4ZIJA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with 2-(4-iodophenylsulfonamido) benzoic acid
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title Determination of ligand binding modes in weak protein-ligand complexes using sparse NMR data.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 65
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zijA00
2YNXA 4BWQA 1QXHA 1Y6EA 5IPGA 1GTUA 4MF6A 1R4WA 3D6IA 3DVWA 1O73A 1YDKA 2PGTA 4XS1A 10GSA 3ZITA 1F37A 8GSSA 2CX3A 3LXZA 4IKHA 5L71A 4GTUA 2DJ3A 4NWYA 1YQ1A 1ON4A 2V41A 4GQFA 4X1UA 3VK9A 4K2DA 4L5OA 1JLWA 4ACSA 4BVYA 3D5JA 3ZL5A 4ML6A 2WS2A 4MZBA 1MD4A 4IP1A 1AIUA 2GZYA 3KGKA 1USBA 3HCZA 2IMIA 4POLA 4PNGA 1YJ6A 4QQ7A 5ECKB 3IAM2 3HKRA 2K9FA 2MMAA 3L78A 1UVZA 3LWAA 1QFNA 3FZAA 3KIJA 4GSSA 3PGTA 3U5RE 4OFMA 1AAZA 1OC9B 1VF2A 1IYIA 3HZ8A 1ZGNA 1SENA 1AUCA 2VM1A 4DSSB 1MDJA 2B3SA 3ZZXA 1FO5A 2P31A 3IC4A 4KA0A 5C04A 1WMJA 5AISA 2H74A 5DDLA 1XZOA 3HHVA 4WR5A 3TDGA 3GN3A 5DALA 5IOXA 2E0QA 2FWEA 16GSA 3BOAA 2LV3A 2BTOT 2VM2A 2R2JA 1TXXA 2V1MA 3VLNA 2FWFA 2C4JA 5IOWA 1WP0A 4G9HA 2IN3A 3ZFBA 3VURA 3DGQA 1RQMA 5IM9A 3C73A 3ZLPA 3W6GA 1YF0A 5H5SA 1GTIA 1WE0A 1SYRA 5F06A 2DC5A 3FR6A 2GGTA 4O5RA 5H5QA 1QGVA 4HQSA 2PU9C 3IDVA 4EDYA 3ZRDA 2HT9A 1TKDB 4TW5A 3UAPA 4MZWA 2C8UA 1X0RA 3GH9A 1RK4A 3H79A 5ECRB 3EWLA 4MJAA 3FZ9A 5AGYA 1KNGA 1HD2A 3CRUA 2E7PA 5B8BA 1TOFA 2L6CA 2REMA 5GSTA 2PVOC 3ZMKA 5HR0A 1TJDA 2H70A 3BJ5A 3CSHA 6GSVA 5DJLA 4GRFA 5IMCA 1K0NA 5CRDA 1GSSA 2TRCP 1QUWA 1S3AA 2C0FA 2VLUA 3TRPA 4L8EA 1GWCA 3UIWA 5ABRA 1XWGA 3LQ7A 1XWKA 2PERA 2VLTA 3LSZA 2R6KA 1AQWA 5JCUA 2VLVA 3I43A 2JSZA 1DBYA 2JL4A 2KHPA 1EZKA 5F07A 1JFUA 4ZBBA 1FB0A 4I2UA 5JWOB 2GT5A 1ZZYA 2L6DA 4CW9A 2O8VB 2XC2A 3HY2A 5KN2A 3QFBC 3HZ4A 3KJYA 4AJ8A 5KEJA 1OE7A 4DSRA 4F9ZA 2GVPA 3ERFA 4EL1A 1GLPA 3TKPA 5JCWA 2VCQA 3CRTA 4JE1A 5IMZA 3ZTLA 2H01A 1R7HA 3D22A 5CYYA 2L5LA 4TR3A 1GNEA 1O7UA 1ZMAA 1XWCA 2HXKA 3KH9A 1G0TA 1XW9A 2O89A 4X0XA 2JACA 2ALBA 2TIRA 4EXJA 1V9WA 4XRDA 1TK8B 4HZ4A 3F6DA 3HXSA 2ZNMA 3DRNA 1ACVA 5J3RA 9GSSA 4GXZA 1OC9A 4Z7XA 4MJBA 1THXA 5DVBA 4OO5A 4I8BA 4DVCA 1ERUA 4MMMA 5CREA 3PH9A 4PNFA 1G6YA 2AV4A 4PURA 1V2AA 2CVBA 1YEPA 4OD7A 4TOPA 3GRXA 3TJGA 3VI7A 3LORA 3DXBA 1SKRB 4H86A 6GSUA 2GQKA 5FWGA 1X9MB 2VCXA 3TCOA 1XFLA 2FGXA 2GSQA 2N5FA 3GKKA 2HZEB 4MPFA 2H8LA 4NMUA 2CVDA 4YAVA 5AIVA 4OCFA 4G2EA 4IELA 3GSTA 1EV9A 2YZUA 4N0ZA 3GTUB 1ERVA 5DALB 1Z3EA 1G7OA 2N5BA 4XHMA 2FLSA 1MTCA 5CRGA 3N5OA 5HFIA 4HZ2A 2B7JA 1ERWA 2MBSA 4TR1A 3C7MA 2PN8A 2CQ9A 2YJ7A 1SYXA 2H19A 3HD5A 2R4VA 4GLTA 1JZDA 2H71A 3F63A 1GSUA 1V58A 5ECMB 4ZXGA 1PQNA 3QCPA 3FEUA 4JRRA 5ID2B 1MDIA 3J7Yb 3RAZA 4MABA 3G9BA 3TKRA 5ECLB 1ML6A 2YJHA 1A8YA 3QAGA 4JZQA 3GKNA 2OE1A 2B1KA 4Q5NA 1TRVA 2C0DA 3MWHA 3PR8A 2RIIA 4AJ7A 3NZNA 1IYHA 1YF1A 5EPFA 2GLRA 3FRCA 2YCDA 3AY8A 4O7HA 2GZZA 2XBIA 3A5WA 1WPIA 4V2LA 1W4VA 4WEYA 1LU4A 1A2LA 2O85A 3UMAA 3E0UA 3HDCA 3ZYWA 2H1GA 2YZHA 4KAEA 1HNAA 5FHIA 2M46A 4LL4B 5IMFA 3U6VA 2CZ3A 3F3QA 1XXUA 4MH3A 4ZL8A 1TK5B 1X5EA 2DJJA 3KZQA 2WCIA 3IXRA 2GSRA 5LNKe 3CMIA 1EGRA 1GP1A 5ECPB 3Q74A 5EY6A 3GA4A 1GL8A 2GSSA 1XVQA 2QGVA 1FVJA 2MMNA 3M9JA 2IFQB 4WR4A 2FA4A 1PN9A 4XS4B 2I1UA 4PUFC 1K0CA 1WOUA 3CBUA 5HR3A 13GSA 2AUVA 4RI7A 2K18A 3CTGA 1C72A 1B8XA 3FYGA 1XIYA 5J5NA 3ISOA 3QAWA 5AN1A 4CDOA 2OJLA 1I5GA 4V1Ap 3QDNA 3S9FA 1A2MA 3GH6A 1Z5YE 2X64A 3KP9A 2GTUA 4J2FA 3GMFA 4KB3A 4N10A 4J56E 2VL2C 4F0CA 1PKWA 1WRYA 2P5QA 1EGOA 2PUKC 4NAXA 4K8MA 2RM5A 5J9CA 2V32A 3M8NA 2DJ1A 2R3XA 2R5GA 3CSJA 5FT3A 1A0FA 1YKAA 3GYKA 4F03A 5KN0A 2MMOA 3WGDA 3LFLA 3V1WA 2CT6A 4PQ1A 6GSTA 1B9XC 3HVVA 4IW9A 4Q5QA 4KNDA 1A8LA 4POMA 1HNBA 2E2MA 2GQLA 4EDZA 1JZOA 1HYUA 3BBYA 3FW2A 1PGTA 1UC7A 2OADA 3WD6A 2KOKA 2LRNA 4MK3A 2WFCA 2YANA 3TGZA 2A4VA 2NBSA 5B7CA 1Z9HA 5ECSA 4MH2A 2DJ2A 1GTAA 2HZEA 3A2WA 4PQIA 1PSQA 1JHBA 2HSHA 4OWYA 2TRXA 1O85A 1GSEA 4TXVA 4PGTA 4V2MA 1HQOA 14GSA 4ZL7A 5A4VA 3GNJA 2H76A 6GSXA 3MAKA 1VF3A 4ILFA 1KBNA 3GTUA 1EEJA 3RHCA 4L5LA 1ZCPA 1V40A 5G1KA 3ME8A 4WF5A 4K7NA 3O76A 2FHEA 2LNTA 4HUAA 1SJIA 3P90A 1SL1B 5A5KA 4WETA 2L57A 1G7EA 4HJMA 2F3MA 4OCEA 3DWVA 1B4QA 1GLQA 5ID2A 2HZFA 3PINA 4TR0A 3IK9A 5J9BA 1A0RP 2CAIA 4FYUA 1T4ZA 2VD1A 2X99A 1U88A 2L4QA 2DIYA 1EP7A 4F82A 2OE3A 3VWWA 3L9VA 1JZWA 3VWVA 4TR1B 2P5RA 2IJYA 1BEDA 2AYTA 5D93A 4OMVA 2IMKA 4K6XA 5F8BA 4FH8A 3RPNA 5ELAA 3D0ZA 2OACA 5COHA 2C0GA 5IMVA 1FW1A 3APSA 1MD3A 4MPGA 3DMLA 3GUSA 7GSSA 1M7TA 3Q19A 4BVXA 5B6NA 4EVMA 1M2AA 4F2IA 5D9TA 4MF5A 2LS5A 4NPBA 2EIQA 1AXDA 3KTLA 2IPAA 3C1SA 1S3CA 3QOUA 1TU7A 2HFDA 3VFIA 1M99A 3FKFA 2RUFA 1Y25A 4IGJA 1KTEA 1SJZA 5DQYA 4RQXA 1RW1A 3NOFA 3VWXA 2JZTA 2RM6A 5GSSA 3BD2A 3SBCA 2YP6A 4IQAA 3F6FA 4EE0A 2IFQA 5CNWA 19GSA 3TKSC 5CRWA 4JU5A 17GSA 5B6MA 4XS4A 4KDYA 4ECCA 2J23A 4MZCA 1K0AA 1VF4A 4D73B 3M0FA 5JWRB 2CVKA 2DIZA 5G2ZA 2LJRA 1F3BA 5ECNB 1URMA 1AC1A 2YPMA 4TXOA 3RHBA 3TB2A 1Z7RA 4ECJA 3TRXA 1X5DA 4K1FA 5D9WA 5E4WA 3KP8A 2WB9A 2AJQB 1U3IA 2H75A 1EP8A 1ZYEA 4JR4A 3HJMA 3WT1A 1B4PA 4LLRA 3GL3A 4IBPA 1GSQA 1LBKA 4HQZA 1XW6A 5DJMA 2VD0A 2MYGA 3GV1A 1OVNA 1B9YC 4GSNA 2IMEA 2KP2A 2YWMA 3LYKA 1GSFA 2KUCA 3O3TA 2OA7A 3F0IA 2CAQA 2L5OA 3TKQA 4CHSA 1T8EB 2FUG2 1NSWA 1CQHA 4AGSA 4G10A 5DAKB 5EVOA 1EOHA 4YQMA 3K8NA 1O8WA 1S3DA 2OBKA 3WGXA 2H30A 3GIXA 5ELGA 1ERTA 3EYTA 2X8HA 4JBBA 3FZ4A 1QK8A 3A2VA 4OFTA 5CO3A 5D96A 1TI3A 3IPZA 1TDIA 4YQUA 1O6JA 1PD21 5HFGA 2LJAA 1V98A 1NHYA 4HU9A 4XRAA 2I4AA 3TJFA 2VIMA 3EE2A 5G31A 2WDUA 1JLVA 2ES7A 1A23A 4IS0A 3N9JA 2QC7A 2FCHA 1K0OA 2H0HA 2H0IA 4EO3A 3GURA 3QPMA 2CX4A 1F3AA 3DYRA 3QMXA 4XS6A 3HA9A 1H4OA 3LEFA 3TJKA 1SJ6A 3H1NA 4IHUA 5INYA 1T3BA 2FNOA 1FG4A 1SL0B 3GKMA 5HR1A 4MDCA 1CQGA 1SK0A 2VAFA 2AAWA 2F8FA 4N11A 1N8JA 5ECQB 3QAVA 1J9BA 3M1GA 1TK0B 1NW2A 4FYCA 5KN3A 3FR9A 2VCWA 4OO4A 3IOSA 3L9UA 1EEMA 4KCAA 3DVXA 2CA8A 1N2AA 3HVXA 2GT6A 3FY7A 3ERGA 5HQPA 1X5CA 3F4SA 1SU9A 2DJ0A 3C8EA 4IN0A 2RLIA 3UEMA 4PXOA 1DE1A 5DCGA 3D4TA 1Z6NA 5A4UA 3FR3A 3DIEA 1AW9A 3GHAA 5GZZB 1XWAA 3ZMLA 4TRXA 1KEBA 3DEXA 4BWSA 4FIWA 2XBQA 2PBJA 1K0BA 1GSYA 3EU4A 3IA1A 1YY7A 4D73A 3E3EA 3C1RA 5JWQB 4K7OA 4POKA 4TR4A 4KDXA 3A3TA 2ZCTA 2P0GA 1TP9A 3EC3A 4YAPA 2WGRA 2B1LA 3TJJA 3D21A 2FWGA 1BAYA 2F51A 5KN1A 3ZIJA 2C3TA 2OBIA 4HU7A 3UOMA 3L0HA 3OR5A 1BG5A 3G7IA 4V2NA 4ZB6A 1M9BA 5DBQA 1T1VA 2B5XA 2RUEA 2FD3A 1M2BA 1GUKA 3EURA 3VWUA 1R5PA 4WF4A 3KEBA 3KMOA 3O6TA 5A4WA 3ZREA 5CP1A 4TXOB 3UL3A 3VPQA 2NDOA 1F6MC 3MSZA 1ILOA 1G6WA 1SL2B 3Q6OA 1Q98A 2DMLA 1TTZA 2EIRA 3J7Yk 5IQYA 3KH7A 1SK2A 5ECOB 2R37A 1SKWB 2JADA 3FHKA 1FOVA 2HRNA 2V2GA 4ZBAA 2V6KA 1FAAA 4KDUA 5DAKA 2NVLA 2DJKA 3IBHA 2KLXA 2GSTA 3EMXA 1OKDA 1TRUA 3DKSA 2YWIA 1ZYQB 5IMAA 2J9HA 2LRTA 4ISDA 4IJIA 4I6XA 3HJOA 1AQXA 2HLSA 1EV4A 1WIKA 3UBLA 6GSYA 3I69A 1FB6A 3FK8A 4LA1A 2IIYA 1GULA 3P8WA 2K6VA 1ZL9A 3F4RA 5CRHA 2NPBA 2QSIA 2GZPA 4K0GA 2YWNA 4BA7A 1PRXA 5F0GA 1DSBA 3H4KA 1YEXA 2JSYA 3GX8A 5JCGA 3ZVJD 2F9SA 5C00A 3H93A 3CXGA 1W89A 5ECHB 4KCEA 3RBTA 1T4YA 4E8HA 1SD8A 3Q18A 1TU8A 2OE0A 5IMDA 3WT2A 3KCMA 1OAZA 4MP4A 4MJEA 4DSQA 4FYBA 5H5RA 1NHOA 1K3OA 3LXTA 1J08A 4ID0A 1FHEA 4L0WA 5IO0A 2VO4A 4O92A 3EMPA 4O32A 2LKUA 3KD0A 2E2GA 1OC8A 4POBA 3LYPA 2OKAA 3WYWA 2WULA 4KE3A 2HNLA 4EF0A 1M2DA 2V6OA 1H75A 1R26A 4NV5A 3VI5A 3TKSE 1OE8A 1K0DA 1BYEA 4KX4A 2MMZA 4EUYA 2LJKA 2KP1A 1GRXA 3QR6A 1TW9A 3LJRA 4TKYA 4AJ6A 22GSA 1WJKA 4IQ1A 5AIXA 5HR2A 1VF1A 2H6XA 2GQMA 2IWTA 1YZXA 2IMFA 1F9MA 2VL9A 1PMTA 3TOUA 2ZUPA 2MZCA 3TOTA 4KSOA 3VPTA 3GX0A 2H73A 2A2SA 4GQCA 1U6TA 5D8IA 1AQVA 1UA5A 1UN2A 2DBCA 2YV7A 1EWXA 5GAND 2WJUA 2VL3A 1T7PB 2I9HA 4HJ2A 2WRTA 18GSA 3ERWA 2NTOA 1Z6MA 4ZIJA 3GKXA 3IR4A 4IJ3A 2LQQA 2I81A 5DQSA 2HRFA 1E2YA 3HJPA 4BPYA 1GNWA 2IL3A 3HVSA 2PMTA 1X9SB 4IVFA 1XPVA 2G2QA 5D73A 1XBSA 5LD0A 3EVIA 2O7KA 2LNSA 1DE2A 2FWHA 1XVWA 2VL2A 1FVKA 4Q5RA 4ULXA 3W8SA 4LL1B 12GSA 2H1BA 4ZILA 3GL5A 4WBRD 3TRQA 1GUMA 4HDEA 2C80A 4HEA2 1OC3A 4MF7A 4YH2A 3KTBA 1BQ7A 20GSA 3TJBA 1ST9A 2VCVA 3I9V2 4GF0A 1TRSA 2B5EA 4N0VA 3NIVA 3ZIVA 2H1DA 1YKCA 1T00A 1SK1A 4TN8A 4JR6A 3RPPA 1BJXA 4RI6A 5F05A 5B8AA 1I9DA 4K0NA 2PVQA 2L59A 3IAS2 3IRAA 2IMDA 2F8AA 4I97A 4N30A 5GAPD 2H6ZA 5IPHA 4F0BA 3MNGA 1OYJA 4J57E 1PA3A 1U3AA 1THOA 2GS3A 3APOA 2VCTA 3ME7A 5LCZA 3US3A 3JCML 2YOIA 4KUNA 1ZOFA 4NHWA 2O87A 4G19A 1F2EA 4ZB9A 4OFNA 2C1YA 2H66A 3IHQA 5J4UA 2QKEA 1K3YA 1LJRA 4KW6A 11GSA 2G0FA 3KMNA 2B5YA 3G7YA 4EC0A 3IE3A 6GSWA 4ECBA 6GSSA 1PX7A 2EIOA 4KGIA 4KSMA 1GH2A 1OKTA 3UARA 3A2XA 3LGCA 3H8QA 1MEKA 2HI7A 1O8XA 3BCIA 5D9XA 3QFAC 1PL2A 4ZL9A 1TI1A 2B6MA 1O81A 1M9AA 1GUHA 2H6YA 3ZFLA 3BCKA 1PL1A 5IO2A 3F9UA 5DCHA 1R5AA 2YN1A 1K3LA 2B7KA 1Q4JA 5G30A 4IP6A 4E8EA 2XHFA 3CYNA 1M0UA 4NV2A 3ZVJA 5G1LA 4DSSA 4K9ZA 4HS1A 2LEGA 4MLYA 2CZ2A 2HYXA 1A2JA 4HOJA 2ON5A 4ZBDA 5G5FA 3L9SA 3F3RA 5D9VA 2I3YA 1QQ2A 1TRWA 1U87A 3DD3A 1XOAA 4KH7A 2DMMA 1HNCA 2GDRA 4FO5A 5EL8A 4LMVA 2LUSA 4GWRA 1E6BA 3E9JB 2LTKA 3EINA 3UVHA 4MA9A 4LMWA 3UJ1A 4ZB8A 3D4MA 2JZSA 4DEJA 4JEDA 5J41A 3APQA 4XTSA 3IK7A 3ED3A 2EC4A 2M80A 1XWBA 2H1AA 2LSTA 5G5EA 3G7JA 3TKSA 3CTFA 4NHZA 2ON7A 2VCZA 3GFKA 1X9WB 2H0GA 1DUGA 2LQOA 4MJCA 2C0EA 3FZ5A 2X8GA 1NM3A 3EU3A 4MCUA 3C71A 4HI7A 2C3QA 5ENUA 4GCIA 2K8SA 4K7IA 3KXOA 4GSTA 4TVEA 4Q5FA 2X8CA 4X43A 1BX9A 1XOBA 2YV9A 2PPTA 4PQHA 5ECIB 2XPEA 1V57A 3P7XA 1QMVA 5E59A 4XIHA 2BMXA 3IV4A 2N5AA 1XCCA 1PKZA 4ECIA 2H72A 4YQVA 2MBTA 2K8VA 4V1Ag 2CV4A 3GSSA 1SKSB 3M3MA 1K0MA 1WWJA 2VUPA 2A2RA 1A24A 1PX6A 2Z9SA 3SWLA 3I6AA 2VOCA 2LRCA 4RQRA 2WZ9A 5HFKA 4PX1A 3R2QA 3L4NA 4WBJA 2DLXA 3UBKA 2PWJA 4XCSA 4BL7A 3LG6A 3M9KA 4L0UA 4PUAA 2YWOA 2D2ZA 2HSYA 2DSAA 2HE3A 1VRSD 2FY6A 3UVTA 4AF2A 3W8JA 4I2TA 1J0FA 4ML1A 3KM6A 4NXIA 2XPDA 3F4TA 3WGEA 3CSIA 1EOGA 1Z7PA 2AHEA 2C3NA 3F8UA 3P2AA 3HYPA 4WKWA 4RUVA 1GSDA 2M72A 4QL9A 2BJXA 5IIZA 4EKZA 1JZRA 3RDWA 4WXTA 1MDKA 3TUEA 1GTBA 3MDKA 2JU5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite