4QL9A

Crystal structure of c-terminus truncated alkylhydroperoxide reductase subunit c (ahpc1-182) from e. coli
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkylhydroperoxide Reductase subunit C
publication title Key roles of the Escherichia coli AhpC C-terminus in assembly and catalysis of alkylhydroperoxide reductase, an enzyme essential for the alleviation of oxidative stress
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ql9A00
5EY6A 2H1GA 1MTCA 1GLQA 2MYGA 2C3NA 3VWWA 4IVFA 1GH2A 1O8XA 1O6JA 4MJBA 3LFLA 2LEGA 2LRTA 4L0UA 1JFUA 2K6VA 4E8EA 4TRXA 1EEMA 1GTAA 3E3EA 2B7JA 3IDVA 3DEXA 5LNKe 4IKHA 1YF0A 2DSAA 1V40A 4MZWA 2GZYA 3APQA 4BWSA 2CAQA 4ZL9A 1THOA 1EWXA 2YZHA 1K0BA 5JCUA 1WP0A 4LMWA 2GSRA 3ZIVA 4Q5QA 1TP9A 3LQ7A 3FRCA 2VUPA 2FA8A 3CXGA 2AJQB 4K1FA 3C1SA 4CHSA 1OVNA 3TKSC 3VPTA 1URMA 2FWGA 4TVEA 2F8AA 3FR3A 1AW9A 5D93A 4EC0A 3HVXA 3EC3A 1BG5A 5ELGA 4DSSA 3ZZXA 1SJIA 1Z7RA 1GUMA 3EE2A 4RUVA 5A4UA 3K8NA 1XW9A 4WBJA 3A2WA 4H86A 2B6MA 5B7CA 5LD0A 3H8QA 5A5KA 4KB3A 3FW2A 1ERTA 2GDRA 4HU9A 4K7IA 3KH9A 1QMVA 1UN2A 5DDLA 1EGOA 5CRHA 1ZMAA 3LYKA 3BD2A 1U3AA 4FYUA 1GSDA 3I43A 2K18A 2PBJA 1X9MB 1K0DA 4EE0A 2LQQA 1K3YA 5JWQB 1O81A 1SJ6A 6GSWA 2ZNMA 4IELA 3G7IA 5ECKB 2DJ2A 4GCIA 1PRXA 4Z7XA 1OC9A 3IRAA 2R6KA 2LRCA 3LYPA 2OBIA 4RQRA 1Z3EA 4TR0A 2WDUA 4G19A 1UC7A 2PERA 3MNGA 2LNTA 2X8GA 4MZBA 4DEJA 2C80A 3G7JA 3TOTA 5ECLB 4BWQA 1WRYA 2YCDA 2VOCA 1BQ7A 1XOAA 5GSTA 6GSYA 5J9CA 1ZZYA 5ABRA 1ZYQB 3BJ5A 2R2JA 4F82A 4CDOA 4EXJA 5ID2A 2H6ZA 2RM6A 4MF5A 5A4WA 3US3A 1JZOA 2IPAA 2HLSA 2H1BA 3NOFA 1JHBA 3KP8A 5F8BA 1H4OA 1FG4A 1FW1A 3HYPA 5DCHA 1SL2B 1XXUA 1HD2A 1TRUA 1PX7A 3ERFA 3ZVJA 2NDOA 1SKRB 1USBA 1M7TA 3CSIA 2C0DA 2V6OA 22GSA 4FH8A 4NHWA 1O8WA 3TRQA 3GTUA 3KMOA 3GKXA 3DVWA 13GSA 4WR4A 3VURA 3I6AA 2I1UA 1BX9A 5HFKA 1Q98A 4KAEA 2L57A 4MZCA 5E4WA 4YAPA 3I69A 5J3RA 2WB9A 5AN1A 3DXBA 4NV5A 1DBYA 1Z6NA 4GQCA 3UVHA 2N5AA 3SBCA 4ZBDA 5D9XA 2RLIA 1T8EB 2RUFA 4MF6A 4PNGA 1U6TA 3OR5A 3GA4A 2M72A 3SWLA 4AJ8A 3M3MA 3S9FA 1X9SB 4RQXA 3IV4A 2DBCA 1FAAA 2KUCA 2JADA 5ECPB 1PD21 2BJXA 3KD0A 3IHQA 5J9BA 1GUKA 2IN3A 5EVOA 2OBKA 4EUYA 2VM2A 1AXDA 16GSA 4MDCA 1YDKA 2JU5A 1EGRA 1OYJA 3VLNA 2C4JA 1F2EA 3F3QA 1J9BA 4TR4A 3VFIA 2YOIA 4V2MA 1DUGA 2GTUA 4XRDA 1PL1A 1TOFA 1XOBA 3GX8A 2EC4A 2PMTA 4PGTA 4GSSA 2VLTA 2V1MA 2EIQA 2VL2C 2DIZA 4IQ1A 2JSYA 3VK9A 3ZMKA 4O7HA 5JWOB 2VCZA 2XC2A 5D9VA 1SD9A 2RIIA 3TJBA 1F9MA 2VD1A 1Z5YE 2L5LA 3VI7A 3KMNA 4MABA 5DJLA 3GKNA 4HDEA 2ON5A 2DJ3A 1S3CA 4PQIA 4MH3A 1HNCA 3HHVA 2HZEA 3HKRA 2HSYA 5FT3A 4GF0A 1WPIA 2XBQA 3W8JA 1ERUA 3FEUA 3WYWA 4TN8A 4HUAA 1VRSD 4OWYA 3UBKA 3DRNA 4LL1B 1Q4JA 3C8EA 5CYYA 3LXTA 2B5YA 3ZMLA 4L0WA 4AF2A 3ZREA 2MBSA 4POKA 2VCWA 2XHFA 3ZITA 1T4ZA 1G7EA 5DVBA 1Z6MA 2FWFA 4WF5A 5G31A 3GFKA 4ACSA 4G10A 5ID2B 2OE3A 3TJFA 4MPGA 2H01A 3D4TA 2PU9C 3KH7A 1BYEA 4RI6A 3GN3A 1MD4A 2EIRA 5IM9A 5HFGA 5GAND 2L59A 2V41A 3CYNA 1XWAA 4KGIA 2PN8A 1RK4A 2R4VA 4F03A 4N10A 5LCZA 4ZBAA 1PGTA 3P8WA 3FR9A 3P90A 2IFQB 2WZ9A 3ISOA 3TJGA 1NHYA 3C73A 3GTUB 3KGKA 1GSQA 4NMUA 4Q5RA 1GSSA 5H5QA 3PGTA 5IMZA 2XPDA 3UEMA 1XW6A 3GIXA 3FK8A 2TRCP 1PQNA 3BCIA 1M2BA 2H74A 4QL7A 5ECHB 3F4SA 2F8FA 2FY6A 2HYXA 4NAXA 3LJRA 4LMVA 1THXA 1GULA 1LBKA 1F3AA 2LTKA 2CA8A 3A5WA 5AISA 4KDUA 5DJMA 3J7Yb 2PVOC 3QR6A 1K3OA 2O85A 3UVTA 4PXOA 3QAGA 3RPNA 3TKSE 3R2QA 3G7YA 1DE1A 2YWOA 4MPFA 4BPYA 2QC7A 2VCTA 2G0FA 3IR4A 2R37A 3NZNA 3L9SA 3UOMA 2AV4A 2DJKA 5ENUA 1A0FA 2NBSA 3H93A 2N5BA 1J0FA 3DVXA 2VD0A 5GAPD 4GTUA 5ELAA 1GSFA 3CMIA 3DD3A 2KOKA 3FY7A 6GSVA 5DBQA 2B1KA 3KCMA 2P5RA 2YP6A 1QK8A 2K9FA 4QQ7A 2Z9SA 1XCCA 4HOJA 4N30A 2H30A 5HR1A 2E7PA 3HXSA 2VM1A 4IW9A 3TUEA 1YKCA 1ZL9A 4I2TA 1V9WA 2JSZA 4POMA 3TCOA 3LXZA 1A2LA 1IYHA 4MCUA 1MEKA 4EL1A 1FHEA 4ISDA 4XS6A 4IJIA 2BMXA 4HJ2A 3BOAA 1SD8A 4JR4A 1N2AA 2YNXA 3HDCA 3N5OA 3IOSA 4JRRA 5CO3A 3ED3A 7GSSA 1M2AA 2HZEB 6GSSA 1QGVA 2LV3A 5ECQB 2GQKA 4L8EA 4KH7A 3LWAA 1O73A 5DQYA 1T00A 4V1Ap 4MJEA 5F0GA 3D6IA 5IPGA 3ZVJD 3WGXA 4I2UA 1LJRA 2V32A 2B1LA 1YKAA 1JLVA 1HQOA 2IL3A 4YH2A 1VF2A 3H4KA 4WKWA 3GL3A 4YAVA 3BBYA 4XS1A 4HQZA 4MF7A 1KEBA 1GL8A 5G30A 1SK0A 5ECSA 3H79A 2DC5A 3TJKA 1I5GA 2YN1A 1E6BA 2DJJA 1G6WA 2HFDA 2IMKA 3KZQA 1K0NA 5DAKA 4IBPA 1R5AA 3WGDA 5ECIB 1GWCA 3IXRA 1SL0B 4XRAA 1Z9HA 2XPEA 1ABAA 2X99A 2CVBA 2F3MA 1X5DA 4FIWA 4NHZA 3L9UA 3CRTA 1O7UA 2H75A 3HVSA 3DMLA 4PUAA 3WD6A 2GQLA 2O7KA 4POBA 5L71A 5D9TA 2GSSA 4IP1A 4NWYA 4OO5A 5C00A 5E59A 3EVIA 12GSA 3CBUA 4JEDA 1J08A 4J2FA 4NXIA 2R3XA 4G9HA 1YF1A 1A8LA 1B4PA 4TXOA 1YY7A 1HNAA 1W4VA 2EIOA 4ZL7A 18GSA 2NVLA 1X9WB 4ML6A 4ECBA 5G1LA 2V2GA 2F9SA 4IS0A 2DJ1A 2LJAA 2LQOA 1V2AA 4XS4A 4EDZA 1T4YA 1R7HA 5A4VA 5IPHA 3U5RE 3J7Yk 3L9VA 5IOWA 1WJKA 2CX3A 1TJDA 5AGYA 3CTGA 1M9BA 1TKDB 1JZDA 1XVQA 3GKKA 1OKDA 1TW9A 4YQUA 1K0AA 5KN2A 2A2RA 3TB2A 3FHKA 2K8VA 3KEBA 1U88A 2MBTA 3F4TA 2KP2A 2J9HA 1Y6EA 4O32A 2ALBA 1GTIA 3IC4A 3QDNA 1V58A 4GSTA 5IO0A 5DCGA 5GSSA 3VWXA 2PPTA 4MJAA 1SU9A 4GXZA 4OO4A 4ML1A 4TOPA 2HXKA 4IN0A 5CAXA 2H8LA 3EMXA 5B6MA 4JU5A 1PMTA 1NHOA 2H71A 2OJLA 1AQVA 2H0IA 2GZPA 3KTBA 4WETA 4I97A 4NV2A 1B4QA 1K3LA 2JACA 4X1UA 1O85A 4KSOA 1EV4A 1DE2A 2VCVA 3QAVA 2L4CA 3W8SA 3PR8A 2GZZA 4CW9A 2GVPA 4DSSB 1I9DA 3D4MA 4QL9A 3VWVA 3QD9A 5J5NA 3UARA 2FWHA 3G9BA 11GSA 2L4QA 3GKMA 1YJ6A 4PQHA 5G5EA 4KNDA 2K8SA 1VF1A 2J23A 3JCML 4K2DA 4HS1A 1A2MA 3F63A 1G7OA 2WGRA 2KHPA 3W6GA 4F0BA 5IO2A 3UL3A 5D8IA 5ECRB 3C71A 4HZ4A 3FZ4A 2VCXA 3WT1A 3BCKA 3H1NA 4MH2A 5AIVA 2CAIA 3A3TA 5IIZA 3MAKA 1A2JA 3UBLA 1EOHA 4BVXA 3WGEA 2FGXA 4V2LA 2P31A 1TI1A 3EU4A 5CREA 3A2XA 3ZTLA 1OC9B 2HSHA 5DAKB 5GZZB 4K7NA 5KN0A 4ECCA 3HCZA 4HQSA 5JCWA 3EMPA 3UJ1A 2I3YA 4AJ7A 4PNFA 2O8VB 2OA7A 1UA5A 3M9JA 3IE3A 1WIKA 4IGJA 2LRNA 2YV9A 1XPVA 4BA7A 4D73A 3KP9A 3ZFLA 3GRXA 3Q74A 4KCAA 2C0FA 4HJMA 3EYTA 3Q6OA 3HJPA 1CQGA 1PA3A 4O5RA 1DSBA 5HR2A 2H1AA 2I81A 3E9JB 4LLRA 2IMIA 5CRWA 5G1KA 2C3QA 2E2GA 4ZBBA 2VCQA 1RW1A 3MDKA 3GX0A 5IMAA 2OKAA 2JZSA 4ZB9A 2DIYA 1N8JA 1ML6A 3TJJA 5EL8A 2F51A 2PWJA 2CVKA 1ZOFA 3LORA 5ECOB 2X8CA 4MMMA 3IK7A 4HI7A 2HI7A 1AQWA 4JE1A 2JZTA 2B7KA 1OE7A 4ZXGA 2E2MA 2GSQA 2WJUA 4XS4B 1BJXA 2PUKC 3EU3A 3M9KA 2FD3A 1TRVA 3WT2A 2LJKA 4OMVA 1FO5A 4K9ZA 2DLXA 3L4NA 1VF4A 2L6CA 1PL2A 1JLWA 4KUNA 4OFMA 4WF4A 1UVZA 3UIWA 4GLTA 3AY8A 6GSTA 1SKWB 3RHCA 5IMCA 2B5EA 2LNSA 3DYRA 1HNBA 4O92A 4MLYA 2B3SA 1W89A 2VL9A 2H6XA 2YWMA 2YJ7A 4MA9A 4DSQA 4NPBA 2A2SA 5G2ZA 1QUWA 2O89A 5C04A 1SENA 3TKQA 2IIYA 3RPPA 2ES7A 1SL1B 4JR6A 2YPMA 1G0TA 5FWGA 4ULXA 2H70A 2CX4A 5D73A 2A4VA 4EVMA 3O3TA 5J4UA 3FZ9A 4KW6A 1PKWA 1HYUA 3GH6A 2C0EA 2H76A 4FYBA 2OE0A 3I9V2 3EINA 1KTEA 2CZ3A 2JL4A 3C1RA 2HE3A 2OACA 2H0HA 3Q19A 4KSMA 1SK2A 2H19A 4TR3A 1NM3A 3GV1A 1AAZA 1PKZA 4ZB6A 3E0UA 3IBHA 1QXHA 4V2NA 3GYKA 4JBBA 1PSQA 2LUSA 4IHUA 1V98A 3APSA 5HR0A 1JZWA 3RAZA 3ZLPA 4WR5A 3GUSA 2CVDA 4EKZA 2YANA 1ILOA 4K6XA 4ECIA 3DIEA 2JZRA 2MMZA 4N11A 4I5QA 2N5FA 1XBSA 3RBTA 3QCPA 3TKPA 3TOUA 3HY2A 3KXOA 3ERWA 3HA9A 20GSA 3P2AA 1TK5B 1FB0A 4IJ3A 3APOA 1ZGNA 2C1YA 4EF0A 4I8BA 3KM6A 4X0XA 4OCFA 3GHAA 5B6NA 1XFLA 2D2ZA 2DMLA 3LSZA 1KNGA 4IP6A 3HD5A 1TK0B 3HZ8A 4LA1A 5IOXA 4MJCA 2M46A 3FZ5A 1WWJA 2R5GA 1CQHA 2H66A 3NIVA 5AIXA 2VAFA 1EOGA 4F9ZA 5DALA 5KN3A 3N9JA 3RHBA 5F05A 3TGZA 3CRUA 4XTSA 5IQYA 4OD7A 3KTLA 14GSA 3GSTA 2NPBA 2E0QA 4D73B 1A0RP 4PURA 1M0UA 1AC1A 3F6FA 1GTBA 4OFTA 3LG6A 4ZL8A 4ZILA 3A2VA 4TR1A 1TXXA 4Q5NA 4E8HA 5IMDA 1T7PB 3DGQA 4V1Ag 4POLA 4DSRA 5H5SA 1K0CA 4WXTA 3U6VA 1VF3A 1K0MA 1PX6A 3HVVA 1IYIA 1FB6A 2B5XA 1OAZA 1OC3A 3F3RA 5DQSA 3EURA 5B8BA 5G5FA 1GLPA 3D5JA 2MZCA 2H6YA 1ZYEA 2H1DA 1C72A 1XWGA 5H5RA 1XZOA 4YQVA 17GSA 3QMXA 1ACVA 5JWRB 1SJZA 2H73A 1B48A 2HRFA 4WBRD 1FVJA 1OE8A 2VLVA 1PN9A 1AQXA 1SK1A 3LEFA 5HFIA 1A24A 4N0ZA 4GSNA 5D96A 2HNLA 2LJRA 2L6DA 2M80A 2C3TA 1YEPA 2QGVA 3D0ZA 2VL2A 2LSTA 1EZKA 3UMAA 2YWIA 5CP1A 4I6XA 1S3DA 5D9WA 1EP8A 1WE0A 2FNOA 4MK3A 2OADA 2GGTA 3F6DA 3TRPA 2TRXA 1BEDA 2OE1A 4TW5A 3M0FA 2IFQA 2GSTA 2WULA 4MP4A 4F0CA 3VI5A 3LGCA 1TDIA 2WS2A 3IAM2 3HJMA 1A8YA 2LKUA 2H72A 2FCHA 5F07A 1YQ1A 3ZIJA 9GSSA 4L5OA 1MDIA 2NTOA 2KP1A 3IK9A 8GSSA 1ERVA 3GH9A 3F8UA 3TKRA 4GQFA 2FUG2 4HEA2 3GMFA 1GRXA 4ZB8A 5IMFA 4ZIJA 1R4WA 1GUHA 1YZXA 1R5PA 5INYA 2ON7A 4J57E 1TTZA 1GSUA 3EWLA 1XWBA 3FR6A 4KE3A 5FHIA 5JCGA 4L5LA 1TRSA 3UAPA 1E2YA 4K8MA 1JZRA 2WFCA 1XW5A 2C8UA 1GNWA 2AYTA 1TI3A 2RUEA 2AUVA 3KJYA 5F06A 1U3IA 4P3YB 2P5QA 3FYGA 2GT6A 3GL5A 1B9YC 3C7MA 3O76A 5CRGA 4OFNA 3MSZA 5EPFA 4AJ6A 4TKYA 3VWUA 2GT5A 2FA4A 3VPQA 4ID0A 2MMAA 2I4AA 2DMMA 3DKSA 2VLUA 1AIUA 3F4RA 2ZUPA 4AGSA 4DVCA 4GRFA 1ZCPA 2ZCTA 3QOUA 2FWEA 5DALB 2FHEA 4XHMA 1GNEA 4GWRA 4PX1A 1EEJA 1X5CA 2G2QA 3L0HA 1SKSB 6GSXA 1TU8A 4F2IA 2BTOT 5HR3A 1NW2A 1RQMA 2CT6A 4PUFC 1SYRA 3HZ4A 2O87A 3RDWA 1T1VA 1F37A 2HRNA 1GTUA 1QFNA 3QFAC 3M8NA 4TR1B 5HQPA 3O6TA 2DJ0A 4K0GA 2I9HA 3GURA 3IA1A 1XVWA 2L5OA 3ME7A 4ECJA 4XCSA 3F9UA 4KA0A 4BL7A 3ZL5A 4BVYA 2IWTA 3M1GA 3FZAA 3L78A 2IJYA 3ZRDA 2WRTA 3FKFA 1S3AA 5ECNB 1EP7A 2REMA 4X43A 1AUCA 4G2EA 1G6YA 3DWVA 4J56E 1BAYA 3QAWA 1VGLA 3GSSA 2FLSA 3ERGA 4EDYA 4YQMA 1ON4A 1KBNA 4WEYA 3PH9A 3D21A 2QSIA 1B9XC 4Q5FA 3PINA 1X5EA 3IAS2 4OCEA 3F0IA 5CRDA 2PGTA 1GP1A 1MD3A 1Y25A 3TRXA 6GSUA 2GS3A 1MDKA 1Z7PA 2KLXA 1LU4A 4TXOB 1M99A 1B8XA 2GLRA 2X64A 4HU7A 5COHA 4TXVA 1XWKA 5CNWA 1K0OA 4PQ1A 1TRWA 5KN1A 1XIYA 1H75A 3KIJA 4FYCA 2GQMA 1WOUA 3CTFA 10GSA 4IQAA 2MMOA 2AB6A 3QFBC 3TKSA 3GNJA 2YJHA 2H0GA 4LL4B 5B8AA 5IMVA 1EV9A 2WCIA 4XIHA 4ILFA 3P7XA 1XWCA 3QPMA 2VIMA 1MDJA 1FOVA 1A23A 1TU7A 2VL3A 4KDXA 3D22A 2QKEA 4RI7A 1GSEA 2HT9A 2CZ2A 1WMJA 5KEJA 2MMNA 2VO4A 19GSA 2XBIA 3IPZA 1GSYA 1QQ2A 2TIRA 2AAWA 3V1WA 3ZYWA 4JZQA 4KCEA 2P0GA 2YV7A 2C0GA 4K7OA 2CQ9A 4FO5A 1SYXA 4KX4A 1TK8B 1R26A 1ST9A 2LS5A 4K0NA 4KDYA 1V57A 2YZUA 5ECMB 1OC8A 2YWNA 3MWHA 1ERWA 2IMDA 4N0VA 1OKTA 2CV4A 3ME8A 2IMEA 2RM5A 2HZFA 2AHEA 1FVKA 3CSHA 4EO3A 1M9AA 1T3BA 4HZ2A 1U87A 1F6MC 3TDGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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