5B8BA

Crystal structure of reduced chimeric e.coli ahpc1-186-yfskhn
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MSLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEITEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYAVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVASHPGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Transition steps in peroxide reduction and a molecular switch for peroxide robustness of prokaryotic peroxiredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C,Peroxiredoxin-2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 48
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b8bA00
2HE3A 3LWAA 1GP1A 4JU5A 2FA4A 4EVMA 2VOCA 3TRXA 2OBIA 5DALB 2VCXA 4OFMA 3A2XA 1KEBA 5ECPB 4V1Ag 3APQA 3H1NA 1PQNA 4MDCA 1FVJA 2R2JA 1T1VA 3CTFA 4TR4A 2B1KA 5L71A 5ECKB 4MJAA 1OC9A 2YZUA 4GF0A 1MEKA 2N5BA 2PPTA 3BJ5A 4TVEA 1ILOA 2LEGA 3VLNA 4FO5A 5G5EA 5AIXA 3MAKA 2A2SA 6GSVA 3ZVJD 1GWCA 4K7NA 5ABRA 1I9DA 1JZRA 3TKSA 1ABAA 3F3QA 1TW9A 3BOAA 2WZ9A 2CV4A 1ERWA 3W8JA 2L6DA 2OACA 1SYRA 1BQ7A 3TJBA 2WDUA 3VPQA 2LKUA 2C0EA 1YKCA 3IAM2 5DAKB 3TJFA 1XXUA 4ZIJA 1TK5B 1GLQA 4RQRA 9GSSA 3TJGA 4HDEA 2NPBA 4ECJA 5F06A 4LLRA 4DVCA 5GSSA 4D73A 3IA1A 5KN1A 1G7EA 2RUFA 1F3AA 4O5RA 5AN1A 3L78A 2GLRA 3ZREA 4LL1B 2CQ9A 3FYGA 1Y6EA 1WP0A 3Q19A 5DCGA 2LRTA 3C73A 3VWWA 6GSYA 3LFLA 1Q4JA 5HQPA 2I4AA 2A2RA 4IP6A 2QGVA 4WETA 5HR2A 4K0GA 3RBTA 4CHSA 4XHMA 4KB3A 1M9AA 1YF0A 1T4ZA 4MZWA 1O6JA 1AXDA 3HZ8A 1EP7A 1AAZA 5G30A 5EY6A 4RUVA 2GT5A 3UEMA 3BCIA 5DJLA 5B7CA 2CZ3A 1AQVA 4Q5NA 3WGXA 5G1KA 3ZIVA 2IMDA 3KCMA 4KGIA 3GUSA 4J56E 2VM2A 2PU9C 2DJJA 22GSA 2MYGA 3RPNA 1Z6NA 3HVXA 3KZQA 4FYUA 3F6FA 3LORA 2IIYA 1OE7A 1XWGA 5KN2A 2MMZA 2AYTA 1QK8A 3GMFA 3UBLA 1GSUA 2VAFA 1R4WA 1R5PA 5DQSA 2I9HA 3ZL5A 3D4TA 3FEUA 2CAQA 1SK2A 1EWXA 4WF5A 4AJ6A 3TRQA 4KW6A 1T3BA 1SU9A 1HQOA 4N0VA 2GSQA 2H1BA 2IFQA 4GQCA 5HFIA 1GNWA 1ZYQB 3MWHA 1GRXA 1K0DA 2ZNMA 4E8HA 4PNGA 3UAPA 1U3AA 5E59A 3CTGA 2HFDA 3QD9A 2P5QA 2P31A 2XHFA 4IGJA 4EXJA 1O8XA 5KN3A 3KTLA 4EKZA 2PVOC 4I97A 5IMZA 1F3BA 3F63A 7GSSA 4WF4A 6GSUA 4IW9A 2KHPA 4K2DA 2C0FA 3QOUA 4IN0A 3QFAC 5ECLB 1PX7A 2H1GA 2LUSA 1PD21 2ON7A 2B6MA 1PSQA 3CSJA 4TRXA 2AB6A 5AIVA 2C0GA 2GT6A 1TK8B 1QFNA 3QAGA 3KMNA 2L5OA 3HZ4A 1O81A 1K3OA 5IMFA 3PGTA 1XW6A 1XZOA 2OA7A 1SENA 2CVDA 1X5EA 4MA9A 5FWGA 3V1WA 2DLXA 4XCSA 1V9WA 1FB6A 1A8LA 1WMJA 4ZILA 2YN1A 3ZVJA 3TDGA 5AISA 2H8LA 1HNBA 6GSTA 5C04A 1NSWA 5ELGA 4GSSA 1YQ1A 2WCIA 1SKRB 2C0DA 1X0RA 5F07A 4D73B 1W89A 4PNFA 3P8WA 3ME7A 4POMA 5D73A 1TRVA 2X8CA 5CNWA 2IL3A 1KTEA 3Q18A 4AJ8A 3G7YA 1K3LA 3EU4A 3TKQA 2G2QA 2IMFA 3IPZA 3J7Yk 1YF1A 3EC3A 1PGTA 3HVSA 5INYA 4OFTA 4ZBBA 2HLSA 2K8SA 2DMLA 1K0AA 4NXIA 1PN9A 3TKSE 2RM6A 5IPGA 5G1LA 4HZ4A 1OC8A 3FY7A 1A2MA 5A4UA 1GSQA 2VD0A 4L0WA 3UBKA 1LU4A 2IMKA 5A5KA 2LNTA 1GULA 1OC3A 2REMA 4JR4A 2GDRA 2YV9A 1M99A 1M9BA 2MBTA 1YEXA 3I69A 3CXGA 3GIXA 4IVFA 4V1Ap 3M9JA 1U87A 4I2TA 4Q5FA 5F05A 2M80A 2H0HA 2DJ1A 4PQIA 2VCQA 1GTAA 3SBCA 2GZZA 2OADA 5IMDA 3ERGA 5G5FA 2HT9A 2A4VA 3LGCA 3E0UA 1VRSD 2VLUA 1CQGA 1MTCA 1JLWA 3WGDA 3ME8A 3D5JA 2FLSA 1ST9A 1MD4A 3WGEA 1TRWA 3RHBA 5A4VA 3LEFA 4LA1A 1K0OA 4K9ZA 4JE1A 2M46A 3GTUA 5HR3A 10GSA 3ZYWA 5D8IA 1I5GA 1HNCA 3UMAA 2LJRA 2QC7A 1THOA 1M0UA 3A2VA 3HXSA 6GSWA 1GUHA 2FCHA 1ERTA 1PA3A 5LD0A 1X9SB 4IBPA 2BTOT 4MCUA 2NTOA 4KE3A 3UVHA 2MMAA 1JLVA 2H01A 2DMMA 1EOGA 4RQXA 4KNDA 2NDOA 2TRXA 1T7PB 4N0ZA 4ZBDA 3IXRA 2JADA 2PWJA 5JWRB 2H1DA 1U88A 3A3TA 4MJCA 3DYRA 3EYTA 5J5NA 1ML6A 1AIUA 5B8BA 1GUKA 4EF0A 3FHKA 1SKWB 4WBRD 3PINA 1H4OA 3LJRA 4EUYA 3HY2A 2TIRA 4LMVA 2X64A 4X0XA 3GHAA 5CRDA 5GAND 3F4TA 4QL9A 3HDCA 4OMVA 2C3NA 1A2JA 4HJ2A 4FYBA 1J9BA 3KGKA 5ECHB 2HI7A 3QDNA 3ZZXA 2P0GA 1S3DA 2L6CA 2V2GA 1NW2A 2VCVA 5J9BA 1FVKA 2DJ0A 2PBJA 4XIHA 8GSSA 2JACA 3GKKA 2H70A 2PUKC 2HSHA 3HJMA 5DCHA 4AF2A 5JWQB 5CP1A 3I6AA 1THXA 3ERWA 5ENUA 2EC4A 3O3TA 4HEA2 4EDYA 4ML1A 3GKXA 1BAYA 1ZYEA 4PX1A 5IMVA 4EL1A 4ECBA 2JZTA 2QSIA 4WXTA 4GSTA 4K7OA 4LMWA 1DBYA 2O7KA 1QXHA 4HQSA 3PR8A 4POLA 1Q98A 2YPMA 2B3SA 2K18A 4I2UA 3ZFBA 1C72A 5F0GA 3WT1A 2C80A 4TXOA 5AGYA 2I1UA 5J9CA 2WULA 1BG5A 1A0RP 4ISDA 2BMXA 3FW2A 2JU5A 2PVQA 1KNGA 2GTUA 4FIWA 1YEPA 1B4QA 3GX8A 4EO3A 2YWNA 2K9FA 3U5RE 1TI3A 5JCGA 2LTKA 4NHWA 1BYEA 2P5RA 2O85A 3GFKA 3N9JA 2H75A 2GSSA 1F2EA 1G0TA 4I6XA 2YJ7A 5ECIB 1MD3A 1EZKA 2C3QA 3IRAA 1HNAA 2AHEA 5F8BA 4J57E 2H1AA 2B7JA 4YQVA 1FB0A 1M2BA 1FO5A 4PUAA 3LQ7A 4NPBA 3LSZA 2AV4A 4JRRA 5HR0A 5GSTA 3KEBA 3K8NA 1QMVA 1FHEA 1UA5A 4O32A 2DSAA 4MMMA 5IOXA 3E3EA 2CX3A 2VUPA 2H6ZA 3GTUB 2YOIA 5IMCA 1VGLA 4K1FA 2KP2A 1O85A 4ZB9A 1TKDB 1NHYA 1PKZA 3L4NA 4XS6A 2HZEA 1EGRA 3LXZA 1URMA 2DJ2A 4JZQA 2Z9SA 3CRUA 3ED3A 4TR0A 3GL5A 4ZXGA 5D9WA 1MDIA 2GS3A 4E8EA 2WB9A 2H76A 3LYPA 3ZITA 2HZFA 2RM5A 2IMEA 4GSNA 1ZL9A 2VCWA 3D6IA 2IWTA 4MF5A 2VCZA 2JSYA 5A4WA 1TDIA 2VIMA 3TOTA 4TR1B 2FWEA 1GUMA 5B8AA 2NVLA 2IN3A 3VURA 2GQMA 4BVYA 3HVVA 3GH6A 3L0HA 4TR3A 5ECQB 5IO0A 1TI1A 3KD0A 1ZCPA 3APSA 2FNOA 1EOHA 2V41A 5ECOB 2X8HA 3F3RA 12GSA 4BVXA 2YP6A 4GLTA 4V2LA 1MDKA 2CVBA 2HRFA 3GNJA 5J3RA 4F0BA 1B9YC 2I81A 4MZBA 4AJ7A 1X9MB 3TB2A 4MPGA 2C4JA 3BD2A 1PRXA 3IOSA 4RI6A 3E9JB 3WD6A 3HJOA 4HZ2A 4MH2A 3KJYA 2CZ2A 1G7OA 5G2ZA 1YY7A 1OC9B 1K3YA 4KSMA 1GTUA 1A24A 1UC7A 2J9HA 2JZSA 3DIEA 2F3MA 3TCOA 1GTIA 4QQ7A 3N5OA 5ECSA 4NMUA 2B5EA 3FZ5A 2V32A 5JCWA 4NAXA 5D9TA 1X5DA 4I5QA 1ERUA 3KMOA 3DVXA 5ECNB 3SWLA 3IK7A 2GSTA 4N10A 1ZZYA 1UVZA 1YZXA 3KXOA 4IHUA 2YWIA 3ZMLA 3TRPA 1XW9A 3EVIA 5LNKe 2M72A 1GSDA 3P7XA 1RQMA 2R5GA 2LQOA 1DUGA 3H93A 3TUEA 4BWSA 4EE0A 1ON4A 4L5LA 2QKEA 4HI7A 2AUVA 1VF4A 4FH8A 3TKPA 1SL0B 1AQWA 4MPFA 2L59A 1ERVA 3VWXA 3OR5A 4DSRA 3I9V2 3F4RA 1IYHA 1GNEA 2YJHA 4GXZA 4YH2A 4KSOA 3US3A 5IQYA 4OO4A 5KN0A 3P90A 3F8UA 1IYIA 4GTUA 3IDVA 4L8EA 2H30A 4BL7A 1QGVA 2VM1A 1SK0A 1GL8A 5JCUA 1W4VA 3QMXA 4Q5RA 4KAEA 1ZOFA 3CSHA 5CRGA 2E7PA 1XVQA 1TRUA 5JWOB 3RAZA 3GL3A 2B7KA 3ZIJA 2OKAA 2HZEB 2DIZA 4MP4A 1EV4A 3CBUA 4OCFA 2H73A 3NIVA 3IBHA 4DSQA 1GSYA 3DKSA 1WPIA 1WJKA 4JR6A 2H72A 3C71A 1BEDA 4XS1A 4K8MA 4IQ1A 1R7HA 1VF3A 2FY6A 3VK9A 3C1SA 4HOJA 3QAWA 1TJDA 2R37A 2XPEA 4TXVA 3TJJA 2EIOA 2L57A 2LV3A 2EIQA 2FWHA 4IP1A 2O87A 1M2AA 2GZYA 1OE8A 2R6KA 1X5CA 1YKAA 2HXKA 5B6NA 4HUAA 2OE3A 2WRTA 2IFQB 2IPAA 1GH2A 1SL1B 1TRSA 3JCML 4K0NA 4NV5A 1RK4A 1O73A 2VL2A 5DBQA 5DAKA 4KH7A 2ZUPA 3U6VA 4ZBAA 3IR4A 1WRYA 3Q6OA 1SKSB 3ERFA 4PQHA 2F8FA 1GTBA 1TU8A 1RW1A 1PL1A 4L5OA 3VFIA 2VO4A 4WEYA 3MDKA 2GVPA 2WJUA 1VF2A 3CYNA 2H66A 3FK8A 2CAIA 2RUEA 2XBQA 3UL3A 5IPHA 3ZRDA 4KUNA 2N5AA 3GURA 3ZLPA 1XIYA 4P3YB 4BA7A 4BWQA 4KDXA 2GQKA 2DJKA 1XWCA 2GGTA 3DEXA 5IMAA 4WR5A 4YAPA 4BPYA 3TJKA 4XTSA 2X99A 1QUWA 2V6KA 3HKRA 3KM6A 2EIRA 3UOMA 2DC5A 4POBA 1T00A 1E6BA 5ID2A 3QR6A 5CAXA 1U3IA 1S3CA 3IHQA 4OD7A 4ZL9A 1WOUA 1QQ2A 2DBCA 3S9FA 4KDYA 3BCKA 1XFLA 1EEJA 1KBNA 5IO2A 1O7UA 3QPMA 4OWYA 2GSRA 3D22A 3FR9A 4ULXA 4IQAA 4TOPA 2LJAA 4HU9A 4XRAA 4GRFA 2VL9A 3P2AA 2PMTA 4RI7A 1A8YA 3DRNA 4JEDA 3HJPA 4NV2A 1EEMA 2KLXA 3UVTA 2OE0A 3DGQA 3WT2A 3A2WA 3AY8A 2D2ZA 4IJ3A 1V58A 3F6DA 3HD5A 3J7Yb 1OKTA 2AJQB 18GSA 1XWAA 4ZB8A 2FWGA 2BJXA 1E2YA 2H0GA 1YDKA 1NHOA 2OJLA 1J08A 4N30A 4G19A 1TK0B 3D4MA 2OE1A 5CREA 1JHBA 3LYKA 2C3TA 1F37A 4H86A 1FAAA 1K0CA 2VL3A 4POKA 4MJBA 11GSA 1T4YA 1PKWA 3GKNA 1A2LA 1ACVA 1EV9A 3DD3A 2JSZA 3LG6A 3H8QA 2H71A 4IS0A 1R5AA 1A23A 4ZL7A 5D96A 3FRCA 3QAVA 1DE2A 3O76A 2ZCTA 2MMNA 4MLYA 4TW5A 4MJEA 1MDJA 3ISOA 1CQHA 2L4CA 3M3MA 2L4QA 2MBSA 4MF7A 3F9UA 2ES7A 1SJ6A 4ECIA 1Z9HA 1SJZA 1OYJA 5G31A 1SJIA 5IIZA 3VI7A 2B5YA 3EWLA 1Z7RA 3C8EA 2H6YA 3CSIA 2JL4A 5ECRB 3IV4A 5LCZA 1FW1A 1XWBA 1J0FA 2ALBA 3H4KA 1V98A 2VLTA 1F9MA 3C7MA 3M8NA 2X8GA 2G0FA 1G6YA 3H79A 3QFBC 1TU7A 3EURA 3GX0A 4G2EA 2E2GA 4F9ZA 16GSA 1B4PA 3GSSA 5KEJA 1LJRA 2LRCA 4MF6A 1XPVA 1DSBA 5EPFA 3HYPA 13GSA 5ID2B 1TXXA 2JZRA 3D21A 5DJMA 1HD2A 2B5XA 1XBSA 5D9VA 2VL2C 3GYKA 4PURA 1LBKA 5GAPD 2LS5A 3GH9A 2WFCA 2WS2A 4KCAA 5D9XA 1FOVA 3DXBA 1U6TA 3A5WA 2FUG2 4KA0A 2FWFA 1BJXA 3KH7A 3Q74A 3G9BA 4F2IA 4O7HA 1B48A 1TTZA 2FHEA 4XRDA 1EP8A 1TP9A 4TN8A 3I43A 3UARA 4HJMA 1O8WA 2I3YA 5EVOA 14GSA 5GZZB 1OKDA 4OCEA 2YCDA 1JZWA 2L5LA 2B1LA 3FZAA 1H75A 1XVWA 2HSYA 4GQFA 2PGTA 4TXOB 4DEJA 3DWVA 3ZFLA 2N5FA 3W6GA 5IOWA 3F4SA 4GWRA 4K6XA 3ZMKA 3FR3A 5HFGA 3F0IA 2KUCA 1Z6MA 5HFKA 3UJ1A 2HNLA 1XOAA 4Q5QA 4MZCA 3VWUA 2H0IA 5C00A 6GSXA 2R4VA 4MABA 1K0MA 2VCTA 1PX6A 2LJKA 5DVBA 1SYXA 4J2FA 2DJ3A 2LQQA 3L9VA 5D93A 4DSSA 3BBYA 2VD1A 4AGSA 4OO5A 3DVWA 3IE3A 3VI5A 3D0ZA 3EINA 6GSSA 3GV1A 4EC0A 2YANA 4PUFC 3RHCA 3KP8A 4XS4A 2FD3A 3DMLA 2H74A 2V1MA 2E0QA 3L9UA 4PQ1A 4KX4A 4YQUA 2YWMA 1X9WB 1K0BA 1AC1A 2XC2A 1Z5YE 4WBJA 4ECCA 4ZL8A 3ZTLA 2XPDA 1JZOA 3MNGA 3MSZA 2O89A 2C1YA 3G7IA 4F82A 3NOFA 4KDUA 4ID0A 3EU3A 2J23A 3GA4A 1GLPA 5ECMB 1S3AA 1AW9A 5DALA 1XCCA 17GSA 2HYXA 2O8VB 5FHIA 2F8AA 1R26A 3IK9A 4K7IA 3KP9A 5E4WA 2CT6A 4YQMA 5FT3A 5CYYA 3IC4A 2FA8A 2OBKA 4IELA 3GKMA 5H5RA 3TKSC 2C8UA 4HU7A 2CX4A 2XBIA 3NZNA 4YAVA 3FR6A 4V2NA 3W8SA 1PL2A 3QCPA 1DE1A 2PN8A 5ELAA 1OAZA 4WR4A 1USBA 3TGZA 2CA8A 4ILFA 4HS1A 4MH3A 4N11A 3RPPA 4G10A 1EGOA 4HQZA 5J41A 2ON5A 3EE2A 2RIIA 2KP1A 5J4UA 2R3XA 3M1GA 2E2MA 1UN2A 2K8VA 3HCZA 3L9SA 1XWKA 3EMPA 2LNSA 3FZ9A 5H5QA 3CRTA 4CDOA 1TOFA 3CMIA 4X43A 2TRCP 3KH9A 4IJIA 2FGXA 20GSA 3IAS2 4WKWA 1VF1A 4L0UA 1FG4A 1AQXA 2KOKA 1V57A 3EMXA 1GSFA 2MZCA 4LL4B 3GSTA 5B6MA 1B8XA 4CW9A 3LXTA 4QL7A 2GZPA 4NWYA 3G7JA 1WE0A 5DQYA 3R2QA 3HHVA 1Z3EA 2RLIA 4V2MA 2YV7A 4KCEA 2AAWA 2LRNA 5COHA 4F03A 4MK3A 1M7TA 5HR1A 1AUCA 1SD9A 3UIWA 1HYUA 1GSEA 1WIKA 5CRHA 3GRXA 1JZDA 1B9XC 1NM3A 1Z7PA 19GSA 4ACSA 5CRWA 4ZB6A 1SK1A 1N2AA 4JBBA 1JFUA 2YNXA 1V40A 2YWOA 4PXOA 1M2DA 3VPTA 3VWVA 2PERA 4O92A 2CVKA 3TKRA 3PH9A 2HRNA 3FZ4A 4EDZA 2IMIA 1G6WA 2VLVA 4X1UA 1SL2B 1YJ6A 2V6OA 1T8EB 4DSSB 5H5SA 3M0FA 4GCIA 4TR1A 3WYWA 2F51A 4FYCA 3RDWA 1A0FA 2LSTA 2H6XA 3HA9A 2MMOA 1WWJA 4OFNA 4PGTA 4G9HA 1PMTA 4ML6A 1SD8A 2H19A 1OVNA 2GQLA 4XS4B 3M9KA 2DIYA 1ZGNA 2K6VA 4NHZA 1Y25A 1K0NA 3KIJA 1GSSA 3O6TA 3KTBA 1XW5A 3C1RA 2NBSA 5EL8A 4I8BA 4Z7XA 4IKHA 2WGRA 1F6MC 5DDLA 4F0CA 4TKYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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