4XS1A

Salmonella typhimurium ahpc t43v mutant
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFVFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 53
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs1A00
1ON4A 4HS1A 1BX9A 2FD3A 2FNOA 3EU3A 3LJRA 2N5BA 3F4SA 1DUGA 4MPGA 2O8VB 1UC7A 1WJKA 4XTSA 3M1GA 1GLPA 1JZOA 12GSA 2KP1A 4D73A 1AW9A 1ACVA 2CZ2A 2XPDA 4YH2A 4PX1A 4F03A 1Z5YE 3TKSA 3A5WA 2WGRA 2A2RA 3TGZA 4TR0A 4F0CA 1GUMA 4EF0A 1Z7PA 2DJ0A 3TRXA 2FY6A 2C1YA 3BD2A 18GSA 3D5JA 3UVHA 2F8AA 5IO2A 1F3BA 2K8VA 5J3RA 3KH9A 2PVOC 3A2VA 1SJ6A 4CHSA 1PL2A 2V6OA 2RUFA 4Z7XA 1VF4A 6GSTA 1A23A 1K0MA 1PX6A 2FA4A 1YKAA 3HDCA 1GSEA 4JE1A 4KW6A 2L4QA 1S3AA 1Y6EA 4MJEA 2ALBA 3EMXA 1K0AA 4PNFA 2AUVA 2GSTA 2H0HA 4AJ8A 2M80A 4O32A 1OC3A 4ECIA 4NWYA 3ZFBA 2GS3A 3EURA 3G7YA 5HR1A 5H5RA 1I5GA 1O85A 3IK9A 3ZVJD 1FB0A 1KNGA 5ECKB 3W8JA 4K8MA 4BL7A 4X1UA 2LJRA 4EO3A 1B9YC 4IJIA 4DSSB 14GSA 1A0RP 5CRHA 1K3LA 3HKRA 3FRCA 2GQMA 4K6XA 1FOVA 3BJ5A 1GSFA 2L57A 2DMLA 1F37A 5E4WA 5JCGA 3QD9A 3O6TA 3WT2A 3I9V2 3KTBA 2C3TA 5ECLB 3VFIA 1QQ2A 3O3TA 3HZ4A 4BPYA 1WOUA 2GQKA 4ID0A 1PL1A 4XS4A 2DJ2A 1J08A 4DSQA 4KSOA 2YJ7A 3ZRDA 3GKNA 4MDCA 3TKSC 3F6FA 2DC5A 5D73A 3DXBA 1XWCA 2R4VA 3GH6A 3TJFA 5G1LA 2Z9SA 4D73B 2H73A 1YEXA 4MABA 3QFAC 2C0EA 2C0FA 4JR4A 3GKMA 4KDXA 2BJXA 2F8FA 3GUSA 4GF0A 1CQGA 4HQZA 1ZCPA 1XWAA 2WULA 2PPTA 2GZPA 1WP0A 1OE8A 1ZYEA 1QMVA 3VPQA 1OC9A 1U3AA 2I9HA 4OFTA 3E0UA 2N5FA 2R6KA 3ZFLA 2H1GA 1AXDA 4FIWA 4O5RA 1A8LA 3F63A 3M3MA 4YQUA 1HNCA 1YJ6A 3HYPA 1FB6A 3L78A 5AN1A 3RHBA 5IOWA 1TK0B 1O8XA 3ME7A 3PR8A 2FGXA 3CTFA 2TRCP 4IQAA 17GSA 4TXVA 2IMFA 2YWIA 3FW2A 1PA3A 3L9VA 3EC3A 4ZBAA 5DJLA 2CAQA 2KLXA 4F82A 3C8EA 1O7UA 4RQRA 4ULXA 4EC0A 5D9TA 4GXZA 4IELA 2XPEA 2YZHA 2YJHA 2H6ZA 4POLA 2FWHA 2MMNA 2MMZA 3IV4A 3GMFA 2WRTA 1B4PA 1U88A 4AGSA 2WJUA 1J0FA 1JZDA 5F06A 2LUSA 3HD5A 6GSXA 2ON5A 1XW6A 2MMOA 4BA7A 2H8LA 2K8SA 4G10A 2IJYA 1PGTA 2F51A 5J41A 1E2YA 3F9UA 4V2NA 1W89A 3IBHA 3NIVA 4JZQA 4IKHA 1EP7A 4V1Ag 5ECMB 1SD9A 2H19A 2EIRA 3NOFA 5HR0A 3GSSA 5DCGA 2HE3A 2PU9C 1O8WA 5DVBA 1Y25A 2J23A 2VM1A 3CRUA 2JADA 2R5GA 2EIQA 2L4CA 4OFNA 1FVJA 4FH8A 1PMTA 3BCIA 4EXJA 3LXZA 4ZXGA 2PN8A 2BMXA 2JACA 2JSYA 2P5QA 2HNLA 4L8EA 1J9BA 4JRRA 1XWKA 2LQOA 3UVTA 2IMKA 1XFLA 2C3QA 3HJPA 2MYGA 2GT5A 2H0IA 2B5XA 3QOUA 2H1BA 1R5AA 5JWQB 4IP1A 2NTOA 5D9XA 4YQMA 3IR4A 4BWQA 4K0GA 1WIKA 3QR6A 5B6MA 1PKWA 4PUAA 3D4TA 4GQFA 2WCIA 2CA8A 2OACA 2LRTA 3TRQA 2HYXA 10GSA 3ZMKA 1NSWA 4NXIA 2GZZA 1PRXA 3GX8A 3FZAA 5HFIA 3FK8A 1RW1A 1K3YA 2FWFA 4PGTA 1LJRA 3GSTA 2PWJA 2MMAA 3BOAA 1TOFA 5DAKA 2E0QA 2VIMA 3KD0A 2HSHA 3E9JB 4IP6A 2LEGA 2ZNMA 1YF1A 2KOKA 2H71A 2A4VA 4MH2A 5ELAA 4MMMA 3DIEA 4G2EA 3L4NA 2XHFA 3DWVA 1VF1A 4MA9A 1QXHA 4O7HA 1JZWA 5IMCA 2VCZA 5ELGA 3QAVA 5DALA 4KCAA 1T4YA 4WBJA 1T1VA 1PQNA 5G2ZA 5ECRB 1OC8A 3KP8A 2JU5A 5COHA 5IMZA 4WXTA 3TOUA 1MEKA 2CAIA 1URMA 1NW2A 1VF2A 2C3NA 1G7EA 4E8HA 5B8BA 5ENUA 2VCTA 1FHEA 3IAS2 1TU7A 6GSSA 1WMJA 3TDGA 1AAZA 4KH7A 4IVFA 1R5PA 4X0XA 1SK0A 1Q4JA 4KSMA 5DJMA 1TW9A 1PD21 3UOMA 4Q5NA 3M0FA 5EL8A 4HZ2A 3G9BA 2YANA 2B1KA 3FEUA 3I6AA 4Q5FA 1X9MB 5ID2A 1YY7A 4YAPA 1T7PB 2ES7A 2KHPA 3KTLA 3WGEA 1T4ZA 2C80A 1Z6NA 1QFNA 3N9JA 3GX0A 4J56E 1WE0A 1XIYA 2H75A 3W6GA 6GSVA 3KH7A 1LBKA 5JWRB 3P7XA 1A0FA 2DBCA 2H6YA 1H4OA 3IXRA 1OKDA 1ERWA 4AF2A 4RI7A 4PXOA 1V9WA 2GGTA 5GSSA 3G7IA 4TR3A 5ECSA 2C0DA 4ML1A 3CSHA 5B7CA 5J5NA 3LGCA 1ABAA 3ZYWA 3A2XA 3DMLA 1KEBA 1WRYA 1TRWA 2H76A 4EDYA 1TRVA 5CYYA 2FA8A 1TRUA 3SWLA 2CQ9A 5INYA 3WGXA 3DVXA 4HI7A 3KMOA 1GSYA 5J4UA 2R2JA 3GA4A 3ZL5A 4J2FA 2EC4A 3F4TA 1UVZA 1F2EA 1R4WA 2I81A 2YN1A 1ZGNA 4LL1B 2B7KA 3C1RA 2YOIA 1VF3A 4FO5A 4MLYA 1IYHA 1X5CA 5DAKB 2OADA 2H74A 2LJKA 3IDVA 4I8BA 1SK1A 2LSTA 1M2BA 3HVVA 6GSUA 5HFGA 5LCZA 1TTZA 1JLVA 3GHAA 1W4VA 4OO5A 4BWSA 1OYJA 5G1KA 5C00A 3TJKA 3GNJA 5JWOB 4XRDA 5DALB 4HQSA 3FY7A 4TR4A 1T8EB 3F6DA 4NV2A 4I2UA 20GSA 2OE3A 3QAWA 4K2DA 3C7MA 4WR5A 3UIWA 4OFMA 3C73A 3Q18A 3HZ8A 3CSIA 2DJJA 3GL5A 1K0CA 2HZEA 4IW9A 1JZRA 4ISDA 5IMDA 4F0BA 3D21A 1XCCA 2VCVA 2FUG2 2LNSA 2FWEA 1SENA 3QPMA 3ISOA 1GLQA 5ID2B 2H72A 4PQIA 3SBCA 1I9DA 5G30A 3VWVA 1SL2B 4F9ZA 4DSRA 4MJBA 4YAVA 3HXSA 1HNAA 5GSTA 5KN0A 1SYXA 2K18A 2MZCA 2N5AA 2IPAA 2GTUA 3UL3A 5IMFA 1V40A 4GSTA 1FO5A 3US3A 5CRGA 1DSBA 3AY8A 4OMVA 2IFQA 5CO3A 4ZIJA 4ZBBA 3F3QA 1U6TA 1TXXA 4KDUA 2V6KA 2B6MA 3F4RA 3BCKA 2H30A 2O87A 3CMIA 2HI7A 1TJDA 2K6VA 4TXOA 3CXGA 2C8UA 3DEXA 3L9SA 4E8EA 5CRDA 3IC4A 3LYKA 3UBKA 2DJ1A 1A2LA 1K0BA 4XHMA 3M8NA 2PMTA 2X8GA 4MZCA 1EGOA 1GUHA 2YWMA 3BBYA 5A5KA 2L5LA 3LWAA 4OWYA 3F8UA 2DJ3A 5H5SA 22GSA 1VGLA 4WF5A 3Q6OA 1WWJA 4IQ1A 1O6JA 2IMIA 4N11A 3RBTA 1EOGA 1QK8A 3IOSA 1C72A 1PN9A 2FCHA 1SU9A 1QUWA 2OJLA 1GNWA 2PGTA 1PKZA 2MBSA 2OE0A 3K8NA 5EVOA 1TKDB 4K7OA 1DBYA 4KDYA 1M7TA 4WETA 3TOTA 2AB6A 2AJQB 2VD0A 2YCDA 3DRNA 2JSZA 2VCXA 3P90A 5H5QA 3WD6A 1M2DA 3H79A 4IS0A 2JZSA 4MPFA 2OBKA 2JZTA 5DCHA 1G7OA 1YZXA 4KA0A 1A2MA 4KB3A 2HZEB 1SJZA 1VRSD 3QDNA 4P3YB 3KGKA 3S9FA 3NZNA 4XRAA 4L0WA 4N10A 2ON7A 3GV1A 2O89A 5GZZB 3RAZA 2VLTA 3PGTA 3H8QA 1GNEA 3VK9A 3MSZA 3ERFA 1RK4A 3TCOA 3CBUA 2AYTA 2V41A 4ZB8A 2L59A 4N0ZA 3F3RA 2YV7A 1B9XC 2DJKA 4EL1A 3EU4A 4V2MA 2TRXA 5LNKe 2M46A 2R37A 3TKRA 4ZB6A 4LLRA 4LL4B 2YNXA 1ZOFA 5D9VA 3D22A 4JEDA 1GTUA 2VL9A 3RPNA 4NHWA 1K0DA 2XBIA 2HXKA 4LMWA 1ZL9A 1XOAA 2HRNA 1EZKA 1XWGA 5D96A 2IFQB 2REMA 2P31A 1ML6A 1U87A 2B1LA 2F9SA 3ZREA 2E2GA 2GSSA 1GUKA 5A4UA 5ECHB 2DIZA 3KCMA 4ZB9A 3MAKA 3R2QA 4PQ1A 4MJAA 4EUYA 3IE3A 1GRXA 4TXOB 3FR6A 3V1WA 3EWLA 1YKCA 2B7JA 1USBA 1GULA 2CVBA 4TR1A 4ML6A 2ZUPA 3E3EA 1HNBA 5D9WA 1AC1A 1MTCA 4YQVA 3N5OA 4CDOA 3L9UA 2VCWA 5F8BA 1BQ7A 4ECCA 4GLTA 3GKXA 3TB2A 5HQPA 1O81A 2D2ZA 1RQMA 3O76A 4PNGA 3HVXA 2VM2A 4KE3A 5ECNB 2OKAA 3ED3A 4IGJA 3OR5A 2HZFA 2C0GA 4ECJA 1GSSA 2C4JA 3M9KA 2CVDA 2YZUA 3GURA 1GSDA 1UA5A 1K0NA 1SL1B 3FHKA 3KP9A 1XWBA 4GTUA 2H0GA 2HRFA 5JCUA 1BJXA 3A2WA 4IBPA 2DLXA 1BEDA 1MD3A 5ABRA 3WGDA 1GTBA 1YEPA 2GT6A 2YP6A 3UJ1A 3ZTLA 3G7JA 3TJBA 3DKSA 4K9ZA 2G2QA 1OKTA 5LD0A 3GTUA 1B4QA 1F3AA 3J7Yb 1M0UA 1GWCA 2OE1A 1EV4A 2PVQA 2WDUA 5G31A 1G6YA 2RM5A 4WKWA 1SD8A 3H1NA 4KUNA 4HEA2 1ERUA 1XVQA 2CV4A 1UN2A 2YPMA 2LRNA 3LFLA 5ECQB 4WEYA 2GSRA 4OO4A 3ZIVA 1S3CA 3GIXA 4ZL7A 4ACSA 4KX4A 3PINA 1JHBA 4QL9A 1M9BA 5IPGA 1NHOA 3WT1A 5IQYA 4GWRA 3APSA 3MNGA 1THXA 3ZZXA 5CAXA 5GAND 1ZYQB 1GTAA 1X9WB 2IMDA 3KEBA 4MJCA 4TR1B 3RPPA 3VWUA 3CSJA 1AQVA 1JLWA 1MDIA 4I97A 1R26A 2HSYA 1EOHA 1NM3A 3Q19A 3EE2A 4IHUA 4TOPA 1FAAA 3VURA 4J57E 4X43A 3VI5A 4QQ7A 3VWXA 16GSA 4JR6A 4RQXA 1TP9A 4O92A 1B8XA 4DEJA 2O85A 5G5FA 1SKRB 4NV5A 3I43A 4TN8A 2X8CA 4NHZA 3UAPA 1HYUA 9GSSA 1A2JA 2CT6A 1NHYA 4MCUA 5CP1A 2QSIA 2VL2A 2VLUA 3J7Yk 2LV3A 1THOA 4GCIA 4AJ7A 1BAYA 5AISA 6GSYA 5D93A 3VWWA 4L5LA 1X5EA 2ZCTA 4CW9A 2AHEA 3D0ZA 1M9AA 1SKWB 3D6IA 2GZYA 2R3XA 3GRXA 5IIZA 2GDRA 5KN2A 2VOCA 3LORA 1AQXA 2I4AA 2QKEA 3ZVJA 2L6CA 2DIYA 3UMAA 3EMPA 19GSA 4WR4A 3IK7A 2NDOA 3HCZA 5IO0A 3IHQA 4OCFA 2NVLA 2A2SA 3LSZA 2XC2A 2V32A 5KN1A 1HQOA 2XBQA 2GVPA 3ME8A 1OVNA 2IMEA 1PX7A 2RUEA 3GTUB 4LA1A 3TUEA 2GSQA 2CX3A 1Z9HA 1H75A 1Q98A 3TKSE 3ZIJA 1Z7RA 4KGIA 4HOJA 2BTOT 4KCEA 1TU8A 2WFCA 5IPHA 4RUVA 5F07A 2H01A 4HJMA 2H6XA 2B5EA 2IN3A 4HZ4A 2IIYA 4K1FA 5L71A 3APOA 2H1DA 4RI6A 3U5RE 8GSSA 4FYBA 5B8AA 2X64A 3TJJA 2YV9A 11GSA 1FVKA 2B3SA 4MK3A 1X9SB 4G19A 1XPVA 4PQHA 3MWHA 5KEJA 4K0NA 4MF5A 2X99A 1EEMA 1EEJA 5C04A 3ZLPA 1ST9A 2AV4A 1XOBA 2CZ3A 2CVKA 1M2AA 2RM6A 3KJYA 2HT9A 2M72A 2GQLA 1A8YA 2DSAA 2K9FA 1XW9A 4Q5RA 4ZL8A 4LMVA 1ERVA 2HFDA 1KTEA 3HVSA 1XW5A 2VL2C 4GQCA 1EGRA 4WBRD 2V2GA 7GSSA 3HJOA 2G0FA 5D8IA 3HJMA 4I6XA 1SJIA 4FYCA 1PSQA 4HU7A 3U6VA 4GSSA 4Q5QA 3DGQA 3CRTA 2FHEA 1GH2A 1YF0A 3FKFA 1T00A 3APQA 3ZITA 1X5DA 1AQWA 2VUPA 4NPBA 3ZMLA 2EIOA 1GSUA 4MP4A 4G9HA 2RLIA 2LRCA 3WYWA 1ERTA 3CTGA 1QGVA 4TW5A 3KM6A 4ZL9A 3H93A 5DDLA 5HR2A 3GH9A 5IOXA 4IJ3A 1MDKA 3FR9A 4NMUA 5FWGA 2P0GA 2VCQA 3TJGA 5J9BA 1OE7A 4POMA 3QAGA 4EKZA 2CX4A 2JL4A 2H66A 2MBTA 3KXOA 5ECPB 4EDZA 3QCPA 2KP2A 2X8HA 1N8JA 4IN0A 1FG4A 2WB9A 3GKKA 5IMVA 2OA7A 1SKSB 2RIIA 5JCWA 1U3IA 3LQ7A 1DE2A 1MD4A 2KUCA 3KMNA 2I1UA 2FLSA 5A4VA 2IL3A 4OCEA 2JZRA 3ERGA 1TI3A 1K0OA 3HHVA 2LKUA 5F0GA 4TRXA 4N0VA 2LTKA 2NBSA 3LG6A 5ECOB 5CREA 4KNDA 1M99A 2QC7A 1GL8A 5KN3A 4I2TA 1GTIA 4F2IA 1G0TA 3VI7A 4XCSA 4XS1A 2PUKC 3FZ4A 4N30A 1V98A 3H4KA 1AIUA 1ZZYA 5A4WA 3GFKA 2L6DA 1G6WA 1DE1A 4ILFA 3QMXA 5HR3A 1F6MC 1F9MA 5EPFA 3MDKA 1EV9A 1IYIA 2AAWA 4FYUA 1TK8B 1LU4A 1SK2A 4JU5A 1OAZA 3I69A 1SYRA 2V1MA 1B48A 1GP1A 3EYTA 3CYNA 1TI1A 3TKQA 5J9CA 1S3DA 5E59A 3GN3A 4H86A 3VLNA 4HJ2A 3FZ5A 4XS4B 5CNWA 1X0RA 3TKPA 3UARA 1R7HA 5FHIA 4ZBDA 2GLRA 2O7KA 5CRWA 3FYGA 2NPBA 3GL3A 3HY2A 4BVYA 3DYRA 3PH9A 4HUAA 2DMMA 5ECIB 4I5QA 3LXTA 1SL0B 2E7PA 3RDWA 3Q74A 1MDJA 3EINA 5EY6A 2E2MA 1TDIA 2HLSA 4MZBA 2QGVA 1FW1A 4BVXA 5GAPD 3ERWA 4GRFA 3C71A 5F05A 1OC9B 1V57A 4MF6A 1E6BA 5IM9A 1T3BA 3LYPA 4TVEA 4K7IA 4KAEA 2VAFA 3M9JA 4V2LA 3IRAA 3KZQA 1YDKA 2WS2A 2YWOA 4PURA 3IA1A 1Z3EA 1AUCA 1BYEA 2J9HA 3FZ9A 4OD7A 2WZ9A 1YQ1A 2OBIA 2H1AA 4NAXA 1V58A 5AGYA 1TK5B 4K7NA 4MH3A 4AJ6A 3EVIA 1O73A 4MF7A 2LS5A 3F0IA 4JBBA 1CQHA 1XBSA 1EWXA 2LJAA 2B5YA 1K3OA 3TRPA 3P8WA 3IAM2 2VL3A 4HU9A 1ZMAA 1A24A 3RHCA 4EVMA 1TRSA 2LNTA 2TIRA 1XVWA 4L5OA 4POBA 1EP8A 3P2AA 5DBQA 3UBLA 1XXUA 1XZOA 2P5RA 3LEFA 2PERA 5DQYA 3DD3A 4ZILA 2I3YA 1N2AA 3JCML 4EE0A 1BG5A 2L5OA 4POKA 1WPIA 3UEMA 4QL7A 3KIJA 4TKYA 1KBNA 4DSSA 1V2AA 5DQSA 3C1SA 6GSWA 4V1Ap 4DVCA 3FR3A 4WF4A 2IWTA 13GSA 4GSNA 3GYKA 4L0UA 2VO4A 3IPZA 1GSQA 2H70A 2PBJA 5B6NA 5G5EA 1ILOA 3A3TA 5FT3A 4XS6A 1Z6MA 3QFBC 3HA9A 5AIVA 5HFKA 3W8SA 1JFUA 2YWNA 5IMAA 2LQQA 4ECBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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