17GSA 2H74A 4KDUA 5D93A 2DIZA 1U88A 2FY6A 3GKXA 5D9WA 2C80A 3IAS2 2WCIA 2JZRA 1TOFA 1NM3A 4L5LA 5EVOA 2B1KA 5DALB 1ERWA 1XWCA 4GQFA 5IMCA 3I43A 5B8BA 2VD1A 4PNGA 3DXBA 3IK7A 8GSSA 4MZCA 5D9TA 3GMFA 1R26A 2N5BA 1I9DA 3KP8A 2L57A 3LQ7A 1S3AA 4GLTA 1MDIA 2FLSA 4YQMA 4OCEA 2J9HA 1YDKA 3KTBA 1O73A 3UMAA 1XW6A 4YAVA 2IL3A 5HR0A 1G6WA 4IS0A 2H72A 2YPMA 2EIQA 2PU9C 3GL3A 5ABRA 1ML6A 5GZZB 3FZ4A 3U6VA 5CREA 4MK3A 1GTAA 3UBKA 1GSUA 5CP1A 3FZ5A 5DAKB 4KDXA 5C04A 5H5SA 3QD9A 2O85A 5H5RA 1J9BA 2AUVA 7GSSA 2PN8A 1LBKA 4OD7A 1JLVA 3P2AA 2P0GA 1S3CA 4ISDA 1G6YA 4GSNA 3MSZA 4GQCA 5LCZA 2LRNA 3VWVA 4FYUA 1GH2A 3KGKA 4MH2A 2IMEA 2X64A 3ZZXA 3EC3A 3E9JB 4CDOA 3KMNA 1V57A 2M46A 2YZHA 4JR4A 2B7KA 5HFGA 1O7UA 1E2YA 1XOBA 3LGCA 2OADA 1F6MC 2H1GA 1GUHA 3Q6OA 4XS4A 1CQHA 5IO2A 5ENUA 1A24A 2C4JA 2GVPA 4BA7A 5A4WA 2X8CA 3D22A 2R2JA 4JE1A 4KA0A 4PXOA 2LRCA 3NIVA 4TVEA 2GT6A 2PVQA 2WFCA 5AISA 3ZL5A 1XVWA 1SJZA 1SKSB 1XBSA 1Z3EA 2VL2A 1USBA 4KAEA 4EUYA 3FY7A 3IPZA 4YAPA 1GULA 2PWJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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