4XCSA

Human peroxiredoxin-1 c83s mutant
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
GSHMSSGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Dimeric Human Peroxiredoxin-1 C83S Mutant
doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 54
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xcsA00
3F4SA 1C72A 3EU3A 1MDKA 3KP9A 1T4ZA 1TOFA 5C00A 5G5FA 4WR4A 3TJBA 1ZCPA 5AIVA 1GP1A 2NPBA 3DD3A 3CBUA 3VLNA 2N5FA 2F51A 2B3SA 4OO5A 2LKUA 2HRNA 4K6XA 4HEA2 3ZRDA 2HSYA 1FB6A 5B8BA 2OBIA 4GSTA 1A2LA 4PUFC 2F3MA 1WWJA 4F2IA 2F8AA 1THXA 4L5LA 3GKMA 4GQFA 1Y25A 1ERVA 3RBTA 1FO5A 3F8UA 2E2GA 2YWNA 4N30A 1J08A 3ED3A 3P2AA 1K0NA 2YZUA 3LEFA 2P5QA 4EKZA 1XWKA 2L5LA 3HCZA 1YKAA 2O89A 2MYGA 2ZUPA 4OWYA 1TI3A 1PL1A 4ID0A 4MZBA 3ZL5A 2L57A 3UARA 5EVOA 1K0MA 4ZILA 2WFCA 20GSA 1VF1A 2H1GA 3QFBC 1BQ7A 1YF0A 1DSBA 1V40A 4WR5A 3L9UA 1EGOA 4EDYA 4TR4A 2YOIA 5ECLB 1GWCA 2F8FA 2JZRA 3LXTA 4QL7A 5IMDA 4OO4A 3DVXA 1XBSA 4Z7XA 1Q4JA 3CYNA 3APOA 1A2JA 2ON7A 3UJ1A 4IQ1A 1TDIA 3VI7A 4CHSA 2P0GA 1GUHA 1G7OA 3CTFA 16GSA 2IMDA 2XBIA 1HNAA 4KB3A 3U6VA 4G9HA 5HR1A 5EL8A 5G5EA 1G6YA 3SWLA 2IWTA 4YQVA 2FNOA 5JCGA 2GZZA 1TU8A 3F3RA 4I6XA 3HA9A 5G30A 3H4KA 3BBYA 3EVIA 2H75A 12GSA 1MTCA 1YF1A 14GSA 4NV2A 5ECKB 1OC9A 2L4QA 2B5XA 2YJHA 2XC2A 3APSA 18GSA 1JZDA 1G6WA 3H8QA 3J7Yb 4HQSA 4KH7A 2IMFA 4IJIA 4XRDA 2LJKA 1TJDA 3PR8A 4L8EA 3GKNA 3GURA 2G0FA 3IAS2 2YP6A 3RAZA 3TKSE 2FA8A 3ZFLA 1FB0A 3GX0A 3GHAA 1T4YA 3US3A 3UL3A 4O7HA 2GQLA 5H5SA 2YJ7A 5D9VA 5A4WA 3QMXA 6GSVA 8GSSA 4MZWA 1EOGA 1ON4A 4TR1B 2H6ZA 1JZWA 1ERUA 3FK8A 4E8HA 1JHBA 3KH7A 1H4OA 3WGEA 2HXKA 2IJYA 2XPDA 5J5NA 1V9WA 4H86A 1YDKA 1XZOA 3GTUB 2YWMA 1XVQA 1QXHA 2YZHA 2WZ9A 2CX4A 1PGTA 4FYCA 4OD7A 1FVJA 1AQWA 4Q5NA 1T3BA 2H73A 3ERWA 2PU9C 3KMNA 2CA8A 3FY7A 2DJ3A 5L71A 2JZSA 3VK9A 3LYKA 4WEYA 1SJIA 2R3XA 1TU7A 5IOXA 3EC3A 5ECOB 2FA4A 1ZYEA 1PKWA 5DJLA 3CSHA 2DIYA 4TXOB 1EZKA 1YQ1A 2A2RA 1XPVA 2BJXA 2LS5A 4CDOA 3DEXA 2VLTA 1MD4A 4Q5QA 4MJBA 5D93A 4N10A 5ECHB 3FR6A 3C73A 5JWQB 5DCHA 1JZOA 1T7PB 3F3QA 1PX7A 1V57A 2H8LA 1TXXA 3V1WA 1B4QA 5IPGA 2I9HA 3GA4A 3NOFA 1EV9A 1EWXA 1Z6MA 4HS1A 2MMOA 3G7IA 2YWOA 4FO5A 1M9BA 2GTUA 4JU5A 1TRUA 3LORA 1IYIA 4YH2A 3LGCA 1MDIA 3KZQA 3S9FA 3DWVA 2C4JA 3CSJA 3DIEA 3EU4A 3TOTA 1M0UA 2IFQA 4XTSA 4KAEA 1SD8A 5ID2A 1T1VA 1S3CA 2VL2A 4G10A 9GSSA 4MH2A 5ECRB 2V6KA 3LWAA 1O8XA 2GDRA 1QGVA 5IMFA 5ELGA 1KTEA 2MBTA 2VM2A 4MMMA 6GSWA 3CTGA 4F0BA 4YQMA 2R5GA 4PQ1A 4POBA 5CRHA 1J9BA 4TOPA 4MH3A 3TJKA 3TRXA 1XXUA 1XW5A 2DLXA 4OCEA 4IBPA 3LFLA 2M72A 1A0FA 1QFNA 13GSA 4F03A 4KSOA 2OE0A 4OMVA 3J7Yk 1PQNA 5J41A 3TDGA 1I9DA 4NHZA 1QUWA 4WETA 5AISA 5EPFA 1Z3EA 1GUMA 2GSRA 3VWXA 4DSSB 4ZBAA 4TXVA 4EL1A 3Q6OA 3TKSC 3RHBA 1K0BA 1NW2A 2HZFA 2DJJA 2H1DA 1O6JA 1A8LA 2CVBA 4EVMA 2RUFA 2GZPA 5DAKB 2DJ1A 5KN2A 4K7OA 1AQVA 2CAQA 2KUCA 3QD9A 4PNGA 3CRUA 3HJMA 4FIWA 3TKRA 2PBJA 3PH9A 3CRTA 1O81A 1K3OA 3Q19A 4IP6A 2BMXA 3FHKA 4MPGA 2FHEA 3L9VA 5DJMA 1AW9A 4ECBA 4ML6A 1TK5B 3GIXA 2HZEB 1FOVA 3K8NA 5DALA 1RK4A 5HR0A 2DMMA 1PD21 2QGVA 2NBSA 5ELAA 3UMAA 2VCTA 3IBHA 1YEPA 4TN8A 1TI1A 1QQ2A 4GCIA 1V58A 3RPNA 3FEUA 2GQMA 5HQPA 4V2NA 2YWIA 1OKTA 2E7PA 2K9FA 1GSSA 1NHYA 3HXSA 3DVWA 2H74A 2L59A 4YAPA 2MZCA 3IHQA 3FYGA 2EIQA 2PMTA 4ZIJA 3WT1A 2YV9A 4MCUA 2C3QA 4EUYA 2HI7A 3KIJA 3N5OA 3KD0A 4TR3A 2PGTA 3QDNA 2TRCP 1SENA 5D96A 2MMAA 4ZBBA 4HU7A 5IOWA 3GRXA 1RW1A 5INYA 1QMVA 1XOBA 4AGSA 5B7CA 3UVHA 3GTUA 1TRVA 1EP8A 2N5AA 1W89A 2H6XA 4D73A 1AIUA 4KGIA 3DGQA 3I9V2 2ON5A 1K3YA 6GSSA 4XCSA 1F37A 4TRXA 1J0FA 2NDOA 1A24A 4OFNA 3M9KA 4RQRA 3GN3A 1WIKA 1GTAA 1ZL9A 4X1UA 4X43A 1F6MC 3SBCA 1KNGA 1GNEA 4RI7A 2FWHA 4WF4A 1FW1A 2DIZA 4XS4B 1OC3A 4TKYA 2PVQA 3ZVJD 2FD3A 2FWGA 2NTOA 2WRTA 2PPTA 4XHMA 2B6MA 1G0TA 1OE7A 3GSTA 4KDYA 4MA9A 4NWYA 1M2DA 3A5WA 3C1SA 4WBJA 1N2AA 2VLUA 2YPMA 5ABRA 4NMUA 4AJ8A 1JFUA 2I4AA 4RQXA 5LD0A 1SYRA 1GNWA 1XWBA 3FW2A 3TB2A 1Z7PA 1AC1A 2L6CA 1K0DA 3QAGA 5JWOB 4KNDA 3LQ7A 3H93A 1ZMAA 1M99A 4KW6A 4LA1A 3IR4A 1VF2A 4G19A 4IJ3A 1PRXA 3HY2A 4MLYA 1T8EB 3HVXA 1B9YC 3VFIA 5CREA 1N8JA 1B48A 2VM1A 3VURA 2WJUA 1KEBA 4MZCA 2GGTA 4ULXA 3VWUA 1TTZA 1UA5A 5D8IA 4EDZA 2V41A 3ME8A 3MNGA 5J4UA 1A0RP 3ERFA 2L5OA 2BTOT 3IC4A 5DBQA 3VWWA 2ZNMA 4LL1B 3L78A 4GTUA 2OA7A 3IXRA 4GRFA 2RLIA 6GSTA 2PUKC 1HNBA 3C7MA 4LMVA 4K0NA 3KH9A 4GLTA 1X9WB 2H76A 5CRGA 2CVKA 2H70A 1SYXA 2H1BA 4F9ZA 2FUG2 3WD6A 2R6KA 1O7UA 2H01A 3D5JA 3L4NA 4G2EA 4GXZA 3WGDA 4WKWA 1DUGA 4V1Ap 3EYTA 2B5EA 3BOAA 3MSZA 2CZ3A 2MBSA 5AN1A 4IN0A 3FZAA 1TP9A 1SKWB 3BCIA 1MDJA 1ML6A 4LLRA 4BWSA 2VD0A 4TVEA 3UBLA 5F06A 2GQKA 1GSQA 1JZRA 2FWFA 1GSEA 4KCAA 1SK0A 5EY6A 1E6BA 2G2QA 2GT6A 19GSA 5DAKA 2NVLA 7GSSA 3IDVA 3HKRA 5F8BA 4E8EA 4POLA 2WS2A 2I1UA 2E2MA 1B9XC 1GLQA 2FCHA 1PL2A 2EIRA 1X5DA 3M0FA 2VO4A 2GSQA 3HJOA 3BD2A 3FKFA 1GSDA 4X0XA 3O6TA 5CYYA 5G1LA 2KOKA 3TJGA 1Z9HA 4IVFA 2OKAA 2KP1A 1PX6A 1R26A 4FH8A 2N5BA 2H0HA 2CV4A 3C8EA 4NHWA 2PN8A 3WYWA 4J56E 3KTBA 1JLVA 2H71A 3EURA 1FHEA 1NSWA 4N0VA 5A5KA 1GLPA 1GTUA 1YEXA 2YANA 3MWHA 2C80A 5IMCA 4RUVA 1GUKA 4O5RA 2LEGA 3L0HA 3A2XA 1EV4A 3ZTLA 2C8UA 3IK7A 1BJXA 1WJKA 4EF0A 5D73A 1HNCA 3A2WA 3TJFA 3FRCA 4EE0A 1CQGA 3APQA 1EGRA 3KP8A 4BVXA 1ERWA 1ERTA 2L6DA 5CO3A 2CQ9A 4HI7A 4GF0A 4MABA 1SL0B 3I6AA 4YQUA 3HHVA 4K7IA 2LSTA 4KE3A 1OE8A 2YN1A 1USBA 1EP7A 5CP1A 1ILOA 2HLSA 3P90A 1QK8A 3LSZA 3TKSA 4ZXGA 5ECSA 4Q5FA 1CQHA 5IO0A 5B6MA 4KDXA 3HVSA 1MD3A 2EIOA 2RM6A 1PN9A 1WE0A 4WXTA 4JR4A 1Z5YE 4KDUA 5CRDA 2I3YA 2C0GA 1R5AA 3TGZA 5ECNB 1F3AA 2RIIA 1XWCA 2IMIA 2I81A 3ERGA 4K1FA 3GNJA 1SL1B 3BJ5A 5IM9A 1GTIA 3HYPA 5J9CA 2D2ZA 1OC9B 2KP2A 1F9MA 3QCPA 3FR3A 2AYTA 2LQQA 2VL9A 1LU4A 3QAVA 2X8GA 1O73A 3F6FA 4IGJA 4ZL7A 3P8WA 1O85A 4HZ2A 1WPIA 6GSYA 4JZQA 2LRNA 3TUEA 4PXOA 5H5QA 2GSTA 2HSHA 2WB9A 4IKHA 4IELA 3FZ9A 2VL2C 3QR6A 3NIVA 3R2QA 4ZL9A 2QSIA 2TRXA 2C3TA 2H0IA 3WGXA 3H1NA 1UN2A 1PKZA 3E0UA 1GSYA 2TIRA 2JADA 3G7JA 1U6TA 5FWGA 5ECQB 3CSIA 1V98A 2GVPA 2EC4A 4EO3A 3DXBA 4K2DA 2GSSA 4TR0A 2RUEA 1SK2A 4MPFA 3A3TA 2HT9A 5JCUA 1GH2A 1Y6EA 3GV1A 2AHEA 3HJPA 3VPQA 1XOAA 3QOUA 3W8JA 3IPZA 4I2UA 4EXJA 4MF6A 1Z7RA 3P7XA 4BL7A 3HZ4A 1YKCA 2JSZA 2HFDA 4KA0A 4PQHA 3KJYA 4XS6A 1NM3A 3GKKA 4DSRA 3W6GA 5KEJA 3ZFBA 2KLXA 2CVDA 5GZZB 5CAXA 2AAWA 5DVBA 2GT5A 1HQOA 3HDCA 1K0AA 6GSUA 4AJ6A 5A4VA 2B5YA 1HD2A 2YNXA 3LG6A 4EC0A 4V2MA 2OBKA 1XFLA 3HD5A 4PUAA 1GSUA 4L0WA 1SD9A 2VCWA 4TR1A 2P31A 1B4PA 2K8VA 1KBNA 1ZOFA 2CZ2A 4HU9A 4JE1A 5A4UA 2JACA 2GS3A 2B1LA 1A8YA 3Q18A 3E3EA 4N11A 4ECCA 4I8BA 1EOHA 1W4VA 2MMZA 2O85A 4KCEA 2VAFA 3Q74A 2CX3A 2IIYA 2LUSA 3DKSA 1SKSB 5ECIB 3VPTA 3GH6A 3ZIVA 3QAWA 5B8AA 3F4TA 3M1GA 2IFQB 2LNSA 1GULA 1TRWA 3TOUA 2IL3A 2VL3A 5ID2B 1TRSA 4POMA 3MAKA 5F07A 2K8SA 4K8MA 4TW5A 1TW9A 3ZMLA 3MDKA 2H0GA 1T00A 2E0QA 2VD1A 2H72A 1AXDA 3D21A 5D9WA 5B6NA 2X99A 3GX8A 2CAIA 1YZXA 3KXOA 1ZYQB 4FYBA 5DQYA 3D4MA 4JRRA 2LV3A 1EEJA 1TKDB 4TXOA 1U3AA 2A4VA 5DCGA 5HFKA 3RPPA 5ECPB 2V6OA 5JCWA 1M9AA 2OE3A 3TKPA 1X9MB 5KN0A 4HJMA 2B1KA 4J57E 1OYJA 5GSTA 5H5RA 1GRXA 5F0GA 3CMIA 3HZ8A 4KUNA 4CW9A 1DBYA 3A2VA 4WF5A 4MF7A 2VCVA 1RQMA 1XWAA 2C0EA 2C3NA 1UVZA 4KSMA 4F0CA 4ZB6A 3EMPA 1M2AA 4BWQA 2LJRA 2DJ0A 3KMOA 1GSFA 3TRPA 3ZITA 2LRCA 2DBCA 4HJ2A 2FY6A 4O32A 1X9SB 3GUSA 2J9HA 1K0CA 3KM6A 1OAZA 2OE1A 2A2SA 3ISOA 5J9BA 2M80A 2X8CA 2M46A 5CRWA 1E2YA 2O87A 3GMFA 3LXZA 4MK3A 4HQZA 2LTKA 4KX4A 1TK8B 4FYUA 1F3BA 5GAPD 1X5CA 5D9XA 10GSA 3IOSA 3H79A 4GQCA 3WT2A 2LNTA 4HOJA 4AJ7A 1URMA 3D0ZA 1M2BA 2L4CA 2DJKA 4PGTA 5DALB 1AUCA 2CT6A 2LJAA 5GAND 1Q98A 1R4WA 4L0UA 4XRAA 4PQIA 4JR6A 5HR3A 1SJ6A 1R7HA 4IQAA 4JEDA 2H30A 4PX1A 1NHOA 2C1YA 2V2GA 3ZVJA 3C1RA 4OFTA 3G9BA 4I97A 1FAAA 2VIMA 1JLWA 4IW9A 1S3DA 4J2FA 3EWLA 5COHA 2V1MA 4YAVA 4DSSA 4XIHA 3UOMA 2H6YA 5J3RA 4P3YB 2VUPA 4NXIA 3VI5A 4LMWA 5JWRB 2H1AA 1SL2B 5F05A 4MDCA 2HRFA 2PWJA 5E59A 3KCMA 2ES7A 2X64A 2AB6A 1XWGA 2QKEA 5ENUA 1XIYA 1BEDA 5HFIA 2DC5A 4L5OA 1DE2A 4NPBA 3VWVA 4OFMA 3ZLPA 3F0IA 4OCFA 4D73B 1AAZA 3GL5A 2DSAA 4Q5RA 3HVVA 2HZEA 5CNWA 2QC7A 3GSSA 4ZBDA 1MEKA 3GH9A 2H66A 3QFAC 3F6DA 4HZ4A 2AJQB 5AGYA 1GL8A 3FR9A 5ECMB 1U88A 4I2TA 11GSA 4POKA 2AUVA 2YV7A 2X8HA 1ST9A 22GSA 5HR2A 2LQOA 4ZB9A 3RHCA 3ZIJA 1WOUA 2VCQA 3BCKA 2FLSA 2R2JA 1PSQA 1OVNA 5IO2A 1XCCA 3TCOA 3IV4A 3M9JA 1IYHA 4GSSA 2WCIA 4MP4A 2C0FA 2DJ2A 3ZYWA 2JSYA 17GSA 3KEBA 1Z6NA 1AQXA 1K3LA 2VCXA 4ILFA 3KGKA 1WP0A 4PNFA 4K7NA 2H19A 2K18A 3ZZXA 1SK1A 3EINA 5IMAA 1OKDA 3CXGA 1R5PA 3O3TA 1X0RA 2REMA 3ZMKA 2R4VA 4V2LA 1FG4A 4MJAA 4ACSA 2XBQA 2RM5A 3O76A 1HYUA 3EMXA 4I5QA 1XW9A 4IP1A 3RDWA 2IN3A 1UC7A 3JCML 4K9ZA 3IK9A 1G7EA 2WULA 3ME7A 1DE1A 3FZ5A 4IHUA 2LRTA 4WBRD 4O92A 2GLRA 1ZGNA 4LL4B 1WMJA 3M3MA 2F9SA 4XS4A 3TJJA 1ZZYA 1THOA 1VF4A 5IMVA 4NAXA 3TKQA 2O8VB 4ZB8A 3F9UA 3N9JA 3IRAA 4GWRA 3GFKA 3E9JB 3FZ4A 3GYKA 2JU5A 2ALBA 2DMLA 5KN3A 3M8NA 5GSSA 1U3IA 2OACA 2GZYA 5KN1A 3D6IA 4ML1A 2FWEA 2B7KA 3GKXA 2OADA 2O7KA 2VLVA 2C0DA 1TK0B 5G31A 4QQ7A 3F4RA 3PGTA 4AF2A 2MMNA 1EEMA 1VGLA 1F2EA 2XHFA 3EE2A 1ABAA 2IPAA 2OJLA 3LJRA 4DEJA 5D9TA 2VOCA 4PURA 2YCDA 1YJ6A 2J23A 1LBKA 5HFGA 3I69A 5FHIA 2KHPA 6GSXA 3UVTA 4V1Ag 5AIXA 2K6VA 3IA1A 1H75A 5IPHA 5FT3A 5IMZA 3UIWA 4GSNA 4NV5A 2VCZA 5IIZA 1S3AA 1BYEA 2V32A 2IMKA 2Z9SA 1VRSD 1K0OA 5DDLA 3W8SA 2IMEA 3D22A 1BX9A 4ECJA 3L9SA 3DRNA 2PVOC 4QL9A 3IE3A 3D4TA 1OC8A 1V2AA 1VF3A 4ZL8A 4BPYA 1ACVA 4K0GA 2XPEA 2WDUA 4RI6A 5DQSA 4N0ZA 1PA3A 1A23A 4ISDA 1YY7A 4F82A 3U5RE 2HE3A 3KTLA 4XS1A 3ZREA 1X5EA 4HUAA 3UAPA 2R37A 1M7TA 3LYPA 1I5GA 3UEMA 2P5RA 3OR5A 4ECIA 1SU9A 2PERA 3DYRA 3PINA 1BG5A 1XW6A 2ZCTA 1B8XA 4BVYA 1O8WA 1U87A 4IS0A 3QPMA 3TRQA 5C04A 2WGRA 5IQYA 3UBKA 2AV4A 1XVWA 3GL3A 3NZNA 2HYXA 2B7JA 4DVCA 3DMLA 2HNLA 1GTBA 3AY8A 1SJZA 4MF5A 1FVKA 1WRYA 5LCZA 2JL4A 1PMTA 2FGXA 3F63A 3G7YA 5G1KA 4HDEA 5G2ZA 3IAM2 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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