4XCSA

Human peroxiredoxin-1 c83s mutant
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
GSHMSSGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Peroxiredoxin-1
publication title Crystal Structure of Dimeric Human Peroxiredoxin-1 C83S Mutant
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xcsA00
1AIUA 4KDXA 1YZXA 4WKWA 14GSA 4F9ZA 5C04A 3TJFA 1C72A 1FAAA 1Z7RA 1K0CA 3GX0A 3LORA 5HQPA 5D9VA 2NDOA 2J9HA 1A2LA 5ELAA 5D96A 1M0UA 1Z7PA 4KDUA 1R7HA 4XS4B 3APQA 4KX4A 4O32A 2EIOA 2DJJA 5COHA 3ZZXA 3RPNA 2IFQA 1PL1A 1WJKA 1AUCA 2IMKA 4EC0A 4HDEA 1TK0B 4EE0A 3CXGA 2C4JA 3H4KA 3DRNA 2E0QA 2DJ1A 2LRCA 3BCKA 1QQ2A 2KHPA 1A8YA 3IRAA 1TRUA 3DVWA 3WGEA 3RPPA 4G10A 1EP8A 1UC7A 3CRUA 1TK5B 5CAXA 3DEXA 3FR9A 3HXSA 4KNDA 4ID0A 4V1Ap 3TDGA 4OWYA 3CSJA 3KIJA 1Q98A 2DC5A 1PA3A 1JZWA 3FK8A 5D9WA 4K0NA 4IJ3A 3IAS2 4F82A 2ON7A 1J9BA 2H1AA 1USBA 3KTBA 5GZZB 2KUCA 3CSIA 2ALBA 4EUYA 3GNJA 1CQGA 4K6XA 4J57E 3F4SA 1A0RP 3D22A 2NVLA 2FLSA 6GSWA 4MF5A 5AIXA 1MDJA 4GSNA 1X5DA 4ZILA 2H1GA 4TOPA 3CTFA 2P31A 5KN2A 3TKPA 3TB2A 2R6KA 2DIZA 5FHIA 4XS4A 5AGYA 5IO2A 2HFDA 1K0OA 1V98A 2GSQA 3NIVA 3ZVJA 2AJQB 2WJUA 2L6CA 4I97A 2IJYA 1I5GA 2NTOA 4ECIA 1GLQA 4WR5A 1GUKA 3G7JA 4CHSA 1ERTA 3M8NA 2I81A 3KP9A 4IBPA 2C8UA 1QFNA 4H86A 1XWAA 4ZBAA 4TR1B 2OADA 1RK4A 2C3TA 3GKKA 1ACVA 1IYIA 1A23A 1O7UA 2IMDA 2OA7A 2A4VA 1G7EA 2YNXA 4QL9A 4OFTA 3SBCA 1WE0A 4MDCA 3LWAA 1YKAA 3MWHA 1XWCA 2G2QA 4NHZA 4ZL7A 2GQKA 4I8BA 1GNEA 1YY7A 2B6MA 1LU4A 2M80A 5H5RA 3RBTA 1W89A 1SD9A 1O8XA 2JL4A 2BTOT 2OE0A 3NOFA 3ZMLA 4KW6A 3BCIA 3QPMA 2IMIA 1T00A 1GTAA 3FR6A 3GKXA 1K3YA 3RDWA 1AQWA 1KBNA 4ZXGA 1V9WA 4ILFA 1RQMA 4WF4A 5IOWA 4I6XA 5G1KA 2QSIA 2GSSA 2H01A 1G6YA 1HNBA 3ZIJA 1F37A 2VLTA 3VFIA 2LJAA 4BWSA 2LNSA 1HYUA 1WP0A 4EF0A 1E6BA 4ACSA 3LXZA 5CO3A 5ECSA 4PNFA 4EL1A 3MNGA 1N2AA 22GSA 1ERVA 3HJMA 1LJRA 2DSAA 1TU8A 1E2YA 4RQXA 2RUFA 4OCEA 4YH2A 2IL3A 2R2JA 1R4WA 4RI6A 2IWTA 4YAVA 1ERWA 3G7YA 1GUMA 2V6KA 1F3AA 1GTIA 2OBKA 1ZL9A 3VK9A 1XZOA 3LYKA 4FH8A 1FVJA 5ID2B 5G5EA 3VWVA 2ZCTA 3G9BA 4OCFA 1JZOA 12GSA 2V32A 1A0FA 1GLPA 2V1MA 5D73A 1IYHA 5HFIA 3C7MA 4XRAA 3IE3A 5LCZA 1SKWB 1WOUA 2L57A 4Q5RA 5IM9A 4N30A 5ECLB 4HZ4A 3ZREA 1DE2A 4L0UA 3HVSA 5H5SA 3I6AA 1TRSA 1GSYA 19GSA 4K1FA 1K0NA 1Z5YE 1YDKA 2VL2C 4RI7A 3FZ9A 1SU9A 1B9XC 4IN0A 2TIRA 4EO3A 4WEYA 3VLNA 3U6VA 4ZB6A 3VWXA 1Z3EA 4OFMA 1TU7A 2R3XA 2LJRA 1VF2A 3HA9A 2O8VB 2KLXA 3L9SA 4X43A 3QDNA 2WB9A 2DMLA 4X0XA 1NHOA 1SKSB 5FWGA 4JE1A 1ZOFA 3F8UA 5IPHA 4JR4A 11GSA 3QAGA 4JU5A 1B8XA 5IQYA 5F06A 1HNAA 3EMXA 2LRTA 3TJKA 1NW2A 1BAYA 2XHFA 4JRRA 5G5FA 5D9TA 3HY2A 1K0BA 5DAKB 5HR0A 4NPBA 4KH7A 2G0FA 2I3YA 1SJ6A 1YF1A 4WR4A 2HRFA 2C3NA 3UEMA 2FY6A 1TKDB 2CZ2A 2XPDA 3P8WA 2V41A 2DJ2A 3O6TA 2HZFA 5F8BA 5KEJA 2MZCA 1K0MA 2N5FA 2R4VA 3ZRDA 2ZNMA 3GFKA 4HU7A 1S3DA 4ECCA 3MAKA 17GSA 2CQ9A 4GXZA 1BX9A 4MZCA 5B7CA 3J7Yb 3LXTA 4XHMA 3M1GA 5A4WA 3H79A 2YN1A 4MF7A 3HDCA 5CREA 1OKTA 1ON4A 1Z6NA 4KSMA 1A2JA 1JZRA 5E4WA 2EIRA 3GUSA 1XW9A 3ZLPA 3DIEA 3DYRA 4ECBA 3CMIA 1DUGA 1V58A 1NHYA 3O3TA 4MH2A 1YEPA 4OMVA 2YZHA 1WIKA 3EYTA 2H71A 3HZ4A 1JLVA 4MF6A 2WZ9A 3GSSA 1PKWA 4PUFC 1K3LA 1TP9A 3APOA 1NSWA 4XS6A 3C1RA 1WMJA 1X9WB 2B1KA 4NAXA 5INYA 1N8JA 4OD7A 3TOTA 2PGTA 5DJLA 2FWGA 5DAKA 1VF1A 4K8MA 1T4YA 2CAQA 3WT2A 5HFKA 2PVOC 5IMDA 2IIYA 4GWRA 3KM6A 3QAWA 1X9MB 1Y25A 3R2QA 1OC9B 2O89A 5F05A 2K9FA 1S3CA 2YV9A 4HJMA 4D73B 4MZBA 4CW9A 4HJ2A 2DMMA 2JSYA 3L78A 2OACA 1OVNA 1YQ1A 4Z7XA 4G19A 3C71A 2H6ZA 2LUSA 1BYEA 1MDKA 4O7HA 3GA4A 4IP1A 5IMVA 2VCZA 2X8CA 3CRTA 1SK1A 5B6MA 3ISOA 5CRHA 4BA7A 1PSQA 2WS2A 1CQHA 2QC7A 3VURA 4XIHA 2CV4A 2VOCA 3GYKA 1GP1A 3W8SA 3GIXA 1LBKA 1WRYA 2IMEA 4FO5A 2H72A 4V1Ag 3A2VA 1F6MC 4MPGA 2K6VA 3UARA 2V2GA 4NMUA 4GF0A 3ME7A 3A2WA 2P5QA 1PD21 2FHEA 1M7TA 4MJEA 4BWQA 4K7IA 3DMLA 4IHUA 4KCAA 4F0CA 1XWKA 4HQZA 2AYTA 4KSOA 4TW5A 2WRTA 3ZFLA 2FWHA 5EPFA 4CDOA 3EURA 1GRXA 4D73A 1XOBA 3WD6A 1EEJA 5IMZA 3GURA 2AHEA 3GX8A 3UIWA 5C00A 1GUHA 5ECKB 1T8EB 5JWQB 4G2EA 3GH6A 3HD5A 1SYRA 2GQLA 2PPTA 1THOA 1ABAA 3MDKA 1Q4JA 2BJXA 5DCHA 3E0UA 2LS5A 3WYWA 2VLUA 4JR6A 2D2ZA 3ZITA 4LMWA 5EVOA 5CYYA 2OKAA 3RAZA 4TXOB 2LQOA 3UAPA 4ZB9A 3TJBA 2P0GA 4JZQA 2HSHA 4L8EA 3TKSC 1M2AA 2B7JA 2VL9A 2TRXA 2F8AA 2RLIA 2B1LA 4DSSB 2E7PA 5D93A 3F4RA 2KOKA 2J23A 5ABRA 3J7Yk 4JEDA 3TKSE 1U87A 1PX7A 1M99A 4GTUA 1EV4A 3D0ZA 3NZNA 1EOGA 3KD0A 4ZBDA 1X9SB 5HR3A 5L71A 1SL2B 1GSUA 2IPAA 2RM5A 4BVYA 3TJJA 1XBSA 1ZYEA 2FWFA 1SENA 1XW6A 4OO4A 2AUVA 4G9HA 2GS3A 3GMFA 1G7OA 3O76A 3L9VA 1FB6A 2GT6A 3H1NA 3IXRA 1O73A 3QCPA 5J3RA 2X64A 3H93A 3WT1A 1J0FA 1GULA 3Q74A 2DJ3A 3D6IA 3BJ5A 3QR6A 3IHQA 3ZIVA 3C73A 5H5QA 4TXOA 3W8JA 1EGRA 1YJ6A 5J9BA 1URMA 2DJKA 2YWNA 2HSYA 4PQHA 4ZB8A 3I9V2 1SL1B 1PGTA 2VLVA 4PNGA 1GSSA 2P5RA 3LEFA 4TR0A 4E8HA 1O85A 1KTEA 2VD0A 5J4UA 3I69A 1U3AA 1XWBA 3ME8A 3F3QA 5CRGA 1SJZA 2L6DA 3KJYA 4MH3A 1B48A 2LRNA 4TR1A 3GKMA 3KXOA 5KN3A 3EU4A 4ULXA 3LYPA 4F0BA 4IS0A 2X8HA 4IJIA 1WPIA 4X1UA 2A2RA 4PX1A 1UA5A 3QFAC 3ZTLA 1GNWA 1T4ZA 4YQUA 3PH9A 1V57A 3UMAA 3F63A 1B9YC 1EP7A 4Q5NA 4AGSA 2YWIA 2XBQA 5KN1A 4IELA 5KN0A 4BPYA 4HZ2A 4AJ6A 5GSSA 1EWXA 3FZAA 3KMNA 4BVXA 3D5JA 2VD1A 3QMXA 2MMAA 2B5XA 2H1BA 4E8EA 2LSTA 4ZL9A 5ECOB 3KH9A 3IAM2 3L4NA 2MYGA 1T1VA 5EL8A 4MABA 5J5NA 6GSXA 1TDIA 4LA1A 3WGXA 1FHEA 2AB6A 2L4QA 3CYNA 1FOVA 4I2TA 1SL0B 2H74A 1O8WA 1BG5A 5ECPB 2DIYA 1U88A 3UBKA 3FKFA 1AC1A 3M3MA 5G31A 2KP2A 5DJMA 1O81A 3FZ4A 4L0WA 1O6JA 5IOXA 2VO4A 4XTSA 3N9JA 1AQXA 1UVZA 5ECRB 2H30A 5IIZA 4MJAA 4K9ZA 3Q18A 1KEBA 4WBRD 4KDYA 5CP1A 3KEBA 2X8GA 1UN2A 3P7XA 1ZGNA 3D21A 3QAVA 5ID2A 1FO5A 2GQMA 1XVWA 2YCDA 2MMZA 4ECJA 1PKZA 2O7KA 3DWVA 3DGQA 3F6DA 2H0IA 4K2DA 3IPZA 3RHBA 2LQQA 2I1UA 2R5GA 20GSA 4NWYA 5G2ZA 4MCUA 5FT3A 3M9KA 4TVEA 2RUEA 2HXKA 1U6TA 3K8NA 1VF3A 1A8LA 2VL2A 4WETA 1GH2A 3ERFA 2GLRA 2VCWA 3F9UA 3LSZA 2H66A 3AY8A 5AIVA 3D4MA 1K0DA 3CSHA 5DBQA 1WWJA 2K18A 2E2GA 5CRDA 4KE3A 5D9XA 5JCUA 5IMAA 2M46A 2GVPA 1H75A 5G30A 2K8SA 3KZQA 3F4TA 3IDVA 2C80A 3UVHA 3CTGA 1SD8A 2MBSA 2RM6A 3QD9A 4RUVA 1F3BA 3FEUA 4O5RA 1M9BA 3EC3A 5LD0A 5J41A 4IVFA 1FG4A 2V6OA 3APSA 3VWUA 2H0HA 1ZZYA 2L5LA 1VF4A 4V2MA 2GT5A 3Q19A 4HS1A 2PMTA 3GTUB 3E9JB 1XFLA 4IGJA 3ZL5A 3OR5A 4Q5QA 4WXTA 1ZMAA 4GSTA 3LFLA 1JHBA 4EVMA 2IFQB 3L0HA 3UOMA 3D4TA 1SYXA 1NM3A 4WF5A 5EY6A 4Q5FA 4GSSA 2EIQA 4LMVA 1TW9A 4LL1B 1ZYQB 3FYGA 2OJLA 2CA8A 4V2NA 4AJ7A 2YP6A 4YQVA 4AF2A 4ML6A 4OO5A 1GSQA 1S3AA 3ZYWA 1HNCA 3FHKA 3N5OA 1R26A 2FWEA 2JZRA 3G7IA 1GL8A 5DDLA 1TTZA 2DLXA 3KCMA 4FIWA 3UJ1A 4GQFA 2YWOA 3QFBC 3ED3A 2VAFA 1ML6A 3UBLA 4NXIA 2H73A 4JBBA 1SK0A 1KNGA 2H76A 5CNWA 2EC4A 3HYPA 3L9UA 4KCEA 5HR1A 5JCGA 2YOIA 3GH9A 3GHAA 2DJ0A 2JZTA 4POKA 3QOUA 3HVVA 2LJKA 2YWMA 4MPFA 3E3EA 2ON5A 3GTUA 5JCWA 2NPBA 2WFCA 2FUG2 2A2SA 3GL5A 3S9FA 1QUWA 3EINA 1SKRB 1ILOA 2F3MA 2L59A 2YJHA 4IW9A 2H19A 1OC9A 4HU9A 2GDRA 5AN1A 1TRVA 3IBHA 5IO0A 3I43A 4NV5A 2N5BA 2MBTA 4PURA 1ERUA 1G0TA 4PXOA 1OE8A 2C3QA 1U3IA 4TKYA 2PERA 1PMTA 2H75A 2H6YA 2PWJA 1XW5A 4XCSA 3FZ5A 6GSSA 1JFUA 4K0GA 3CBUA 4J56E 2GGTA 3PGTA 4ZBBA 2QGVA 3PINA 5F0GA 5A4UA 3GKNA 2LKUA 2VCXA 1K3OA 9GSSA 3IV4A 5DQSA 2C0EA 1QXHA 1JLWA 1I9DA 3BBYA 3EWLA 1TXXA 3EE2A 1X5EA 4MJCA 1J08A 3IR4A 5AISA 2AV4A 2VIMA 4ZL8A 2VL3A 1OKDA 4EKZA 3H8QA 3DKSA 10GSA 4N11A 3P90A 2JZSA 3TCOA 3TUEA 4POBA 4N0ZA 3VPTA 3GL3A 2NBSA 1X0RA 2MMOA 1MD4A 3ZMKA 1MD3A 5ENUA 3GRXA 2F51A 3FY7A 2WULA 5F07A 2WGRA 1AW9A 1BJXA 1THXA 4KB3A 2YV7A 2I4AA 4MK3A 5LNKe 4MP4A 3IK7A 2HT9A 4AJ8A 3KMOA 5HFGA 2CVDA 3VI5A 4RQRA 4BL7A 1FW1A 5IMFA 3JCML 4KA0A 16GSA 1XPVA 1XCCA 1G6WA 4DSRA 3ZFBA 2HYXA 4IQ1A 8GSSA 2FA4A 2JU5A 3EU3A 5HR2A 4I5QA 4P3YB 1YEXA 3SWLA 3IOSA 2JACA 4ML1A 3DD3A 2MMNA 3C8EA 3F6FA 4J2FA 1SJIA 3EVIA 1R5AA 1OAZA 4ISDA 3LQ7A 3ERWA 1QGVA 5ECNB 5DVBA 2CX3A 4QQ7A 1H4OA 4O92A 3TKSA 3FW2A 3F0IA 4GRFA 2GSRA 2GZYA 2JADA 1GSEA 2OBIA 4DSSA 2OE1A 2CT6A 3LGCA 1EZKA 3A5WA 4HOJA 4XRDA 5D8IA 4PGTA 1W4VA 2E2MA 2HRNA 2XBIA 4HQSA 1VGLA 3IK9A 4KUNA 4MMMA 2VM2A 2XPEA 1PQNA 4IP6A 1HD2A 1M9AA 1QK8A 5DCGA 2YANA 1YKCA 5GSTA 3UL3A 2YPMA 4DEJA 3BOAA 4MLYA 3GV1A 6GSUA 1V2AA 3DXBA 4L5OA 1V40A 2HE3A 4DVCA 1M2BA 1OYJA 1RW1A 4NV2A 3BD2A 3PR8A 1X5CA 3KGKA 3FR3A 2PBJA 2OE3A 1Y6EA 3P2AA 3M0FA 4WBJA 4GQCA 4N0VA 1T3BA 1YF0A 2M72A 1R5PA 1GWCA 2I9HA 2C1YA 3HZ8A 3VWWA 2B7KA 5DQYA 4FYCA 2B5EA 4QL7A 2F9SA 2GZPA 3HVXA 2CVBA 2DBCA 2HI7A 4IQAA 2H1DA 4ZIJA 5B8AA 3TJGA 3HHVA 3RHCA 3EMPA 4HUAA 1AQVA 2B5YA 1PL2A 1EGOA 1TK8B 5DALB 4EXJA 3M9JA 2GZZA 2VCTA 4HI7A 1GSDA 1AXDA 2LTKA 6GSTA 13GSA 2H8LA 2REMA 5ECIB 1HQOA 2O85A 2C0DA 1FB0A 4N10A 2XC2A 3TOUA 1GSFA 2IMFA 5CRWA 4FYBA 2PU9C 2F8FA 4IKHA 2LEGA 2GTUA 3TRQA 3TKRA 2B3SA 5IMCA 3A2XA 1SK2A 7GSSA 2C0FA 3US3A 4GCIA 5JWRB 2YZUA 1BEDA 2Z9SA 5IPGA 2YJ7A 5GAND 1MTCA 4DSQA 3A3TA 3HJPA 1DBYA 1PX6A 4EDYA 4PUAA 2FGXA 5ECQB 2H0GA 3TRPA 2FA8A 3HJOA 3UVTA 2TRCP 4F03A 5G1LA 4YQMA 3DVXA 4POLA 2KP1A 3TGZA 3KP8A 2GSTA 2L5OA 3VI7A 1VRSD 1TI3A 1OE7A 1Z6MA 5ELGA 1T7PB 1EOHA 4POMA 2O87A 3GN3A 2CAIA 1MDIA 2HZEB 5B8BA 3HKRA 4TR4A 1EV9A 6GSYA 5DALA 1F9MA 2JSZA 5A5KA 3W6GA 5JWOB 2R37A 2WDUA 1TOFA 4V2LA 5A4VA 3F3RA 5GAPD 2C0GA 1M2DA 1DE1A 2BMXA 1B4QA 4HEA2 2LNTA 3U5RE 4OFNA 2FD3A 2K8VA 5ECMB 4PQIA 4L5LA 3LJRA 2H70A 4XS1A 1PN9A 2ES7A 4K7NA 1OC8A 2VM1A 4K7OA 4MA9A 4TRXA 4TXVA 4TR3A 5J9CA 2H6XA 1GTBA 3MSZA 4EDZA 4I2UA 3HCZA 4GLTA 4PQ1A 2FNOA 3TRXA 3GSTA 1F2EA 2WCIA 2VCQA 5ECHB 3LG6A 3Q6OA 2CX4A 2HLSA 4FYUA 4KGIA 2VUPA 1ST9A 3IA1A 6GSVA 2HNLA 2PVQA 4KAEA 2QKEA 3FRCA 18GSA 1JZDA 5B6NA 4MZWA 2CVKA 1AAZA 3V1WA 2AAWA 4TN8A 1PRXA 3KH7A 1QMVA 1MEKA 4LL4B 1TRWA 1Z9HA 1TJDA 2IN3A 1B4PA 2FCHA 2VCVA 2PUKC 1GTUA 2HZEA 2LV3A 4F2IA 3TKQA 4MJBA 2N5AA 4NHWA 4LLRA 3ZVJD 2X99A 1OC3A 1BQ7A 3C1SA 3ERGA 1EEMA 1XWGA 1ZCPA 1TI1A 3VPQA 1A2MA 1A24A 1FVKA 5E59A 1XIYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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