4MH2A

Crystal strucutre of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
APAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEAHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
publication title Improved Catenated Structures of Bovine Peroxiredoxin III F190L Reveal Details of Ring-Ring Interactions and a Novel Conformational State.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 57
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mh2A00
1B4QA 1SK2A 1EEJA 4MF5A 3WGXA 1KBNA 3GH9A 1TRVA 4WBJA 2YOIA 3F6DA 5CRGA 2C3NA 1URMA 2DJ2A 2OACA 4NAXA 2LSTA 3ZIVA 2H0IA 1ABAA 1R5PA 3GUSA 5LD0A 2VCQA 1KEBA 1MDJA 4CW9A 2I1UA 1AQWA 5ECPB 5KN2A 2HXKA 5DDLA 2YWOA 2VLTA 4V2NA 5DJMA 4HJ2A 4G10A 2LJKA 3C1RA 2OE1A 5C00A 3UVTA 5GAND 1Z7RA 3KXOA 4IS0A 1PN9A 2VCVA 4MCUA 1R26A 5B8BA 19GSA 3TRXA 1TRSA 4HS1A 1HNCA 2IMDA 4HJMA 4IJ3A 2HZEB 3NOFA 3CXGA 4L5OA 2OADA 5ID2B 3QD9A 3ISOA 2LKUA 4L0UA 2J23A 5ECQB 5JWQB 1A0RP 1JZRA 4EXJA 3VK9A 3WD6A 5J4UA 4MZCA 1T4YA 5HR1A 1GLPA 2YJ7A 4ILFA 3U5RE 1MTCA 1V57A 1MEKA 4G9HA 3KMOA 4IVFA 4NMUA 1ZGNA 3D0ZA 2QKEA 4HEA2 3KP8A 1WE0A 1SJZA 3IC4A 1ZMAA 1YF1A 1MDIA 3EYTA 3A2WA 4HUAA 3M9KA 2GQMA 1X9WB 3WT2A 3EC3A 2GVPA 2WULA 4F82A 4V2LA 2H1GA 1I9DA 2CVKA 4JR6A 1LU4A 4KCEA 2O87A 4F9ZA 1IYIA 4MK3A 1K0CA 3IK9A 2MMZA 5IMFA 2IWTA 3L9UA 17GSA 1GUKA 3GL3A 1J9BA 6GSSA 3PINA 2WB9A 2YNXA 2M46A 1M0UA 3IPZA 3GKKA 4DVCA 14GSA 2AHEA 1OE7A 3LEFA 1E2YA 1BX9A 4XS6A 4I97A 5HR0A 2GSTA 1ILOA 5KN3A 4MA9A 3N9JA 1OAZA 3ZVJD 3TJGA 4HOJA 3D21A 1W4VA 5G5FA 3M3MA 1VF3A 2VAFA 4GWRA 2H0HA 1F9MA 1GTIA 3KH9A 4MLYA 4ZIJA 3D22A 3HJMA 2H66A 1TRWA 2GTUA 2OKAA 2GQLA 1K0BA 4P3YB 2N5AA 3E9JB 5ECRB 5ELGA 2MMOA 4O32A 3M1GA 3FRCA 1R5AA 1JZOA 4IELA 4N10A 4TVEA 3DXBA 1K0MA 3EURA 3RPPA 4AJ7A 1K3LA 5ECOB 1GSDA 3DKSA 5JCGA 4XCSA 5GSSA 4J57E 1ZOFA 1YQ1A 3KH7A 3G7YA 1T00A 4TW5A 3VPQA 5LNKe 1QK8A 4F03A 1PX7A 3HZ4A 1XWCA 3BJ5A 3QDNA 3H79A 3KP9A 4MH3A 4ZB8A 2CAIA 2A2SA 4IP1A 3O76A 2G0FA 2VO4A 2QGVA 2LQQA 2LQOA 2RM6A 3FW2A 4OD7A 1PMTA 2LS5A 3FHKA 2B1LA 2YJHA 3I9V2 1THOA 3ZTLA 1F3BA 1GSUA 7GSSA 4GCIA 1GL8A 1JZWA 2YZUA 2C4JA 4GSTA 1AC1A 1G6YA 3VURA 4EF0A 3VI7A 3TDGA 1QGVA 2CX4A 2C0GA 3TGZA 1QMVA 4POLA 1JFUA 3PR8A 1GSFA 3G7JA 1LJRA 4BVXA 4FYBA 1EGOA 3APQA 2L5OA 5CO3A 1SD9A 4ZBAA 4D73A 2H8LA 2K8VA 2ON5A 4POMA 2EIOA 2VL2A 2VCTA 3EVIA 5H5RA 2WGRA 3F4TA 2I4AA 3TJJA 1SL0B 2HRFA 4GSNA 5DCGA 2HNLA 4XS1A 1A2JA 2IN3A 4DSRA 1ON4A 3QOUA 5LCZA 1WWJA 1ERWA 2FHEA 1K0AA 3GH6A 1UVZA 1SU9A 3A2XA 1ZZYA 1OVNA 4DEJA 2ZUPA 2VM1A 1EP7A 2FWFA 3FY7A 1TTZA 3LQ7A 2YWMA 3F4RA 4J56E 3RBTA 1OC3A 5G1KA 4L0WA 2E2MA 5G31A 2IIYA 2H76A 2AB6A 4ECBA 2ON7A 2O89A 1S3CA 4GQFA 5G1LA 1YEPA 1I5GA 5IPHA 2FA4A 5DAKB 2EIRA 2YV7A 1GUHA 2MBTA 2KLXA 2IMFA 1XW6A 3UVHA 1PGTA 1ZL9A 1XBSA 3DRNA 2NPBA 4K0NA 4XS4A 4K7NA 4YQVA 1GP1A 2WCIA 1GLQA 1SJ6A 2OBIA 3HVXA 3IAS2 4MH2A 5KN0A 1T7PB 3IE3A 2R2JA 3F3RA 4BVYA 3HY2A 4FYUA 4OFTA 4WF4A 3HDCA 2N5BA 1GUMA 3IRAA 4LA1A 1H4OA 2K9FA 3GKMA 4I8BA 5L71A 4JRRA 12GSA 1Z6MA 2CAQA 1LBKA 2TIRA 2PBJA 3APSA 3IBHA 1K3OA 1XZOA 2AV4A 1SKRB 2H74A 5CAXA 4NHWA 1EZKA 1CQHA 2P0GA 4MF6A 5A4WA 1O8XA 4PURA 2FGXA 4EUYA 5J9BA 1PD21 4TOPA 4K8MA 4EDYA 1QQ2A 2HZFA 1TKDB 4DSSA 4QQ7A 2L4CA 4QL9A 4YAPA 4MZBA 3EE2A 1XWBA 5ABRA 4POBA 4GF0A 1M2DA 1SK0A 1TK5B 3KGKA 5FT3A 2CZ3A 2DJJA 4PQ1A 2YPMA 5EL8A 1SKWB 3ERFA 2KOKA 2LRTA 3ZFLA 1XVWA 4K0GA 5C04A 1PKWA 5DVBA 2V32A 4NHZA 1Q98A 3FR3A 4XHMA 1UA5A 2V2GA 1K0OA 3DVWA 2OBKA 20GSA 1YEXA 4JR4A 4O7HA 2NBSA 1EOGA 3EMPA 4Q5NA 3AY8A 2JZTA 6GSWA 5KEJA 2YV9A 3KIJA 1XFLA 3CMIA 2DC5A 1BAYA 1HD2A 4NXIA 3Q74A 1OC8A 1SD8A 2FY6A 3GKXA 1B9XC 4ZL8A 2GQKA 2C3QA 5D8IA 1V40A 5HFGA 4K7IA 4GTUA 3IXRA 2DLXA 2H01A 2K6VA 2OE3A 5J5NA 3D6IA 4GQCA 2DMLA 4F0CA 3HJPA 1Z6NA 3L4NA 3GTUB 4N30A 4ZL9A 3RAZA 3GSSA 2M80A 1AXDA 2B7KA 4KUNA 1U6TA 4TR4A 4NPBA 5JCWA 1FAAA 1BJXA 3IHQA 2MMNA 1ACVA 5DBQA 4NWYA 4XTSA 1C72A 3UARA 1XCCA 3W8JA 3LG6A 5A5KA 2DJ1A 3F8UA 2X99A 4IW9A 2H6ZA 1E6BA 1O8WA 3VPTA 2VL3A 1AW9A 5CNWA 2PVQA 2REMA 2QSIA 1QFNA 5JWRB 5A4VA 3DEXA 4Q5QA 4KDYA 3KZQA 3TJBA 3TKSA 3TKRA 1U87A 1A8YA 2YCDA 3KCMA 1GNEA 1FVKA 1Q4JA 3CTFA 1TDIA 1MDKA 4ZXGA 1GRXA 3FZ5A 4QL7A 1HQOA 3GKNA 4Q5RA 3QFAC 2RUEA 3BCKA 1BYEA 1XW5A 1SKSB 3L9VA 2DIZA 3P2AA 2VCWA 4ML6A 1NSWA 2C3TA 1AAZA 3ZYWA 3CSHA 1WMJA 4PQIA 2QC7A 3TKPA 3TJKA 3IDVA 1TJDA 2F8AA 3Q19A 2VOCA 3ED3A 1ZCPA 4IQ1A 4FH8A 1UC7A 1KTEA 5IMVA 1Z5YE 2IFQB 3HJOA 5IO2A 2BJXA 1T1VA 3M8NA 4MMMA 2JU5A 2H73A 2C0EA 1X9MB 1GSSA 4KGIA 3SWLA 5IQYA 5IM9A 5DQYA 5E59A 4V1Ag 4JU5A 2OA7A 4GSSA 1K0DA 2H0GA 3IAM2 3GURA 3WGDA 5D96A 4ECIA 4K6XA 3TJFA 3VLNA 2MZCA 3TUEA 4BA7A 3TCOA 1ERUA 2V6KA 1A8LA 1EGRA 4MZWA 2H1DA 5AISA 1AIUA 5AGYA 1O81A 4JZQA 4V2MA 3KD0A 4OCEA 1PL1A 2B5EA 2VL9A 4CHSA 4MJEA 5EY6A 3UBKA 4ZILA 2E7PA 4TXOA 4CDOA 3ZVJA 3N5OA 5DQSA 1N2AA 5HR3A 4WEYA 1TOFA 3QR6A 3DVXA 1TW9A 2HI7A 10GSA 3CTGA 3RHCA 4YAVA 2JSZA 6GSVA 3EINA 1EOHA 1ML6A 4LMVA 5IMAA 3GL5A 2XPDA 1RW1A 2LRCA 4WETA 1G7OA 1OYJA 3VWXA 5D9TA 3GX0A 3NZNA 5COHA 3C7MA 1B48A 3HA9A 4TR1B 1XWGA 2XC2A 5G5EA 2DJ0A 2LEGA 2F3MA 3BD2A 1WPIA 2B5XA 1TRUA 1YKAA 2B6MA 4J2FA 3MAKA 4KSOA 2GZZA 4MF7A 1EP8A 4MJAA 1YY7A 2GSSA 2C0FA 2ZCTA 5E4WA 1X9SB 3TOTA 3LYKA 2FD3A 4Q5FA 6GSYA 3E3EA 4IP6A 1TP9A 4BL7A 2F8FA 4K1FA 2XBQA 4OMVA 1Z7PA 5DAKA 5EVOA 13GSA 2G2QA 2YWIA 2PPTA 5AIXA 1PX6A 3D4TA 1SJIA 4FYCA 3GA4A 3BOAA 4OFNA 3C71A 4ECCA 1FW1A 1R7HA 1O6JA 4IHUA 1V58A 2VM2A 5GSTA 3QCPA 3QAVA 1M9BA 1SYRA 2XBIA 3D5JA 4IKHA 2CQ9A 3FEUA 5H5SA 4WR5A 4OWYA 3F3QA 1J08A 1Y25A 16GSA 4PXOA 2NDOA 5CRWA 2CVBA 3RPNA 3GX8A 3APOA 3DYRA 1O85A 1B9YC 3VI5A 2H70A 1M2AA 5GAPD 5IIZA 2RUFA 2LTKA 1FO5A 2VUPA 1WP0A 2R4VA 2AUVA 2YANA 4ML1A 3UBLA 2IMKA 22GSA 3I69A 5GZZB 3VFIA 1SL1B 4KX4A 3TB2A 4HQSA 4D73B 5J41A 3DD3A 4KSMA 4EDZA 3GNJA 4LMWA 1A2MA 4KB3A 4KE3A 1S3AA 4IBPA 5EPFA 4KCAA 4TRXA 5ECLB 2TRCP 4PGTA 1YJ6A 2K18A 3ZITA 1ERVA 1OE8A 3BCIA 2AJQB 3UAPA 3V1WA 2RLIA 3MWHA 5D9VA 5ECNB 1ST9A 2ES7A 4AJ8A 5IOWA 1GSYA 4HQZA 1X0RA 4KAEA 4LL4B 3C8EA 2L4QA 6GSTA 4L5LA 3HCZA 3PH9A 5D9XA 3MDKA 5IPGA 2ALBA 2H19A 2DIYA 2V6OA 3UL3A 4FO5A 1DUGA 4KDUA 1SENA 3UIWA 3CSJA 2WFCA 3U6VA 5ECSA 5DALB 2A4VA 2L6DA 4MJBA 2C80A 1PSQA 2H1BA 4K9ZA 3TOUA 1SL2B 3J7Yk 4ZB9A 1TI1A 3KTBA 2X8GA 2C8UA 1NHOA 1T4ZA 1A2LA 2PN8A 1AQXA 2JL4A 4N0VA 3LWAA 1OKDA 3QAGA 4K7OA 5G2ZA 4EE0A 3OR5A 1CQGA 1GTUA 4MJCA 3GRXA 3GTUA 5HR2A 1TU8A 3WT1A 3PGTA 3JCML 1OC9B 2X8CA 4H86A 4KH7A 2HYXA 1H75A 4WXTA 4NV2A 2X64A 1YDKA 3W8SA 4V1Ap 1M99A 3Q6OA 5A4UA 3KM6A 1A24A 5DCHA 2VL2C 1V2AA 2JSYA 5DJLA 1RK4A 3SBCA 1TK0B 4L8EA 3ZMLA 4YQMA 3TKQA 3KTLA 4ISDA 2HZEA 3I43A 3IK7A 5ID2A 2GZYA 5IMDA 3LYPA 4FIWA 1NM3A 3Q18A 1YZXA 2FWHA 2MYGA 1FB6A 1JZDA 1J0FA 1O7UA 2CX3A 4LL1B 3L9SA 1U88A 1XWAA 4X1UA 3GIXA 1WIKA 2GGTA 2HSHA 2CZ2A 4NV5A 2PVOC 1G0TA 2O7KA 1G7EA 1WJKA 3GHAA 4X43A 2K8SA 5G30A 3US3A 4GLTA 3ME7A 3LORA 3RHBA 3R2QA 4I6XA 2V41A 4Z7XA 3ZIJA 1F37A 4XIHA 2WJUA 3CSIA 3F63A 3FKFA 2GSQA 3QPMA 3E0UA 1BQ7A 1X5CA 2CA8A 1EEMA 2GS3A 3LGCA 2PERA 1PRXA 3ERWA 4RQXA 1ZYQB 2HE3A 2HLSA 2IFQA 2BMXA 1VF1A 1F3AA 2P5RA 1USBA 1VRSD 2FWGA 1PL2A 2LV3A 1TK8B 2JADA 3H4KA 4I2TA 2L6CA 2LUSA 4LLRA 5ECMB 1N8JA 3ZRDA 6GSUA 2YP6A 5D93A 3HD5A 1XXUA 2CV4A 2NVLA 2DBCA 3VWWA 2H6XA 3NIVA 3GV1A 3CBUA 4BWQA 2FUG2 3QMXA 4YQUA 4BWSA 3VWVA 5ENUA 2LJRA 3IV4A 4OCFA 1Z9HA 3FZAA 4MP4A 4BPYA 1A0FA 1RQMA 2A2RA 1GNWA 1JLVA 1UN2A 2YN1A 1YF0A 4RQRA 2IMEA 2L5LA 3FZ9A 1NHYA 5F05A 3ZREA 5H5QA 4TR0A 3O6TA 3FR6A 5CYYA 4YH2A 4MABA 3H93A 2B7JA 2IMIA 4AJ6A 1V9WA 3P90A 1BG5A 4MPFA 1VF4A 1T8EB 1ZYEA 4HU7A 4PQHA 2VIMA 5AIVA 3GYKA 2HT9A 4MDCA 4AF2A 2O8VB 3HHVA 1K3YA 4POKA 2H75A 2NTOA 2RM5A 1EV9A 4I2UA 3LXZA 1X5DA 3UMAA 4N11A 5INYA 1FG4A 1M9AA 1GTAA 2CVDA 3ZFBA 4GRFA 4WKWA 4HU9A 4XRDA 3KEBA 4PUFC 4WF5A 4TR1A 1ERTA 1X5EA 2B1KA 2IPAA 3FR9A 1JHBA 5ECHB 4EC0A 4KA0A 3UJ1A 3P8WA 4HI7A 1DSBA 2FLSA 4RI7A 2KP1A 1JLWA 3H1NA 1B8XA 2GSRA 1U3IA 5B6NA 2YWNA 3ZL5A 4AGSA 4K2DA 5KN1A 6GSXA 3M0FA 1HYUA 2L59A 1T3BA 1VF2A 3ZLPA 4E8EA 3A5WA 5CP1A 1HNBA 1B4PA 2YZHA 3IA1A 1F2EA 2H71A 1XPVA 1THXA 2EC4A 2Z9SA 2C0DA 4X0XA 2LRNA 3WYWA 3GSTA 1V98A 2WRTA 3GN3A 3EMXA 1SK1A 2GT5A 2F9SA 2VCXA 1XW9A 2GT6A 2X8HA 3LXTA 4TR3A 4ZBDA 1EWXA 5B6MA 3HZ8A 3LJRA 3EU4A 4WR4A 2O85A 3LFLA 2LJAA 2KP2A 3G7IA 3ME8A 3QAWA 1XIYA 2AYTA 2KHPA 3L0HA 2JZSA 2P31A 2H1AA 2B3SA 2WZ9A 1QXHA 2RIIA 1KNGA 4O92A 5F06A 1PQNA 1GH2A 2XPEA 1AQVA 3DWVA 3WGEA 4TXOB 5FWGA 2LNTA 1OKTA 2D2ZA 18GSA 4RUVA 2I81A 5HFKA 1GSEA 2LNSA 4G2EA 2I3YA 1XWKA 1MD4A 4O5RA 3W6GA 3HVSA 3TKSC 2DSAA 4HDEA 3M9JA 2F51A 3TRQA 1K0NA 4IGJA 2FNOA 3GFKA 3FYGA 3EWLA 5IMCA 3S9FA 11GSA 4IN0A 1R4WA 5IMZA 1F6MC 1BEDA 4EKZA 4N0ZA 1Z3EA 4TN8A 4ZB6A 4IQAA 2PU9C 5ECIB 2WDUA 3IR4A 3HKRA 5JWOB 4F2IA 1DE2A 2HFDA 4TKYA 1XOAA 5D9WA 4ECJA 1FB0A 4DSQA 1G6WA 2H6YA 4TXVA 1AUCA 1PA3A 3MSZA 4KDXA 3TRPA 2MBSA 3HXSA 2R6KA 4PNGA 1GWCA 3G9BA 2DJ3A 1FHEA 2L57A 3CYNA 1M7TA 2B5YA 1IYHA 4I5QA 3LSZA 5AN1A 2TRXA 3KJYA 3ZZXA 2CT6A 2DMMA 5D73A 3ERGA 2VD0A 4RI6A 5DALA 2IL3A 3K8NA 1HNAA 1M2BA 2AAWA 3L78A 5ELAA 5CRDA 4PNFA 4PUAA 4F0BA 2PMTA 1DE1A 3KMNA 4IJIA 3J7Yb 2VD1A 3EU3A 3F9UA 4ZBBA 3UEMA 2R3XA 4HZ2A 3H8QA 4ACSA 4JE1A 4ID0A 3BBYA 4JBBA 1FOVA 2R5GA 1GTBA 3DGQA 4KW6A 5B8AA 1W89A 4XRAA 1GSQA 4HZ4A 3F4SA 4EL1A 5F0GA 4OFMA 1QUWA 2E0QA 3RDWA 3HYPA 1OC9A 3CRUA 2JZRA 3MNGA 3HVVA 5J9CA 4GXZA 2PUKC 2PGTA 5F07A 2GLRA 4EVMA 1PKZA 2FWEA 1DBYA 2VLUA 3D4MA 1MD3A 1EV4A 1XVQA 1TI3A 4EO3A 2R37A 4MPGA 1U3AA 2EIQA 3C73A 1A23A 2V1MA 2J9HA 3F6FA 1VGLA 2VCZA 5B7CA 1Y6EA 3A3TA 5ECKB 3VWUA 5FHIA 3TKSE 2N5FA 3FK8A 2M72A 4JEDA 4ULXA 1XOBA 4XS4B 3GMFA 2OJLA 3C1SA 2MMAA 2HRNA 2PWJA 2H30A 3O3TA 2P5QA 4OO4A 5CREA 3ZMKA 2KUCA 2DJKA 9GSSA 3I6AA 3IOSA 1WRYA 2IJYA 5IOXA 5HQPA 1YKCA 1GULA 2H72A 4OO5A 3QFBC 2FA8A 2HSYA 3P7XA 2OE0A 3DIEA 4KNDA 4G19A 2E2GA 8GSSA 5JCUA 2JACA 5CRHA 3UOMA 3CRTA 2ZNMA 1WOUA 4PX1A 1O73A 1NW2A 2BTOT 2GDRA 3F0IA 1FVJA 3DMLA 2VLVA 1SYXA 2WS2A 1TXXA 3A2VA 2C1YA 5HFIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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