4XS1 | Genus

Total Genus 53

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	53
sequence length	165
structure length	165
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFVFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVC

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant rcsb
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	53
structure length	165
sequence length	165
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xs1A00

5CYYA 3GX8A 3J7Yk 3HHVA 4L0WA 3P7XA 2CAQA 2VCVA 2QSIA 1U3IA 4KB3A 1FB6A 2FWEA 5ECNB 2J23A 5ECSA 3D5JA 4K8MA 11GSA 1WIKA 3MNGA 3US3A 4POBA 4ML6A 4PGTA 3QOUA 5LNKe 2VD0A 3KP9A 1PX6A 3ZIJA 2CAIA 1GUMA 5A4WA 1MEKA 3M3MA 4P3YB 1T00A 2CZ3A 4MJAA 2ALBA 1O81A 4XS6A 3C8EA 3D22A 4XRAA 1XWBA 2IFQB 2H1AA 4E8HA 1N8JA 4QQ7A 1THOA 2L59A 1UC7A 5CRWA 1XWKA 2VO4A 1TKDB 1EEMA 1K3OA 4D73A 4O5RA 4F9ZA 2BJXA 3U5RE 4NXIA 2K9FA 2JZRA 2OBIA 2MMAA 3WD6A 4AJ6A 2OACA 2EIRA 4MLYA 4ZIJA 5A5KA 1R5AA 4HU9A 1NSWA 3QD9A 2H1BA 2V1MA 4JBBA 1K0NA 2DMLA 4AJ8A 1KBNA 2AJQB 4KW6A 4OO5A 3IPZA 4HZ4A 1K0BA 3BBYA 1WRYA 3QR6A 1E2YA 4DSSA 3PR8A 3EU3A 1USBA 2HZEA 2YWIA 3W6GA 2HSHA 2X8CA 1VGLA 2N5BA 4HU7A 4YH2A 5C04A 2CX4A 2DMMA 1V9WA 2EIQA 3FR3A 3TKSE 1TDIA 5HFIA 3ZITA 2WJUA 3ZREA 4KDXA 3VWWA 4ECIA 1ZYEA 4IN0A 3UVTA 3HA9A 2F8AA 3L78A 4ECJA 2ON7A 3ZMKA 5LCZA 1TRWA 2I4AA 3EMPA 4AGSA 3KJYA 3G9BA 1S3AA 3GL5A 4WETA 4I5QA 2MYGA 1SENA 2DJKA 2AAWA 3P90A 2YNXA 4GSNA 5GSSA 2R4VA 5B6MA 1ZGNA 3R2QA 5DJMA 4POMA 3VLNA 3DWVA 3GN3A 5J9BA 5JCUA 1M9BA 3UVHA 6GSXA 1OVNA 1AXDA 3IV4A 4WEYA 2HRNA 3G7JA 1SK1A 1RQMA 3WGXA 4AJ7A 1EV9A 4V1Ap 2XHFA 1MD4A 4IVFA 2E0QA 3DXBA 2JACA 2DBCA 6GSVA 2VCZA 4GSSA 2B1LA 6GSUA 2GZPA 3ZVJA 3UBLA 4Z7XA 1YKCA 4IJ3A 5ECHB 4TXOA 1U87A 3GURA 5D9XA 1XWGA 2MMZA 16GSA 2WRTA 4D73B 3CMIA 1JLWA 3HY2A 2IMFA 4EDYA 1X5DA 4O32A 2GSSA 3IOSA 3A2VA 1PL2A 5CO3A 1XVQA 1HQOA 3F0IA 4OD7A 4WBJA 3TKQA 2X99A 4J56E 2EC4A 1A8YA 3BCIA 3KGKA 2XBQA 3LSZA 4G2EA 4TR1A 5HFKA 2LRNA 4I2UA 2H19A 2V6KA 3EU4A 2J9HA 1TI3A 4K6XA 2ES7A 4POKA 4EKZA 5DCHA 4DSSB 1YEPA 3ME8A 1ZCPA 2WULA 3VI5A 1TI1A 1ERWA 3TOUA 2HZEB 4TRXA 1K0OA 2GTUA 2H70A 5H5SA 2P0GA 2H0GA 3CYNA 3DKSA 3DRNA 1NW2A 3KP8A 1FB0A 2VM2A 3GSSA 1F37A 2IN3A 1URMA 3HJPA 3I9V2 1O73A 4H86A 2LQOA 5IMFA 1M2BA 3TJKA 4F0BA 5KN0A 3RAZA 3EVIA 3LFLA 3NOFA 4CDOA 5EL8A 2JU5A 3RHBA 1SYRA 2OA7A 6GSYA 1SL1B 3NZNA 3I43A 5J5NA 5E59A 3D0ZA 1A2JA 1Z3EA 5D9VA 1XXUA 1F3AA 4DVCA 3L4NA 2K8VA 3SWLA 2VLUA 1Z7PA 3KH7A 2CX3A 4RQRA 4YAVA 2ZNMA 4GQCA 5GZZB 2RM5A 2XC2A 1AUCA 3N9JA 1V58A 1JZDA 4BWSA 4MJBA 2X8HA 3LORA 5FWGA 2IMDA 1PD21 4IQ1A 2H75A 5G31A 3F4SA 4V1Ag 1WE0A 1MTCA 22GSA 4Q5FA 3CRTA 5ID2A 1QGVA 2B6MA 1XW9A 5F07A 19GSA 5IMAA 5IOXA 3GNJA 2WGRA 4HQZA 2IL3A 3D4TA 4IW9A 5IMDA 3GFKA 4TXOB 1SD8A 2H30A 3QCPA 2GZZA 1A2LA 1SL0B 5ELGA 3F6FA 2PBJA 3IR4A 5CP1A 2WFCA 1EOGA 3KH9A 4N30A 2IIYA 1YDKA 3BCKA 3HVSA 2YJHA 1ERUA 4O92A 2YANA 3TKRA 4KSOA 2HYXA 3IC4A 1QK8A 1BYEA 1I9DA 4KUNA 4TR1B 1ON4A 1FOVA 4KSMA 1JLVA 2C80A 4PUFC 4IGJA 4GTUA 3UBKA 4J2FA 2KUCA 4WF4A 3TGZA 1X0RA 5D8IA 3IHQA 3A2XA 2G0FA 2X64A 2XBIA 1MDJA 2O87A 4MDCA 2VL2A 4KH7A 3LGCA 3CXGA 5J4UA 2DJ1A 4MK3A 2DJ0A 4DSQA 2V2GA 4GSTA 3WT1A 2H1GA 4MABA 1SL2B 3KM6A 2ZCTA 3IK7A 2GQKA 4Q5RA 2DLXA 1ABAA 2IMKA 5CAXA 4ISDA 4ZL8A 4N11A 2E2MA 5CRGA 5ECOB 4MF7A 4IS0A 4PURA 4RUVA 3F4TA 2R3XA 3S9FA 4Q5NA 2C0EA 3KZQA 3IE3A 1WWJA 3IAM2 12GSA 1F3BA 3ZFBA 1OE7A 1DUGA 3LWAA 5AN1A 18GSA 2RUFA 5AGYA 5FT3A 1OKTA 1GSFA 3GTUA 1KTEA 2GQLA 3MWHA 4KCEA 4L5LA 5IPHA 1F6MC 1QQ2A 3UOMA 2WZ9A 1ZYQB 4WF5A 1AIUA 1PRXA 3IXRA 2TRCP 1EZKA 1SK0A 3Q19A 4BVXA 4I2TA 3M9KA 2HRFA 3TUEA 5CNWA 2LS5A 4WR5A 2IPAA 3FR6A 5ID2B 2P5RA 1Z7RA 5IQYA 2WS2A 1B9YC 1XIYA 3F3QA 3EINA 1GH2A 3KEBA 4OCFA 2OBKA 3UARA 3A3TA 1XOBA 2GQMA 3CSJA 1AQXA 3F63A 3HDCA 2JSZA 3BJ5A 4MA9A 3RBTA 3TRXA 4OCEA 5ENUA 1YEXA 3ZZXA 4K0GA 1SJIA 1SKWB 5GAND 3APSA 4V2MA 1EP8A 1TW9A 2HI7A 4JZQA 3CTGA 1IYIA 3H1NA 5ECLB 4LL1B 1GSYA 1GWCA 5EVOA 4HQSA 3NIVA 5F05A 3MSZA 2KOKA 3JCML 4HEA2 2N5FA 5F06A 3LEFA 3TJJA 2V6OA 4KE3A 1J0FA 2C3NA 2B5YA 1V57A 2DIZA 4BPYA 1YKAA 3WGEA 1W4VA 1E6BA 2FA4A 2HE3A 1X9SB 3EMXA 1DE2A 4TOPA 1PN9A 3FZAA 3DMLA 4N0ZA 1OE8A 1WMJA 4MCUA 1GTIA 1BQ7A 5DCGA 4DSRA 4OWYA 1WPIA 4FO5A 2KHPA 4TW5A 2M80A 3G7IA 2A2RA 2AYTA 2CQ9A 2FLSA 4XTSA 2PN8A 3PH9A 4EVMA 5AIVA 2MZCA 3HZ4A 2NTOA 2H0HA 3I6AA 3IA1A 3RHCA 3E3EA 4HJMA 3KCMA 2B5EA 4F82A 2HT9A 2HFDA 3WT2A 3GV1A 2FUG2 4LL4B 1Z6MA 2KP1A 4PUAA 1TRSA 4PX1A 4KAEA 3L9SA 2FNOA 2L4QA 3RDWA 2O85A 4MH2A 1ZMAA 1PGTA 1T4YA 4K7NA 3P8WA 1Q4JA 4KNDA 2N5AA 4LLRA 2DSAA 5CREA 4HUAA 1NHOA 3GTUB 3D4MA 2H66A 2GSTA 4WKWA 4GRFA 1VF1A 3ZFLA 3HKRA 5C00A 3ZTLA 2H8LA 4MP4A 3PINA 1GSQA 3TCOA 4ZB6A 5JWQB 5HR0A 1ZL9A 1GL8A 1TK8B 2H71A 5JWOB 5G2ZA 4J57E 4KX4A 3F6DA 1A2MA 1XBSA 3J7Yb 3FHKA 3TJFA 1VF3A 3A5WA 4YQVA 3MAKA 1MDKA 2GLRA 1TK5B 3CRUA 4OFMA 5CRDA 2CA8A 1K0CA 1R26A 1C72A 4F03A 3ED3A 2LNTA 3EE2A 2PPTA 4XIHA 1Z5YE 2NBSA 3FYGA 2LUSA 2ON5A 2A2SA 3VWVA 3WGDA 7GSSA 1B9XC 2K6VA 4NWYA 3KIJA 4N0VA 1TRVA 2CV4A 4NPBA 3D6IA 1OKDA 2ZUPA 1QMVA 2C3QA 4WXTA 4V2LA 2R37A 4WBRD 2FCHA 3TDGA 2OE3A 2JADA 13GSA 3FKFA 1XW6A 3FZ4A 1GUKA 1M99A 4JR4A 3FK8A 3N5OA 3I69A 2VL9A 1GSDA 3BD2A 3LYKA 1S3CA 3GSTA 2MBTA 1M7TA 2AHEA 2YZHA 1F9MA 1CQHA 1G7OA 1TJDA 4MH3A 4MPGA 3L9UA 3RPNA 3GKNA 1YQ1A 1O6JA 3ME7A 5DVBA 3ZYWA 2M46A 1R5PA 5E4WA 3DGQA 2RUEA 2FA8A 1XCCA 4IKHA 4K2DA 2YZUA 4K1FA 2HSYA 1FVJA 5IM9A 1AAZA 1I5GA 2L6CA 2R6KA 4TR4A 3FRCA 2YWNA 4N10A 3M1GA 3F8UA 2NDOA 1ZOFA 3VI7A 1M2DA 5B6NA 2F51A 4IELA 2L5LA 3CBUA 9GSSA 2YWOA 1GSUA 17GSA 3QMXA 3ERGA 2IJYA 3HD5A 5H5RA 5COHA 1X9WB 1JZWA 1EOHA 2LKUA 3TKSA 4XS4A 3FR9A 1MD3A 2CZ2A 3LQ7A 4GCIA 3E0UA 2WCIA 2FWGA 3ZMLA 4RQXA 1LJRA 5G1LA 3FEUA 2C8UA 1TK0B 1N2AA 2O7KA 2VCWA 2X8GA 4NV2A 5KN3A 2JSYA 2DJJA 1VF2A 3CTFA 2LNSA 3GA4A 2K18A 4L5OA 3D21A 1B8XA 2CT6A 2LQQA 1GTUA 4JEDA 1G7EA 2DJ2A 4ZXGA 3MDKA 5F0GA 1J9BA 3W8JA 1O8XA 2H1DA 2DIYA 2YN1A 3W8SA 6GSWA 2AB6A 5DAKA 4ECCA 3C71A 2YV9A 3HJOA 4I6XA 3HYPA 1AQWA 5G5EA 2XPDA 5IO0A 4PNGA 5DALA 4IP1A 2YOIA 4OMVA 2YP6A 4FYCA 1H4OA 4PNFA 3GH9A 3GL3A 4EC0A 5L71A 1Y6EA 1G6YA 4IQAA 2LV3A 1SJZA 1XW5A 1NM3A 3HVXA 5A4UA 5LD0A 1ERVA 20GSA 3DIEA 1ML6A 3SBCA 5ELAA 2GVPA 1EGOA 2EIOA 4RI7A 1GRXA 1EWXA 5EY6A 2C4JA 4L8EA 4OFNA 3M0FA 3HXSA 3UL3A 3G7YA 4MJCA 4K7OA 1ILOA 5ECIB 3C73A 1WP0A 2YCDA 1FVKA 2E2GA 3KTBA 3TJGA 2JZSA 3M8NA 3QFAC 4NMUA 4CHSA 4F0CA 4GF0A 3KD0A 1V98A 1O8WA 4NHZA 5DQSA 1YJ6A 2GSRA 3O6TA 4MMMA 3U6VA 1YF0A 4XS1A 2I3YA 1R7HA 2MMNA 1Y25A 4MZCA 4XS4B 3H79A 4CW9A 4JR6A 2I81A 2F8FA 5AISA 2IMIA 4X0XA 4V2NA 5GSTA 1PKWA 5F8BA 4EDZA 2REMA 3LXTA 1LBKA 3KXOA 5HFGA 2VAFA 1T8EB 3QAGA 3RPPA 5ECMB 3F9UA 1ZZYA 5FHIA 4WR4A 2LJAA 4E8EA 3FW2A 3ERWA 4K9ZA 3F3RA 3ZIVA 5IO2A 3LG6A 2VM1A 1AC1A 1Q98A 4YAPA 1K3YA 2RIIA 3LYPA 2C3TA 1EEJA 1O7UA 4ZBDA 4ECBA 6GSSA 4BWQA 2Z9SA 4MPFA 5A4VA 3HCZA 4PQ1A 4NV5A 5IMZA 5IMVA 2RLIA 4IHUA 3TRQA 1TP9A 5DAKB 4ZB8A 4I8BA 1U3AA 4HOJA 2OE1A 5D96A 5D93A 5KEJA 2CVBA 2O8VB 2PGTA 1GP1A 3QPMA 3LXZA 1JZRA 3GUSA 3KMOA 2PERA 2PVOC 3WYWA 2FGXA 2H74A 5ECRB 5JCGA 5DALB 4EE0A 3VK9A 1PX7A 3VPTA 4LMVA 4AF2A 2FD3A 3GKKA 4KA0A 1GNWA 2BTOT 2PWJA 4POLA 4IP6A 2H72A 5ABRA 2I1UA 3DYRA 1HNCA 4BA7A 2QKEA 3VURA 4I97A 5J3RA 2C0GA 2I9HA 3AY8A 4GWRA 2YPMA 3K8NA 2R5GA 1PKZA 4JRRA 2PVQA 3DVWA 5JWRB 1K0MA 4TR3A 2YV7A 3O3TA 2GT6A 2OE0A 14GSA 2IWTA 1HNAA 4DEJA 3TKSC 1BX9A 5IOWA 5IIZA 2K8SA 4OFTA 1QFNA 1X5EA 1GNEA 2GZYA 3ZL5A 5INYA 3TB2A 4GQFA 5IMCA 2GGTA 1Z6NA 1GTBA 4YQMA 5B8AA 2WB9A 3GH6A 1ST9A 5ECQB 1TRUA 3IBHA 2R2JA 2VUPA 1GLQA 2OJLA 2LEGA 5J41A 4F2IA 5B8BA 4LA1A 2HLSA 5G1KA 1ERTA 2TRXA 2P31A 3DEXA 2PU9C 1M2AA 1KEBA 5ECKB 3GX0A 4ACSA 4ID0A 1A8LA 4ULXA 4MF5A 4PXOA 1T1VA 1K0AA 2M72A 3GRXA 4ZB9A 1UVZA 4ML1A 5HQPA 2L57A 3QDNA 2BMXA 4HJ2A 3EWLA 3C1RA 2C0FA 1RK4A 5D9TA 5HR2A 5KN1A 1SYXA 4FYUA 3Q18A 1DSBA 4PQHA 6GSTA 1J08A 1VF4A 5DDLA 1H75A 1HNBA 4LMWA 10GSA 1OC8A 4KDYA 3GKXA 3TKPA 4XRDA 1SJ6A 3BOAA 3QAVA 4HZ2A 3KTLA 2B5XA 2DJ3A 4JU5A 2VCQA 1A0FA 1TU7A 3HJMA 2PMTA 2VOCA 4EL1A 1XZOA 1T7PB 2XPEA 1FAAA 4ZL9A 1O85A 4RI6A 1YZXA 2B1KA 2HZFA 2JL4A 5IPGA 1SK2A 4QL7A 1THXA 4TVEA 4PQIA 3C1SA 4X1UA 2WDUA 3ZRDA 4MZBA 1CQGA 1PL1A 1W89A 2VL2C 4O7HA 1KNGA 4OO4A 1TTZA 1HYUA 2H0IA 2HXKA 2VD1A 2AV4A 4EXJA 4ZBBA 2LJKA 1G6WA 2LRTA 2A4VA 2KLXA 3EURA 1TOFA 3ZVJD 4IBPA 1T3BA 1WJKA 3UJ1A 1OYJA 2C0DA 2B7JA 2CVKA 2LTKA 1DE1A 1UA5A 3H93A 3UMAA 4MJEA 5G5FA 1M0UA 3GIXA 4HDEA 2VIMA 3APOA 3HZ8A 3GKMA 1X9MB 2B3SA 1K3LA 1HD2A 2GSQA 2DC5A 2H73A 1OC3A 4TKYA 4EF0A 3GYKA 1V2AA 3IRAA 1GULA 3IK9A 2GS3A 3GMFA 1X5CA 3OR5A 2KP2A 1S3DA 4QL9A 1B4QA 1EV4A 1PSQA 3TJBA 1U88A 1V40A 1EP7A 5CRHA 1SU9A 1WOUA 3APQA 4HS1A 1M9AA 3E9JB 3DVXA 3FZ5A 5DBQA 5D9WA 3QFBC 1OC9A 3VWXA 2LJRA 1LU4A 4GXZA 2LRCA 3L9VA 5GAPD 2RM6A 2VLVA 4MZWA 1IYHA 2TIRA 3H8QA 3VPQA 1XPVA 2H6ZA 3Q6OA 4JE1A 3F4RA 2V41A 2IMEA 2O89A 4YQUA 1JZOA 2H76A 3VWUA 1A24A 1VRSD 3ERFA 1GLPA 1AQVA 5G30A 1K0DA 1FW1A 1G0TA 4FIWA 3Q74A 3FY7A 4K0NA 2G2QA 1PQNA 1TU8A 1GSEA 2YJ7A 1T4ZA 3V1WA 1SKRB 1RW1A 2H6YA 4FYBA 2L4CA 2OKAA 3L0HA 2PUKC 2QC7A 5H5QA 1R4WA 1GTAA 2MBSA 1BEDA 2L6DA 1A0RP 3GHAA 4ZL7A 4XHMA 1JHBA 4Q5QA 1U6TA 5KN2A 2AUVA 3C7MA 4X43A 3VFIA 1B4PA 3A2WA 1B48A 1MDIA 2MMOA 4TN8A 4G10A 3UIWA 2FWHA 4IJIA 4NAXA 2B7KA 3H4KA 3P2AA 1NHYA 3IDVA 1PA3A 5AIXA 2GT5A 4KGIA 5DQYA 4GLTA 1BAYA 8GSSA 1YY7A 1XWCA 3CSHA 4K7IA 3M9JA 3FZ9A 4KDUA 2OADA 2QGVA 2NPBA 3EYTA 1Z9HA 2D2ZA 1UN2A 3TOTA 2IFQA 4MF6A 2F3MA 1BJXA 3HVVA 2E7PA 4TXVA 2L5OA 1DBYA 4L0UA 1GUHA 2LSTA 4ZBAA 1AW9A 3PGTA 1FHEA 2GDRA 4EUYA 4HI7A 4KCAA 5D73A 1F2EA 1QUWA 2VCTA 5HR3A 2H6XA 2P5QA 3O76A 4BL7A 3KMNA 2VCXA 4G19A 2FWFA 3UAPA 3EC3A 4ILFA 1QXHA 4G9HA 1FO5A 3UEMA 1XVWA 2YWMA 3ISOA 4EO3A 1XOAA 2C1YA 4TR0A 1YF1A 4ZILA 2H01A 1OC9B 1FG4A 5B7CA 2NVLA 2FHEA 3TRPA 1SD9A 5HR1A 3IAS2 2JZTA 4XCSA 5JCWA 2HNLA 4FH8A 1EGRA 3CSIA 3ZLPA 3LJRA 5EPFA 1XWAA 4BVYA 1JFUA 5DJLA 5ECPB 1ACVA 1OAZA 2FY6A 3DD3A 5J9CA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4XS1A

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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