4O5RA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit c from e. coli
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords AhpC component, subunit of alkylhydroperoxide reductase
publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 45
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5rA00
1GL8A 4PXOA 3EE2A 2DIZA 5FWGA 1M9BA 3A5WA 1T00A 3EMXA 4TR0A 1F9MA 2IWTA 3VI5A 4XRDA 2GSRA 1XW5A 1J0FA 1ABAA 2GS3A 4NAXA 6GSWA 5KN3A 4POKA 1I5GA 4PURA 3LGCA 2H1DA 3VWVA 1T4ZA 4TRXA 1TK5B 2I3YA 3U5RE 5DVBA 2H72A 2C0EA 3PGTA 2F8FA 1AQWA 1MDIA 2YCDA 4FIWA 5ID2A 1Z3EA 1Z7PA 2C8UA 4MJEA 2F51A 2FD3A 1RQMA 2R6KA 2V6KA 3HJPA 3TJBA 1YF1A 1XW9A 1FW1A 1EGOA 1GUKA 3Q6OA 4NHWA 2DJ3A 3VK9A 4EDYA 3IOSA 4ULXA 3QCPA 2CAQA 3KH9A 2R37A 1TRSA 2ALBA 2L57A 11GSA 1O8WA 2YWOA 2GDRA 3GURA 4WF4A 3ZZXA 4IHUA 1BX9A 2B3SA 1URMA 2M72A 4K7OA 2GVPA 3G7YA 3JCML 1TRVA 2EIRA 3EYTA 4EXJA 2H0GA 1SYXA 5IQYA 3DVWA 5B6MA 1O8XA 4V1Ag 1O85A 3L9UA 5JCWA 14GSA 2CVBA 2L4CA 4TOPA 3C71A 3FYGA 3HXSA 1THXA 3UJ1A 4LLRA 3ZVJA 2XHFA 3APSA 1PL2A 5F05A 1HYUA 1T4YA 2QGVA 3S9FA 1TK0B 3DMLA 3GTUA 4AJ7A 1OAZA 2CV4A 4ML1A 2R3XA 2HNLA 3ZYWA 2XPDA 2B7JA 1MTCA 5DAKB 3GN3A 2K8VA 1V2AA 3CSJA 2HLSA 3I43A 2DJ2A 5HFIA 2FY6A 5IO2A 1A2MA 4AJ8A 2PUKC 2NVLA 3F63A 1GP1A 2GT5A 1BQ7A 2JU5A 3H1NA 1U3AA 3F9UA 3KM6A 3P90A 3TKQA 2RM6A 3RBTA 1MDKA 4KCAA 4X1UA 1SENA 2AHEA 3IRAA 5CO3A 2GSTA 4O32A 3IAS2 1F3BA 1GNWA 4F9ZA 3LWAA 3D21A 2B7KA 4WR4A 1TP9A 1GTIA 1BEDA 2JADA 2P5RA 4JRRA 2VL9A 1EV9A 3ISOA 3M0FA 2OE1A 1AW9A 4OCFA 6GSUA 2N5FA 4HUAA 3VWWA 5B8AA 2L6DA 19GSA 1OC9A 1U3IA 1DE1A 5D8IA 2WCIA 2XC2A 1SK1A 12GSA 1USBA 3VWXA 2DJKA 5D9VA 4GRFA 2B6MA 2NDOA 2WJUA 1VGLA 5AISA 1TDIA 4TXOB 3P7XA 5COHA 3L0HA 1GSFA 2FA8A 1S3DA 4HS1A 1OE8A 4MZCA 2IIYA 1ON4A 1QXHA 3QOUA 1V98A 3HJMA 4K7IA 1ZCPA 2WDUA 3L4NA 4KA0A 3D6IA 3HD5A 4ILFA 4XHMA 4CHSA 1OE7A 1FO5A 1X9MB 2LJRA 1VRSD 1O81A 5J3RA 5ECNB 4IBPA 4F03A 4KAEA 1T3BA 1GLPA 2C3TA 2P5QA 1R5AA 2HYXA 2K9FA 3RHCA 3LYPA 2WULA 3I6AA 3TKSC 1JLVA 1XVWA 3KCMA 3N9JA 3FR3A 5GSSA 3F6DA 2LJAA 1QFNA 4OO4A 1HD2A 2VL3A 3BD2A 3N5OA 1MD3A 1A8YA 4WETA 5HFKA 2GSQA 4ZILA 3NZNA 3ZITA 1YJ6A 2BJXA 2IN3A 1F3AA 1VF1A 2G0FA 4D73B 4KW6A 2OE3A 3UVHA 2EIQA 4NWYA 2H70A 2FWFA 2HZEB 4AJ6A 2CA8A 3J7Yk 3QAVA 2LSTA 2VCZA 3LXZA 2LNTA 2VO4A 2A4VA 4I2TA 1GUMA 3LQ7A 2MMZA 4POBA 3SBCA 1K0DA 3IV4A 1PX6A 3IK7A 3ERWA 4PX1A 1XFLA 5HFGA 5B7CA 2AJQB 4KX4A 4GQCA 2Z9SA 5DJLA 2VCTA 4ZB6A 4I6XA 2H01A 3KH7A 4YQVA 3CTFA 1ILOA 1LBKA 2FWGA 2V41A 4EE0A 3CTGA 4DSSB 3VPQA 2HI7A 2YV9A 2HRNA 2DBCA 2E2MA 3TKSA 1FVKA 5IMVA 1SL1B 1WPIA 2V32A 4FYUA 4MF5A 4TKYA 5EVOA 18GSA 4MF7A 4MJCA 4DSRA 1BYEA 1W4VA 2VM2A 1XWAA 2YJHA 1OKTA 4Q5QA 3UL3A 1K0CA 5DAKA 3TGZA 5ECHB 1GSYA 3ZMLA 3GH6A 3LJRA 4V2NA 2CX3A 4K7NA 2R5GA 1M7TA 2VLVA 1BG5A 2NTOA 4ZL9A 2G2QA 3TJKA 5G1LA 1TKDB 5AIVA 2TIRA 5IO0A 4ZB8A 4ACSA 1QGVA 1YKCA 2YWNA 2PU9C 3IHQA 3QD9A 2H76A 4HI7A 4RI7A 4N10A 2M80A 3H8QA 2IMIA 3HVXA 3A3TA 3D4MA 1ERVA 2PMTA 4LA1A 1PQNA 2LQOA 1X9WB 1TRUA 2FHEA 2FWEA 3EWLA 2DIYA 4JE1A 3IPZA 2LEGA 3VURA 3WGDA 1CQHA 4KDYA 4ZBDA 1Z9HA 4MF6A 4P3YB 3ZL5A 3TB2A 1JZOA 1XCCA 3J7Yb 5DALB 2C3NA 5ELGA 2H0HA 4ZIJA 1XBSA 3IAM2 4PQHA 4G9HA 2J9HA 3GA4A 3Q19A 4HQSA 5A5KA 4TXOA 5HQPA 4MH3A 4ZB9A 2VAFA 2K8SA 2V2GA 1JZRA 1UN2A 2XPEA 5A4UA 1B4PA 4MABA 1ST9A 1WIKA 20GSA 3FZ4A 2IFQB 3F4TA 4L5OA 5DBQA 3PH9A 4CW9A 1GUHA 1WOUA 4EUYA 3VPTA 3HA9A 1J9BA 3IBHA 1XWCA 2BMXA 2YWIA 5J9BA 1SJIA 3GL5A 2QC7A 1NM3A 4IJ3A 3ME8A 5IMFA 2H75A 4XS6A 4XRAA 4IVFA 1SJZA 2OA7A 5DQYA 4KSOA 4H86A 2H1GA 3IK9A 3WT2A 5FHIA 3IA1A 2R2JA 3EC3A 3TUEA 3CRUA 3KMNA 2VCXA 1GTUA 5A4WA 13GSA 4BVXA 3FR9A 5H5SA 3FK8A 3R2QA 4MZWA 4WBRD 3E3EA 5DJMA 2GQMA 3M9KA 4RUVA 5AGYA 2EIOA 2GSSA 5IMZA 3M1GA 3G7JA 4EO3A 3CBUA 1T8EB 1FG4A 2IMKA 2LRCA 1I9DA 3TJJA 5GAPD 2HZEA 1T7PB 2WGRA 1R4WA 1TTZA 4NV5A 4X0XA 3QMXA 3DVXA 3CRTA 2YZUA 3LXTA 1EEMA 4OCEA 5D96A 2H19A 2ZCTA 1WE0A 3GSTA 2XBQA 2LUSA 5JWRB 3QR6A 2H1BA 1N2AA 3F0IA 1GWCA 4ZL7A 4KDUA 2J23A 4PUAA 1PGTA 4KH7A 7GSSA 2C0GA 2C80A 1LJRA 4WF5A 3KIJA 3RHBA 3EU3A 3QFAC 3HCZA 1Z6MA 1WP0A 5J41A 4NV2A 5GSTA 4GLTA 1G0TA 3CXGA 5EPFA 4MDCA 3KP9A 4DSSA 5ECIB 2B5EA 1NW2A 4KB3A 3ERFA 4ZXGA 1B8XA 2WZ9A 2DSAA 2IMDA 3E9JB 4G2EA 1NHOA 1WMJA 1PMTA 3GKNA 2O7KA 2OBIA 4KCEA 1X5DA 1BAYA 1S3CA 4MK3A 3QDNA 1VF2A 2H1AA 2IPAA 3C73A 2JZRA 2KLXA 2O89A 2ON5A 3Q74A 2HSYA 4WBJA 3KMOA 3F3QA 1B4QA 2V1MA 3VI7A 1ZYEA 4MJAA 4EC0A 2X8GA 1PKZA 4J2FA 2ES7A 4MPGA 3OR5A 2N5BA 3DWVA 10GSA 4K6XA 3FY7A 4YQUA 4EVMA 5CRWA 4GQFA 3FHKA 2C0FA 5G2ZA 2WRTA 2RM5A 5JWQB 1PA3A 3NIVA 2L4QA 1RW1A 4HDEA 4N0ZA 3VLNA 3GKMA 1M99A 1XWBA 3EVIA 4NPBA 1EGRA 1Q4JA 3TKPA 2H30A 3ZREA 4ML6A 4NMUA 2JACA 5CAXA 4L0WA 5DALA 2YPMA 3KTBA 4IKHA 5A4VA 4GF0A 3FKFA 3D5JA 3CSHA 4KNDA 1OKDA 1A23A 2KUCA 5IMDA 1V57A 3UBKA 5DDLA 2FNOA 3EINA 2I81A 3PINA 5F0GA 4GSNA 5ELAA 4MJBA 1TU8A 1OYJA 1GH2A 5AIXA 3UEMA 4ISDA 2GQLA 5G5FA 3KJYA 1DE2A 3TRXA 4ZBBA 3BOAA 3IDVA 4XS4B 4NXIA 3WT1A 1GLQA 1TXXA 2IJYA 4MP4A 3TOUA 2I9HA 2H74A 3HVSA 4N11A 3LYKA 1SK0A 5IM9A 4OD7A 2L5OA 3O3TA 2K18A 2WB9A 2OBKA 2H8LA 2LV3A 4GCIA 5E59A 1ERTA 3HVVA 3W8SA 2CVKA 2VLUA 1B9YC 1THOA 4AF2A 2PPTA 4RQXA 2BTOT 5CRHA 4POLA 2PVQA 2IMFA 4F82A 5D93A 4AGSA 3GV1A 4X43A 2JZSA 1SKRB 6GSVA 2IMEA 1A8LA 1FHEA 2VM1A 4POMA 1F37A 3IE3A 1PSQA 2AAWA 6GSSA 3C1RA 4TR3A 1A2JA 1Y25A 3WGEA 2YANA 3HHVA 4EL1A 3GKKA 2IL3A 1YF0A 2YV7A 1DUGA 1O7UA 1ACVA 2JSYA 5LNKe 2LRTA 3L9VA 4ZL8A 3ZMKA 4O92A 1YKAA 3HKRA 4O7HA 4RQRA 1M2AA 4ID0A 3LORA 4DVCA 1YQ1A 3LEFA 2X64A 2O85A 3H93A 2MYGA 2MBSA 2PBJA 1GSUA 2B5YA 2DC5A 4KSMA 4KE3A 1EZKA 1JLWA 3UVTA 4N0VA 3ZTLA 3K8NA 1U6TA 4V2LA 3SWLA 3AY8A 1SL2B 3BBYA 2LJKA 3EU4A 1AAZA 1OVNA 1R26A 2CVDA 3GRXA 2RIIA 4KUNA 2MZCA 2LKUA 4WEYA 2LS5A 1XPVA 1IYIA 4L0UA 3IR4A 1QQ2A 3LSZA 3FW2A 3P8WA 3O76A 3FR6A 5L71A 1Z7RA 2DMLA 3KP8A 2YJ7A 1IYHA 1ML6A 3WGXA 3ERGA 2DMMA 4FYCA 3TKSE 1G7OA 5J4UA 3A2XA 1HNAA 1YY7A 4JEDA 1K0MA 5G5EA 3BCKA 1YZXA 2VOCA 3FZAA 4V1Ap 3HZ4A 4K1FA 2YWMA 5GAND 2OKAA 2DJ1A 4YAPA 3FZ5A 3RAZA 2FWHA 4MZBA 5DQSA 2QKEA 4BVYA 3FRCA 3FZ9A 5B6NA 5INYA 4WXTA 5IMCA 2ZNMA 4IN0A 1CQGA 1ZGNA 1XOAA 2WFCA 3H79A 4XIHA 4O5RA 4HEA2 4IGJA 3EMPA 1NSWA 4Z7XA 2YN1A 4PUFC 5D9XA 2XBIA 3TJFA 1Y6EA 5ECSA 1ERWA 5GZZB 2TRCP 1VF3A 2VD0A 4IJIA 4EDZA 1V40A 2VIMA 1K0AA 4K0NA 2F3MA 3DYRA 3KGKA 4MPFA 4TN8A 2CAIA 2L5LA 4BWSA 2WS2A 3DGQA 5IPHA 1PKWA 3H4KA 2DJ0A 4PQIA 4ECIA 2YOIA 5CNWA 3VWUA 3V1WA 1V58A 4TXVA 5HR3A 1XWKA 3PR8A 1EOGA 1MDJA 4BA7A 3ED3A 1OC3A 4IP1A 1V9WA 2H66A 1A2LA 1SKSB 4HJ2A 3U6VA 2VUPA 1GULA 1KTEA 4OO5A 2FA4A 3HDCA 3ZFBA 2H0IA 1H4OA 2B5XA 3ZIVA 2RUFA 3EURA 2PERA 1EEJA 1T1VA 1GSDA 2FGXA 2P31A 5ECLB 4JZQA 1ZOFA 4K9ZA 2LRNA 2MMAA 1PD21 2RUEA 4IS0A 1X9SB 4LL1B 4MH2A 3G9BA 1A0FA 4JR4A 4BWQA 1F6MC 4Q5NA 1AXDA 1E2YA 2E7PA 2X8HA 3C7MA 2L59A 3ZFLA 16GSA 4XCSA 3P2AA 3KD0A 4F0BA 5ENUA 1PL1A 1WJKA 1XZOA 2L6CA 3CMIA 4KDXA 4ECJA 4IW9A 4IQ1A 1K3YA 3LG6A 5AN1A 4F2IA 1BJXA 2HE3A 3M9JA 1OC8A 4D73A 4XS1A 4PNGA 1K3OA 5C00A 4OMVA 2F8AA 1UC7A 3DKSA 1JFUA 1FOVA 5DCGA 2LQQA 3IC4A 2B1LA 4MA9A 2GZYA 3L78A 5HR2A 3I9V2 2FLSA 3TJGA 5EY6A 1FAAA 5CREA 5IMAA 1GNEA 2O87A 3DRNA 1K0OA 22GSA 1FB0A 2A2RA 3ZRDA 4FH8A 5D9WA 2GGTA 4MMMA 1SJ6A 3TDGA 1E6BA 2H73A 4HOJA 2ON7A 1EP7A 3APQA 3GX0A 1ZZYA 1SD9A 1LU4A 2P0GA 5E4WA 2GTUA 3IXRA 3QAWA 4TW5A 2H6YA 5KN1A 1RK4A 2HZFA 5CYYA 4TR1B 5G30A 4IP6A 3GHAA 6GSYA 1JZDA 5G31A 4IELA 2HFDA 2DJJA 2ZUPA 1M0UA 3MNGA 1B9XC 3D0ZA 3GSSA 4HZ2A 1EV4A 5J9CA 2H6XA 1K0BA 3DD3A 4YAVA 3ZVJD 3HZ8A 2A2SA 5ECMB 1EWXA 4QQ7A 4GTUA 5C04A 2MMOA 1K0NA 3W6GA 1C72A 2HSHA 4YH2A 2VD1A 5ECRB 1SL0B 1X5EA 4E8EA 4J57E 4TVEA 3BCIA 2I4AA 1QK8A 3MAKA 2N5AA 3M8NA 5HR0A 2H6ZA 4GSTA 5ECPB 5ECQB 4HU7A 3WD6A 4OWYA 4F0CA 2VLTA 1R5PA 2VCWA 4BL7A 3RDWA 1MEKA 1FB6A 2X8CA 1QMVA 2K6VA 2YP6A 3W8JA 3A2VA 2OE0A 2OACA 2VCVA 1S3AA 2PVOC 1R7HA 4Q5RA 3Q18A 1QUWA 1YDKA 5DCHA 1TRWA 3MSZA 1VF4A 5CRDA 1TI3A 1TU7A 1UVZA 1G7EA 4GSSA 5CRGA 1A24A 3GH9A 2OADA 1N8JA 5D73A 2AYTA 2QSIA 2PGTA 1O6JA 5F8BA 3GKXA 4YQMA 3HYPA 5B8BA 1AIUA 4MCUA 4OFTA 1GRXA 1EP8A 2IFQA 3GL3A 4LMVA 1HQOA 4N30A 1GSSA 5IOWA 2HXKA 3KXOA 5H5RA 3C8EA 1U87A 1U88A 2O8VB 5LCZA 4XTSA 4HQZA 1TW9A 2C4JA 1XWGA 3LFLA 1HNCA 4G19A 2GZPA 2MMNA 3GNJA 4PQ1A 5ECOB 5D9TA 3ME7A 4L5LA 3QAGA 4LMWA 4JBBA 5JCGA 2FUG2 4BPYA 2B1KA 2DLXA 4HU9A 1KBNA 2F9SA 1M2DA 2C1YA 3CYNA 2REMA 4ECCA 6GSTA 4V2MA 2AV4A 4EF0A 4WR5A 3E0UA 1PX7A 1XVQA 2H71A 2PWJA 1AC1A 5ABRA 3BJ5A 1YEXA 1ERUA 2VCQA 1Q98A 2RLIA 1JHBA 1TI1A 3F4RA 1Z6NA 1TOFA 4I97A 3G7IA 4I5QA 1K3LA 1G6WA 5F06A 5IOXA 4FYBA 3TRQA 3F3RA 4I2UA 4OFMA 1GTAA 5H5QA 1MD4A 3UMAA 1J08A 3ZIJA 3WYWA 2JL4A 4QL9A 4GWRA 5IPGA 1AQVA 1WRYA 2AUVA 4G10A 4JR6A 4WKWA 3I69A 1KNGA 1XIYA 2AB6A 2KP2A 3MWHA 5HR1A 4FO5A 2EC4A 1PN9A 5FT3A 3HJOA 1UA5A 3APOA 2HRFA 1DSBA 2FCHA 5ID2B 3GIXA 4TR1A 2LNSA 1GSQA 3KEBA 2M46A 1A0RP 1O73A 4QL7A 3UOMA 2E0QA 3D4TA 2C3QA 6GSXA 1ZMAA 9GSSA 2GZZA 2TRXA 1JZWA 3F4SA 4RI6A 4ZBAA 1NHYA 5KEJA 2CX4A 3L9SA 4I8BA 3US3A 1KEBA 4ECBA 1HNBA 1ZL9A 4PGTA 3C1SA 4PNFA 4CDOA 1G6YA 1TK8B 3GUSA 3UIWA 1EOHA 4NHZA 3NOFA 2KHPA 1XOBA 2GT6A 1B48A 1SYRA 4HJMA 5G1KA 3TOTA 2VL2C 1SK2A 5KN0A 4E8HA 2CZ2A 4Q5FA 2C0DA 4MLYA 2GQKA 3TRPA 5EL8A 3QFBC 3VFIA 3F6FA 5JWOB 3QPMA 2KP1A 2X99A 1DBYA 3DXBA 4JU5A 1W89A 2PN8A 3F8UA 2JZTA 3UAPA 3GTUB 1SKWB 1AUCA 2MBTA 5KN2A 1YEPA 2V6OA 2GLRA 1H75A 3A2WA 1XXUA 2HT9A 4HZ4A 1FVJA 3HY2A 1WWJA 3MDKA 3RPNA 5IIZA 4DSQA 5JCUA 4K8MA 2JSZA 4XS4A 3UBLA 2YNXA 1X5CA 4OFNA 8GSSA 1SU9A 5LD0A 1SD8A 1X0RA 4K0GA 4KGIA 1M2BA 2D2ZA 5ECKB 4TR4A 3KZQA 3DEXA 2NBSA 2I1UA 3FEUA 4J56E 3M3MA 3RPPA 1TJDA 1M9AA 2VL2A 4EKZA 4K2DA 3KTLA 4GXZA 4DEJA 2LTKA 1PRXA 4IQAA 2R4VA 1Z5YE 1XW6A 2OJLA 3GMFA 3TKRA 1ZYQB 2CT6A 2KOKA 2YZHA 1GSEA 1OC9B 2E2GA 3ZLPA 4LL4B 5J5NA 5F07A 3GFKA 3D22A 3GX8A 2NPBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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