5ENUA

Crystal structure of an alkyl hyroperoxide reductase from burkholderia ambifaria
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HHHHMSVEVDRQVPDFTAPATGGDISLSDLKGRKLVLYFYPKDNTPGCTTEGLQFRELYPKFKKAGAEIIGVSRDSLRSHDNFKAKLELPFPLISDADEALCALFDVIKMKKMYGKEVRGIERSTFLIDADGVLRQAWRGIKVPGHVDDVLSAVQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an alkyl hyroperoxide reductase from Burkholderia ambifaria
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ M
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia ambifaria
total genus 53
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5enuA00
2LV3A 4I97A 2VCVA 2FWFA 1SKWB 1WP0A 1PKZA 2F8AA 1SYRA 2DJ1A 4JR6A 2P31A 2MBSA 2DJ0A 2HXKA 4MF7A 1LU4A 5DBQA 4HEA2 3ZFBA 1Z7RA 3C1SA 4BVXA 1WJKA 1JLWA 2LEGA 5IO0A 1THOA 4CHSA 3G9BA 2B7JA 5CRDA 3DVXA 2HRNA 5IOWA 5ID2B 2VD0A 4WBRD 1MD3A 2WZ9A 9GSSA 3DEXA 2GLRA 1XW5A 5F07A 5CYYA 3SWLA 4XRDA 2YZUA 2LJKA 4PX1A 2H74A 3BCKA 1WE0A 5J5NA 1YQ1A 3WYWA 3ZMKA 2ON7A 4KAEA 2VCWA 1PGTA 3EWLA 2B3SA 3H8QA 2DBCA 3HVXA 5IMVA 1GH2A 3VFIA 5EL8A 3EVIA 1XCCA 1EWXA 1R4WA 2GZYA 3WT2A 3F4SA 5D96A 3ISOA 1M2AA 2FUG2 4POKA 5CP1A 3TKQA 3ZIJA 1T3BA 4L8EA 2C1YA 4K6XA 4HI7A 1TP9A 3M9JA 1JZRA 1O8XA 3GTUA 3DD3A 4OFTA 2R37A 4KDXA 2VIMA 4HZ2A 4EDYA 2VL2A 4FIWA 5B6NA 2K6VA 2Z9SA 4ECBA 4ZB9A 3ZL5A 1K0CA 2JU5A 5DDLA 1E2YA 1Z6NA 1XWGA 4EUYA 1PQNA 3Q74A 4MH2A 3FK8A 4MPGA 2PBJA 3HVVA 1FG4A 2H75A 2IIYA 3GA4A 3GKXA 3D22A 3W8SA 4HJ2A 4F0CA 4EC0A 1AUCA 3EE2A 1GTAA 1V98A 20GSA 1GULA 4I2TA 2H72A 3FY7A 2QKEA 2VUPA 3CMIA 2H19A 3F8UA 1ZYQB 5KEJA 1JFUA 1SK2A 2YOIA 3CXGA 3LFLA 2B7KA 2N5BA 1AW9A 2IN3A 3LG6A 3U5RE 6GSWA 2VLVA 3IR4A 1Y6EA 5ECRB 3KXOA 2CT6A 4OWYA 3HKRA 3S9FA 5HR1A 2NTOA 1NW2A 5EY6A 4EKZA 1WOUA 3IAM2 3F4TA 5ECOB 2C3NA 3A2VA 4ECCA 4K1FA 3GN3A 1BQ7A 1H4OA 2ON5A 1X9SB 3D4TA 2WFCA 2VLUA 1KBNA 3A2WA 2VL2C 1F6MC 4O92A 4ID0A 4XTSA 2KP1A 1GSDA 3TKPA 5D9WA 1R26A 4IQAA 4ZILA 1O6JA 1X5EA 1A8YA 4LA1A 2O85A 1YF1A 4I8BA 4MP4A 3D21A 4MPFA 1TK0B 1MDIA 1GRXA 2NBSA 3FYGA 3Q6OA 4XS4A 3M0FA 1A2JA 3APSA 4YQMA 1WRYA 3UBLA 2DMMA 2IFQA 2E7PA 4JE1A 5G5FA 3GFKA 1NHOA 4GQCA 4RUVA 3D4MA 2E2MA 2C8UA 4O7HA 1AIUA 3GV1A 4KB3A 2H30A 1YEPA 1MEKA 3WT1A 4J57E 2LRTA 1LJRA 1U87A 3ME7A 5J9BA 1OYJA 5JWRB 5F0GA 3TJGA 6GSVA 4IHUA 1DE1A 2VL9A 5KN0A 1S3CA 3TJFA 2JSYA 4OMVA 2TRCP 2EC4A 4F9ZA 3VWXA 2A2RA 4MMMA 2CZ2A 2AAWA 4XS6A 4GSNA 2CAQA 1XWKA 5JCWA 1XOBA 5DJLA 2VD1A 1UC7A 1V2AA 1FB6A 2L4CA 4MCUA 2YJHA 1SJ6A 1M99A 3GH6A 3ZZXA 2MBTA 5F05A 1ERUA 1T1VA 4JBBA 2HFDA 2OE1A 4DSQA 1FVKA 3HJPA 5ECMB 3ZRDA 1AQWA 5LCZA 4PNGA 3QD9A 5F06A 2L4QA 5IM9A 2VLTA 5DQYA 4L5LA 4G19A 3VWVA 5L71A 1R5PA 3EINA 3JCML 1M7TA 5FHIA 3HA9A 1GSQA 2HE3A 4I6XA 1FHEA 3VLNA 1PD21 4YQVA 2K9FA 4E8EA 3KCMA 1X5CA 1OAZA 1OC9B 2AHEA 4AF2A 4TVEA 5AN1A 4Q5FA 1ERVA 1EGRA 4ZIJA 3KD0A 2P0GA 3PINA 1G0TA 3I43A 2WJUA 2RUFA 1PKWA 1K0NA 4WF5A 1SD8A 4ZBBA 4ECJA 2FWGA 1GP1A 1T7PB 2L5LA 1N2AA 3IK7A 4IP6A 5ECPB 2DJKA 1W89A 1RQMA 3UEMA 2WB9A 3TKSA 1EEMA 2AV4A 2XBIA 2GQLA 2V6OA 4NHZA 2K8VA 1AQXA 2OKAA 2E0QA 3A2XA 3VI5A 1O7UA 3GSTA 5DALA 2JZSA 5H5QA 4K0NA 4XCSA 2GDRA 4ML1A 2LQOA 5IPHA 4H86A 3VURA 1AAZA 5J9CA 2CVBA 1TXXA 1SKRB 3IPZA 3P90A 4XRAA 5G30A 1TK8B 1YDKA 2R5GA 3IRAA 1A2LA 1URMA 4TXOA 3KMNA 1TKDB 3F9UA 4PQ1A 1GSUA 3GKNA 4TR0A 2QSIA 2B1LA 2H8LA 4O32A 3QCPA 3ZVJD 3KTLA 4X43A 1GTBA 1V40A 4YQUA 1T4YA 2KLXA 4RQXA 3GTUB 4BPYA 1EV9A 3DMLA 1K0OA 1RW1A 4TR3A 3GH9A 4MK3A 2JADA 3MDKA 1TRSA 2NPBA 2OE3A 3RPNA 5IQYA 2CX3A 5ENUA 1SL2B 1K3LA 2MYGA 1BEDA 3TKSC 1GLQA 3L9UA 3LJRA 2P5RA 5A5KA 5B8AA 5J41A 3FZ5A 1YJ6A 1OC8A 1DE2A 3MAKA 1SENA 1IYHA 2H66A 4Q5NA 4OO5A 2FHEA 3LSZA 1XPVA 1U3AA 1KTEA 4GXZA 4O5RA 3I6AA 2F9SA 1TTZA 2YCDA 2KUCA 1F2EA 1K0DA 2CAIA 1SK1A 3TUEA 4MF5A 2JL4A 3DVWA 4BWQA 18GSA 4F82A 1TK5B 3NOFA 3RAZA 4QQ7A 4GSSA 1FB0A 3FKFA 2X99A 3EU4A 4BL7A 4AJ7A 4ISDA 4GWRA 1XFLA 4J2FA 3FZ4A 4EVMA 2PUKC 1RK4A 5DCGA 1Z9HA 4G10A 4TXVA 2YJ7A 3P7XA 2FWEA 5HFKA 5AIVA 2LSTA 2H6YA 3TJKA 2HT9A 4BA7A 4NXIA 3A5WA 2VCZA 3CRTA 2VO4A 1HNAA 2FNOA 1X0RA 1A2MA 2R3XA 2X64A 4MJEA 1FOVA 1SK0A 3HXSA 3KEBA 1JZWA 4XHMA 5INYA 1J0FA 4WXTA 5HR2A 3WD6A 4XS4B 4DEJA 2GSQA 3APQA 4TR4A 3GL3A 2KP2A 4IBPA 5ELGA 4ILFA 1FAAA 5J3RA 1X9MB 2IFQB 5HFGA 2C0GA 1GUKA 4WKWA 1HYUA 2WULA 1V58A 5ECHB 3QOUA 6GSTA 3RHCA 4JEDA 3G7IA 4GQFA 5G31A 1QQ2A 2GT5A 2ZNMA 1SD9A 5GSSA 4V1Ag 3P2AA 1WMJA 3D0ZA 4V2NA 3E3EA 3PH9A 3IDVA 4TW5A 2GTUA 1J9BA 1Z5YE 1Z3EA 3HZ8A 5D9XA 1S3AA 1MDJA 5IMCA 2J23A 1B4PA 5IMAA 4IW9A 2LUSA 4F0BA 2H0HA 2DJ3A 3ED3A 1X9WB 4RI7A 4HJMA 5ELAA 3AY8A 4WEYA 4NMUA 3H4KA 1EGOA 4ML6A 1TRVA 4PURA 3FR3A 2CV4A 4AJ6A 3F63A 4GCIA 3PR8A 1FW1A 4FH8A 4IS0A 2CVKA 3LYPA 3QDNA 4LL4B 3R2QA 1K0MA 2FGXA 1TI1A 1XW9A 5D93A 2H76A 2X8HA 3HDCA 5JWQB 2DSAA 1XVQA 2BMXA 2IWTA 1F3AA 4N0VA 3QPMA 2H1BA 3GYKA 2F8FA 2BJXA 3EMXA 3L0HA 1GTIA 3KMOA 1CQGA 3DRNA 5ECNB 1VF1A 2FWHA 2XC2A 3ZREA 2YNXA 1SJIA 5CREA 1TJDA 1WWJA 2RM5A 2KHPA 2YP6A 5HR3A 2HZEB 3NZNA 5G5EA 2OBKA 5H5RA 2DJJA 3M9KA 4ECIA 2OJLA 1CQHA 1F3BA 3EMPA 3GURA 5LNKe 2XBQA 2V1MA 1R7HA 3P8WA 4RI6A 3TJBA 1Z6MA 4GRFA 3CYNA 2O89A 3CTFA 2TRXA 3FHKA 3GIXA 2PMTA 1ZOFA 2C0FA 2IMDA 1VF2A 14GSA 2XPEA 5EPFA 3FZAA 2YWOA 3LORA 5DALB 2GGTA 1U6TA 1K0BA 2LRCA 4IJ3A 5B7CA 1C72A 4V2MA 2R6KA 2CQ9A 3MSZA 4GTUA 1SYXA 4BVYA 4DSSA 2WRTA 4QL9A 1GLPA 3BJ5A 4TXOB 3GNJA 3LEFA 5CNWA 3UIWA 5ECLB 4TR1B 2ALBA 1VRSD 3LGCA 5G1KA 1OE8A 1A24A 3KZQA 4KH7A 1PA3A 1O81A 17GSA 3TB2A 4P3YB 2R2JA 1MDKA 3HVSA 2NVLA 1BAYA 2DJ2A 4K8MA 6GSYA 1XZOA 3ZYWA 2VL3A 4MJAA 1EP8A 4N30A 4ZL9A 2PERA 4NHWA 4JR4A 3LYKA 5CRWA 2H71A 5CRGA 3M1GA 1AXDA 1Q98A 5IIZA 2O87A 4D73B 4PQIA 2A4VA 5ECIB 2M46A 1EOHA 1XVWA 1U88A 5F8BA 2GS3A 4MH3A 4NV2A 1LBKA 2B1KA 3IXRA 4WR4A 4KE3A 3FEUA 3QMXA 2F51A 4GF0A 5DVBA 1ILOA 4MZCA 3H79A 3UOMA 3FW2A 4MDCA 2GZZA 2CA8A 1XBSA 5D8IA 1M9BA 1EEJA 3HY2A 5KN3A 4MJCA 3VK9A 3VWUA 2JZRA 5ECSA 4FYUA 4ZB8A 2HZEA 3F3QA 3Q19A 4IJIA 4WETA 2EIQA 3KGKA 3F3RA 4YAVA 1M2BA 2LNTA 2VM2A 4PQHA 2MMZA 2MMAA 3HHVA 2EIRA 2H1DA 1VGLA 3WGXA 3QAGA 4KX4A 5D73A 2ES7A 2RIIA 3I69A 1TDIA 3IBHA 3V1WA 1JZDA 3CSHA 3M8NA 4GSTA 5ABRA 3CSJA 3OR5A 1AQVA 2L59A 2H01A 2PVOC 4PUFC 2FD3A 4PGTA 4N10A 1R5AA 4KDUA 3HJMA 3ZLPA 2VAFA 1YF0A 1TRWA 1I5GA 1ERTA 5EVOA 2IJYA 1OC3A 4CDOA 3UVTA 4MABA 2I81A 3CTGA 2B5EA 3TRQA 2WS2A 4JZQA 4LMVA 3TGZA 3WGDA 5HR0A 2M72A 2H70A 2OBIA 4TR1A 4X1UA 4WF4A 2REMA 10GSA 3APOA 1JHBA 2LTKA 3LXZA 5KN2A 3L9VA 1THXA 1YY7A 1X5DA 4POBA 1ZGNA 2QGVA 5C00A 3EYTA 4TOPA 3EC3A 1HNCA 4K0GA 3FRCA 4KSMA 4AGSA 3QAVA 5CRHA 1TW9A 3IHQA 3KIJA 3BOAA 4D73A 2IMKA 5IMZA 2PPTA 2YANA 2LS5A 3FR6A 1YEXA 2D2ZA 2I9HA 4NAXA 3DWVA 1GTUA 3PGTA 3DYRA 5DAKB 1VF4A 2GT6A 5AGYA 2YWIA 3HYPA 3E0UA 1Q4JA 4K7OA 3TCOA 3ZITA 1SJZA 5DQSA 4PXOA 4ACSA 3QAWA 3TKRA 3KTBA 1B9XC 1PN9A 2MZCA 8GSSA 2RM6A 2BTOT 4MA9A 4TRXA 1ON4A 3J7Yb 4LL1B 1JLVA 5AIXA 4EO3A 4KSOA 4NPBA 3ZIVA 4L5OA 2X8GA 1YKAA 5D9VA 3C1RA 6GSXA 4EL1A 4HOJA 2P5QA 2A2SA 3QR6A 3A3TA 1I9DA 2HLSA 3F4RA 4YH2A 1GNWA 3HZ4A 1XXUA 4IELA 1NHYA 3H93A 1ABAA 2J9HA 1K3YA 1SL0B 1PMTA 2GZPA 1EV4A 4K7IA 2YV9A 2EIOA 1V57A 1ML6A 1F9MA 1NSWA 3GKKA 3O76A 3KJYA 3TOTA 5H5SA 2LQQA 4E8HA 5GZZB 3TDGA 1EZKA 2CZ3A 3QFBC 5J4UA 4OCFA 2O7KA 1H75A 4ZBDA 13GSA 3VPTA 4XIHA 4V2LA 3ZFLA 1XW6A 1ACVA 3MWHA 2VOCA 1EP7A 5E4WA 1KEBA 1A23A 4OFNA 1DSBA 1S3DA 4TN8A 3W6GA 2PWJA 4FYCA 3IOSA 2N5AA 3L4NA 3Q18A 1W4VA 5KN1A 3ERFA 2JACA 2L6DA 1V9WA 4F2IA 4DSSB 3BBYA 3L78A 3W8JA 4EE0A 2XHFA 1B8XA 2V6KA 4POLA 1G6YA 5GAND 1A0RP 4DSRA 2ZUPA 2LJRA 3IK9A 4RQRA 1SL1B 3LQ7A 2V32A 2JSZA 3ZTLA 1ZL9A 5A4WA 4X0XA 1QUWA 19GSA 3ERGA 2H6ZA 4I2UA 4G2EA 4ZB6A 3EU3A 4MZBA 1G7OA 3FZ9A 5DAKA 5B6MA 2WDUA 2V41A 4IN0A 3VPQA 2LJAA 22GSA 4IVFA 4ZL7A 1T8EB 2DIYA 4L0UA 4ZBAA 1O85A 1ZCPA 3RDWA 2C0DA 1GUMA 3DIEA 2NDOA 5D9TA 4FO5A 4IQ1A 1HQOA 4ULXA 2M80A 2O8VB 3UMAA 2LKUA 5FT3A 2G2QA 2I1UA 1UA5A 1O73A 2ZCTA 2QC7A 1YKCA 2H1AA 2R4VA 5CAXA 2HSHA 3EURA 1GSFA 5ECQB 4LMWA 2GSTA 4K7NA 3US3A 2WCIA 3TKSE 16GSA 1TI3A 1T4ZA 2C3QA 3UBKA 2CVDA 5B8BA 3HD5A 3UJ1A 2F3MA 1BG5A 3KP9A 6GSSA 5JCGA 4FYBA 1DBYA 5CO3A 2YV7A 4POMA 2FLSA 2GVPA 1PX7A 2FCHA 2I3YA 2B5YA 2IL3A 3GX0A 1SKSB 4HS1A 4KCEA 4LLRA 1MD4A 4HU9A 5ID2A 3J7Yk 4KDYA 2B5XA 3IAS2 2YWNA 5AISA 1PX6A 4TKYA 3O6TA 5COHA 3CBUA 1MTCA 1QFNA 1G7EA 3LWAA 3L9SA 2CX4A 3O3TA 5IMDA 3ME8A 2HNLA 2AJQB 2V2GA 4MF6A 3GHAA 3K8NA 2E2GA 5ECKB 1TRUA 1HD2A 4V1Ap 3FR9A 4HDEA 2OA7A 2C3TA 2RUEA 2HRFA 1OKDA 4PNFA 2N5FA 5IMFA 4DVCA 1T00A 4HUAA 2H0GA 2GQMA 3N5OA 3CSIA 1PSQA 5E59A 3KM6A 1BJXA 3IA1A 2DC5A 1E6BA 1SU9A 2C4JA 3N9JA 1ZZYA 3TOUA 3F0IA 1BYEA 4NWYA 2YZHA 5IPGA 5GAPD 3F6FA 3WGEA 4EXJA 3I9V2 1XIYA 1AC1A 1JZOA 3HJOA 2FY6A 3D5JA 3TRPA 1OE7A 1QMVA 1J08A 5LD0A 1DUGA 4K2DA 2PGTA 1Z7PA 4JU5A 3U6VA 3M3MA 1ST9A 1XWCA 2L6CA 1OKTA 1HNBA 5IOXA 4G9HA 2OACA 1B9YC 4KCAA 3UAPA 6GSUA 4OO4A 2IMIA 1Y25A 4ZXGA 1GUHA 3VI7A 4Z7XA 2YPMA 1M9AA 2DIZA 4Q5QA 2FA4A 2PU9C 3IE3A 1KNGA 1ERWA 3RPPA 4BWSA 2H6XA 3GUSA 3LXTA 4EDZA 1FVJA 1O8WA 1USBA 3GRXA 1GNEA 2K8SA 2H73A 3G7YA 2L5OA 5JWOB 1VF3A 1PL2A 2H0IA 3RHBA 3GSSA 3GMFA 3TJJA 3BCIA 1K3OA 1A0FA 1M0UA 4KW6A 4IGJA 2KOKA 2I4AA 2HSYA 4IKHA 4YAPA 1TOFA 1XWAA 2IMFA 2YWMA 4HU7A 4GLTA 3UARA 2AYTA 1GSEA 2YN1A 11GSA 4JRRA 3F6DA 1F37A 3D6IA 4KNDA 4N0ZA 1B48A 1G6WA 2RLIA 1GSSA 2VCQA 3SBCA 1WIKA 4PUAA 3C8EA 4HQZA 1FO5A 1N8JA 1B4QA 2L57A 3NIVA 2OE0A 3UVHA 4OD7A 2LNSA 4ZL8A 2HI7A 1UN2A 4KGIA 1UVZA 4KUNA 3GL5A 2AB6A 4I5QA 3C7MA 3RBTA 1YZXA 3ZVJA 4WR5A 3MNGA 3IV4A 5A4UA 1XOAA 5G1LA 1GL8A 3KH9A 2G0FA 4N11A 2WGRA 2DMLA 3VWWA 2FA8A 2AUVA 2X8CA 3E9JB 4NV5A 2DLXA 1M2DA 4HZ4A 3C71A 1QGVA 1XWBA 1A8LA 1GSYA 2HZFA 2IMEA 2PN8A 2TIRA 3GKMA 4MLYA 2LRNA 1TU7A 3G7JA 4OFMA 3QFAC 3ERWA 2VCTA 4XS1A 4J56E 1OVNA 1WPIA 1GWCA 1PRXA 5HFIA 2XPDA 2H1GA 2MMNA 2VM1A 3UL3A 3DKSA 3HCZA 3H1NA 4K9ZA 4CW9A 4KA0A 1QXHA 7GSSA 5DJMA 4EF0A 4WBJA 3KP8A 2B6MA 3TRXA 3BD2A 2JZTA 5DCHA 2C0EA 4MJBA 2HYXA 1U3IA 4Q5RA 2IPAA 12GSA 5GSTA 4L0WA 3IC4A 3C73A 2GSRA 5FWGA 1IYIA 2GSSA 2OADA 5G2ZA 1K0AA 2C80A 3CRUA 2K18A 3DGQA 4IP1A 5C04A 3ZMLA 4OCEA 1ZMAA 5JCUA 1TU8A 1NM3A 4AJ8A 3KH7A 4QL7A 1EOGA 2MMOA 4F03A 5A4VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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