4ZL7A

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa dsba e82i: crystal i
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
DYTAGKEYVELSSPVPVSQPGKIEVVELFWYGCPHCYAFEPTIVPWSEKLPADVHFVRLPALFGGIWNVHGQMFLTLISMGVEHDVHNAVFEAIHKEHKKLATPEEMADFLAGKGVDKEKFLSTYNSFAIKGQMEKAKKLAMAYQVTGVPTMVVNGKYRFDIGSAGGPEETLKLADYLIEKERAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title Sent packing: protein engineering generates a new crystal form of Pseudomonas aeruginosa DsbA1 with increased catalytic surface accessibility.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 63
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zl7A00
1S3CA 2LTKA 3MWHA 3IA1A 2H1BA 2DIYA 3FKFA 2V41A 2BMXA 5F0GA 2GSSA 4EDZA 2ON7A 1R5AA 3TJJA 1SL1B 1NSWA 5ENUA 2JZRA 1X9MB 4I5QA 2XPEA 1E6BA 3G7JA 2M46A 5CREA 3WGEA 1M2BA 2B7KA 3BBYA 4MMMA 3TCOA 12GSA 1GH2A 3CMIA 1ACVA 2JZTA 3L9VA 1PA3A 3ZREA 3LQ7A 2WFCA 1V98A 2VL9A 1A2MA 1BAYA 3ME8A 4XS1A 1YZXA 1PX6A 4ML1A 2L5OA 1JZWA 3GKMA 4FYCA 4KNDA 3HJMA 4POKA 3NIVA 4Q5RA 1TOFA 2L6CA 3P2AA 2WRTA 2H1DA 20GSA 1U88A 2B7JA 4F9ZA 5IMAA 4OCFA 4TW5A 1SJIA 1OC9A 2BJXA 4G9HA 2K8VA 1OYJA 3ZYWA 2L4QA 3GX8A 2V6OA 2JU5A 2VM2A 1X9SB 1K0BA 1SKWB 2H72A 1G6WA 3Q19A 4KCEA 2VL3A 2KOKA 1K0CA 1XW6A 2OADA 4GQCA 2H6XA 3UVTA 1X5CA 2IMFA 4ZIJA 2O89A 4LL4B 2DJ0A 3KH9A 2MYGA 2EIQA 2QSIA 4V1Ag 5KN0A 3DD3A 1SKSB 4F0CA 3VWUA 4FO5A 1WMJA 4J2FA 3EMXA 6GSWA 13GSA 4HUAA 5AN1A 4ML6A 1HNAA 2YWOA 1J9BA 3LJRA 2DJKA 3IPZA 6GSYA 4F0BA 1PL1A 3F9UA 2A2SA 5ECHB 2FA4A 4TXOA 3TKQA 1FB6A 3GMFA 4PNGA 4X0XA 2TIRA 3LGCA 3F0IA 2VCQA 4ECJA 3TKPA 1XOBA 1OC3A 5ECKB 2RUFA 4F82A 1T4YA 3EINA 3FR3A 3U5RE 3N5OA 3ED3A 3O76A 3UAPA 2KUCA 1SU9A 1ERTA 2CX3A 1B4PA 2ON5A 3QD9A 2KP1A 2C4JA 5AIXA 4YQVA 2CAIA 5A4WA 5LNKe 1M2AA 1M99A 6GSXA 2H71A 18GSA 3S9FA 3ERWA 1VRSD 5INYA 1O81A 1OAZA 5IMVA 4JBBA 1ZYQB 2LNTA 2JADA 1HQOA 2NVLA 3N9JA 4GLTA 3EC3A 4D73B 2HRFA 2IMDA 4POLA 5IQYA 4ZBDA 2G2QA 5B8BA 4ZL9A 4IS0A 22GSA 2OKAA 3TJFA 4JEDA 4IN0A 2PUKC 2DJ1A 2DSAA 3QFAC 3HVXA 4ISDA 1GSFA 1X5EA 2R6KA 5KEJA 3CSHA 3GL5A 14GSA 3QPMA 1ILOA 1DE1A 2X8GA 3RPNA 4HDEA 5G1KA 4JE1A 3P8WA 1UVZA 5F06A 1M7TA 2B1KA 4ZBAA 4E8EA 1F2EA 3GRXA 4PX1A 4OD7A 4BWQA 2A2RA 2XHFA 1O7UA 4V2NA 1NM3A 2NPBA 4XHMA 2GZPA 4PUAA 4J57E 1Z7PA 2YCDA 3GKNA 4IGJA 4TVEA 11GSA 3O6TA 1TI1A 1Z6MA 5IM9A 2GQLA 1ZMAA 3TKSA 5CYYA 2H70A 3LSZA 1AQVA 2YPMA 4MPFA 4MJEA 1ABAA 1GNWA 3C73A 3F6DA 3D5JA 5HR0A 2J9HA 1GSUA 2IMKA 4KAEA 4PGTA 2HI7A 1EZKA 1OKTA 1I9DA 3GSSA 4KDXA 2HYXA 5ECSA 1BX9A 3TRXA 2VCXA 4JRRA 2K18A 2IFQA 2WDUA 3M9JA 3TRPA 1T00A 4OFTA 3ERGA 5COHA 1F3BA 2FA8A 2IL3A 3ZMKA 1G6YA 2H1AA 2IN3A 1THXA 2FD3A 1PN9A 3DKSA 3RDWA 3QDNA 4MLYA 1QQ2A 2G0FA 2C3QA 1WJKA 2LJRA 2AV4A 2FWHA 3RPPA 2X8HA 2L59A 2I3YA 3UIWA 2GVPA 5DCGA 2PBJA 2VM1A 2B5XA 4KSMA 1E2YA 4TN8A 1XWCA 2KP2A 2CZ2A 2DC5A 2GT5A 4LA1A 2XBIA 1F6MC 2H1GA 3HXSA 1B9YC 3FZ9A 3DMLA 3VI5A 4GSTA 1X9WB 2V6KA 3C7MA 5DAKB 1U6TA 2VO4A 1K3YA 4RQRA 1XFLA 1M0UA 3KGKA 2F8FA 4HJMA 5ELAA 2RUEA 3UARA 4PXOA 2KLXA 3GKKA 4CW9A 5GSSA 1O8XA 3I69A 2GT6A 3AY8A 3F6FA 4GXZA 1XWAA 4KCAA 2LQOA 1SL2B 1YJ6A 1HYUA 3G9BA 4GTUA 1EGRA 1JFUA 5KN3A 4MABA 2IPAA 2WCIA 3A5WA 1A2JA 5B7CA 1R4WA 3TJGA 2H0GA 3HYPA 2ES7A 1ON4A 5IO2A 1JZRA 4IVFA 3D21A 3TKRA 1FVKA 5CRDA 3CXGA 1ZOFA 2P5RA 4WF5A 3PH9A 4EVMA 2ZCTA 1GSYA 3ZVJA 1TI3A 2H0IA 1MDJA 2QC7A 2JZSA 2EC4A 1A23A 1M2DA 4DEJA 3KM6A 3KTLA 3G7YA 3WT1A 4Q5FA 2CVDA 4KX4A 5ELGA 1TK5B 2HNLA 3ZTLA 2E7PA 4L5OA 4XRDA 4OFMA 2B5YA 3O3TA 4HJ2A 4HU9A 1JHBA 1WIKA 4NV2A 5EY6A 3F63A 5IMCA 2A4VA 2E0QA 2GTUA 3L0HA 4N30A 3EU3A 3I9V2 5HR2A 3MSZA 4XS6A 1XW5A 2VD1A 4GF0A 1ERVA 1MD4A 3GN3A 3W8JA 4NXIA 1XOAA 2AHEA 16GSA 1PKZA 2RIIA 3GKXA 2PWJA 4OFNA 2MZCA 3IAS2 2HZEB 5ECMB 3APSA 1KNGA 4DSSB 2C0FA 3GHAA 4FIWA 1JZDA 1B9XC 4YH2A 2WB9A 1EOGA 2CX4A 2MMAA 2C0DA 1TDIA 2JACA 3APQA 2P5QA 4JR4A 3FZAA 4ECCA 2VCWA 4MH2A 5GZZB 2C1YA 1YKCA 4FYBA 1SYRA 9GSSA 3VURA 1TRSA 1GLQA 1PKWA 3UEMA 1S3AA 1Z9HA 2H19A 1F3AA 2I9HA 3J7Yk 2H0HA 2LRTA 2QKEA 4POMA 4HEA2 4K0GA 2O8VB 1PD21 2R4VA 4HQSA 4MH3A 4OMVA 2JSZA 1THOA 2GGTA 2CVKA 2CVBA 4KB3A 4WF4A 1TW9A 5ECQB 5F8BA 6GSSA 1TRWA 3WD6A 3QMXA 4QL7A 4AJ8A 1T1VA 2X64A 4J56E 3Q6OA 1AUCA 1EEJA 2WJUA 4ZBBA 4HZ2A 2MMNA 2VL2C 3GUSA 4XS4A 2C3NA 3H93A 1C72A 2I4AA 1GL8A 4EL1A 1ERWA 2GSTA 1U3IA 2WGRA 1JLVA 5D8IA 3QR6A 1VF4A 2IMEA 2K8SA 1YKAA 2FUG2 2YJHA 1N8JA 1RK4A 3H4KA 3ZFLA 2LQQA 1WP0A 3GX0A 3LG6A 3ISOA 1FG4A 3HD5A 4IQAA 2P31A 3RAZA 1O8WA 4MCUA 4EKZA 2IWTA 2K6VA 2KHPA 2OE0A 3ERFA 4EO3A 1VF3A 4TRXA 2X8CA 1ERUA 1MEKA 2F51A 1XVQA 1VF1A 2FWEA 1BEDA 4KGIA 3BCIA 3TOTA 4IKHA 2B6MA 2WS2A 1EOHA 1CQHA 4H86A 3E0UA 10GSA 1A8YA 5G1LA 4DSRA 3PGTA 1TP9A 1X0RA 1GUMA 4CDOA 4F03A 5IMZA 3EU4A 4BA7A 4Q5QA 4NHWA 3VFIA 2CZ3A 1OVNA 2P0GA 4ECIA 2YWMA 5E4WA 1HNBA 4ZB6A 1J08A 2PVQA 4Q5NA 4MJAA 3TOUA 2I81A 1G7EA 4EUYA 5HFGA 5ID2A 1S3DA 1AQWA 2PU9C 3CSJA 3HJPA 4TR1B 1SKRB 1URMA 4RI7A 1DBYA 2FGXA 1FAAA 3NZNA 5DJLA 1K0OA 4OCEA 1JZOA 2K9FA 4XTSA 4YQUA 2N5BA 4P3YB 2MMZA 3OR5A 1O85A 3IHQA 2V1MA 4ZL8A 5KN2A 2MBSA 1O73A 2TRCP 3DEXA 1IYIA 2L6DA 1NHOA 3FK8A 5JWOB 1V2AA 4WEYA 4LMVA 2XC2A 1TU8A 3QAWA 1SYXA 3WYWA 5JCUA 5DALB 3US3A 1EP8A 3QFBC 4KE3A 4EDYA 2PN8A 2DIZA 2OJLA 4FH8A 3D22A 4GRFA 4JZQA 3E9JB 3FZ4A 5J5NA 1KBNA 2C3TA 1MDKA 4OO5A 4DSQA 3IV4A 1RQMA 2YZUA 5A5KA 2YWNA 1UA5A 4Z7XA 1FOVA 5F05A 1KEBA 2EIOA 2YANA 3ZL5A 1TK0B 1JLWA 2XPDA 1B48A 5HR1A 1XWBA 3F3QA 1O6JA 4LLRA 2VAFA 5H5SA 2C0GA 1PSQA 3ZITA 4IP6A 2PGTA 5E59A 5IIZA 4BVYA 2DMMA 4MF5A 2WZ9A 2VOCA 4BWSA 2DJ3A 3GTUB 1TRUA 4GSSA 3HKRA 2HXKA 2VUPA 2MBTA 3KP8A 3V1WA 2YJ7A 2FWGA 1BG5A 2MMOA 4JU5A 5GAPD 4ECBA 5G31A 3HY2A 1Z6NA 4RI6A 1YF0A 3WGDA 5ECIB 1XPVA 2VLVA 4XIHA 4ZL7A 3K8NA 3KMNA 1XIYA 5CAXA 4MZWA 2WULA 3BD2A 4N11A 3GYKA 5D9WA 1FHEA 1ST9A 4TXVA 4KA0A 2VLTA 6GSVA 2AAWA 3DVWA 1B8XA 4YAVA 3VWWA 4BVXA 3VI7A 4MZBA 2DLXA 2AB6A 2AUVA 1SJ6A 4EXJA 1HNCA 3SBCA 5CRHA 1NW2A 4OWYA 3H8QA 5G2ZA 2CT6A 5G30A 2HSYA 1SD9A 1XCCA 2HLSA 3HZ4A 4L0UA 2JSYA 3DWVA 1SJZA 1TU7A 4NAXA 1A0FA 1Z5YE 1HD2A 3E3EA 3D0ZA 1MDIA 1W4VA 3WGXA 1TKDB 1GTIA 1Q98A 1ZZYA 3BOAA 2FY6A 1QUWA 1YF1A 4MZCA 2LRCA 5H5QA 1YEPA 3KEBA 5C00A 1PL2A 3RBTA 2YV9A 2F9SA 4NPBA 2HFDA 3KZQA 3GH6A 2GS3A 4V1Ap 5DQSA 3APOA 4TR0A 4EE0A 2YZHA 5CRWA 5DBQA 2H76A 5EL8A 5F07A 3J7Yb 1GSDA 2OE1A 1OC9B 2ZNMA 3D4MA 3Q74A 3RHCA 4K1FA 1GWCA 5B6MA 2H75A 5ECPB 4KDYA 1XVWA 1ZCPA 4WBJA 3A2WA 2HRNA 1SK1A 5D93A 4BPYA 2H6YA 3U6VA 4HQZA 3L9UA 1PMTA 2IMIA 1LBKA 4NWYA 2EIRA 3A2VA 3D6IA 1TXXA 5ECRB 4D73A 1IYHA 3MNGA 3M1GA 4G19A 2CQ9A 5JCWA 3GURA 1R7HA 3FYGA 2YWIA 3FR9A 3IXRA 3MAKA 3LYPA 1T8EB 3G7IA 3TB2A 2LEGA 2H30A 4LMWA 5HQPA 4TR3A 3I6AA 1PGTA 3PINA 3TJBA 5D9TA 5D73A 1SENA 8GSSA 5D9VA 1W89A 4WKWA 1Q4JA 2VL2A 2O85A 3PR8A 4ID0A 2ALBA 4TOPA 1M9BA 5FHIA 4X43A 3KP9A 3TGZA 2R3XA 4N0ZA 3BCKA 3ME7A 2LSTA 5C04A 2NTOA 1EV9A 3IDVA 2O7KA 2VD0A 1GNEA 2R2JA 3TJKA 1GUKA 4O32A 3VK9A 2GLRA 2LS5A 3UJ1A 2DMLA 2VLUA 2N5AA 3LEFA 4N10A 3GH9A 4QQ7A 4IJ3A 3F8UA 4MPGA 1FW1A 3KD0A 4XCSA 17GSA 2BTOT 1F9MA 1T3BA 6GSTA 3KMOA 4MA9A 4ACSA 3F3RA 3IOSA 3IK9A 1V57A 2J23A 2OE3A 3L78A 4KW6A 4KUNA 2HE3A 1OE7A 1MTCA 4MJBA 5AIVA 4ZXGA 4WETA 5CRGA 3FR6A 1WOUA 3L9SA 1LJRA 4EF0A 1WE0A 1RW1A 1YQ1A 2E2GA 3FEUA 4I2UA 2PMTA 1X5DA 1OE8A 4F2IA 1TJDA 2AYTA 2PERA 4XRAA 4AJ7A 3F4SA 3H1NA 1QMVA 5D96A 1EWXA 2D2ZA 3ZVJD 4O92A 5IMDA 2H01A 4TR4A 3DGQA 1GP1A 3GV1A 3IK7A 2B5EA 1I5GA 3M9KA 1BQ7A 2DBCA 2PPTA 3IAM2 4I97A 1Y6EA 4ILFA 3UBKA 2C8UA 4L0WA 5IPGA 3ZZXA 5KN1A 2OA7A 7GSSA 1ZL9A 3KIJA 6GSUA 4LL1B 3GIXA 3ZRDA 3CTFA 1XBSA 2V2GA 4WBRD 1QGVA 1A0RP 4GSNA 2R5GA 3BJ5A 4YAPA 4YQMA 2GSQA 3IC4A 3UBLA 1VF2A 4K7IA 5DAKA 1Z7RA 1GSSA 1WRYA 2L4CA 1AAZA 2N5FA 2R37A 1V40A 3SWLA 4N0VA 3HHVA 1GLPA 2H6ZA 5CNWA 3M0FA 3CYNA 2IFQB 4IHUA 3FY7A 5ECOB 3C71A 2H8LA 1GULA 3MDKA 4HS1A 5IPHA 3IBHA 3CRTA 1CQGA 3GA4A 5L71A 1LU4A 1GTUA 3FHKA 5JWRB 3UOMA 5J9CA 3VWXA 3P90A 2L5LA 3EVIA 1J0FA 1USBA 1AIUA 1QXHA 3RHBA 3HZ8A 1GTAA 3UVHA 3GNJA 2TRXA 2B1LA 3EMPA 4IELA 3LXTA 2M80A 5FT3A 4I6XA 4IW9A 3GL3A 1OKDA 5HR3A 3CSIA 1FO5A 2IJYA 5J9BA 3FZ5A 2ZUPA 2GQMA 4HU7A 2I1UA 4V2MA 3KXOA 2GZYA 3HA9A 2XBQA 2IIYA 2PVOC 4L8EA 3W8SA 2VCZA 1K0NA 3UMAA 4QL9A 1PRXA 3TDGA 1A2LA 4PURA 1XXUA 2FNOA 1SD8A 4MDCA 2H74A 2NDOA 4AJ6A 5G5FA 2Z9SA 1KTEA 1SK0A 3KJYA 2C0EA 4G10A 1M9AA 5EPFA 2DJJA 4OO4A 2HZEA 3UL3A 2RM6A 4DSSA 2VCTA 2FCHA 1SK2A 4MJCA 3M8NA 4NV5A 4V2LA 4WR4A 3JCML 4IJIA 2LJAA 5DDLA 1Z3EA 1TRVA 2VIMA 4GQFA 1YY7A 4RQXA 4WR5A 1PQNA 2JL4A 4X1UA 2FLSA 5B6NA 1K3LA 4WXTA 3DYRA 2OBKA 2HT9A 2YV7A 1ML6A 3ZIJA 3GSTA 4K2DA 2VCVA 5HFIA 2E2MA 2YN1A 1FB0A 5G5EA 3R2QA 4EC0A 3EYTA 3I43A 3H79A 1K0MA 1H4OA 4G2EA 2RLIA 2LV3A 1K0AA 4AGSA 3C1RA 5A4UA 3CTGA 4ULXA 3LWAA 5HFKA 1XW9A 2B3SA 1PX7A 5J41A 5GAND 5EVOA 2LRNA 4ZB8A 5CO3A 1BYEA 2REMA 2YOIA 3D4TA 4HI7A 3NOFA 4AF2A 1DSBA 2RM5A 3HJOA 4HOJA 3ZLPA 2LNSA 1N2AA 3HDCA 5DVBA 1QFNA 3QOUA 3HCZA 3LYKA 1R26A 5H5RA 5ABRA 2NBSA 19GSA 5JWQB 4IP1A 1WPIA 1AW9A 5ECNB 4NHZA 1GUHA 5LD0A 1FVJA 4K7OA 3EE2A 3KCMA 3C8EA 4I8BA 5A4VA 4NMUA 2DJ2A 3ZFBA 1NHYA 1VGLA 1GTBA 3FRCA 2F8AA 4L5LA 3DXBA 4ZILA 3A3TA 4IQ1A 3ZIVA 1A8LA 1K3OA 2FWFA 3HVSA 3HVVA 3VPQA 2HSHA 2YNXA 2FHEA 3TUEA 4FYUA 5LCZA 1G7OA 3LXZA 3LORA 1EEMA 1XWKA 1U87A 1GSQA 4JR6A 1AC1A 3DRNA 2V32A 2O87A 2GQKA 1XZOA 1GSEA 4O7HA 5DJMA 4K8MA 4O5RA 3VWVA 3C1SA 1K0DA 1ZYEA 2C80A 3VLNA 3GFKA 5DCHA 4XS4B 3A2XA 1T7PB 3QAVA 4MF7A 4MP4A 1DUGA 2GZZA 1QK8A 1UN2A 2CAQA 3TRQA 1GRXA 5D9XA 3M3MA 3KTBA 4TR1A 5IOXA 3IRAA 3EWLA 2GSRA 3F4TA 4POBA 1AQXA 3TKSC 1MD3A 3F4RA 3CBUA 1T4ZA 3CRUA 1B4QA 1G0TA 5IO0A 4CHSA 2OACA 4PNFA 3VPTA 1YEXA 2GDRA 1TTZA 1TK8B 1V9WA 4PQIA 2YP6A 3DIEA 1ZGNA 4K0NA 5IMFA 5CP1A 4TKYA 5IOWA 4ZB9A 1BJXA 5DALA 1DE2A 3DVXA 4PQHA 3EURA 5DQYA 3WT2A 4HZ4A 4MF6A 5AGYA 4GCIA 4RUVA 4GWRA 4TXOB 5JCGA 2CA8A 3ZMLA 1U3AA 1OC8A 4K9ZA 1Y25A 1A24A 2CV4A 3FW2A 5J3RA 4K6XA 3Q18A 4PUFC 3LFLA 3QAGA 5J4UA 1H75A 1V58A 3W6GA 5B8AA 3QCPA 5AISA 1SL0B 2LKUA 2X99A 2QGVA 1XWGA 4E8HA 3P7XA 2H66A 4DVCA 3IR4A 4PQ1A 5ID2B 5GSTA 1EV4A 1UC7A 3GTUA 2LUSA 5FWGA 4I2TA 1F37A 2HZFA 3TKSE 2M72A 2F3MA 2L57A 1EP7A 2H73A 5ECLB 3IE3A 2LJKA 1YDKA 4K7NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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