4QL7 | Genus

Total Genus 44

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	44
sequence length	166
structure length	166
Chain Sequence	MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEVC

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Alkylhydroperoxide Reductase subunit C
publication title	Key roles of the Escherichia coli AhpC C-terminus in assembly and catalysis of alkylhydroperoxide reductase, an enzyme essential for the alleviation of oxidative stress pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
total genus	44
structure length	166
sequence length	166
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2014-06-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4ql7A00

17GSA 3P2AA 2B5XA 3BD2A 1FO5A 4PUFC 2FLSA 1F2EA 2ON7A 1TRVA 2YOIA 5FWGA 1XIYA 2C80A 2I4AA 5H5QA 1M2DA 3ERFA 2VLVA 3GKKA 4ZBDA 4CHSA 4MF5A 4NV2A 5DDLA 5G30A 1AQVA 3VURA 2OBIA 3FR6A 1TK0B 2H75A 2WS2A 3W8SA 3FEUA 4CDOA 2K9FA 1V58A 2ZCTA 1EEMA 3K8NA 1GTIA 4HS1A 3NZNA 3PGTA 3RAZA 2V6OA 3QMXA 1XZOA 1QFNA 4BWQA 3F9UA 4MA9A 4F0CA 1GUMA 2WZ9A 3C73A 4IP1A 1PKZA 3ZREA 3M3MA 1FVKA 2WRTA 3HJPA 5KN1A 1AC1A 4ISDA 1UA5A 2GQLA 3GHAA 1WE0A 1TK5B 1QK8A 1X9WB 4TR1A 2VUPA 1X0RA 2BJXA 3A2WA 4X43A 1EGRA 3KM6A 2QSIA 3FYGA 2VD1A 5CO3A 1SYXA 2OE3A 3ZYWA 1YKAA 4I97A 2O8VB 3L9VA 5IMAA 4FH8A 1USBA 2R6KA 2YN1A 2PN8A 2PERA 3ME7A 3D6IA 3VPQA 2YWMA 2M80A 3PINA 1IYIA 1V57A 3HVVA 3HVXA 1HNBA 3FZ4A 1GTUA 4POLA 2MZCA 1QGVA 1Z5YE 3IBHA 2KLXA 2C0FA 1EP7A 4IGJA 1UVZA 1WOUA 2IFQB 4J2FA 3LG6A 1EOHA 4MJEA 1SD9A 5B8BA 3GV1A 1GTAA 5F05A 2DMLA 1UN2A 2C0EA 3SWLA 1JFUA 3F4RA 5C00A 4MMMA 4OO5A 1U88A 1BX9A 4XS6A 3NIVA 2RIIA 1ABAA 1O6JA 1U3IA 3MWHA 1XPVA 4TOPA 1S3DA 1SD8A 3WD6A 1ZOFA 5GAND 3IR4A 2JADA 3ME8A 2CA8A 2FWFA 4RQXA 5HR3A 4KDYA 4TW5A 1TI1A 4L0UA 1THXA 3KMOA 2IL3A 2IJYA 3I43A 4OFTA 1THOA 2H74A 3KTLA 3GIXA 5EVOA 4IJIA 4GRFA 1C72A 1JZRA 2ZNMA 3L0HA 4J56E 2YJ7A 3APOA 1ZYQB 1Y6EA 1G6WA 4MDCA 2DIZA 2H72A 1R7HA 2GGTA 4ZB8A 3C7MA 3Q18A 4XRDA 2P31A 4AGSA 3DWVA 2LQQA 4I2UA 3ZMKA 2VM2A 1SKSB 2FNOA 1JHBA 5G5FA 1EV4A 4V2LA 4ZL8A 3I6AA 3KTBA 2EIRA 1EOGA 1A8YA 1MDJA 3H79A 2OBKA 3H93A 2OE1A 2X8HA 2AYTA 3O3TA 5ELGA 4HDEA 4K1FA 1VF3A 3RDWA 3AY8A 3QDNA 3HZ4A 2LV3A 2CVDA 2TRXA 3M1GA 4WETA 3IAS2 18GSA 4IW9A 2MMOA 1OC9A 5FT3A 1A0RP 3BCIA 4TN8A 1QQ2A 1T8EB 1T1VA 1SJ6A 2B1KA 2PWJA 2WDUA 1XWCA 1XCCA 3BOAA 2YZUA 5ECSA 1UC7A 3FW2A 2AJQB 1K0CA 2JZSA 1AW9A 4PGTA 4TXVA 4JRRA 1A2MA 4OCEA 2H1BA 1JLWA 1BG5A 3FRCA 4JZQA 4WBRD 3GSTA 1W4VA 2VIMA 3GURA 3HJMA 2R2JA 2VLUA 2YWOA 1WIKA 3TJKA 4I6XA 3KMNA 1YDKA 2H1DA 3HZ8A 4HU7A 2CAQA 5ABRA 4K9ZA 1EGOA 4HZ2A 3M9JA 2YWIA 3DEXA 4KW6A 2J23A 5G1KA 4PXOA 2MMZA 2H1GA 5JCWA 3GUSA 1F9MA 4ECIA 2X8GA 1MDKA 4L0WA 4IKHA 5G31A 5DVBA 1DUGA 4EL1A 4KGIA 4MJAA 5B6MA 3U6VA 1OKDA 5IMCA 1V98A 2ON5A 1ZGNA 3HA9A 6GSTA 4QQ7A 2XC2A 3QOUA 1VRSD 4K7IA 1J0FA 2FUG2 1OC3A 2OA7A 2OACA 5HFGA 2OADA 4MH3A 1XW5A 1N2AA 3ZITA 2VCVA 4DEJA 2MMNA 1SKWB 4PUAA 2REMA 3NOFA 5ECQB 4OCFA 3HKRA 4EDZA 2JU5A 4ZBAA 4MP4A 4V2NA 1B9XC 5HQPA 2HNLA 3KXOA 1YF0A 5DALB 3UVTA 2L5LA 2HE3A 2PPTA 1FW1A 2LSTA 1CQGA 3F63A 3CTFA 4ACSA 2A2RA 2VCXA 3F0IA 3VI5A 5EL8A 1K0DA 3UVHA 4ZB9A 3ZMLA 4BA7A 2E7PA 4POMA 4EDYA 1TRUA 1U3AA 5F07A 4PNFA 1B8XA 2L6DA 1BAYA 4XHMA 4CW9A 3TJGA 5JWOB 2KP1A 1V2AA 2GSQA 3IPZA 4OMVA 2N5AA 1TTZA 2NBSA 2VL3A 5CRWA 2TIRA 4ZL7A 3W8JA 6GSVA 5A5KA 3DVWA 4WBJA 2HYXA 4EXJA 2GQMA 4BPYA 3ZVJA 3KZQA 2FA4A 2IIYA 2L4QA 3ISOA 1H75A 2F51A 5IO2A 2QKEA 4EO3A 2YZHA 1B4PA 2GSTA 2HXKA 1SJIA 1Z7RA 5IIZA 4HEA2 2WGRA 1EZKA 4IQAA 1F3AA 3WGXA 5IOXA 3LSZA 1XWKA 3EVIA 2K18A 4NHWA 2M46A 5J4UA 3QPMA 3R2QA 1J9BA 9GSSA 2H6ZA 4LLRA 3KH7A 2PBJA 4MK3A 1WJKA 4TR3A 1QUWA 1X9SB 4K7NA 4XS1A 3F4SA 2R37A 3RPNA 1BYEA 2GDRA 4NHZA 5ECMB 1GSDA 4N0ZA 5DBQA 5G5EA 2L6CA 3C71A 3E3EA 4EVMA 1TRSA 2WB9A 2ZUPA 2E2MA 2V6KA 5ECIB 2V41A 4GSNA 1GSSA 1EWXA 2C0GA 1TU8A 3UARA 3G7YA 3M0FA 2O85A 1AQXA 1A0FA 2GZPA 2B6MA 3GKNA 5JCUA 1H4OA 2H71A 4PQ1A 1O8XA 3F6FA 4IHUA 3GKMA 4HZ4A 1MTCA 5B7CA 1G7OA 5AISA 3M9KA 5B8AA 1R5AA 5COHA 1O81A 5DAKB 3MDKA 4FYCA 3J7Yk 4Q5RA 1W89A 1SL0B 3F6DA 4EKZA 3GNJA 2G2QA 1Z6MA 5EY6A 3EMPA 1PA3A 4TXOB 2H66A 4XIHA 5F8BA 3CMIA 4QL9A 2C3NA 2LNSA 1GSQA 4FYBA 2CVBA 5AIXA 1HD2A 3FZ5A 1S3CA 2PU9C 3GX8A 5DCHA 1PKWA 4V2MA 2QC7A 1FOVA 3L9UA 3EMXA 3IRAA 2DJ2A 3O6TA 3LQ7A 4HUAA 3HVSA 4G9HA 1G0TA 3C1SA 4TR0A 4IELA 2I81A 5C04A 3P8WA 1ZYEA 4BVYA 1ACVA 3WYWA 4MJBA 3J7Yb 16GSA 4TRXA 1E6BA 3TCOA 3WT1A 4HJMA 3LGCA 3ZLPA 1JZWA 3FZ9A 3TJBA 4KCEA 3V1WA 3TRPA 2IMIA 1XBSA 1O7UA 2IFQA 4P3YB 1XVWA 2YV7A 6GSWA 2YANA 3U5RE 2AB6A 1EV9A 2DSAA 1T4YA 1GLQA 3IHQA 3ZFBA 3EE2A 2QGVA 2D2ZA 1O8WA 4L8EA 3HHVA 1FAAA 4WXTA 1HNCA 5KN3A 4DVCA 6GSXA 2F9SA 2KUCA 2LRTA 3UBKA 3W6GA 4Q5QA 2L57A 2AAWA 2O7KA 3Q19A 14GSA 1XWBA 3IV4A 4FIWA 1ZCPA 4MJCA 2F8FA 3KJYA 4F9ZA 4RI7A 1XXUA 4ML1A 1GWCA 4KH7A 2C8UA 2K8SA 3EU4A 5L71A 4O32A 4TKYA 3FR3A 4NXIA 3IXRA 3VWXA 1PL2A 1MEKA 3D4MA 5G2ZA 2FWGA 1XWGA 4IVFA 4V1Ap 4Q5FA 1T3BA 2YCDA 3HYPA 1SL1B 1LBKA 4WF5A 5ECKB 2FA8A 3QAWA 4YAPA 1QMVA 2P0GA 3RHCA 4MABA 5HR0A 3VFIA 1DSBA 1YQ1A 3KH9A 5A4WA 5ID2B 2CZ3A 4JR6A 3ED3A 1T00A 2X8CA 1HYUA 4AJ7A 3PR8A 1E2YA 1X5CA 3GH9A 2I9HA 3A2XA 3APSA 4BL7A 3GTUA 4NMUA 4ZIJA 2VD0A 4LL1B 2NDOA 3GMFA 5IPGA 11GSA 4OFNA 2K8VA 2M72A 3GTUB 2HZEB 4AJ6A 2OE0A 1K3YA 4MF6A 3CRUA 1SK1A 4OWYA 5G1LA 3MNGA 1WMJA 3HJOA 4ID0A 3DRNA 4N0VA 4IQ1A 2H70A 1XW6A 1I9DA 4JR4A 1ILOA 1ZZYA 5HFKA 5D9WA 3DMLA 4GCIA 2JL4A 1R5PA 4Q5NA 1ZL9A 1B4QA 4GSTA 2F8AA 4PQHA 4K7OA 4L5OA 4X0XA 4EC0A 2CX3A 3VWUA 4GF0A 1K0OA 3DIEA 1TU7A 1ON4A 3MSZA 4BVXA 1ERUA 5J5NA 4DSQA 4MPGA 2FY6A 4GXZA 2XPEA 3O76A 2DMMA 3JCML 3TKPA 2GT5A 2C1YA 2NPBA 4ML6A 1O73A 2VCZA 1ERWA 1HQOA 2O89A 3GYKA 1DE2A 3DVXA 2DC5A 2PVOC 3A5WA 1GUKA 3VPTA 2GSRA 3GRXA 1PX7A 1PN9A 4KCAA 3FHKA 2PVQA 5ECRB 1SK0A 1GNEA 3FKFA 6GSYA 1T4ZA 1F37A 2H0HA 2LUSA 3M8NA 5DCGA 1TXXA 2J9HA 3H4KA 1AIUA 3F4TA 1GUHA 4ECJA 2JZRA 5INYA 4WR4A 1B48A 1FB6A 4PX1A 3D4TA 1GH2A 2LS5A 3TJFA 2B3SA 1ZMAA 3D0ZA 3D21A 2JSZA 3L4NA 3LEFA 5CRHA 4EE0A 5DALA 2DJ1A 1KBNA 3EU3A 2K6VA 1FG4A 1F3BA 3QR6A 2LKUA 5ECPB 4GWRA 4XS4B 4MZWA 13GSA 1R4WA 4PNGA 1SK2A 7GSSA 1GNWA 1TK8B 4YQUA 2VL9A 3VWVA 5HR1A 3C8EA 1GRXA 2CZ2A 5JWRB 2B1LA 5H5RA 3GX0A 3OR5A 4WF4A 1YJ6A 1GP1A 5AN1A 3DD3A 4O92A 1A2LA 1Z9HA 4N10A 2YP6A 2H76A 1RW1A 3TKQA 4WR5A 5CREA 2H8LA 4ULXA 3KD0A 2CVKA 3IE3A 4HQSA 3UBLA 1F6MC 2B5YA 2B5EA 1Q4JA 6GSSA 3EYTA 4AJ8A 4N11A 3CSHA 1GSEA 1GULA 3TRQA 3TB2A 3UL3A 3UIWA 1ML6A 3LORA 5DJMA 1GL8A 3GL5A 3ZVJD 10GSA 3LYKA 1U6TA 2L59A 2FWHA 1SU9A 1URMA 2R4VA 5GAPD 4DSSA 1SJZA 3ZZXA 3IA1A 4YAVA 1RQMA 2I3YA 1I5GA 4F2IA 4GSSA 1YEPA 4E8HA 2B7KA 4DSSB 3IAM2 2EIOA 2F3MA 3Q6OA 1JLVA 3QD9A 5ELAA 5LD0A 4EF0A 2P5QA 3UEMA 3UJ1A 3KIJA 2RLIA 3CSJA 2GS3A 2N5BA 1GLPA 4HJ2A 5CAXA 2VO4A 1G6YA 5F0GA 2GSSA 1PX6A 4YQVA 3KP9A 4KE3A 6GSUA 1LU4A 3QAVA 3SBCA 3RBTA 5J9CA 5F06A 1XVQA 5CNWA 1V9WA 2KOKA 1OC8A 2O87A 1MD4A 2L5OA 2HRFA 1AQWA 4K8MA 2IPAA 3FZAA 8GSSA 3APQA 2I1UA 3CSIA 2LJKA 5IMVA 5E4WA 1TJDA 1Z3EA 4BWSA 1JZOA 5LCZA 1GSYA 4MLYA 5D9XA 1K0AA 5DAKA 1ERVA 20GSA 3KGKA 3VLNA 1LJRA 3P7XA 4G19A 4I5QA 1T7PB 2H0IA 2GZZA 1O85A 4GQCA 4GQFA 4TXOA 2FWEA 1M99A 2VCTA 3FR9A 3N9JA 1TP9A 1GSUA 1X5EA 1A24A 3LWAA 2C3QA 4ZILA 3QFBC 2XHFA 2A4VA 3BJ5A 4YQMA 2AHEA 4O5RA 1OYJA 1OKTA 1TKDB 1RK4A 2XPDA 5D9VA 2B7JA 3IK7A 4MZCA 5D93A 3TKSE 1WPIA 2DJ0A 3ERGA 5J3RA 1GSFA 3QAGA 3P90A 3BBYA 5A4VA 4MH2A 1PSQA 5IMZA 4ILFA 1WP0A 2H1AA 1AUCA 2H01A 2HLSA 2IMFA 4KUNA 3TKSA 5IPHA 3FY7A 1FVJA 3CRTA 1K0BA 4KNDA 4LMWA 4MZBA 4N30A 3TOUA 2E0QA 2RM5A 2TRCP 3HD5A 1ERTA 2FHEA 3GKXA 4TR1B 3TRXA 3ERWA 2FD3A 4ZXGA 4PQIA 4KDUA 3G7IA 3HY2A 1A23A 2VL2A 2KP2A 3D22A 5IM9A 3EURA 1NHYA 1KNGA 4L5LA 4D73A 1J08A 2DLXA 4KSMA 1M2AA 5AIVA 3C1RA 3KCMA 5E59A 1XW9A 2LRCA 4QL7A 1NW2A 4RI6A 1M9AA 3I9V2 4D73B 4FO5A 3I69A 4JEDA 1WRYA 2FGXA 1Z6NA 2EIQA 3DXBA 2LTKA 1AAZA 3E9JB 3DYRA 3TDGA 3LXTA 1PMTA 2V2GA 4F0BA 1BEDA 2PUKC 4HI7A 4G10A 2NTOA 2JZTA 5GSTA 5J41A 1NHOA 2ES7A 4K6XA 2GZYA 2HSYA 5ID2A 3QCPA 3D5JA 2DJ3A 4KX4A 4IN0A 1K0NA 4K2DA 3VI7A 1SL2B 5GSSA 2JACA 1CQHA 2ALBA 5ECHB 4LA1A 4KA0A 1XWAA 4KSOA 5KN0A 5KEJA 3DKSA 1M0UA 3GFKA 3WT2A 5AGYA 1B9YC 2GQKA 3H8QA 1FB0A 4OFMA 3ZFLA 3TGZA 5H5SA 1Y25A 2AUVA 4F03A 2AV4A 4WEYA 2IMEA 2OKAA 2HSHA 2H73A 3EC3A 5LNKe 3GH6A 2G0FA 2HZEA 3DGQA 3CBUA 2MYGA 1OE8A 3E0UA 4JE1A 1VGLA 4FYUA 1SENA 4KDXA 5D96A 5ECNB 3ZRDA 1X5DA 2VOCA 3GL3A 2HI7A 1NM3A 1N8JA 1GTBA 1KTEA 2LEGA 4DSRA 4XRAA 3VWWA 2LQOA 3VK9A 1NSWA 2RUFA 2MBSA 3A2VA 3EINA 4NV5A 1TRWA 2YNXA 2XBIA 1R26A 3UOMA 1XOBA 1A2JA 2XBQA 2X64A 3H1NA 3CTGA 1FHEA 4HOJA 1OAZA 1IYHA 5IQYA 2YV9A 5A4UA 2V1MA 3GSSA 5IOWA 3ZIVA 3WGDA 3S9FA 1EEJA 1TOFA 4I2TA 2RM6A 2DBCA 3CYNA 3A3TA 4TVEA 3G9BA 2NVLA 3L9SA 3TUEA 3LXZA 1DE1A 2HT9A 4TR4A 3F3RA 1PRXA 1OC9B 1VF2A 2BMXA 2EC4A 2N5FA 3PH9A 4X1UA 1DBYA 1AXDA 3MAKA 1HNAA 2Z9SA 4JU5A 1ST9A 3KEBA 3IDVA 4MCUA 3LFLA 1M2BA 1JZDA 2YPMA 5D9TA 3IC4A 2H0GA 2HZFA 3ZTLA 4K0NA 1YZXA 5DJLA 2V32A 2HFDA 5B6NA 3HDCA 4POKA 5IO0A 2E2GA 3QFAC 2WULA 4NWYA 1Z7PA 2GVPA 3IK9A 2DIYA 1XFLA 4OO4A 4XTSA 2VCQA 3GA4A 2MBTA 12GSA 1A8LA 4I8BA 1K0MA 2VM1A 2C4JA 5D73A 4IBPA 4JBBA 5J9BA 2CV4A 3US3A 1TW9A 1YEXA 4Z7XA 4IJ3A 3UAPA 1X9MB 1OVNA 3G7JA 4K0GA 4RUVA 4XS4A 2CX4A 1MDIA 2RUEA 19GSA 1VF1A 2PGTA 2H6XA 2R5GA 5CRGA 1V40A 2X99A 3LYPA 2MMAA 2IN3A 2CT6A 5IMFA 1OE7A 1K3OA 4ECBA 2LJRA 4OD7A 3BCKA 1KEBA 4G2EA 4F82A 5D8IA 2VLTA 4AF2A 4LL4B 2H19A 4WKWA 1XOAA 3ZL5A 5ENUA 4RQRA 2H6YA 3TJJA 1YKCA 2CQ9A 2BTOT 5DQSA 4ZBBA 4E8EA 1SKRB 1MD3A 1M7TA 2R3XA 4H86A 5CRDA 1WWJA 1U87A 4IS0A 1EP8A 3EWLA 4XCSA 5HFIA 2WJUA 2L4CA 1S3AA 4HU9A 2KHPA 4IP6A 1M9BA 3TKRA 3KP8A 4ZL9A 1QXHA 3F8UA 4YH2A 1YF1A 5CYYA 2IMKA 2LNTA 4PURA 3GN3A 2H30A 4LMVA 3HCZA 5ECOB 1BJXA 4ECCA 3ZIJA 3N5OA 1PQNA 1PL1A 2IWTA 3TKSC 2YWNA 4NPBA 5JWQB 2GTUA 1YY7A 4EUYA 4O7HA 1PD21 3UMAA 1SYRA 5HR2A 4MPFA 1TI3A 3L78A 2CAIA 1K3LA 2P5RA 4ZB6A 1VF4A 5CP1A 1BQ7A 3LJRA 1G7EA 1TDIA 2VAFA 5JCGA 3FK8A 2IMDA 2OJLA 1Q98A 3HXSA 4POBA 2DJKA 4J57E 2GLRA 4NAXA 22GSA 2GT6A 2YJHA 3Q74A 2A2SA 2VL2C 3RHBA 2FCHA 2WCIA 3IOSA 4KB3A 5ECLB 5DQYA 2C3TA 3RPPA 2JSYA 3CXGA 4HQZA 2C0DA 2VCWA 5FHIA 3F3QA 4GTUA 2WFCA 4MF7A 3TOTA 3WGEA 2LRNA 2HRNA 2PMTA 1PGTA 2LJAA 5EPFA 5KN2A 5IMDA 4GLTA 4V1Ag 2DJJA 4KAEA 5GZZB
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4QL7A

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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