4KW6A

Crystal structure of peroxiredoxin-1 (c-terminal truncation mutant) from the human hookworm ancylostoma ceylanicum bound to conoidin a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
172
structure length
172
Chain Sequence
HMSKAFIGKPAPDFATKAVFDGDFVDVKLSDYKGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRFPEFKNLNVAVLACSTDSVFSHLAWINTPRKHGGLGDMKIPVLADTNHQIAKDYGVLKDDEGIAYRGLFIIDPKGILRQITINDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin-1 from the Human Hookworm Ancylostoma ceylanicum Forms a Stable Oxidized Decamer and Is Covalently Inhibited by Conoidin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Ancylostoma ceylanicum
total genus 52
structure length 172
sequence length 172
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kw6A00
3ZITA 2YV9A 5IMVA 6GSUA 1J0FA 4KW6A 3EMPA 2NPBA 5DDLA 5J5NA 3P90A 3GA4A 5DBQA 1YEPA 1K3OA 3GX8A 2CX3A 3IHQA 5J9CA 4WXTA 4ZBAA 4WF5A 3IK7A 2YPMA 2GZZA 3SBCA 5DJMA 2M72A 5CNWA 2OBKA 3IAM2 1FO5A 4O7HA 4HOJA 2P5QA 5IIZA 4YQUA 4HI7A 4DSSA 4TR1A 2H6XA 2LSTA 1NW2A 2GZYA 2F8FA 2V1MA 4IVFA 2C3QA 3CXGA 5IMAA 1M9BA 1QQ2A 2H01A 1GSUA 3TDGA 1B48A 2IFQA 3MNGA 3WT2A 1T4ZA 2HFDA 2NBSA 4OO5A 2X99A 3GKKA 1R26A 5GZZB 1AQWA 5EVOA 2MMNA 1OC3A 1EV4A 1SK0A 1U6TA 5ECIB 3C1RA 1XW9A 2LEGA 5ECSA 2H70A 1M0UA 2IIYA 3A5WA 5ID2B 2VIMA 2C0FA 1M9AA 4POLA 2HYXA 1YEXA 3GUSA 1GWCA 5AIXA 4PX1A 3EINA 2OADA 3GH6A 1QUWA 3TJBA 3HZ4A 4ECIA 4MF6A 1OE7A 4F03A 2CVBA 1DE1A 5IMZA 5HQPA 2LTKA 4J57E 4NHZA 17GSA 1SJIA 4YAPA 1QFNA 4IBPA 5G5EA 2LQQA 4PUFC 4MPFA 4V1Ag 5CYYA 3M1GA 3L9UA 1A0FA 3KCMA 3U6VA 4XIHA 2MZCA 1WIKA 1G0TA 2GSTA 3I6AA 1T7PB 1F2EA 2PVOC 2RLIA 4K2DA 3PINA 2HSYA 1XPVA 2D2ZA 1DSBA 22GSA 3M9KA 4NMUA 3ERGA 2X8HA 3RBTA 3E0UA 2QGVA 5JWOB 3GN3A 4F82A 4OFNA 2H0IA 3DXBA 3ZYWA 5B6MA 5J9BA 3UVTA 1ON4A 2H73A 1M99A 4D73B 4PQIA 2YV7A 1GTAA 1WRYA 4GXZA 4MZBA 4EDZA 1ZOFA 1WE0A 5F06A 4V2LA 4MF5A 3J7Yb 4G10A 1XCCA 4JEDA 5ECMB 1TW9A 1W4VA 3TGZA 4KDXA 1K3YA 2HNLA 3BD2A 4GSSA 5LNKe 1GTUA 1YQ1A 1BX9A 4ZIJA 1ABAA 5HR3A 2ON5A 1ZCPA 4TR4A 2FHEA 1PA3A 1Z7RA 3KMNA 2DMMA 4N0ZA 4XS6A 1ERVA 2LJRA 1OAZA 1FVJA 3QCPA 5FHIA 4HQSA 3CTGA 1VF1A 2C1YA 4XTSA 3HXSA 2GSSA 2N5BA 3BOAA 1MDKA 3TOTA 1O8WA 3EMXA 3TB2A 2DJKA 13GSA 1GSFA 2X8GA 4WETA 4I5QA 2K18A 2GT5A 1QGVA 4TR1B 1S3CA 1AUCA 1HD2A 4IQ1A 1OC9A 1HYUA 5DQYA 1X0RA 4POKA 4K7OA 2VD0A 3W8JA 4WBJA 4EUYA 1JLVA 1K0NA 1R4WA 1YF1A 3UVHA 4RQXA 4IGJA 1V2AA 3GMFA 2J23A 1B4QA 2FA8A 2B7JA 1PKZA 2YWNA 2DJ2A 1Z6NA 3QDNA 3QR6A 1NM3A 5IOXA 3GKMA 2ZCTA 2HRNA 3VPTA 4XRDA 1SD8A 3IC4A 2PWJA 3SWLA 4JZQA 1MD4A 5GAPD 2O7KA 4IN0A 3VI7A 2JU5A 1U3AA 2I3YA 4PQ1A 2QKEA 3Q19A 1BAYA 2H30A 5ABRA 3ZL5A 3UIWA 3G7IA 1NHOA 1A0RP 3HCZA 2IMKA 1O7UA 4FYBA 2V41A 4MK3A 4MPGA 2DJ1A 1WPIA 3A3TA 5EY6A 1J08A 2VCXA 1M2AA 2H75A 4IJIA 2B1KA 4OFMA 1R7HA 2YWOA 2PN8A 3ZIJA 1RK4A 1GTBA 2DMLA 1GUMA 1MEKA 4MA9A 1VF4A 4X0XA 2XPDA 1RW1A 3HD5A 3M9JA 4IS0A 2NTOA 4Q5FA 5ECHB 1K0MA 3I69A 2B5XA 3IE3A 3ZRDA 1R5AA 2L5LA 2TIRA 1TU8A 3DD3A 1O6JA 1F37A 3NIVA 4ZXGA 4ZL9A 3FR6A 2A2SA 4ZBDA 4KDUA 4ZILA 2F51A 2WRTA 3LEFA 5C04A 3N9JA 3UBLA 5KN2A 1Q98A 5G2ZA 3G9BA 5FT3A 2YOIA 5DALA 2IWTA 3EC3A 4GCIA 5ID2A 1XVQA 7GSSA 1PMTA 1PN9A 4DSRA 3EE2A 1OC8A 5ECLB 4EE0A 1Z6MA 1FAAA 3H1NA 2DIZA 3QPMA 2VL3A 3L4NA 4TKYA 3IBHA 1BEDA 3UJ1A 5KN1A 4HZ4A 5D96A 1XWCA 1YZXA 14GSA 2WZ9A 3C71A 2AUVA 3PH9A 20GSA 1AIUA 4CHSA 3APOA 2DBCA 4K6XA 5GAND 2AV4A 1VF2A 1K0CA 4HEA2 1UN2A 2HE3A 2PBJA 2DJ3A 3LGCA 4K9ZA 1HNCA 2MBSA 1AC1A 3BCKA 4LL1B 3H4KA 3ZVJD 5B8AA 3ED3A 5AGYA 3TKRA 1OC9B 1E6BA 3IDVA 2JZTA 2VLTA 3DVXA 3M8NA 5ELGA 3W6GA 3NOFA 2OACA 2HI7A 1DBYA 2I81A 3VURA 3N5OA 3J7Yk 1M2BA 4F0CA 3KP8A 1LBKA 4O5RA 2XBQA 5HR1A 5JCUA 2R4VA 3RDWA 4MDCA 1WWJA 1VF3A 4PGTA 1ZYQB 2DLXA 3CRUA 3F4RA 5JWRB 18GSA 4PNFA 2L59A 2KUCA 2R6KA 1TRUA 3VFIA 2R3XA 1TRWA 2ES7A 1LJRA 5KEJA 1DUGA 2WS2A 2Z9SA 3TOUA 2O87A 2C8UA 3HHVA 6GSYA 3HVVA 4KSMA 1SL1B 4JR4A 4N0VA 3KMOA 2HXKA 2XPEA 3QMXA 5LCZA 4FYUA 3G7YA 1B4PA 4JBBA 3MDKA 2H74A 2KP1A 2GSQA 4N10A 3QAWA 5COHA 1URMA 4NPBA 3D4MA 3CMIA 4MMMA 2MYGA 3C7MA 4O32A 1Y25A 5GSSA 4HU9A 3LQ7A 3HDCA 3UMAA 3TKSE 2VO4A 1A2LA 2OE0A 2DJ0A 2H1BA 1ERWA 1OKDA 1T1VA 3ZREA 4EF0A 2WB9A 3GNJA 2YZUA 5ECOB 4L5OA 2KOKA 3TKSA 5A4UA 2H1AA 5IMDA 1XZOA 6GSTA 1ST9A 4QL7A 1SJZA 3FY7A 2OA7A 4OWYA 2A2RA 3TKQA 1XIYA 2CZ3A 3M0FA 1ZGNA 4F9ZA 2YJHA 1VGLA 5ECQB 1THOA 3F4SA 3GH9A 3ME8A 4GQFA 3GSTA 3P2AA 4ACSA 1QXHA 1K0AA 2GT6A 3TJFA 5AIVA 4IJ3A 4OCEA 2P0GA 4DSQA 2M46A 4ULXA 2OE3A 2I9HA 5DALB 4YAVA 4GWRA 3LXTA 4DVCA 2GS3A 4AF2A 1SD9A 3LWAA 3UAPA 3U5RE 3IK9A 2LUSA 3LG6A 3UEMA 2L4QA 1XVWA 4BVYA 5A5KA 4XS4A 3HYPA 2TRXA 1EEJA 1V98A 4OD7A 5G5FA 3HY2A 4IKHA 2MMOA 2C0GA 2EC4A 3MSZA 1ML6A 3KH9A 2VL2C 1GSYA 2NDOA 1GUHA 2QC7A 3I9V2 3VI5A 3OR5A 1RQMA 3ZIVA 4MF7A 1JHBA 5CP1A 3H8QA 5JCWA 2YN1A 4QQ7A 2C0EA 4HJMA 2MMAA 4PXOA 1EOHA 2C0DA 2RUFA 1M2DA 2YJ7A 1K0OA 1ACVA 1PRXA 1V9WA 4NAXA 1F3AA 2E2GA 3D5JA 1KEBA 4I2UA 1EV9A 5E59A 1AQVA 1OYJA 1BQ7A 2GQMA 1ILOA 4TVEA 1MDIA 3ZTLA 3WGXA 3L9SA 3F3QA 2VM1A 3QD9A 2VAFA 3CYNA 1TP9A 4JRRA 4TR3A 1ERUA 3QFBC 1Z7PA 3DVWA 4AJ6A 2YCDA 1N2AA 3QFAC 2CAIA 1TOFA 1TRVA 1UC7A 2IMEA 5ECPB 3P8WA 1QK8A 5HR2A 3ZFLA 5KN0A 3F6DA 2QSIA 3LJRA 4MH2A 1HQOA 1SYRA 1GUKA 3ZMLA 3FW2A 4Q5NA 2B3SA 3RAZA 1J9BA 1ERTA 2WJUA 4ZB9A 3ZFBA 1IYIA 1THXA 1G7OA 2RUEA 1XOBA 4KB3A 9GSSA 2WDUA 2H72A 2YWMA 4I2TA 4ECJA 4GSTA 3VWWA 2K6VA 3TJKA 2JADA 1O73A 2CT6A 4KSOA 1OKTA 2IN3A 5HFKA 3FR9A 1TI1A 2VCTA 3D6IA 2LRCA 3FZ4A 5IQYA 1SK2A 4OO4A 1MD3A 5DVBA 2MBTA 5IPGA 2VCVA 3RPNA 2PMTA 2R37A 1I5GA 3DYRA 4MABA 2JZRA 1NSWA 5CRGA 3VWVA 3ZLPA 2LNTA 2YP6A 3PR8A 5H5RA 4GF0A 1TK0B 4K0NA 1GSSA 6GSVA 4XRAA 1QMVA 2N5FA 3IAS2 1Z5YE 5IOWA 3TRXA 1YKAA 5CRHA 2E0QA 1A8LA 3FEUA 1PX7A 1EGOA 2FNOA 2I4AA 5IMFA 3RPPA 1TK8B 4IW9A 4BA7A 4TXVA 3RHBA 3HJOA 4X1UA 2KLXA 5D73A 4EDYA 3TJGA 3GX0A 2L6DA 1EZKA 1BJXA 3HVSA 1SL0B 4ECBA 1K0BA 10GSA 5IMCA 3UARA 1BYEA 4XCSA 5G1KA 3KXOA 5F05A 4XS4B 1YJ6A 4NV2A 1SYXA 2L6CA 4Z7XA 3H79A 1PQNA 3HKRA 3L0HA 5IM9A 3HVXA 5D9WA 1X9MB 4DEJA 5HR0A 2FLSA 1GSDA 1PSQA 1U87A 2WFCA 1N8JA 1EEMA 1NHYA 5ECRB 1GP1A 6GSSA 3KZQA 3NZNA 4EC0A 4NHWA 3IR4A 4TRXA 16GSA 1TU7A 4IHUA 2IMIA 4EKZA 2R5GA 4Q5RA 4GSNA 4ZB8A 1F6MC 2H8LA 5A4VA 5AN1A 1B8XA 1KNGA 3UOMA 4K7IA 3C8EA 2K8VA 3HZ8A 2OBIA 1AW9A 3MAKA 3US3A 2GVPA 1ZYEA 4BL7A 5G30A 1UVZA 3QAVA 3MWHA 3C1SA 2LRTA 2X8CA 2YNXA 2HZEA 2B5EA 4KX4A 4TOPA 4EO3A 2H6ZA 1GLPA 2N5AA 3EYTA 2YWIA 3CRTA 1K0DA 4LA1A 3A2VA 3F3RA 4BWQA 4X43A 1KBNA 1GL8A 2VLVA 5H5SA 1JLWA 2GQKA 3VPQA 2ON7A 3L78A 2H1DA 4WF4A 4E8EA 2AJQB 3LXZA 3I43A 4MJAA 3FRCA 3O6TA 4G9HA 3LORA 19GSA 4F2IA 2F8AA 4WKWA 2CAQA 1GSEA 2E7PA 3GFKA 5LD0A 4WR5A 4ID0A 4RUVA 2F9SA 3TRPA 5J41A 2H1GA 2OE1A 4POBA 3L9VA 1SK1A 4PNGA 3ISOA 3KM6A 2VUPA 1JZRA 1K3LA 2FGXA 2GGTA 5DJLA 2NVLA 3TRQA 3IXRA 1GULA 1SL2B 2VD1A 3DMLA 1AQXA 1PX6A 5J3RA 4MZWA 2VL9A 1SKSB 4K1FA 1GSQA 4PQHA 1FB0A 4ML1A 3ERWA 1TK5B 2O8VB 5FWGA 1U88A 3F4TA 1USBA 2PERA 3VK9A 1SKRB 4K7NA 4L8EA 5ELAA 3WD6A 3D21A 3DRNA 4L0WA 3Q6OA 4EVMA 1O85A 1FG4A 4K8MA 2RM6A 1GH2A 1GNWA 3QAGA 2H66A 3D0ZA 2WCIA 3ZZXA 3P7XA 4CW9A 2PPTA 4JR6A 3TJJA 3TKPA 3LYKA 4MJCA 4RI6A 2C3NA 3FZ5A 3S9FA 4HDEA 2P31A 2L4CA 4O92A 3D4TA 5EL8A 3BBYA 3VWXA 1A2JA 1V57A 4EXJA 2LS5A 2FUG2 5C00A 4TR0A 2DC5A 1TXXA 5DAKA 2BJXA 1G6YA 4LMWA 1OE8A 5D8IA 3H93A 1JZDA 5DCGA 4MJEA 3BJ5A 2AHEA 1I9DA 4HZ2A 2EIOA 2YANA 3FR3A 2IMFA 2GZPA 2DJJA 5JWQB 5B8BA 4ZB6A 1VRSD 3DWVA 3TKSC 4N11A 4ILFA 4F0BA 1EP7A 4E8HA 3CSIA 4BWSA 1YKCA 2KP2A 1EOGA 5CREA 1XWBA 4GRFA 2AAWA 5B6NA 5ECKB 5D9TA 3WGEA 3GKNA 3HJPA 4HJ2A 5B7CA 1C72A 4TXOB 4H86A 1TKDB 2AB6A 1U3IA 4FIWA 5CAXA 1XWAA 1GLQA 3EWLA 2O85A 2HZEB 3GIXA 3M3MA 3KH7A 1E2YA 1WMJA 1T00A 2VCQA 5EPFA 2CX4A 1S3AA 2YZHA 2LQOA 1EWXA 3GTUA 1XXUA 2K8SA 1JFUA 2PGTA 5A4WA 1X5EA 1LU4A 2V6OA 3DIEA 5D93A 1X5DA 3ERFA 2OKAA 2L57A 5ECNB 4ZL7A 4MJBA 2CA8A 1DE2A 1TI3A 2FA4A 4XS1A 2C80A 1YY7A 3WYWA 1FVKA 2JACA 4YQMA 3QOUA 1ZL9A 2V32A 4KNDA 1FB6A 1CQGA 3KP9A 2H6YA 3F9UA 3FYGA 1TDIA 1SENA 2VL2A 2FWGA 1Q4JA 3Q18A 4JU5A 3RHCA 4AJ8A 4KE3A 1Z3EA 3GL5A 2M80A 1EGRA 5CRDA 2B1LA 3GKXA 3GRXA 3DGQA 4NWYA 2J9HA 2FWFA 2GTUA 3EU3A 4I97A 5E4WA 4YQVA 2FCHA 3IPZA 3KGKA 3LSZA 4CDOA 3WGDA 4TW5A 2G0FA 3AY8A 1XBSA 2GQLA 1Y6EA 4K0GA 1H4OA 5D9VA 1PGTA 4G2EA 3E9JB 4GQCA 3KIJA 2LNSA 5IO0A 4NV5A 2FWEA 2HSHA 5F07A 4J2FA 1ZZYA 4LL4B 4OCFA 2H76A 2RIIA 3IV4A 2PVQA 4KAEA 4PUAA 3APSA 6GSXA 3KD0A 4RI7A 3KJYA 1MDJA 4L0UA 4WBRD 2DIYA 1A8YA 5DAKB 2F3MA 4WR4A 1AXDA 3F8UA 3GSSA 2GDRA 2IJYA 3ME7A 2HZFA 2FY6A 5HFGA 2VLUA 1SKWB 1XW6A 5F0GA 5L71A 4V2NA 3F63A 3APQA 4XHMA 3O3TA 2BTOT 4J56E 3EURA 3LFLA 3FK8A 3KEBA 2XBIA 5G1LA 3CSHA 4TN8A 5G31A 2K9FA 4KA0A 2OJLA 4PURA 4FO5A 1T8EB 4AGSA 1V40A 1GTIA 4DSSB 1IYHA 4NXIA 3EU4A 2P5RA 5ENUA 2PUKC 3C73A 1XW5A 1PL2A 4GTUA 1WOUA 3GYKA 5AISA 2E2MA 1GRXA 2IFQB 2ZNMA 2FD3A 3HA9A 2REMA 4KCEA 8GSSA 6GSWA 3GTUB 1T4YA 1X5CA 1O8XA 4KH7A 2LJAA 12GSA 4V1Ap 3A2XA 4YH2A 4L5LA 2H19A 4IQAA 5GSTA 4KDYA 3FHKA 1XWGA 2CQ9A 2GLRA 3UBKA 1F3BA 3R2QA 2HRFA 1CQHA 2HT9A 5CRWA 4BVXA 4HS1A 2GSRA 1HNAA 3IRAA 4OMVA 5J4UA 2TRCP 4FYCA 1JZWA 1W89A 4MLYA 3D22A 1WJKA 4HUAA 3WT1A 3TCOA 2FWHA 4HU7A 2CZ2A 4WEYA 2KHPA 2WGRA 1H75A 1TTZA 1WP0A 1BG5A 2EIQA 1PKWA 5HFIA 5IPHA 1XWKA 4ZBBA 4QL9A 1EP8A 3GV1A 3LYPA 3CBUA 1XOAA 1X9WB 3CTFA 3V1WA 4G19A 4TXOA 1MTCA 4JE1A 1R5PA 5JCGA 1X9SB 2A4VA 4ML6A 2H0GA 1GNEA 1OVNA 4P3YB 3DEXA 4EL1A 2JSZA 4I8BA 2LRNA 2B6MA 4KCAA 5CO3A 2MMZA 1A2MA 11GSA 2O89A 4IP6A 3HJMA 2G2QA 3CSJA 1S3DA 5F8BA 3VLNA 2X64A 1T3BA 2VCZA 2R2JA 1A24A 3GURA 2IL3A 2LV3A 3GHAA 1ZMAA 3K8NA 3W8SA 2JL4A 3BCIA 1B9XC 3PGTA 1SJ6A 4IP1A 1PD21 2V6KA 1UA5A 2IMDA 2RM5A 4OFTA 1FOVA 3FKFA 2ZUPA 1FW1A 2DSAA 2L5OA 2VM2A 1G7EA 2H71A 4ISDA 4RQRA 2LJKA 5D9XA 3IOSA 4I6XA 1G6WA 1Z9HA 1FHEA 4Q5QA 4ZL8A 4MZCA 3FZ9A 4V2MA 5DQSA 1SU9A 2WULA 1B9YC 2XC2A 3ZMKA 2IPAA 1TJDA 5DCHA 3EVIA 3DKSA 2PU9C 2VCWA 2LKUA 2V2GA 3Q74A 3UL3A 2VOCA 3F0IA 4MH3A 2I1UA 3G7JA 4KUNA 4FH8A 3TUEA 2CVDA 5H5QA 3F6FA 1YF0A 3VWUA 1YDKA 5IO2A 2EIRA 4GLTA 2B7KA 4N30A 2AYTA 4ECCA 1M7TA 1TRSA 3GL3A 5INYA 3KTBA 4AJ7A 4KGIA 2H0HA 1HNBA 1KTEA 4POMA 4IELA 2JSYA 4D73A 4HQZA 3ZVJA 1V58A 3IA1A 4MCUA 3A2WA 2C3TA 4LLRA 3E3EA 5KN3A 1O81A 3O76A 1PL1A 4BPYA 1XFLA 2CVKA 3FZAA 2ALBA 4MP4A 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