4XS6A

Salmonella typhimurium ahpc w81f mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAFHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 50
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs6A00
4KGIA 1T00A 3D4MA 2DJ2A 1HQOA 4WETA 5B6MA 4WEYA 1PX6A 1LBKA 3LYKA 2BTOT 1FHEA 1Z3EA 4ZXGA 2NDOA 3ZLPA 1GUHA 4I6XA 1TJDA 3GYKA 2DMMA 2VCVA 2J23A 2FA8A 2TRCP 1DE1A 4RQRA 2YPMA 3L0HA 5JCGA 3PH9A 1EOGA 2O87A 3U5RE 2FY6A 3Q18A 5ECLB 5JWOB 2LJRA 1JLWA 1ON4A 2K8SA 1S3AA 2CQ9A 2K9FA 18GSA 4WF4A 1MEKA 3QFBC 2KOKA 5GSTA 1OC3A 1K0DA 2FWEA 4KX4A 2FUG2 1ACVA 1MDJA 3WGEA 3UOMA 4QL7A 4AJ7A 3A2WA 1U3AA 4MPGA 3M0FA 3BBYA 4ZIJA 4LA1A 1TK5B 5ECKB 7GSSA 3VWXA 4MF6A 5DJMA 5IO0A 4ECCA 1T4YA 1PQNA 4ZBBA 1QXHA 1KBNA 4TN8A 1Z6NA 2PUKC 4K0GA 1YKCA 5C04A 4ZBAA 2O85A 4MK3A 4D73A 1XVQA 3F4SA 3GUSA 1SJ6A 4G2EA 5D9TA 3GL5A 4BVXA 3UMAA 3TKQA 3C73A 1RQMA 2WZ9A 1BAYA 2I4AA 2H72A 1OE7A 3VLNA 2WDUA 2C0EA 1TI1A 3EURA 4KUNA 2HT9A 2H70A 3FR9A 1NM3A 5J9CA 1G7OA 1A2JA 3FZAA 1B4PA 5ELGA 4MJAA 1MDIA 2RUFA 5D73A 1EWXA 2H1AA 3FHKA 2VO4A 2DMLA 4ID0A 3DKSA 1G0TA 1PGTA 3LYPA 4XCSA 3C71A 3CYNA 2X8GA 3G9BA 3CBUA 1B9YC 1BYEA 5KN3A 4LL1B 4PURA 1G6YA 2QC7A 2GSSA 4KNDA 1DBYA 4L0UA 4POMA 3F8UA 4L5LA 3JCML 3OR5A 1GUKA 2B7JA 4OFMA 4GQCA 1R4WA 4FH8A 3GRXA 2JZRA 1U3IA 4TKYA 2PU9C 2CVBA 2IPAA 3LXTA 2AAWA 2LRNA 3F6DA 3ISOA 3UVTA 1TTZA 2HZFA 3LORA 1F37A 4BL7A 4I5QA 3RHBA 2GZYA 3EYTA 3DEXA 1SJZA 3M3MA 1GSQA 22GSA 3BJ5A 5DBQA 5GSSA 4QQ7A 3GHAA 4XS4A 4DSQA 5CRDA 4POBA 2CZ3A 2V1MA 4ZILA 2DLXA 3GX8A 3D0ZA 2ZNMA 1OAZA 5E4WA 4K9ZA 2R3XA 5D9XA 4KE3A 2L6DA 1XXUA 2HYXA 4G10A 2FCHA 3RPPA 4N11A 2DIYA 1ERTA 1U88A 5DALB 1EOHA 4JE1A 1ZCPA 1E6BA 4BVYA 3ZRDA 1WWJA 2WULA 5HFGA 3GA4A 1FOVA 4RQXA 4GSTA 5GZZB 1FO5A 1GLQA 5HFIA 3KP8A 3KIJA 4OMVA 5HR3A 5IO2A 5B7CA 1AQVA 2IMDA 1HNCA 2BJXA 2D2ZA 3ZYWA 2VD0A 5IM9A 1A2LA 4GLTA 1EEMA 3E9JB 3WT1A 5AISA 5D8IA 1WP0A 1J08A 2F8FA 3IC4A 1J9BA 3G7JA 4MH2A 11GSA 4ILFA 1AC1A 2B1KA 2Z9SA 1ST9A 3TJKA 3HXSA 3CXGA 1VRSD 2KLXA 2E0QA 4ZL8A 1GL8A 1NW2A 1BX9A 4ISDA 1MD3A 5G31A 1AUCA 2O8VB 5IMVA 1GH2A 4EL1A 4JZQA 20GSA 1ZYEA 2LNTA 3QR6A 1Z5YE 5JWRB 1A0RP 5B6NA 2AV4A 4E8EA 5FWGA 2C0FA 3HDCA 1AIUA 2B5YA 4CHSA 1SK2A 2F3MA 1NHOA 2VM1A 4F2IA 1TW9A 2GQLA 4KB3A 2VL2C 3NZNA 5LNKe 5ECNB 1Z9HA 3GSTA 2WFCA 1FVKA 1XW5A 2H1DA 2B7KA 5AIXA 2H6YA 3ZREA 2H0IA 1O6JA 2H1GA 4FYBA 2MZCA 4PNGA 3G7IA 1AW9A 3EMPA 1F6MC 2VIMA 3KMOA 3SWLA 19GSA 1OC8A 3I43A 3ED3A 4ML6A 1M99A 2MMAA 3QFAC 3QAWA 4E8HA 4PXOA 1T8EB 1XW9A 1JLVA 2YZUA 4IP6A 1ML6A 5AIVA 5KEJA 3DD3A 3U6VA 3ERFA 3TKPA 3L78A 4H86A 3MAKA 2R6KA 1SD8A 2LQQA 1FG4A 3FZ4A 3RHCA 9GSSA 1YEPA 3TJFA 4K0NA 4F0CA 4MZBA 4KH7A 1Y6EA 3RBTA 4OFTA 4O5RA 3ME7A 4K8MA 4RI6A 1SJIA 2DJ3A 5ECHB 5G5EA 1O8WA 5F0GA 3M8NA 2ALBA 3DVWA 1X5CA 2FWHA 4AGSA 1X5EA 2IIYA 2V6KA 2L5LA 1ZZYA 1TU8A 2O89A 5DCGA 3M1GA 4LMVA 1EGRA 2PERA 5IOWA 5J3RA 2LJAA 4WBJA 3VWUA 2MMZA 4K1FA 2LEGA 4AF2A 2VUPA 5CRWA 2V2GA 1ERVA 2F8AA 2HSHA 3IV4A 6GSYA 2PWJA 4PQIA 1CQGA 3A2VA 3FYGA 2C1YA 3MWHA 3ZVJD 4MPFA 2K8VA 4KCEA 2OE1A 3IDVA 2A2RA 3CTFA 3O76A 2H66A 4GTUA 5DALA 4F0BA 2EIQA 4ZB6A 4PNFA 3AY8A 5GAND 1PKZA 2DJ1A 2XBIA 4XTSA 5COHA 4FO5A 2KHPA 1W89A 1M2DA 1F9MA 4NWYA 3CSHA 1A23A 1TI3A 5FT3A 3DIEA 4I2TA 3FZ9A 2GZZA 3VPQA 3GKXA 2EC4A 2X64A 4OO5A 4L0WA 4I97A 5F05A 5B8AA 2RUEA 5CREA 5DCHA 2DIZA 3N5OA 2GS3A 4TVEA 2DJKA 4IP1A 3VI5A 2H6XA 4ECIA 3LQ7A 3UBKA 2DJ0A 1Q4JA 1PSQA 3WT2A 8GSSA 3IK7A 2CAIA 2H6ZA 1SYRA 2IMKA 2DJJA 4TXOA 3KXOA 5ECQB 3EWLA 4POKA 1O85A 5HFKA 2H30A 3L9SA 1BJXA 4IQ1A 1YEXA 2XPDA 4AJ6A 4HS1A 3VURA 5CAXA 4J2FA 4HZ4A 3EVIA 1BQ7A 2V6OA 5D9WA 1QFNA 1S3DA 2DSAA 5G5FA 1A8LA 3P90A 3DMLA 3VI7A 1YF1A 1FB6A 4EUYA 1OKTA 3I9V2 1GSEA 3BD2A 2YOIA 2WCIA 1UN2A 4HEA2 1HNAA 1JZDA 3Q74A 1FVJA 1XIYA 1GSFA 2GSTA 2H8LA 2E2GA 4NMUA 2E7PA 3GMFA 3A3TA 1ZGNA 2OE0A 1PN9A 3HKRA 3UIWA 1T3BA 4HI7A 5CYYA 1A0FA 4EDZA 2B5XA 2GVPA 5CNWA 4V2NA 1TRVA 2KP1A 4TR1B 4EVMA 4RUVA 1XWGA 2HLSA 5ID2A 1XWCA 2NVLA 1RK4A 3Q19A 2JZTA 1R26A 2ON7A 3FZ5A 3F63A 2B1LA 1USBA 1IYHA 3BCIA 3SBCA 2H74A 3TKSC 2B5EA 1PL1A 2EIOA 3N9JA 4TOPA 3ZFBA 3P2AA 3QD9A 5DAKB 3CRUA 5C00A 3TKRA 1TK0B 4XIHA 4ACSA 4MF5A 5ECOB 4NXIA 4I8BA 5J5NA 5ECMB 1PA3A 3FRCA 3PINA 2WS2A 4YQUA 1C72A 1B4QA 1I5GA 3GKKA 4LMWA 1ZL9A 3IOSA 3D5JA 5ECRB 2C3QA 2H01A 3D21A 3W8JA 1S3CA 3TRXA 2OA7A 4KDYA 2BMXA 2OBIA 3APQA 4ECJA 2L4QA 1OVNA 2XBQA 1KEBA 5DQYA 4N10A 2ES7A 2ZCTA 5IMCA 3F6FA 4TR4A 4X43A 4IBPA 4Q5QA 1AQXA 4HJ2A 4PX1A 3EE2A 1SKWB 3HZ4A 1FB0A 3TJJA 5G30A 4GWRA 4ML1A 1T4ZA 3CTGA 3EINA 1AXDA 2PBJA 5B8BA 5D93A 3KMNA 4CDOA 2C0DA 2M46A 1ERWA 2OACA 2IN3A 5IPHA 1O7UA 1TXXA 1SL1B 2FA4A 2VCQA 4PQ1A 3P8WA 2VLUA 3IR4A 3DRNA 2ZUPA 4EC0A 2KP2A 1X9MB 1TRWA 4HQZA 4MF7A 1F3BA 3IBHA 4PUAA 1F2EA 4FYCA 2RLIA 1YKAA 4TRXA 4RI7A 4POLA 1ABAA 2X8HA 4Z7XA 2JZSA 2M72A 2HRNA 4HZ2A 1A24A 1QK8A 2P5RA 4IS0A 1H4OA 4Q5NA 3P7XA 3H4KA 3F4TA 4O32A 3LXZA 3ZIVA 5F06A 4KSOA 1URMA 4KCAA 1T1VA 2C0GA 1GWCA 1U6TA 2YJHA 3F9UA 2L59A 2GZPA 4NAXA 5DVBA 2LV3A 3IAM2 16GSA 3D4TA 3DWVA 2YWMA 4WF5A 1U87A 4JU5A 3HJMA 1XCCA 1THOA 2P31A 4QL9A 3LJRA 1KTEA 3CSJA 3H1NA 6GSXA 1EP8A 1GUMA 1JZRA 2IMFA 2H71A 2YANA 2R2JA 3UJ1A 4Q5RA 2CVDA 3GTUB 3I6AA 5IMZA 3PR8A 3ERWA 5JWQB 2QSIA 1X0RA 2HNLA 4XS6A 3KZQA 3FKFA 2H73A 1WPIA 4K6XA 2PVOC 4PUFC 1QMVA 4DSSB 1B8XA 4MZCA 1G7EA 1SL2B 2GSRA 2VAFA 2CT6A 1K0OA 3W6GA 2PVQA 2F51A 3F4RA 1GSUA 3UVHA 3TRQA 2AHEA 2WGRA 2A4VA 4TR0A 4K7IA 1VF1A 1HYUA 4GSSA 3EU3A 1XPVA 4GCIA 1VF3A 2FWGA 5HR2A 4PQHA 4KDXA 2H75A 2H1BA 3HYPA 3FY7A 5HR1A 3DVXA 3G7YA 3VFIA 2WRTA 4Q5FA 4J57E 2V41A 2G0FA 1R7HA 2GT5A 3GIXA 5EVOA 1PRXA 3CRTA 1A8YA 1HD2A 4F9ZA 1GTUA 4XS1A 1IYIA 4MJCA 5D9VA 4FIWA 2OBKA 1Y25A 3KTLA 4MH3A 5D96A 5IMFA 3HHVA 5DJLA 1JHBA 2P0GA 3IXRA 1VGLA 2JL4A 4V1Ap 4CW9A 2EIRA 6GSVA 3LGCA 1XFLA 4D73B 3O6TA 2QGVA 3A2XA 3RAZA 4MZWA 1YY7A 1EV9A 4GF0A 5J4UA 4ZBDA 4KAEA 4OO4A 3DGQA 1GNEA 3I69A 1M2BA 1FW1A 3KEBA 5F07A 3FW2A 5EL8A 2X99A 3GH6A 2E2MA 2CA8A 3C7MA 1EEJA 1XWAA 4MJBA 5FHIA 4ULXA 1O8XA 3HJOA 1T7PB 4LLRA 3DXBA 1MDKA 3HD5A 1R5AA 4WR4A 2N5BA 1YZXA 2NBSA 3H93A 2I81A 3L4NA 4K7NA 2YWOA 3TOTA 1TOFA 3DYRA 3ME8A 12GSA 2R5GA 4HU7A 4ZB9A 1CQHA 2I9HA 4HU9A 3EC3A 4ZL7A 4EF0A 2VLVA 3L9UA 4IQAA 5CRHA 4JR4A 4O7HA 1Z7RA 3IRAA 4F82A 4MCUA 5CP1A 3VWWA 13GSA 1K0BA 4WXTA 1ZMAA 4JEDA 5J41A 2XC2A 2MYGA 4GRFA 5H5RA 3IHQA 3K8NA 1R5PA 3GFKA 2HE3A 3TKSE 1XWBA 2H76A 1KNGA 4N0ZA 3GKMA 2L4CA 1XOBA 2VCTA 2M80A 5G1KA 1DSBA 3QAGA 1M2AA 3IAS2 4IHUA 1VF2A 2HZEB 4V2MA 1TDIA 1PD21 4OFNA 2NTOA 1XZOA 3ZVJA 1M9AA 3A5WA 2IMIA 3UAPA 2AB6A 2GSQA 3UL3A 2FD3A 5HQPA 1ZOFA 4OD7A 1EV4A 1K0CA 1TKDB 1SD9A 4EE0A 1PL2A 1N8JA 3VK9A 5IOXA 3FEUA 3R2QA 1ZYQB 2A2SA 5DQSA 3TGZA 3TUEA 4BPYA 2H19A 1V58A 3KM6A 2PN8A 2PMTA 1OE8A 4IN0A 3WGDA 5IPGA 3J7Yk 2B3SA 3GTUA 2FWFA 3ZFLA 2O7KA 2G2QA 4TR3A 17GSA 3UEMA 4DSSA 2H0HA 2X8CA 3C1RA 4J56E 2R4VA 1NSWA 6GSWA 1DE2A 3GL3A 2GT6A 2OKAA 4F03A 1GRXA 2OADA 5L71A 4X0XA 4WKWA 1F3AA 1YF0A 1XW6A 3BOAA 1B48A 2VCWA 5GAPD 2JSZA 4GQFA 5INYA 3HCZA 1GTBA 1ERUA 3US3A 1QQ2A 3RPNA 3HVXA 4IVFA 1GSYA 2C3NA 4YQMA 1GNWA 4BWSA 1PKWA 2FNOA 5AN1A 4IW9A 5H5QA 2AJQB 4HQSA 3ZTLA 1SYXA 5E59A 3NIVA 1M9BA 3H79A 4DSRA 2YZHA 3ZMKA 2YCDA 5HR0A 1SK0A 4NV5A 2GGTA 4HJMA 4GXZA 1SL0B 5IIZA 2JU5A 1YQ1A 14GSA 1K0AA 2CVKA 2YP6A 1WRYA 5ABRA 3MNGA 3PGTA 1XWKA 2J9HA 2V32A 1OC9B 4V2LA 2HI7A 2MMNA 10GSA 4HOJA 2XHFA 2XPEA 2VCXA 3LWAA 3QAVA 3GSSA 3KTBA 5IMDA 3HY2A 2WJUA 1H75A 2VL2A 2AUVA 4KW6A 2YV9A 1K0MA 1ILOA 2YWIA 4N0VA 4NHWA 2C80A 1TRUA 1O73A 2IJYA 2FHEA 5A4VA 3C1SA 3LEFA 2LKUA 2PPTA 4TW5A 2I1UA 2GTUA 4X1UA 3TJGA 2N5FA 2GDRA 2RM6A 4LL4B 3IA1A 3GH9A 2NPBA 2IFQB 2MMOA 3E0UA 1TK8B 4MABA 5ECSA 2FLSA 2LJKA 4HUAA 2VL3A 4YQVA 1QGVA 3KP9A 3TRPA 1X9SB 3Q6OA 3ZZXA 1UC7A 4NV2A 2TRXA 2JADA 4JBBA 2VOCA 3CMIA 1SK1A 2YNXA 3GNJA 2N5AA 2RM5A 1WIKA 1FAAA 4N30A 3HVSA 3F0IA 1XOAA 2H0GA 2HZEA 3GURA 1LJRA 3MSZA 1PMTA 4V1Ag 1YJ6A 3D22A 2FGXA 4IGJA 5ENUA 3WD6A 5EY6A 3KJYA 1OKDA 2KUCA 4MDCA 1GTAA 1LU4A 4MJEA 1JFUA 2HFDA 4IELA 4XRDA 3KD0A 4JR6A 1DUGA 4OCFA 1I9DA 2IMEA 4BA7A 5J9BA 3VPTA 2CX3A 1GULA 5DDLA 2YWNA 1X9WB 2QKEA 4MA9A 2C3TA 1UVZA 5KN1A 4IJIA 1VF4A 1GSDA 3TDGA 1GP1A 1O81A 4G19A 4ZL9A 3TCOA 3HVVA 4YAVA 3M9KA 3WYWA 1SENA 1W4VA 2DC5A 3TB2A 1K3LA 1TP9A 3ERGA 3WGXA 3F3RA 5IQYA 3RDWA 2GLRA 5G1LA 4TXVA 2VM2A 5EPFA 5IMAA 1UA5A 1K0NA 3LSZA 1BG5A 4WBRD 4ECBA 3HZ8A 4EKZA 2MBSA 1V40A 4HDEA 3TOUA 1M7TA 2K6VA 5JCWA 1RW1A 1WJKA 2CZ2A 4MLYA 4K7OA 2LSTA 1JZWA 4K2DA 3QPMA 4NHZA 4TXOB 4NPBA 1XVWA 5CO3A 4KDUA 1SU9A 3MDKA 3ZL5A 2DBCA 2CV4A 3L9VA 4TR1A 4XRAA 5A4WA 3M9JA 4MMMA 2YJ7A 4ZB8A 3J7Yb 2LUSA 1EGOA 4OCEA 1GLPA 5A5KA 3FR6A 1M0UA 1OC9A 3V1WA 2VL9A 1YDKA 2JACA 1WE0A 2GQMA 4KA0A 1GSSA 4O92A 1X5DA 6GSSA 4IJ3A 3C8EA 2K18A 4GSNA 2VD1A 2PGTA 3GX0A 5DAKA 3O3TA 2VCZA 1AQWA 2IL3A 1Z6MA 3EU4A 2CX4A 1K3YA 3CSIA 2LS5A 1Z7PA 2LNSA 2VLTA 5A4UA 3IK9A 3D6IA 1QUWA 2TIRA 4OWYA 3FR3A 3F3QA 3QMXA 3APOA 6GSUA 3UBLA 4IKHA 2HXKA 4EO3A 3IE3A 4WR5A 2RIIA 1WMJA 1V2AA 5CRGA 2LRCA 4KSMA 1N2AA 5F8BA 1EZKA 2I3YA 3GN3A 2IFQA 1OYJA 2R37A 3VWVA 4AJ8A 3KH9A 3QDNA 4PGTA 3GV1A 5ID2B 3S9FA 4YAPA 2CAQA 5JCUA 3H8QA 1NHYA 2LQOA 3EMXA 1V9WA 4L5OA 2REMA 5KN2A 1A2MA 1THXA 3KGKA 3FK8A 3ZITA 1J0FA 2HRFA 3TKSA 4DVCA 4L8EA 1HNBA 2MBTA 5KN0A 3IPZA 3BCKA 4MP4A 2YV7A 2L5OA 3LFLA 1MD4A 1Q98A 3ZIJA 1TRSA 3ZMLA 1SKRB 1TU7A 2AYTA 2HSYA 1EP7A 1BEDA 1V98A 5LCZA 1B9XC 4FYUA 4YH2A 5ELAA 4XHMA 1GTIA 1WOUA 1MTCA 5AGYA 4BWQA 4G9HA 5G2ZA 3NOFA 1PX7A 1G6WA 1V57A 3LG6A 5ECIB 2P5QA 2LRTA 2JSYA 3KCMA 1E2YA 6GSTA 2C4JA 2B6MA 3W8SA 3QCPA 4EDYA 2LTKA 1XBSA 3GKNA 1JZOA 3APSA 2OE3A 5ECPB 3KH7A 4DEJA 4I2UA 2WB9A 1K3OA 3UARA 2F9SA 2IWTA 2C8UA 4P3YB 2ON5A 3HA9A 5H5SA 3E3EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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