4XTSA

Salmonella typhimurium ahpc t43a mutant
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFAFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 51
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xtsA00
2GZPA 3CXGA 2XBIA 3L9SA 1EP7A 4ZB9A 2O87A 2H75A 2VLTA 3L78A 4WR5A 1XXUA 4JRRA 2CVDA 3CSJA 3F6DA 4O5RA 3FRCA 3TOTA 1FG4A 2EIQA 4V1Ag 3W6GA 3LQ7A 1V58A 13GSA 2GVPA 3LJRA 2H0HA 1UVZA 2K6VA 2F8AA 4POLA 1TI1A 1SKWB 1B48A 2GGTA 3RBTA 3TCOA 4LMVA 3H1NA 5JCGA 4GQCA 1EZKA 5D9VA 3VPTA 5COHA 1ZGNA 1M9BA 1Q4JA 2H0GA 3HZ4A 1Z6NA 2YNXA 1PKZA 1PD21 2GQMA 3IHQA 1A2JA 2JL4A 4K7IA 5ENUA 1Z7RA 3GV1A 3HD5A 2IIYA 3CRTA 2AAWA 2HNLA 5KN2A 1GTAA 2MMNA 1XWGA 5E59A 3QFAC 1B4QA 2XHFA 2DIYA 2GTUA 4I2TA 3TKQA 1TKDB 3D6IA 2D2ZA 3H79A 3CTFA 3LG6A 4TR3A 3GL3A 4MH2A 2R4VA 2H74A 1OE8A 2MBTA 5GSTA 2A4VA 2I4AA 2ZNMA 2OACA 3P8WA 3GNJA 5FWGA 5HR1A 1A24A 2YZHA 5HQPA 3UJ1A 2HYXA 3KM6A 3FK8A 1AIUA 4LA1A 1F9MA 1WIKA 3A3TA 3TRPA 3VI7A 1Y25A 2DC5A 1R5PA 5ECMB 1JZRA 2H66A 4JE1A 5ECQB 3UMAA 1FOVA 1MDKA 2E2MA 2VAFA 3MSZA 3TGZA 3APQA 3DYRA 4HJMA 2K18A 5IO0A 4MCUA 3Q6OA 2GS3A 4L0UA 2AHEA 1SJ6A 5DAKA 1QQ2A 4PUAA 5J5NA 4LMWA 4OCFA 4FYCA 4FYBA 1YZXA 2VL2A 3HKRA 3GTUB 14GSA 3ERFA 2YV7A 3KIJA 4IGJA 4IW9A 3G9BA 2FWGA 1JZDA 5D9WA 4E8EA 3R2QA 1TRVA 5F05A 1SD8A 1GP1A 2NDOA 3GIXA 2WRTA 5B8AA 1SKRB 1OC9B 4NPBA 1UA5A 2LRTA 3M8NA 5A5KA 5KN0A 2EC4A 4ECBA 5HFGA 2FUG2 1XBSA 3LYPA 4MPGA 3ZIJA 3FY7A 4XCSA 2QSIA 4KAEA 5ECOB 1B9YC 4IQAA 1UN2A 1TI3A 3A2VA 4QQ7A 2DJJA 3TRQA 3QAVA 3F6FA 3IAM2 1A8LA 3ME8A 3HJPA 1LU4A 1EOGA 2YWOA 5G1LA 1DUGA 5J4UA 2V1MA 4V2NA 3M3MA 5J3RA 4BA7A 2MZCA 1GLPA 3ZMKA 1WP0A 3H4KA 3IBHA 2DMMA 1U6TA 3TRXA 5FHIA 3GKKA 1FW1A 2VCZA 4EKZA 2GT6A 1PMTA 1EEJA 1PX7A 1USBA 3IOSA 3RHBA 5F8BA 5G5EA 2P31A 3IC4A 1X5DA 4KA0A 3EWLA 2LQQA 2X8GA 1BX9A 5J9BA 4GSSA 1X5EA 4GRFA 5HFIA 3KEBA 2GQKA 4MF5A 3E0UA 5IIZA 3APOA 1XVQA 1I5GA 3QPMA 4MJEA 3BBYA 5F0GA 3ZTLA 1BYEA 2IJYA 6GSTA 4HS1A 1H75A 2PVQA 5CRHA 3GKNA 2PGTA 4OCEA 4XTSA 4I97A 1EGOA 5H5SA 3BCIA 4ECCA 5ECNB 1VRSD 3HJOA 3NZNA 3VWVA 2KLXA 2ZCTA 5IQYA 2KP2A 3A5WA 5AN1A 2HRNA 2G0FA 4XS4A 1GULA 5DJMA 5GAND 3TKPA 1Z9HA 4TOPA 2GZZA 4EDZA 3D22A 1A0RP 1TRSA 2REMA 1F37A 2C0GA 1W4VA 3ERGA 3A2XA 1GLQA 2IMFA 3IV4A 4JZQA 2HXKA 1EWXA 1SU9A 2C4JA 1I9DA 2K8SA 4ZBAA 2XPEA 2CX3A 1DSBA 4GSTA 2L4CA 4WF5A 2E0QA 4POKA 2AV4A 3ZYWA 1QFNA 3KZQA 4K7OA 3MNGA 1FVJA 3ZFLA 5D8IA 3VURA 1F3BA 3DXBA 5DCGA 1R5AA 2WDUA 20GSA 4GCIA 3PR8A 4MLYA 2FGXA 2H6XA 3IR4A 5J41A 2R2JA 2R37A 4TVEA 2X8HA 1ERTA 2MYGA 5A4UA 5B6MA 2YZUA 1YEXA 2JSZA 3FR9A 2XPDA 3IA1A 1J08A 5HR3A 2K9FA 4POMA 1M9AA 4RI7A 2B6MA 1A23A 2JZSA 4FH8A 1PL2A 2F3MA 3HVSA 1TU7A 4GWRA 2OE3A 5ECPB 1AQWA 4MABA 3SWLA 4I8BA 4KUNA 2FY6A 1QXHA 5EL8A 3KP8A 4ZL7A 5D96A 3IRAA 4FYUA 5DVBA 3W8SA 1T3BA 3RPNA 2EIRA 3RHCA 2WULA 4P3YB 3ZVJA 3VFIA 3WT2A 3P7XA 1QMVA 4Z7XA 3KH7A 5ID2B 5IM9A 4IKHA 3D0ZA 1WOUA 1OYJA 2FWHA 4J2FA 3GX0A 3L9VA 3EU3A 4HDEA 1SL0B 3GSTA 2YWNA 5IOXA 3GKXA 2F8FA 4PQHA 5IO2A 3KD0A 5JCWA 2X99A 1TDIA 3N5OA 4XS4B 1GUHA 2GZYA 1H4OA 4K9ZA 3J7Yk 5INYA 4ML6A 3KTLA 4PNFA 1SJZA 2B7JA 1K0BA 1ERWA 22GSA 3HHVA 4KCEA 3VLNA 2L4QA 6GSWA 12GSA 3FZ9A 2PMTA 3TOUA 4IP6A 4K7NA 3IE3A 3TDGA 3P90A 1SKSB 3GH9A 4ECJA 1E2YA 1SENA 1ILOA 4K6XA 4NV5A 4OFTA 1B8XA 3D5JA 4EE0A 4KCAA 1MDIA 1XWCA 1NW2A 4XHMA 5D9TA 2YANA 6GSSA 1WMJA 2WGRA 4AGSA 1FB6A 3TKSA 1X5CA 4LL4B 5IMCA 4OO5A 1TW9A 3EVIA 1XZOA 1B9XC 5JCUA 4MH3A 3RDWA 3ZVJD 1U3AA 1Y6EA 4BWSA 3FR3A 1M2BA 1T4ZA 4GSNA 1AW9A 4JR4A 4TN8A 2J9HA 1DE2A 1GSSA 2WS2A 5D73A 2P5QA 2DJ2A 2HE3A 1Z5YE 2GSQA 2H1BA 1G6YA 3ME7A 2AJQB 2IWTA 1EEMA 4I5QA 5H5QA 1M0UA 3EU4A 3LWAA 4EDYA 2WZ9A 3APSA 4F03A 1TK8B 1ACVA 4NAXA 4K8MA 5JWQB 2JZTA 2LNTA 2M46A 5DJLA 2LUSA 4KB3A 4F9ZA 2GT5A 4HI7A 3IAS2 3ZRDA 6GSXA 2VL9A 1ZL9A 3FEUA 2VUPA 3FKFA 4L5OA 1Z6MA 1F6MC 3M9JA 4IN0A 5A4WA 3M0FA 1WWJA 1SK2A 1GTIA 2FD3A 2CV4A 3I9V2 2HSHA 2H76A 5IOWA 3GX8A 1W89A 3PGTA 1Z7PA 1XOBA 3NOFA 2H70A 4IS0A 1S3AA 4WF4A 1VF4A 1BEDA 4HU9A 2B7KA 2IMKA 1S3DA 1WPIA 2TRCP 2B5YA 4XRDA 2R3XA 1HYUA 1T1VA 2CQ9A 1XWAA 2VCQA 2VCVA 4MZCA 1XW9A 2C80A 2LNSA 3S9FA 2A2RA 4LL1B 4HZ2A 3FZ4A 4I6XA 4ZL8A 2R6KA 1FB0A 1ABAA 2B1KA 1MD4A 3C71A 2IMIA 3VWWA 1SD9A 2ON5A 5KN1A 4QL9A 5CNWA 4L8EA 3LXZA 4GTUA 2VOCA 1XPVA 1V9WA 2KP1A 3EYTA 4J56E 1X9SB 1K3OA 4K0GA 3QR6A 1TP9A 1YF1A 1Q98A 4TRXA 5G31A 4EF0A 2A2SA 1OC8A 2BTOT 3C73A 1YY7A 1ZYEA 3KCMA 2GDRA 4TR1A 4ZBDA 3L9UA 2C3TA 5JWOB 3KH9A 4MMMA 5B6NA 3TJGA 2PBJA 2DJ0A 1JZWA 3Q18A 3TJBA 3F8UA 5F06A 4TW5A 1K0OA 1GUMA 2HLSA 3ZITA 3F63A 5CRDA 2X8CA 3KMNA 1SL2B 2F9SA 3EMXA 1YKAA 4X0XA 2YJHA 4Q5QA 4RUVA 2P0GA 3HZ8A 4HJ2A 2OE1A 2JSYA 3ZLPA 2DLXA 2G2QA 4O32A 1GSEA 3I6AA 2VLUA 4EO3A 1PSQA 4ZL9A 4CW9A 4WBRD 4OFNA 2L5OA 4NHZA 1PQNA 3UOMA 2I3YA 1EP8A 5CO3A 1FAAA 4EL1A 4NV2A 1VF1A 4PURA 2BJXA 1G7EA 4LLRA 1T4YA 4TR0A 4RQRA 4YH2A 1HQOA 4N0ZA 2WJUA 5EY6A 3TKRA 5CREA 1DE1A 1GSDA 3DKSA 3KGKA 5J9CA 1UC7A 2WFCA 5EPFA 1KBNA 2NBSA 4AJ6A 1SK0A 4POBA 2PPTA 1AQXA 4HU7A 5IMAA 3WD6A 5G1KA 1RW1A 3UVHA 3KJYA 1QGVA 4MPFA 2V41A 2B1LA 4V1Ap 1ZYQB 1O8WA 3O3TA 3MDKA 3UEMA 2H30A 4ID0A 1ZMAA 1HNCA 4JU5A 4ZILA 3DMLA 2KHPA 3HCZA 1T7PB 5G5FA 5DALA 1TK5B 3QDNA 4KSMA 1ON4A 2DBCA 5IMFA 2OADA 2L5LA 1ERVA 1VF2A 1SL1B 2PWJA 2B5EA 2VD1A 1TRWA 4WEYA 1K0NA 4HQSA 4MA9A 1K0DA 1RQMA 2I9HA 4MJBA 2PUKC 5HR0A 1WRYA 5AISA 2FWEA 3EINA 3VWXA 5DAKB 1BAYA 5E4WA 1PN9A 4OFMA 5HR2A 4F0BA 3ED3A 4HUAA 4H86A 4N30A 1JHBA 2TRXA 2OJLA 3BD2A 2HT9A 2PERA 4Q5NA 4CDOA 1E6BA 2RM5A 4KH7A 1XIYA 5CRWA 5IMZA 2PU9C 3TJJA 1X9MB 3O6TA 2IN3A 2LEGA 3U6VA 3C7MA 2LQOA 2H1DA 4I2UA 2DSAA 1C72A 1YEPA 2AB6A 1QUWA 4ZB6A 2M80A 3P2AA 1A0FA 3TJKA 1MEKA 4ULXA 4PQIA 2Z9SA 2L6CA 2IL3A 1KTEA 4GQFA 2IFQA 3GRXA 2CVKA 3D21A 5H5RA 4TR4A 1OC3A 1ZCPA 2MBSA 3G7IA 4ZBBA 2VM1A 3CMIA 3UBKA 5FT3A 3H93A 4O92A 4KDYA 3GUSA 3F3RA 1TOFA 3GMFA 2O89A 5C04A 4ECIA 1JZOA 1NHYA 4HEA2 3JCML 5DBQA 1SJIA 1HNAA 2N5AA 3QFBC 3A2WA 3ZREA 2J23A 3E3EA 4GLTA 2MMZA 3EURA 3LFLA 4V2LA 2YOIA 4G10A 3UL3A 2ON7A 4ZIJA 3EE2A 1AQVA 1N2AA 5LNKe 1J9BA 2YN1A 2DJ1A 1KNGA 1J0FA 1O81A 17GSA 3UARA 1B4PA 1GTUA 2QKEA 2H73A 2FWFA 3D4MA 1SK1A 3GA4A 4V2MA 4ISDA 5ECSA 3GURA 4EXJA 3HVXA 3GSSA 4OD7A 5CP1A 2YWMA 2GSRA 1FVKA 3DVXA 1OE7A 1GNEA 2LKUA 2L57A 2RLIA 1IYIA 1ZOFA 1NSWA 2X64A 2LTKA 3HJMA 3C1RA 5IMDA 2VD0A 5GAPD 1VF3A 3IDVA 2CZ3A 2YWIA 2IPAA 3HXSA 4NMUA 3QAGA 1V2AA 5DQYA 4NWYA 3GL5A 3DGQA 2HSYA 3LSZA 1R26A 4QL7A 2WB9A 2GQLA 3HDCA 1TU8A 4FO5A 3HY2A 1G7OA 4PQ1A 1JLWA 4EUYA 1XOAA 3M9KA 2RUFA 1R7HA 1SYRA 1YDKA 2GSSA 2O7KA 3IK7A 1FO5A 2XBQA 5B7CA 1K0CA 3UAPA 4XIHA 2IFQB 2VL2C 3KP9A 3F4RA 1TJDA 4XS6A 4PUFC 1LBKA 2RM6A 3L0HA 5F07A 4YQUA 2H01A 2RUEA 1M2AA 4BVXA 3H8QA 3QD9A 4ACSA 1G0TA 1TXXA 2VCTA 4OWYA 3CTGA 3MAKA 1M7TA 3CYNA 4J57E 4YAVA 4MP4A 2VCXA 2PVOC 4HQZA 2ZUPA 4KSOA 3TB2A 2L6DA 3WYWA 2K8VA 1KEBA 4TXVA 19GSA 5ABRA 2AYTA 3QCPA 2ALBA 1N8JA 2E2GA 3GTUA 1URMA 1MTCA 1M99A 1THXA 2ES7A 1R4WA 1JFUA 1YKCA 3LEFA 5A4VA 2QC7A 4ZB8A 3OR5A 2O85A 1OC9A 2FLSA 1V57A 3W8JA 4HZ4A 1M2DA 5G30A 4E8HA 4X43A 2VCWA 3RAZA 4DEJA 1OKTA 2N5FA 2FCHA 8GSSA 2CVBA 2CAIA 3G7YA 1LJRA 1OKDA 4PX1A 3K8NA 2QGVA 2N5BA 3DWVA 3FHKA 1EOHA 4X1UA 5D9XA 4RI6A 4PNGA 2BMXA 2O8VB 5ECIB 1NHOA 3DRNA 4IVFA 4IJ3A 5IPHA 4BVYA 4Q5RA 2NTOA 2H19A 4OO4A 3KMOA 3HYPA 3LORA 2YP6A 4IBPA 4N11A 4NXIA 1F2EA 9GSSA 2NVLA 1OAZA 3ZZXA 1FHEA 2OBIA 5GZZB 3RPPA 2RIIA 3QAWA 5LCZA 5ELAA 1S3CA 2LS5A 3BOAA 3HA9A 1VGLA 4ILFA 1Z3EA 3LGCA 11GSA 2HZEA 5DQSA 2YJ7A 7GSSA 18GSA 1O7UA 1THOA 2B5XA 1K3YA 1JLVA 3HVVA 3KTBA 4MJCA 1AAZA 3I43A 4BL7A 4BPYA 4KW6A 3WT1A 2FNOA 5JWRB 4JBBA 4F2IA 4DSSA 4IJIA 4MJAA 1EV9A 3FR6A 4TXOA 1PGTA 3BJ5A 2HRFA 6GSYA 1XFLA 5AGYA 2OE0A 4RQXA 1PX6A 2FA4A 2NPBA 2C3NA 1GSUA 1GRXA 1BQ7A 4GXZA 1PL1A 4O7HA 1GSFA 2H1GA 4N0VA 4KGIA 4XS1A 2LJRA 3AY8A 5B8BA 2YV9A 4IHUA 5AIXA 2JACA 5DDLA 4MF6A 3F4SA 3I69A 2C0DA 4AJ8A 1PA3A 2CAQA 4KX4A 3C1SA 3FYGA 1XCCA 3FZAA 2DJ3A 1A8YA 3Q19A 4JEDA 1HD2A 1F3AA 2R5GA 2H71A 1BG5A 1O8XA 3WGDA 1MD3A 2V32A 4G9HA 5ELGA 1WE0A 2AUVA 4PGTA 2FA8A 2DIZA 2DJKA 2I81A 5C00A 4HOJA 1A2MA 2WCIA 1AXDA 1HNBA 6GSUA 5ECHB 5ECKB 3DD3A 4F0CA 1ZZYA 2HFDA 1OVNA 4G19A 1K3LA 4BWQA 2KOKA 6GSVA 2I1UA 1XW6A 2P5RA 1WJKA 2H8LA 2HZEB 2H1AA 2TIRA 5ID2A 3VPQA 1V40A 4TR1B 3G7JA 2LRCA 3ZFBA 1O85A 4G2EA 2VLVA 4K0NA 3F0IA 4MF7A 3PINA 1O6JA 3WGEA 1ST9A 1RK4A 4NHWA 2L59A 2JZRA 1IYHA 2C1YA 1XWKA 3TKSC 4DSSB 4XRAA 3TJFA 3TKSE 4PXOA 3GHAA 3FW2A 1O73A 4AJ7A 3ZMLA 1EV4A 4TXOB 1GUKA 5CRGA 1TTZA 3F9UA 2C3QA 1G6WA 1QK8A 3LXTA 2VIMA 5EVOA 2LRNA 5DCHA 4WXTA 2VM2A 4YAPA 3IXRA 5LD0A 4YQMA 5CAXA 4IQ1A 3PH9A 5CYYA 2C0FA 1NM3A 3GN3A 3TUEA 3CBUA 2LJAA 2OBKA 2M72A 4IELA 4F82A 1K0MA 2CA8A 2MMAA 3FZ5A 5ECLB 1ML6A 4EC0A 2XC2A 2H6ZA 3QOUA 3VK9A 3IK9A 3VI5A 3EMPA 4DSRA 2CX4A 3F3QA 1XVWA 3KXOA 2GLRA 3GKMA 2YPMA 3CRUA 3IPZA 2V6KA 2HZFA 1PRXA 1TK0B 2CT6A 2CZ2A 1GL8A 2YCDA 3ZIVA 1XWBA 4D73A 16GSA 1TRUA 4WR4A 1GTBA 2IMDA 4IP1A 5L71A 2OA7A 1YJ6A 2VO4A 2JU5A 2LJKA 3L4NA 4KNDA 3N9JA 1U88A 1XW5A 2KUCA 3US3A 4K1FA 1A2LA 4L0WA 1K0AA 5DALB 2C0EA 3O76A 1SYXA 2MMOA 3SBCA 4L5LA 3C8EA 2C8UA 3DVWA 1PKWA 1ERUA 5KEJA 1T8EB 4AF2A 2F51A 3WGXA 3UVTA 5GSSA 4KE3A 4Q5FA 3MWHA 3VWUA 2OKAA 5IPGA 1CQHA 2GSTA 4WBJA 4YQVA 1T00A 5ECRB 4KDXA 2LSTA 4TKYA 3E9JB 1CQGA 3ISOA 1GSQA 5G2ZA 4WKWA 2H0IA 4MK3A 3BCKA 2V6OA 3GFKA 1MDJA 4DSQA 5AIVA 2E7PA 2B3SA 3DIEA 4MZBA 5D93A 4MZWA 1GWCA 4EVMA 4WETA 3U5RE 1YF0A 4K2DA 2HI7A 3Q74A 3LYKA 1AUCA 1YQ1A 10GSA 1V98A 2LV3A 4FIWA 3UBLA 1BJXA 5HFKA 3NIVA 2FHEA 5IMVA 3J7Yb 2EIOA 4ZXGA 3UIWA 1DBYA 2IMEA 4OMVA 1GSYA 1U3IA 1AC1A 1GNWA 3M1GA 3ZL5A 5KN3A 3CSHA 1GH2A 3GH6A 4KDUA 1U87A 2JADA 3GYKA 2PN8A 4N10A 4CHSA 3F4TA 3EC3A 4MDCA 3CSIA 1EGRA 4GF0A 3D4TA 2H72A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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