4X1UA

The structure of ahpe from mycobacterium tuberculosis revisited
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
PRGSHMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin MT2298
publication title Revisiting sulfur H-bonds in proteins: The example of peroxiredoxin AhpE.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 50
structure length 156
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x1uA00
2VL3A 2HSHA 1TRSA 4OCEA 1X9SB 1U3AA 3C7MA 3RPPA 3QCPA 2FD3A 2LJKA 1ABAA 2NPBA 4FYCA 4XRAA 1PX7A 3EURA 5IPGA 1WRYA 5HFGA 1B9YC 2QC7A 5C00A 5H5QA 2EIRA 1YZXA 3N5OA 2LJRA 5B6MA 3VI7A 4IVFA 1TP9A 1G7OA 1F37A 2H71A 3KP8A 4ZB8A 1A8YA 2MMOA 1TDIA 3KTLA 2OJLA 3CSIA 4BWSA 4KW6A 4ZL7A 2FWGA 4J56E 1S3CA 2FWEA 1ZCPA 2YANA 4MF7A 1Z6MA 2LRNA 3ZFLA 3L9UA 3FKFA 3EMPA 2WFCA 3M8NA 3O6TA 1AXDA 2IPAA 1Q98A 2F3MA 2VCZA 1JLWA 4GWRA 1M2AA 3FR6A 5JWQB 4I8BA 1AC1A 2DJ0A 3HVSA 2BMXA 4MABA 2LRCA 2GTUA 2L6DA 4POMA 1GH2A 2IFQB 4K7NA 4N10A 3GH6A 4EXJA 2GT5A 4BWQA 3CYNA 1O85A 1WMJA 4K7IA 4ZBBA 2EIQA 4HU7A 2KLXA 3GUSA 3G7IA 4EUYA 1JFUA 2YV9A 1SKWB 2O7KA 1FG4A 2H74A 1OVNA 1T3BA 5ECNB 4OO5A 3UJ1A 1OC9B 1GTIA 1EOGA 3US3A 3LORA 4GQCA 4ACSA 1K0DA 3GMFA 4V2NA 4AF2A 5GSTA 2C0EA 2LTKA 1HNCA 1MTCA 1Z7PA 2H66A 3LXTA 4MPFA 1T1VA 4KUNA 3RPNA 4ECCA 1GLPA 1MD3A 2YWNA 1Z9HA 5IMAA 2DJ1A 4WR4A 2KHPA 2H72A 3M9KA 1WOUA 1XOAA 1V58A 4OFMA 2DJKA 4JEDA 2YP6A 3HKRA 1R4WA 3TKQA 5CREA 2RM5A 5CO3A 1VRSD 4EDYA 2OE1A 4WEYA 2RIIA 4EC0A 4KGIA 3KXOA 2FLSA 2H6YA 3GX0A 3ZLPA 4EF0A 1Y25A 3KGKA 3G7YA 1EEMA 1B4PA 1QMVA 4HU9A 4ISDA 1AUCA 2IFQA 5G2ZA 3TOTA 4HQZA 1XXUA 2LV3A 4L5LA 3F0IA 4MZCA 4L8EA 2L4CA 1PKZA 4KX4A 4N11A 2X8HA 1ERUA 3FZ4A 4MZBA 3BD2A 3LYPA 4EKZA 3WGXA 4PURA 2AYTA 1YKCA 3HXSA 2QKEA 1OKDA 1OC9A 4QQ7A 3ED3A 3LSZA 1TRWA 3HA9A 4BA7A 3TRQA 4OFTA 1A8LA 1G7EA 2H1BA 2VIMA 4KE3A 1FAAA 2YZHA 3UIWA 1JHBA 3TJJA 4WF4A 4DSQA 1UVZA 5G1LA 1GLQA 2CVKA 3HVXA 1ZOFA 1GUKA 3VWUA 3F6FA 4PNGA 4NV5A 2OE0A 1UN2A 1OKTA 3IPZA 1M99A 3TJFA 3C73A 4BL7A 2GQLA 2KOKA 4PQ1A 2NBSA 1FVJA 5IM9A 2XPDA 3EVIA 2XPEA 5CNWA 3F4RA 2B5XA 3Q18A 1TU7A 2IMFA 1PSQA 1SK0A 3A2XA 5IO0A 3UL3A 3KJYA 3ZITA 3TUEA 2VD0A 4IHUA 3ZVJD 3GTUB 1XZOA 5JWRB 1YF1A 1PRXA 1SJZA 2ALBA 2PVOC 2HRNA 2L4QA 3QAWA 4X1UA 1FW1A 4WETA 5COHA 1HQOA 4IBPA 1WE0A 1WIKA 4EL1A 1SK1A 1U88A 1FO5A 1QQ2A 4MCUA 2I81A 5B7CA 5ELAA 1AAZA 4DEJA 2B6MA 1VF1A 3QFBC 2F51A 2EIOA 1VF3A 4FYUA 3VPTA 1E6BA 3GV1A 3KCMA 2BJXA 1EV9A 2FA8A 5H5RA 3LJRA 1PX6A 2ES7A 4PUAA 2O85A 1S3DA 2FHEA 4O7HA 2QGVA 5JWOB 3DRNA 2YWMA 3FZ9A 1ZYEA 2GS3A 4ZBDA 2X8GA 2H0IA 3PR8A 3D4TA 3DMLA 4HEA2 1NSWA 3A2WA 2C3NA 5CYYA 1XVQA 2H01A 2IMIA 4L5OA 1NHYA 10GSA 4F2IA 5DAKB 4HS1A 3CTFA 3GTUA 3NIVA 1TI1A 4MJBA 4V1Ap 2YV7A 3HCZA 5EL8A 1QXHA 4V2MA 5G5EA 1QGVA 2CT6A 1N8JA 2GGTA 2YJ7A 3A5WA 1GSQA 2CX3A 3APOA 2KP1A 4G2EA 3EWLA 6GSTA 3O3TA 2B5EA 5E59A 2TRXA 4V2LA 5GZZB 3H79A 2GVPA 4AJ6A 3GL3A 1T4ZA 3KTBA 2H0GA 4KNDA 1XFLA 4F03A 3I69A 1TK5B 4K9ZA 3ZMKA 2HZFA 1HD2A 4MF5A 3MWHA 3P7XA 4ECIA 2DSAA 4K0NA 4NHWA 3ZL5A 2YOIA 4TKYA 4MF6A 2VO4A 2VCTA 1B8XA 2P0GA 3UMAA 4ZL8A 1Z3EA 3DWVA 3IR4A 1GULA 1FB0A 5ECPB 2H1AA 16GSA 2C0FA 1JZRA 1SYXA 2RM6A 2R37A 4JE1A 4LL4B 4HJ2A 4IW9A 1UA5A 4AGSA 3E0UA 4XCSA 2C8UA 1XWBA 2O87A 4TXVA 5DAKA 3IK7A 5G5FA 1GTBA 1JZOA 3RBTA 8GSSA 3KD0A 1SD8A 2L5OA 1M2BA 1K3YA 2DJ3A 1M9AA 2WRTA 4PQIA 4MH3A 2H1DA 1JLVA 2NVLA 4G19A 1YDKA 5FHIA 3F8UA 3HYPA 1K3OA 5E4WA 2I4AA 4PXOA 4MMMA 2YWIA 1CQGA 4NMUA 1X9WB 4IQ1A 1K0MA 5KN0A 1MD4A 1SD9A 1DUGA 3I6AA 1BQ7A 1PL1A 3M3MA 2DMMA 4YQVA 5DQSA 3J7Yb 2CVBA 1THOA 1AW9A 2JZRA 4E8EA 3IK9A 1B9XC 1EV4A 3FY7A 1KTEA 4PQHA 4ML6A 3CXGA 3TCOA 4KH7A 2YWOA 2IJYA 4TR4A 2FWHA 3VK9A 4ECJA 5B8BA 6GSXA 1QK8A 3PH9A 3TOUA 1TXXA 1XW6A 2MMAA 1K0OA 2PVQA 2E7PA 4GTUA 2LSTA 1OYJA 4ZILA 3LFLA 1SK2A 1LJRA 3SBCA 2HRFA 2X64A 5IO2A 2XBIA 2VLUA 2H6XA 1NM3A 1R5PA 3BCIA 5D9XA 2IMDA 1V9WA 1C72A 4K0GA 3G7JA 3GL5A 5JCWA 1K0AA 4GF0A 4Q5QA 3ZIVA 3C1SA 4E8HA 1AQWA 1GRXA 3MDKA 2KP2A 5ECSA 2AB6A 2OBIA 2IMEA 3UBLA 1ST9A 2MMZA 5HFIA 1ZYQB 19GSA 3BBYA 2OADA 1W4VA 1GL8A 3GKXA 3H93A 4MPGA 3OR5A 2B5YA 3ERWA 4PGTA 3LG6A 4KDYA 4LMWA 4OD7A 3FYGA 2DJJA 2R6KA 2PU9C 3EINA 3TJBA 3IHQA 2YCDA 4XRDA 2FNOA 4IS0A 3DVWA 2H0HA 3H1NA 3LYKA 2DLXA 1EOHA 4F0BA 2DC5A 4L0UA 3KIJA 2F8AA 3KMNA 4TR1B 1J08A 2V2GA 4POLA 5IIZA 1O6JA 5A5KA 3GIXA 1I5GA 4BVYA 3GKMA 4IKHA 4EVMA 2C80A 1T7PB 3VWVA 2GZYA 1T4YA 2HZEB 5DALB 4GSNA 2M80A 2PMTA 1XWGA 2FGXA 4RUVA 1GSFA 5KN1A 4TR0A 3NZNA 1E2YA 3RDWA 3UAPA 3WGDA 3K8NA 4OMVA 3S9FA 1GTUA 3UBKA 4HZ4A 2XHFA 5KN2A 2CZ2A 4MP4A 3QFAC 2VM1A 1SENA 2MBSA 3ZYWA 1NHOA 1OC3A 2ZUPA 4O5RA 1YF0A 4POKA 3KH9A 5ECMB 4HQSA 4N0ZA 4WBJA 3TKSC 5ECOB 2GSTA 4IGJA 1GUHA 3ZZXA 2P5RA 4K1FA 4KCEA 4DVCA 2PERA 3F6DA 3CRTA 2DIZA 2PN8A 3TKSE 4MH2A 2V1MA 4HOJA 3WGEA 4TVEA 1R7HA 4MDCA 4LA1A 4EDZA 5J5NA 3HVVA 2GZZA 4ZL9A 22GSA 1BG5A 4ZIJA 4TR1A 4IJIA 5FWGA 5IOWA 4KSOA 2VD1A 1A2MA 4Q5FA 4MK3A 2ON7A 4AJ8A 2XC2A 1X5EA 1OC8A 1QFNA 1GP1A 4K2DA 5KEJA 2HZEA 5DALA 2CAIA 3IXRA 2B1LA 4LLRA 5DQYA 3KZQA 2WJUA 4HI7A 2E0QA 1S3AA 3DIEA 3UARA 2ZCTA 5ENUA 1YEPA 4LL1B 5JCUA 4K7OA 3UOMA 3WYWA 1XWAA 5H5SA 4N30A 5ECRB 3IC4A 3EMXA 3CSHA 4F9ZA 1LU4A 3TGZA 1XIYA 2GZPA 3IAS2 4XS4B 3VFIA 2N5AA 1EWXA 2V6KA 3APQA 2R5GA 1WPIA 4ID0A 2PGTA 1GTAA 3DGQA 6GSUA 3ME7A 3W6GA 2OBKA 3L9VA 2E2GA 1MDIA 1F3BA 4JRRA 3WD6A 1FHEA 1V40A 4BVXA 5EPFA 3ZIJA 3LGCA 2F8FA 3FRCA 3TB2A 2FUG2 4PX1A 3KMOA 3ZRDA 4YH2A 4CDOA 5F06A 1EZKA 4GRFA 2MMNA 6GSWA 2B1KA 3DVXA 2P31A 3GX8A 1SYRA 3L4NA 1BEDA 3CTGA 5ID2B 18GSA 4MA9A 3GNJA 2OKAA 1DBYA 1PKWA 2WCIA 2HT9A 4XHMA 3D22A 1SJIA 1J9BA 1GUMA 3BCKA 2HLSA 3NOFA 5LD0A 5C04A 1WJKA 3FEUA 3VWXA 2H19A 1Q4JA 1BX9A 2BTOT 4ILFA 2VLTA 4RQXA 2OA7A 2F9SA 1OAZA 3E9JB 2C4JA 4G9HA 4XS4A 3QPMA 4FO5A 3ZMLA 4NPBA 4XS1A 3IOSA 5AISA 1BYEA 2M72A 2AV4A 3HJPA 4H86A 2X99A 3IV4A 1EP8A 1Z7RA 2ON5A 1KEBA 1TK8B 2LKUA 4KCAA 4XTSA 4JZQA 3WT2A 6GSSA 5AGYA 2H73A 5ECIB 1FOVA 1EEJA 1G6YA 2LQOA 2C0GA 2VL9A 4EE0A 2L5LA 2C3TA 4D73B 1UC7A 3ERFA 2HYXA 2TIRA 2B7JA 5ID2A 5F05A 2LEGA 3D0ZA 1SU9A 1TOFA 3AY8A 3ZVJA 4X0XA 5ECHB 4GQFA 2DBCA 1PQNA 3GRXA 2VLVA 2OE3A 3GSSA 1O73A 2LQQA 4WF5A 2YPMA 1TW9A 2L59A 1ML6A 2H1GA 1DE2A 2FY6A 1A23A 1CQHA 1GSYA 4I6XA 4RQRA 2X8CA 2A4VA 3DXBA 2MYGA 3MSZA 1GWCA 5G31A 5AN1A 2C0DA 4ECBA 4K6XA 4RI7A 3KEBA 4QL9A 1K0BA 5DCGA 3GYKA 5L71A 2P5QA 1N2AA 1H4OA 2GDRA 2WULA 2FCHA 4X43A 3ISOA 1EGRA 2PUKC 1USBA 3HJOA 3F4SA 12GSA 1A2LA 4IN0A 1IYHA 2B3SA 5B6NA 14GSA 2HNLA 5HR0A 3W8JA 1X0RA 3Q6OA 5D96A 3HDCA 4P3YB 4MJAA 3U6VA 2YJHA 4FH8A 5CAXA 1ZZYA 2MZCA 3DYRA 1V2AA 2WDUA 1GSDA 4NHZA 1M0UA 3RAZA 1R5AA 2AJQB 4NXIA 2YN1A 2GSRA 1W89A 4O32A 3ERGA 2C3QA 3L9SA 3V1WA 4WBRD 4WR5A 4L0WA 1F9MA 1X5CA 3CSJA 4KAEA 4CW9A 5EY6A 3PINA 2K6VA 3TJKA 3FZAA 1TJDA 3L78A 1T00A 1O81A 4I2TA 3VPQA 1J0FA 5D9VA 6GSVA 3FZ5A 2N5BA 3EYTA 2FWFA 5A4VA 4G10A 3A2VA 2O8VB 5HQPA 3J7Yk 2I9HA 2K9FA 2YNXA 2VL2C 3LXZA 2LUSA 5LCZA 3M9JA 2V32A 5KN3A 3C8EA 3BJ5A 2GSSA 4HDEA 5ABRA 5IMCA 1FVKA 1O8XA 2H30A 4JU5A 4KDXA 3C1RA 4MJEA 2VM2A 2IIYA 2WB9A 5A4UA 17GSA 1F2EA 2JACA 3TDGA 4HUAA 1YY7A 4F0CA 2H75A 4V1Ag 1ON4A 2H8LA 2G0FA 3QOUA 1M7TA 4Z7XA 1XPVA 3D5JA 3Q74A 4IP6A 1TRUA 5ELGA 3TKSA 1O8WA 1PD21 3UEMA 4NV2A 1WWJA 1X5DA 5CP1A 3FHKA 5D93A 2GLRA 1SL2B 4TRXA 1BAYA 2HFDA 2AAWA 2V41A 3VWWA 2L57A 1YQ1A 3EE2A 1RK4A 4MJCA 3F3QA 5G30A 1ACVA 4ZXGA 2I1UA 3LEFA 4N0VA 4YQUA 1TI3A 1F3AA 5HFKA 2A2SA 4I5QA 3TRPA 1TRVA 2O89A 1PN9A 3QR6A 1XW9A 1M9BA 5DBQA 4OFNA 1SL1B 2VCWA 4I97A 3QD9A 2H6ZA 2FA4A 1Z6NA 3UVHA 2DMLA 1MEKA 2VCVA 3WT1A 2VAFA 1ERTA 2J23A 3F63A 2WGRA 1K3LA 2PWJA 2HXKA 3L0HA 4O92A 3D6IA 1Z5YE 2NTOA 5A4WA 5GSSA 4TOPA 3GA4A 1I9DA 1LBKA 3RHBA 4NWYA 2JZSA 1V57A 3IBHA 3LQ7A 1Y6EA 2GSQA 2HSYA 2LJAA 4YAPA 4GSSA 2AHEA 3U5RE 5CRHA 4IQAA 4JR4A 3SWLA 4ZBAA 5IPHA 3GN3A 2D2ZA 3DD3A 3H4KA 4TN8A 1X9MB 3GURA 5INYA 1JZWA 9GSSA 1GNWA 2JSZA 1IYIA 3CBUA 3EC3A 4NAXA 1OE7A 3LWAA 1GSUA 2KUCA 2JADA 4YAVA 2A2RA 3KH7A 3M0FA 1AQXA 1A2JA 1QUWA 4ML1A 1EGOA 4POBA 2CX4A 1THXA 2CQ9A 5HR2A 3N9JA 3GHAA 1VF4A 1AIUA 5CRDA 1HNAA 1BJXA 1XWCA 5F07A 2DIYA 3QDNA 4DSSB 4JR6A 1TK0B 5AIVA 2GQKA 1O7UA 5D9WA 3HHVA 3ME8A 1ZMAA 1XVWA 3VI5A 5G1KA 4YQMA 1XW5A 3A3TA 4HJMA 1PL2A 3P90A 20GSA 3TKRA 1YEXA 2GT6A 2H76A 3EU3A 1DSBA 3IAM2 2CVDA 1NW2A 2LNSA 5HR3A 5IMVA 3QAVA 5B8AA 3E3EA 5DJLA 3F4TA 1K0CA 3GH9A 2C1YA 3TRXA 2R4VA 3P8WA 5AIXA 1U87A 2N5FA 3VLNA 5ECLB 2V6OA 4OCFA 1JZDA 3CRUA 5HR1A 1TU8A 1PGTA 4Q5NA 2JSYA 3D21A 4GXZA 5IMZA 2IWTA 3HD5A 1G0TA 4J2FA 5DVBA 4IP1A 4GLTA 1URMA 4AJ7A 3GFKA 5FT3A 3PGTA 2DJ2A 3HJMA 1YJ6A 2K8SA 3RHCA 3F3RA 2PPTA 1HNBA 4OWYA 1ZL9A 5ECKB 4DSSA 3MNGA 2Z9SA 4QL7A 3ZFBA 3FR3A 2VOCA 3F9UA 3CMIA 5LNKe 1SKSB 5IQYA 2ZNMA 1B48A 5F8BA 2REMA 1U3IA 1GNEA 4IJ3A 1VF2A 3KM6A 2VCQA 1WP0A 1TKDB 3FR9A 2XBQA 1SJ6A 4TR3A 3VURA 4WXTA 3UVTA 5J9BA 4TXOB 4FIWA 1GSEA 3I9V2 2VUPA 1YKAA 4KDUA 3R2QA 5J9CA 4GSTA 4ZB9A 3JCML 3DEXA 3HZ8A 1XBSA 3MAKA 1HYUA 1EP7A 4OO4A 1GSSA 4BPYA 2L6CA 1SL0B 1A0RP 4WKWA 1DE1A 5CRGA 2RUEA 2CV4A 11GSA 2RUFA 2HE3A 2HI7A 1RW1A 1K0NA 1KBNA 3QAGA 4JBBA 1G6WA 4TW5A 4K8MA 1OE8A 1MDKA 2LS5A 4IELA 1KNGA 3KP9A 3M1GA 2NDOA 3IDVA 2R2JA 1ZGNA 4LMVA 2WZ9A 2H70A 4MLYA 1F6MC 5IMDA 1ERWA 3HY2A 2JU5A 3BOAA 3IE3A 5IMFA 1H75A 6GSYA 1M2DA 5J4UA 5GAPD 2JL4A 4I2UA 3QMXA 1A0FA 5DDLA 1A24A 1AQVA 1U6TA 13GSA 3DKSA 2G2QA 3IA1A 3FK8A 4TXOA 4PUFC 3IRAA 2CAQA 5EVOA 1PA3A 2VL2A 2MBTA 3FW2A 2AUVA 5IOXA 1XCCA 3GKNA 1MDJA 5ECQB 7GSSA 2VCXA 2M46A 1FB6A 3TJGA 3W8SA 2GQMA 2LRTA 4XS6A 2PBJA 1XWKA 2YZUA 4CHSA 2QSIA 1PMTA 5D8IA 1B4QA 4KA0A 5J41A 1VGLA 4D73A 5D73A 2LNTA 2RLIA 5DCHA 1ILOA 3H8QA 5DJMA 2IL3A 1V98A 4KB3A 1XOBA 4HZ2A 2CZ3A 4F82A 2TRCP 2CA8A 4ULXA 2B7KA 5F0GA 2EC4A 3APSA 3GSTA 4FYBA 4XIHA 4PNFA 1R26A 3ZTLA 3P2AA 3GKKA 4DSRA 5CRWA 1ERVA 2J9HA 2OACA 2I3YA 3C71A 2IN3A 2E2MA 4Q5RA 2JZTA 5J3RA 4ZB6A 5GAND 2IMKA 5JCGA 3Q19A 1TTZA 1T8EB 1SKRB 4EO3A 3ZREA 3HZ4A 4KSMA 3G9BA 3I43A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite