4POLA

Crystal structures of thioredoxin with mesna at 2.8a resolution
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
TMVKQIESKTAFQKALKAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKKKLEATINKLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin
publication title BNP7787 Forms Novel Covalent Adducts on Human Thioredoxin and Modulates Thioredoxin Activity
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 32
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4polA00
1KNGA 14GSA 2YCDA 1PSQA 4I97A 3FY7A 1SKSB 4L0UA 4PQ1A 4EKZA 4F0CA 2PMTA 3TRXA 1SJIA 3TRQA 2H1GA 3VLNA 1WMJA 4MZBA 2G0FA 5GAND 1FOVA 4POBA 2L5OA 5HR0A 2KLXA 2C3NA 1TRSA 3EU4A 4GF0A 1WPIA 3D5JA 2FHEA 3GMFA 4MLYA 4IW9A 4OD7A 1EOGA 5DDLA 3SWLA 4EXJA 3IK9A 2FWHA 2F3MA 2MMOA 3FEUA 5D96A 3ZIVA 4GSTA 4ZBBA 1TI3A 4DSSB 3GFKA 4EL1A 2H1DA 3FR6A 1DSBA 1EGOA 4KAEA 2VCVA 5D8IA 4RI7A 5EL8A 4DSSA 4KB3A 5G5EA 1T4ZA 3M9JA 5J9CA 1G6YA 4GCIA 1BAYA 2YN1A 2GZZA 3APQA 3J7Yb 2HT9A 1YDKA 1WJKA 4K7OA 4KDXA 4I8BA 2C3TA 2JADA 1UN2A 1PX7A 1V9WA 2M46A 1SYXA 2REMA 5KEJA 1O6JA 2K8VA 2L6CA 3EMPA 2VCXA 1R26A 3HZ8A 5ECLB 1J0FA 4MK3A 1HNAA 2R4VA 4KUNA 1LBKA 4H86A 4F0BA 4LMVA 5D9XA 2J9HA 1JFUA 2YOIA 1FG4A 4POKA 4RQXA 1NHOA 2DJ0A 3TUEA 1W89A 2HI7A 4HZ4A 1S3DA 3C7MA 1FB0A 2X8GA 1GSYA 3AY8A 3BCIA 2IMKA 3KTBA 1VF4A 2H6ZA 4MPGA 3A2WA 5IPGA 3TGZA 2ES7A 3GKXA 4KSOA 4XS4B 2IMEA 4OWYA 4FYUA 4G2EA 2R2JA 1A24A 4GSSA 4XS4A 1GLQA 5G1LA 5AN1A 2A2RA 2P0GA 4ZXGA 1TI1A 1AAZA 5D93A 5ECQB 2L4QA 2HXKA 2VAFA 1U3AA 3WYWA 4HU7A 2IL3A 1HNBA 2PGTA 1T00A 5JCGA 4E8EA 4ID0A 3WGXA 3KGKA 4ECIA 5AGYA 2GLRA 2GQMA 3QD9A 3M1GA 1G7OA 1VRSD 3DYRA 2X99A 3KIJA 1XWGA 2GSTA 5HR2A 4G19A 1I9DA 3F4RA 2FD3A 1PA3A 4ZBAA 5IO0A 3VPQA 3CTFA 2KP2A 2QGVA 1Z6NA 3IHQA 1SJ6A 3FZAA 4TKYA 4JR4A 4BPYA 1XWAA 2A4VA 5ECSA 2K8SA 5ELAA 4LA1A 4HJ2A 1OKDA 1ZZYA 2IMIA 2DBCA 4BVXA 4L5LA 4IP1A 4AJ6A 1QK8A 3U6VA 3BBYA 3IA1A 2H0GA 2PN8A 2BMXA 2R3XA 1YKCA 3IPZA 2MBTA 3H1NA 2H66A 2VOCA 3I6AA 3GIXA 4ZB8A 3TKRA 3WGEA 1H75A 1YZXA 2CQ9A 2N5FA 2AYTA 3G7JA 3H79A 1IYHA 3CSJA 3QMXA 4G10A 3LWAA 2C80A 1ZL9A 5DCGA 3H93A 4EC0A 3TCOA 5DJMA 1YF1A 1V2AA 3KP9A 1YEXA 1PGTA 3A2VA 4I6XA 1BQ7A 2YJHA 3C71A 5IIZA 3M3MA 1E2YA 4FH8A 1A0RP 2O89A 1TKDB 5KN0A 4MJBA 2E2MA 3UARA 1J08A 11GSA 1O7UA 2K6VA 2OA7A 4GWRA 1OC9A 1FB6A 1G6WA 2OE1A 1OE7A 2V2GA 2GZYA 2H71A 3HD5A 5F0GA 2Z9SA 2AJQB 3ZLPA 20GSA 5DQYA 2PPTA 4OO5A 1URMA 1SJZA 1EV4A 5F05A 2WRTA 3A3TA 2RM6A 1QMVA 2GT6A 4OCFA 4PX1A 1TJDA 4YQUA 2AV4A 4JE1A 4CHSA 2EIQA 2WULA 4ML1A 2VCTA 3KEBA 5G31A 3ERWA 1M2AA 5COHA 1GRXA 3TJBA 2OBKA 4V2MA 1A2JA 2ZCTA 1XCCA 1A0FA 1GULA 2PVOC 5ELGA 4ECCA 3HHVA 2E7PA 1AUCA 1YF0A 4YAVA 1DE1A 3LGCA 2K9FA 1MDJA 4TXVA 1GSDA 2ON7A 2PVQA 1M2BA 1ERVA 4OO4A 1EEJA 4PNFA 3W6GA 3WD6A 2FLSA 2IIYA 3N9JA 3FK8A 1X9WB 2C3QA 5JCWA 3F4TA 4NXIA 3GRXA 2BJXA 5DQSA 1FVKA 2R5GA 1Y6EA 5HFKA 3P8WA 2C0FA 2KP1A 1EP7A 1K3YA 3TKSC 3D6IA 2HZEB 4WKWA 3IXRA 5ECNB 1OKTA 2VL3A 4LMWA 1SYRA 1K0DA 3OR5A 5G30A 2A2SA 2H72A 3RHBA 2HZEA 5DAKB 1TP9A 4ZL9A 2IFQB 3GL5A 3M0FA 3PR8A 5DAKA 3LORA 3RDWA 2MZCA 4GTUA 2IFQA 3P2AA 5AIVA 1XOAA 3D4TA 2FA4A 2F51A 1T8EB 6GSWA 1GWCA 1AW9A 5C00A 4D73B 2B1LA 4WF5A 3HZ4A 2CAIA 4OCEA 6GSTA 4DEJA 3GV1A 2GQKA 4IELA 5IQYA 3ZYWA 3HJPA 5CRGA 4D73A 3C73A 3V1WA 9GSSA 4WEYA 5DCHA 3WT2A 1X0RA 3ZFLA 3A2XA 2DIZA 1CQGA 1K3OA 1XOBA 4YAPA 4K9ZA 2DJ3A 5IPHA 3BOAA 1AQXA 2DC5A 5D73A 1YKAA 2V6OA 1MD4A 1NHYA 3EMXA 5A4WA 1Q4JA 2B7KA 5JWQB 3VFIA 1GSFA 4Q5FA 1EV9A 4PGTA 2GTUA 3IC4A 2AB6A 3L9UA 4ZILA 2I1UA 1M7TA 3E9JB 1XVQA 4ZL7A 1N2AA 2OE3A 4V2NA 3LG6A 1TK0B 4NHWA 3UOMA 1HQOA 2L57A 2H73A 4AJ7A 4GXZA 4XIHA 2R37A 5INYA 2E2GA 2LJAA 3CSIA 3DVXA 2DLXA 4FO5A 5ABRA 4ECJA 2VL2C 4IJIA 2LS5A 5H5SA 2C0GA 4KDUA 2YWNA 3DGQA 2CX3A 2H1AA 2NVLA 3I69A 3EWLA 1GSQA 2IN3A 3UAPA 1Q98A 3GA4A 2HZFA 4TR4A 5KN3A 4X1UA 5LCZA 4MABA 2I81A 1SU9A 2HFDA 2DMLA 4KX4A 1ERTA 5HR1A 2X8CA 4MF6A 5ID2B 3RPPA 5IOWA 2WB9A 3LFLA 3IDVA 1AQVA 2M72A 3D4MA 3DMLA 3UMAA 2DIYA 1R7HA 5ID2A 1M99A 1U6TA 5HFIA 2VLVA 2O87A 4PXOA 1A23A 1TDIA 3KXOA 3EYTA 3BD2A 2D2ZA 4GLTA 1X9SB 4HZ2A 1OYJA 3VI7A 3QFBC 2LV3A 2CV4A 4EDZA 3LXZA 5CRWA 3GYKA 17GSA 3QPMA 5KN2A 1GTBA 4TN8A 2H0HA 4HOJA 1AIUA 2VD0A 1OE8A 1NM3A 1M9BA 4ZBDA 2V6KA 2N5BA 2DSAA 3IRAA 5E59A 1O8WA 1RK4A 1T7PB 4XS1A 3ZFBA 1F9MA 1V40A 4HQZA 5HR3A 4OFNA 1G7EA 2AAWA 1EWXA 3C1SA 2YV9A 2YWMA 4TW5A 6GSVA 1S3CA 4MH2A 1R4WA 1SK0A 3IK7A 2WZ9A 1TK5B 1GL8A 4ACSA 3S9FA 1J9BA 4FYCA 3RBTA 3L78A 5IMZA 3APOA 4GRFA 5F07A 4JRRA 5CP1A 5D9WA 1F2EA 1U87A 4OFTA 2H6XA 4NPBA 1V58A 3JCML 1GTAA 4I2TA 3ZVJD 4O32A 4ECBA 1ILOA 5CYYA 3QR6A 3NOFA 2XHFA 4MJAA 2GQLA 2CX4A 4XRDA 5KN1A 1WOUA 2JZRA 2F9SA 1TTZA 2QKEA 3QOUA 3ZZXA 2CA8A 3G7IA 1NW2A 1FAAA 3G9BA 2RUFA 3GHAA 1XZOA 2PWJA 1A2LA 5H5RA 4N30A 2VLTA 3M9KA 3W8SA 1WRYA 3LEFA 2V32A 3O6TA 1YY7A 3FR9A 2RUEA 4WBJA 2OACA 1FO5A 3TOTA 5D9TA 2LJKA 1GUKA 2GVPA 3F6DA 3QAWA 3H8QA 1XVWA 1EZKA 1JZDA 4K0GA 4P3YB 3Q74A 2CVKA 4IN0A 2DMMA 4KSMA 4E8HA 4KE3A 3DXBA 5DJLA 1TRVA 2G2QA 4ZIJA 5EY6A 5HFGA 1VF1A 2YWIA 4RQRA 2B3SA 1ST9A 3LYKA 5IO2A 5G1KA 2MMNA 4QQ7A 2XPEA 4IGJA 7GSSA 1PQNA 5ECPB 4Q5RA 4MPFA 4LLRA 4AGSA 1K0AA 2KOKA 1TK8B 1W4VA 2GT5A 2JU5A 2FUG2 3GKMA 1AXDA 5GSSA 2YANA 4PQIA 2JSZA 1SK1A 3ZMKA 18GSA 4EO3A 2H70A 3Q19A 1ERUA 1IYIA 1PD21 2YNXA 2DJKA 3EVIA 1DUGA 2B7JA 1ZMAA 3TKSA 4IJ3A 4J2FA 4WF4A 4KCAA 4NV5A 5IMAA 5LD0A 1S3AA 22GSA 1GTUA 3GSSA 1SD8A 5JCUA 5L71A 1XXUA 2KHPA 2GS3A 3A5WA 3G7YA 1OC9B 1X9MB 2M80A 1ZGNA 2I4AA 2NBSA 4F9ZA 2EC4A 3ISOA 1GTIA 3ZL5A 2VUPA 2HE3A 1SK2A 1YQ1A 3L9SA 3HYPA 2HSYA 3EINA 4BL7A 2TRCP 1F3BA 2L59A 2L4CA 5ECRB 2GSSA 1ABAA 3KH9A 5AIXA 3UVHA 3P90A 1DBYA 1KTEA 3ZVJA 2V1MA 2ZNMA 2C0DA 3GX8A 4PURA 1XW5A 1M2DA 4WBRD 1A8LA 3ZRDA 2H76A 6GSYA 4O92A 3GN3A 3DIEA 4ZB6A 2LTKA 3CYNA 1JZOA 3VI5A 3TKSE 1TU7A 3TOUA 3DKSA 1M9AA 2CVDA 3N5OA 5G2ZA 2RLIA 4TRXA 1A8YA 1JHBA 3ERFA 4KH7A 1PN9A 1SL2B 4WR5A 4CW9A 4NMUA 3TRPA 4XHMA 3F3QA 4XTSA 5IMCA 3DVWA 3WGDA 1NSWA 5B7CA 1HD2A 1PKZA 4AJ8A 4O5RA 4BA7A 2CT6A 2JSYA 4GQCA 5JWOB 4O7HA 1THXA 4MJEA 2J23A 1QQ2A 3O76A 4POMA 2VIMA 1CQHA 4YQMA 1Y25A 3Q18A 3GH9A 2PU9C 3IAS2 2WS2A 2C4JA 1X5EA 2YWOA 4QL9A 2XBQA 2VL2A 2CAQA 1GNEA 1XW9A 2V41A 5ECHB 3CXGA 5ENUA 5CRDA 2WFCA 4HEA2 3H4KA 1SENA 2FWGA 4N10A 2P5RA 3FRCA 1BX9A 2WDUA 4V2LA 3F4SA 4KDYA 3HJOA 1K0CA 3L4NA 3GX0A 2IMDA 5G5FA 3VK9A 5C04A 4EVMA 4JBBA 3KZQA 4NV2A 2FGXA 4PQHA 3IOSA 2ON5A 4XCSA 3DWVA 4IS0A 4OFMA 3KD0A 2GSQA 1T3BA 4K0NA 2OJLA 4ULXA 2RIIA 5ECKB 3W8JA 3LJRA 1M0UA 5DVBA 12GSA 1Z6MA 1WP0A 5F06A 1OAZA 3MAKA 1GP1A 2PBJA 4GSNA 1UVZA 1QGVA 5J5NA 10GSA 1MTCA 3TDGA 3QFAC 4K8MA 4J57E 5CREA 6GSUA 4Q5NA 4OMVA 4HI7A 2NTOA 2OADA 1ZYEA 4F03A 2H0IA 2HNLA 3UL3A 1SKWB 2H74A 1O8XA 4ILFA 3EC3A 2JZTA 5JWRB 2WJUA 4K7IA 3APSA 1F6MC 5H5QA 3HKRA 2YP6A 3I43A 2F8FA 1OVNA 5E4WA 1O85A 5GSTA 3HY2A 4RUVA 2E0QA 3ZMLA 2H1BA 3SBCA 5GZZB 4TR1B 2RM5A 4XRAA 1QUWA 3IBHA 3DD3A 5J4UA 1K0BA 1B8XA 4N0VA 5A4UA 2WCIA 1RW1A 4TR1A 1GLPA 4K6XA 2XPDA 4F2IA 8GSSA 3L0HA 1B9XC 3RHCA 3QAGA 19GSA 3VWXA 1JZWA 3IV4A 3KTLA 4LL1B 3R2QA 1ML6A 3FZ5A 3Q6OA 4TR0A 1C72A 4MZCA 5F8BA 2YV7A 2JZSA 1SKRB 4DSRA 3E0UA 1TOFA 1TRWA 4GQFA 2B5EA 1WE0A 3F6FA 5A5KA 2OE0A 3P7XA 3BCKA 1N8JA 3F3RA 1O73A 3VPTA 1SL1B 1U88A 2O8VB 5B6NA 4HU9A 1K0MA 3F63A 2CZ3A 2HLSA 3GKKA 4KCEA 1YEPA 5CNWA 4IBPA 5GAPD 3GURA 3GSTA 2LKUA 2L5LA 3VWVA 3CSHA 3C8EA 3HDCA 1HNCA 3D0ZA 1JLVA 4MA9A 4JR6A 4IP6A 1WIKA 3FYGA 1SL0B 1XW6A 3KCMA 5B6MA 2GSRA 1GH2A 5IMDA 2FCHA 2FNOA 3CBUA 3KMOA 3LQ7A 3UIWA 3ME8A 2VM1A 3ZTLA 13GSA 16GSA 4ZB9A 4K1FA 4JU5A 1PL2A 1BG5A 4NHZA 5J41A 3FZ9A 4J56E 2VO4A 1GSEA 2LSTA 3CRTA 1LU4A 4I5QA 4TXOB 3TJKA 1U3IA 2HSHA 1GNWA 3IR4A 5EPFA 1V57A 1R5PA 2C1YA 2TIRA 1Z3EA 4TXOA 1ZCPA 5CAXA 4MH3A 3HVVA 2H01A 4V1Ag 2X8HA 3HJMA 5B8BA 4EF0A 1KBNA 2VL9A 2YPMA 3NIVA 5FHIA 3TJGA 5IMVA 5ECOB 3GTUB 1ZYQB 5J9BA 1F37A 5LNKe 3M8NA 4WR4A 4X0XA 1B4QA 3D22A 3EE2A 1XBSA 3UBKA 3GTUA 2DJJA 3LXTA 3QAVA 4YH2A 3LSZA 4I2UA 2BTOT 1WWJA 4L8EA 2JL4A 4MF7A 2IWTA 3PH9A 2CZ2A 3GUSA 1TXXA 3BJ5A 6GSXA 4MZWA 2H75A 2HRFA 3NZNA 3DRNA 1BEDA 2MMZA 4EDYA 3U5RE 2YZHA 1ERWA 3F0IA 4IQ1A 2IMFA 2QSIA 3CRUA 5IM9A 2GZPA 3TJJA 2PUKC 5EVOA 1FW1A 2PERA 3ED3A 1YJ6A 3TKPA 4JEDA 1K0NA 2HRNA 3MWHA 2F8AA 2NPBA 5ECMB 1MDIA 2EIRA 4BWQA 2R6KA 4NAXA 2DJ1A 4MDCA 1XWBA 2MMAA 3KP8A 4MF5A 2FWFA 2H19A 1TRUA 5IMFA 1VGLA 1K0OA 5J3RA 2LNSA 2QC7A 3VURA 2IJYA 4FIWA 4KW6A 1BJXA 4X43A 1H4OA 4PUAA 1VF2A 3PGTA 1I5GA 2GGTA 2AUVA 5CRHA 1UA5A 3EU3A 3VWWA 2C0EA 1Z7RA 4Q5QA 5DALB 3MNGA 2B6MA 1KEBA 1FVJA 2O7KA 4Z7XA 2MYGA 3RPNA 1MEKA 5DALA 2LEGA 1EOHA 3K8NA 1PKWA 2P5QA 1TU8A 4TVEA 1GSSA 2H8LA 1X5DA 4HUAA 1EEMA 1SD9A 4TR3A 2K18A 1K3LA 1BYEA 2FY6A 4YQVA 2LRTA 3RAZA 5FT3A 3WT1A 1ZOFA 2LRNA 1Z9HA 1EP8A 5HQPA 4CDOA 5CO3A 2B1KA 1PMTA 3CMIA 1T4YA 2LUSA 4JZQA 1XPVA 2HYXA 1TW9A 3I9V2 3GKNA 2YJ7A 5B8AA 4KA0A 3HVXA 2B5YA 3FKFA 2VCZA 4IVFA 4POLA 3EURA 3PINA 3LYPA 3VWUA 4DVCA 1XIYA 3UVTA 3E3EA 3FZ4A 1A2MA 1OC8A 3J7Yk 3ERGA 1JLWA 5DBQA 2NDOA 2EIOA 1ON4A 1AQWA 1V98A 2VM2A 4WETA 3C1RA 2P31A 4AF2A 2AHEA 1THOA 2I9HA 1RQMA 2MBSA 4L5OA 2WGRA 3IE3A 2LJRA 3HCZA 4PUFC 5FWGA 1GSUA 4ZL8A 3TB2A 1DE2A 4MJCA 2X64A 4WXTA 2O85A 2XC2A 3GNJA 1OC3A 1X5CA 1O81A 1QXHA 2OBIA 1USBA 3FHKA 3HA9A 2YZUA 3KMNA 1FHEA 2B5XA 1F3AA 2JACA 4FYBA 1B4PA 2LQOA 1T1VA 3KH7A 1EGRA 1ACVA 3CTGA 4BVYA 2ZUPA 3MDKA 4HJMA 4K7NA 3KM6A 1HYUA 2H6YA 2LNTA 4BWSA 3FW2A 3GL3A 3MSZA 2VCQA 4HDEA 4RI6A 4IQAA 3DEXA 4QL7A 1G0TA 3ME7A 1GUMA 3QDNA 3TKQA 2IPAA 2XBIA 5ECIB 1JZRA 2ALBA 3D21A 2VCWA 4DSQA 1GUHA 5IOXA 3ZREA 3KJYA 2I3YA 2FWEA 1XFLA 1LJRA 2C8UA 1MDKA 4ISDA 4EE0A 1B48A 1VF3A 5D9VA 3UJ1A 2L6DA 4XS6A 1E6BA 4ML6A 4TOPA 3US3A 3F9UA 2N5AA 1UC7A 2OKAA 1AC1A 4IKHA 4N11A 1PRXA 1Z7PA 4MP4A 2KUCA 1XWCA 4MCUA 4V1Ap 2H30A 4HS1A 6GSSA 4NWYA 5AISA 4L0WA 2VD1A 3GH6A 4KGIA 3L9VA 1R5AA 3O3TA 4HQSA 4LL4B 3UEMA 1B9YC 2TRXA 5A4VA 3HXSA 4K2DA 1XWKA 3IAM2 4EUYA 3TJFA 3ZIJA 2CVBA 2LRCA 4G9HA 3ZITA 4KNDA 2DJ2A 1QFNA 4N0ZA 3FR3A 2VLUA 4MMMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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