4XS1 | Genus

Total Genus 53

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	53
sequence length	165
structure length	165
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFVFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVC

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus	53
structure length	165
sequence length	165
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xs1A00

1GLPA 2TRCP 2JZRA 2P31A 3HD5A 4WF5A 3UJ1A 4F0CA 4PURA 1U3AA 1EEJA 1FW1A 4HJMA 4MDCA 2MYGA 3VWWA 4EKZA 5JCWA 4N0VA 4DVCA 1G7EA 2OACA 2N5BA 4HOJA 4JE1A 3C1RA 4CHSA 2OBKA 2VLTA 2YP6A 1MTCA 5IQYA 3VFIA 2MBSA 2BMXA 3RHCA 1O81A 3M3MA 1M2AA 1F2EA 2HLSA 1JZDA 4IKHA 2H74A 1TRSA 4XIHA 1OC3A 9GSSA 2I81A 4N11A 3TKQA 3QAWA 4AF2A 1ZGNA 2AJQB 5DALB 4OFTA 1GNEA 2IMDA 5B8AA 4MF7A 1OKTA 2YWIA 3C1SA 2OADA 4N10A 4V1Ag 3GSSA 1SKRB 2V32A 3CRUA 3WGXA 4IBPA 4ACSA 4KA0A 2FY6A 1FHEA 1UVZA 2E7PA 3TOTA 2VAFA 5EY6A 5IMFA 2C4JA 2WRTA 3TKSE 2C3NA 3K8NA 5IO0A 2F9SA 1JLVA 4YQVA 4FIWA 2I3YA 2WULA 4FYBA 2VCWA 4ZL7A 1ABAA 3UARA 4PQIA 19GSA 4L8EA 4POKA 2JSZA 4BA7A 5DJMA 4DSQA 4GSNA 1S3DA 1WIKA 4NAXA 3ZFBA 1ST9A 1SJ6A 1T1VA 1A2JA 4MLYA 1A0RP 1H4OA 3ERGA 5ECPB 2EIOA 2LJRA 5IM9A 1U88A 3BOAA 3HVSA 3WYWA 3GUSA 2R5GA 3EE2A 2LQQA 2XBIA 3IA1A 2IFQA 1A8LA 2JACA 4K7IA 4XS4A 3CSIA 6GSVA 3KIJA 3TKRA 4J2FA 1X5EA 5J4UA 2FWGA 1SYXA 2H72A 1ZYQB 2E0QA 3F0IA 3LXTA 1RQMA 16GSA 4MF5A 5D93A 3GURA 2B3SA 5IMZA 1TK8B 4K0NA 4DSSA 1FAAA 3L9SA 2VCTA 1K3OA 3UVTA 5DQYA 3KMOA 1VGLA 1UA5A 1IYIA 2FNOA 2HXKA 2DSAA 3DD3A 2PN8A 4HZ4A 3ME7A 5AGYA 5IO2A 1C72A 4MZWA 1NSWA 3BD2A 5CYYA 3ZRDA 4G9HA 2LSTA 1AQWA 2VIMA 2PPTA 3FHKA 3TOUA 1ZYEA 4AJ7A 2HSYA 5GAPD 5E4WA 4Q5RA 4GF0A 1XFLA 5B8BA 1SL2B 1PD21 5F05A 5ECRB 5KEJA 2H0GA 1EGOA 3KMNA 3MSZA 4JBBA 1GUKA 4XS6A 2YJHA 1KEBA 1EOGA 4MJBA 2GSQA 1KBNA 2F3MA 1N2AA 2G2QA 4GSSA 1WP0A 3QD9A 1XW5A 3GMFA 1O8XA 3E9JB 3GTUA 3ISOA 1DE1A 4TW5A 2HZEB 4CDOA 2V1MA 18GSA 3IC4A 1B4PA 2B7JA 4ILFA 4KDYA 3RAZA 3S9FA 3JCML 1JZOA 5ECQB 1LU4A 2GQMA 2CZ3A 3HA9A 5DQSA 3F8UA 1N8JA 1QXHA 3HYPA 5HR2A 2H70A 3A5WA 4K7NA 4N0ZA 4EUYA 4EVMA 2NTOA 2RUFA 4I97A 1G7OA 3HDCA 2B1KA 5B6NA 2B7KA 2J23A 2EC4A 1AAZA 1HYUA 3HVVA 2A4VA 5INYA 4MPFA 1M9BA 2XBQA 5JWQB 4IJ3A 2DIZA 5DBQA 6GSSA 2FA8A 4POMA 1UC7A 1GRXA 2PUKC 4GXZA 2WCIA 3RPNA 1V98A 4EE0A 5IMDA 3U5RE 2N5AA 1GP1A 1X9WB 2C0DA 4J56E 3AY8A 2DMMA 5DVBA 4LL1B 1SD8A 4ECIA 3LGCA 3CRTA 4POBA 1T4YA 2MMZA 4TN8A 3DVWA 2IL3A 2ON7A 1GNWA 2L4QA 3VI7A 2M46A 3DGQA 2DBCA 3KEBA 1ZCPA 2CVDA 4ECBA 5D9WA 5G5EA 5G1KA 4PX1A 2CX3A 4MH2A 1OE8A 3HKRA 2OA7A 4NMUA 1RW1A 1PL1A 1MD3A 1JHBA 5KN3A 2AUVA 5DDLA 1GSSA 1M99A 3L9UA 1TRUA 3ZL5A 4KH7A 2H01A 1KNGA 3G9BA 4MF6A 5H5QA 2F51A 2P0GA 2RUEA 1W89A 5IPGA 4TVEA 4G2EA 2YANA 4O7HA 1A8YA 1TXXA 4EL1A 4HJ2A 1T3BA 1X5CA 1OAZA 2MMOA 2YNXA 4GWRA 2B6MA 2GQKA 2RM5A 4EC0A 2OE1A 3I43A 3P2AA 3F3RA 3QMXA 3H1NA 1Z5YE 2R6KA 1B9YC 2X99A 2YV7A 2HNLA 3BCKA 4YAPA 1GTAA 3IAM2 1SK0A 1NM3A 4K6XA 3I6AA 3QR6A 3H79A 1RK4A 4JRRA 4IQ1A 2C0EA 3ZVJD 4NWYA 2FGXA 3O3TA 1GSYA 1Q4JA 2IFQB 4XS4B 1V9WA 2DJJA 1BG5A 1Z7PA 1YZXA 4V2LA 2LRTA 4F9ZA 2CV4A 5CP1A 5F06A 4NHWA 4NXIA 4DSSB 2WS2A 3J7Yb 3QAGA 1O85A 2PU9C 2L59A 2HSHA 3KP8A 3F4SA 4MK3A 1I5GA 2QSIA 2H1GA 2R37A 3LFLA 3MWHA 3D21A 4JEDA 1M2BA 5G1LA 4O92A 2GT5A 1Y6EA 2N5FA 1TP9A 3KM6A 1K0BA 4GQFA 3FY7A 3IE3A 1K0MA 2VL3A 3QCPA 5A4VA 1KTEA 2CAIA 1E2YA 3RHBA 1T4ZA 3QOUA 2QC7A 3UMAA 3VWVA 3HZ4A 4MABA 1XOAA 5GSSA 3F9UA 4RQRA 1J08A 3DKSA 2F8FA 1W4VA 2DC5A 3GA4A 2FWHA 3ZIJA 4KSOA 5KN0A 3VURA 3TKPA 3DMLA 6GSTA 4HEA2 1QFNA 2YOIA 14GSA 3C71A 2KOKA 2VLVA 2LUSA 2IIYA 1EV9A 3CBUA 2GVPA 1XWBA 4HQZA 1PMTA 3KD0A 4QQ7A 5CO3A 3LYPA 3FEUA 4LLRA 2O87A 1GSUA 2VL2C 17GSA 3GN3A 4F82A 3LJRA 4IW9A 3GTUB 3O6TA 3GL5A 4NHZA 4PUAA 1YQ1A 2V2GA 4OO5A 2L4CA 4OCFA 1O7UA 1TI3A 1THOA 1ZL9A 2CZ2A 4KDUA 3EVIA 3A2XA 3TRXA 1FB0A 2NDOA 5JCUA 2LV3A 5A4WA 4OWYA 5C04A 3C8EA 3LYKA 2GLRA 1J0FA 3FZ5A 1TI1A 2BJXA 1I9DA 1U3IA 2H8LA 2LJAA 2C8UA 2EIRA 3UL3A 1XCCA 3MNGA 2LRCA 3P8WA 3P90A 4GSTA 3RBTA 1OE7A 1VF3A 3PR8A 3Q18A 4I6XA 1AW9A 3UOMA 2R3XA 3GL3A 2LS5A 3ERFA 4K2DA 4TRXA 2CT6A 2DJKA 5H5RA 1F37A 4IHUA 2FA4A 1F3AA 2OE3A 1MEKA 1OVNA 3DWVA 3KGKA 3US3A 4HUAA 1BAYA 1Z3EA 2L6CA 2IN3A 3TJKA 2TIRA 4F03A 3MDKA 13GSA 4GCIA 5C00A 3APSA 2PVQA 2GS3A 1VRSD 2IJYA 4ZL8A 2XPDA 2KP2A 5IMAA 3KH9A 3LG6A 2K9FA 1PKZA 2VOCA 1GSFA 5ECNB 3EMXA 3EURA 4PQ1A 3KJYA 3F4TA 4ZBDA 1J9BA 2JZSA 3W8SA 5GSTA 2ON5A 2FWEA 1SU9A 2FLSA 5HFGA 1CQHA 1R5AA 4ID0A 1PX7A 4XS1A 1BEDA 1EEMA 1K0NA 2AB6A 4RI6A 3GKNA 3VLNA 4TOPA 3NIVA 1GTUA 2DLXA 2B5YA 1WMJA 2PMTA 5H5SA 3GHAA 1BYEA 4KSMA 1R4WA 1U6TA 4LMWA 4PQHA 4MJEA 1Z7RA 3LSZA 3M8NA 5CAXA 3MAKA 2XHFA 2QKEA 1GULA 4QL9A 5ENUA 1SJZA 4MJAA 2X8HA 3KTBA 3LXZA 4ZIJA 1HNBA 1AQVA 3CTGA 4WF4A 1URMA 2GGTA 3EMPA 5LD0A 4OMVA 3W8JA 3H4KA 1R26A 2MMAA 3VWXA 2WDUA 1Z6NA 4WR5A 1DUGA 1SKSB 4ECCA 5DCGA 2WB9A 2MBTA 2D2ZA 5LNKe 1M0UA 5F0GA 1JFUA 3ZYWA 5HFIA 1BJXA 1SKWB 4FYCA 5FT3A 3WGDA 3IAS2 1DE2A 1A24A 2R4VA 2V41A 2C3TA 4LL4B 3APQA 3FZ9A 4ISDA 3GSTA 5GZZB 1O6JA 1F6MC 3HJOA 3IK9A 4IP6A 3HCZA 2OE0A 2QGVA 5ECOB 1Q98A 5KN1A 4I5QA 1QMVA 3RPPA 4K9ZA 1T7PB 5G31A 1FVJA 4TR4A 4RI7A 3W6GA 2VM1A 1S3CA 3KZQA 3Q74A 3SWLA 3D4TA 3FR3A 4EF0A 5G30A 2CX4A 4K0GA 6GSXA 3TJGA 1YEPA 2JZTA 4WETA 4L5OA 1OC8A 1CQGA 2YJ7A 2E2MA 3GKKA 3L4NA 1SK1A 2A2SA 2LQOA 5AIXA 4AJ8A 2CA8A 2B5XA 1NHYA 2CVBA 5D96A 1JZWA 5IOXA 3H8QA 3ZMKA 3UAPA 2K6VA 4HU7A 2I4AA 1FOVA 3VI5A 5G5FA 1VF2A 5B6MA 2ZCTA 3J7Yk 1YEXA 2H6YA 3EC3A 3QFAC 3DIEA 3UIWA 2GZPA 4L0UA 5ELAA 1E6BA 1K0DA 1ACVA 2WZ9A 4MMMA 5ECMB 2LNTA 2CAQA 4V1Ap 2GZZA 1AUCA 1K0OA 1ILOA 1G6WA 2AHEA 5D8IA 1QGVA 2H19A 3ZITA 3C7MA 2VCZA 4HDEA 3R2QA 2LJKA 2P5QA 4CW9A 1V57A 1YDKA 2C0FA 1HQOA 20GSA 3TCOA 1WOUA 3G7JA 22GSA 1YJ6A 3LEFA 2RLIA 1K0AA 2VL2A 3F6FA 4K8MA 3HJPA 1SYRA 2PGTA 1WPIA 2MMNA 3L78A 4ZB8A 2YZHA 2GSTA 4ZL9A 2TRXA 2AYTA 3TJFA 5D9VA 1B48A 5HR0A 3FW2A 2L5LA 3BBYA 3VWUA 5JWRB 2KLXA 4I2TA 3TRQA 1X9SB 3Q19A 5J41A 1NHOA 5D9XA 4WXTA 1AXDA 3EWLA 4H86A 3F4RA 2YPMA 2WJUA 4RUVA 3CXGA 1XIYA 3D4MA 2H1AA 2V6KA 4Q5NA 5EL8A 4ZBAA 2ZUPA 2HRNA 1SL0B 1TRWA 1OC9A 1X5DA 3GKXA 4KW6A 1T8EB 3WGEA 1U87A 1R5PA 3D6IA 1SJIA 2XPEA 2YWMA 6GSYA 4KX4A 2FD3A 2PERA 3VPTA 1SD9A 3CSJA 1TW9A 2HI7A 4WR4A 3F63A 5LCZA 4WKWA 1ZZYA 2JADA 3FRCA 2HFDA 3TB2A 4BVXA 1SENA 4V2NA 1AC1A 2DJ0A 4IS0A 4L5LA 1G6YA 4DSRA 2P5RA 1H75A 2H71A 2GZYA 4TXVA 3I69A 3TDGA 4KGIA 1UN2A 4TR1A 3DRNA 3TRPA 2OKAA 3CMIA 4FYUA 2JSYA 2MZCA 2O85A 2NBSA 3KH7A 1ML6A 2K18A 1FB6A 3D0ZA 2IPAA 1ERUA 1TOFA 4NPBA 1XWAA 1T00A 4J57E 2DJ1A 1GSQA 2L5OA 4XHMA 2FWFA 1NW2A 2GTUA 3GYKA 5D73A 5GAND 3ME8A 5DAKA 1PSQA 2X8CA 1TRVA 4MCUA 2DMLA 1VF4A 4OO4A 3QAVA 2XC2A 2ES7A 5IPHA 3ZMLA 2VCQA 2YWNA 3IV4A 3TJBA 4BL7A 3KXOA 3KTLA 2E2GA 4ML6A 2IMKA 3Q6OA 4BWQA 4D73A 5D9TA 4BVYA 4L0WA 5EPFA 3TGZA 2X8GA 3D22A 6GSUA 2GQLA 2VLUA 3DVXA 4IQAA 3TUEA 3N9JA 2H0HA 1FG4A 4IN0A 5F07A 4IP1A 2OJLA 3IR4A 3IXRA 1EZKA 4HQSA 1Y25A 4Q5FA 3LWAA 4XRDA 1WRYA 2NVLA 4KCEA 1YY7A 4LMVA 3LQ7A 4PNFA 2KHPA 1GTBA 1PQNA 1XBSA 3P7XA 2YN1A 1XW9A 1X9MB 1XVQA 3E3EA 1BX9A 3VK9A 2PBJA 3BJ5A 2VUPA 4ZB6A 3HXSA 2C3QA 1G0TA 2LNSA 2VO4A 2ZNMA 3GNJA 1X0RA 7GSSA 1OKDA 4K1FA 3UBLA 5ECKB 5ID2A 1JZRA 2VL9A 1EWXA 5AIVA 2KP1A 2M72A 4ZBBA 1GSEA 3PGTA 5IIZA 4MA9A 2H66A 2LKUA 3M9KA 4TR3A 3L9VA 2AV4A 2CQ9A 5HR1A 2OBIA 2H73A 5EVOA 4TXOA 1USBA 5COHA 3A3TA 4E8EA 4I8BA 5CRDA 1SK2A 2ALBA 3ZTLA 3RDWA 4F2IA 4KUNA 4ZILA 3TKSC 3OR5A 3WD6A 3CSHA 1ERWA 3GH9A 4FO5A 3EU3A 2H0IA 5CRGA 5IMVA 2LTKA 2DIYA 1DSBA 3UBKA 1TTZA 1GUMA 2H75A 1LJRA 1XW6A 2IWTA 1WE0A 5A5KA 4GLTA 4RQXA 4G19A 4F0BA 1XWKA 2REMA 3EU4A 5HFKA 2YCDA 1HNCA 3ZFLA 2HE3A 3ZREA 5E59A 3EYTA 4HI7A 2YV9A 1K3YA 3I9V2 5G2ZA 2H76A 1WWJA 2HT9A 2GSRA 3HHVA 3A2WA 3ERWA 2FUG2 1EP8A 1TK5B 5CREA 5FWGA 3CTFA 1Z9HA 1TKDB 4ML1A 2R2JA 5DCHA 4ECJA 3ZVJA 2F8AA 3H93A 1LBKA 2V6OA 3GRXA 4PGTA 4TKYA 1SL1B 3HVXA 3KCMA 5CNWA 1FO5A 4EO3A 11GSA 1B4QA 1V40A 1OC9B 2H6ZA 4JR6A 1K0CA 1V58A 3GIXA 3IHQA 4EDYA 1MDJA 4EDZA 3A2VA 1THXA 4XTSA 4PUFC 1M7TA 3V1WA 4Q5QA 1B8XA 1XWGA 4AJ6A 2K8SA 2IMFA 3HZ8A 1A2MA 2B1LA 3D5JA 1XVWA 3M1GA 4X1UA 4BPYA 5JCGA 4Z7XA 1AIUA 1GLQA 2CVKA 2M80A 4MP4A 3HY2A 4ZB9A 1BQ7A 1GTIA 4KCAA 4EXJA 3VPQA 5L71A 1IYHA 3GX8A 2G0FA 2L57A 4TR1B 5ECLB 1YKAA 1EV4A 1HNAA 1VF1A 1A0FA 4JZQA 5ELGA 1O73A 1ZMAA 1PN9A 4I2UA 10GSA 3F3QA 2B5EA 4X0XA 1MD4A 4KDXA 1EOHA 1DBYA 3IDVA 1ERTA 2J9HA 1R7HA 2YWOA 2BTOT 2C0GA 4BWSA 3WT1A 1ERVA 5CRWA 2RM6A 4MZCA 5DAKB 2LEGA 1K3LA 2X64A 4MPGA 4WBJA 3UVHA 3ZZXA 4DEJA 4JU5A 2C80A 4MJCA 2KUCA 1JLWA 3ED3A 3BCIA 4YQUA 3SBCA 4NV5A 5AN1A 4IVFA 5DALA 5HR3A 4PNGA 2H6XA 4D73B 2YZUA 2O8VB 2PWJA 1PA3A 1GSDA 5F8BA 3KP9A 3EINA 4O32A 3N5OA 1YF1A 1EGRA 1A2LA 2VCVA 2HZFA 3TJJA 2JU5A 3ZLPA 3M0FA 1PX6A 1XOBA 2GSSA 2RIIA 4JR4A 4KE3A 2PVOC 4TR0A 6GSWA 2HYXA 3IOSA 1YKCA 4ULXA 3NOFA 3U6VA 2Z9SA 1F9MA 4GRFA 3FK8A 2IMEA 1M9AA 4PXOA 3LORA 4YH2A 1QQ2A 4OFNA 3DEXA 5A4UA 4IGJA 2VCXA 1TU7A 4YQMA 2I1UA 2K8VA 2VM2A 3APOA 4POLA 3GH6A 3UEMA 1TK0B 3IBHA 8GSSA 5FHIA 2A2RA 3FKFA 1TDIA 4E8HA 4NV2A 1EP7A 1XWCA 5ID2B 2VD1A 5HQPA 5B7CA 4G10A 5ECSA 2DJ2A 1XPVA 3GX0A 2H30A 1XXUA 1O8WA 3WT2A 4GTUA 3DYRA 4MZBA 5AISA 1M2DA 1TU8A 3GFKA 1ON4A 12GSA 3C73A 4O5RA 2I9HA 4ZXGA 5ECIB 4P3YB 4IJIA 4TXOB 2O7KA 2FHEA 3QDNA 3IK7A 4HU9A 3G7YA 3G7IA 3FZAA 1QK8A 2JL4A 3FR9A 1PRXA 3PINA 4AGSA 2NPBA 3E0UA 4KB3A 4XCSA 4N30A 4MH3A 2FCHA 1TJDA 1AQXA 1XZOA 4LA1A 1GL8A 1S3AA 1QUWA 2GDRA 3IPZA 4KAEA 1GH2A 2C1YA 4OCEA 4OD7A 4GQCA 5CRHA 1PGTA 1ZOFA 4WEYA 4V2MA 2HRFA 2WGRA 4QL7A 2H1BA 5IMCA 3QFBC 3F6DA 2H1DA 3O76A 1PL2A 4HZ2A 2VD0A 3HJMA 2O89A 5ABRA 3QPMA 3FZ4A 3FR6A 3PH9A 2L6DA 5J9BA 3GKMA 3TKSA 4X43A 1HD2A 3NZNA 3M9JA 5IOWA 3L0HA 1WJKA 5ECHB 4WBRD 3DXBA 1MDKA 5J3RA 4FH8A 1MDIA 5JWOB 1GUHA 4IELA 2HZEA 4KNDA 3ZIVA 1Z6MA 2IMIA 2WFCA 4OFMA 2AAWA 5J5NA 2EIQA 3CYNA 2DJ3A 4K7OA 4YAVA 1PKWA 1B9XC 5KN2A 3IRAA 1GWCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XS1A

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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