5CNWA

Crystal structure of a novel disulfide oxidoreductase from deinococcus radiodurans
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
KIRVDIWSDIACPWCYIGKRRFESALGQFPQRDQVEVVWHSFELDPSARPLNPIAMRDGLAMKYSISPAQAQGSLDHMTQTAAQEGLEYHFDRVKLANTFLAHQLIHYAAEQGQGDAMKERLLRAYMSEGQNVNDLDTLQKLAAEVGLDAGAARAALEAGTYAQAVRYDEAQAQQLGITGVPFFVLGGKYGVSGAQAPETLLGALSQVWAEQHPAPLTMLGQDAPAEGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title drFrnE Represents a Hitherto Unknown Class of Eubacterial Cytoplasmic Disulfide Oxido-Reductases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans (strain atcc 13939 / dsm 20539 / jcm 16871 / lmg 4051 /
molecule keywords FrnE protein
total genus 85
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cnwA01
3EE2A 1YJ6A 2RM5A 2C80A 3ZMKA 1FHEA 2VCZA 1ERVA 1XWBA 4CDOA 4K1FA 5IOWA 1OKDA 2X8GA 5IMCA 1A2MA 1BQ7A 2VLTA 1YDKA 4WBJA 4TXOA 2PGTA 2CAQA 3ZL5A 2GGTA 1SU9A 1THOA 1M2BA 3VI7A 3EYTA 3W8JA 1TU7A 2X8HA 1PRXA 2G2QA 4IP6A 2VD0A 4G2EA 1IYIA 3LEFA 4IHUA 3GFKA 2QKEA 2GT6A 5DJMA 5KN2A 2YN1A 1KBNA 2R4VA 2HZEB 1WPIA 4WKWA 3A2WA 3HJPA 2HT9A 3HHVA 1ZGNA 4ZBBA 3A2XA 4OCFA 4GCIA 1SD9A 3APSA 1K3OA 3GHAA 2LNTA 2LSTA 1OE8A 1ZYEA 4KE3A 2DJJA 2HLSA 3GKXA 4ECBA 1XWKA 3D4MA 1M0UA 3D21A 3LQ7A 1TK5B 1F2EA 1AUCA 3EVIA 4NV5A 3HD5A 4IN0A 2GZZA 4KUNA 3EU3A 4WXTA 1ST9A 3M9JA 1DE2A 3KIJA 5IOXA 1UC7A 1VGLA 4D73A 2YZHA 4MPGA 3FRCA 5LCZA 1PSQA 4XS6A 1JZRA 2C8UA 2B1LA 1QK8A 3TJJA 5J9BA 5ABRA 2GT5A 1JLWA 2LTKA 1A23A 4J2FA 2OE0A 1O73A 2IL3A 2WRTA 3HVVA 4DSSB 3QFBC 2YV9A 4Q5FA 3P2AA 1AAZA 2KHPA 3KP9A 1YF0A 4JEDA 4JRRA 14GSA 5F05A 5H5SA 3ZMLA 2MZCA 4NV2A 4ECIA 2LJKA 5IQYA 2YJ7A 5EY6A 4NAXA 1PMTA 4N11A 4PX1A 3ZYWA 3O76A 2GSSA 3TKQA 1MD3A 1O8WA 3TKSC 4L5LA 3ZLPA 2IJYA 3S9FA 4Q5RA 2GDRA 3US3A 1Q4JA 2RUFA 3HY2A 1ZMAA 4ZILA 4F0BA 2DLXA 4N30A 2EIOA 1O85A 4V1Ap 5JWQB 4FYCA 3VPTA 3EU4A 3TJBA 4V1Ag 3IR4A 2B3SA 2GS3A 2P31A 2E2GA 4I8BA 5HR2A 2ON7A 3IA1A 3C1RA 3F0IA 4HZ4A 5FWGA 3R2QA 1HQOA 4K6XA 4HS1A 4POMA 3I9V2 4K7NA 5CRGA 1H4OA 2AB6A 4EDYA 2X99A 1S3CA 5DCGA 1Q98A 1QMVA 1WMJA 2O7KA 3L9VA 1QQ2A 1SK1A 2J9HA 3IDVA 2RLIA 1GH2A 3GV1A 2B1KA 4DVCA 5CRHA 3FZ4A 3WD6A 5F06A 1NSWA 3TRXA 3LWAA 4I2TA 3GH6A 4F0CA 4I6XA 1XWAA 1U87A 3UJ1A 4YQMA 4WR5A 2LRNA 1PA3A 2L59A 2ALBA 2WDUA 2C1YA 4KW6A 1O8XA 4ZB9A 1A8YA 3MNGA 2DIYA 5HR1A 1YKCA 2JZRA 3GRXA 2F9SA 1TRSA 5IPHA 2JACA 5CP1A 4MPFA 3QR6A 2B5YA 4AJ6A 1OC9A 9GSSA 4EDZA 3D4TA 3FR3A 4Z7XA 5GAND 1EP7A 3HZ4A 4TR1B 4MA9A 3AY8A 3FEUA 1K3LA 1QXHA 4HI7A 2H1GA 4ZBDA 1JZWA 3TKRA 2FWEA 2E7PA 2H0HA 4MP4A 4BPYA 1JFUA 3IRAA 5DAKB 1TRWA 3L78A 3N5OA 5JCWA 3IPZA 1K0BA 4MH3A 2KP2A 4BWSA 4I97A 3UIWA 3TOTA 1B9XC 4KNDA 1WE0A 2HE3A 2OBIA 2WZ9A 4HJ2A 4KSMA 5B8BA 3KCMA 3UVHA 2FA8A 2JU5A 4L0WA 1VF4A 1T7PB 2VCXA 2R3XA 1UVZA 3DKSA 1B8XA 5JCGA 4V2MA 2NDOA 3KTBA 2VM2A 4ISDA 4XIHA 2FNOA 3F3QA 2B7KA 3DYRA 1SK0A 2VLVA 3GL5A 2GSQA 1A2LA 2LRTA 2IFQA 3MWHA 3UL3A 4TW5A 1MDJA 3ZREA 3FZ5A 3HA9A 4HUAA 4XTSA 3TKSE 4L5OA 1TU8A 1PD21 5D73A 4KCAA 5GSTA 4IW9A 5AIXA 2V2GA 2A2RA 2E0QA 3H79A 1DE1A 1SJ6A 2LJRA 1V58A 1WJKA 2KUCA 3QDNA 4TR0A 4ZXGA 3UOMA 1XW5A 2DMMA 2CX3A 3GKNA 1U6TA 5A4VA 4PQIA 1BX9A 2V6KA 5DALA 4MABA 3GL3A 3KH9A 3WGXA 1YZXA 5HQPA 2G0FA 2XPDA 5DQYA 2L5LA 2VCQA 3ZITA 2RUEA 6GSUA 2KOKA 4RI6A 2YV7A 3IE3A 4GSSA 4YAPA 2MMZA 5F8BA 2OACA 3RHBA 5LNKe 1TOFA 3F6DA 2YP6A 4MF5A 2YWMA 2RIIA 1XZOA 1I5GA 3KZQA 4HQZA 4ECCA 4HEA2 3KP8A 5G2ZA 1GRXA 3HJOA 2C0FA 3Q19A 4ULXA 4O7HA 3H93A 2CAIA 1YEPA 1XVWA 2FHEA 1SYRA 16GSA 3ZFLA 1T1VA 1GNWA 5AIVA 3WYWA 5HR3A 1PGTA 2P5QA 1FOVA 1ZL9A 1DSBA 2CT6A 4J56E 3FW2A 4XS4B 4O32A 2DIZA 1Z6NA 3QD9A 1SJZA 1W89A 5G5EA 2OA7A 1XCCA 4PXOA 1XOBA 5DBQA 1UN2A 1ACVA 2HZFA 4WR4A 4QL7A 3IC4A 2REMA 3LFLA 2GQLA 2ES7A 4HDEA 4OFNA 2BJXA 5IMFA 2AHEA 4GSNA 1Z9HA 22GSA 4FH8A 4TKYA 1SKRB 4ZB8A 3M9KA 4TVEA 1YF1A 3RHCA 2AUVA 3KMOA 1OVNA 19GSA 3DGQA 4J57E 3GH9A 1M9BA 4ECJA 3VI5A 3C71A 4OO5A 1URMA 2I1UA 1TK0B 4HQSA 3GIXA 4ZL8A 1M7TA 2B5XA 3CSJA 2DJ3A 1KEBA 1BAYA 4K7OA 3GKKA 3RDWA 1O6JA 3ERFA 3VWUA 2M72A 3SWLA 3H8QA 4G10A 2ZUPA 3CSIA 1M9AA 1Z7RA 1CQGA 1TRUA 2C3QA 1G7OA 1XXUA 4DSRA 4JR4A 2H8LA 4K7IA 3EURA 2IMDA 3M1GA 4G19A 1NW2A 3ERWA 3L9SA 1SK2A 1PN9A 4MF7A 4DEJA 1DUGA 3KMNA 4LMWA 3G7YA 3APQA 1EGOA 1FB6A 5B8AA 1K0OA 2MYGA 1GP1A 1T00A 4WF5A 1J08A 4NWYA 2JZTA 2K8SA 2HSHA 4GQFA 3C7MA 4OFMA 3FZAA 3TJGA 2ZCTA 5ID2A 2H1DA 3CMIA 1TI1A 2B7JA 4O92A 3D22A 5EVOA 3BBYA 2WULA 2HSYA 4TRXA 2OE1A 3NOFA 1KTEA 4TXOB 1BEDA 2CA8A 2R5GA 1XVQA 2PWJA 3LG6A 4X0XA 4JBBA 2P0GA 2ZNMA 1I9DA 2N5AA 3BJ5A 2CQ9A 2L57A 5ECOB 1JLVA 5A4UA 1GSYA 2NPBA 3HDCA 1FB0A 2XBIA 1MDIA 3HJMA 1B4QA 2VL3A 5G5FA 1C72A 3NZNA 4JU5A 1V40A 5HFGA 3Q74A 3HZ8A 1GLPA 1ZZYA 3F3RA 1XBSA 5KN0A 3GN3A 2CX4A 2JSZA 1OC8A 1JHBA 2YJHA 3DXBA 1PL2A 3DMLA 2WFCA 2CVBA 1GUKA 1GSSA 4MLYA 2F8AA 2K8VA 5ECIB 3VURA 4LA1A 3FR6A 1VF1A 3A5WA 4MK3A 1T8EB 3ZFBA 5J5NA 4NXIA 3EWLA 6GSTA 2H0GA 6GSXA 1OC3A 2L4QA 4HZ2A 4D73B 4IKHA 2VAFA 5D9TA 1OKTA 2H0IA 4RUVA 4KSOA 5F0GA 5CO3A 4HOJA 4OD7A 3FYGA 4AJ7A 2GQMA 1MEKA 5B6MA 1YY7A 4MJCA 3I69A 1EOHA 3EINA 3RPNA 3F4TA 1HNAA 4X43A 1IYHA 4HU7A 2K9FA 1V9WA 3KH7A 8GSSA 1PKWA 4K8MA 4IJIA 5G31A 4DSQA 5JWRB 4MH2A 1GSQA 3U5RE 3PR8A 4QL9A 1EP8A 1CQHA 5ECMB 3BCIA 3BOAA 3VLNA 2CZ2A 3P90A 3WT2A 2H71A 11GSA 3C1SA 1TTZA 5KN1A 3DRNA 4ID0A 1Z7PA 3GNJA 1Y6EA 5DQSA 3QOUA 4QQ7A 4EC0A 2XPEA 4GTUA 1M2AA 1WOUA 4AGSA 2RM6A 4ZBAA 3LSZA 4PQ1A 3WT1A 3GKMA 2H70A 1N8JA 5ECPB 2AJQB 4ACSA 2J23A 1GLQA 1GSEA 2IMIA 4GWRA 1QFNA 4K0NA 2VL2A 1GSFA 5IMZA 3GTUA 2A4VA 1RK4A 2VUPA 1XW6A 3I43A 4KDYA 2I4AA 5GAPD 1R7HA 1TP9A 2VOCA 1R5PA 2H73A 2K6VA 3F6FA 2M46A 2GZYA 5ECHB 2GZPA 1R5AA 3O6TA 5DVBA 4OWYA 1WIKA 4TN8A 1G6YA 2I81A 1SKSB 2DJ2A 6GSYA 1G7EA 1SYXA 2H6XA 4F2IA 3TKPA 3KXOA 3CRTA 4MZBA 3GURA 3UVTA 3MSZA 3C8EA 3IK9A 4BVXA 3H4KA 4NHWA 2GTUA 3PINA 3DWVA 1X5CA 1RQMA 1SJIA 4MMMA 4TR4A 4PQHA 4G9HA 3IOSA 1B9YC 3IV4A 1UA5A 2IIYA 1OC9B 5C00A 12GSA 1F6MC 5DCHA 2FY6A 1PKZA 1YKAA 5KN3A 3D6IA 3UBKA 3QAWA 3ZRDA 4MDCA 2JSYA 2I3YA 4KH7A 1F3BA 5A5KA 2CVKA 2CZ3A 2HI7A 2DJKA 1A0RP 1AQWA 4OFTA 4WETA 5G30A 4MJEA 2YANA 1E2YA 5G1LA 1K0DA 5ECLB 3IK7A 5J9CA 2YOIA 3QCPA 5J41A 4IELA 4P3YB 1ILOA 3ZZXA 1G0TA 5ECKB 1OAZA 2PMTA 5E4WA 3F9UA 3UEMA 1X9WB 1GTBA 2LJAA 1FG4A 5IIZA 3GYKA 2VO4A 5GSSA 3GUSA 2WGRA 5JWOB 2H75A 1XW9A 3GX0A 3WGEA 4N0VA 1S3AA 4LL4B 5HR0A 3F8UA 3MAKA 4PURA 2O85A 3W6GA 2KLXA 2MMNA 5IMVA 2FUG2 2BMXA 2TRCP 1X5EA 3ED3A 1XWGA 3P8WA 5D96A 2YZUA 4RQRA 3VFIA 4PNGA 2IFQB 2LNSA 2MBTA 1QUWA 4RQXA 4K0GA 1EEMA 3EMPA 2YWIA 2IMEA 1K0CA 3DIEA 2YWNA 3L0HA 4POBA 6GSVA 3LYKA 5AISA 5D8IA 1FAAA 3SBCA 2OJLA 2OKAA 3A3TA 1VRSD 2I9HA 1PX6A 4YH2A 4WF4A 3RPPA 1HNCA 1TXXA 2H1BA 4XCSA 3CXGA 5AN1A 2WS2A 3E9JB 1YEXA 2LQOA 2DBCA 5DALB 2H01A 4AF2A 3HVSA 1ML6A 2GVPA 4EO3A 2FLSA 3E0UA 3ME8A 4Q5QA 3G7JA 1VF3A 1GUHA 2L6DA 1VF2A 4GXZA 4EXJA 3HCZA 18GSA 5LD0A 1NHYA 5CRWA 3KD0A 2HZEA 2MMAA 2FA4A 4X1UA 5E59A 4XS1A 2WJUA 3MDKA 3TRPA 3EMXA 2YCDA 5IMDA 4K2DA 1F37A 4EL1A 1GTIA 2XC2A 5CYYA 1O7UA 2V41A 1LU4A 2PU9C 20GSA 3F4SA 1AIUA 5CREA 4POKA 5EPFA 3J7Yb 2VD1A 3V1WA 3VPQA 2VL2C 1Z6MA 1K0AA 2OADA 3ZIJA 4ML1A 4ILFA 1K0MA 4LMVA 1JZDA 1HYUA 5D9XA 2NVLA 2TRXA 1BJXA 3GA4A 1GUMA 2FWGA 3A2VA 1TK8B 5F07A 2HRNA 1ERWA 2MBSA 2R37A 4KDXA 3K8NA 2P5RA 1MDKA 2PVOC 2PUKC 5J4UA 2MMOA 2N5FA 1EV9A 4DSSA 2HRFA 2IMKA 1DBYA 2VL9A 2EIQA 4ZIJA 3ZIVA 2H72A 2AV4A 3TCOA 3UBLA 3APOA 1EEJA 1RW1A 3J7Yk 2H6ZA 4YQUA 2OE3A 4NMUA 2GQKA 1N2AA 1WP0A 4ZL7A 5ELAA 3LJRA 1XOAA 2CVDA 4LL1B 1A8LA 1AC1A 1R4WA 3IBHA 2V1MA 4FYBA 1BG5A 2IN3A 4XHMA 1T3BA 2EIRA 3LYPA 1A2JA 3O3TA 1WRYA 4ZB6A 1GNEA 3VWXA 2B6MA 2FD3A 3DD3A 4ML6A 4GSTA 5H5QA 2QC7A 2VIMA 2H1AA 3D5JA 4PNFA 2PBJA 4MJAA 4E8EA 1PX7A 2GSTA 5C04A 2F51A 6GSWA 5CAXA 1EWXA 1XIYA 1M2DA 1SD8A 5FT3A 1EGRA 2HYXA 2LS5A 2YNXA 4GQCA 2H74A 2DMLA 1LJRA 2QGVA 4BA7A 5J3RA 3CBUA 5D9VA 4F82A 2HFDA 4TOPA 2LKUA 5ID2B 1X9SB 2DJ0A 3TRQA 1ABAA 2YWOA 2HNLA 2XBQA 1NM3A 1XWCA 2AYTA 2ON5A 2M80A 1HNBA 1FVJA 2NTOA 4MJBA 3CTFA 2PERA 1GULA 3VK9A 2IWTA 3HXSA 2FGXA 1TKDB 3ZTLA 2R6KA 7GSSA 1A0FA 4I2UA 2A2SA 3CSHA 2OBKA 2FWFA 2NBSA 1ZOFA 2LUSA 1T4YA 2N5BA 4WBRD 1A24A 4IBPA 4PUFC 2WB9A 3GMFA 4V2LA 2E2MA 1Y25A 3QFAC 4IS0A 4RI7A 2X8CA 2PN8A 4KAEA 2VCVA 5GZZB 1U88A 5ELGA 4HJMA 4V2NA 2IPAA 5FHIA 1J9BA 3D0ZA 1H75A 1SL1B 3BCKA 3LXZA 4IP1A 1YQ1A 2L6CA 4KDUA 5CRDA 3P7XA 3Q18A 5IMAA 3I6AA 3KJYA 4KGIA 1F9MA 4FIWA 5H5RA 4WEYA 3HKRA 1U3IA 3GSSA 3ME7A 1M99A 3RBTA 4TR1A 2IMFA 1AQXA 1X9MB 2QSIA 4EVMA 4XRAA 3PH9A 1B48A 3ISOA 1TI3A 2C0GA 4O5RA 2V32A 4GRFA 1EV4A 2GLRA 4MZWA 4EE0A 4MZCA 5DAKA 3ZVJA 1ZYQB 3DEXA 6GSSA 2YPMA 1ZCPA 1THXA 3F63A 4KA0A 3KEBA 5HFIA 4IGJA 3PGTA 3QAVA 1XFLA 5INYA 1AQVA 3HYPA 4IQ1A 2FCHA 3FK8A 2F3MA 1MD4A 4POLA 4MCUA 3UAPA 1GTUA 3H1NA 3GX8A 2V6OA 4PGTA 1FVKA 1TDIA 1X0RA 4IQAA 4CW9A 1E6BA 2H66A 3QAGA 2H30A 3EC3A 3L9UA 1EOGA 4YAVA 13GSA 5IM9A 4YQVA 2DC5A 3IAM2 5ECSA 2WCIA 5ECNB 4IJ3A 4ZL9A 1FO5A 1MTCA 4NHZA 5ENUA 2LEGA 2BTOT 4F9ZA 10GSA 4OO4A 1GTAA 3E3EA 2D2ZA 3N9JA 5L71A 4I5QA 5D9WA 2JL4A 1O81A 3GSTA 1Z3EA 3BD2A 2LQQA 1EZKA 3M0FA 1K0NA 1AW9A 3U6VA 5G1KA 2F8FA 3LORA 3GTUB 2L4CA 3M8NA 4EF0A 4L8EA 1SL0B 4HU9A 2B5EA 3LGCA 2DJ1A 2H6YA 3C73A 5ECRB 3VWWA 1V57A 2H76A 1J0FA 3KGKA 1TJDA 1AXDA 2XHFA 1USBA 5IO2A 3NIVA 1X5DA 3IAS2 5IO0A 3TB2A 2PVQA 4Q5NA 2C4JA 2FWHA 4KX4A 4GF0A 5A4WA 3DVXA 1K3YA 2KP1A 1SL2B 1GSUA 2LRCA 2O89A 3L4NA 3TDGA 4FO5A 3G7IA 1ERTA 2TIRA 3DVWA 4MF6A 4EUYA 4NPBA 5AGYA 1BYEA 3OR5A 4PUAA 3TKSA 3RAZA 1ON4A 4EKZA 4L0UA 4LLRA 1XPVA 4AJ8A 2LV3A 1F3AA 4OCEA 5D93A 5DDLA 4JZQA 2K18A 4N10A 3WGDA 2Z9SA 1SENA 3UMAA 1KNGA 3CYNA 2VCWA 4FYUA 3TGZA 2O8VB 4BL7A 3M3MA 4KCEA 3ZVJD 5IPGA 2L5OA 3QMXA 1GWCA 2VCTA 4XS4A 4F03A 4TR3A 1V98A 3JCML 4CHSA 3KTLA 1JZOA 1B4PA 4TXVA 1PL1A 3F4RA 3TJKA 1GL8A 2C0DA 3IHQA 4KB3A 1TRVA 4BVYA 1OE7A 3HVXA 1S3DA 1V2AA 4XRDA 1T4ZA 5KEJA 3CTGA 2C3TA 3FY7A 5CNWA 1FW1A 1Z5YE 4OMVA 4E8HA 2C3NA 5ECQB 2DSAA 1LBKA 3QPMA 4JR6A 5JCUA 2HXKA 2X64A 2CV4A 3LXTA 1QGVA 1HD2A 1SKWB 1ERUA 5B7CA 3FHKA 4IVFA 3FR9A 4JE1A 3ERGA 3KM6A 2H19A 1PQNA 5HFKA 1OYJA 1R26A 2R2JA 5EL8A 3CRUA 4N0ZA 2EC4A 2VLUA 2JADA 17GSA 3IXRA 2JZSA 4H86A 1G6WA 5COHA 3G9BA 3FZ9A 4BWQA 3TOUA 2C0EA 3TJFA 3FKFA 4K9ZA 1NHOA 2GSRA 1TW9A 1W4VA 2PPTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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