4OWYA

Crystal structure of ahp1 from saccharomyces cerevisiae. investigating the electron transfers.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
174
structure length
169
Chain Sequence
DLVNKKFPAGDYKFQYIAISQSDCKMPQTVEWSKLISENKKVIITGAPAAFSPTCTVSHIPGYINYLDELVKEKEVDQVIVVTVDNPFANQAWAKSLGVKDTTHIKFASDPGCAFTKSIGFELAVGDGVYWSGRWAMVVENGIVTYAAKETNPGTDVTVSSVESVLAHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin type-2
publication title Crystal Structure of Ahp1 from Saccharomyces cerevisiae. Investigating the electron transfers.
rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 45
structure length 169
sequence length 174
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4owyA00
3KM6A 2GT6A 2PPTA 5E4WA 2VLVA 5C04A 1CQGA 4WF5A 3WGEA 4JE1A 2WZ9A 1XBSA 5HFKA 1ZYQB 4FH8A 3UIWA 1H4OA 2E7PA 2IPAA 3TGZA 1YKAA 3MDKA 2FCHA 5CREA 2HSYA 1XWCA 1RQMA 2EC4A 5KN3A 3TKQA 2L5LA 2CA8A 1ZYEA 5ENUA 1Z7RA 3GTUA 2YJHA 1ZGNA 2GZYA 3FEUA 4GSNA 3V1WA 4O92A 1PA3A 4DSRA 3TOTA 3DRNA 2H8LA 3ISOA 2O89A 3HA9A 3GKMA 4N0VA 1WJKA 2JZTA 3M9JA 3NZNA 1YQ1A 3MSZA 3GFKA 2L4QA 1NHYA 4WEYA 1DUGA 3VURA 5COHA 2WGRA 1XWGA 1JZWA 1XWKA 5IO2A 2RUEA 4TW5A 2GZZA 1EEJA 4Q5RA 4PUAA 2LSTA 4DSQA 4QQ7A 4YQMA 4DEJA 4IGJA 4TXOA 2CZ2A 2B5YA 2H74A 1WWJA 3QAWA 4AF2A 1OE7A 5DQYA 3APOA 1TK8B 4YAVA 3DXBA 2C0EA 2H1DA 2A4VA 2DLXA 2FGXA 2AJQB 2H0IA 5IMDA 1B4PA 3F4RA 2MYGA 4CDOA 4IQ1A 4MK3A 1TK0B 3L9SA 2VL2A 4O7HA 3QFBC 1R7HA 1SD8A 4V2NA 1SENA 1JZRA 5CP1A 2KOKA 4RI7A 3PR8A 3ZL5A 1A8LA 1OE8A 3DVWA 2F9SA 2DJJA 5F07A 2FWHA 2PBJA 3GKNA 3D0ZA 3EVIA 1FO5A 3FKFA 1ST9A 2FNOA 4TR4A 5EVOA 2JL4A 2A2SA 3TKSA 8GSSA 1PKWA 1A23A 4AJ7A 4WXTA 2R3XA 3NIVA 5DALB 2YV9A 4HJ2A 3S9FA 5G1KA 4JR4A 4ZBBA 1FVJA 2B5EA 3G9BA 1VF4A 5D96A 2YWIA 4MZCA 4F03A 2VAFA 3VWUA 4EC0A 1TJDA 1OC3A 1GULA 4OFTA 4QL7A 1TI1A 2VLUA 4KA0A 1XPVA 3D6IA 1OKTA 2K6VA 3IV4A 3KEBA 4KUNA 1Z7PA 4V2MA 2YV7A 4LLRA 3SBCA 5G31A 1SL0B 4ZXGA 3F9UA 3RPNA 3MWHA 4K7NA 3LFLA 4HQSA 3KTBA 4HU9A 4I5QA 4KB3A 3QFAC 4KDXA 1SU9A 1JFUA 5CRHA 5IMFA 1G6WA 5IMVA 3CMIA 3GH9A 5JWOB 3FZAA 4JBBA 2HZEA 5JCGA 2YWOA 4NHWA 5B6MA 3HDCA 3E0UA 5CNWA 1XWAA 4JRRA 1R26A 4E8EA 4E8HA 2DJ0A 2OKAA 4KCAA 1OVNA 1SKWB 1K0NA 4PXOA 4EE0A 2YANA 5ECRB 2LJRA 1YDKA 4IVFA 3TJJA 1MD4A 5IMZA 1JZDA 4OWYA 2WJUA 6GSTA 4IELA 4IJ3A 4J2FA 5HQPA 2PMTA 1B4QA 2IIYA 2VOCA 4N10A 5D9VA 3ZITA 4Q5NA 1G7OA 3IXRA 2IL3A 3BCKA 4DSSB 3DGQA 3UBKA 3F6FA 1HNCA 1ZZYA 5KN1A 2C3QA 2IMDA 4L8EA 4F9ZA 2YOIA 1ML6A 3GL5A 2KHPA 3HJPA 2E0QA 4KH7A 1YY7A 2OACA 2I4AA 2CVKA 1SL2B 3TKSE 2ZUPA 3Q19A 1M9BA 1XW9A 3FY7A 1A0RP 3I6AA 5J9CA 4TR1B 7GSSA 1AC1A 4PX1A 4OD7A 1N2AA 3VWXA 2DJ3A 3TKPA 2LRNA 4G10A 3O76A 3UVTA 1X9MB 2ON7A 1SKRB 3EURA 1EOGA 1SK2A 5DJMA 1ERUA 3IHQA 14GSA 4K7IA 4YH2A 1WOUA 1B9XC 1FOVA 5F05A 2DMMA 3TUEA 4I2TA 3TKRA 3WT2A 4ULXA 5ELAA 3GUSA 4MF6A 2PERA 1ILOA 5ECNB 3KXOA 1GTAA 1I5GA 1TOFA 3TJKA 3UAPA 4L5LA 3M1GA 1VGLA 1YF0A 2B7JA 3KP8A 4ZB9A 1S3AA 2TIRA 5G1LA 2LTKA 4K6XA 5G2ZA 3H8QA 2GQKA 4ACSA 2HI7A 2CX4A 4PQHA 1ZL9A 3HXSA 2KP2A 3EC3A 18GSA 2NBSA 1GTIA 3F3RA 2ZCTA 2L59A 4NHZA 3A5WA 4MPGA 1EEMA 4KGIA 2WULA 2NDOA 2H19A 4MZWA 2GSTA 1SL1B 4GF0A 4X1UA 1M2BA 3P90A 2PN8A 1Z3EA 2D2ZA 4XS4B 2LNSA 4GTUA 3D5JA 3L9VA 4IQAA 2LS5A 2JSYA 3QOUA 3TJFA 5DAKB 4MH3A 2OA7A 2O8VB 4GCIA 1GNEA 2DMLA 2G2QA 3RPPA 1PX6A 2GGTA 4NV2A 3HVXA 4IS0A 5CRWA 4AGSA 1G7EA 1PX7A 3LORA 2GQLA 1EGRA 3F4SA 4HZ2A 2LEGA 4KSOA 2JADA 4F0BA 1HYUA 3KTLA 1EV9A 4K0GA 1G0TA 2VCTA 3ZLPA 3N9JA 1X5CA 3ERGA 4BA7A 2XHFA 3G7YA 2CV4A 4KW6A 4XS6A 3M8NA 2FA4A 3RBTA 4MH2A 1Q4JA 1PL2A 4XCSA 4I97A 4WR4A 2Z9SA 2I3YA 2IFQA 4P3YB 2K8SA 3RDWA 3JCML 3KCMA 3K8NA 4MP4A 5HFIA 4EUYA 4MLYA 4OCFA 2VCZA 1F9MA 2IMEA 1XOAA 1YF1A 2ES7A 1T1VA 1QQ2A 1UVZA 1TRWA 2IMIA 1GUHA 2VD0A 5F06A 3VPQA 4K8MA 3GRXA 3GV1A 1PGTA 2JACA 3GSTA 2PWJA 4GQCA 3D4MA 2EIQA 4ZL8A 3Q6OA 3IAM2 3I69A 2EIOA 3QD9A 2DJKA 1ZMAA 1KEBA 2E2GA 2GVPA 1K3OA 1O7UA 5A4VA 3UJ1A 1O81A 2H1AA 5D9XA 3Q18A 5DCHA 2H0HA 1FB0A 1AW9A 4K0NA 1OC9B 1LU4A 3VWVA 3UVHA 1EOHA 1J08A 2YPMA 3ZVJD 2QC7A 1B48A 1O8XA 3D21A 1ZCPA 2YCDA 2JU5A 1T3BA 2IMFA 3VFIA 2LNTA 2P0GA 4ZBAA 2REMA 1R5PA 3D4TA 5ECIB 5C00A 1O6JA 4OMVA 2FY6A 2HYXA 3D22A 4DVCA 3NOFA 1U87A 1EP8A 2FWEA 4X43A 1FVKA 3RAZA 1YJ6A 5JCUA 2C0GA 3LEFA 3H1NA 2H72A 4D73A 1ACVA 2OADA 1K0DA 3ERWA 1HD2A 1TXXA 3UEMA 2C1YA 1O85A 1ERVA 4IW9A 3GTUB 3M3MA 1OKDA 2AAWA 1QK8A 4JU5A 2E2MA 4AJ8A 2VO4A 2YZUA 1OAZA 2RUFA 4ECJA 3GX0A 5ELGA 2OE3A 1THXA 2HNLA 4TN8A 4PQIA 2YWMA 4LL1B 1XCCA 2I9HA 1Z5YE 2NVLA 2N5BA 4Z7XA 5A4UA 3MNGA 2P5RA 5EPFA 1G6YA 2LUSA 3WT1A 1B8XA 4ML1A 5HFGA 2XPEA 4MA9A 3QAGA 4BWSA 2R2JA 2GLRA 2H71A 3LYKA 3ZIVA 2YN1A 3TCOA 4L5OA 4JZQA 3KJYA 4TXOB 2H6YA 2HZFA 4WBRD 4EO3A 5B8AA 1JLWA 2XPDA 3IK7A 4V1Ag 5DBQA 3EU3A 4NPBA 1K3LA 2VL2C 3HD5A 3J7Yb 4JEDA 1WMJA 4XHMA 3LGCA 2H75A 3ZIJA 2H66A 3GH6A 5EY6A 1S3DA 4POLA 1M0UA 1I9DA 3TJBA 3WD6A 2O87A 2GTUA 4POBA 2RM6A 2KP1A 5HR3A 3TKSC 1XVWA 2F3MA 13GSA 3KP9A 1WRYA 1GUKA 5CAXA 3PINA 4EDYA 2LQOA 3KD0A 2VLTA 2B1KA 4J57E 2J9HA 1X9WB 1J9BA 4ZILA 1TU7A 1XZOA 5FT3A 3VWWA 3CTFA 4MMMA 1RW1A 1USBA 3GKKA 5DVBA 2ALBA 2GSSA 1EP7A 2XC2A 5KEJA 3A2VA 2FA8A 5ID2A 3F3QA 4KDYA 2X8CA 2M46A 6GSYA 1TU8A 3IAS2 1YEXA 3KMOA 2CAQA 2CVDA 1EWXA 4ML6A 5ECSA 1A24A 5D9WA 2TRCP 4OFMA 3I9V2 3BCIA 3RHCA 1ZOFA 2GDRA 4L0WA 3EMPA 4G9HA 3Q74A 2MMNA 4KDUA 3LSZA 2F8AA 4TXVA 1A8YA 3WYWA 3ZYWA 3FK8A 2HZEB 2RIIA 4NWYA 4ID0A 2RM5A 5GZZB 2VL3A 5D73A 4PURA 3HVSA 4XS1A 2XBIA 2V6KA 4LMVA 2B5XA 2LJKA 1W4VA 5EL8A 4MJEA 4HI7A 4IN0A 4BVXA 2V2GA 3FHKA 2B6MA 1TP9A 3LWAA 3FW2A 1K3YA 1M2AA 2LJAA 3F63A 1DBYA 3UMAA 4MCUA 4N0ZA 3C73A 3EE2A 1N8JA 2O85A 1UC7A 2DJ2A 2H1GA 3ZRDA 4ILFA 1FB6A 1PQNA 3GIXA 4EL1A 4GSTA 1WP0A 4BWQA 4HOJA 2VD1A 2FD3A 2VIMA 1GSSA 2H6ZA 1NM3A 4GRFA 5CO3A 1SKSB 1GSDA 1NSWA 1NHOA 3DEXA 2AB6A 4O5RA 4TR3A 3U5RE 4Q5FA 2C8UA 1O8WA 4KCEA 1PSQA 2H70A 2P31A 4V2LA 3P8WA 1LJRA 4BL7A 2MZCA 2C0DA 6GSVA 4I8BA 1WE0A 1GWCA 4V1Ap 3ME7A 1RK4A 3QAVA 1Y6EA 4EXJA 1V57A 2B7KA 4IJIA 4O32A 1URMA 3IDVA 1TKDB 1AQXA 4TR0A 2O7KA 2GS3A 1FW1A 1OYJA 3IE3A 3GMFA 4MJAA 3LXZA 1Q98A 3OR5A 5AN1A 3HYPA 4IP1A 2V41A 5IOXA 1EV4A 4HU7A 3GURA 3SWLA 3W8SA 5ECHB 1TDIA 4EF0A 4L0UA 3FZ9A 3H79A 1X5EA 3LXTA 3TB2A 2TRXA 2BJXA 4HQZA 1GSUA 2CQ9A 1GSQA 1JLVA 5E59A 2FWGA 4POMA 3CRTA 3CSIA 3C1RA 4ZB8A 3ZZXA 3L78A 4K1FA 2FHEA 1SJZA 3PH9A 3GSSA 2MMAA 1THOA 3H93A 5KN0A 16GSA 1EZKA 3M0FA 1U88A 2IMKA 1QFNA 1MDKA 3EYTA 6GSUA 3VLNA 3CRUA 3GYKA 11GSA 4K7OA 3EU4A 2V6OA 4OFNA 3DMLA 3BBYA 2F8FA 2X64A 2L5OA 2OE1A 1Z6NA 2LRCA 2B3SA 2HFDA 1V98A 1T00A 2C80A 3DKSA 4KAEA 1X5DA 2R4VA 3BD2A 2H76A 2PUKC 2EIRA 3G7IA 3ZFLA 4I2UA 1CQHA 2K8VA 2DBCA 2V1MA 2GSQA 5B8BA 2H0GA 5FHIA 4LMWA 3F4TA 1AAZA 2IFQB 2IWTA 1V58A 4G19A 3CSHA 1GSFA 1M7TA 2L6DA 3FR9A 4IKHA 2HSHA 1XOBA 4TOPA 4FO5A 5LNKe 4MJBA 4RQRA 1DSBA 4WKWA 5IMCA 4XTSA 4WBJA 4NXIA 4RQXA 3ZMLA 2YJ7A 2YP6A 2BMXA 3TRPA 1R4WA 2N5AA 3BJ5A 3CXGA 3HZ8A 1BG5A 3HZ4A 1K0MA 1K0BA 3GNJA 1MEKA 2PU9C 1O73A 5GAPD 1AQVA 1TI3A 5A5KA 3F6DA 1UA5A 4RUVA 1X9SB 1TW9A 5IMAA 1GRXA 3DVXA 3UL3A 3CSJA 1KBNA 1M9AA 3KZQA 4EDZA 2DSAA 2L57A 3DD3A 3HJMA 3VI5A 2HLSA 1ERTA 2OBIA 1XVQA 4KNDA 1PMTA 4ECBA 3ZTLA 1IYHA 1J0FA 2NPBA 2L4CA 3GA4A 2L6CA 5F8BA 2FLSA 3IA1A 4XRAA 5ECMB 1F3AA 1YZXA 3FR3A 5AIXA 5AISA 20GSA 3O6TA 4PGTA 4ZIJA 12GSA 3VI7A 1F3BA 4TVEA 3P7XA 1K0OA 4GQFA 1A2LA 2AHEA 3C8EA 5FWGA 5D9TA 4D73B 3LJRA 2CX3A 2YZHA 1C72A 3F8UA 3UBLA 5ABRA 2WFCA 5HR2A 6GSXA 1H75A 3FR6A 1QGVA 4KSMA 2GQMA 1ERWA 2A2RA 2VL9A 2H6XA 1QMVA 4EVMA 5GSSA 3TOUA 3ZVJA 1V40A 3KMNA 2PVQA 5H5QA 3ME8A 4KE3A 1V2AA 2MBTA 1UN2A 3GN3A 1XW5A 1SYRA 2FUG2 1QUWA 4FYUA 3P2AA 2GZPA 3ERFA 2DC5A 4XRDA 3L0HA 3LYPA 5DCGA 2AV4A 3UOMA 1T7PB 1BEDA 3WGDA 3HY2A 5DDLA 1GSYA 2C3NA 10GSA 3U6VA 5CRDA 1X0RA 3FRCA 1JHBA 2AYTA 3AY8A 1F6MC 4FYCA 4WF4A 4X0XA 3GKXA 3O3TA 1ABAA 1VF2A 2WDUA 2RLIA 5LCZA 1AIUA 2MMOA 4YQVA 3IPZA 5LD0A 3C1SA 3CBUA 1GL8A 1K0AA 2HRFA 9GSSA 3FZ5A 3TRXA 1XIYA 4J56E 4MPFA 5H5RA 1T8EB 3IOSA 6GSWA 2J23A 2M72A 2WRTA 4MJCA 5JWQB 5INYA 4ISDA 2VM1A 2K18A 1W89A 1GUMA 2X99A 5B7CA 3F0IA 2F51A 3W8JA 3W6GA 22GSA 5AGYA 4TRXA 2ZNMA 2VCVA 5DALA 5G30A 2OE0A 1U3AA 5H5SA 3BOAA 1SJIA 4NMUA 2JZSA 2HE3A 5AIVA 3MAKA 2H1BA 3L9UA 2C4JA 3CYNA 1B9YC 3APSA 5G5EA 1TRVA 4OO5A 3KH9A 5JWRB 5ECOB 1WPIA 3IR4A 5ID2B 3ZFBA 3WGXA 5J4UA 4NV5A 5DQSA 4F0CA 1SD9A 3HCZA 4HS1A 4GXZA 1AUCA 1MDJA 1DE2A 3APQA 2QGVA 5DJLA 3KH7A 2BTOT 2I1UA 1ON4A 4QL9A 1A2JA 1SJ6A 3LQ7A 4PNGA 5IOWA 3ED3A 1HQOA 3J7Yk 2IJYA 4K2DA 5ECPB 5D93A 4MZBA 4N30A 2HT9A 3C71A 1AQWA 2N5FA 3VPTA 1HNAA 2JSZA 3IC4A 2B1LA 1A2MA 4GSSA 5J5NA 3QPMA 2DIYA 2MMZA 3IBHA 1SYXA 1PL1A 2YWNA 5IM9A 3E9JB 3M9KA 2VCWA 2IN3A 4AJ6A 4DSSA 4ECCA 1GTUA 3E3EA 2KLXA 4H86A 1OC8A 3R2QA 1MD3A 4JR6A 3HHVA 2QSIA 5CRGA 1VRSD 4TKYA 1MDIA 1TTZA 2R37A 3ZMKA 3DIEA 4WR5A 2H73A 2P5QA 1MTCA 3FZ4A 3VK9A 3PGTA 4N11A 5ECLB 2G0FA 5IPHA 1WIKA 5GAND 3GX8A 4TR1A 2QKEA 1BYEA 3KGKA 1PRXA 3EWLA 4LL4B 5B6NA 1T4ZA 4K9ZA 2CT6A 5JCWA 5IIZA 2MBSA 3IK9A 4CW9A 4GLTA 4YQUA 4GWRA 1A0FA 19GSA 2KUCA 2NTOA 4HDEA 4HUAA 2HXKA 4ZBDA 2DJ1A 3G7JA 4ZL9A 1BX9A 1VF1A 1FAAA 4BPYA 5J9BA 5G5FA 1XXUA 1VF3A 4PQ1A 3A3TA 2LKUA 2H01A 1HNBA 4LA1A 1GH2A 3L4NA 1FHEA 3EMXA 2GT5A 2M80A 3EINA 4F2IA 1Z6MA 1SK1A 3HJOA 2R5GA 1T4YA 5J3RA 1U3IA 1BJXA 3I43A 3TJGA 3C7MA 5L71A 4IHUA 1U6TA 17GSA 3QCPA 2OBKA 4OO4A 5HR1A 1NW2A 1K0CA 3HVVA 4KX4A 1KNGA 3QR6A 4ZB6A 5GSTA 3US3A 2V32A 4XS4A 2JZRA 3A2WA 4MF5A 4YAPA 1QXHA 1GNWA 1R5AA 1TK5B 3GHAA 1AXDA 5DAKA 3DYRA 4IP6A 2K9FA 4PNFA 2PVOC 1BQ7A 1E6BA 1EGOA 1DE1A 6GSSA 2HRNA 2CAIA 1PD21 2YNXA 1V9WA 3CTGA 3QDNA 2C3TA 3RHBA 4Q5QA 1YKCA 2AUVA 3FYGA 2VM2A 2LV3A 2XBQA 3QMXA 1XW6A 4PUFC 5ECQB 4MDCA 3KIJA 2FWFA 1LBKA 5IPGA 5J41A 1IYIA 2WCIA 1E2YA 4MF7A 1GLPA 5HR0A 4WETA 1Z9HA 4ECIA 2R6KA 5IQYA 1PN9A 4OCEA 1BAYA 4CHSA 5ECKB 1SK0A 2OJLA 4RI6A 4BVYA 5D8IA 2VCQA 2LRTA 4G2EA 1XWBA 4FYBA 4EKZA 3TRQA 3H4KA 3LG6A 4XIHA 1M99A 2CVBA 1TRSA 4ZL7A 4POKA 1GSEA 4F82A 2VUPA 3HKRA 4NAXA 2PGTA 1S3CA 3IRAA 5CYYA 2I81A 4I6XA 1Y25A 3UARA 1YEPA 4IBPA 1KTEA 2X8HA 1GTBA 2DIZA 3TDGA 5KN2A 4FIWA 2C0FA 1FG4A 2X8GA 4HEA2 2GSRA 2LQQA 4HJMA 2ON5A 1JZOA 2VCXA 3ZREA 2WB9A 5A4WA 1F37A 1PKZA 3GL3A 2H30A 1OC9A 3N5OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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