4XTS | Genus

Total Genus 51

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	51
sequence length	160
structure length	160
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFAFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus	51
structure length	160
sequence length	160
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xtsA00

4NV5A 1JLVA 4ZXGA 1BEDA 2VCQA 5D73A 3TJGA 4AJ7A 3K8NA 2O89A 3DMLA 3EWLA 4BWSA 3FK8A 5DJMA 2OJLA 2WJUA 1AC1A 1EP7A 1XWBA 4TVEA 1Y6EA 5EVOA 5DQYA 1CQGA 2TRCP 5ECPB 4ID0A 4QL9A 4WF4A 3HZ8A 3EVIA 1GUKA 4TKYA 1Y25A 3MAKA 5IO0A 3C7MA 1EV9A 4E8HA 1EEMA 1T4ZA 3VWVA 3UVTA 3G7JA 2K18A 3GKKA 2VAFA 3IA1A 4GQFA 4PQIA 4PNGA 4K1FA 4GQCA 2GLRA 3DEXA 1UN2A 4MJBA 3TJFA 3D4TA 5ELAA 1HQOA 3HJOA 1QFNA 3VWUA 1WJKA 5ELGA 1SKSB 4F2IA 1XIYA 4TW5A 3WGEA 1WMJA 4J57E 1GSDA 2HZEA 2O8VB 2X8CA 3HJPA 4MA9A 4RQRA 1QUWA 2E2GA 1ABAA 3HYPA 4BPYA 2V6OA 1ST9A 2IWTA 6GSVA 1YKCA 1F6MC 1WOUA 4OCEA 5IPHA 4G2EA 4TR4A 2F3MA 1X9WB 1M2AA 2DJ2A 3PH9A 2JADA 2DJ3A 2OKAA 1I9DA 4KB3A 1GSEA 5F07A 1RW1A 3IOSA 3Q6OA 2WRTA 5DAKA 2H76A 2GS3A 3ZMKA 2L4CA 3A5WA 1T3BA 2H1DA 3FZ5A 1FW1A 4ZL9A 3UEMA 2C0DA 2J9HA 5B8AA 3IBHA 2FWFA 2YJHA 1SENA 4X43A 3TJKA 4Q5NA 2CQ9A 2R3XA 3H1NA 4GF0A 2GSSA 5EY6A 3GH6A 1H4OA 3HVVA 2GSTA 5IOXA 3LYPA 2IMFA 3RHBA 3TJJA 1TRVA 5ECNB 4D73A 1XOBA 3Q18A 1GUMA 3F3QA 2B5XA 3HXSA 7GSSA 4OCFA 4IQAA 4DVCA 3M3MA 2LQOA 3MDKA 1XOAA 3A2VA 3GV1A 3GKXA 5DQSA 18GSA 3ZTLA 5AN1A 12GSA 3P90A 5AGYA 5IPGA 2VLVA 5CYYA 1BJXA 2VCZA 1A24A 2DLXA 1AW9A 5ECLB 5FT3A 2X99A 2IMEA 3F4SA 1XZOA 2H71A 20GSA 4F0BA 2FA8A 3QAWA 4K8MA 1K0OA 3EYTA 4MMMA 1EGRA 2F8AA 1MEKA 4XS4B 1B4PA 4IGJA 1EGOA 3KH7A 1SL1B 4NHZA 2YJ7A 2FGXA 4F82A 1Z9HA 1K0MA 1RQMA 2KLXA 1QMVA 1SKRB 4IW9A 3TKRA 5FHIA 2YWNA 4OFTA 5HR2A 3H4KA 4HS1A 4CDOA 5J4UA 3FYGA 3ME7A 5JWOB 5HR3A 3GKMA 8GSSA 2NVLA 2ON7A 4V2MA 3LXZA 2VIMA 1JLWA 1RK4A 2MMAA 2FD3A 2H1BA 2YWOA 1Z3EA 1PSQA 1QK8A 2VL3A 1BAYA 5DALB 5D9XA 2PVQA 4HZ4A 2VD1A 2CAIA 2NPBA 2C3TA 2PPTA 3TGZA 3KD0A 2VL9A 2H19A 2TRXA 2KOKA 6GSWA 2VCXA 13GSA 1XVQA 4AGSA 1Q98A 3RPPA 1K0CA 1LJRA 3HDCA 3KMOA 3IV4A 3HD5A 1S3AA 4N30A 1X5DA 2IMIA 3DD3A 2H1AA 1FVKA 1AXDA 4RI6A 4TR0A 3KIJA 1JZWA 2P31A 2EC4A 1GTAA 1YJ6A 1DBYA 1PX6A 2QKEA 1O85A 1V9WA 4DEJA 3HHVA 4KW6A 4NHWA 3DYRA 3L9VA 1EZKA 2CV4A 1MTCA 3HVSA 5ECRB 2DSAA 5G1LA 3TKSA 5A4WA 4O5RA 3HKRA 1M2BA 3A3TA 1OC9A 4FYCA 2OA7A 3NOFA 3CTGA 1JFUA 1ERUA 1XPVA 4KA0A 4MZBA 3GUSA 1X5CA 1V58A 1IYIA 3QPMA 2FA4A 5CRHA 3IAS2 1U3IA 2KP1A 2O85A 2WS2A 5HQPA 2EIOA 3RDWA 2JU5A 3Q19A 4EF0A 3QAGA 5IM9A 4K7OA 2M80A 1OKDA 2OBKA 4KX4A 4ZILA 3QFAC 3ZVJD 3SBCA 2RLIA 1ZMAA 4WR5A 3F3RA 3D5JA 3IR4A 1EP8A 4K7IA 5KN1A 1GULA 1V57A 4D73B 2JSZA 2DJ1A 2LJAA 1OE8A 1T00A 1JZRA 4G10A 3LJRA 2LKUA 3DGQA 2JL4A 3FZ9A 4L5LA 4KH7A 4EL1A 1C72A 3GHAA 1MDKA 5COHA 1NHYA 2DMLA 1GTIA 2H1GA 3WD6A 2HXKA 3IRAA 1Z7RA 5KN0A 4IQ1A 1THOA 4I8BA 1GRXA 4AJ8A 3WGDA 5J3RA 2P5RA 2YV9A 1DUGA 4MJCA 4ACSA 1PN9A 5DCHA 1TRSA 3EMPA 2F8FA 3I69A 3RHCA 1SD8A 3C1SA 2R37A 4IBPA 1A2LA 4L8EA 4BL7A 1GLQA 1URMA 4WXTA 3VWWA 1MD3A 5JWRB 2FLSA 3GIXA 3ZREA 1U3AA 1GLPA 2PWJA 3UL3A 1SKWB 2CAQA 1PL1A 2VM2A 2RIIA 2JZRA 1ERTA 2WGRA 1EWXA 1CQHA 2C3NA 4YAPA 3E9JB 1AQVA 2A2SA 3LEFA 4DSQA 3IXRA 4MK3A 1SL2B 1ERWA 10GSA 2VL2A 4FYBA 1UA5A 4LL4B 1TW9A 4KCEA 2B3SA 4WR4A 3QMXA 4G9HA 2DIZA 1ZYQB 4O92A 5CRGA 17GSA 3M1GA 3FRCA 4JR4A 4YQUA 4OO4A 3CXGA 4GCIA 1A0FA 5DBQA 3GKNA 4IN0A 2HRFA 5IMZA 3UJ1A 2MMOA 2XPEA 2VM1A 4DSSA 3GURA 2BTOT 1G7OA 3UBKA 1T1VA 3BJ5A 1K3YA 3C1RA 1B8XA 1J0FA 5IIZA 3SWLA 3DXBA 1O8WA 4K7NA 3QR6A 4V1Ag 3TCOA 4J2FA 1KBNA 1O81A 5F0GA 4PURA 4HOJA 2QSIA 4WF5A 5C00A 3GTUA 4NV2A 3ZYWA 3LG6A 5D96A 1XWKA 5G1KA 1I5GA 1XWGA 4HUAA 2H6YA 3WGXA 3FHKA 2MMZA 2OBIA 2H6XA 1M9AA 3FKFA 3VFIA 5HR0A 3TKSE 3GX0A 3GL3A 5DDLA 2M46A 4LMWA 1G7EA 3M0FA 1VF1A 1HNAA 1FB0A 2ZCTA 4KE3A 2YV7A 1OC3A 4ECJA 3APQA 1R5PA 2B7KA 2H75A 5IMDA 2QC7A 4ML6A 4EC0A 4MP4A 4ZBDA 2IMDA 1SK2A 6GSUA 1G6YA 2A2RA 5ID2B 4L5OA 2C0FA 4H86A 3D6IA 1GSUA 5KN2A 4GRFA 3IAM2 2OACA 1J08A 2ES7A 16GSA 1PKZA 4EDYA 5KEJA 3KMNA 4POMA 5G31A 2K6VA 3TRQA 3GL5A 2O7KA 5IOWA 3BCKA 1FB6A 2MBTA 3UMAA 5LD0A 5GSTA 3ZIVA 1QQ2A 5C04A 2G2QA 3DWVA 1FHEA 4ECBA 1VGLA 1T7PB 2YZHA 4P3YB 1TK5B 2DJJA 4I2UA 5EL8A 1OAZA 2HFDA 2I9HA 4BWQA 2H72A 2J23A 1NW2A 5JCUA 1EEJA 4FO5A 2K8SA 4NAXA 1PMTA 3F8UA 5HFKA 5A5KA 3ERWA 2CZ2A 2PVOC 2H0HA 1DE1A 3KEBA 2KHPA 5D9WA 3VI7A 4OD7A 2HRNA 2R6KA 1HNBA 4MF6A 1HYUA 2HLSA 3QD9A 1GTUA 1K0NA 2I3YA 4IHUA 2L5LA 1TRUA 4XS1A 4HQZA 3OR5A 3CRUA 3RAZA 1A2MA 1X9MB 1AAZA 4RI7A 3CSJA 5IMCA 3E0UA 4KDYA 2FHEA 5ABRA 1AQWA 1MD4A 3MNGA 1G0TA 5GSSA 2FWHA 2ON5A 1K0DA 4TXOA 2MBSA 4Z7XA 3A2XA 2B6MA 5F8BA 2A4VA 5A4UA 5D9VA 4V2LA 1DSBA 1XBSA 1JHBA 3W8JA 2GZPA 2QGVA 4PXOA 3UVHA 5CP1A 4V2NA 1QGVA 2FNOA 5AISA 3GH9A 1VF2A 4TRXA 2L59A 1XW5A 2NBSA 3CTFA 3JCML 1SU9A 3ZIJA 3KTLA 2H0IA 3G9BA 3GFKA 1THXA 2LRNA 2OE3A 3HY2A 1R5AA 3TOUA 2GVPA 3IPZA 3ERFA 3QAVA 4JEDA 4GSTA 3APSA 1R4WA 1E6BA 2PBJA 2JZTA 3O76A 1O7UA 1K3OA 4ZB9A 5G30A 2LRCA 3GMFA 2LS5A 2GQKA 2B7JA 4KSMA 4NXIA 2M72A 1OE7A 2AHEA 1A2JA 3MSZA 2DIYA 2H01A 5G2ZA 1R26A 3TUEA 2PGTA 3WT2A 4BVYA 4IJIA 5B6MA 2B5EA 4IP1A 4OMVA 1YKAA 4X1UA 5CRDA 4MZWA 3FR6A 1ILOA 5CAXA 5D9TA 4PQ1A 4F03A 2C1YA 5CO3A 3CSHA 1YQ1A 3TRXA 1UVZA 4IVFA 3PR8A 4ISDA 2FWEA 1B9YC 2Z9SA 2PUKC 3CRTA 3BCIA 2CX4A 1F37A 1SL0B 2KP2A 4POBA 2HT9A 5DJLA 1YEXA 1VF3A 4G19A 5AIVA 2VUPA 1M0UA 2E7PA 2HSHA 2H8LA 3TDGA 2ZNMA 2HZEB 1FG4A 2O87A 3KXOA 4N10A 2K9FA 1W89A 4MCUA 2E2MA 3FW2A 2RM6A 3O6TA 1O73A 2X64A 4N11A 1LBKA 1XCCA 1O6JA 3W6GA 4CHSA 1ON4A 3IDVA 3BBYA 2JZSA 2YOIA 4WKWA 2B5YA 2YN1A 3TB2A 5FWGA 3P8WA 1TK8B 5H5QA 5JCWA 1V40A 5DAKB 4XTSA 2CT6A 1N8JA 1WWJA 4J56E 4HU9A 4NMUA 4JZQA 3H93A 3J7Yb 2AJQB 3LWAA 2AAWA 3GYKA 2WZ9A 2E0QA 2C0GA 4PUAA 2IL3A 2LTKA 1TTZA 3KH9A 5CRWA 1PX7A 2P5QA 3ISOA 1YF0A 3EU3A 1YEPA 3KGKA 3G7IA 3CYNA 2XHFA 4OWYA 1WP0A 4LMVA 3F6DA 3IC4A 2BJXA 1OC8A 3EMXA 2HE3A 2NTOA 2B1KA 4GTUA 2MYGA 3VWXA 3KTBA 3IE3A 1FO5A 4MDCA 2L4QA 2CA8A 4KUNA 2K8VA 2WFCA 2HZFA 3ME8A 4GWRA 3I9V2 3D21A 4MJAA 1YY7A 2YCDA 3LFLA 1ZOFA 1XW6A 3GN3A 5F05A 2CVDA 4EVMA 1GSYA 1SK1A 3DVWA 1M7TA 2VLTA 2PN8A 1B4QA 1LU4A 2I4AA 1BG5A 4WEYA 1SJIA 2FWGA 4LLRA 4XIHA 1BYEA 3ZZXA 1SK0A 4KSOA 4YH2A 1M9BA 1MDIA 1VF4A 3S9FA 4GSNA 3UOMA 2CZ3A 3AY8A 2RUEA 2R2JA 1NM3A 3P7XA 3L0HA 4JBBA 1XWCA 2GSRA 1B48A 1O8XA 1WPIA 2IIYA 2EIQA 5E59A 4NPBA 2GSQA 1XWAA 5CREA 3NZNA 4POKA 4TR1A 3L9UA 3EINA 5B6NA 4IS0A 4TN8A 2AB6A 1ZCPA 1ZL9A 2OE0A 1WE0A 5ECIB 4MZCA 4XRDA 1QXHA 2D2ZA 4NWYA 2VCWA 2CVBA 5E4WA 2XBQA 4WBRD 2LEGA 5H5RA 6GSXA 2ALBA 4JE1A 5DVBA 2DMMA 1Z6MA 3BD2A 2N5FA 2L5OA 4GSSA 3UARA 2B1LA 1W4VA 19GSA 4OFMA 4JU5A 2AUVA 3EC3A 2PERA 1GP1A 1ZZYA 2C4JA 4QQ7A 3DIEA 2F9SA 4DSRA 2FCHA 4XS4A 1F3AA 2GT6A 2I81A 3M9JA 1EV4A 2IN3A 1PRXA 3M9KA 3C71A 4WBJA 3HA9A 4HDEA 3TOTA 3DVXA 5KN3A 1OVNA 3D0ZA 2C3QA 1OC9B 2ZUPA 3M8NA 6GSSA 2LJRA 5F06A 4HJ2A 1TU8A 2I1UA 4Q5FA 4ZL8A 3N9JA 1HNCA 1GNEA 2F51A 4N0VA 5IO2A 1GWCA 3U6VA 3TKSC 3QOUA 1U88A 1PD21 3ZL5A 3VPTA 3TKPA 1BX9A 4K0GA 4LL1B 1ERVA 5DALA 2H70A 4RUVA 2PMTA 1GH2A 1FOVA 1GTBA 4MPFA 4Q5RA 4EUYA 1SJ6A 2HI7A 1XW9A 4HJMA 2FY6A 3TJBA 1H75A 3P2AA 4ML1A 3N5OA 1DE2A 1Z6NA 3F63A 4K6XA 1FAAA 1YF1A 1X9SB 3UAPA 2NDOA 3F4TA 2V1MA 4O32A 2LSTA 3ZITA 4EXJA 3KP8A 2DC5A 2HNLA 1TKDB 4WETA 3KJYA 2GT5A 4MLYA 3ZFLA 5INYA 5J5NA 2AV4A 3D22A 4EO3A 5JWQB 1ZYEA 4PNFA 1TRWA 3CBUA 5DCGA 3ZFBA 1R7HA 3CSIA 2JSYA 4XCSA 3I43A 2LV3A 4IJ3A 4ZB6A 4X0XA 3GNJA 2VCVA 4LA1A 2C8UA 5IMAA 3RPNA 2DJ0A 2VLUA 1YZXA 2XPDA 1U6TA 2BMXA 3ED3A 2IFQA 3FR9A 5GZZB 3LXTA 1K0AA 4ZB8A 1TOFA 3C73A 1TK0B 4L0WA 4K9ZA 2H66A 4ZL7A 2WDUA 2OADA 3KP9A 4E8EA 2YPMA 4JRRA 3UIWA 3FEUA 5GAND 3C8EA 3W8SA 1F2EA 2OE1A 4IELA 1XFLA 2EIRA 4PQHA 5G5FA 1EOHA 1XVWA 4HI7A 2XBIA 4TR1B 4I5QA 4YQVA 1S3CA 3D4MA 2C80A 2MMNA 3KCMA 5J41A 4AF2A 5ENUA 4I6XA 5B7CA 6GSYA 4MJEA 4PX1A 1Q4JA 2CVKA 2DBCA 4CW9A 3L78A 2R4VA 1U87A 5H5SA 3TKQA 3GSTA 2GQMA 3VPQA 3F6FA 3APOA 4BVXA 1OYJA 3DRNA 2H74A 1TU7A 2HYXA 2LNTA 2R5GA 1SD9A 2RM5A 1AIUA 2VL2C 4MH2A 1TI1A 9GSSA 1PKWA 5ECSA 1F3BA 4ILFA 1AUCA 3LSZA 3ERGA 1SYRA 1TJDA 4DSSB 5ECOB 3L4NA 5LCZA 2XC2A 2YWMA 5B8BA 2VOCA 4ECIA 1BQ7A 2VD0A 4MH3A 2GZZA 2G0FA 2AYTA 5G5EA 4V1Ap 4TR3A 1Z7PA 1V98A 4EE0A 1A8LA 11GSA 3A2WA 4MPGA 4OFNA 3GTUB 1M2DA 1K3LA 1X0RA 4XRAA 3IK9A 1WIKA 4K0NA 1GNWA 1YDKA 1Z5YE 2LRTA 2REMA 2LNSA 2H6ZA 5EPFA 1TP9A 2X8HA 3PINA 2JACA 4PUFC 4TOPA 3BOAA 3IHQA 4ECCA 4KDUA 1WRYA 3HJMA 5GAPD 3ZLPA 4F9ZA 4AJ6A 3FZAA 1G6WA 3LYKA 2MZCA 1HD2A 4MF5A 2YNXA 2PU9C 4TXVA 4HEA2 2GZYA 1JZOA 3QFBC 3EU4A 2GGTA 4KAEA 3CMIA 2WULA 4OO5A 1M99A 4HU7A 4XHMA 3US3A 1PQNA 1PL2A 1A0RP 3FZ4A 4ZBAA 5J9CA 3V1WA 4ULXA 1B9XC 3FR3A 1EOGA 4KDXA 3PGTA 1FVJA 5ECMB 4POLA 4RQXA 1MDJA 4L0UA 4IP6A 3VI5A 2V32A 1ACVA 3UBLA 1ML6A 3LQ7A 4MABA 4N0ZA 3IK7A 4YAVA 5LNKe 1TXXA 2H0GA 1GSFA 1UC7A 3F4RA 4EDZA 2IFQB 3VLNA 1SYXA 4KGIA 2YP6A 1ZGNA 1KTEA 5HFGA 2L6DA 4KNDA 1A8YA 3H79A 1K0BA 3ZMLA 2V41A 5IMVA 1AQXA 3E3EA 3R2QA 3EURA 4ZIJA 1VRSD 4XS6A 4ZBBA 3Q74A 5AIXA 3NIVA 3G7YA 1NSWA 1TDIA 5ID2A 2KUCA 2WCIA 14GSA 2WB9A 2GQLA 4EKZA 3EE2A 1E2YA 3KM6A 5JCGA 1V2AA 3MWHA 3ZVJA 4TXOB 2DJKA 5HFIA 2YZUA 1TI3A 3VK9A 4FIWA 2N5AA 2VO4A 2FUG2 2X8GA 1GSSA 4GXZA 4YQMA 5L71A 3GRXA 3J7Yk 2YWIA 3VURA 1GUHA 3HVXA 4FYUA 3GSSA 4BA7A 1NHOA 3WT1A 2H30A 2C0EA 4I2TA 3F9UA 4PGTA 2YANA 1T4YA 2H73A 3LORA 2VCTA 2GTUA 2LUSA 2LQQA 3QCPA 1J9BA 3U5RE 4I97A 5IMFA 1SJZA 2RUFA 5J9BA 3RBTA 2L57A 2V2GA 3L9SA 5ECHB 4IKHA 1N2AA 5ECKB 5A4VA 3WYWA 2IMKA 3H8QA 4FH8A 1IYHA 2IPAA 4Q5QA 2LJKA 2L6CA 4QL7A 3HCZA 1F9MA 1PA3A 1KEBA 5CNWA 3DKSA 4HQSA 3I6AA 5D93A 5HR1A 3LGCA 3GA4A 1A23A 3TRPA 2V6KA 1PGTA 1GL8A 3HZ4A 4MF7A 1KNGA 1JZDA 1XXUA 4K2DA 1USBA 1T8EB 5D8IA 4GLTA 22GSA 2GDRA 3ZRDA 5ECQB 4KCAA 1X5EA 2N5BA 3O3TA 4O7HA 1OKTA 3QDNA 3KZQA 2IJYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4XTSA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations