5COHA

Crystal structure of a novel disulfide oxidoreductase from deinococcus radiodurans crystallized in presence of beta-mercaptoethanol
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SEKIRVDIWSDIACPWCYIGKRRFESALGQFPQRDQVEVVWHSFELDPSARPLNPIAMRDGLAMKYSISPAQAQGSLDHMTQTAAQEGLEYHFDRVKLANTFLAHQLIHYAAEQGQGDAMKERLLRAYMSEGQNVNDLDTLQKLAAEVGLDAGAARAALEAGTYAQAVRYDEAQAQQLGITGVPFFVLGGKYGVSGAQAPETLLGALSQVWAEQHPAPLTMLGQDAPAEGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title drFrnE Represents a Hitherto Unknown Class of Eubacterial Cytoplasmic Disulfide Oxido-Reductases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FrnE protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans (strain atcc 13939 / dsm 20539 / jcm 16871 / lmg 4051 /
total genus 88
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cohA01
3UJ1A 3HXSA 2RLIA 2CV4A 4HDEA 3TOTA 2GZYA 1GSYA 3ZITA 1MEKA 2FA4A 3UBLA 3FK8A 4L0UA 5GSTA 2CVKA 8GSSA 2VCQA 2ZCTA 3GTUB 3GTUA 4FYUA 4QL9A 2C1YA 2JSYA 3EYTA 3CRUA 6GSYA 3TJKA 4MK3A 2H6ZA 4N0VA 4IELA 2KOKA 4OWYA 3LSZA 1GTBA 1EOHA 4X43A 5G1KA 3HA9A 3MWHA 2N5FA 1HNBA 2OE1A 1HYUA 2YV7A 4HI7A 4OFNA 2FWFA 3C7MA 3IPZA 5D9WA 5EVOA 3C73A 4NV2A 4LA1A 1I9DA 2DMLA 5AIVA 2PPTA 3KP8A 4PGTA 3TJBA 2DC5A 2PVQA 1TRSA 1HQOA 5AN1A 2A2SA 4HU7A 3P90A 2HI7A 4Q5NA 4H86A 3M1GA 4TKYA 1R4WA 2P5QA 3WT2A 1KBNA 1OE7A 3FW2A 4FH8A 1S3CA 3IDVA 4K0NA 5HR1A 3QR6A 3EC3A 1QFNA 1G7OA 3CYNA 3HYPA 1WP0A 2KP1A 1QXHA 4MPGA 2YWIA 3RBTA 1U6TA 4ZBBA 5D9XA 2GSSA 1M2AA 1BAYA 2LRNA 3HDCA 3IBHA 3DIEA 2PU9C 2TRCP 4JRRA 3IR4A 1VRSD 3IE3A 4AGSA 2HZEA 2HZEB 1XWGA 20GSA 2H1DA 3IRAA 4LLRA 4ACSA 4YQUA 1XOAA 5ECNB 1EP7A 2DJ2A 4PQ1A 5INYA 4KW6A 1VF2A 1RK4A 2PN8A 1YY7A 4TN8A 2I81A 1Z3EA 2L4CA 1DSBA 2WCIA 4ID0A 3VWUA 1EP8A 4I5QA 2C3QA 3H1NA 2GSQA 2CVBA 6GSTA 3UARA 3VURA 3DXBA 5IMVA 1FVJA 2IMKA 2GT5A 1F6MC 3TB2A 3G7IA 1YQ1A 4EDZA 3MAKA 4WBJA 1PRXA 2H1AA 5J9BA 3C1RA 1W4VA 3ZMLA 3TKSC 4L5LA 3ZVJA 3FR3A 2YOIA 2ZNMA 1O6JA 2VUPA 2CZ2A 1TJDA 5F0GA 2H1GA 2OE0A 5IMCA 4YAVA 4GQCA 4NAXA 5ECMB 4JE1A 5H5SA 2R37A 1CQHA 1SJIA 3TDGA 2F8AA 5CAXA 2X99A 5DJLA 3HVXA 1T4YA 3BOAA 2E7PA 2E0QA 2L6CA 5HFKA 2N5AA 3Q6OA 1LJRA 1Z7PA 5DBQA 2M46A 1TRUA 2V2GA 2HZFA 5HFGA 4F9ZA 1QQ2A 2FCHA 3KGKA 3LJRA 5FT3A 1YZXA 1SKRB 2GGTA 2CZ3A 2C8UA 4MF7A 2WZ9A 1TK0B 1NW2A 2V32A 4ILFA 4MA9A 2BTOT 3GKXA 4N30A 1OE8A 4IP1A 3NIVA 3CRTA 5JWRB 3TUEA 2YP6A 1G0TA 1G7EA 5G31A 3KM6A 1GNEA 1EWXA 2L6DA 1GTIA 4KH7A 3IC4A 3TRXA 1M2DA 1VF1A 3GA4A 4NXIA 3KTBA 3KIJA 1OYJA 1WE0A 2KP2A 3UBKA 1TP9A 3GKKA 1HNAA 2I9HA 3D4MA 2LJAA 3F6FA 1AQXA 3BJ5A 2F3MA 3D6IA 5ECHB 3MSZA 6GSXA 1USBA 1TRWA 5IMZA 4BL7A 1A2MA 3GHAA 4AJ7A 2OJLA 1QGVA 3E0UA 2HXKA 2LUSA 2VD0A 4ML6A 3VFIA 2RM5A 2JSZA 2LQQA 1V58A 1Z7RA 1THOA 4NV5A 2VIMA 2NVLA 3LQ7A 4BVYA 2GSTA 2LSTA 4JR6A 1TU7A 1XW5A 2OADA 2WB9A 3BCKA 1K0AA 3H4KA 4YAPA 1E2YA 2B1KA 2B7KA 2CA8A 2HYXA 3HKRA 4DSRA 4MJCA 1GTUA 5LD0A 1ILOA 5G5EA 1ON4A 1F2EA 4G9HA 4KDYA 2X8CA 5JCWA 3DVWA 3HJPA 3PH9A 1B9YC 3SWLA 2VCVA 3F63A 3L78A 5E59A 2HE3A 3LWAA 3GNJA 1SKWB 3LG6A 1ERUA 4L0WA 4XS4A 4XS4B 2H1BA 13GSA 3GMFA 4Q5FA 1X9WB 2EIRA 3BD2A 4GSTA 5ECPB 1GH2A 5JCGA 2V6OA 1SL0B 3LFLA 3R2QA 2MBTA 2VL9A 2VCWA 5IMFA 1YJ6A 2YCDA 5AISA 3VI5A 2JU5A 2O89A 4J2FA 4MH3A 4XIHA 1TRVA 3QAVA 2GTUA 4FO5A 3KJYA 1ML6A 1PL1A 2H71A 3FKFA 4LMVA 4KB3A 1T00A 1X9MB 2NBSA 5D9TA 4KX4A 3FZ4A 3TJGA 6GSWA 1V98A 1BJXA 3RDWA 5GSSA 1B8XA 3HVSA 4GQFA 2XHFA 4ECJA 1GSSA 1PX6A 3CBUA 4BPYA 3MDKA 4K1FA 3DYRA 2E2GA 1WIKA 3FRCA 4LL4B 2IIYA 1A0FA 1K0BA 2GDRA 1EEJA 3F0IA 5J4UA 3D4TA 1UA5A 2DJ1A 3LYPA 1GTAA 2FWEA 3UIWA 1PQNA 1F37A 5A4WA 3ERWA 5C04A 3PGTA 4WF5A 2H66A 3ZTLA 1PKZA 1K0DA 3ZL5A 2RUEA 2IJYA 4TR3A 1K3LA 1SD9A 4IHUA 1MDIA 1ZMAA 4MLYA 4EUYA 1IYIA 3M9JA 2CVDA 4POKA 3ME7A 1FG4A 4AF2A 2H0GA 4HJMA 1B48A 2WGRA 2B5XA 3DD3A 5B8BA 2I1UA 3K8NA 1ST9A 2IMIA 4IS0A 2J23A 3M8NA 1XPVA 1AC1A 2JACA 2FLSA 4DSSA 4DSSB 3P2AA 2IMEA 1M99A 4V2LA 1LBKA 1KTEA 2LNSA 2GQKA 2H0IA 1PGTA 1FW1A 2VM2A 4F2IA 5IPHA 2RIIA 3M9KA 3QPMA 1XWCA 5DVBA 3WGEA 4PX1A 3GN3A 1HNCA 2M80A 5IIZA 3I6AA 3KXOA 1EEMA 1FB0A 2FUG2 2H70A 3LEFA 1UC7A 2ALBA 4F82A 2YPMA 2YZUA 3I43A 3IHQA 1U87A 1A24A 4MF6A 2RUFA 5KN3A 1ERVA 4K6XA 3VLNA 2YNXA 2N5BA 4IQAA 4MF5A 4KSOA 2HRFA 4YH2A 1NM3A 22GSA 2C0DA 3F4RA 5A5KA 2NTOA 2B1LA 4F03A 2OA7A 2HSYA 2CAIA 5GAND 4MPFA 3FZ5A 2A4VA 2MMOA 3CSJA 2QSIA 4QL7A 3BCIA 1K0MA 3TJJA 4ZBDA 3VWVA 2FD3A 4L8EA 1R5AA 1T7PB 2L59A 1SYXA 1GRXA 4EO3A 1PSQA 1M0UA 1TTZA 4KDUA 4IQ1A 4MDCA 5DQYA 2R4VA 3NZNA 3WGDA 2H6XA 1XBSA 5ELAA 1GLQA 3W8SA 3O3TA 3VWWA 3EWLA 4ULXA 1FAAA 4HQSA 1NSWA 1XIYA 2AHEA 2GT6A 2GS3A 2LJKA 4GTUA 2GZPA 2C3TA 4HEA2 1JFUA 3UVHA 3E9JB 2JZSA 5H5QA 3KH7A 4HS1A 1FB6A 2VLTA 4ZL7A 3IAS2 2BMXA 4TR4A 2C0GA 4PUFC 4OFMA 1YEXA 1XOBA 4NPBA 5ENUA 4XRAA 3FYGA 5D8IA 1M9BA 1C72A 4WETA 1ERTA 2GQMA 4POMA 4PNGA 3LXTA 1PKWA 1YF1A 2OKAA 3N5OA 2AAWA 5G2ZA 2OBIA 4PNFA 4IJ3A 2FY6A 1JLVA 4EC0A 3F6DA 1SJZA 3HZ8A 3TGZA 3A2VA 1W89A 2VCZA 3NOFA 4WBRD 3MNGA 3DVXA 1XVQA 4EE0A 4F0CA 4G2EA 2H01A 4FYBA 2DMMA 4K2DA 1AQVA 4KGIA 2V6KA 2XPEA 4EDYA 4OO4A 3CMIA 3U6VA 3UMAA 4Z7XA 6GSSA 3FY7A 3HJMA 3I69A 1G6YA 2IFQA 2IFQB 1EGRA 3H8QA 4EL1A 2YWMA 3QAWA 2H8LA 4HJ2A 3EU4A 1V2AA 2EIQA 4X1UA 4K7OA 4O5RA 2K6VA 3P7XA 3EU3A 1BYEA 2OACA 2FA8A 3DEXA 3RHCA 2F8FA 3KEBA 3TKSA 1FO5A 14GSA 4ZXGA 1SK2A 3TKRA 3A3TA 2LEGA 2VM1A 3D0ZA 2ZUPA 2YANA 4JBBA 1O85A 4TR0A 3EINA 1CQGA 5CRHA 1K0NA 3GSSA 3LGCA 4ZL9A 2DSAA 1SYRA 3IAM2 4N11A 1WJKA 1AUCA 3A5WA 3PINA 1TK8B 1UN2A 3TJFA 4XCSA 3QMXA 5CYYA 2OE3A 5J5NA 2H0HA 5D9VA 17GSA 2H74A 1G6WA 1V40A 3GFKA 3FEUA 3QAGA 3W8JA 3I9V2 1X0RA 5ECSA 2K8VA 4LMWA 1Z5YE 3C8EA 4PURA 1X9SB 4O92A 2JZRA 1SJ6A 1YKCA 2O7KA 1AXDA 2PERA 3UAPA 1FVKA 4KSMA 1GULA 2WRTA 5JWQB 2GZZA 4ZL8A 1O7UA 5CP1A 2P31A 3WT1A 3LORA 2H19A 1PMTA 3DWVA 3TOUA 5FHIA 1OC3A 2GLRA 3ZRDA 4F0BA 2DIZA 5DALA 5DALB 2X8GA 11GSA 1GSFA 1GUMA 2LRCA 4L5OA 3F9UA 3O6TA 2YWNA 2H73A 1MD4A 4WR5A 3S9FA 1BG5A 3TKSE 2DJKA 4CHSA 1MDKA 2VCTA 3GL5A 4PQHA 2LJRA 3ERFA 1GLPA 5HR3A 1U3AA 2CX3A 3GV1A 1MDJA 5CRGA 1O8WA 4E8EA 4DSQA 1E6BA 1SK0A 2JZTA 3QFBC 3CXGA 4WF4A 4N10A 2VOCA 2WFCA 4KAEA 1M2BA 2IMFA 4IGJA 2L5LA 3L0HA 3EVIA 3GYKA 2LRTA 1EGOA 1EV9A 3ISOA 2VD1A 1H75A 3QOUA 3KMOA 1XXUA 5HFIA 4G10A 2H75A 4TRXA 1WWJA 1EZKA 3HVVA 3L4NA 5DCGA 3WYWA 3VPQA 2LS5A 1M7TA 1OKTA 5EL8A 2C0FA 3KH9A 2YZHA 2QC7A 2VL2C 1ZL9A 2B5YA 4HQZA 3D5JA 4EF0A 2X8HA 1GWCA 2C4JA 3GH6A 3ZFBA 4EKZA 2CQ9A 4WXTA 5ECIB 1Y25A 2O85A 5G1LA 4ML1A 1NHYA 5GAPD 2DIYA 1THXA 5HQPA 3TRPA 2O87A 5COHA 1BQ7A 1TU8A 3ED3A 2AJQB 4N0ZA 5G5FA 4O32A 2CX4A 1YEPA 3GSTA 5ECRB 5A4UA 5CO3A 5D93A 1OVNA 2O8VB 1F3BA 3RAZA 3L9SA 2OBKA 1K3YA 3EE2A 2BJXA 3GRXA 5CREA 3F4SA 3Q18A 1K3OA 1R7HA 2LTKA 1PL2A 5DJMA 2VLVA 3IXRA 3HY2A 1LU4A 2VAFA 1R5PA 4TXVA 4YQMA 3ZFLA 2JADA 5KEJA 2YJ7A 1U3IA 1FOVA 5IMDA 1X5CA 1PD21 1RW1A 4V1Ap 4YQVA 4GWRA 4MABA 2V41A 1DE2A 2IN3A 5IM9A 1ABAA 3V1WA 4I2TA 3TKQA 3E3EA 4ZBAA 4BA7A 2MMNA 4LL1B 2IL3A 2H6YA 3FZ9A 2L5OA 5J41A 2M72A 3L9UA 4RQXA 2AUVA 2HSHA 3GH9A 5G30A 3G7JA 3IV4A 3IK7A 4XTSA 2YV9A 2WULA 1Q4JA 4K8MA 3IOSA 2YJHA 3DRNA 2VLUA 5H5RA 2PWJA 4MH2A 1SKSB 3HHVA 1VGLA 2MMZA 1S3AA 5CNWA 3QCPA 3DKSA 4BWQA 3KCMA 3Q74A 1X5DA 1S3DA 2LQOA 4IVFA 4HOJA 3GUSA 5ELGA 1T8EB 4ZB8A 1TKDB 2TIRA 1XZOA 3APSA 4EVMA 3SBCA 5DDLA 2D2ZA 2K18A 4XHMA 4KUNA 2QGVA 3A2WA 1ACVA 3D21A 3ZVJD 4IW9A 2F9SA 2MZCA 5KN0A 2NPBA 1NHOA 1GSDA 1QK8A 3ZLPA 2RM6A 1ZOFA 2HFDA 1SL2B 3KMNA 4CW9A 2CT6A 1A2LA 1Z9HA 5ECQB 1ZCPA 2EIOA 4PQIA 1TW9A 2DLXA 1GL8A 3WGXA 5IO2A 4J57E 3N9JA 3ME8A 5EPFA 1TXXA 3ZYWA 5B8AA 1K0OA 4MJEA 2MMAA 3TKPA 4OO5A 2IPAA 1I5GA 2JL4A 3TCOA 2PGTA 3CSHA 1T1VA 4JEDA 3DMLA 4OCEA 3TRQA 3VWXA 5IMAA 4ISDA 3W6GA 1JLWA 1VF4A 2G0FA 7GSSA 5C00A 2LV3A 3C1SA 3F3RA 3P8WA 5ECLB 1A8LA 3APOA 5CRWA 2WDUA 3ZIVA 4ECBA 2FGXA 2LKUA 2J9HA 4EXJA 1MD3A 1AW9A 5EY6A 1A2JA 5L71A 4WKWA 3G9BA 5IOXA 2FHEA 2GVPA 2NDOA 2B7JA 4I97A 1AQWA 1T3BA 3KTLA 4I6XA 4HUAA 1EV4A 2REMA 1B9XC 1DUGA 3APQA 5J9CA 3GL3A 5A4VA 1PN9A 3GURA 1HD2A 2LNTA 1F3AA 4G19A 4K7IA 1ZZYA 3VK9A 4JR4A 2MYGA 2YN1A 3GKMA 4TW5A 2PMTA 5DCHA 3EMXA 1YKAA 1J9BA 2HRNA 5AGYA 1N8JA 4WEYA 3VPTA 1ZGNA 1DE1A 1SD8A 4POBA 5LNKe 4K9ZA 4FIWA 1GSQA 3GX0A 2R3XA 4WR4A 5IO0A 2B5EA 4P3YB 3FHKA 4Q5RA 4JZQA 19GSA 2DJ3A 2XC2A 1GNWA 1ZYEA 1TI3A 1GUHA 2ES7A 16GSA 1V9WA 2H72A 4GF0A 4ECCA 2Z9SA 3GX8A 2AB6A 6GSVA 5B7CA 3FR9A 5HR0A 1XVWA 3BBYA 1BEDA 1B4QA 5IQYA 4MZCA 5F05A 3U5RE 1TI1A 3ZIJA 2HNLA 3QFAC 4HZ4A 5ECOB 4TXOA 4TXOB 2FWHA 5D96A 3KD0A 2FWGA 3F3QA 1SENA 4I2UA 4MP4A 2R5GA 2XPDA 1H4OA 4DVCA 3O76A 1KNGA 3C71A 1JHBA 5F06A 4KDXA 4RI7A 3EURA 3IK9A 4OFTA 3UOMA 5IPGA 4K7NA 4O7HA 1XW9A 5DAKA 5DAKB 3H93A 1SU9A 3KP9A 1U88A 4BWSA 2G2QA 1GSUA 4ZB9A 4Q5QA 4GLTA 3ZREA 2KHPA 3D22A 3HZ4A 2P0GA 1WMJA 1XWBA 2XBQA 2C80A 3AY8A 4NHWA 4CDOA 2I3YA 1A23A 1PX7A 1X5EA 4XS1A 3H79A 3HCZA 1MTCA 1JZDA 1RQMA 3J7Yk 1Y6EA 3IA1A 4NHZA 2F51A 2V1MA 4IP6A 2L57A 4BVXA 5J3RA 1V57A 1YDKA 1UVZA 4IBPA 2B6MA 4JU5A 3RPPA 1OAZA 1R26A 3DGQA 1TK5B 2EC4A 4XRDA 3UEMA 3FZAA 1SK1A 5F07A 1IYHA 2PUKC 4PXOA 1OC8A 4XS6A 5ID2A 5ID2B 1WPIA 4IJIA 4GSNA 4X0XA 4DEJA 2WJUA 3ZZXA 1YF0A 4IN0A 4E8HA 5AIXA 4RI6A 4V2MA 4ECIA 4GSSA 2DJJA 9GSSA 1Z6MA 3LXZA 5CRDA 1TOFA 3QD9A 2I4AA 4TOPA 2DBCA 1BX9A 5LCZA 1A0RP 4OMVA 4ZIJA 1GSEA 2X64A 3GKNA 1WOUA 2ON5A 2WS2A 2K9FA 2YWOA 4RQRA 1ERWA 2H30A 1O73A 3OR5A 4MMMA 2VCXA 5JCUA 1DBYA 3F8UA 3G7YA 3LYKA 4MZBA 1F9MA 3M0FA 4K0GA 1OC9A 1OC9B 4RUVA 1J08A 5D73A 1XW6A 5DQSA 1K0CA 4GXZA 5B6MA 1QMVA 2B3SA 3RPNA 1URMA 3J7Yb 18GSA 4KCEA 2P5RA 2FNOA 5E4WA 2DJ0A 4HZ2A 2IWTA 3GIXA 1KEBA 3L9VA 4TVEA 2GSRA 1GP1A 3Q19A 4OCFA 6GSUA 1WRYA 2E2MA 4V1Ag 4POLA 2XBIA 4KE3A 3A2XA 3JCML 1J0FA 4PUAA 4OD7A 3FR6A 4MJBA 4D73A 4D73B 1QUWA 4AJ8A 2QKEA 10GSA 1VF3A 1XFLA 1AAZA 4HU9A 2HT9A 1XWKA 3CTFA 4KNDA 5JWOB 12GSA 1T4ZA 4V2NA 3EMPA 2MBSA 2AV4A 2C3NA 5FWGA 1M9AA 2L4QA 2VO4A 4FYCA 5IOWA 2R6KA 1B4PA 1OKDA 2GQLA 3UVTA 2PVOC 3F4TA 3PR8A 2A2RA 5GZZB 2IMDA 3RHBA 4AJ6A 1A8YA 3CTGA 4QQ7A 1SL1B 2PBJA 1XCCA 1JZWA 2VL2A 3CSIA 4GCIA 1JZRA 2K8SA 4ZILA 5F8BA 3VI7A 1FHEA 5HR2A 4MJAA 3KZQA 2KUCA 1ZYQB 3QDNA 1GUKA 2TRXA 3US3A 1JZOA 4J56E 2C0EA 3UL3A 3ZMKA 4MZWA 5ECKB 1O8XA 1AIUA 2R2JA 1O81A 4IKHA 2VL3A 1N2AA 2HLSA 2AYTA 1Q98A 3WD6A 5KN2A 2H76A 3HD5A 1XWAA 3HJOA 4NWYA 2KLXA 4KA0A 4TR1A 4TR1B 1PA3A 1TDIA 3ERGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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