4XS4B

Salmonella typhimurium ahpc c165s mutant
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
186
structure length
185
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPAKWKEGEATLAPSLDLVGKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 56
structure length 185
sequence length 186
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
B PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs4B00
3IK9A 4KSOA 4JRRA 2N5AA 2LSTA 3CRUA 1OKTA 3C8EA 2B1KA 4WR4A 4I6XA 2GSQA 1O81A 2GS3A 3PGTA 2CAQA 5DDLA 2H0GA 3M8NA 2DJ1A 3TOUA 4I97A 2MYGA 4BL7A 3US3A 1BQ7A 3L9VA 3KTBA 4KB3A 4WBJA 1WE0A 1YKCA 3GX8A 2O87A 1EEMA 5GAPD 1Z5YE 1V40A 1K0NA 1BAYA 1FVJA 2K6VA 3HJMA 3LWAA 1G7EA 1MEKA 1ERTA 2VIMA 2FCHA 2DC5A 4L5LA 5E59A 2H1BA 5CRDA 2HZEA 4MPFA 3N5OA 3LXZA 4ZB9A 3ISOA 2B3SA 1F9MA 2YCDA 1EOGA 1O6JA 1TK5B 5IM9A 22GSA 1A24A 1V57A 2YWNA 2NVLA 1X5EA 2YZUA 3C1SA 1K3YA 1JZOA 2H72A 1Z9HA 1B9XC 3LEFA 1H4OA 4K8MA 4Q5QA 5IMZA 2C8UA 2GZYA 5J5NA 2EIQA 1PX6A 1X5DA 4ISDA 3A5WA 2VM1A 4KCEA 5IMDA 1OYJA 5CAXA 2EIRA 1Z3EA 3ZMLA 3FK8A 1O85A 1F3AA 3IXRA 5HR2A 1AQVA 4MJBA 2YWOA 5AGYA 1E2YA 2WDUA 5D93A 4JU5A 3CSJA 3CBUA 1FW1A 6GSSA 1PMTA 2LNSA 3CYNA 3UL3A 1TI1A 4LL4B 1UN2A 2L5OA 4IJ3A 1YKAA 2AUVA 4TXOA 3NOFA 3ME8A 4DVCA 4PGTA 4NV5A 3TJKA 2JZSA 3C73A 2YJHA 5ECMB 1GUMA 4K7OA 1JZRA 4DSQA 5EY6A 6GSYA 3APOA 2B5YA 4JR4A 3GTUB 1GTIA 2A4VA 1A23A 4MDCA 4OD7A 3GV1A 1X9WB 1QUWA 3GL3A 4OMVA 3L4NA 3MNGA 3LFLA 2KUCA 1OC9A 1ERVA 1K0DA 2X8HA 4XRDA 5G5FA 5IO2A 3WYWA 3P2AA 4NHZA 3P7XA 1GTBA 2V1MA 1IYHA 3UVHA 3GTUA 2ZCTA 4BWQA 2CAIA 1A2MA 3ZMKA 4K2DA 3GFKA 1VRSD 5CRWA 4V2NA 3APSA 5AISA 4YQUA 1QQ2A 3M9JA 3UOMA 1GSQA 1S3CA 5ABRA 5ECRB 4HOJA 4WBRD 2I3YA 2YJ7A 5FHIA 1TP9A 3DIEA 1JZWA 4JBBA 4HU7A 4ZBDA 1AQWA 3GH9A 5G1KA 2G2QA 1OAZA 4EC0A 5G5EA 2P5QA 3UMAA 4MZBA 4GSNA 5KEJA 1HNAA 3GNJA 2GT6A 4FIWA 2H76A 2QSIA 5ENUA 4QL9A 1UVZA 1XPVA 1AQXA 4O5RA 4AJ7A 1VF3A 3GKXA 3ZRDA 1GTAA 4F0CA 5ECPB 1AUCA 3E0UA 5D9WA 4PNGA 2YANA 2F51A 2CZ3A 1SK0A 2R5GA 2H30A 1ZYEA 2KP1A 4EVMA 2VLVA 1F2EA 1S3AA 4TOPA 4PUAA 3TGZA 4MABA 1KBNA 3HA9A 2J9HA 3F6DA 2PVQA 1U3AA 3EE2A 5HR3A 1NSWA 3KMOA 3C71A 3GSTA 4AJ8A 8GSSA 2LQQA 1XVWA 5AIXA 3TRXA 5DCHA 1GSSA 1ZZYA 3ZITA 3HVVA 1A8LA 3F6FA 3JCML 1FO5A 2IWTA 5INYA 3GMFA 4E8EA 4EE0A 4MMMA 1SKWB 3IK7A 1ILOA 1V98A 4TRXA 1MTCA 5DQSA 2LNTA 4XRAA 5AIVA 3HD5A 4EO3A 3TCOA 3F4RA 2IFQB 1F3BA 4KGIA 4HZ4A 1TRWA 3RAZA 4V2LA 2HSHA 1Q4JA 3EC3A 1GULA 2YWMA 3UBLA 1GSUA 1Y25A 4HZ2A 5B6MA 5DJMA 2JSZA 1ZOFA 2D2ZA 3QFBC 5HR1A 4NMUA 3K8NA 3D21A 2IFQA 4K9ZA 5CYYA 5GSSA 1JLWA 2IL3A 3CRTA 1B4QA 3CTGA 3LGCA 1PN9A 3KH7A 2HSYA 2P0GA 2B5XA 3LYPA 4K0NA 1B48A 5CRHA 5D8IA 4MK3A 1THXA 4XIHA 3LSZA 3W8JA 4HS1A 5JCUA 5DCGA 1GUKA 1Z6NA 4F9ZA 3C7MA 1TRVA 3H79A 2HRNA 2LRNA 3QAWA 1WIKA 3UEMA 4GQCA 1R4WA 3IOSA 3LYKA 2ZUPA 4TW5A 4WETA 1OVNA 4FO5A 4TR0A 1HD2A 1PGTA 4O32A 2OADA 3VI5A 1B4PA 1CQGA 3VURA 2N5BA 2A2RA 1ERWA 4AF2A 1OC3A 5LD0A 1X9MB 2VLUA 1MDJA 1SYXA 4J2FA 3WGDA 4TKYA 5A4VA 3U6VA 3HY2A 4I5QA 3CXGA 2O7KA 2QKEA 2M72A 2JACA 5CRGA 4IKHA 4NWYA 4K0GA 4MLYA 1X0RA 3ERWA 2K8SA 4BVYA 2IIYA 4WEYA 4F82A 4K1FA 2B1LA 3TRQA 2K8VA 3QMXA 4EDZA 2HE3A 3PH9A 1T4ZA 4WXTA 1QMVA 3R2QA 1YZXA 3KTLA 2DMMA 1GL8A 1BEDA 4MF6A 1BX9A 1N2AA 1VF4A 1URMA 3NZNA 1T7PB 4MZCA 1G0TA 3QCPA 4X1UA 1XFLA 1PL2A 2PUKC 4KCAA 4IGJA 1ML6A 2FWGA 3KMNA 2YV9A 4LL1B 2DBCA 4N0VA 2WJUA 1GNEA 3ED3A 3WT2A 5IMVA 3FZ9A 1XW9A 5LNKe 4QQ7A 1GLQA 1FB0A 5EL8A 2B5EA 1EP7A 1GTUA 3U5RE 3BJ5A 3ERFA 1TI3A 3ZREA 2H0HA 2H75A 1WP0A 4HDEA 3BCIA 1EV9A 3I69A 4ZXGA 2GSRA 2PGTA 1ABAA 2MMZA 4TN8A 2BJXA 4LLRA 2JL4A 1Z7PA 2CA8A 3J7Yb 2PBJA 3KZQA 3APQA 5IOWA 2J23A 1K3OA 1GWCA 3RHCA 3KM6A 3EINA 4FH8A 2H01A 2P31A 1M2BA 1MDKA 1T3BA 19GSA 1WOUA 2DJ3A 1IYIA 5KN3A 2IMEA 2H6ZA 3MDKA 2OJLA 3G7JA 3GHAA 5ID2B 1NHYA 4ZILA 4F03A 5D73A 5J41A 2X8GA 3GIXA 4NV2A 3O76A 4DSRA 4IW9A 4KDUA 3QD9A 3DYRA 3A2XA 1WMJA 3ZLPA 1W4VA 1ACVA 2QC7A 3WGXA 2TRXA 2PVOC 1KTEA 1R5PA 4GSSA 4L0WA 4PUFC 2GQMA 3FRCA 5ID2A 2HFDA 5DAKB 4HEA2 2NTOA 1OKDA 1O8XA 1K0CA 4P3YB 2C0EA 1I9DA 5IOXA 3HXSA 4HUAA 3TUEA 4GTUA 2FWHA 3DVWA 2X99A 1DUGA 2OA7A 2CZ2A 1Y6EA 2L6DA 1ZL9A 2E7PA 2GSSA 3F0IA 1EGOA 1AXDA 3PR8A 5L71A 3A2WA 4MF7A 1TXXA 4ZL9A 5JCWA 3GA4A 3IE3A 1TK0B 2VLTA 3KEBA 5KN2A 3VI7A 4V1Ap 2CVDA 2H66A 3EVIA 4PXOA 3DRNA 4PQHA 2FD3A 2C0FA 1ZYQB 4ULXA 2DLXA 2V6KA 1VF1A 2ON5A 5J4UA 4ECJA 4KNDA 3A3TA 3HJPA 4POMA 3H93A 2VCVA 2OKAA 3DVXA 5AN1A 1OC8A 3EU3A 4EF0A 3LORA 4FYCA 4JR6A 2BTOT 3DGQA 4O92A 2MBTA 5G2ZA 3P90A 2JADA 2GDRA 2WZ9A 4MH2A 4EDYA 2GQKA 5FWGA 4GSTA 4MJCA 3RBTA 5B7CA 4IP1A 2WFCA 2IJYA 4KDXA 1KEBA 3I43A 4GCIA 3G7IA 4GRFA 3KCMA 2XPEA 2IMFA 3TB2A 2PU9C 1A0FA 4Q5NA 2FUG2 4POLA 2C0DA 2EIOA 5HR0A 3TJGA 4IQAA 1TW9A 3KD0A 2VL3A 1X5CA 5B8BA 3FY7A 3D6IA 4NXIA 3V1WA 3AY8A 1GNWA 3BD2A 3M3MA 2WULA 3IAM2 2V6OA 1PL1A 2ON7A 2HI7A 1GP1A 5CO3A 2R2JA 2L5LA 3DWVA 2XBQA 2XPDA 2GQLA 2M46A 1TRSA 4NPBA 4HJ2A 5ECIB 3HZ8A 2CT6A 2PERA 3N9JA 3ZZXA 4ECBA 3L0HA 4CHSA 2YV7A 1DSBA 3F9UA 4KUNA 1M9BA 1HYUA 2I9HA 1V9WA 5IMFA 1M2AA 2F3MA 3Q74A 2KHPA 3M9KA 2HT9A 4OO4A 3TKSA 4JZQA 5ECKB 4MH3A 5G31A 2VD0A 4OCFA 2PMTA 2XC2A 2X8CA 2GVPA 3IBHA 4IELA 1SL0B 1PD21 3TRPA 2YPMA 1O8WA 3Q18A 2LV3A 3Q6OA 3IPZA 3EU4A 5C00A 3LXTA 2NBSA 1PX7A 2MMNA 5A5KA 4WR5A 3IR4A 4XHMA 4FYBA 1CQHA 2I4AA 3QDNA 3SBCA 3ZFBA 2LJRA 1G6WA 6GSVA 4K7NA 3DD3A 1MD4A 1YF0A 4OFTA 3E3EA 1QK8A 3IC4A 1GSEA 4N30A 2VAFA 4MF5A 1PKZA 1MD3A 4TVEA 3KIJA 4PQIA 4O7HA 3WD6A 2RLIA 2YNXA 1X9SB 5EPFA 3GRXA 4WF5A 1SJIA 1YY7A 3O6TA 2E2GA 3FR9A 2CV4A 4GWRA 4KX4A 4RQRA 4J56E 2R6KA 4ZBAA 11GSA 4V1Ag 1SKRB 2HNLA 2K18A 4RI7A 4ZL7A 3TDGA 2I81A 2VL9A 4OWYA 4E8HA 1PA3A 1DE1A 5D9TA 3CSHA 3VLNA 2ZNMA 2ES7A 3J7Yk 1V2AA 2C3TA 4J57E 4K6XA 2GSTA 1AC1A 1FVKA 1HNBA 2H6YA 3FR6A 1ST9A 1EV4A 5KN0A 1K0MA 3FZ5A 2FWFA 2X64A 2CVKA 3FHKA 4MJEA 5HQPA 4ML1A 3KXOA 1USBA 1GSYA 4GQFA 4MP4A 2FHEA 4EKZA 5ECOB 2C4JA 5D9XA 4POBA 1WWJA 2VCXA 3VPQA 2MMOA 1FB6A 1T1VA 2XBIA 2V2GA 2FWEA 2IMKA 3I9V2 2REMA 3FW2A 3A2VA 6GSWA 3DMLA 2CQ9A 2XHFA 3TKRA 3D0ZA 2BMXA 4ML6A 3BBYA 5HFIA 1JFUA 4MJAA 4NAXA 1TRUA 5F05A 4PURA 3FR3A 3EMPA 3HCZA 5LCZA 1XWKA 2L6CA 2OE3A 1TK8B 3ZVJA 3I6AA 4BWSA 1WRYA 2NDOA 2LUSA 5CNWA 5DVBA 3IHQA 4PX1A 3RDWA 5J3RA 3TJJA 2VUPA 20GSA 4IVFA 5E4WA 3TKPA 5F8BA 1Z6MA 4TXVA 3HZ4A 5IMAA 4N11A 1M0UA 5ECQB 5DBQA 3F63A 3TJBA 1ZMAA 1EOHA 1XWBA 3LG6A 4Z7XA 4LMVA 2VM2A 5ELGA 3S9FA 4KE3A 5DALB 4EUYA 1YEPA 1K0BA 2R3XA 3TKSC 3UIWA 2OE0A 1O73A 5KN1A 1W89A 3ZIJA 2JZTA 2DJ0A 2VOCA 4L8EA 5J9BA 4CDOA 2O8VB 1VGLA 4MCUA 3G9BA 3BOAA 1V58A 3LJRA 1XWGA 2LJKA 3QPMA 2AV4A 1XXUA 1U3IA 1XWCA 3GL5A 2OE1A 1HQOA 2DJ2A 1SD8A 3D5JA 4WKWA 3GUSA 3Q19A 1J0FA 4AJ6A 4LMWA 3MWHA 3KP8A 1EP8A 1PRXA 4KW6A 3ME7A 3MSZA 4GLTA 4DEJA 5ECHB 1RQMA 4XS4B 2YZHA 3GYKA 2H1AA 3SWLA 2H6XA 3BCKA 1SJ6A 1XW5A 1EGRA 2K9FA 2WCIA 1M99A 5A4UA 5HFGA 4RI6A 1C72A 2YN1A 4IQ1A 2HYXA 3KH9A 3FZ4A 5F0GA 1SJZA 4ZBBA 2AHEA 2DMLA 2O89A 4F2IA 1XW6A 1ZGNA 4ECIA 2H8LA 4XS4A 3LQ7A 4ACSA 1TDIA 2C0GA 2IN3A 2R37A 2OBKA 1T00A 3ZYWA 2TIRA 2HZFA 2IMDA 3IA1A 2RUEA 2B6MA 3O3TA 4OFNA 6GSXA 2HZEB 1FOVA 2E0QA 1UA5A 2JZRA 2LRCA 2TRCP 3W6GA 3VK9A 1JZDA 2FA4A 1K0AA 5H5SA 4TR4A 1BG5A 1EEJA 1TJDA 2VL2A 2CVBA 4I2TA 3UAPA 2DSAA 1KNGA 2JSYA 4JE1A 2CX3A 3RPNA 2VCWA 4IP6A 1HNCA 4RUVA 5D96A 4EXJA 17GSA 4QL7A 1BYEA 5F06A 3QR6A 4IBPA 1J08A 1SU9A 1XVQA 5IQYA 4H86A 1NM3A 1LU4A 4L5OA 2DJKA 4ZB8A 2WRTA 3TKQA 3IV4A 4G9HA 2OBIA 3UBKA 1TU8A 1FHEA 4MPGA 2H19A 2WS2A 5ELAA 2GZZA 1R5AA 2VCZA 4L0UA 4IS0A 5C04A 3ERGA 1F6MC 1GUHA 3IRAA 1JHBA 3EWLA 1AAZA 5EVOA 5ECLB 4KH7A 4XCSA 5DJLA 2L57A 4BPYA 4G10A 3GURA 1GH2A 1XCCA 3M1GA 3FZAA 4HI7A 1XOBA 2B7KA 4WF4A 4MA9A 3KGKA 5DAKA 4TR3A 3TKSE 1SENA 3D4TA 1G6YA 2LKUA 1T8EB 12GSA 2VO4A 1M2DA 1H75A 4TXOB 4EL1A 2OACA 2VCQA 4RQXA 4HJMA 3IAS2 6GSUA 1S3DA 4ZB6A 4KDYA 5ECNB 3G7YA 1R26A 1QXHA 1YEXA 3VWUA 2LQOA 3GH6A 3FKFA 1YF1A 3EMXA 4POKA 4X0XA 2H70A 2GTUA 5IIZA 3UVTA 4AGSA 1E6BA 3TJFA 1U6TA 3EURA 1OC9B 1RK4A 2AAWA 1FAAA 2V32A 2KP2A 3HJOA 4KA0A 1K3LA 2I1UA 5G30A 3HYPA 3VWWA 1NHOA 3F4SA 1YJ6A 4V2MA 2MZCA 1RW1A 2GZPA 3P8WA 4OCEA 1U88A 4K7IA 4Q5RA 5F07A 1A0RP 4YAPA 1B8XA 3H4KA 7GSSA 16GSA 4GXZA 2LJAA 2QGVA 3UJ1A 3QFAC 5H5QA 5ECSA 2B7JA 1WPIA 2KLXA 3KJYA 5JCGA 4D73B 2FLSA 3D22A 1AW9A 1OE8A 4DSSB 4PQ1A 4Q5FA 3VFIA 1T4YA 1F37A 2H0IA 1A2LA 2CX4A 3TOTA 5IO0A 2L4CA 2AJQB 2L4QA 4ECCA 4YH2A 4IN0A 2RUFA 4NHWA 2VL2C 3CSIA 2Z9SA 3KP9A 4I2UA 1G7OA 3DEXA 4D73A 3CTFA 2LEGA 3D4MA 4FYUA 2YP6A 1J9BA 4DSSA 4G19A 2C80A 2P5RA 5J9CA 1A8YA 1LJRA 5IPHA 3W8SA 1UC7A 1BJXA 2F9SA 3ZVJD 1FG4A 14GSA 4ZIJA 3VWVA 3F3QA 2H1DA 2M80A 3L9SA 1QGVA 5GSTA 5B6NA 1THOA 3GKKA 1Q98A 4X43A 4KAEA 4HQSA 2FGXA 3C1RA 1GSFA 2LS5A 1M7TA 2HXKA 1TOFA 2RM6A 2IMIA 1GSDA 1PSQA 4HQZA 1SD9A 4IHUA 4IJIA 18GSA 2H71A 2VCTA 4N10A 4PNFA 1WJKA 1OE7A 3EYTA 1TU7A 1U87A 2EC4A 2FY6A 3F3RA 2G0FA 3ZL5A 4KSMA 3GSSA 2WGRA 3NIVA 2C3NA 1I5GA 3FYGA 3ZFLA 3DKSA 2HRFA 10GSA 1DE2A 1SL1B 1SKSB 1GLPA 1NW2A 1B9YC 1YQ1A 2PPTA 2V41A 3HDCA 2F8FA 2MBSA 1EZKA 2C1YA 2LTKA 4BA7A 5COHA 5JWQB 1TTZA 4TR1B 5IMCA 3ZIVA 4OFMA 2AYTA 4F0BA 1O7UA 3ZTLA 5H5RA 3GN3A 2NPBA 2H73A 3DXBA 2PWJA 1Z7RA 3WT1A 4G2EA 5D9VA 1DBYA 3HKRA 5A4WA 3HVSA 3GKNA 2DIYA 2YWIA 5CREA 5G1LA 4TR1A 3F4TA 4N0ZA 3QAGA 1JLVA 2JU5A 4ID0A 1YDKA 3HVXA 1VF2A 3H1NA 3L9UA 2C3QA 2R4VA 5IPGA 3OR5A 4YAVA 1ZCPA 2YOIA 1AIUA 3GKMA 1XWAA 3CMIA 2WB9A 9GSSA 3FEUA 4XS1A 3WGEA 4ILFA 1XBSA 2AB6A 3GX0A 2F8AA 1A2JA 3L78A 2L59A 3UARA 1TKDB 5HFKA 2O85A 3HHVA 1ON4A 2ALBA 2FA8A 3M0FA 2A2SA 2H1GA 4YQVA 1XIYA 4ZL8A 1QFNA 3RPPA 1XZOA 1PKWA 2LRTA 3RHBA 2PN8A 1SL2B 3H8QA 2GGTA 1K0OA 2DIZA 5GZZB 2GT5A 5JWRB 2KOKA 4OO5A 3QAVA 3F8UA 4I8BA 2VD1A 4XS6A 1SK2A 5DQYA 4JEDA 5B8AA 2MMAA 5JWOB 2E2MA 5DALA 1R7HA 2DJJA 1XOAA 2RIIA 4GF0A 1EWXA 2HLSA 3E9JB 4LA1A 1GRXA 3VPTA 5GAND 4XTSA 3IDVA 3PINA 6GSTA 1M9AA 3QOUA 1ERUA 4YQMA 1N8JA 1MDIA 4HU9A 2H74A 2IPAA 2FNOA 2RM5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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