5B6NA

Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in sulfinic acid state
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-6
total genus 52
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6nA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6nA01
5CYYA 2GSQA 3DD3A 1A2JA 1J08A 2F51A 1I5GA 1X0RA 2QKEA 2IPAA 4V2MA 2IIYA 4MP4A 2REMA 2HRFA 4IQ1A 5HFIA 1AC1A 2YWNA 1PQNA 5CRGA 4LL1B 3HKRA 2LV3A 3BD2A 3D6IA 2RLIA 3LXZA 3VK9A 1QGVA 5G5EA 4GQFA 1PKWA 4JEDA 2HSHA 1T3BA 1XOAA 4ZB9A 5DAKB 1B9XC 4EL1A 2V41A 3F6DA 4IGJA 2FLSA 2JZTA 1TI1A 3E0UA 4NWYA 1YDKA 2C1YA 2L6CA 4L5OA 3EURA 2L59A 3EMXA 4JR4A 1MEKA 4KAEA 2L6DA 2X8HA 2FD3A 4ZB6A 3CSJA 1WPIA 5ECMB 4FIWA 1TRWA 1ML6A 1O8XA 2E0QA 3G7IA 3UBKA 3WT1A 4WKWA 2QGVA 1UA5A 2I3YA 4TXVA 13GSA 1VF1A 1THXA 3EMPA 1Z3EA 3UEMA 5J4UA 1KEBA 2DBCA 1I9DA 5F06A 2YZHA 5H5SA 2I4AA 4EF0A 4ZBDA 4MJBA 3D21A 5KN1A 1V2AA 1PN9A 1QK8A 5GZZB 3UIWA 5IO0A 2KLXA 5D9VA 2IL3A 1A8YA 5F07A 4F9ZA 1EP8A 4ILFA 2VM1A 1SL1B 5ECNB 3HA9A 1GUKA 5AIXA 4OMVA 3KTLA 5AGYA 2DJ2A 3C71A 3FR6A 3GSTA 1AAZA 4PQHA 1K0MA 1QQ2A 3FKFA 4ML6A 5G1KA 2VIMA 4N10A 2YOIA 2OADA 4OFMA 5ECIB 5DQYA 1WRYA 1TOFA 1BQ7A 3Q19A 1X5DA 3GURA 1YY7A 2FHEA 4KDYA 5IM9A 2AHEA 2VCZA 4L8EA 3EC3A 3WT2A 1OC9B 4QL9A 4X1UA 3VWUA 3DEXA 4IS0A 1BX9A 3QPMA 4EDZA 5DBQA 2CQ9A 1HD2A 4HJ2A 2V6OA 2AUVA 4JZQA 2LRNA 3BJ5A 2VM2A 1VRSD 1WE0A 1AIUA 5ENUA 1PL2A 4Q5QA 3JCML 1ON4A 5ID2A 2H74A 3ZIJA 4G10A 4POBA 1OYJA 4EUYA 2DMMA 5JWQB 1XWGA 4MH2A 3E3EA 4MPFA 3VPQA 3GSSA 2LRTA 4NV2A 3CSIA 1Z5YE 1X5EA 1SD8A 3O76A 4TR4A 4IP6A 3GTUA 2V6KA 2X8CA 1WJKA 1EWXA 5A4VA 2V2GA 2WDUA 1SK0A 5C04A 2AJQB 4N0ZA 1ERUA 4K2DA 3TOTA 2MBTA 3ZMLA 4BWQA 3TJGA 3KEBA 5F8BA 2GZYA 1Y25A 4K9ZA 3TKSE 2PN8A 2IWTA 3UMAA 3W8JA 3D22A 5G1LA 4MJCA 2C0GA 3DKSA 2DSAA 4PNFA 2NTOA 3PGTA 3LWAA 3KM6A 3A2WA 3RHCA 2XPDA 3FHKA 3HVSA 1OC3A 3W6GA 3FRCA 3MSZA 1XWAA 5E4WA 2H01A 1M2AA 4DEJA 2R37A 5D73A 1XWKA 3VURA 1OAZA 4BA7A 2YZUA 5ECRB 4K0GA 1M2DA 1A8LA 5JCUA 4BWSA 5C00A 1T1VA 4OO5A 1XVQA 3GN3A 3TKRA 4ZIJA 3FR3A 1YEPA 2C4JA 4K7IA 1XWBA 1ZL9A 5AIVA 4IBPA 2OA7A 3KZQA 2CZ2A 2L57A 3IAM2 3CRUA 3ZIVA 1YKCA 4IJIA 2EC4A 3GL5A 2CZ3A 4TXOB 5CAXA 1R26A 1GSSA 4Q5NA 4DSSA 5ECLB 2GSTA 3BCIA 1G6WA 9GSSA 1PL1A 3MNGA 2E2GA 1GSDA 1GNEA 2A4VA 3K8NA 4POMA 4WBRD 3V1WA 1M9AA 2AYTA 2M46A 3A2VA 3WGDA 4Q5FA 2B7KA 1TRVA 2H1AA 2CVBA 2HZFA 3LQ7A 3TGZA 4ECCA 5HR3A 4P3YB 4JBBA 4EC0A 2B5YA 2PVQA 4OCEA 5IQYA 4KX4A 3HVXA 4KDXA 1V9WA 2GQMA 2MMAA 4IELA 3IDVA 3KCMA 2RM6A 2H19A 1GULA 3U5RE 2CT6A 1ACVA 4TR1A 2NDOA 1PGTA 2DC5A 1TJDA 3VWVA 1Q4JA 4JRRA 4RUVA 1FVKA 1BYEA 2ZNMA 3PR8A 3GH9A 1UC7A 3Q6OA 5FHIA 1XVWA 3KMNA 3NOFA 3M9KA 4JU5A 3WYWA 5HR0A 2X99A 4WBJA 3QDNA 1O73A 4LA1A 3L9SA 2FWEA 2H72A 4AJ8A 4G19A 2MZCA 1EOGA 1X9WB 5HQPA 3FZ4A 1YQ1A 4D73A 3L9UA 2RUEA 3N5OA 1KTEA 5CRWA 4LMWA 3RPNA 4WETA 2OJLA 3FYGA 4XS1A 1ST9A 4HJMA 2LS5A 2YV7A 2PUKC 3GRXA 2MBSA 1O8WA 1LU4A 1Z9HA 2JADA 1R7HA 3UJ1A 1HYUA 1H75A 4XCSA 2GSSA 4PUFC 2H66A 3TDGA 2TIRA 3UVTA 2B3SA 2Z9SA 2C3NA 2IMEA 3I9V2 2C3TA 1S3AA 1B4PA 4BVXA 4WF4A 2DIYA 5DDLA 4JR6A 2OE3A 4CW9A 1YF0A 1OKDA 3EYTA 2H76A 4K0NA 3I6AA 3APOA 5IMCA 3DRNA 4ZB8A 1GWCA 4I2UA 5IMFA 2GDRA 2QC7A 3CMIA 3EU4A 5J9BA 1JZOA 1FOVA 4KA0A 4DSRA 4MK3A 1FG4A 2YWIA 2C0FA 2B5XA 1M2BA 4EE0A 1K0OA 3W8SA 1VF2A 2O87A 12GSA 2DJKA 4K6XA 1ZGNA 1TK8B 2MMOA 5HFGA 1NSWA 2GVPA 18GSA 2E7PA 4KW6A 1XOBA 2YNXA 16GSA 3CTFA 2H1GA 2OKAA 3H79A 5ELGA 2K8SA 4AGSA 4F03A 1AW9A 1SKWB 2IFQA 6GSXA 5DALA 5JWRB 1EV4A 5AN1A 3SWLA 2X8GA 3MAKA 1AUCA 1F3BA 3FZ9A 3LXTA 2PPTA 4CDOA 1HNCA 3ME7A 4XHMA 1B4QA 2K18A 4KCAA 2GQKA 3AY8A 2H30A 4J2FA 2CAIA 4HZ2A 1DUGA 2O7KA 3P90A 4WEYA 1DBYA 4NAXA 1XCCA 4MZBA 4LLRA 4PUAA 3F9UA 5CREA 2YWMA 1C72A 4BL7A 2VD1A 2EIOA 2KOKA 4HZ4A 1XBSA 1U88A 2YPMA 3C8EA 1A2MA 2HI7A 2VLTA 4KH7A 2HT9A 2P5RA 1PX6A 2H71A 5IOXA 4TRXA 2JU5A 2HZEB 2LKUA 1JZDA 3ISOA 1XPVA 3DXBA 2CA8A 2F3MA 3TKPA 1XW6A 3FEUA 1SL0B 2RUFA 4NMUA 3S9FA 4ISDA 1WIKA 2WZ9A 2E2MA 4E8HA 1TRUA 2VOCA 4O7HA 2DLXA 2JZRA 4NPBA 2F8FA 2VCTA 3GFKA 1GSEA 3TRXA 3ERWA 4WR5A 4ZL8A 5DCHA 3H93A 3F3RA 3P2AA 3GX8A 1GLPA 2G2QA 4F0BA 4ZILA 3CTGA 3UARA 3LGCA 2RIIA 5LNKe 4O92A 1R5AA 4XS4A 1IYHA 2CVDA 4MJAA 3HJOA 1VF3A 3IRAA 5A4UA 4IJ3A 2ON5A 1U3AA 1URMA 2B5EA 3GUSA 5F05A 3O6TA 2IMIA 2AV4A 1BG5A 3D5JA 3DGQA 4TVEA 5D9TA 4EO3A 3HD5A 1SKRB 2GT6A 2R5GA 3QFBC 1K0DA 1ZCPA 1TKDB 4L0WA 3O3TA 1NM3A 3CBUA 2YN1A 4I6XA 4RI7A 3HXSA 1YZXA 3EWLA 1QUWA 1UVZA 3Q18A 3F0IA 3GTUB 2L5LA 1GRXA 1QXHA 3R2QA 3LYPA 4XRDA 1XFLA 3DVXA 3QAVA 2H75A 1IYIA 1YJ6A 5INYA 4OFTA 1AQVA 3CYNA 1J0FA 2BTOT 4ECIA 3WGEA 1SD9A 2WGRA 3CXGA 5G5FA 1BAYA 1MD3A 5G30A 1Z6MA 1GH2A 4FO5A 3RBTA 1M9BA 4NHZA 2LJRA 2JSZA 1NHOA 1WWJA 2FCHA 3HJMA 5D96A 2OE0A 2R4VA 4AJ7A 2AB6A 1J9BA 1M99A 2PVOC 1E2YA 2L5OA 2GZPA 1NHYA 1H4OA 2GQLA 3TKSC 4KDUA 2VCWA 4K1FA 3ZRDA 1U3IA 1K0BA 3TRPA 3TKSA 4YQUA 3UOMA 5GAPD 5HR1A 3VI5A 3HCZA 4PGTA 4HU7A 1SL2B 3H8QA 1EV9A 1XIYA 4WR4A 4L0UA 5GSTA 4KSMA 3IE3A 2P0GA 4XIHA 4F82A 4YQMA 1A24A 3VLNA 3TUEA 3F4SA 5CNWA 2FA4A 1GTIA 3HZ8A 2D2ZA 1JLWA 3OR5A 2M80A 1LJRA 4DSSB 3BCKA 1GTAA 4KB3A 1SJZA 4FYCA 2KP2A 3H1NA 2WCIA 4G9HA 5ELAA 5D93A 2LQQA 4MMMA 4N11A 2IMDA 1EOHA 2YWOA 2C0DA 4BPYA 17GSA 1PD21 3KXOA 3ME8A 3FK8A 5DQSA 2VAFA 4KSOA 3EU3A 1GTBA 1AQWA 2H1BA 4AJ6A 3MDKA 1RW1A 2VL3A 1B9YC 1GSYA 2JSYA 1G6YA 2L4CA 1F37A 2GS3A 3L4NA 1TTZA 4TR1B 2PU9C 3DVWA 3ED3A 3US3A 3DYRA 2CAQA 2HLSA 1FW1A 2DIZA 4XRAA 3KD0A 4MZCA 2H6YA 3G7YA 2IMFA 2GLRA 1PSQA 2I1UA 4J56E 1PMTA 1BEDA 1U87A 1XW9A 5DCGA 5KEJA 4WXTA 4Z7XA 2FUG2 2LJAA 1ZYEA 5B7CA 4D73B 1TP9A 2FWFA 5IIZA 4IN0A 2YCDA 2GGTA 1XXUA 3M9JA 4ECJA 1FHEA 5ECQB 2HRNA 22GSA 4TN8A 5ECPB 1EP7A 5HFKA 1TU8A 4GSSA 1U6TA 3KP9A 3QAGA 1F6MC 2F8AA 2ES7A 1TDIA 2CVKA 1DSBA 1G7EA 1ERWA 5B8BA 3QMXA 3C1RA 4ZBBA 3GKKA 4I8BA 1DE1A 3P8WA 1THOA 4YH2A 4HI7A 8GSSA 2PBJA 5A5KA 1JHBA 2VCVA 2YV9A 3BBYA 5J3RA 2H73A 5EPFA 2NVLA 5HR2A 2ALBA 2GT5A 5FWGA 4V1Ap 3TJBA 1FO5A 1RQMA 3VPTA 2CX3A 2BMXA 1R5PA 1PRXA 2XPEA 2OBKA 2VL2C 3LORA 4PX1A 2PGTA 3TJKA 2LEGA 2N5BA 2VL2A 5ECSA 5DJMA 4HQZA 5B8AA 1SK2A 4DVCA 2C8UA 2I81A 1ZOFA 3LJRA 2IFQB 2NBSA 4OWYA 1ZZYA 5DALB 1PA3A 1KNGA 2XBIA 3TOUA 1QFNA 3N9JA 1GUHA 1ZMAA 1T8EB 3QD9A 3IXRA 1WMJA 3NIVA 1S3DA 4L5LA 2VCXA 1EGRA 4FH8A 2EIQA 5EVOA 4MDCA 5J41A 2XC2A 3C1SA 2I9HA 1B8XA 1AQXA 5IPHA 5A4WA 3SBCA 2K9FA 4RI6A 2H1DA 7GSSA 4FYBA 2N5AA 1EZKA 2MMNA 4K8MA 4F0CA 3J7Yk 2H6ZA 4NXIA 2JACA 2LQOA 5ECHB 1HNAA 2CX4A 3TJJA 1EEJA 3GMFA 2FGXA 2CV4A 10GSA 1O81A 4V2NA 1ILOA 4HOJA 5CRHA 3RHBA 2LNSA 1GUMA 1K0CA 2P31A 1JLVA 4BVYA 3ZFBA 5EL8A 2VO4A 3IAS2 5LD0A 3G7JA 5H5QA 1CQGA 4K7NA 4N30A 1MD4A 1A23A 4QQ7A 2HE3A 1T7PB 1SK1A 3F8UA 2C3QA 2VLVA 3GIXA 4PXOA 1Z6NA 1K3LA 4HQSA 3GL3A 2A2RA 2GSRA 3ZLPA 11GSA 3HZ4A 3HJPA 1XW5A 3F4RA 2PERA 2AAWA 1F9MA 6GSUA 1YEXA 2O8VB 5G2ZA 4IP1A 3F4TA 6GSVA 4EXJA 3IPZA 3LG6A 2XHFA 2K6VA 2FWHA 3I43A 4H86A 1RK4A 4MA9A 1T4ZA 2QSIA 3GX0A 3VFIA 2H0GA 1A2LA 4XS4B 1PX7A 3TB2A 3A5WA 2XBQA 1TW9A 3DWVA 1GLQA 2LUSA 3GA4A 4I97A 1Q98A 5L71A 5CO3A 2B1LA 1F3AA 5DJLA 1MDKA 1SU9A 4HDEA 2K8VA 2YP6A 4MPGA 1XWCA 3I69A 3ZTLA 2JZSA 5KN2A 3BOAA 1K3OA 1OE8A 1TK0B 1Y6EA 5CP1A 3RAZA 2MYGA 4HU9A 4X43A 2C0EA 3TKQA 3ZVJD 2OBIA 4ULXA 3EVIA 1SYRA 5DAKA 2HZEA 5ECOB 1EGOA 4MABA 3ERGA 3UAPA 2VCQA 4YAVA 2TRXA 4PURA 2WS2A 3FZ5A 3VWWA 4O5RA 2PMTA 1OVNA 3IV4A 5CRDA 4ML1A 3TCOA 4KGIA 1OKTA 3M3MA 3GKMA 5B6MA 2R3XA 3CSHA 3KGKA 2LJKA 1B48A 3WGXA 1N8JA 4YAPA 4MH3A 1O7UA 1Z7RA 2J23A 4GXZA 1QMVA 1ERTA 5ID2B 2J9HA 2P5QA 3IA1A 2B7JA 4Q5RA 1GP1A 4ECBA 5IMDA 2OE1A 1HNBA 1GTUA 4OD7A 1AXDA 4NV5A 1WP0A 3ZZXA 4V1Ag 1X9MB 4RQXA 3ZYWA 4WF5A 2VD0A 4KE3A 5DVBA 2HYXA 5ABRA 19GSA 3TJFA 1K3YA 2TRCP 3ZVJA 4J57E 5IOWA 2LSTA 4IKHA 2GZZA 4EDYA 4E8EA 3QAWA 3UBLA 3LEFA 4G2EA 3IC4A 1ABAA 4CHSA 4GRFA 4GQCA 1MDJA 2O85A 4MJEA 2M72A 4HUAA 1W4VA 1T00A 1A0RP 5EY6A 4K7OA 1GSFA 3L9VA 4YQVA 3A3TA 2H6XA 5GSSA 4IVFA 5IPGA 4F2IA 2H70A 3VWXA 4XTSA 2BJXA 3CRTA 4GTUA 1X9SB 1M0UA 3M0FA 2WULA 5GAND 4HS1A 1OC9A 3C73A 4IHUA 1YF1A 2IJYA 1JFUA 4ACSA 3G9BA 3GNJA 3IOSA 1V57A 4MCUA 4ZXGA 3ZMKA 2H0IA 6GSWA 4V2LA 4IW9A 3QR6A 5LCZA 1FB6A 3IK7A 2HNLA 5JWOB 1JZRA 1VGLA 4ZL9A 4TOPA 4MLYA 1TRSA 2IMKA 4TKYA 1SENA 3UL3A 3UVHA 4TW5A 3APQA 2JL4A 3IBHA 3NZNA 2LRCA 3M1GA 3EINA 2B1KA 1T4YA 2ON7A 4I2TA 3HDCA 5KN0A 1Z7PA 3VI7A 2V1MA 2NPBA 2YANA 4EVMA 1A0FA 4MF7A 3MWHA 5D9XA 4N0VA 5B6NA 3FZAA 5H5RA 1ERVA 1TXXA 3TRQA 1JZWA 4POLA 2ZUPA 2HSYA 5JCGA 3ERFA 4IQAA 3U6VA 4ZL7A 4PQ1A 3QFAC 3F63A 4FYUA 4KUNA 2WJUA 1FB0A 5IMVA 1M7TA 5D8IA 3DMLA 4XS6A 1CQHA 3GYKA 1OE7A 2X64A 1SJIA 3LSZA 1G7OA 2RM5A 1V58A 3GHAA 4OFNA 2G0FA 1NW2A 4HEA2 20GSA 3EE2A 2B6MA 5AISA 1HQOA 1GNWA 3IHQA 2PWJA 5COHA 1X5CA 4GF0A 4X0XA 3GV1A 2FY6A 2R2JA 1MDIA 3L78A 2MMZA 2C80A 1WOUA 2DMLA 4GCIA 5KN3A 1TU7A 1XZOA 1F2EA 4GWRA 1K0AA 5E59A 3Q74A 4QL7A 2DJ3A 3C7MA 1MTCA 3GKXA 4POKA 1FAAA 3M8NA 1SYXA 4TXOA 1DE2A 1FVJA 3HHVA 3RDWA 2FWGA 3LYKA 1PKZA 1G0TA 3D4TA 14GSA 1KBNA 4LL4B 2DJJA 4TR3A 4KNDA 3HY2A 3J7Yb 2VL9A 2FNOA 5G31A 2FA8A 2KP1A 1GSQA 3QOUA 2DJ0A 1OC8A 4OO4A 3PH9A 1R4WA 3KJYA 1E6BA 5IMZA 5J5NA 2L4QA 3ZREA 4GSNA 1V40A 4O32A 2DJ1A 4KCEA 2IN3A 2A2SA 2LTKA 3FY7A 3RPPA 3WD6A 4EKZA 3LFLA 1VF4A 3IR4A 1SKSB 3F3QA 1EEMA 1BJXA 4TR0A 3D4MA 5FT3A 6GSTA 1W89A 2F9SA 4ID0A 2HFDA 1V98A 3HYPA 3PINA 1YKAA 5JCWA 2EIRA 3KH9A 1UN2A 4MF6A 4I5QA 2WRTA 4PQIA 2H0HA 3A2XA 3KIJA 4PNGA 2ZCTA 2VLUA 3GKNA 5ECKB 1TK5B 2LNTA 5D9WA 2WFCA 1K0NA 2KHPA 2WB9A 4LMVA 6GSYA 2YJHA 2R6KA 3GH6A 2H8LA 5J9CA 4DSQA 3ZL5A 4NHWA 3KH7A 3DIEA 3D0ZA 1O85A 3IK9A 2YJ7A 3KMOA 3QCPA 4OCFA 5IMAA 2KUCA 4ZBAA 3L0HA 4MF5A 1SJ6A 4GSTA 2HXKA 3P7XA 3F6FA 3ZITA 1GSUA 2VUPA 1O6JA 4GLTA 4JE1A 1USBA 2N5FA 1TI3A 3H4KA 2O89A 1S3CA 1ZYQB 3ZFLA 3APSA 4MZWA 4AF2A 2GTUA 1GL8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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