4XS4B

Salmonella typhimurium ahpc c165s mutant
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
186
structure length
185
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPAKWKEGEATLAPSLDLVGKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus 56
structure length 185
sequence length 186
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
B PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs4B00
1U3IA 2JADA 1SD8A 1OKDA 2CZ3A 3UARA 3KH9A 1J0FA 4OFTA 1XBSA 3IBHA 2R4VA 4HJ2A 2DJJA 4L5OA 2B3SA 1ZYQB 3LXTA 4MF6A 3HVVA 2GQKA 4DSRA 3FK8A 3IPZA 10GSA 4J57E 4Q5QA 3GX0A 3EWLA 5IMZA 4RQRA 4ML6A 3C71A 3IK7A 11GSA 1JZRA 1XVQA 4IS0A 4ZB6A 5JWOB 3PH9A 5AGYA 1T1VA 2CX4A 3VLNA 1ERTA 1BJXA 2RLIA 1A0RP 1X9MB 3UVHA 4TXOA 2IMFA 2X64A 4XIHA 5AISA 3D4MA 4D73A 1EZKA 3CYNA 4G19A 2H76A 1J08A 4F82A 2LUSA 1J9BA 3BJ5A 3VFIA 5B8BA 3CMIA 3IAM2 1B8XA 2C1YA 2VAFA 3C1SA 2VL2A 4MLYA 4V1Ap 1SJ6A 18GSA 2WZ9A 1JLWA 3FZAA 5L71A 3UBKA 5ECHB 2H0HA 4KCAA 2IFQA 4KNDA 5INYA 2MMAA 4PQIA 3LORA 1FVJA 2R37A 2B6MA 2OADA 2YV9A 3LQ7A 2FCHA 3Q74A 5ECPB 4JZQA 5A4WA 2IPAA 3FW2A 4EDZA 4IJ3A 3HD5A 4NHZA 2E7PA 1XWCA 3L78A 4AJ6A 4HUAA 4OO5A 13GSA 2XBIA 2LRCA 2ZUPA 2IN3A 2IMDA 3FHKA 2BJXA 2C3TA 4J2FA 3NOFA 5J4UA 5F06A 1W4VA 3G9BA 4V2LA 2GVPA 3W8JA 5B8AA 5IO2A 3UOMA 2OA7A 1WRYA 3F4TA 3L9VA 4TN8A 4Q5RA 4QQ7A 1BQ7A 4BA7A 3H93A 3IRAA 3AY8A 1T8EB 4OCFA 2GSRA 2VO4A 2DJ0A 2X8CA 1M9AA 3LYKA 5G1LA 2HSYA 4F9ZA 2VCVA 3LG6A 3CBUA 5CRWA 1M7TA 1XFLA 2TRCP 2DJ1A 3HXSA 2I3YA 3QDNA 1G6YA 4DSQA 1OC9A 2KUCA 2E2GA 3QD9A 1PL1A 1SK2A 3DD3A 2FY6A 2AJQB 1VF1A 3TRQA 5A4VA 1PKWA 5G5EA 1T4ZA 2BMXA 2P5RA 6GSUA 3BOAA 1GTIA 3WT2A 2AAWA 2E2MA 3HYPA 2C80A 1NW2A 1MD4A 2DJKA 8GSSA 1TK8B 2K9FA 9GSSA 5JCGA 3HJOA 1AQWA 1GSSA 3S9FA 1K0AA 5FT3A 3ZREA 3ZMKA 4IQ1A 2K8SA 3IXRA 1AW9A 2YCDA 2ES7A 1EP8A 3KD0A 1EGRA 1AXDA 5F0GA 3UIWA 4PURA 2OBIA 3RHBA 1LU4A 2FNOA 1BX9A 5ELGA 2EIQA 3HZ8A 5D93A 4ZILA 2D2ZA 1WIKA 1K0DA 1N2AA 5LCZA 3US3A 2PUKC 3F63A 1XZOA 4IP6A 2LNSA 4POKA 1RK4A 2C0FA 1PRXA 5J5NA 2JZRA 2WS2A 4HQZA 2HZEB 1KBNA 4JRRA 4OO4A 3TCOA 1GSYA 4G2EA 1EEMA 2R3XA 3TOTA 1UN2A 1V40A 5DDLA 1K0CA 4E8HA 3EU3A 1ST9A 2VL3A 2JZSA 4XS4A 1ACVA 2CAIA 1SKWB 4MPGA 2C3QA 3ZYWA 4WBRD 4FH8A 5E59A 4GQCA 1F3BA 2PGTA 4F0BA 3UAPA 4EXJA 2MMZA 1V9WA 2NVLA 12GSA 1MDIA 4POBA 1F2EA 2L4CA 2F8AA 1K0BA 1Y25A 1A0FA 2FWGA 4HS1A 5DALB 3HJPA 5DCHA 5G30A 4L0WA 4EKZA 4FYCA 3TKSE 1HNBA 1S3AA 1XW9A 5ID2B 4IW9A 1KNGA 2I81A 3L9SA 2MYGA 2NPBA 2H01A 3VPTA 1U6TA 2O87A 4N0ZA 3KIJA 3P8WA 1A2MA 1FO5A 3MWHA 5D9WA 3RPPA 1Q98A 1O8XA 1LJRA 1XWAA 3KEBA 2GT5A 3G7JA 3OR5A 3DRNA 2L6CA 2H72A 1TRUA 1XCCA 3ZZXA 1JZWA 2AHEA 4WETA 1TOFA 1GULA 4PX1A 4BPYA 2ZCTA 3W6GA 1O81A 4WXTA 2JU5A 4WR5A 2GSQA 4LMWA 2JSZA 4BWSA 3F8UA 4OFNA 4IN0A 4PQHA 1SKRB 2VCQA 2B7JA 2B1LA 1K0OA 4XS6A 1VRSD 1B9XC 4DSSA 1HYUA 3TJGA 1URMA 3ED3A 2NBSA 4MDCA 3E3EA 3TRPA 2DMMA 4KDYA 4QL7A 1DSBA 5CRGA 1WMJA 3RAZA 5H5RA 4KA0A 1FG4A 4DSSB 1GTUA 4HOJA 4IBPA 2A2SA 3MSZA 4V2MA 1CQGA 5CRDA 5HQPA 1R5AA 1O73A 4ULXA 3TKSA 1RQMA 4I8BA 4LL4B 5GAPD 1KEBA 2J9HA 3F6DA 1OC3A 3QMXA 2YN1A 1ZGNA 1ZL9A 3QPMA 2GGTA 2L59A 1G6WA 1MDKA 1PX6A 3H8QA 4YAVA 1M99A 4ACSA 4ZBDA 3FZ9A 4RI6A 4FO5A 4I6XA 3VI5A 1OYJA 5KN3A 4KCEA 4O7HA 3P2AA 2MMOA 2GZPA 2IMEA 1I9DA 4HQSA 2IJYA 2O8VB 1MDJA 1M0UA 5IMVA 2YPMA 3HCZA 2HZFA 1OE7A 5FHIA 6GSYA 3C8EA 1MTCA 2MZCA 2LSTA 3GRXA 1F6MC 1GNWA 3HZ4A 3LEFA 4K0GA 1GTAA 3KP9A 1BYEA 3D4TA 4TR3A 3DGQA 4PGTA 4ZL8A 1USBA 2KLXA 1JZDA 1Z7RA 2OE0A 4POLA 1THXA 5F07A 3P90A 4POMA 4K8MA 1SYXA 2LJRA 5IOXA 22GSA 2L4QA 2LRNA 2IL3A 2WRTA 2VM2A 1V57A 1HQOA 3ZLPA 4ISDA 5HFGA 2CVBA 4IGJA 3FR6A 2LRTA 3F0IA 4HZ4A 4YQUA 3ZVJA 2AV4A 4MJCA 4XCSA 3GTUA 1TRSA 3R2QA 2IMKA 3A2XA 1SJZA 4F0CA 1SENA 3VWVA 6GSSA 3GKMA 1G0TA 5CNWA 2LQOA 4KE3A 1I5GA 3GTUB 5HR2A 3GSTA 3GH9A 3LFLA 4GCIA 5A5KA 2PU9C 3ZRDA 5HR3A 4PQ1A 3P7XA 4V1Ag 1TDIA 1BAYA 1YF1A 4X0XA 4WF5A 5JCWA 1UVZA 3DIEA 3FR9A 2IIYA 2FGXA 3IAS2 1FB0A 3WD6A 4BL7A 3TJKA 4YH2A 3GUSA 3LGCA 5DBQA 2HXKA 5KEJA 5J3RA 4GF0A 5KN2A 1EP7A 1ZCPA 3Q19A 4TXOB 1QFNA 2YNXA 2JZTA 2FWFA 2VD1A 2OE3A 2WDUA 1PKZA 1PQNA 3NZNA 3KH7A 4D73B 1GP1A 5G31A 4OCEA 3HDCA 4MF7A 2PBJA 3TKRA 1B48A 2YZHA 5HR1A 2TRXA 1SYRA 1W89A 1PN9A 5ELAA 1A2JA 1DE1A 4IELA 5CO3A 2EC4A 2PWJA 3M0FA 3EE2A 2GSSA 2IFQB 4TVEA 1XWGA 3KMNA 2N5BA 3APQA 5KN1A 2VUPA 2HRFA 3GKKA 2V41A 3DEXA 5IMAA 5GSTA 4KDXA 3J7Yk 1T4YA 4MZCA 1BG5A 2JL4A 3QR6A 3DYRA 3KXOA 5C00A 4N0VA 2L5LA 3KMOA 3LYPA 2H66A 3A3TA 1GLPA 1TI1A 2DSAA 1THOA 1EWXA 4NMUA 2YWMA 1HNCA 2F8FA 5LNKe 4JBBA 5DAKA 1XWBA 1OVNA 1R4WA 1YEPA 1JZOA 3IE3A 3GX8A 2F51A 3E9JB 3FZ5A 1HD2A 2R6KA 1DE2A 5DAKB 1YZXA 2VL2C 4TR1A 1TK5B 3EMXA 1TW9A 4EE0A 4IVFA 4RUVA 4PNFA 3EMPA 5GAND 3SBCA 3Q18A 4ID0A 3L9UA 2H1BA 4GSSA 2H6YA 1EV9A 3HVSA 3V1WA 4TR1B 1M2AA 1ZOFA 1OC9B 2NDOA 2H6XA 4ZB8A 1H75A 1GNEA 5IO0A 3ZIVA 3HVXA 2LS5A 1EOHA 3TOUA 2FA4A 3DVWA 2YV7A 5IMFA 4OFMA 4O92A 4HEA2 2WJUA 1XPVA 2JSYA 2VD0A 2XPDA 3UBLA 3LJRA 4KSOA 2J23A 1ERWA 2LJAA 5ECMB 2LJKA 1QK8A 4GWRA 1WPIA 4BVXA 4N30A 3WYWA 2LV3A 2P0GA 3M3MA 3VURA 5J9BA 4GTUA 2AB6A 5CAXA 1S3DA 5DQSA 3GURA 3GMFA 4KDUA 1PL2A 3D22A 5IIZA 1K3OA 2ALBA 2LKUA 2REMA 1XXUA 1Y6EA 3UMAA 1XW5A 5ECNB 4RI7A 2XPEA 2E0QA 4IP1A 1PMTA 4CW9A 1XVWA 6GSTA 4MMMA 2GQMA 4N10A 3RDWA 4ZBBA 4ZL9A 5EL8A 4WEYA 5DQYA 5G1KA 4GLTA 4P3YB 2CAQA 3WT1A 1FOVA 3D21A 4YQVA 5AN1A 2CX3A 3GIXA 4GQFA 3PINA 3ERGA 2N5FA 4NHWA 2GT6A 4NPBA 4RQXA 3GL5A 1NSWA 2H0GA 1FVKA 1SL2B 4YAPA 2H0IA 2WCIA 2X8HA 2HFDA 2F3MA 4JEDA 4HDEA 2KP1A 1M9BA 4XS4B 2M46A 2PN8A 6GSXA 2DBCA 2H8LA 3QFBC 2H70A 1F9MA 1UC7A 1AQXA 5IMCA 3TB2A 5D9TA 4KW6A 2XC2A 1NHYA 1TKDB 1V98A 2VLVA 1RW1A 3EU4A 4Q5NA 4WR4A 3TDGA 3FY7A 3CSHA 2EIOA 4JE1A 4LA1A 4K7IA 1A8YA 2FWEA 2RM6A 3GHAA 2ZNMA 2N5AA 3KP8A 1M2BA 4O5RA 1FB6A 1H4OA 5ECRB 4GXZA 1HNAA 2H71A 5JWQB 4XS1A 5KN0A 5A4UA 4O32A 3APSA 3HKRA 1WJKA 4K2DA 2AYTA 1MEKA 3D6IA 4ECJA 1TU7A 1R5PA 3TJBA 2G0FA 3KJYA 5ECOB 3FKFA 3IA1A 1A8LA 5COHA 1A23A 4WF4A 1X9WB 2C0EA 2C4JA 3KCMA 3QAWA 2YWIA 3FEUA 1U87A 1SL0B 2YOIA 5G2ZA 4WBJA 4ECIA 3BBYA 3ERFA 3ZFLA 4I97A 1QUWA 2LEGA 4OD7A 2I4AA 3GN3A 1SJIA 4KAEA 5D73A 1Z6NA 2V6KA 1OC8A 2YZUA 5FWGA 2DMLA 1WOUA 2Z9SA 3BD2A 4AJ8A 1GUKA 1GTBA 1ILOA 4K1FA 5DJLA 1QXHA 2AUVA 4FYBA 5DJMA 3GNJA 3KM6A 4MP4A 1V2AA 3N9JA 3CXGA 4OWYA 1YKAA 4K6XA 1UA5A 3J7Yb 2RIIA 2YJ7A 1NM3A 2V32A 2H6ZA 2H75A 4MPFA 2BTOT 1O6JA 1ON4A 1YJ6A 4MJAA 1K3LA 1YY7A 1EV4A 3IOSA 2LQQA 3TKPA 1Z3EA 2XBQA 1K0NA 2V2GA 4I2UA 3O6TA 1OE8A 5G5FA 5HFIA 2VOCA 5CREA 3CSJA 2B5XA 1IYIA 3C1RA 4V2NA 1R26A 1C72A 1AUCA 3HA9A 1CQHA 5CRHA 4X1UA 5LD0A 2O89A 3CTGA 1SD9A 5B6NA 5D9XA 3F9UA 3PGTA 3PR8A 20GSA 2IWTA 4EF0A 5GZZB 2GS3A 2MBTA 4TR4A 3M9JA 1X5DA 4EVMA 4K7OA 4IJIA 2GTUA 3C73A 1E6BA 1QQ2A 4N11A 4HJMA 1E2YA 2KP2A 1XW6A 1Z7PA 2VCZA 3D0ZA 1AIUA 4WKWA 3TKSC 3I6AA 3MAKA 5IPHA 5IMDA 4LL1B 3G7IA 2CZ2A 3GV1A 3UJ1A 2EIRA 1DUGA 5ECKB 3ZL5A 2DIYA 3L4NA 4TKYA 5F05A 4MJEA 1AQVA 3CSIA 5J9CA 1YF0A 3Q6OA 4MF5A 4PXOA 4EC0A 4KSMA 2IMIA 4LLRA 1B4QA 2C0DA 3ME8A 3W8SA 1G7OA 3GKXA 3VK9A 4ZIJA 1A2LA 4MK3A 2KHPA 3H4KA 3VWWA 1TTZA 3U6VA 4LMVA 4L0UA 4MJBA 2K8VA 1GSDA 4IKHA 4ECCA 4E8EA 1MD3A 3D5JA 4DVCA 2I9HA 5ECSA 4EO3A 5IQYA 2TIRA 3I9V2 2B1KA 2WFCA 3RBTA 2O85A 3JCML 1FW1A 4J56E 3F3QA 2L5OA 2CVDA 2HNLA 1F3AA 2HLSA 3FRCA 1ERUA 4KX4A 3GFKA 1TP9A 2H1GA 4TRXA 2DC5A 1XIYA 3IK9A 4F03A 3IR4A 1B9YC 1AAZA 5D8IA 4YQMA 3LSZA 1U3AA 1VF3A 5B6MA 4Z7XA 2I1UA 2V1MA 1OKTA 1GUMA 4HZ2A 5EY6A 4AF2A 3MDKA 2DIZA 1T3BA 1O85A 1GSFA 2L6DA 5IOWA 3VWUA 3VPQA 4FYUA 1ABAA 3KZQA 1TJDA 1PD21 2XHFA 4EL1A 2JACA 4TOPA 2YANA 2CV4A 4NAXA 2FUG2 2WULA 3EINA 2CT6A 1GH2A 3GA4A 5DVBA 2CA8A 1X0RA 1YKCA 3APOA 1OAZA 3VI7A 2QC7A 3F6FA 3RPNA 4L5LA 3DWVA 3DKSA 2OBKA 1S3CA 1V58A 3LXZA 1YQ1A 3VWXA 2DLXA 2OJLA 1TI3A 1JLVA 4MZWA 2RM5A 4G10A 2P31A 3L0HA 6GSWA 1GLQA 1GL8A 1GRXA 2YJHA 2A2RA 3M9KA 3KTLA 3MNGA 4AJ7A 1Q4JA 2G2QA 2VCWA 3KGKA 4BVYA 3F3RA 5JCUA 4JR6A 3ME7A 1K3YA 1SU9A 5J41A 2PVQA 4X43A 2PMTA 2H1AA 1FAAA 5D96A 3A5WA 1BEDA 2VCXA 2NTOA 2OACA 2ON7A 2LNTA 5F8BA 3GSSA 3ISOA 5AIXA 2MBSA 2H73A 2B5EA 1K0MA 1GUHA 3IC4A 1PX7A 4MCUA 3WGDA 4AGSA 1XOBA 3QCPA 2DJ2A 4PUFC 3QAVA 3QFAC 4NWYA 4ML1A 3WGXA 1DBYA 1F37A 4TW5A 5GSSA 3ZMLA 2VM1A 5ABRA 3BCIA 1B4PA 4NXIA 3CRTA 4ZBAA 14GSA 4OMVA 2H19A 2M80A 2L57A 2GZZA 17GSA 5H5QA 2OE1A 4FIWA 1N8JA 3A2WA 4ILFA 4IHUA 4XRAA 2HI7A 4HI7A 3EC3A 3GYKA 2HZEA 3TGZA 2VIMA 2P5QA 1JHBA 1X9SB 2B5YA 4NV5A 4Q5FA 3TRXA 4MH3A 2C8UA 3FZ4A 3TJJA 1ZMAA 1TU8A 1GSQA 2X8GA 1Z6MA 1U88A 3M1GA 2H74A 4BWQA 1FHEA 1Z5YE 1IYHA 2WB9A 2O7KA 3ZFBA 1VF4A 4ECBA 5DALA 2LTKA 3O76A 3F4RA 3FR3A 3M8NA 2VLUA 1ZZYA 2F9SA 2QGVA 4JU5A 4MZBA 2FD3A 3A2VA 19GSA 3E0UA 4EDYA 5ECIB 5E4WA 1QGVA 5ID2A 3ZITA 2V6OA 3CTFA 3I43A 2PVOC 3H1NA 3DXBA 4I5QA 2HRNA 1TXXA 3I69A 3HJMA 3WGEA 4MABA 1YEXA 1T00A 3IDVA 1WWJA 2HSHA 4KH7A 1M2DA 5AIVA 2RUFA 3U5RE 1T7PB 5ECQB 1PSQA 4MH2A 2PERA 4GSNA 1GSUA 3FYGA 1XWKA 3DMLA 3EURA 1ML6A 1R7HA 5IM9A 3F4SA 3ZTLA 3NIVA 3QAGA 3H79A 5ENUA 2FA8A 3TKQA 4PUAA 4ZXGA 3EYTA 3RHCA 5D9VA 5JWRB 4ZL7A 1O8WA 2C3NA 6GSVA 3HHVA 5DCGA 1EGOA 4EUYA 2VCTA 1EOGA 1AC1A 4XRDA 2FLSA 3SWLA 3ZIJA 2FWHA 2DJ3A 3TUEA 1NHOA 1JFUA 1GSEA 3UEMA 2CQ9A 4JR4A 3GL3A 4CDOA 4CHSA 5ECLB 1VF2A 4K0NA 5HR0A 2C0GA 4XHMA 5EPFA 2RUEA 1ZYEA 1LBKA 2ON5A 4TR0A 2YWOA 1SKSB 1X5EA 3GH6A 3N5OA 1G7EA 3ERWA 4L8EA 1SL1B 4GSTA 2R5GA 3KTBA 1VGLA 4KGIA 2B7KA 2PPTA 5EVOA 3QOUA 3BCKA 2K18A 1YDKA 4MA9A 1Z9HA 2YP6A 2X99A 4QL9A 4XTSA 3K8NA 3CRUA 4HU9A 2A4VA 3DVXA 4HU7A 2GLRA 4IQAA 4ZB9A 1A24A 4KB3A 4PNGA 4TXVA 3UL3A 1EEJA 5HFKA 3LWAA 4K9ZA 1WP0A 7GSSA 2GZYA 16GSA 1GWCA 3IHQA 1TRWA 2H1DA 4I2TA 3EVIA 2YWNA 3ZVJD 1SK0A 3HY2A 5H5SA 3O3TA 2QKEA 3G7YA 1QMVA 4H86A 4KUNA 3IV4A 1PGTA 1WE0A 1O7UA 2R2JA 2GQLA 2FHEA 2M72A 5C04A 4DEJA 2KOKA 2H30A 1ERVA 2WGRA 5CYYA 1TK0B 2GDRA 2VL9A 1PA3A 3TJFA 5IPGA 1XOAA 1TRVA 2QSIA 4K7NA 4NV2A 2HYXA 1X5CA 5CP1A 3GKNA 2HE3A 2HT9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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