5CO3A

Crystal structure of a novel disulfide oxidoreductase from deinococcus radiodurans crystallized in presence of dtt
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
238
structure length
229
Chain Sequence
EKIRVDIWSDIACPWCYIGKRRFESALGQFPQRDQVEVVWHSFELDPSARPLNPIAMRDGLAMKYSISPAQAQGSLDHMTQTAAQEGLEYHFDRVKLANTFLAHQLIHYAAEQGQGDAMKERLLRAYMSEGQNVNDLDTLQKLAAEVGLDAGAARAALEAGTYAQAVRYDEAQAQQLGITGVPFFVLGGKYGVSGAQAPETLLGALSQVWAEQHPAPLTMLGDGQCAVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title drFrnE Represents a Hitherto Unknown Class of Eubacterial Cytoplasmic Disulfide Oxido-Reductases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FrnE protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans (strain atcc 13939 / dsm 20539 / jcm 16871 / lmg 4051 /
total genus 91
structure length 229
sequence length 238
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5co3A01
2IMKA 3KTLA 2FA4A 1TP9A 4MJAA 4IELA 2V2GA 2GQLA 1GSYA 1XIYA 4LA1A 3EC3A 1TRSA 4WKWA 3EINA 1F6MC 2HLSA 4WXTA 1WE0A 2R37A 4LLRA 1X5DA 4IQAA 2C0GA 1PQNA 3F3QA 3PR8A 4DVCA 1VF1A 1U3AA 4HZ2A 2GZPA 3QMXA 1TK8B 2H1DA 3IXRA 2IPAA 5IOWA 1QGVA 2OADA 3VWWA 1U88A 4KX4A 5IMCA 2DJ2A 4XCSA 3CYNA 3EVIA 3GUSA 2YZUA 4MZBA 2GZYA 4EVMA 3KD0A 4GF0A 3VWUA 4HDEA 3CRTA 2LJKA 4HU7A 2DBCA 2HNLA 3CMIA 4O5RA 1FW1A 4POKA 1YF1A 3WGDA 1M7TA 2G0FA 1XFLA 4IJ3A 4L5OA 3FR6A 5ABRA 1B9YC 2OJLA 5DAKB 5GSTA 2B6MA 2DJKA 1SYRA 3V1WA 1PD21 3GTUB 4HEA2 5EL8A 3EWLA 2OBIA 2PWJA 3GKKA 2VD0A 4IHUA 1BYEA 4IJIA 5J9CA 1TJDA 2GQMA 1GH2A 1M2AA 2H1BA 2RLIA 1WPIA 3C71A 5AGYA 6GSWA 1M2DA 3FYGA 3PINA 4HI7A 4PX1A 2YV9A 1B48A 2VCZA 1U6TA 2I1UA 3M9KA 2H70A 3KIJA 3IA1A 3EURA 2X8HA 4ULXA 5ECNB 4K2DA 2LJAA 2B7JA 4D73B 3CTFA 2VM1A 3WYWA 1X9MB 1AC1A 2WRTA 2GSTA 2LRCA 2XBIA 2GSRA 5KN3A 2DC5A 2RIIA 2KHPA 5G1LA 1DSBA 5F8BA 2B1LA 2JSYA 2F8FA 1XPVA 3KMOA 3ZITA 1YEXA 2NDOA 3S9FA 3TKSE 1EGOA 4OFMA 5C04A 4K6XA 3WGEA 1Z5YE 4GXZA 4OFNA 22GSA 1G6WA 1PN9A 2HRNA 3BD2A 3ZIVA 3EYTA 2LUSA 3QOUA 2Z9SA 3ERGA 1C72A 4TRXA 4G10A 1R4WA 3FHKA 1PKZA 17GSA 1OE8A 3GV1A 2IMIA 1T1VA 4WF5A 3Q19A 1O8WA 2WDUA 1FG4A 2VCWA 4DSRA 1SK2A 3HVSA 4HZ4A 11GSA 4F9ZA 2YJHA 1A0RP 5H5SA 3L9UA 4MP4A 4ECBA 1ERTA 4FYUA 1OVNA 3TJFA 1RK4A 1THXA 3US3A 3APOA 3D0ZA 2LNTA 4J2FA 4DSSA 1TW9A 4N0VA 2K8SA 4KNDA 1HNAA 1W89A 5CO3A 1Z9HA 1OAZA 5IQYA 1K0OA 2L6DA 1TDIA 3HA9A 5GZZB 1PL2A 3TOUA 5DJMA 3CSJA 3BOAA 3HHVA 1TRVA 1Q4JA 3GKXA 2CZ3A 2BTOT 5INYA 1JZOA 4NHWA 2I9HA 1DUGA 5HFIA 4JR6A 2YPMA 3BCKA 1DE1A 3WT1A 5HR3A 1ST9A 3ME7A 2CAIA 1NHOA 4AGSA 2R4VA 1FVJA 2FCHA 1URMA 2PN8A 4KDUA 1WIKA 2F8AA 5A4UA 3GIXA 10GSA 1XWCA 3UIWA 2DLXA 3L0HA 5COHA 2H19A 4PUFC 1A0FA 4KW6A 5ENUA 2MMOA 3HD5A 3H4KA 1SKWB 2YP6A 1V57A 3FEUA 1W4VA 5DCHA 4FYBA 1X5EA 3KZQA 2IFQA 3VWVA 3FR9A 1K0DA 3G7IA 4CW9A 2KP2A 2P0GA 2YANA 2XPDA 3M9JA 4TVEA 2CV4A 1NM3A 1GSFA 2H30A 4POBA 2XC2A 3GA4A 3M3MA 4IKHA 1TI3A 1LJRA 3UL3A 3CSIA 1MEKA 3M1GA 3HZ4A 4AF2A 2J23A 2PU9C 4KGIA 4PXOA 2P5RA 4PQ1A 1Z7PA 3RDWA 3KH9A 3R2QA 2VL9A 3NZNA 2V6KA 1U87A 4RUVA 2EC4A 1ABAA 1GUMA 1TK0B 3LQ7A 3QR6A 6GSUA 2H8LA 3WGXA 5JWRB 1QXHA 1K3LA 3TKPA 4MK3A 5D9VA 1VF2A 4I8BA 4XS1A 3DMLA 3EU4A 3G7JA 4LMVA 4OO5A 3A2WA 2GDRA 3TKSA 2H75A 1A8LA 4FO5A 3M8NA 2LRNA 4HQZA 2O89A 2AJQB 5D96A 1ON4A 2C4JA 5J41A 5IMZA 4Q5RA 2PPTA 5ID2B 3GH6A 3IR4A 1YKAA 3DD3A 5ECRB 1K3OA 2LKUA 2GTUA 5CYYA 3GKNA 3GYKA 1EEMA 3LSZA 1TI1A 3NIVA 4KDYA 1OC3A 2HXKA 1SL0B 1BQ7A 4TXOB 1SK1A 5F06A 2HZEA 5KEJA 3MDKA 1X9SB 4H86A 2LQOA 3ED3A 5CREA 2MMNA 3LORA 3DYRA 2ON5A 3LYKA 1B4QA 2GT6A 1R26A 5CRHA 3UJ1A 3F6DA 3ISOA 1A23A 2K18A 2FLSA 3GFKA 4RI6A 2OE0A 2OE1A 2VAFA 3DVXA 3HY2A 3D4TA 4IBPA 4K1FA 4KCAA 3TDGA 5JCUA 4OO4A 5J5NA 1USBA 4EXJA 3HXSA 2YCDA 3W8JA 1V40A 2LTKA 3LEFA 2ALBA 2YWOA 4BL7A 5D9WA 1ZL9A 3L4NA 2FD3A 3GMFA 2O8VB 3J7Yk 3KM6A 1JHBA 2HZFA 6GSVA 4ISDA 9GSSA 5G2ZA 3RHCA 6GSSA 3LG6A 3FR3A 2B7KA 3F9UA 3IBHA 1F3BA 3KP8A 3IE3A 2B5EA 2DJ1A 2H73A 2M46A 1KNGA 4K0GA 2TIRA 3L9VA 4EUYA 1YQ1A 3BCIA 4V2MA 5B6NA 5JWQB 3FK8A 2H0IA 4GTUA 1GTUA 1F37A 1SENA 2LEGA 3D21A 2GSQA 1BAYA 3IV4A 1T3BA 1MDKA 1EOHA 2HE3A 2P5QA 3BJ5A 5J4UA 1T8EB 2WCIA 3ZMKA 2DIYA 4OWYA 2NTOA 4X0XA 4MMMA 3GHAA 2E0QA 2H0GA 3G7YA 3UARA 3ZFBA 3WD6A 2AB6A 6GSXA 5A4VA 2RM5A 4MLYA 1FO5A 2RUEA 4MPFA 4K9ZA 2LV3A 2GZZA 4ZXGA 2CT6A 4NAXA 1GTIA 1Z6MA 4N10A 4ML6A 3LGCA 4GSSA 1M99A 3TJKA 4ML1A 3TJBA 1OC8A 1RQMA 1TKDB 2K6VA 2H0HA 20GSA 1Z3EA 1QUWA 4G9HA 2LSTA 5KN2A 2YV7A 3QAGA 4NV2A 3QFBC 4PURA 3MNGA 1WOUA 4MA9A 3CXGA 5LD0A 4F0BA 2V6OA 1KTEA 3QD9A 1ERUA 2PBJA 3ZFLA 2X8CA 2ZNMA 1YJ6A 3P90A 2YWNA 3A5WA 3DWVA 2CA8A 1XWGA 4OD7A 3KMNA 4F0CA 2VD1A 5ECQB 8GSSA 1OC9B 3E3EA 4RI7A 4NPBA 3DRNA 1T4YA 4K7IA 2CAQA 2JU5A 2IWTA 4IP1A 2IN3A 4KA0A 6GSYA 3F6FA 5IM9A 5D9XA 3PGTA 3FZ5A 1BEDA 3GNJA 1PA3A 4WEYA 1GLQA 1SD8A 3RBTA 3SWLA 1O7UA 3O6TA 4WR4A 1OKDA 2I4AA 4JEDA 4JRRA 5G5EA 3HJMA 1XWAA 1X9WB 5ECPB 4MCUA 4GQFA 3TOTA 4MZWA 3E0UA 14GSA 4BPYA 5B7CA 3VWXA 2GT5A 2K9FA 1PSQA 2GQKA 3F4SA 1A2JA 2AV4A 4TR1A 5CAXA 3GN3A 4NWYA 4IP6A 4EKZA 2CZ2A 19GSA 1MDIA 4E8HA 4ECCA 4TR4A 2GGTA 3WT2A 5IPGA 4I2TA 1M2BA 2FWGA 5ECHB 1DBYA 2N5BA 3P2AA 1VGLA 4KCEA 5G5FA 4YAPA 4HJMA 3DVWA 2KOKA 5ECKB 3ZMLA 4L8EA 16GSA 1XXUA 5ELAA 3ME8A 4JZQA 5B8AA 3GL5A 2HSHA 4MF6A 2IMEA 5KN0A 1Z7RA 2OA7A 1OYJA 1AUCA 2GS3A 2TRCP 4EL1A 2VL2C 4J56E 1GTAA 5EVOA 2CX4A 5DDLA 2C0FA 4WETA 3LWAA 4BWSA 1A2LA 3CSHA 2AUVA 2L5OA 2M72A 4IW9A 5DBQA 2QC7A 3KP9A 3P7XA 5IO2A 4ZB8A 1A24A 4JU5A 1GTBA 2H1AA 3CTGA 5E4WA 1IYIA 2HYXA 2H66A 4HU9A 2NVLA 3C73A 3VK9A 1YKCA 3ZYWA 2JL4A 1XCCA 3P8WA 3VPTA 2C1YA 2PVQA 5CP1A 1GUKA 1ZMAA 2CQ9A 3U6VA 5B6MA 4NXIA 1QK8A 4GQCA 3F3RA 2L57A 5DALB 1O85A 3FZAA 1TU8A 4L5LA 4ZL8A 4MF7A 4MJCA 3VLNA 1T00A 4Z7XA 4Q5NA 3KTBA 3RAZA 3ZTLA 2P31A 3FKFA 1AAZA 1THOA 2HFDA 4ZIJA 2YWMA 5L71A 1EOGA 3TB2A 2YN1A 1PGTA 2A4VA 2L6CA 2VM2A 1O81A 4EC0A 1YF0A 2F51A 3ZIJA 4XTSA 3I9V2 1GSEA 4KDXA 4TOPA 4ACSA 3EU3A 2V32A 1YEPA 2DJJA 5CRGA 4Q5FA 3LFLA 5DAKA 2A2RA 3EE2A 3QAWA 2VLUA 4N11A 3GTUA 2TRXA 3CRUA 4TKYA 1PKWA 2DMMA 2HSYA 1SYXA 5CRWA 1Z6NA 2H6XA 2XBQA 4O7HA 4I2UA 5AN1A 4O92A 4DEJA 3L78A 1U3IA 1EEJA 2QGVA 2RUFA 1B8XA 3TRXA 1X5CA 2D2ZA 2GVPA 2REMA 4L0UA 2JACA 1FB0A 2H6YA 2L59A 5GAPD 2GSSA 18GSA 5G31A 1GSSA 5H5RA 1M0UA 1LBKA 1GNEA 1S3AA 1XOAA 4HS1A 1OE7A 2DIZA 4BA7A 5D93A 1OKTA 1EV9A 4KSMA 4IN0A 1QMVA 2WZ9A 2BJXA 5JCGA 2MMZA 3UAPA 4D73A 4EDZA 5DQYA 4KE3A 1MD4A 5ECMB 2CX3A 3H93A 2L5LA 4ECJA 1R5PA 1SL2B 4V2NA 3TKQA 4ZB9A 2L4QA 3KJYA 4KH7A 3HYPA 3RHBA 2B5XA 4MF5A 4ID0A 2I81A 1QFNA 2HI7A 3DXBA 2KUCA 5IOXA 3F0IA 1AQXA 5LNKe 3J7Yb 3E9JB 1Y6EA 5E59A 4LL4B 1ERWA 4QQ7A 3W8SA 1ACVA 4YQUA 3TJGA 3Q18A 2C0DA 2JSZA 4XS6A 3VURA 5CNWA 1GLPA 4QL7A 2FA8A 1O8XA 2C3QA 2HRFA 4N0ZA 1HNBA 2O7KA 4CHSA 3D4MA 4YH2A 1SU9A 1GNWA 4ZL7A 3VI7A 4CDOA 5CRDA 3IDVA 1WWJA 4POMA 4MJBA 2VCVA 3SBCA 2WJUA 3KXOA 2PGTA 4RQRA 4XHMA 1R5AA 3F4TA 1V9WA 4IVFA 4I5QA 2RM6A 3GX8A 3TKSC 3UBLA 3PH9A 1TXXA 2JZSA 1AW9A 2AAWA 4MPGA 1T4ZA 2LJRA 5IPHA 4WR5A 2N5FA 3MSZA 4V1Ap 2IIYA 3H8QA 2H72A 3ZVJA 3IAS2 3O3TA 4KSOA 4K7OA 1JLWA 4HQSA 4GLTA 2YZHA 2FUG2 4ZBDA 2XHFA 1FB6A 1YZXA 4PNGA 2VCQA 2JZRA 3FW2A 2WGRA 3KGKA 2NBSA 1TOFA 4POLA 5A5KA 3C7MA 3HCZA 4EO3A 2H74A 2F3MA 4PNFA 3ZRDA 2VLTA 2R3XA 5J9BA 4GSTA 1NHYA 3D6IA 1HNCA 4DSSB 3I43A 3UMAA 1QQ2A 4LL1B 4J57E 1JFUA 3IC4A 4GWRA 1DE2A 1H75A 1H4OA 2ZCTA 2C3TA 1G0TA 1FOVA 4G19A 3APSA 1G7EA 5HFGA 4HJ2A 5G30A 4WBJA 2IJYA 2KP1A 4N30A 3ZREA 4MZCA 2H71A 1KEBA 7GSSA 3EMPA 1SL1B 1XW6A 1ZCPA 4NV5A 2LNSA 3IHQA 5KN1A 1FHEA 3IK9A 1EGRA 4V1Ag 2VUPA 3H1NA 4MH2A 3RPNA 2FWFA 4MDCA 2QKEA 4IS0A 5A4WA 3KEBA 1PX7A 1K0MA 1GP1A 3HZ8A 1GL8A 3UVHA 4TW5A 3HVVA 1S3DA 4OCEA 2FHEA 4K7NA 1K0AA 1M9AA 3UVTA 2IFQB 2C8UA 4NMUA 1PL1A 5H5QA 2ON7A 2ES7A 3DIEA 2VCTA 1EWXA 1JZDA 1TTZA 3LYPA 4GCIA 2PMTA 5EY6A 5JWOB 1JZRA 1BX9A 1GSUA 3APQA 3MAKA 2FY6A 1GSDA 1XWKA 2O85A 4E8EA 2MBSA 2LQQA 3HJPA 4MABA 1WMJA 3UOMA 5ID2A 2YWIA 4EF0A 1EV4A 2CVBA 5ECLB 4KB3A 1KBNA 1SJZA 12GSA 2H1GA 4OFTA 1WJKA 4YQMA 4TXOA 1XWBA 1ZZYA 4HOJA 5HR0A 5F05A 4AJ6A 2OE3A 3C1RA 3QCPA 2E7PA 3Q74A 2VL2A 3GX0A 4MJEA 4WF4A 3U5RE 3C8EA 4FYCA 4GRFA 1R7HA 5ECSA 3Q6OA 1ZGNA 1PRXA 4FIWA 2M80A 3GSSA 2C80A 4V2LA 1AIUA 4XS4A 3N5OA 4OMVA 1F3AA 1SJ6A 2DJ3A 4ILFA 3QDNA 1N2AA 5C00A 3DEXA 4FH8A 1WRYA 2J9HA 4ZBAA 1T7PB 2LRTA 1XVWA 4F03A 2C0EA 2H01A 2X8GA 1SJIA 2R6KA 3L9SA 2HZEB 4IQ1A 1JZWA 2L4CA 1SKRB 3IAM2 1ERVA 3I69A 1SKSB 2OBKA 5AISA 4F2IA 2AYTA 3LXTA 3KCMA 5DCGA 1ZYEA 4JBBA 5IMFA 4X43A 2DJ0A 5HR2A 1GRXA 4EDYA 1PMTA 4TN8A 4I6XA 1MD3A 4PQHA 2WFCA 1FAAA 2KLXA 3JCML 4YAVA 3QAVA 1X0RA 2IMFA 4TR3A 2PUKC 3ERFA 4GSNA 2I3YA 3W6GA 5IO0A 4JE1A 2JZTA 5FWGA 1ML6A 2E2GA 3GRXA 2DMLA 2OKAA 3A2VA 1UVZA 2LS5A 2VLVA 5F0GA 2FGXA 1YY7A 2HT9A 3IK7A 3NOFA 4MH3A 2V41A 5IMAA 5EPFA 5ECOB 1TRWA 3CBUA 1ZOFA 3TRQA 3D22A 2XPEA 3TJJA 4WBRD 3TUEA 2AHEA 1TK5B 5GAND 2R2JA 3TKRA 3A3TA 1VF3A 3GKMA 3IRAA 3I6AA 4DSQA 1XVQA 3DGQA 5IMVA 5G1KA 4QL9A 1B9XC 4O32A 4PQIA 2VL3A 1V98A 4Q5QA 2B1KA 5DQSA 4F82A 1AQWA 5ELGA 2WB9A 3EMXA 3FRCA 4OCFA 1O6JA 1E6BA 2H6ZA 1EP8A 5F07A 1ZYQB 3O76A 1F9MA 1UC7A 1NSWA 3GL3A 2C3NA 1TRUA 1V2AA 3VFIA 1GUHA 1J08A 4L0WA 5HQPA 3HKRA 4KAEA 5FHIA 2VOCA 2O87A 4RQXA 3FZ9A 3M0FA 4IGJA 1OC9A 3GURA 1XZOA 3TRPA 1AXDA 1FVKA 1TU7A 4JR4A 3BBYA 1I5GA 1J9BA 3ERWA 3DKSA 1CQGA 2NPBA 4XRAA 1G6YA 3F4RA 1ILOA 1MTCA 1AQVA 3VI5A 1XW9A 2QSIA 2R5GA 4BWQA 2MYGA 2MZCA 3LXZA 5GSSA 4ECIA 1VF4A 3ZLPA 2YNXA 4ZB6A 1K3YA 1CQHA 3A2XA 1SD9A 2F9SA 1A8YA 1K0NA 2MBTA 2CVKA 2WS2A 2VIMA 1G7OA 1Q98A 3OR5A 3C1SA 4AJ8A 4EE0A 3FZ4A 1F2EA 3G9BA 3N9JA 2A2SA 3H79A 3D5JA 13GSA 4XIHA 1IYHA 2FNOA 5ECIB 1VRSD 4K8MA 5J3RA 2K8VA 1BJXA 2X64A 2FWEA 3IOSA 1LU4A 1A2MA 2VCXA 2PVOC 5IMDA 1HQOA 1S3CA 1Y25A 4AJ7A 2CVDA 2FWHA 1HD2A 1UN2A 2YOIA 1K0CA 1EP7A 2ZUPA 2OACA 2VO4A 2YJ7A 4TR0A 3MWHA 5D73A 1MDJA 1PX6A 1O73A 2IL3A 2EIQA 5HFKA 4LMWA 3ZL5A 5JCWA 3TGZA 2B5YA 5D8IA 4ZILA 1K0BA 5HR1A 2EIRA 5D9TA 1BG5A 2WULA 1M9BA 1EZKA 2B3SA 3F8UA 2BMXA 3K8NA 1E2YA 2EIOA 3F63A 4TR1B 3LJRA 3QFAC 3IPZA 3UBKA 3HDCA 3QPMA 1NW2A 1GWCA 2PERA 2G2QA 3GSTA 4YQVA 1XBSA 2GLRA 2IMDA 4XS4B 4X1UA 5DVBA 4BVYA 5AIVA 3AY8A 1N8JA 4PGTA 2JADA 1WP0A 1RW1A 1GSQA 1J0FA 1HYUA 4G2EA 4P3YB 4HUAA 3GH9A 2MMAA 1GULA 4NHZA 1SK0A 3VPQA 2X99A 1V58A 3HVXA 2V1MA 5DJLA 3ZZXA 3TCOA 4TXVA 4PUAA 2E2MA 3KH7A 5FT3A 5B8BA 4ZBBA 3UEMA 4XRDA 4I97A 1JLVA 2DSAA 6GSTA 3HJOA 2N5AA 4BVXA 5DALA 5IIZA 5LCZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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