4MCUA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from klebsiella pneumoniae in reduced state
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
NAQITDGKQYITLDKPIAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVRQKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKDLTQAWAVAIALGVEDKITAPMFEAVQKTQTVQSVADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMYVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVAQYADTVKQLVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative Sequence, Structure and Redox Analyses of Klebsiella pneumoniae DsbA Show That Anti-Virulence Target DsbA Enzymes Fall into Distinct Classes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Klebsiella pneumoniae
total genus 58
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mcuA00
4XRDA 4JZQA 2B6MA 4HQZA 4PX1A 5KN3A 4I2UA 4WEYA 3RPNA 3NIVA 2HZEA 2RLIA 3TRXA 2X99A 4HI7A 4IQ1A 3HKRA 3KMOA 4K0NA 4ECIA 2DLXA 2PN8A 3F8UA 3LYPA 4OO4A 1V9WA 5CAXA 4GXZA 3L0HA 1DSBA 4PURA 4DSRA 1T7PB 2A4VA 3M8NA 1K0DA 4N10A 3GH6A 2LSTA 3O3TA 4CDOA 4LLRA 2HT9A 2LQOA 4GCIA 4RUVA 3H93A 3DIEA 3GA4A 1BX9A 3Q6OA 3VPQA 1JZOA 4QL7A 2OBKA 3TKRA 3CTFA 4E8EA 4KCEA 4KDUA 2ES7A 1VF2A 1MD3A 3LQ7A 1A24A 1WOUA 3FK8A 3TRPA 4PNGA 1YEPA 4IS0A 2LJAA 4FYUA 2GT6A 5GSTA 4XIHA 1K0BA 2VO4A 3IK9A 3S9FA 2IJYA 1RQMA 2MBTA 1B4PA 1SENA 2L5OA 1GWCA 1MDJA 1VRSD 1FOVA 6GSVA 1ERWA 2IFQA 5GAPD 2H1DA 1GLQA 3UBLA 4D73A 3TJFA 2GDRA 1ZZYA 2DIZA 1G7EA 2I81A 3CXGA 2HZEB 2BJXA 2FY6A 3UIWA 2VAFA 2H6XA 4BL7A 1TK8B 2DJJA 3GTUA 1H4OA 1OC8A 2B5YA 4KSOA 2IMEA 4K6XA 4I6XA 1K0CA 2WCIA 2PVQA 1KTEA 4KSMA 1DBYA 2CQ9A 3TKSA 4DEJA 3GX0A 5G1KA 4BVYA 1GSUA 3F6DA 3ZVJA 5AIXA 3E3EA 3FR3A 3KCMA 4F0CA 5LD0A 3OR5A 1XWGA 3QR6A 1G6WA 5D9TA 4I5QA 1URMA 1PRXA 5G30A 2FHEA 3HJOA 3FKFA 3VPTA 2OBIA 4TR1A 2OJLA 4XS6A 6GSUA 4G19A 5AISA 5B8BA 1X9SB 4L0WA 3H1NA 1XCCA 1TRUA 2GQKA 3QAWA 2E2MA 2N5FA 3ME8A 1O85A 5ECNB 1Z6NA 4J2FA 3RHCA 3ZMKA 4HDEA 4NHWA 1T3BA 3LWAA 2DMLA 1GULA 1WJKA 2PPTA 5FT3A 2BTOT 4KB3A 2IFQB 3RBTA 2YV7A 2GQLA 1ZGNA 4D73B 2HFDA 1R5AA 4G10A 1GSSA 4ZL9A 5AGYA 3TKQA 2GZYA 3QFAC 2CVBA 5DVBA 1OKDA 2YZUA 2C1YA 1R5PA 2B3SA 3TJBA 3GTUB 3F6FA 3MAKA 1EWXA 1WP0A 2C0FA 3LG6A 3HDCA 1ABAA 3CYNA 4ZL7A 3GKNA 3BBYA 4F0BA 1GUKA 1UVZA 4MP4A 2PWJA 2MBSA 4LL1B 1TK5B 2C8UA 4I97A 5F06A 1F6MC 5CO3A 1GH2A 5DAKA 4ECBA 3G7IA 2QSIA 3D22A 5DCHA 3VWVA 1CQGA 2LTKA 4OCFA 3I43A 4MF5A 4NXIA 4TXVA 2L4QA 2J9HA 1FHEA 2HXKA 2YWIA 3LXTA 4PQ1A 3WD6A 5FHIA 4TR1B 2JZSA 2BMXA 1SK2A 5CRWA 3VK9A 1Y25A 3VWXA 2VL2C 1SKRB 3QAVA 4MK3A 1QQ2A 2F3MA 6GSXA 4N0ZA 2HRNA 4XS4A 5J5NA 3ZRDA 3EURA 1DUGA 1OE8A 2H8LA 4HEA2 5J9BA 2VL3A 5COHA 3TRQA 2H73A 6GSYA 4WKWA 1AXDA 5LNKe 1M7TA 3CMIA 1F37A 4TOPA 5ECRB 4TW5A 4EO3A 1NSWA 4K1FA 1SYRA 3PH9A 1S3CA 4V1Ag 5EPFA 3TJKA 2X8CA 5HR0A 1AQVA 1J0FA 1EV9A 2DC5A 2H72A 2M46A 5H5RA 3TKSE 18GSA 5KN2A 4ECCA 4EF0A 5DAKB 1PQNA 4K2DA 1FB6A 3RDWA 4MABA 3D4MA 2JSYA 1EOGA 2TRXA 2PUKC 2VM1A 1SJIA 2YN1A 2AUVA 2GZZA 2CX4A 2JACA 3M9JA 1ZYEA 1F3BA 1I9DA 1HD2A 1TRSA 2YCDA 1YJ6A 3IHQA 5D9WA 17GSA 7GSSA 5F0GA 5D96A 1GTUA 3MDKA 4AJ8A 4EKZA 5IMFA 4HZ2A 4Q5QA 1XWBA 4ZIJA 1W4VA 4JEDA 2FLSA 4XS4B 5EL8A 3GRXA 2MMNA 5HFGA 3IBHA 2B1LA 2CZ2A 4JR4A 5IMZA 4MA9A 5DJLA 3KM6A 4ML6A 3HHVA 3ZTLA 2LRTA 4ZBAA 4OCEA 3HVSA 4MDCA 3QMXA 2K6VA 5JCWA 4MJEA 2VLUA 2OKAA 2V6OA 3IDVA 3WT2A 1GSFA 1O73A 4F03A 4YQUA 3VLNA 2VCZA 2LRCA 4ML1A 3PR8A 3IR4A 3Q19A 4LMWA 3ZL5A 3ERWA 2L4CA 2H66A 3HVVA 1ERUA 4ZXGA 3HZ8A 1TW9A 5FWGA 3TB2A 2WZ9A 4JRRA 4GTUA 3TUEA 1XW9A 3GSSA 1GSQA 5DALA 2N5AA 3TKSC 1YDKA 3RHBA 3ZIVA 5C04A 3VWWA 3TKPA 1FAAA 1ERTA 3LFLA 2H1BA 2OADA 4XCSA 2R6KA 3GIXA 3FR9A 1XW5A 4FIWA 4TR3A 4POKA 4MZBA 3IAM2 2H01A 2C4JA 2YANA 5IO0A 2X64A 3P8WA 2E7PA 5IMCA 4RQRA 1GNEA 3HVXA 4O5RA 3O6TA 1HNAA 4TKYA 4BWQA 2DJKA 4IQAA 3KP8A 4MF6A 3ZREA 1FB0A 2O89A 3Q18A 3F3QA 2O8VB 5HR2A 2REMA 2FNOA 2EC4A 1PL1A 5LCZA 1GP1A 4KDXA 2XBIA 1QMVA 4X43A 3TDGA 3C73A 3A3TA 5ELAA 1A2LA 3GUSA 1EV4A 2O7KA 2AV4A 4NMUA 3KMNA 5IM9A 2WFCA 3P7XA 2VOCA 4O7HA 2IL3A 1MDKA 5AIVA 1DE1A 5E59A 1WWJA 4IVFA 1NHOA 2CV4A 3ISOA 5IQYA 4NV2A 2LNTA 2R4VA 4KNDA 5ECLB 1OKTA 3MNGA 1ACVA 4CW9A 1W89A 5JCUA 2JZRA 1S3AA 4POMA 5B6MA 2B1KA 1SL1B 5DALB 4GQFA 2YWNA 2O87A 3HD5A 3DRNA 2AHEA 1R7HA 1XPVA 5J3RA 4IBPA 4ZB6A 2V1MA 5F8BA 5DQYA 3U5RE 2PMTA 1QGVA 1PX7A 2YOIA 5JWRB 5ECQB 2B7KA 5B7CA 1OC3A 5A5KA 5ECPB 1QXHA 5KEJA 4F2IA 3PINA 20GSA 1U88A 4MJCA 2ZCTA 2ZUPA 3FYGA 4MF7A 4V1Ap 3FEUA 5DCGA 2CVDA 2GTUA 2H1AA 1R4WA 4L8EA 2R5GA 5HFIA 1M2BA 4O32A 1A2JA 1N2AA 5J4UA 1BYEA 3C7MA 2H75A 1TKDB 2OE3A 2PU9C 1FG4A 2GVPA 1GSEA 2M72A 3C1RA 1FW1A 2H71A 1SL0B 4HQSA 1UN2A 5ECKB 3FR6A 2GSRA 4MH2A 1SJ6A 4MPFA 1K3LA 2DJ2A 2H30A 3AY8A 1RK4A 1AQWA 4L5LA 4KX4A 1AW9A 3DXBA 3TJJA 2R37A 3CSJA 5DQSA 5C00A 3D5JA 5IMAA 4PQIA 2Z9SA 2IMDA 4TXOA 2DJ3A 2LRNA 2FD3A 1J9BA 2PERA 2H76A 3UJ1A 2EIOA 3FZ5A 4IHUA 2DSAA 1E6BA 4LL4B 4XRAA 3GKMA 3L9SA 2FWHA 2CX3A 3FZAA 5CRHA 5ABRA 5J9CA 4MMMA 3HY2A 1GUHA 2K8VA 4YQVA 1GUMA 2VUPA 4RQXA 2RM5A 2WRTA 3GMFA 1VGLA 3I69A 3PGTA 2K18A 4OFTA 5D93A 1SL2B 1BAYA 2QGVA 2B7JA 2DJ0A 4MZWA 2NTOA 1R26A 3L9UA 3UEMA 4ULXA 5G31A 1VF4A 5IMDA 3I9V2 3R2QA 1ERVA 4QL9A 2IPAA 3F9UA 5ECOB 3F63A 3BOAA 1ON4A 4F9ZA 5D8IA 1J08A 3A2WA 3APQA 2F8AA 3TOTA 2A2RA 1M9AA 1QUWA 4O92A 5CRGA 5IPGA 1T8EB 3D21A 4FYBA 5G5FA 2DJ1A 4WXTA 4HU9A 3W8JA 1GSYA 3UMAA 3KGKA 2CAQA 4TXOB 4AJ7A 1X5EA 2WS2A 2DIYA 3GNJA 2F9SA 5ECHB 2HNLA 4OD7A 3HYPA 3SWLA 2JSZA 3ME7A 4I2TA 1ZOFA 1K0NA 3LGCA 4MCUA 2YP6A 1GLPA 1OVNA 3F0IA 4GRFA 2R3XA 1USBA 3IOSA 4GSTA 3H79A 3WGEA 1OC9A 2JZTA 3DKSA 1F9MA 1WE0A 4MJBA 1EGOA 1BEDA 2YJ7A 2B5XA 5GSSA 4G2EA 1Z7RA 1ZYQB 3MWHA 5HR3A 1F2EA 5G2ZA 3FRCA 1PN9A 4AJ6A 3ED3A 3MSZA 2CAIA 1XBSA 1ILOA 3GKKA 1O81A 1YEXA 2KHPA 4ISDA 4K7IA 3VI7A 1B9YC 4H86A 2MMOA 3KTBA 5JWOB 3A2VA 4PXOA 4TR4A 2V41A 1WMJA 3DWVA 4IN0A 3D4TA 5E4WA 2DMMA 2H0IA 1NHYA 3US3A 3EWLA 1JFUA 4V2MA 4IKHA 1SJZA 1YKAA 2IMFA 2KLXA 1PMTA 2QKEA 4HJ2A 1YZXA 1LJRA 4OWYA 3UBKA 1K0MA 5DDLA 1I5GA 2I3YA 2MMAA 3EVIA 4DSSA 4IP6A 4OO5A 3IPZA 3C1SA 3F4RA 2NDOA 4FYCA 1IYIA 2F8FA 2V32A 4MLYA 4WR4A 4IW9A 2L6CA 5B6NA 1T4ZA 4ZILA 3QOUA 5J41A 4EL1A 2R2JA 1OC9B 5JWQB 4BVXA 1NM3A 3O76A 2A2SA 3IAS2 1Q4JA 3UL3A 5D73A 4KAEA 3KP9A 1T1VA 3H4KA 1JZWA 2IWTA 1M99A 4YH2A 1E2YA 3GV1A 4TN8A 2VLTA 4KDYA 3VI5A 3FY7A 4GF0A 1Z5YE 3TOUA 1AC1A 2WDUA 4EDYA 2QC7A 3EU3A 4YAVA 5A4UA 2OACA 3FZ4A 4ACSA 3GH9A 2G2QA 3WT1A 1V57A 2GSSA 3KTLA 1AIUA 3DVXA 3UAPA 1PD21 1ML6A 3LEFA 1O8XA 4G9HA 3BD2A 4EVMA 1EP7A 4IGJA 1CQHA 2LJRA 3WYWA 1X9MB 4XS1A 2GS3A 2WULA 3CRUA 4NV5A 2N5BA 3UARA 2VCXA 3IRAA 2LUSA 5CYYA 4X1UA 1AUCA 2JADA 4PGTA 3UVTA 2ALBA 2JL4A 2YWMA 4PUFC 1EP8A 5IIZA 1IYHA 4NPBA 1X5CA 2V2GA 4KUNA 4XHMA 3U6VA 4Q5NA 1OYJA 1B8XA 5D9XA 4QQ7A 2FGXA 4K8MA 1K0OA 1HQOA 3L4NA 4N30A 2YZHA 3E9JB 1F3AA 3IXRA 1GNWA 2GSTA 4BWSA 2NPBA 1MD4A 4OFNA 4MPGA 2DBCA 4Q5RA 4ILFA 3D0ZA 1RW1A 5ECSA 2RM6A 3C8EA 4K7OA 4BPYA 2KP2A 2L6DA 1HNCA 1KEBA 1XIYA 3BCIA 3ZZXA 2H0HA 2H19A 4E8HA 4YAPA 4I8BA 5GZZB 2VD0A 1MDIA 1B48A 3L78A 3QDNA 4X0XA 3APSA 3QAGA 3LSZA 3NOFA 3DVWA 1XW6A 1O6JA 1FVKA 3WGDA 1A8YA 3EMXA 3BJ5A 3KJYA 2WJUA 3FW2A 2GT5A 1ZMAA 1XOBA 1Y6EA 3GURA 1BG5A 3DMLA 4ZB8A 3EYTA 4EE0A 2GSQA 2YNXA 1YQ1A 1ZCPA 2RUFA 3M1GA 1QFNA 1VF3A 1QK8A 3IV4A 1THXA 2RUEA 3NZNA 2FWFA 3DGQA 2OE0A 2VCTA 4WBRD 4XTSA 5CP1A 3VURA 2C0GA 1A2MA 1HNBA 1YF0A 1EEMA 3GL3A 2CVKA 2O85A 2I9HA 2P31A 3RPPA 2HLSA 1YKCA 2C0DA 2C80A 1SK1A 2CZ3A 3ERGA 3GSTA 3WGXA 3ERFA 5ELGA 3GX8A 14GSA 4YQMA 3TCOA 3EC3A 5AN1A 3LYKA 2AYTA 2GZPA 3CSIA 2FA4A 4NWYA 1GL8A 4HU7A 2B5EA 1SU9A 3CRTA 4HZ4A 1EGRA 2EIQA 4N11A 1G7OA 4AF2A 2K9FA 4PQHA 4L5OA 4EUYA 5IO2A 4JR6A 1OE7A 2L57A 1KBNA 1GSDA 4ECJA 5H5QA 1JZRA 2VCWA 2J23A 3CSHA 4JE1A 1UA5A 4Z7XA 3H8QA 2C3NA 1V58A 2PBJA 5L71A 4GSNA 2LQQA 1U3AA 5HFKA 3ZYWA 3KH7A 1X9WB 10GSA 4J57E 4WF4A 2LS5A 5B8AA 1XWKA 2XPDA 2HRFA 1LU4A 1FVJA 1H75A 1UC7A 2XPEA 3UVHA 3HJPA 3ZMLA 3TJGA 4HS1A 4POBA 3KXOA 13GSA 4ZBBA 4EC0A 3QCPA 2P5RA 5DJMA 2ZNMA 2OA7A 1WIKA 3K8NA 2KOKA 2VLVA 2GQMA 4J56E 2AB6A 4TRXA 3LJRA 1K0AA 1XFLA 5ECIB 3GN3A 4TR0A 3ZFLA 3ZVJD 3EE2A 5IPHA 2HSYA 3KZQA 1T4YA 3F4TA 4V2LA 1XZOA 4ZL8A 3IE3A 4ID0A 4GSSA 5A4WA 4OMVA 5INYA 3KD0A 2TIRA 3C71A 1NW2A 19GSA 1Z3EA 5HR1A 5IOXA 3F3RA 3CTGA 2CA8A 2OE1A 2KUCA 3EU4A 3HZ4A 1A8LA 4KCAA 4WETA 2FCHA 3IA1A 1XXUA 1WPIA 2JU5A 4AGSA 1C72A 5D9VA 1PX6A 1JZDA 4POLA 3ZITA 5F07A 3FZ9A 2LJKA 1YY7A 3N5OA 4EXJA 2H70A 3JCML 3A5WA 5A4VA 3QD9A 1TJDA 2L59A 4V2NA 1GTIA 1M9BA 1M2DA 1GTAA 4IJ3A 3DD3A 2IMKA 3DYRA 3KEBA 5JCGA 6GSTA 2LEGA 4MH3A 3M3MA 2IMIA 2CT6A 1Q98A 2IIYA 2YWOA 4DSQA 2C0EA 4TVEA 4PUAA 3IC4A 2ON5A 2FA8A 4KW6A 5ENUA 6GSSA 4WBJA 2ON7A 1PKZA 3LORA 1M2AA 1SK0A 11GSA 2F51A 1XVQA 3HA9A 2I4AA 3VWUA 1DE2A 1BJXA 3HXSA 4MZCA 2H0GA 2XHFA 3V1WA 3KIJA 5EY6A 9GSSA 1ZL9A 1LBKA 3APOA 1K3YA 3LXZA 1MTCA 5ID2A 1V2AA 3G7JA 2LV3A 2VD1A 2NVLA 4Q5FA 1PSQA 5EVOA 1XOAA 4KE3A 1EOHA 2VCVA 3GL5A 3P90A 1BQ7A 1TRWA 1JLWA 3GYKA 2VL9A 3VFIA 1M0UA 3A2XA 3N9JA 4IP1A 2RIIA 3I6AA 2H6YA 1HYUA 4ZB9A 2VIMA 1TP9A 3M9KA 5IMVA 1TTZA 1X0RA 2H6ZA 1S3DA 4RI6A 2KP1A 1A23A 1N8JA 3QPMA 2FWEA 3CBUA 3P2AA 3ZIJA 1TOFA 4KGIA 3W6GA 1JLVA 1SYXA 1X5DA 1Z9HA 1V98A 4GQCA 2WB9A 3D6IA 12GSA 1K3OA 1TXXA 3W8SA 4WF5A 4LA1A 3IK7A 3EINA 2E2GA 1TU8A 2M80A 1AQXA 3GKXA 1O8WA 2FUG2 1SD9A 5KN1A 1SD8A 3GFKA 2HI7A 3QFBC 2GGTA 4K0GA 1U6TA 2VCQA 2X8HA 8GSSA 5KN0A 5GAND 2XC2A 1MEKA 5ID2B 2EIRA 2NBSA 1EEJA 1FO5A 22GSA 4PNFA 3J7Yk 4P3YB 4IJIA 5H5SA 1GTBA 2V6KA 4F82A 1O7UA 2MZCA 3HCZA 3M0FA 2AAWA 1XWCA 4JU5A 5CREA 1ST9A 1WRYA 3L9VA 4MJAA 3DEXA 4KA0A 4WR5A 4NAXA 2YJHA 5G5EA 5ECMB 4FO5A 4DSSB 1TI3A 2HYXA 1U87A 1KNGA 1SKSB 4OFMA 4KH7A 4IELA 2PVOC 2MYGA 2MMZA 1G0TA 3G7YA 3EMPA 4K9ZA 2HE3A 1PKWA 5CRDA 3GHAA 1TK0B 2YV9A 4GWRA 2LNSA 1XVWA 4CHSA 2X8GA 16GSA 4HJMA 4RI7A 6GSWA 2H74A 2LKUA 1TI1A 3TGZA 3J7Yb 1AAZA 1Z6MA 1YF1A 1B4QA 4L0UA 1TU7A 4ZBDA 1A0RP 1VF1A 3F4SA 2PGTA 2HZFA 2P5QA 1JHBA 1THOA 1GRXA 2FWGA 4HUAA 3E0UA 2TRCP 4HOJA 2C3TA 2I1UA 3BCKA 1G6YA 3HJMA 2GLRA 1TDIA 4LMVA 1U3IA 3RAZA 1T00A 5G1LA 2D2ZA 2WGRA 2XBQA 4FH8A 3KH9A 4DVCA 2YPMA 2AJQB 2C3QA 3G9BA 4GLTA 2H1GA 1PA3A 1XWAA 3UOMA 1EZKA 1OAZA 1SKWB 2L5LA 1V40A 2IN3A 5CNWA 1PL2A 2G0FA 2VL2A 3ZFBA 4JBBA 5F05A 2K8SA 1B9XC 1TRVA 3SBCA 5DBQA 1A0FA 2VM2A 3ZLPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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