5ENUA

Crystal structure of an alkyl hyroperoxide reductase from burkholderia ambifaria
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HHHHMSVEVDRQVPDFTAPATGGDISLSDLKGRKLVLYFYPKDNTPGCTTEGLQFRELYPKFKKAGAEIIGVSRDSLRSHDNFKAKLELPFPLISDADEALCALFDVIKMKKMYGKEVRGIERSTFLIDADGVLRQAWRGIKVPGHVDDVLSAVQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an alkyl hyroperoxide reductase from Burkholderia ambifaria
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ M
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia ambifaria
total genus 53
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5enuA00
1VF1A 1YZXA 2OE3A 2H6YA 3TRXA 1GTIA 4D73A 2DBCA 1LJRA 3IDVA 4XRDA 1GNEA 4L0UA 18GSA 3TOUA 2H75A 1GSQA 1EZKA 2WCIA 2H30A 4WBJA 3APQA 5IIZA 4V1Ag 4JZQA 4KAEA 4GSSA 5DALB 4CDOA 2PERA 1X5EA 4MCUA 2Z9SA 4ZL7A 3QDNA 4DVCA 2VL2C 3IOSA 3MAKA 4E8HA 3GN3A 1O6JA 1ACVA 5INYA 3UJ1A 2LNSA 2VLTA 2H0GA 1V98A 2JL4A 4POLA 1SKWB 3TKSE 4XIHA 2XBIA 2RLIA 4POMA 1U87A 5EVOA 2FWHA 3MWHA 3ED3A 3UEMA 1YQ1A 5D9TA 3TOTA 1JLWA 4CW9A 1OC9B 1K0OA 3I69A 3ZFBA 1ON4A 4MF7A 4QQ7A 3E3EA 4ML1A 1NW2A 1JZWA 1GSEA 4PURA 5IMAA 4KCAA 4FH8A 3ZYWA 1FW1A 5ECKB 4HU9A 4NHZA 5CRHA 4K6XA 4TOPA 4KNDA 2DMLA 4YQVA 1ST9A 1Z7RA 4MMMA 4NV2A 3WGEA 4HI7A 3M9JA 3IK9A 2HXKA 4H86A 3HDCA 4ZIJA 3UL3A 2E2MA 2YZHA 1NM3A 4OFMA 1GTUA 3WGDA 1B9XC 3WD6A 3VI7A 4MABA 5J5NA 2RM6A 3GFKA 3GKMA 2GQMA 4WETA 2LRTA 3FR6A 2I81A 1T7PB 4F03A 3GURA 1SENA 3EYTA 1N8JA 5ECSA 3A3TA 1A2LA 5A5KA 4QL7A 2F3MA 4HZ2A 3FYGA 2H72A 3LFLA 4IJIA 1IYHA 5AIXA 1A8YA 4RQXA 5F8BA 2C4JA 3EURA 4GQCA 3D4MA 4ECCA 4EO3A 4XRAA 2RUEA 1AQWA 1ZYEA 2B1KA 4ID0A 2KP1A 3H93A 2HSYA 3RPNA 1RK4A 4D73B 4IQ1A 3K8NA 4OO5A 4ZB8A 3FW2A 5D96A 4MP4A 2FWEA 1R7HA 3DYRA 1SL1B 3LXTA 1H4OA 3FZ4A 3Q74A 4L5LA 1GSYA 2N5FA 4TR4A 3GL3A 6GSSA 2HZEA 4IGJA 2B5XA 2L6DA 1QMVA 1M0UA 3C1SA 4HJ2A 1N2AA 2HSHA 2VCQA 2DJJA 5ECMB 5GSSA 2X99A 4G2EA 5IO2A 2R4VA 1MDKA 3RHBA 2LV3A 3Q18A 5IMDA 2FCHA 1LBKA 4YAPA 5IPHA 3WGXA 3TCOA 3UIWA 2HFDA 4KDUA 3FHKA 5D9VA 4BVXA 4ZBBA 5L71A 2H73A 1TRWA 2O7KA 4DSRA 2GT6A 2DJKA 3PGTA 3E0UA 2IJYA 2L5LA 2VCXA 2HNLA 2DLXA 2X64A 1X0RA 1F6MC 1GH2A 2IL3A 4O92A 4Q5QA 5CP1A 4LA1A 3DD3A 2KHPA 4ACSA 5EL8A 4EXJA 3HXSA 3HZ8A 3I43A 1OKTA 3GRXA 3IC4A 4PNFA 6GSVA 1YF0A 4IN0A 5LCZA 4Q5NA 20GSA 1O8WA 2OE1A 4P3YB 5ECQB 5FT3A 3TKSC 3D22A 1BYEA 4MDCA 2GSQA 1HNAA 2DJ3A 4Q5RA 1F2EA 3EWLA 3FK8A 1OAZA 2YN1A 5HFKA 1DBYA 4GCIA 4PQIA 5EY6A 2REMA 4OCFA 5EPFA 1MDIA 5CRWA 2X8HA 3GUSA 5C04A 2MMAA 3L9VA 4OWYA 5AN1A 3IA1A 2JZRA 1Q98A 5GAPD 1VF3A 1WPIA 2LUSA 2B5EA 1BX9A 3VK9A 2P5RA 3F4TA 1T8EB 5ECRB 1E2YA 2K6VA 2VIMA 1S3DA 3WYWA 5JWQB 3C1RA 4KGIA 2JADA 3TB2A 2H66A 3FR3A 2XHFA 2H8LA 2C1YA 1SD8A 2PUKC 4TXOA 1PKZA 4NAXA 2VL9A 3ZVJA 3ZZXA 2AJQB 2H0HA 3VWUA 2F9SA 1C72A 3J7Yk 3UOMA 3C71A 2C0FA 2QC7A 1Z6NA 1OKDA 4J56E 4YQUA 5J41A 1TU8A 3EU3A 1JZRA 1JHBA 4ZILA 3TKRA 1FB6A 3F4RA 2DSAA 2LRCA 1TRUA 4IP1A 2HZEB 2HYXA 3HD5A 6GSXA 2LJRA 1WE0A 3GH9A 1M99A 4V1Ap 5H5QA 1WWJA 4O5RA 2LQQA 3EMXA 5F06A 2I4AA 4PQ1A 2YJ7A 4ECJA 1W89A 2VCWA 3UVTA 5HR1A 1YY7A 1OE8A 3Q19A 3D4TA 4X1UA 4KH7A 2KUCA 2LNTA 1KEBA 1BJXA 5ENUA 5E4WA 2MBTA 1QK8A 4YQMA 4KDXA 4MH3A 3O76A 4NMUA 2H6XA 3A2WA 1U3AA 3KTBA 3KMNA 4JRRA 4RQRA 3M3MA 1X9WB 3KTLA 3GX8A 1XWAA 7GSSA 5KEJA 2MMOA 1FOVA 4OFTA 2I9HA 2ON5A 4BWQA 1G7OA 2LJAA 3E9JB 1F3AA 3GKKA 2C3QA 2IN3A 2YP6A 3RHCA 1GTBA 3TKQA 4HEA2 1HD2A 3ZTLA 3QAVA 2IIYA 1B9YC 2FLSA 1H75A 4I2TA 1G6WA 1V57A 2VUPA 2NVLA 5HFIA 1SJZA 4I2UA 1ZZYA 1J0FA 2O8VB 1PN9A 1K3LA 1M2AA 1XWKA 3KM6A 1PQNA 2KP2A 4N11A 6GSWA 5F05A 1AW9A 1EEJA 1THOA 2M80A 4MA9A 1G6YA 2JSYA 1FAAA 2K8SA 2GQKA 1PL1A 3WT2A 5CREA 1T1VA 2VM1A 3PINA 4TVEA 5COHA 4RUVA 3IBHA 1T4ZA 2MMZA 1K0BA 3CSHA 5JCWA 2WULA 4PGTA 2OA7A 2J23A 2C0GA 4N0VA 2A2RA 2OBKA 5CAXA 1YKCA 4V2NA 2WB9A 1QFNA 1QXHA 1EV9A 2IMFA 3DVXA 4I97A 5C00A 2FNOA 2H70A 2V2GA 4RI6A 3QPMA 4K7IA 3EC3A 3H1NA 3QR6A 2D2ZA 4GXZA 2L4QA 4TXOB 4L5OA 3FEUA 1BG5A 4PX1A 2WJUA 4POBA 1AXDA 3DRNA 1RQMA 1R26A 4WKWA 2O85A 2BTOT 1ZOFA 1PGTA 5F0GA 3GHAA 5DAKA 3CMIA 3P7XA 5CYYA 4ZXGA 4HZ4A 4WF5A 4K0NA 5CO3A 1XOBA 1O85A 4FYCA 4TR1A 5AGYA 2CX3A 5JWRB 4L0WA 3V1WA 2GSTA 1TU7A 1NHYA 2H1BA 3KMOA 1FHEA 5D9WA 3US3A 2WS2A 1GRXA 1ERTA 1ABAA 1A23A 2WDUA 2JACA 2LSTA 1XW6A 3I6AA 2WGRA 2LS5A 5DVBA 1BQ7A 3TRQA 1GWCA 3KGKA 1CQHA 1M2BA 2HE3A 3ZVJD 3GSSA 2IMKA 3UAPA 1TK0B 5J9CA 2PMTA 2L57A 4MJCA 1VF2A 5DJMA 1GSFA 5ECIB 1RW1A 2MMNA 1K0CA 2CZ3A 4PNGA 4LLRA 3FRCA 2E0QA 1EOGA 1HNCA 3L9SA 1SK2A 3QFBC 3ME7A 2G2QA 2GT5A 4WR4A 4HJMA 1Y25A 2CVDA 3M9KA 1TKDB 3U5RE 1OC8A 2FD3A 3W6GA 5CRDA 4IS0A 3VPTA 2O87A 1B48A 3LSZA 3FKFA 5B8BA 2DJ2A 2LKUA 3ERWA 1FVJA 2B7KA 8GSSA 2C8UA 1PKWA 4IELA 4CHSA 3FY7A 3HCZA 1SYXA 5G2ZA 4LL4B 4IP6A 1O7UA 4GSTA 2E2GA 3N5OA 2R2JA 1GP1A 1SKRB 2QKEA 5CRGA 1V40A 1T00A 3GYKA 3QMXA 3TDGA 4EL1A 3M8NA 19GSA 2VL3A 4IHUA 3C8EA 3GX0A 1I9DA 2VAFA 1T4YA 1F3BA 1UN2A 2XPEA 4F82A 4HUAA 2GZZA 4XHMA 3KP8A 1WJKA 1ML6A 4HDEA 3DGQA 3P8WA 1SD9A 4EKZA 5JCGA 4X0XA 4K9ZA 1XVWA 1Z5YE 13GSA 2RUFA 3GKNA 5H5SA 3PR8A 2DJ0A 3ZLPA 2ZUPA 1AC1A 3FZ5A 5ABRA 3UBKA 4F0CA 1PRXA 3TJGA 2CQ9A 1QUWA 2YPMA 2FWFA 3EINA 1O73A 2H01A 2GDRA 4QL9A 5HQPA 4GWRA 4K2DA 3LJRA 5DAKB 3ISOA 5IQYA 4HS1A 2JZSA 3QCPA 4KCEA 2TRCP 1XXUA 4TR1B 3L4NA 3F6DA 4JBBA 3VWWA 5LNKe 3DMLA 3F6FA 4MZWA 1EP8A 4X43A 1OYJA 4MJBA 5HR3A 2YANA 3TJKA 3ZIJA 1A8LA 3LORA 12GSA 2P5QA 1Z9HA 3QAWA 1A2JA 2IWTA 2H19A 4BWSA 3HVVA 3BD2A 4NXIA 2PN8A 2PVQA 3ZFLA 2ALBA 3ERFA 1GLPA 1AIUA 3U6VA 3D0ZA 4PUAA 2VCTA 3BCIA 3HYPA 14GSA 1UC7A 1U6TA 1XWBA 1WP0A 4GLTA 3KJYA 4BPYA 1BAYA 5GSTA 4TR0A 5FHIA 11GSA 3TJBA 4KE3A 3L78A 1U88A 4PUFC 1ZMAA 3CSIA 1XW9A 1YEXA 1G0TA 1GUKA 1DUGA 3F63A 2V6OA 3CYNA 1J9BA 3F3QA 2PVOC 1EP7A 4HQSA 1XWGA 3CXGA 2L5OA 3TGZA 2YNXA 3DVWA 4NHWA 1SL0B 5A4VA 3DXBA 1YEPA 4LL1B 1IYIA 3I9V2 5GZZB 2H74A 5FWGA 4EDYA 3M0FA 2P0GA 3GA4A 4GRFA 2YWOA 4XS4A 1B4QA 2CV4A 1HQOA 2WFCA 4NPBA 5J3RA 3CRTA 1K0MA 1PX6A 2GGTA 5ID2A 1MTCA 2V1MA 4AJ7A 1KBNA 2EIOA 3BBYA 1TP9A 2P31A 3ZRDA 2AHEA 4IW9A 3IK7A 3EU4A 1PX7A 6GSUA 3IPZA 2EC4A 4TXVA 3GL5A 1V58A 3KIJA 2XBQA 2EIQA 2CZ2A 4JU5A 4K7NA 3G7IA 2YWNA 2AUVA 5DJLA 4G10A 5B6MA 4K8MA 3KP9A 2H71A 1TJDA 2GQLA 5DQSA 1A0FA 2B6MA 4YAVA 1TK8B 1ERWA 16GSA 3LG6A 3CSJA 1QQ2A 4N10A 4AJ8A 5IOXA 3IAM2 1WRYA 4ECBA 3KD0A 4ZBDA 4IBPA 3GMFA 4KX4A 3HHVA 2I1UA 4Q5FA 4IVFA 3UBLA 3HZ4A 2N5BA 5A4UA 3P2AA 3C73A 2DIYA 2NDOA 3KCMA 2IPAA 3KEBA 3LYPA 1YJ6A 4MJAA 3CTGA 3GNJA 3M1GA 4HQZA 1AAZA 3L0HA 2X8GA 1XFLA 4EVMA 1ZL9A 2K9FA 2FGXA 2AAWA 3H4KA 1MD4A 3P90A 4WBRD 2H1GA 4OD7A 3DEXA 2JSZA 2AV4A 3ZL5A 1WIKA 4GF0A 4G19A 2YWMA 5HFGA 1EGRA 1X5CA 1TTZA 2YOIA 4ZBAA 4O7HA 3SBCA 1M7TA 4ISDA 1XZOA 4MH2A 4ZB6A 3F3RA 1GLQA 1Z6MA 3TJFA 1MDJA 4DSSA 1ERVA 4E8EA 1GUHA 1E6BA 2OJLA 2VCZA 1CQGA 5ECHB 1Y6EA 1X9MB 5HR2A 1YKAA 4K7OA 3IR4A 1WOUA 4I6XA 3H8QA 5LD0A 2VO4A 1F9MA 2B5YA 4NV5A 4Z7XA 1A0RP 2V41A 3FR9A 4XCSA 3MNGA 3FZ9A 5G1LA 5GAND 4RI7A 2B7JA 4ILFA 3GV1A 3TRPA 3KH9A 1PD21 2M46A 2IMIA 4XS4B 3ZMLA 1EV4A 1FB0A 1JZOA 2VM2A 5G1KA 4TKYA 1GTAA 4F2IA 4KA0A 4K0GA 3O6TA 3F0IA 1K3OA 1OC3A 2A4VA 2GTUA 4XS1A 4G9HA 5ID2B 1AQXA 3HA9A 4XTSA 1GUMA 3HY2A 1SYRA 2EIRA 5G5EA 1TI3A 3DIEA 1SKSB 4NWYA 1R5AA 5G30A 3G9BA 5IO0A 3LYKA 2L6CA 2PGTA 4KW6A 1V9WA 3ZREA 1TK5B 5J4UA 3NZNA 1O8XA 2V32A 2ES7A 2I3YA 3N9JA 2LTKA 2WRTA 2LQOA 2F8AA 1J08A 1W4VA 5IMCA 2CVBA 5F07A 1QGVA 2H1DA 1SJ6A 2WZ9A 1K0NA 1EEMA 22GSA 1GSDA 3F9UA 5ECOB 4XS6A 2NPBA 5DCGA 5G31A 4KSMA 2H0IA 3VLNA 4EE0A 1PA3A 1M9AA 4ML6A 3KZQA 1UVZA 2TRXA 2IMDA 4I8BA 3LQ7A 3VFIA 5IPGA 1X5DA 2JU5A 2YZUA 6GSYA 3WT1A 5HR0A 2JZTA 1DE1A 1B8XA 1MD3A 2PBJA 4PXOA 4LMVA 1GL8A 2A2SA 4HU7A 1UA5A 2G0FA 2F8FA 3IHQA 1JFUA 5D8IA 1TRVA 2LEGA 3TUEA 3UMAA 3DWVA 1SK0A 3APSA 3HKRA 4N30A 1VF4A 4WF4A 1M9BA 5IMFA 3ERGA 4V2LA 4OMVA 1K0AA 5ECLB 3QFAC 2H6ZA 1SL2B 10GSA 1HYUA 4OO4A 4FO5A 3GH6A 4JEDA 1TW9A 1Z7PA 3CRUA 1PL2A 5H5RA 2CX4A 4DSSB 2YV7A 1GSSA 4L8EA 1WMJA 5A4WA 1PSQA 1V2AA 1TRSA 3A5WA 3NOFA 2IMEA 4TN8A 1LU4A 9GSSA 1XIYA 3LWAA 5B6NA 2OKAA 3LGCA 1BEDA 3RAZA 1M2DA 2HT9A 5AISA 2FY6A 2VLUA 4BL7A 2KLXA 3HVXA 4BA7A 4KB3A 5DQYA 3QOUA 1TDIA 2YCDA 1VRSD 3GKXA 3FZAA 2N5AA 2R37A 3A2VA 4MF6A 2DMMA 4JR6A 4MPFA 2VD1A 2L4CA 3BJ5A 3W8JA 3IAS2 3QD9A 3BOAA 5KN0A 5KN2A 3IRAA 1FO5A 2V6KA 3APOA 4WR5A 4F0BA 2C0DA 3MSZA 4K1FA 4JR4A 1GSUA 2OE0A 2E7PA 3IE3A 4TR3A 2C3TA 1K3YA 1HNBA 1KTEA 4EC0A 1OVNA 2MYGA 5DBQA 5CNWA 3O3TA 6GSTA 1TXXA 3HJPA 3W8SA 2KOKA 3IXRA 1OE7A 1XCCA 5J9BA 5JWOB 3SWLA 2M72A 1YF1A 4JE1A 3VI5A 1THXA 4MLYA 1B4PA 3GIXA 1JLVA 3JCML 3ME8A 1ZGNA 1ZYQB 2GVPA 1ERUA 5KN1A 4IQAA 2K8VA 2CA8A 3TKPA 3OR5A 5AIVA 4MZBA 3CTFA 3RDWA 1ILOA 1F37A 2C3NA 1G7EA 5ELGA 4ULXA 2L59A 4I5QA 3UARA 3VWVA 4IKHA 2IFQA 5D93A 4IJ3A 3Q6OA 5DDLA 2YWIA 3HVSA 3QAGA 4ZL9A 3F4SA 1NHOA 1XBSA 3VWXA 5B8AA 2VCVA 3R2QA 2VL2A 2GZYA 3GTUA 4ZB9A 2FHEA 1URMA 2CAIA 2CT6A 1A2MA 2O89A 2MZCA 1EOHA 2F51A 2QSIA 3TJJA 1YDKA 4MZCA 1DSBA 2HRFA 1NSWA 2J9HA 4ZL8A 3RBTA 2ON7A 2VLVA 1SJIA 5JCUA 5IMVA 1I5GA 1PMTA 1XW5A 2DC5A 1DE2A 1FVKA 4FYBA 3H79A 1TOFA 2NTOA 2HLSA 3KXOA 1U3IA 1T3BA 1AQVA 1O81A 4AF2A 5IOWA 4YH2A 3ZMKA 2RM5A 3IV4A 1S3CA 3EMPA 3ZITA 5IMZA 5ELAA 2CVKA 5ECPB 2GZPA 1EWXA 2GLRA 5KN3A 1GNWA 2C0EA 1MEKA 3EE2A 4F9ZA 4ECIA 2AB6A 2LJKA 2FUG2 1K0DA 4GQFA 1XOAA 2QGVA 4N0ZA 3J7Yb 4KUNA 4EF0A 5D73A 4MJEA 2NBSA 4WXTA 4GTUA 1ZCPA 2HRNA 3EVIA 4V2MA 3MDKA 1XVQA 2TIRA 4MK3A 1Q4JA 5DCHA 4HOJA 1X9SB 2PPTA 1EGOA 2GSSA 4BVYA 4AJ6A 3AY8A 4TW5A 2GSRA 5DALA 4TRXA 2OBIA 2DJ1A 5G5FA 1USBA 2XPDA 5B7CA 2HZFA 4WEYA 1R4WA 4KDYA 4MPGA 3HJOA 1JZDA 3D5JA 3D21A 4LMWA 4OCEA 2FA8A 2ZCTA 2RIIA 2XC2A 1KNGA 4J2FA 3F8UA 2B1LA 2R6KA 3C7MA 3A2XA 4FIWA 4OFNA 4MF5A 2C80A 1OC9A 2AYTA 3HJMA 2VOCA 3LEFA 2VD0A 2IFQB 5E59A 4EDZA 4AGSA 1R5PA 3VURA 4DSQA 4O32A 5IM9A 3G7YA 2YV9A 2HI7A 3PH9A 3BCKA 3GTUB 3L9UA 2BMXA 2OACA 1VGLA 3D6IA 2K18A 4DEJA 3NIVA 3UVHA 2YJHA 2H1AA 3DKSA 5D9XA 2FWGA 3LXZA 2B3SA 3VPQA 2MBSA 4POKA 3CBUA 1A24A 1AUCA 2X8CA 4J57E 2PU9C 1S3AA 4PQHA 1SU9A 1Z3EA 3S9FA 17GSA 2CAQA 2R5GA 2R3XA 5ECNB 3GSTA 1FG4A 2ZNMA 2H76A 3ZIVA 4EUYA 1SK1A 4GSNA 3TKSA 1GULA 4FYUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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