5E4WA

Crystal structure of cpsrp43 chromodomains 2 and 3 in complex with the alb3 tail
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for cpSRP43 chromodomain selectivity and dynamics in Alb3 insertase interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-1
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 26
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5e4wA00
1R5PA 3ISOA 1K3YA 3FY7A 4F82A 2NDOA 3IHQA 4K9ZA 4KA0A 3F8UA 3GKXA 2OE1A 4IS0A 3TJJA 5ECRB 3IV4A 4HZ2A 10GSA 1PQNA 1V2AA 5IOXA 2DIZA 2VAFA 1B9YC 4HI7A 3TOUA 4G9HA 5E59A 4J57E 3A2WA 1R5AA 3RAZA 2XBIA 4YQUA 4H86A 2R3XA 2EC4A 3PH9A 4F0BA 3FEUA 3FYGA 2F3MA 3TRXA 1H75A 3ZIJA 2X8HA 1F37A 4TXOB 1U87A 3ED3A 3GURA 5B6MA 4K2DA 2KP2A 19GSA 1TK0B 4KGIA 5JWQB 4N0ZA 2CZ2A 1UA5A 1O7UA 5CRWA 3GKKA 1S3DA 3C7MA 1T7PB 3RHCA 4EF0A 1XWKA 1X9WB 1KTEA 2FHEA 4BVYA 1OKDA 2AYTA 2PVOC 4IN0A 3EE2A 3QDNA 3TUEA 5ELGA 2QGVA 3QAVA 4GLTA 2IFQB 3KXOA 2ZNMA 1PKWA 3GRXA 1WRYA 1WIKA 4V1Ap 2O8VB 1N2AA 1MD4A 1JLWA 2CV4A 1ILOA 2TIRA 5D9WA 2KHPA 2JSZA 1HNAA 1R4WA 5G5FA 5DDLA 3I43A 3H79A 1SKWB 3TKSE 5IM9A 1TRUA 3LJRA 2DSAA 2YN1A 3KP9A 5HFIA 4NHZA 4Z7XA 2B1KA 1AW9A 4QL7A 1G7OA 3ZFBA 2X99A 4DVCA 5KN0A 3HKRA 5ECMB 3VLNA 3A5WA 3BCKA 1JLVA 4J56E 2H8LA 2I3YA 2H74A 5IMVA 2LNTA 3FZ9A 1BQ7A 4V2MA 5D93A 3ERGA 3LFLA 2VL3A 3KMNA 3GMFA 2GTUA 1QMVA 4N30A 2LJKA 3IK9A 2K8SA 1FOVA 1TJDA 1Y6EA 2ON5A 3EMPA 2JADA 1MD3A 4ML1A 2YANA 4HJ2A 3G7IA 1TK5B 2BMXA 2ES7A 1S3CA 3KZQA 2K6VA 4RI7A 5IMCA 2L6DA 5G2ZA 4J2FA 4KCAA 2B1LA 1XOBA 1V57A 3KH7A 1DSBA 2AUVA 5G1KA 1F9MA 3ZITA 1URMA 2V6KA 1K0BA 3QR6A 5J5NA 4ZB8A 4LLRA 1B4QA 2PBJA 1T4ZA 4OFMA 2IJYA 2X8CA 4XS4B 1AUCA 3ZYWA 2VO4A 1B9XC 1BJXA 5D9XA 2WULA 2RM6A 1VRSD 1SK2A 4BPYA 5G30A 1GTBA 1V98A 4TN8A 1XBSA 3TB2A 1ZZYA 3A2XA 4TXVA 1EEJA 2LJAA 4LMWA 3LGCA 1PA3A 2R4VA 2TRXA 4LMVA 2KOKA 2F8FA 4QQ7A 3GSTA 1VF3A 3Q18A 1JZWA 1O8XA 2DJ2A 1WWJA 1AQVA 1K0MA 3D22A 3DIEA 3LEFA 1OE7A 1QQ2A 1RK4A 1QUWA 2IPAA 1ZL9A 4GWRA 1FG4A 3F0IA 1SYRA 1YJ6A 1SYXA 4FYCA 2YWMA 3GTUB 2PN8A 2RIIA 2OA7A 2YPMA 3U6VA 4GQCA 1E6BA 1T8EB 1SL1B 4F0CA 3D5JA 1O73A 2K9FA 2CZ3A 3ERFA 2PWJA 1ZOFA 3IE3A 3TJGA 3BOAA 4KDYA 5GAPD 1K3OA 3CSHA 4QL9A 2B3SA 1XIYA 3LSZA 1XWAA 2YZHA 1GUHA 1SU9A 1TRVA 3UJ1A 2VUPA 4L5OA 3J7Yk 3ZREA 3LXTA 1F3AA 5HFGA 2HFDA 5ENUA 2GLRA 1PSQA 6GSSA 1TI1A 4L8EA 2MMZA 5EVOA 4TRXA 3CTFA 2IWTA 2H30A 1XXUA 5IIZA 4GF0A 3MWHA 3VK9A 4X43A 2NVLA 1YZXA 1XPVA 1ERVA 2HI7A 2B5EA 1MTCA 2LEGA 1QK8A 5A4UA 5CRHA 3LWAA 2R6KA 1O85A 1E2YA 4MZBA 5GZZB 2E2MA 1GTAA 2GSTA 2L59A 3TDGA 4TW5A 2RLIA 2C0FA 1BEDA 2JZSA 1M0UA 3P8WA 5B8BA 3J7Yb 5B8AA 4D73A 1NW2A 2HZEA 3DKSA 3VWUA 16GSA 3VURA 1GNWA 4EVMA 4O7HA 3I9V2 2DBCA 5HFKA 2VIMA 4TR1B 1B48A 3GNJA 4JE1A 2VLTA 4I2TA 3ZLPA 2C8UA 2P0GA 3W8JA 2AJQB 1A0FA 4BL7A 4KUNA 3US3A 5KN3A 4EO3A 2L4CA 2AV4A 2FA4A 4PX1A 3H93A 2H72A 8GSSA 3TKSA 3H4KA 5D96A 1M9AA 2C3QA 4DSSA 2DMMA 3HZ8A 4ECBA 4GSSA 2PGTA 5CNWA 1G7EA 1M9BA 3HY2A 3HDCA 4MP4A 1GULA 1SD8A 3DWVA 3M0FA 4K0NA 1A2MA 4FH8A 4ZILA 2M80A 5LD0A 2EIRA 1UC7A 2PPTA 4MF5A 5CRGA 3D0ZA 1X5DA 3HHVA 2FWEA 4EDZA 3HZ4A 3EU3A 4IJIA 4MJBA 4JZQA 5ID2B 3GN3A 3IAS2 1WJKA 3BJ5A 2MYGA 1DBYA 3QFAC 3Q6OA 3W8SA 1FB6A 4KH7A 2N5AA 2GT6A 5D8IA 1AIUA 3VI5A 4ML6A 3E3EA 3HVXA 4WF5A 3L0HA 3MAKA 2N5BA 2H75A 4XRAA 4N0VA 3APOA 3BD2A 3GHAA 2VLVA 6GSVA 2HT9A 1RQMA 1ON4A 1YQ1A 2WFCA 4OFTA 4ECCA 5IMFA 2CVBA 2HE3A 2WZ9A 1SKRB 1JFUA 1F6MC 2H0GA 2R5GA 2B7JA 5FHIA 4ZL9A 2FD3A 5HR1A 1ML6A 1Z3EA 5CAXA 2VCVA 2N5FA 1PMTA 1OE8A 4MZCA 5IPHA 3QAWA 1TU7A 3CBUA 2IMIA 3KGKA 1BX9A 2VM2A 1U3IA 1KNGA 5EPFA 2O85A 3F4TA 3DGQA 5J41A 3ZVJD 1ABAA 3GX8A 5HR0A 2VCQA 4CHSA 2FUG2 3UBLA 2KUCA 1ZYEA 2FCHA 1OC9B 3F3QA 1EV4A 1YF0A 4XIHA 1PX6A 4HJMA 1K3LA 2P5RA 4AJ7A 2B5XA 4YQMA 1O81A 1ACVA 1Z5YE 3TRQA 1SL0B 1GRXA 2FGXA 3MSZA 4MABA 4RQXA 2HXKA 1Z7PA 1GWCA 3GKNA 4ZL8A 3DRNA 2LS5A 1IYHA 1WOUA 3LQ7A 3ZTLA 1EOHA 4IHUA 4L0WA 1W4VA 1FAAA 2H6XA 5ABRA 4TXOA 1EOGA 2LQOA 1GLQA 3E0UA 3GA4A 2FWGA 1MEKA 1GSEA 4N11A 1R7HA 2IIYA 3GH9A 4K1FA 3TRPA 11GSA 2VCXA 2H1BA 1HD2A 4F03A 4ZIJA 5IMDA 4E8HA 1EWXA 3BBYA 4L5LA 4KSOA 3VWXA 2YV7A 2LRTA 1PL2A 5CO3A 5ELAA 1AAZA 2H1GA 4MA9A 5HR2A 1W89A 1M2BA 3HCZA 1U88A 2H6ZA 2O89A 4NWYA 4PQHA 1FVJA 6GSTA 2PMTA 2IFQA 2GS3A 3NIVA 1Z6MA 3IRAA 4FYBA 1QGVA 5GSTA 3D6IA 3HVVA 5DAKB 4I2UA 4K8MA 3ZFLA 3F6FA 3TKSC 5FT3A 3L4NA 1XW9A 1FVKA 3TKQA 2O87A 2VD1A 2X8GA 5D73A 2LRCA 2C0GA 2E2GA 1B4PA 2V32A 1XWBA 5HQPA 1U6TA 2RUEA 5IPGA 1TKDB 3MDKA 4RUVA 3I6AA 4MF6A 5DJMA 5J4UA 2A2RA 1YKCA 1XWGA 1CQGA 1KEBA 3F9UA 2MMAA 1A2LA 1YEXA 1SL2B 5E4WA 4OWYA 4IGJA 4RI6A 2YWNA 1A24A 3L9SA 3UBKA 2H19A 3FR9A 13GSA 5DVBA 1XW5A 3V1WA 3LYPA 4ISDA 3P2AA 2FNOA 4YH2A 4F2IA 2K18A 4POLA 3EC3A 3UL3A 2JZTA 2I81A 1GSYA 3FZ4A 3KMOA 4WETA 2LJRA 3WGDA 3UVHA 1GL8A 1AQXA 1X5CA 2MMOA 1Q4JA 1QXHA 1LU4A 6GSXA 3EYTA 3RDWA 2A2SA 4EXJA 4WEYA 3U5RE 2E0QA 4BWQA 2FWHA 3GX0A 5IO2A 3FHKA 2H71A 5CRDA 2GVPA 1ZMAA 3UOMA 5B7CA 4POKA 2PVQA 2GQKA 1THOA 1H4OA 4WBJA 1NHOA 4EUYA 3M8NA 2VD0A 1B8XA 4JEDA 2BJXA 4XS4A 3ZVJA 4O5RA 1I9DA 2B7KA 1SJ6A 1QFNA 2FY6A 3IAM2 1MDKA 1Z9HA 3ZL5A 2YCDA 2P31A 1T4YA 2H1DA 1TRWA 2WJUA 3VWWA 4KSMA 2V1MA 3MNGA 2HRNA 3ZMLA 3IDVA 2G2QA 1JZRA 5A4VA 2GZYA 5JCWA 3I69A 1GH2A 3D4MA 5DALB 2OKAA 5IMAA 4MLYA 2JSYA 5DQSA 2ON7A 5D9VA 2MMNA 5LNKe 4DSQA 3G7JA 3IOSA 4MZWA 5CYYA 2H6YA 4BWSA 2GDRA 1PRXA 4Q5RA 3GTUA 2QSIA 4LL1B 2PERA 3IBHA 3L9VA 1K0AA 2GQLA 3CSJA 1GSDA 2OE0A 5C04A 2HSHA 2NBSA 1HNBA 2YZUA 5KEJA 1PKZA 1FB0A 1USBA 4O92A 1YDKA 4NHWA 2A4VA 2HSYA 2DMLA 4POBA 1TXXA 2C3TA 3IK7A 4NMUA 4PGTA 3SBCA 1K0OA 3EWLA 3FKFA 1KBNA 3G9BA 1R26A 3GSSA 3M3MA 3PR8A 3UAPA 1V40A 4FIWA 2CVKA 1U3AA 3KP8A 3KCMA 4YQVA 1GSFA 2DLXA 3EU4A 4E8EA 2C1YA 4XHMA 1HYUA 4DEJA 2XC2A 4ZBDA 1TP9A 1K0CA 3HD5A 3A2VA 2ZUPA 1EGRA 4K7NA 3GL5A 4KCEA 1NSWA 5AN1A 4V2LA 1YKAA 2MBTA 2CA8A 9GSSA 3ERWA 1G6WA 1WPIA 1DE2A 4KDUA 4G19A 1OYJA 4PQ1A 4WBRD 4MPGA 1XWCA 14GSA 4OO5A 3C71A 5H5QA 1AQWA 2AB6A 7GSSA 3TCOA 4TVEA 4HUAA 5F8BA 4TR1A 3VPQA 3LXZA 1AXDA 3LYKA 3ZIVA 2H73A 1YY7A 2IMFA 3FZ5A 3C8EA 3CRTA 1BG5A 4GCIA 1O6JA 3DVWA 3SWLA 3M9KA 2GZZA 5D9TA 3C73A 4IP6A 4XCSA 3C1RA 3KM6A 3QCPA 1SK1A 4LL4B 3A3TA 1MDIA 4MK3A 1M99A 3TKPA 3EVIA 3F4SA 3KTLA 4X1UA 2GSRA 1GUMA 5FWGA 1Z6NA 3ZZXA 1SENA 1XZOA 4K0GA 1V9WA 4ULXA 2V41A 5AGYA 4ZB6A 4MJCA 2CAIA 3G7YA 2VCTA 4PXOA 3P90A 5JWRB 4OCEA 1M2DA 3QOUA 5KN1A 1TU8A 4OO4A 1OAZA 1UVZA 3KH9A 2GQMA 3L78A 3TJFA 5IQYA 2NPBA 5ID2A 4IJ3A 3KIJA 1SK0A 2FA8A 2H70A 4KDXA 2VL2A 3O76A 2G0FA 3GKMA 3HA9A 2WRTA 1NM3A 1S3AA 2OJLA 2IMEA 2X64A 2YJHA 4WR5A 4IKHA 3APQA 1M2AA 4L0UA 3P7XA 2B6MA 2QKEA 3WGEA 1I5GA 3HVSA 1CQHA 2LRNA 5ECLB 1BYEA 1PD21 1X9MB 2YNXA 1GP1A 3TKRA 3HXSA 3RBTA 3DVXA 2OADA 1FO5A 5DCHA 4IW9A 4XRDA 3DEXA 1Z7RA 4HQZA 2H1AA 1XCCA 3CRUA 2CAQA 2GSSA 2LNSA 2WCIA 2H0HA 2NTOA 3CMIA 4ECIA 1ZCPA 2IMKA 3ZRDA 4ILFA 1UN2A 2IMDA 6GSUA 4BVXA 2MZCA 5EL8A 1F3BA 3M9JA 4K7OA 4EL1A 1GTIA 22GSA 4PQIA 3CXGA 1FHEA 4ZXGA 4KAEA 3F3RA 4LA1A 4G2EA 3F4RA 2JACA 5F0GA 4MJEA 1GUKA 3WT2A 2KLXA 1EP8A 4I5QA 1OVNA 2HRFA 5A5KA 2JZRA 1OC9A 3FZAA 3Q74A 4TKYA 3GUSA 1G0TA 4X0XA 2QC7A 2JL4A 5IOWA 4GRFA 2R37A 4K6XA 5COHA 3JCML 3GH6A 4IQAA 5EY6A 2F51A 2L5LA 1A8LA 2L5OA 2OACA 4AF2A 1BAYA 3K8NA 4PUAA 3FW2A 1AC1A 20GSA 4MCUA 4P3YB 2B5YA 4ID0A 4ZBBA 2I9HA 2FLSA 1X9SB 4EDYA 3ME8A 4JU5A 6GSYA 1DE1A 2GSQA 4Q5QA 4I8BA 2M72A 2L6CA 2ALBA 2C3NA 3DXBA 1GSSA 3QD9A 4FO5A 2DJ3A 1ERWA 5J9CA 5DJLA 3WT1A 3WYWA 5AIVA 1JHBA 1T3BA 4G10A 5ECNB 1YF1A 2DIYA 3HJPA 4MMMA 5H5RA 2WGRA 2CX4A 5B6NA 1RW1A 1GSUA 4KW6A 4HQSA 3C1SA 4CDOA 1TK8B 4I97A 2FWFA 2VLUA 5F06A 3PINA 1XW6A 2L57A 1JZOA 4GSNA 2DJ0A 4JR4A 3DD3A 5DAKA 1XVQA 3TJBA 2Z9SA 4HOJA 3IXRA 2H0IA 4OMVA 1HNCA 3ZMKA 4ZBAA 4JRRA 1OKTA 4MH2A 3GL3A 1J0FA 3QAGA 4IP1A 4TR3A 1THXA 2C0EA 4PNGA 5H5SA 4HS1A 2LQQA 2CVDA 1VF1A 2LKUA 2D2ZA 1VF2A 4WF4A 3LG6A 2J23A 3EMXA 5J3RA 4NPBA 4I6XA 1MDJA 1G6YA 3KTBA 3W6GA 2PUKC 2VL2C 5GSSA 2LUSA 3D21A 5J9BA 1EGOA 1GSQA 1WP0A 4KX4A 5INYA 1JZDA 2CQ9A 3PGTA 2WS2A 4HU7A 2OBIA 1EV9A 1TW9A 2OE3A 1X5EA 5ECIB 1T00A 3F6DA 1DUGA 2IL3A 3RPPA 2H76A 2YP6A 4IELA 5G1LA 3VWVA 4ZB9A 4GXZA 1PX7A 4GSTA 1SKSB 3H8QA 3KD0A 2TRCP 3LORA 3UIWA 2J9HA 5F05A 5L71A 1EEMA 1F2EA 3L9UA 2DJ1A 2DJJA 5IO0A 3WGXA 1PN9A 1LJRA 2F9SA 2CT6A 4EKZA 1GLPA 3O3TA 1TI3A 3TGZA 1LBKA 4AGSA 2HNLA 4IQ1A 2K8VA 2RM5A 3H1NA 2KP1A 3QMXA 1A2JA 1FW1A 3UVTA 3IPZA 1M7TA 3NOFA 1J9BA 5IMZA 2GZPA 3BCIA 1VGLA 2C4JA 4EC0A 2YWOA 4KNDA 5JCGA 4V2NA 4IBPA 5DALA 2C0DA 4NV2A 1YEPA 1GTUA 4POMA 2IN3A 1ERTA 1K0NA 4RQRA 4PNFA 3CYNA 2I4AA 2REMA 1ERUA 3IR4A 2CX3A 3E9JB 2EIOA 4Q5NA 1A23A 1PGTA 3DYRA 2DC5A 3R2QA 1PL1A 5AIXA 2E7PA 2DJKA 1XOAA 3VPTA 4OCFA 4HDEA 2PU9C 4PURA 3QPMA 3KJYA 5F07A 1HQOA 5LCZA 4DSRA 2ZCTA 2XBQA 1OC3A 2JU5A 4AJ6A 6GSWA 2C80A 3HJMA 4BA7A 1Y25A 4F9ZA 1ZYQB 2XPEA 2LTKA 3HYPA 3GV1A 4YAVA 3RPNA 1ZGNA 4XS1A 4OFNA 4CW9A 4MPFA 3RHBA 5HR3A 3ME7A 3KEBA 1EP7A 2VCZA 4MDCA 1TOFA 5GAND 5DQYA 1C72A 4V1Ag 3O6TA 3IC4A 4D73B 2HZEB 4IVFA 3S9FA 1IYIA 3HJOA 4WKWA 2P5QA 3UMAA 2H66A 2VOCA 2VCWA 4XS6A 4WR4A 3QFBC 1GNEA 1OC8A 4GTUA 4XTSA 1WMJA 4KB3A 1X0RA 1NHYA 3WD6A 1SD9A 4HU9A 5ECOB 4OD7A 2L4QA 1EZKA 5CREA 4GQFA 4HZ4A 2XHFA 1A8YA 5ECQB 4TR0A 5AISA 5ECPB 4YAPA 3FR6A 1TTZA 4EE0A 4K7IA 4NV5A 3CTGA 4DSSB 3FK8A 2MBSA 1TRSA 1J08A 3AY8A 2RUFA 5DCGA 2O7KA 4NXIA 4N10A 2YWIA 4TR4A 2VM1A 2F8AA 2YOIA 4FYUA 4NAXA 2YJ7A 1XFLA 4MH3A 5ECHB 2I1UA 2LSTA 3Q19A 3N9JA 1T1VA 12GSA 2AAWA 2V2GA 4AJ8A 4JR6A 4PUFC 1O8WA 3EINA 5ECSA 2LV3A 4TOPA 5C00A 1K0DA 3TOTA 4JBBA 3VFIA 4ZL7A 5JWOB 2EIQA 1SJIA 2M46A 4MJAA 18GSA 3FRCA 2GGTA 5JCUA 1WE0A 3DMLA 1Q98A 5KN2A 4Q5FA 2HYXA 3GYKA 4WXTA 3GFKA 3NZNA 4O32A 2HZFA 4ECJA 1XVWA 3TJKA 2WDUA 3N5OA 3EURA 3IA1A 3UARA 3OR5A 3F63A 4KE3A 2VL9A 1SJZA 3D4TA 3VI7A 3M1GA 2XPDA 2WB9A 5G31A 1N8JA 2BTOT 2OBKA 3GIXA 1ST9A 2V6OA 2YV9A 2AHEA 2H01A 5G5EA 17GSA 3UEMA 2HLSA 5ECKB 4HEA2 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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