4L0UA

Crystal structure of plasmodium vivax prx1a
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
PTYVGKEAPFFKAEAVFGDNSFGEVNLTQFIGKKYVLLYFYPLDFTFVCPSEIIALDKALDAFHERNVELLGCSVDSKYTHLAWKKTPLAKGGIGNIKHTLLSDITKSISKDYNVLFDDSVSLRAFVLIDMNGIVQHLLVNNLAIGRSVDEILRIIDAIQHHEKYGDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-Cys peroxiredoxin, putative
publication title Observed octameric assembly of a Plasmodium yoelii peroxiredoxin can be explained by the replacement of native "ball-and-socket" interacting residues by an affinity tag.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium vivax sal-1
total genus 55
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4l0uA00
4FO5A 2EC4A 4KX4A 1BG5A 1TK0B 1ML6A 5G2ZA 3BBYA 4NMUA 1B9YC 1AXDA 1K0BA 3GMFA 2C0GA 1X9MB 1T4YA 2CVKA 4ISDA 1OE7A 2RUFA 2K9FA 1KNGA 1HNAA 4IJ3A 4KA0A 4WR5A 5CRDA 1JZOA 4XRDA 3KP8A 1E6BA 2BMXA 1XIYA 3ZL5A 2IMDA 3ZMKA 4XS1A 2IJYA 1EGRA 3ERGA 2L5LA 1V2AA 2R2JA 3GV1A 3KH9A 4KCEA 2GQMA 3DEXA 1EWXA 4POKA 1Q98A 4TR3A 5F05A 3EU4A 5DDLA 2M46A 1JFUA 1KTEA 1FB6A 4TR0A 1I5GA 2O87A 3M1GA 1K0DA 5ID2A 2DJ0A 3GKNA 2LTKA 3QCPA 4V2NA 2EIQA 2ALBA 4TOPA 4EE0A 2VLTA 1HNCA 1K0MA 1K3LA 2EIOA 1K0OA 3NZNA 2I4AA 2F8FA 4WKWA 1M9BA 3PR8A 3HVVA 3V1WA 5AISA 2JU5A 3TKSE 1UC7A 3QAWA 4AJ7A 4PXOA 4DSRA 3LEFA 4GQCA 2QSIA 2GQKA 4KH7A 1H75A 1RQMA 4MJEA 1ERWA 3F9UA 4IQ1A 2HZEB 5B6MA 1FVKA 1A2JA 3EVIA 2ZNMA 1M0UA 2FD3A 5DBQA 4ECJA 1FAAA 1GP1A 3A3TA 3TKPA 4CDOA 3KH7A 2LQOA 4PQHA 1XPVA 4GLTA 5F8BA 4LMWA 1GTBA 1GUKA 1YF1A 4IP6A 3NIVA 2YANA 4AJ6A 1TP9A 4MA9A 5ABRA 6GSWA 3E9JB 4IJIA 2LRCA 3TJFA 1EP7A 2GZPA 1EEJA 3PINA 4WF5A 1J0FA 3FY7A 3HDCA 4K7IA 5CRWA 1TKDB 2L6DA 3R2QA 2PVQA 5ECPB 3MDKA 1UA5A 3H8QA 4IKHA 4J56E 1IYIA 4O5RA 2CAIA 3GIXA 1G7OA 4F9ZA 4N30A 2C3NA 4N11A 3H79A 3TJBA 3WYWA 5H5SA 3CSJA 2YZUA 1W89A 3HCZA 3HJPA 1ABAA 2KOKA 4JEDA 3CMIA 4MZCA 4TXOB 2FUG2 3MAKA 2H74A 1BX9A 2RUEA 4JR4A 1OVNA 4HUAA 2MBTA 3GX8A 4V1Ap 4BVYA 1ZZYA 2CA8A 1URMA 3QDNA 1SL2B 3C73A 1NSWA 4PGTA 3ZLPA 1T00A 3KGKA 6GSUA 4N10A 3UVHA 4I2TA 5FWGA 3EU3A 1X9WB 1RK4A 2GSSA 1VF1A 2TRXA 1U88A 2AYTA 4XCSA 2B5XA 1EP8A 4FYUA 2ZUPA 3TKQA 2FA8A 3IRAA 5JWOB 2XBIA 3WT2A 4MH2A 1SK0A 2LJAA 3CTFA 2HNLA 1PN9A 2IFQA 1NM3A 3W8SA 4K8MA 3ZIVA 3IBHA 3TOTA 22GSA 1PX6A 4K7NA 1TDIA 2YJ7A 5HFKA 2HRNA 5J9CA 5CRHA 3ZVJA 2Z9SA 3CXGA 1A2LA 1VF2A 5G31A 3P90A 4K0NA 11GSA 4ZB8A 4H86A 1XOBA 3VWUA 1WRYA 4EF0A 1BYEA 3GN3A 1GSYA 1NHOA 3TRQA 4N0VA 4GSSA 4V2LA 1O85A 3O3TA 3E0UA 2VO4A 2I1UA 2GSTA 3UIWA 5ECKB 3EYTA 2BTOT 2MZCA 3L9SA 2B1KA 1TXXA 2LEGA 1GLPA 5DVBA 5EVOA 1AQWA 3IHQA 3LJRA 3AY8A 3M3MA 4N0ZA 2MMOA 5G5EA 1A8YA 3Q19A 2DIZA 1S3AA 3F4TA 3HZ4A 2H73A 3PGTA 2RIIA 4PQIA 3QPMA 4ZBDA 2H76A 2KUCA 5IMCA 1WWJA 2JL4A 1B9XC 4MLYA 3HVXA 4PNFA 1FVJA 2GTUA 2J9HA 2HYXA 1K0CA 2L5OA 1PQNA 1XWAA 3VURA 1XZOA 2C3QA 1EGOA 3HJMA 5AIVA 1SKSB 2VCVA 4DEJA 5HFIA 4GSTA 1USBA 5COHA 3VWWA 4MABA 3F8UA 1Z3EA 3C71A 3EMXA 4TR1A 1U3IA 4KSMA 4EVMA 4RQRA 4ZBAA 2VIMA 1SJ6A 2YV7A 4FIWA 4JR6A 2JZRA 4EO3A 2JSYA 2LJRA 3ZZXA 2GS3A 2IMKA 1Z6MA 14GSA 1GSQA 2CV4A 3O76A 4NAXA 2WRTA 4G9HA 1AUCA 4XS6A 3ZIJA 2EIRA 1KEBA 1X9SB 4OCFA 1F2EA 3ED3A 4E8HA 3D4MA 4NPBA 2H70A 4EDYA 5KN3A 3F3QA 3GTUA 2V6KA 2JZTA 3CTGA 4X1UA 2CVBA 3L9VA 1HD2A 1E2YA 5D9VA 2L6CA 1A23A 2REMA 2OE3A 4L0WA 1TOFA 2DJ1A 4NXIA 1GSUA 2HSHA 4E8EA 2H19A 2MYGA 2AV4A 1S3DA 3EINA 1X5CA 2GT6A 3LFLA 4IBPA 2FLSA 1B8XA 4OO5A 1GH2A 2DMMA 3ZYWA 3IR4A 2FWEA 2DJ3A 2P31A 4ZL8A 4O92A 3WGXA 4I97A 2HRFA 1XW9A 2CX3A 4IELA 1AW9A 4POMA 4ECCA 1O6JA 1OKTA 2IFQB 1VRSD 1ZMAA 1OKDA 2CQ9A 4G2EA 5ECRB 4RQXA 2PERA 5DQSA 5ECMB 1WOUA 5G5FA 1MDIA 1ZYEA 4KUNA 3GSSA 1K0NA 3UVTA 2R37A 4TXVA 3TDGA 3A2WA 17GSA 2IN3A 4TKYA 1DUGA 3FZ4A 3BCKA 5HFGA 2LKUA 5B8AA 3BOAA 4KDYA 3BCIA 1TRSA 2VCXA 4HDEA 5ELGA 2NPBA 1J9BA 10GSA 4KE3A 2VD0A 1AC1A 3G9BA 2M80A 2YOIA 2JZSA 3N5OA 18GSA 4ULXA 4QL9A 5ECLB 1JZDA 2E2GA 4YQMA 1SKWB 3C1SA 2L57A 3J7Yk 3GUSA 1M99A 3A2VA 1NHYA 5INYA 5C00A 2O89A 1GULA 3APQA 1QGVA 5G1LA 2CZ2A 2MBSA 4K7OA 5J5NA 3ZRDA 1BAYA 2GDRA 4ZILA 3IAM2 4OCEA 2YCDA 4OD7A 4KCAA 4ML1A 3MSZA 2GVPA 1EOHA 1YEPA 5D96A 1O73A 3KZQA 2PMTA 3N9JA 3TGZA 5JCUA 1ILOA 1ZYQB 2RM5A 2C0FA 2N5AA 4KW6A 5IO2A 3P2AA 1TI1A 3BD2A 1O8XA 2PVOC 2WULA 4I5QA 4K2DA 3U5RE 1CQGA 4LLRA 4HS1A 3IC4A 1LJRA 5GSTA 2H0IA 4PQ1A 1QUWA 5EY6A 1N8JA 2F3MA 1QQ2A 3LORA 3ERWA 3MNGA 3BJ5A 2VM1A 3DVWA 2L59A 1WJKA 3G7IA 1HQOA 3D22A 1GNEA 4TR1B 3LXTA 2PN8A 1GSFA 1SD8A 3FZAA 2IMFA 4RI7A 5E4WA 3KTBA 3LSZA 1T4ZA 3GKXA 2YNXA 3ZMLA 5KN1A 5JCGA 4BA7A 3DXBA 2ON5A 1F3BA 2YWIA 1F37A 5JWQB 5DALA 3UJ1A 3M8NA 2YWNA 2ZCTA 3QFAC 3VPQA 5J41A 5KEJA 3P7XA 3F0IA 2YZHA 2V2GA 4HZ4A 2DC5A 1DBYA 3GTUB 3QMXA 2HFDA 4XS4A 1EEMA 4K9ZA 3UARA 4YAVA 3KEBA 1PGTA 2GZZA 1Q4JA 3ZVJD 1TRUA 4K0GA 1FO5A 1DE2A 2E7PA 4MF5A 5HR1A 6GSSA 1R26A 1YDKA 3GA4A 2VLUA 3DD3A 4JBBA 1OAZA 2HZFA 4YQUA 3WGEA 1SENA 16GSA 2H0GA 2R3XA 1GWCA 3TKSC 1OC9A 3IAS2 2V6OA 3FYGA 1R4WA 2C80A 3FEUA 1EV4A 1G6YA 3GKMA 4KGIA 2H72A 8GSSA 3KMNA 1PRXA 2NBSA 3GL3A 2C0EA 4LL1B 2F8AA 2LQQA 3IDVA 2JACA 1UVZA 4K1FA 3ME8A 4D73A 4PUAA 4TR4A 4L5OA 1XOAA 5A4UA 2F9SA 3HZ8A 2H1BA 3LQ7A 3TKSA 2OJLA 3GYKA 1A8LA 2FWGA 2OBKA 5CAXA 5IPGA 1F9MA 5HR0A 3IE3A 2WDUA 1GTIA 4RUVA 2PGTA 2V1MA 1AAZA 1WE0A 2KP2A 2H0HA 2VOCA 3KMOA 5KN0A 2VCWA 1YY7A 5CP1A 3TRPA 2N5FA 2O85A 3F3RA 3GL5A 4HJMA 4BVXA 1PL2A 4OO4A 2PPTA 2AJQB 1T3BA 4F0CA 5IMDA 2DJKA 5H5RA 3TB2A 5IOWA 5AIXA 2KP1A 7GSSA 3ZFBA 3SWLA 2H6YA 1ZOFA 4IHUA 4XRAA 2ES7A 1EV9A 2GSRA 2H1GA 1Z9HA 3EURA 1SYXA 1WPIA 4IS0A 4GQFA 4AF2A 1W4VA 3M0FA 3DWVA 1Z6NA 5B8BA 4WEYA 1MTCA 3LG6A 1A2MA 5B6NA 3KIJA 13GSA 4HZ2A 2LRNA 3UBKA 1VF4A 5ID2B 1SK2A 1M2AA 3ME7A 2FNOA 3VPTA 4BL7A 4QQ7A 3CBUA 3F63A 1FG4A 1JZRA 5EPFA 3VWXA 3W6GA 1V58A 2QKEA 4EXJA 1GSEA 4BPYA 4LL4B 3GFKA 4Q5FA 4XTSA 2LUSA 3RPPA 2H6ZA 1F3AA 2IMEA 5IMFA 2K8VA 2XBQA 2HLSA 2VL9A 2H71A 4QL7A 5DALB 3TKRA 4PX1A 4OFMA 1M7TA 2C1YA 1XFLA 5F0GA 1PSQA 2KLXA 2WGRA 4ML6A 1R5PA 2GLRA 2LRTA 2GQLA 2CX4A 3D21A 2DSAA 2XPEA 1H4OA 1PKZA 2IPAA 4XS4B 4TW5A 1MEKA 2PBJA 4MF6A 4WBJA 3DYRA 5AN1A 4IN0A 2AB6A 4LMVA 1Y6EA 2LS5A 1SU9A 1OC8A 3HA9A 1M2BA 4Q5NA 5JCWA 2I81A 2B1LA 5DCGA 4O7HA 5IO0A 6GSVA 2H8LA 5LNKe 4JRRA 4WETA 1SYRA 1K3OA 2X8GA 1IYHA 2BJXA 2JSZA 3SBCA 3HKRA 1ERVA 5E59A 1OC9B 2L4CA 1MDKA 1OC3A 4ZBBA 5DCHA 2E2MA 3WT1A 4ZXGA 1ACVA 2PUKC 1I9DA 3J7Yb 1ON4A 4MDCA 2JADA 1M9AA 3DVXA 3KXOA 4KAEA 2OE1A 4MF7A 4MK3A 4D73B 3I9V2 3WGDA 1U87A 1TU8A 3I43A 1ZL9A 2LJKA 3ZREA 2GT5A 1WP0A 2OADA 3F4SA 3LYKA 3L9UA 3D4TA 4V2MA 2B5EA 1C72A 3D5JA 3S9FA 5J9BA 4X0XA 4ILFA 4X43A 3U6VA 2HXKA 3EMPA 5G1KA 3UMAA 5HQPA 1HNBA 1K0AA 3ISOA 2O8VB 2HZEA 2VL3A 3GNJA 3APOA 4P3YB 5IM9A 2F51A 1FB0A 3UOMA 4I8BA 4POLA 1Z7RA 4NHWA 2OBIA 1AQVA 1YEXA 5ECHB 5AGYA 3M9KA 5G30A 4RI6A 2YWMA 1A0RP 1V40A 3CSHA 1KBNA 1G0TA 1SJZA 2E0QA 2VLVA 4GWRA 3Q6OA 1MD4A 5IQYA 3QD9A 5D93A 4WBRD 3F6DA 3Q74A 4HOJA 1TK5B 3QFBC 5JWRB 1TK8B 2V32A 4J2FA 4FH8A 5D9TA 5D73A 4EL1A 3QAGA 4F82A 1PKWA 1YF0A 5CREA 2H01A 4JU5A 2H66A 1CQHA 5CRGA 4MJCA 1XVQA 1VGLA 2VL2C 1Y25A 3KM6A 3FW2A 1WIKA 1PD21 3TJJA 3FHKA 1SK1A 4GRFA 4MJAA 2P5RA 2KHPA 3E3EA 3KD0A 3QAVA 3RHCA 5DAKA 1GLQA 4GXZA 1THOA 1XWCA 2G0FA 2DJ2A 4MZBA 3LGCA 4NWYA 1PX7A 4TN8A 4IVFA 3ZTLA 4EUYA 1OYJA 2IL3A 5FHIA 4TXOA 2M72A 4GF0A 2MMAA 3GH6A 2VL2A 1PA3A 4MCUA 2X64A 1AIUA 2VUPA 2CVDA 1V57A 2IWTA 2R6KA 5FT3A 1EOGA 3VFIA 3CSIA 5A5KA 3F4RA 4WXTA 4EKZA 1BQ7A 3TOUA 1XBSA 4NV5A 2QGVA 2R5GA 2DJJA 2LSTA 2OA7A 5A4VA 1XW5A 2A2SA 2IIYA 4ZB9A 4ECIA 3FR3A 4MJBA 1B4QA 3FR9A 4MP4A 3HJOA 5ECOB 2HSYA 1K3YA 4HEA2 2B7JA 1ERUA 2YN1A 5A4WA 3GSTA 4YQVA 3D0ZA 2DBCA 5ECIB 3GRXA 3CRUA 4CW9A 2YP6A 4OFTA 1RW1A 2CZ3A 5D9XA 4PURA 3PH9A 1T8EB 4DSSA 3TCOA 3UBLA 1DE1A 3EWLA 4AGSA 2TIRA 2K8SA 3H93A 4PNGA 1MDJA 3FZ9A 2H30A 1SJIA 4GCIA 2K18A 1F6MC 4OWYA 4NV2A 4I6XA 2WJUA 1XWBA 4Z7XA 4MPFA 2GSQA 1PL1A 4XIHA 5LD0A 4ZB6A 4F03A 1TRWA 1G6WA 4J57E 2A2RA 4MMMA 2H1AA 4WR4A 4FYCA 3Q18A 4POBA 4ZIJA 1BEDA 5IMZA 3I69A 2FA4A 2PWJA 5IMAA 3L0HA 3EC3A 3W8JA 3UEMA 4WF4A 5IIZA 5GZZB 2VCQA 3UL3A 1QK8A 3ERFA 2HI7A 4YAPA 20GSA 3ZITA 3RPNA 4HU9A 4EDZA 1XCCA 4HJ2A 2FWFA 3L78A 1J08A 1V98A 3O6TA 2P5QA 1N2AA 3M9JA 3A5WA 3EE2A 2AUVA 1QMVA 4L8EA 2B3SA 3GURA 3UAPA 1YKAA 2V41A 3H4KA 3DMLA 3VLNA 1JHBA 4NHZA 2K6VA 1OE8A 2R4VA 2D2ZA 3US3A 5B7CA 1X0RA 3OR5A 1TTZA 2DMLA 4HI7A 5HR3A 3VI5A 1WMJA 2I3YA 4ECBA 3FKFA 2OKAA 3KJYA 2AAWA 1AQXA 3KP9A 2B6MA 4GSNA 1ZGNA 2N5BA 1FHEA 3L4NA 3HHVA 1GL8A 1ZCPA 3RBTA 1SD9A 2P0GA 4ACSA 4KSOA 5J4UA 3DRNA 4HQZA 1QFNA 2RM6A 2RLIA 2YJHA 4GTUA 1TJDA 3TRXA 3VI7A 3MWHA 2MMZA 2OACA 5DQYA 2B5YA 5DAKB 1LBKA 4CHSA 2WB9A 5L71A 2HT9A 1Z5YE 1R7HA 5F07A 4BWSA 2YWOA 1SL1B 3DGQA 5ECNB 1GTAA 3TJKA 1TU7A 1YJ6A 4OMVA 5F06A 4MH3A 1MD3A 3A2XA 3GH9A 3IPZA 4FYBA 1VF3A 1SKRB 1XVWA 3HY2A 3HYPA 4MZWA 1XWKA 1ERTA 2J23A 3G7YA 5ECQB 3QR6A 5KN2A 2AHEA 4L0UA 3D6IA 1LU4A 4JE1A 3APSA 4O32A 3IK7A 3DIEA 2PU9C 2WFCA 3C1RA 5H5QA 1NW2A 3TUEA 2YV9A 2H6XA 2MMNA 3IV4A 2WZ9A 4F2IA 5DJLA 1JZWA 1GUMA 2ON7A 5CO3A 2VM2A 1GSDA 4KB3A 4TRXA 1HYUA 1GSSA 4YH2A 4DSSB 1XXUA 5ENUA 1UN2A 2L4QA 2FWHA 5LCZA 1O81A 1EZKA 2VAFA 4ZL7A 5IOXA 1XWGA 4BWQA 2LNTA 4F0BA 2LNSA 5GAPD 2C4JA 1B4PA 1X5DA 1O8WA 3WD6A 2GGTA 3LYPA 2FCHA 1V9WA 3LXZA 5ELAA 1A0FA 3ZFLA 4EC0A 1GTUA 3P8WA 3RHBA 1XW6A 4KNDA 3JCML 1GRXA 5D8IA 2YPMA 2LV3A 4LA1A 3TJGA 2FHEA 4XHMA 5C04A 1ST9A 3NOFA 3DKSA 5CYYA 1BJXA 2C8UA 3C7MA 3FZ5A 2C3TA 3F6FA 3KCMA 4I2UA 4V1Ag 2HE3A 1YQ1A 4IGJA 5D9WA 4TVEA 1Z7PA 1U6TA 2NTOA 12GSA 1R5AA 2VCZA 3LWAA 5GAND 2NDOA 2O7KA 3IXRA 3QOUA 5DJMA 1U3AA 4Q5RA 4G19A 3I6AA 1T1VA 3CYNA 1YKCA 4Q5QA 3GX0A 3IK9A 4IW9A 4PUFC 1GNWA 4IQAA 3G7JA 4KDUA 2X8HA 4IP1A 2FY6A 3FR6A 2FGXA 1QXHA 2B7KA 2TRCP 1YZXA 3C8EA 3KTLA 4L5LA 3IOSA 1X5EA 4ZL9A 5CNWA 4DVCA 5EL8A 4KDXA 1GUHA 5J3RA 1TW9A 1DSBA 1FW1A 2X8CA 2XPDA 2GZYA 2DIYA 1M2DA 2WCIA 1O7UA 2G2QA 1JLVA 3FRCA 3GHAA 1JLWA 1SL0B 1B48A 2WS2A 5HR2A 3IA1A 2A4VA 2QC7A 4AJ8A 3HD5A 4K6XA 6GSXA 1G7EA 3RAZA 3VWVA 2C0DA 4HQSA 2VCTA 1FOVA 2XC2A 3H1NA 1PMTA 4G10A 5ECSA 6GSTA 2CAQA 9GSSA 2I9HA 1TRVA 2IMIA 4HU7A 2NVLA 4OFNA 6GSYA 3RDWA 3CRTA 5IMVA 2OE0A 1A24A 1T7PB 2CT6A 2X99A 4MPGA 19GSA 4JZQA 3GKKA 4DSQA 4ID0A 1THXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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