4XS4A

Salmonella typhimurium ahpc c165s mutant
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 57
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs4A00
1UN2A 3VWVA 2JSYA 3W6GA 1TU7A 2E0QA 2JZTA 2XBIA 4OD7A 4AJ8A 1XPVA 3LYPA 2H1AA 3F4RA 3ZL5A 4TN8A 2X99A 3FKFA 1PMTA 4XCSA 3FZ5A 3GHAA 1ZCPA 3FZ4A 1R5AA 5ECSA 4KAEA 1EP8A 3ME7A 1Z5YE 1F3BA 5D9VA 2GGTA 1XZOA 3LSZA 4POBA 3G7IA 4MDCA 1ZYQB 3IOSA 3IE3A 2FY6A 1O6JA 1LU4A 4JRRA 3UBKA 3DIEA 3ZMLA 1EEMA 1JZOA 2WFCA 4ID0A 4PGTA 4MF7A 5HR1A 3VI7A 1G7EA 3HHVA 1GTAA 3HVSA 3QFAC 4Q5QA 1U3IA 3M8NA 5IOXA 4IN0A 2D2ZA 1HNCA 2C4JA 4HJMA 1A2LA 2R2JA 2JU5A 2YWNA 3PR8A 2DJ3A 4HOJA 3ZTLA 2HI7A 2JSZA 3LEFA 13GSA 2X64A 1B4QA 1BX9A 2C0FA 2M46A 1FW1A 2YJ7A 2H72A 2MZCA 4WETA 3KH9A 1TOFA 5AISA 5H5SA 5HR2A 2PVQA 2F8FA 1Y25A 1RK4A 1I5GA 2HYXA 1GNEA 2OKAA 5DQYA 2BMXA 2FLSA 1YKCA 2FNOA 2DMLA 1YJ6A 1SK0A 2RUEA 2C80A 3GNJA 1TXXA 2GT6A 3MDKA 5IMFA 2CVBA 1PRXA 2FCHA 2TRXA 1X9SB 3KMNA 1GH2A 1PSQA 3NIVA 3Q18A 5IO2A 4TR1B 3QPMA 1M2DA 4EVMA 2H1GA 4GLTA 4KH7A 3TJKA 3TB2A 1QGVA 3CRUA 5CRWA 3BD2A 3HZ4A 3GV1A 3A2WA 2GZZA 3M9KA 1K3OA 1IYIA 4TXVA 1GSEA 2HNLA 1XW6A 3FY7A 3N9JA 4NMUA 4H86A 3ERGA 4PNFA 1NHOA 3MSZA 1X5DA 4I2TA 2HSHA 1GL8A 3MWHA 3BJ5A 1DUGA 5COHA 5B8AA 4OCEA 2DJKA 4CW9A 2WZ9A 3KP8A 1VF4A 1A2MA 2K8VA 1U88A 2VM1A 2FWEA 4RI7A 4I2UA 3GTUA 3GTUB 3UBLA 1Z9HA 3QAGA 2OBKA 2K8SA 6GSXA 2VL2A 2CVDA 1XW9A 4YQMA 2NVLA 2ON7A 5AIVA 3GIXA 4IQAA 5J41A 1TP9A 1I9DA 2YPMA 2KP2A 1SYRA 4MPFA 4NXIA 4JR4A 2IWTA 4IVFA 4J2FA 5B6MA 5CAXA 1XWCA 2VCZA 3FR3A 2DMMA 2KHPA 1EV9A 1MD4A 4L0UA 2DIYA 4IP6A 3UIWA 4NV2A 3QAWA 2R4VA 4MJCA 3GL3A 4MZBA 2E7PA 1XFLA 3GKNA 2CVKA 3UVTA 4EF0A 1ST9A 2IMKA 4ACSA 2FWGA 2FWHA 3TKSC 2CQ9A 4IHUA 1OKTA 4IKHA 4HU7A 8GSSA 2LQQA 3IAS2 5D9TA 1AXDA 5J3RA 4FYUA 2VD1A 3QR6A 5IMCA 1OYJA 5HFKA 2VO4A 5IO0A 4KDYA 5A4VA 3U5RE 4I5QA 3F4TA 2AB6A 2GLRA 3GH9A 1AUCA 4K7OA 4FO5A 3FYGA 1GULA 1GSDA 4KCAA 2E2MA 3LXTA 1Q4JA 1TI1A 1ON4A 5G5EA 3FHKA 3J7Yb 3D4TA 4FIWA 5A4WA 3G7JA 1YF0A 1K0CA 4N0VA 1OAZA 4QL9A 1ERWA 5H5RA 1EGOA 4BA7A 3UVHA 4ISDA 1WPIA 3ZREA 4DVCA 5HQPA 1SKWB 4EXJA 2QC7A 3RHCA 1OE8A 2H8LA 4MZCA 3APOA 2K6VA 3G9BA 4ECJA 3TJGA 1ILOA 1BEDA 1XIYA 2KLXA 1T4YA 4XS1A 3GSTA 5INYA 2VL9A 3IDVA 11GSA 3KJYA 1HNBA 2REMA 4NHZA 4DSQA 4NHWA 2LTKA 4Z7XA 4PNGA 3NZNA 3CXGA 3WD6A 3M0FA 1JHBA 1TRVA 3GKMA 4GWRA 2IFQA 2IFQB 2RIIA 3DVXA 3RBTA 1M2BA 2YCDA 5JCUA 1U87A 5D73A 2CA8A 2H0IA 4PUFC 1PGTA 4KB3A 3ZRDA 2PUKC 4MH2A 2HFDA 2DJJA 3CSJA 3RPNA 3R2QA 3CTGA 1KNGA 3TKPA 3HYPA 4V1Ag 3TKSE 1QFNA 2GSSA 2LUSA 3EYTA 2I1UA 1X5EA 2LNTA 1OC9A 1OC9B 4KSMA 2ES7A 4MA9A 1IYHA 4PXOA 1SL1B 4J56E 2LQOA 2PU9C 4KA0A 2ON5A 4PURA 3ISOA 3QCPA 2HRNA 4N10A 1YEXA 2DIZA 1R7HA 2YZUA 5IMVA 1YEPA 2O89A 3TOTA 3ZIVA 2AV4A 1HNAA 2VCWA 2I9HA 4K7NA 3UEMA 2L5OA 1F6MC 2NTOA 4OFMA 4MJEA 2O8VB 3F63A 2B7JA 2YV9A 1R26A 2AAWA 4HU9A 1SU9A 4ECIA 1EZKA 3ZMKA 1ZZYA 4FH8A 2V2GA 4E8EA 1V98A 1FVJA 4DEJA 4MMMA 2L59A 4TR0A 1PQNA 1ZGNA 3H8QA 5IMAA 1V40A 4ML1A 3KH7A 4MK3A 1E2YA 2GZYA 1HQOA 2MMNA 2VL2C 1FAAA 3WGDA 3TRQA 4JU5A 2H6YA 3WGEA 5J4UA 4XRAA 2YOIA 1BJXA 4ILFA 4HS1A 4MP4A 4HZ2A 3IA1A 1F3AA 1ZYEA 3ZIJA 3GUSA 3HKRA 1A24A 2LRTA 1BG5A 3HXSA 3APSA 2L5LA 1XVQA 4G19A 1K0MA 2DBCA 1JZRA 2J23A 3LGCA 4CDOA 4XHMA 5LD0A 1WP0A 1SL0B 3ZVJA 3HVXA 1EP7A 1VF3A 4TKYA 2RLIA 1FOVA 3UL3A 2R3XA 5HR3A 1M9AA 4HUAA 2C3NA 4BWQA 3UJ1A 3DEXA 3D5JA 1NM3A 4ZB6A 3VI5A 5L71A 2BJXA 5D8IA 5B6NA 5HR0A 4G9HA 3O76A 2QSIA 5D9XA 3ED3A 4OFTA 3J7Yk 1MEKA 1C72A 2VIMA 1TRSA 3ZFBA 2GTUA 1AQWA 3O3TA 3WGXA 3QMXA 2OE3A 5G30A 5C00A 2O7KA 2IN3A 3VFIA 5DQSA 1OE7A 1O85A 4JBBA 3LJRA 3TOUA 4ZIJA 1X9MB 1PKZA 1URMA 2CX3A 3ZZXA 1LBKA 2G0FA 4PQIA 2OJLA 1GUMA 3H1NA 4X43A 3DVWA 4KW6A 5ECKB 1AAZA 2PGTA 2JZSA 1UVZA 2MMZA 4ZBAA 3BBYA 4O92A 4L5LA 4ZL7A 4TVEA 3TJFA 3KP9A 5KN3A 3RAZA 2JACA 4IW9A 5KN0A 4XTSA 2IMEA 4EDYA 4KX4A 2M80A 2XPDA 4OO5A 1J0FA 3TJJA 2EIOA 3IXRA 4LLRA 3IK9A 2VUPA 4ZL9A 1JFUA 2GDRA 4JE1A 4GRFA 5GAPD 3HJOA 2GQLA 4HZ4A 1RQMA 2O85A 5LNKe 2I81A 3WYWA 4F0CA 4L8EA 3LFLA 2YN1A 1J08A 2A2RA 4N0ZA 1OC8A 2B5EA 2DC5A 1KTEA 3JCML 2H66A 5JWOB 5IPGA 4V2LA 2ZCTA 1JZDA 2RUFA 1PL2A 4MZWA 5F06A 4TR1A 1S3AA 2OACA 4HDEA 3D0ZA 4LL1B 1V57A 1QMVA 1WJKA 1MDKA 5EL8A 4Q5NA 2HZFA 2V1MA 4EUYA 5D96A 2F51A 1T00A 3KMOA 2DJ0A 1M0UA 1A8LA 4HJ2A 5IPHA 2B3SA 3FEUA 1YQ1A 2XBQA 4HQZA 3A2XA 5JCWA 4N30A 1GWCA 3ZYWA 3EU4A 2VCXA 1OKDA 1MD3A 1NSWA 2B7KA 3L9SA 2AUVA 3D22A 2JL4A 2FGXA 5IOWA 1FHEA 5J9BA 1O8WA 4GSSA 2C0GA 1MDJA 3C1RA 2K9FA 3H93A 4MJBA 1WE0A 3VLNA 4OO4A 4XS6A 3IHQA 2YANA 4KGIA 4EL1A 5ECLB 2GSTA 3KEBA 2YNXA 1TRUA 2OE0A 1OC3A 2B1LA 1TRWA 3D21A 3L9UA 3UOMA 2EC4A 1TK5B 4PQHA 4RQXA 5AN1A 2N5BA 3I43A 1VRSD 1T7PB 4K1FA 5DALB 5DALA 2AHEA 5G1LA 1TKDB 4NPBA 1XOBA 20GSA 3KCMA 4GTUA 1K3YA 1SKSB 2G2QA 5EPFA 2OE1A 5F0GA 3VK9A 2E2GA 2B5XA 3IK7A 1GRXA 2GVPA 3Q6OA 1THOA 4TR3A 2H6ZA 3DXBA 4ZILA 2GSQA 2GSRA 3H4KA 18GSA 2HT9A 3HJPA 4O5RA 5AIXA 2YWOA 3QFBC 4O32A 1X0RA 2L4CA 3EU3A 1VF1A 4DSRA 2WJUA 2X8GA 2JZRA 1J9BA 5G31A 2QKEA 2I3YA 2GQMA 2MBSA 2VOCA 1BQ7A 1CQGA 2H71A 3EVIA 1G0TA 3KXOA 4POMA 1A23A 2L6CA 3QD9A 1N8JA 3EC3A 2V41A 2HE3A 2WULA 5CO3A 2I4AA 3U6VA 3UARA 1GSSA 3LXZA 5IM9A 3CSHA 1DSBA 3IR4A 4PX1A 4TRXA 1B48A 1PA3A 5DCGA 4QL7A 3ERFA 4IQ1A 1GSQA 5DVBA 1WIKA 2VL3A 4X1UA 1UC7A 2XPEA 3CMIA 4GQFA 3FW2A 1Z3EA 1U6TA 1E6BA 2VM2A 1F37A 2FA8A 3KD0A 1V9WA 2IMDA 5FHIA 2CAQA 2VD0A 4BVXA 5J9CA 4IJIA 1XXUA 2YV7A 4MF6A 1JLVA 2Z9SA 3A5WA 5GZZB 1XOAA 3SWLA 3GX0A 2PBJA 4OMVA 5JWQB 3E9JB 4F03A 4WR5A 3FK8A 4YAVA 4TR4A 4RQRA 2LSTA 3KZQA 4MLYA 2LS5A 5C04A 4WKWA 3E3EA 1GSFA 3MNGA 4I97A 4AGSA 3QOUA 5ID2A 5ID2B 1M99A 1Z6NA 1O8XA 4G2EA 2V32A 4GQCA 3E0UA 1VGLA 3D6IA 2R37A 2IPAA 3PINA 3IPZA 3OR5A 3P8WA 14GSA 3QAVA 1M9BA 2XC2A 6GSUA 3GRXA 3L0HA 4PUAA 3L4NA 4JEDA 2EIQA 2P5RA 2XHFA 1X5CA 3FZAA 3TUEA 2AYTA 4POKA 2LJKA 1TTZA 3VWXA 2CZ3A 1T8EB 4MJAA 4WXTA 5CRHA 1GTBA 1AQXA 1AIUA 2H74A 2H0GA 2LEGA 2VAFA 3O6TA 5H5QA 2IMIA 4TXOA 4TXOB 5D93A 2RM6A 5F07A 1M2AA 2GQKA 5ECRB 1TU8A 5E59A 2CT6A 4TOPA 1WMJA 1QXHA 3GSSA 1SK1A 1V58A 2ZUPA 3EMXA 2PERA 2DJ2A 5DAKB 2HZEA 2HZEB 2MMOA 4IS0A 7GSSA 5ENUA 1XWAA 1QUWA 1SD9A 4K7IA 4WBRD 4NWYA 3EMPA 1XW5A 4XIHA 4ULXA 3V1WA 3F9UA 4V1Ap 3BCIA 4I8BA 5CYYA 5GSSA 1XWBA 4DSSB 4DSSA 2L4QA 4EO3A 3AY8A 5ECMB 2CV4A 5GAND 2C1YA 2CX4A 2H76A 2H75A 2C3TA 1U3AA 2NDOA 2PWJA 1TW9A 1SL2B 1G7OA 5CREA 4AJ6A 4WF5A 5CNWA 4BWSA 2H1DA 4CHSA 1TI3A 3N5OA 1UA5A 3VPQA 2VLVA 3HVVA 4JZQA 2FWFA 4F2IA 4EKZA 1H75A 3VWUA 5F8BA 2C0EA 1SJIA 1THXA 3GURA 4ZBBA 1YKAA 2GT5A 2HSYA 2WRTA 2C8UA 4OWYA 1RW1A 2IJYA 2N5AA 4J57E 3GYKA 5G5FA 2H0HA 1EOHA 3CYNA 2MYGA 4OFNA 2H73A 3DMLA 2PN8A 5ECHB 3DYRA 2WDUA 3HY2A 2A4VA 4BPYA 1GUHA 1MDIA 1QK8A 4GSTA 1S3DA 1PN9A 3RHBA 22GSA 1SK2A 6GSWA 2NBSA 3M9JA 1FB6A 2IL3A 2B5YA 3US3A 1ERTA 2KP1A 4HI7A 2VLTA 2LJRA 1QQ2A 1ZOFA 3C1SA 1PKWA 2A2SA 3D4MA 4TW5A 2VCVA 4IGJA 2WS2A 4NAXA 1SKRB 3FRCA 2EIRA 3ZLPA 3GA4A 1A2JA 5B7CA 4RI6A 3L9VA 3EURA 5KN2A 4WBJA 3DD3A 5DJLA 4BL7A 1B9XC 1YZXA 4EE0A 2P5QA 5IQYA 1AQVA 1MTCA 3KTLA 1KEBA 1AW9A 1FG4A 5ECQB 2LV3A 2LKUA 4KUNA 2HRFA 3IAM2 4F9ZA 4N11A 1G6YA 2VCTA 2WGRA 4FYBA 2J9HA 3F6FA 4YQUA 3LQ7A 19GSA 2RM5A 1BAYA 1F9MA 3PGTA 4HEA2 2P0GA 1K0NA 1ZMAA 2LRCA 3TGZA 5ECNB 4IJ3A 3GKKA 1Y6EA 2HLSA 1SD8A 2LRNA 1FVKA 2PVOC 4ZL8A 1EWXA 4GXZA 1B8XA 3GFKA 1EGRA 1YY7A 4LMWA 1ERVA 3LYKA 3CSIA 1USBA 3UAPA 1W89A 3WT2A 1PD21 2DSAA 3CTFA 3GL5A 4LL4B 4MABA 4ML6A 3NOFA 4HQSA 2YP6A 4KDXA 3CBUA 2C3QA 2H70A 1WOUA 4Q5FA 4MF5A 6GSTA 1R4WA 4MCUA 2OBIA 4WF4A 1TK0B 1FB0A 1F2EA 2R5GA 3APQA 3L78A 1GUKA 2P31A 1XWKA 4ECBA 3G7YA 5IMDA 3HDCA 3DWVA 2QGVA 4LA1A 1YF1A 5A5KA 5ECOB 3VWWA 3ZVJD 1Z7RA 1A8YA 1K0DA 4X0XA 3I69A 1T3BA 3TDGA 1W4VA 4MH3A 4ZBDA 2V6KA 3IC4A 3RPPA 3F6DA 4V2MA 4G10A 1B9YC 4AJ7A 1PL1A 3EINA 4ECCA 1CQHA 4YAPA 3LG6A 1AC1A 1GSUA 5D9WA 2HXKA 3GKXA 1JLWA 5ABRA 2B6MA 4L5OA 3F0IA 4GSNA 6GSVA 4XRDA 3W8SA 1JZWA 5CRDA 1PX7A 2KOKA 4ZB9A 3W8JA 2H01A 3P7XA 3FR6A 2LJAA 3BOAA 1R5PA 4YH2A 4AF2A 3KIJA 1Q98A 5IIZA 1SJZA 2K18A 1G6WA 1TK8B 3F3RA 4KCEA 4ZXGA 4F82A 1GP1A 1N2AA 1GLQA 3EWLA 3TKRA 5FWGA 2MMAA 3WT1A 1ACVA 2FUG2 2R6KA 1EV4A 3BCKA 3VPTA 3C8EA 3H79A 5HFGA 4I6XA 3EE2A 5KN1A 1SYXA 4K2DA 12GSA 4WEYA 4IBPA 4E8HA 3DRNA 3Q74A 4K0GA 3DGQA 5E4WA 5ELGA 1SJ6A 2DLXA 3SBCA 3HD5A 1WWJA 4KSOA 2H30A 3C71A 4GCIA 1PX6A 3M1GA 2L6DA 2GS3A 2ALBA 2V6OA 2C0DA 3ERWA 1S3CA 1YDKA 3HA9A 5G1KA 3QDNA 2WB9A 4O7HA 5DCHA 3VURA 4K8MA 5IMZA 2YWMA 6GSSA 4K9ZA 3TRPA 3KGKA 3HCZA 3I6AA 6GSYA 4EDZA 2BTOT 3TCOA 1T1VA 5JCGA 3A2VA 2YZHA 3GN3A 5DJMA 1GTUA 1O73A 3Q19A 3IV4A 2JADA 3CRTA 2N5FA 3A3TA 4MPGA 1DBYA 1EOGA 5EVOA 3ZFLA 5B8BA 2DJ1A 2KUCA 3S9FA 4F0BA 1O7UA 5EY6A 3HZ8A 2MBTA 4FYCA 2CZ2A 2OA7A 5CRGA 5ECIB 2YWIA 1ABAA 3ZITA 5GSTA 4K6XA 1FO5A 3I9V2 2TIRA 1NW2A 1TDIA 1DE2A 1VF2A 4D73A 4D73B 5DDLA 9GSSA 1XCCA 3C7MA 1V2AA 3F8UA 2PPTA 4KE3A 2ZNMA 5A4UA 1TJDA 1Z7PA 3FR9A 3F4SA 5LCZA 2IMFA 1O81A 3TKQA 1XVWA 5F05A 2B1KA 3K8NA 2WCIA 2H1BA 5AGYA 4YQVA 1SENA 5ELAA 4Q5RA 2H6XA 5G2ZA 1K3LA 2YJHA 2M72A 5KEJA 1M7TA 3FZ9A 2X8CA 4IP1A 2H19A 2FA4A 2VLUA 4GF0A 1KBNA 3UMAA 2NPBA 5FT3A 2O87A 4L0WA 3M3MA 4XS4A 4XS4B 1XWGA 1GTIA 3P2AA 3TRXA 5ECPB 3P90A 1GNWA 3F3QA 2F9SA 4PQ1A 4IELA 1GSYA 3HJMA 2FD3A 5DAKA 1GLPA 2X8HA 2LNSA 3KM6A 3LWAA 3GMFA 1HYUA 1B4PA 4WR4A 16GSA 1DE1A 1Z6MA 1LJRA 4NV5A 1A0FA 2L57A 3KTBA 5DBQA 4LMVA 1ML6A 1H4OA 1ZL9A 17GSA 4K0NA 3IRAA 2F8AA 2F3MA 3MAKA 4KNDA 4POLA 4JR6A 4EC0A 5JWRB 1K0OA 1K0AA 1T4ZA 2FHEA 3RDWA 2AJQB 1EEJA 1A0RP 4V2NA 4ZB8A 2GZPA 3IBHA 5CP1A 4OCFA 2CAIA 1K0BA 3DKSA 2PMTA 10GSA 3ME8A 3C73A 3TJBA 3GX8A 1WRYA 2IIYA 3GH6A 1HD2A 1X9WB 3PH9A 1NHYA 1OVNA 1BYEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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