5B6MA

Crystal structure of human peroxiredoxin 6 in reduced state
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-6
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6mA01
3NIVA 1SK2A 2VL2C 3LJRA 1U3IA 2B6MA 2E2MA 1O8WA 3F3QA 2CX4A 2RIIA 4EKZA 2FCHA 1X0RA 2MYGA 1V2AA 1B48A 4F0CA 2WB9A 1JZRA 5HQPA 4OO4A 1XOAA 3A3TA 3VWVA 4OFNA 17GSA 2A2SA 2CVDA 1GRXA 4G9HA 4JR6A 2FGXA 2A2RA 2GLRA 2PERA 3FR3A 2FA8A 3RPNA 4KCEA 5CYYA 2JZRA 5B6NA 2GDRA 3GN3A 2VAFA 2IJYA 5IIZA 2TRCP 4E8EA 1B9XC 4HOJA 1S3AA 2NDOA 1WJKA 1THOA 4HZ4A 4BVXA 1GSDA 1TOFA 4D73B 4MH3A 4MCUA 5IMDA 1Q4JA 2RLIA 4ZBDA 2PVQA 2VLUA 1PMTA 1VF1A 1ACVA 5B6MA 1X9WB 2NPBA 5EPFA 4HS1A 3LYKA 2IMEA 1UN2A 5EVOA 3TJJA 3BOAA 3A2WA 1ERWA 4LL4B 3TGZA 2QKEA 1PL1A 4AGSA 2FWFA 3R2QA 3QAGA 1QK8A 4TKYA 1ZZYA 3TRXA 4Z7XA 3KTBA 3TKQA 3EE2A 1EEJA 4QL9A 3UL3A 1OC3A 2P5QA 2NTOA 4V2NA 4I2UA 3HD5A 1YF0A 3H1NA 4EO3A 3CSIA 1EEMA 2OACA 3G7IA 4HJ2A 1EP7A 1K0DA 3WD6A 2WFCA 2B3SA 3GURA 4HZ2A 1FO5A 3LORA 3JCML 2I3YA 3HHVA 4TXVA 2E0QA 4NV5A 2Z9SA 4DSSA 1TK0B 3ME7A 1DE1A 3U6VA 3ZFBA 1NSWA 1M2BA 2FY6A 5ECSA 2CZ3A 1GP1A 2ES7A 5D9TA 2C8UA 2HZEA 3I6AA 4OWYA 1O7UA 3WT2A 1PX7A 5DALA 5CRWA 2R6KA 2H0IA 3FR6A 4HQZA 2DJKA 2I1UA 1J08A 3QAVA 4MJCA 1JLWA 4GSSA 3CTFA 1XW9A 18GSA 1U87A 5G5FA 3D22A 1TRWA 5EY6A 3ZFLA 10GSA 3Q19A 3MAKA 4XS4B 3KJYA 2QC7A 2HRNA 2DC5A 3ZZXA 2JL4A 2PUKC 2FWGA 4HU9A 4TW5A 1CQGA 2YJHA 4HJMA 3RPPA 3UEMA 3UVTA 1X9SB 4Q5NA 5COHA 3IXRA 3GL3A 2CVKA 12GSA 1QMVA 2LNSA 4PUFC 3ZRDA 1IYHA 4OD7A 4TR1A 3KM6A 2XC2A 1EP8A 1GUHA 3FK8A 1FVJA 4G10A 3LXZA 3TKPA 2DSAA 2RM5A 2YANA 3DKSA 3LWAA 4ISDA 3GL5A 3A2XA 4GWRA 2KP2A 1BEDA 3GKMA 3EMXA 1AQXA 3FRCA 4XTSA 5DAKB 2IL3A 2M80A 4PGTA 1SU9A 2JADA 1JZDA 4L8EA 3GKXA 2CV4A 4BWSA 1XBSA 3C1SA 1YF1A 2GQMA 5H5RA 3HJPA 4NWYA 5INYA 2GQLA 5IMCA 1GSSA 4O7HA 2MMZA 3F6FA 1UA5A 1GH2A 4RUVA 3E9JB 4WBRD 5DALB 3ZMKA 3A5WA 3GSSA 2DIZA 4IQ1A 4NXIA 1UVZA 5D93A 5ECNB 3WGDA 3ZVJA 2LJAA 11GSA 1QFNA 6GSSA 5IOWA 1PSQA 1OVNA 5KN1A 2IMDA 5J4UA 4PX1A 2CAQA 3UJ1A 4IQAA 2FHEA 2GVPA 4DEJA 4CDOA 1E2YA 1HD2A 3PH9A 2O8VB 2K8SA 4JBBA 1BX9A 2VD1A 1AQWA 3F4RA 4IN0A 3IA1A 4FYUA 4O5RA 1I9DA 1WP0A 3DWVA 3GFKA 3LEFA 2R5GA 4N0VA 2VM2A 4F82A 2VCQA 2K6VA 2RM6A 3GSTA 4CW9A 2MMNA 1GNWA 1SK1A 1YKAA 1YJ6A 2MZCA 4N10A 3G7JA 5JCWA 3IOSA 3TKSC 2GSTA 3KIJA 2YWMA 2MBSA 2H72A 1EZKA 4EE0A 3US3A 1GWCA 3TRQA 2DJ3A 5G5EA 3HZ4A 3QPMA 2J23A 1K0CA 3IV4A 1TDIA 1R4WA 5B8BA 1EGRA 5GAPD 2H0HA 2KOKA 3H93A 1SYRA 5ID2A 2D2ZA 2L6CA 3FHKA 3ZTLA 3U5RE 1H75A 1O81A 2PGTA 2XBQA 4KDYA 1U3AA 2OBKA 3WT1A 3QAWA 4X43A 1AXDA 5D9XA 4Q5QA 6GSXA 3IK9A 1XFLA 2V1MA 2GGTA 2DJ0A 3CMIA 2WJUA 4JEDA 5IOXA 2OKAA 3QDNA 3HVSA 3IE3A 1HQOA 2LQOA 1AUCA 1TRSA 3ZIJA 4FIWA 3F4SA 1XXUA 3P2AA 1TXXA 1Z9HA 16GSA 2YCDA 2HRFA 2YZHA 1T8EB 4KDUA 3TUEA 4NHWA 2HSHA 3RDWA 1ZYEA 1R5AA 4GSTA 3SWLA 2DJ1A 4KDXA 1YDKA 2WRTA 1K3YA 3GA4A 4FYCA 4TVEA 3BCKA 3KP9A 3ED3A 1XCCA 4OCEA 5B8AA 5DQYA 2MBTA 4J2FA 2AYTA 4GLTA 2L5LA 5ECLB 2YWIA 1K3OA 5L71A 1X9MB 1GTBA 1SKWB 1SL1B 1PRXA 3M1GA 5HR2A 1HNBA 4IS0A 4MP4A 5KN0A 3FZ5A 3HCZA 1LU4A 2C0EA 1KEBA 2L6DA 4N0ZA 1QXHA 2VO4A 4RQRA 1PL2A 3L9SA 4WKWA 3KH9A 2K9FA 2H30A 3KP8A 1A2LA 4RI6A 1Z6MA 1EGOA 3DVXA 3GX0A 1GNEA 3IK7A 3KZQA 2WCIA 1XW6A 3NOFA 1SK0A 1UC7A 2H0GA 2JZTA 1LJRA 3GX8A 2XBIA 4YQVA 1M2DA 2LNTA 4K7IA 5ECMB 3FZAA 1SJIA 5C00A 1Z7RA 4KNDA 2VM1A 3DGQA 3M8NA 5G31A 2VL2A 3RHCA 3QFAC 3DVWA 3DD3A 4O32A 4PQIA 3VLNA 3DXBA 3D21A 4WETA 5D8IA 2F9SA 4F03A 1TK8B 3IAM2 1RK4A 1MTCA 1EWXA 2BMXA 2LUSA 5KEJA 2K18A 3CSJA 3IC4A 3QOUA 3GTUB 1AQVA 3L78A 3ZLPA 5JCGA 1F2EA 5LCZA 4OFTA 1B4QA 2IFQA 3VPTA 2JU5A 1TU8A 5IMVA 4O92A 3F9UA 2H1AA 1PD21 3TRPA 2E2GA 2GSSA 3FKFA 1DUGA 2C3NA 5E4WA 3HXSA 4V2MA 5DDLA 4MF7A 2X8GA 2HNLA 2OADA 4X1UA 5C04A 5CRHA 4EDYA 2O89A 4FO5A 5IPGA 2VIMA 2VL9A 2JZSA 2C3TA 1GLQA 2L5OA 3LSZA 4EUYA 4Q5FA 4ILFA 2LSTA 1TI1A 4GCIA 1ILOA 3ME8A 2B1KA 3DIEA 2H1GA 1XVQA 4QQ7A 3TCOA 4PQ1A 2YN1A 2OA7A 1WWJA 3QMXA 13GSA 2OE3A 2XHFA 3GYKA 4V1Ap 2KHPA 2B5XA 3HZ8A 1DBYA 2DLXA 1BQ7A 1AAZA 4DSRA 3KEBA 4MZCA 3MNGA 1JHBA 2IIYA 1TI3A 3FY7A 1X5EA 2DMMA 2LQQA 1N8JA 4IELA 3N5OA 4PURA 4K7NA 3LG6A 4KE3A 5E59A 4EL1A 4MK3A 2GZZA 3TJKA 1TRVA 1IYIA 2YV9A 1OC9A 4YH2A 3UMAA 2G2QA 4XS6A 5JWOB 2HLSA 4LA1A 1O8XA 1TRUA 2IFQB 2C0FA 2H71A 1AW9A 2LEGA 2PVOC 3UBLA 1E6BA 3L4NA 1KBNA 3L0HA 4K1FA 2X8HA 1Q98A 4ID0A 4RQXA 5IPHA 5F8BA 2EIOA 1GSFA 2AV4A 1R26A 3QFBC 2HSYA 2ON5A 3EVIA 3IR4A 4MMMA 4ZILA 1S3DA 3CBUA 1TKDB 5LD0A 2C0DA 9GSSA 1MEKA 2CAIA 5D73A 2AB6A 4LMVA 5D9VA 1MD4A 2V32A 2CQ9A 2F3MA 4K6XA 3RHBA 5GSTA 3WGEA 1TP9A 3HVVA 1SKRB 5DVBA 1TW9A 2FD3A 4KA0A 1G7OA 4ZB6A 1WE0A 3E0UA 3W8JA 1R7HA 4ZB8A 1M99A 3C8EA 4ECIA 5JCUA 1AC1A 3RAZA 1GULA 2EC4A 3EYTA 3BBYA 3VI5A 4KSMA 5DJMA 2LTKA 4DSQA 5GZZB 3E3EA 4PNFA 3KTLA 4G2EA 4JRRA 5ECRB 1BG5A 2PU9C 3H8QA 1THXA 3GV1A 3EU3A 6GSUA 2WS2A 3BJ5A 1YEXA 1M7TA 2JACA 3OR5A 4L5LA 1T1VA 8GSSA 2GS3A 1GSEA 2LV3A 5J9CA 1Z7PA 2GT6A 4KAEA 2GTUA 1A0RP 1ERVA 1WIKA 3M0FA 5F0GA 4DSSB 4L0UA 3UBKA 3ISOA 3D4TA 4GXZA 1XVWA 2YZUA 4L0WA 3ZMLA 3M3MA 4KSOA 4IP6A 2LRNA 3IAS2 1OE7A 5D9WA 4ECJA 1XW5A 5IO0A 1T3BA 5H5QA 2HZEB 3VWXA 3V1WA 3J7Yb 4ECCA 1F37A 1PQNA 5J9BA 1ZMAA 3PINA 2ZUPA 1GSYA 2MMAA 2FWHA 3W6GA 1A2MA 2YNXA 3CRTA 4ECBA 2F51A 3VPQA 5HFKA 4KW6A 3LQ7A 4XHMA 1OC8A 4ULXA 5HR1A 1K0AA 1LBKA 4YQUA 3I69A 4L5OA 4KGIA 3O3TA 1K0MA 4WF4A 4IVFA 3EMPA 2NBSA 1BJXA 1U6TA 2QGVA 1ZOFA 3KMNA 4CHSA 3L9UA 1F3AA 3P90A 1C72A 5HR0A 4TR1B 2TRXA 1GTAA 5A4UA 4IJ3A 1ZL9A 4HEA2 4Q5RA 1RW1A 4ACSA 3UVHA 4V2LA 4WXTA 4NHZA 1JZOA 5JWRB 2OJLA 2N5BA 5AIVA 4ZL9A 5GAND 5DCHA 3GH6A 3ZVJD 4OMVA 2C1YA 5J5NA 3C1RA 2R4VA 4TOPA 1ST9A 4AJ6A 1V58A 3J7Yk 2P5RA 2ZNMA 4I8BA 2AHEA 1ZCPA 4MPGA 1GL8A 5DCGA 4XRAA 2AUVA 5B7CA 4POMA 3TKSA 2YJ7A 2H1DA 1TJDA 2LS5A 4IKHA 2VCWA 6GSYA 1FW1A 3HY2A 5H5SA 1F9MA 3Q18A 2VCZA 3EINA 2LJKA 4ML1A 2LKUA 2HT9A 4FH8A 5HFIA 2IMIA 3M9JA 1JLVA 1KTEA 3KCMA 5F06A 4N30A 1S3CA 2JSZA 1GTIA 2IMKA 3TB2A 3G7YA 2RUFA 4G19A 4IBPA 4WEYA 5ABRA 4ZIJA 4MF5A 4ZBAA 2X64A 4I5QA 1USBA 3RBTA 3TDGA 2OE1A 1VRSD 2EIQA 1WRYA 2N5AA 5FT3A 1BYEA 1HNCA 2VLVA 1A8YA 1SL0B 4BPYA 4F2IA 3LFLA 2JSYA 4V1Ag 1ZYQB 1T7PB 4MZWA 4J56E 1J0FA 2H01A 2F8FA 1O73A 3LGCA 2A4VA 1Z3EA 2F8AA 2VL3A 2HFDA 2L4QA 2OBIA 3VK9A 3HA9A 1WMJA 4WR5A 1Z5YE 2CX3A 4MA9A 1HYUA 2CVBA 5CRDA 5CNWA 3QR6A 1EOGA 4TR4A 1M2AA 1Y25A 1SKSB 2B5YA 5JWQB 1V98A 4P3YB 1GSQA 2DJ2A 4KX4A 3H4KA 1B9YC 1T00A 3HJMA 2BTOT 5AIXA 3ZL5A 1O6JA 2P31A 3F63A 3TOTA 4MJBA 1MDJA 3HJOA 4KB3A 5IMZA 4HQSA 4QL7A 2H8LA 5DBQA 5ID2B 2RUEA 4NV2A 2B5EA 1A0FA 3K8NA 4TXOA 3I9V2 3TOUA 5CREA 5D96A 3BCIA 3M9KA 1ZGNA 2IN3A 1YY7A 4IP1A 4GSNA 4J57E 20GSA 22GSA 5IMFA 4EC0A 4MH2A 5ECPB 4XRDA 4ZXGA 2H6ZA 5ECKB 1PKWA 5A4VA 3GHAA 1EV9A 2KLXA 1TU7A 3PR8A 4TR3A 2VD0A 3S9FA 1U88A 1OYJA 5HR3A 3VFIA 1I5GA 2I4AA 2PPTA 4K2DA 4GTUA 2LRCA 4I6XA 4WBJA 6GSVA 1GSUA 4K8MA 1A2JA 2FUG2 2B1LA 2WZ9A 4EVMA 2M46A 1YZXA 2O87A 3F0IA 3MSZA 4POLA 1KNGA 4I97A 1XOBA 2C0GA 2DJJA 4WF5A 3LXTA 3APOA 4KUNA 1ML6A 3CYNA 3G9BA 4H86A 1V9WA 4MDCA 4AJ8A 3F8UA 1VF4A 1WOUA 4TR0A 3O6TA 3N9JA 1YKCA 5CP1A 1XWKA 4OFMA 1MD3A 2KP1A 5F07A 4MJEA 4XCSA 4XS4A 4TXOB 5ECIB 3TKSE 2GSQA 6GSTA 2YWOA 3UOMA 2VCXA 4ZBBA 1XWAA 3GKKA 3IPZA 1K0BA 2IMFA 1OKDA 1B8XA 5G2ZA 19GSA 2VCVA 5CRGA 2P0GA 4GQCA 2G0FA 3GUSA 2C3QA 2PN8A 2CT6A 3NZNA 5DQSA 3UIWA 3SBCA 4NAXA 1URMA 2I9HA 1QUWA 3P8WA 1FB0A 5DAKA 3GMFA 2YPMA 1SD9A 2HI7A 4PXOA 6GSWA 4MJAA 2L57A 2IPAA 4HUAA 5IO2A 4MF6A 5AN1A 1G0TA 1F3BA 4AJ7A 3CTGA 1SJ6A 3WGXA 2H75A 2O7KA 3ZIVA 3D4MA 1SJZA 2H70A 3CRUA 2LRTA 2B7JA 5ECHB 1HNAA 2VLTA 1NM3A 5FHIA 3VWUA 5ENUA 2HZFA 4PQHA 1ERTA 5G1LA 4YAVA 3FR9A 3C73A 1A24A 3GNJA 4OO5A 3LYPA 2PMTA 1OKTA 3UARA 1G6YA 1PKZA 3GKNA 2REMA 4MZBA 2K8VA 3VI7A 1OE8A 3TKRA 3AY8A 4KCAA 1EOHA 1VGLA 2TIRA 3UAPA 3DMLA 4OCFA 5G30A 1PA3A 2L59A 4HDEA 4IGJA 4FYBA 3KMOA 2DIYA 2H6YA 1ABAA 3EURA 1T4ZA 1X5CA 3Q74A 2V2GA 1OC9B 1Z6NA 5KN2A 2HXKA 2YWNA 1EV4A 4YQMA 3DRNA 1ON4A 4IHUA 1FAAA 3ERFA 5A4WA 3MWHA 1A8LA 1QGVA 1ERUA 3BD2A 2H74A 2V6OA 2DBCA 3ZITA 2XPDA 3F6DA 1TTZA 3KXOA 3F4TA 1K0NA 3Q6OA 1VF2A 4TRXA 3O76A 3FZ4A 1XZOA 1SD8A 3ZREA 5AGYA 3KD0A 1NW2A 2WULA 4ZL8A 3HVXA 2L4CA 3EWLA 5ECQB 4JZQA 2LJRA 1B4PA 1Y6EA 4GQFA 3HKRA 1MDKA 3HYPA 2VUPA 3APSA 4DVCA 3I43A 2HE3A 5KN3A 3D6IA 1BAYA 4YAPA 5DJLA 4F9ZA 1A23A 4GF0A 3WYWA 4K7OA 2ZCTA 2VOCA 1V57A 1J9BA 3TJBA 2N5FA 1JZWA 2H73A 4EXJA 1O85A 3GRXA 5F05A 5A5KA 4X0XA 1GUMA 4TN8A 2C4JA 4IW9A 4HU7A 3L9VA 1FG4A 3D5JA 1AIUA 4GRFA 3IRAA 1XWGA 1VF3A 3CSHA 4BL7A 1R5PA 2XPEA 3ERWA 1DSBA 3P7XA 4XS1A 1SL2B 1XWCA 2ALBA 2QSIA 3F3RA 1GTUA 3TJGA 1XPVA 1NHOA 2ON7A 1FB6A 4POBA 4ZL7A 3D0ZA 1F6MC 4HI7A 4AF2A 2AAWA 3C71A 1GUKA 5AISA 5ECOB 3IBHA 2KUCA 3IHQA 2HYXA 1M9BA 1XIYA 2GQKA 2FA4A 4LL1B 4KH7A 4LLRA 4MPFA 2R3XA 2V41A 2V6KA 1XWBA 3DEXA 3FW2A 3QD9A 2H6XA 2PWJA 3FEUA 4JR4A 3CXGA 1X5DA 2E7PA 14GSA 1K3LA 1SYXA 4NMUA 3A2VA 2R2JA 4WR4A 1MDIA 1V40A 4JE1A 3FYGA 1CQHA 1G7EA 4MLYA 4LMWA 7GSSA 2AJQB 3VURA 1FVKA 2DMLA 2YOIA 3ERGA 4EF0A 5IQYA 2GZYA 3W8SA 2IWTA 2FLSA 4K0NA 4ML6A 3KGKA 4NPBA 2FNOA 2H19A 4BA7A 4BVYA 5EL8A 2H76A 2J9HA 3GIXA 5CAXA 2CA8A 3C7MA 4RI7A 3QCPA 3H79A 5J41A 4JU5A 1M0UA 1QQ2A 2VCTA 2BJXA 4POKA 4K0GA 2GZPA 4N11A 1JFUA 2B7KA 3KH7A 2PBJA 1G6WA 2CZ2A 2O85A 3EU4A 4PUAA 3TJFA 3GTUA 5IM9A 1YEPA 2FWEA 2NVLA 1NHYA 1PGTA 1RQMA 1TK5B 4F0BA 3GH9A 5IMAA 5LNKe 1N2AA 4BWQA 4IJIA 2R37A 3IDVA 2X8CA 4XIHA 5HFGA 2WGRA 3EC3A 1W89A 3APQA 2I81A 2H66A 3VWWA 4ZB9A 1H4OA 2EIRA 5ELAA 1DE2A 2X99A 1FHEA 1SENA 1WPIA 4K9ZA 4D73A 1FOVA 1GLPA 3DYRA 1PX6A 3PGTA 1W4VA 3HDCA 1T4YA 2MMOA 2H1BA 2OE0A 4PNGA 2M72A 5G1KA 5GSSA 2WDUA 2GT5A 4MABA 2YP6A 2C80A 5J3RA 1K0OA 2YV7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite