5HQPA

Crystal structure of the erp44-peroxiredoxin 4 complex
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the ERp44-Peroxiredoxin 4 Complex Reveals the Molecular Mechanisms of Thiol-Mediated Protein Retention.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hqpA00
4MABA 1ERWA 5IMZA 3NIVA 4F2IA 2R6KA 5D8IA 5G31A 5J4UA 4JU5A 2DJ1A 4XRDA 1A2JA 3D22A 3P8WA 3CXGA 2BTOT 1XBSA 4ML1A 5LD0A 1U88A 2B3SA 2HNLA 3RHBA 2GZZA 4POKA 11GSA 2GQLA 2V32A 3D4TA 2ES7A 4XS1A 2LRNA 1XOBA 4AJ7A 3DGQA 2IMEA 3AY8A 5CNWA 19GSA 1TJDA 2P31A 2FD3A 3KEBA 4G19A 1TRSA 2PGTA 2H0IA 5ELGA 2CZ2A 2C0EA 3VPQA 4WXTA 2PU9C 2PVOC 1QFNA 1DBYA 1IYHA 3BBYA 2FUG2 4XS4B 22GSA 4YAVA 1OKTA 1Z3EA 2OE0A 2CT6A 5HR0A 3J7Yk 3U6VA 2L6DA 3ISOA 3L9SA 2FGXA 3BOAA 2J23A 2WGRA 4O5RA 2QGVA 4EVMA 20GSA 1YZXA 1T4ZA 4K9ZA 2N5BA 3CRTA 5G30A 1H4OA 5AGYA 1TXXA 2R5GA 3LG6A 4ZBAA 5FHIA 2F51A 2IN3A 4PURA 3LXTA 4YAPA 4NHWA 2KLXA 2VO4A 4G10A 4TVEA 3WGXA 4MH2A 2IFQB 5DJLA 2YJHA 1YKCA 2PERA 2IMFA 5H5RA 1GSYA 4F82A 1FVJA 2LSTA 1T00A 1I9DA 5GSSA 5HFIA 5DAKB 2RUFA 4L5OA 4PQHA 2DIYA 5IO0A 1X5CA 2MBSA 2VAFA 3JCML 3FHKA 4DVCA 3APQA 1BX9A 1GUMA 2C0GA 1EOGA 4PUAA 3M3MA 5IIZA 2IFQA 3MAKA 1UVZA 7GSSA 1O81A 1WP0A 2R37A 4AJ6A 3PGTA 4MF5A 1QUWA 5DBQA 3ZMLA 1SD8A 3HHVA 4MLYA 2OBKA 3D4MA 1Y6EA 1S3CA 1PA3A 5J9CA 3LFLA 3Q6OA 3UJ1A 4AJ8A 1X5DA 3BD2A 1EP7A 8GSSA 4ILFA 2OA7A 4TR3A 5EVOA 4PX1A 2XBQA 1WE0A 3GV1A 3RBTA 2XPDA 1G7EA 2C0FA 2PMTA 3TCOA 3WD6A 1HYUA 2VCZA 1USBA 1WMJA 4L0WA 5CYYA 4GSSA 3QFAC 4GSNA 3I69A 4K2DA 5DJMA 1GULA 2H74A 2RLIA 3IOSA 2V6OA 1S3AA 3Q19A 5G5EA 4CW9A 4NV5A 5ENUA 4GRFA 4V2LA 4BWSA 2C4JA 1K3OA 4I2UA 5DQSA 2XPEA 3LORA 2L5OA 1AQXA 1WOUA 2EIQA 3ZZXA 4FYCA 2H6YA 1UA5A 1O6JA 2LTKA 4J2FA 5LNKe 1BG5A 1Z6MA 2M80A 2FHEA 3PINA 1V40A 4K7IA 5IQYA 2GS3A 1MD4A 3W6GA 5A5KA 3K8NA 5FT3A 1PGTA 4CHSA 1WRYA 2HSHA 3LJRA 4ISDA 3GN3A 1FAAA 3ZITA 1Q98A 3SWLA 4XIHA 4BPYA 1GLQA 2P5QA 2YN1A 3TKRA 1PD21 1G0TA 3BCIA 3M1GA 1TTZA 2QSIA 2V1MA 2TRCP 1W4VA 2GSQA 1QQ2A 2VD0A 2VL3A 4K1FA 1KEBA 1T1VA 4MZCA 4ULXA 4HDEA 2F3MA 4MMMA 2G2QA 2ZCTA 3TDGA 5B8AA 2WB9A 3KTBA 2B7KA 3KMNA 2X8HA 3C71A 3E0UA 1ZOFA 1GUKA 1YKAA 4OFNA 3FZ9A 2GSRA 1JLWA 4OCEA 3HD5A 1U3IA 3LEFA 4HS1A 4IBPA 1B4QA 1EWXA 1NHOA 1PKWA 5AIVA 3PH9A 3KD0A 4Q5NA 3QAGA 4H86A 4K8MA 5HR3A 4V1Ag 5IMCA 3UOMA 4D73B 2EIRA 1B48A 2KOKA 1A23A 3G9BA 2CVKA 1Q4JA 3QD9A 4K7NA 1TRVA 4KSOA 2YWIA 3FKFA 3GX0A 5INYA 1PQNA 1GL8A 1N8JA 4GSTA 2K9FA 1BQ7A 2LJAA 3IR4A 5ID2B 4FIWA 5IMFA 1TKDB 4D73A 1XVQA 1WJKA 4XS6A 1FO5A 2HXKA 4EL1A 2B1KA 2IMDA 1PMTA 5EY6A 3DKSA 2DC5A 4MPGA 3I43A 3TKPA 4QL7A 3UVHA 4N11A 3ZFBA 18GSA 2YNXA 5ID2A 4BVYA 2P5RA 1YF0A 3QPMA 2DJ3A 3GSTA 3M9KA 2PUKC 2K6VA 3KTLA 2QC7A 3GKKA 1FB6A 2M72A 2NDOA 4IQ1A 4E8HA 1J08A 4PXOA 5ECSA 1X5EA 2IMIA 5J5NA 2K8SA 3VLNA 1THXA 4NHZA 2LV3A 2ALBA 3VWWA 3F6FA 2YANA 4KSMA 5D93A 3D21A 3QFBC 4EF0A 3GH6A 4EDZA 5H5QA 4HOJA 3GX8A 2E2MA 2AYTA 3GA4A 3LQ7A 4JE1A 3HY2A 3A5WA 3J7Yb 4GF0A 5KEJA 2TIRA 4RQXA 3P2AA 1GUHA 2FWGA 2VM2A 2KP2A 2JADA 1OYJA 2VLVA 2JZTA 2H30A 1SK0A 3TKSE 2FLSA 1YEXA 3N9JA 1VRSD 4MH3A 1GTUA 2IMKA 4TW5A 1HQOA 3CSIA 1NSWA 3DD3A 2C3TA 2LNSA 1GRXA 4G9HA 3HVSA 1YEPA 2NTOA 3P7XA 1CQHA 4OMVA 4KGIA 1TI3A 1OVNA 2YWOA 2JU5A 3FZ5A 2RM6A 1K0OA 2YP6A 3CBUA 3QAWA 4N30A 3H8QA 5FWGA 4IP6A 3ZVJA 4TXOB 4I8BA 4HQZA 1JZOA 4KCEA 2GTUA 1JZRA 2F8FA 1SK2A 1TK0B 4TR4A 4EXJA 5D9WA 1JFUA 5B6NA 3IE3A 2WS2A 4ZBDA 1R5PA 5GAND 9GSSA 2H8LA 4K0NA 4LL1B 3F3RA 4WF5A 2H75A 4KAEA 4MJCA 4ZB8A 3VFIA 1LU4A 2ON5A 4TXOA 3VWXA 4XHMA 4J56E 4MZBA 1ZL9A 4LMWA 3G7JA 2XBIA 2GSSA 3TGZA 1GP1A 2H19A 5GSTA 2EIOA 3LWAA 1Z7PA 3EURA 4POLA 5KN2A 3TKSA 3ZYWA 3F4SA 3ERGA 2ON7A 3L9UA 5IOXA 4TXVA 4IJIA 1SK1A 1WIKA 4JBBA 1MTCA 4CDOA 4ZILA 2WRTA 4F0CA 1JZDA 1K0BA 3EMPA 3TOTA 3EE2A 2IJYA 1FVKA 1F3AA 1XWBA 5A4VA 3A2XA 2X99A 4KA0A 4DSQA 4KE3A 3NZNA 4KH7A 1M2BA 3HZ4A 1T8EB 5JCGA 2OJLA 3DRNA 2CA8A 4ZL8A 3I6AA 3KMOA 1FG4A 4JR4A 1SL0B 4DSSB 3W8JA 5DVBA 3L0HA 5CREA 1ERVA 1ERTA 1VF1A 2N5FA 3A2VA 2VL9A 1O7UA 3KH7A 2JZRA 4OFTA 1O8WA 3P90A 6GSXA 1ZYEA 5F0GA 3EYTA 3FK8A 1HD2A 3F3QA 4GTUA 4GXZA 1R4WA 1XVWA 3IAM2 4DSSA 5A4WA 1YY7A 3TJBA 4TKYA 5ECHB 2VUPA 2RM5A 2WDUA 2JSYA 3LYKA 4FH8A 5ABRA 2BJXA 2YZUA 2PVQA 3UBKA 1HNBA 3DEXA 1AIUA 5HQPA 4WBJA 1XCCA 1RW1A 2PPTA 3FRCA 1SJIA 4AGSA 3IK7A 3FW2A 5IPGA 1ZYQB 1ZMAA 1FOVA 1GTIA 4XRAA 1XXUA 5JWRB 1SYRA 4MZWA 1C72A 4QL9A 3UEMA 2B7JA 3QMXA 1K3YA 2X8CA 4LA1A 3KJYA 1FHEA 4ECBA 2K18A 2CAQA 1GNEA 3ZFLA 4WKWA 1BJXA 1A0RP 4EUYA 4WF4A 3ZIVA 5D96A 3LGCA 3O3TA 4ZB9A 1R7HA 3CMIA 4G2EA 1F6MC 2LNTA 1M99A 5J9BA 3VK9A 3TJJA 2C0DA 4KB3A 1M9BA 3M9JA 4IN0A 2H01A 4OWYA 1GSQA 2GQKA 10GSA 3IRAA 3DVWA 3S9FA 1ILOA 5G5FA 1TU8A 2MZCA 3HVVA 4RI7A 2YJ7A 1JLVA 2H6XA 4N10A 2O85A 12GSA 2KP1A 1VF4A 3LYPA 3TRQA 3FZ4A 5B7CA 4E8EA 2CX4A 1SJ6A 1G6WA 3EMXA 4KCAA 3C1SA 1M7TA 6GSSA 5D73A 2AV4A 1EP8A 3HYPA 4NAXA 5ECMB 2I1UA 1XFLA 2GT5A 3IA1A 1B8XA 2AAWA 1X0RA 2AB6A 2MMZA 5GAPD 3TJFA 4ZBBA 2FY6A 4ZL7A 4EE0A 4HQSA 3ZRDA 4P3YB 2HLSA 4WEYA 5LCZA 4J57E 4JZQA 3VI5A 3WT2A 2V2GA 2C8UA 2YV9A 5CAXA 2H66A 1OKDA 1SKSB 2HYXA 3UVTA 6GSYA 2NBSA 5CRDA 5ECOB 2DBCA 3GFKA 4MDCA 2LRTA 1MDJA 2G0FA 2YCDA 2L59A 2JACA 4EDYA 4OFMA 1M9AA 3I9V2 5HR1A 5CRWA 2O87A 2O8VB 3EINA 3DYRA 3IPZA 5B8BA 1OAZA 3US3A 3GNJA 3ZL5A 3D6IA 1J0FA 1Y25A 2JZSA 3HA9A 3HCZA 1H75A 2FWHA 3H4KA 3BCKA 1ZGNA 4K7OA 1SYXA 4Q5QA 3VWVA 3GUSA 4KX4A 4RQRA 6GSVA 3GTUB 3U5RE 2HI7A 1GTBA 3LXZA 3FZAA 1XWAA 1F2EA 1A24A 2FA8A 2VD1A 2KHPA 5DALB 2GT6A 3ZVJD 1NW2A 3F4TA 2VL2A 4HJ2A 5IPHA 2VLTA 1DSBA 4PUFC 2DIZA 1K0CA 5ECNB 1E2YA 3GTUA 2YWNA 4PGTA 2H1GA 3ZLPA 1YDKA 16GSA 2HT9A 4MF6A 5DALA 5HFKA 3CYNA 2H76A 2I4AA 3KM6A 1DUGA 3EC3A 1A0FA 2M46A 2WCIA 4WBRD 4YQVA 4O7HA 1PKZA 3IHQA 2B5XA 5DCHA 3UL3A 5D9TA 1CQGA 3GHAA 2Z9SA 1ON4A 2ZUPA 5AISA 3RPNA 4MA9A 1I5GA 4PQ1A 4NPBA 1XWCA 2HRFA 4BWQA 2OE3A 4V1Ap 1URMA 2HE3A 1W89A 2H0GA 4TOPA 3TOUA 2VCXA 3UIWA 4AF2A 2L4CA 1U6TA 2CV4A 2OACA 3ME7A 1ABAA 1VF2A 3TRXA 1EGOA 2OBIA 4GCIA 4L8EA 5A4UA 5F8BA 4TR1A 3IC4A 3HZ8A 1KBNA 2ZNMA 3H1NA 5ECRB 3GURA 1VF3A 1IYIA 2YWMA 3GYKA 5ECPB 4YQUA 4IGJA 1M0UA 4JR6A 5D9VA 4HI7A 4XCSA 4L5LA 5IO2A 5G2ZA 2PWJA 2L6CA 2FNOA 3UARA 3TJGA 2O7KA 1ZCPA 4MP4A 4N0VA 3L4NA 2LEGA 3GRXA 5JWOB 4IKHA 1A2LA 1F9MA 2HRNA 4KUNA 3L9VA 2JL4A 1A8LA 1SENA 1XOAA 1V98A 5ECIB 3UBLA 1DE2A 5IMVA 3D5JA 1O85A 4ID0A 3KCMA 1TK5B 2CX3A 2GSTA 1AC1A 2N5AA 2YPMA 1T4YA 4IELA 1Z7RA 4K0GA 2H70A 2E0QA 4OD7A 4KDYA 2IIYA 1G6YA 1PN9A 3RDWA 4NV2A 3UAPA 4GQCA 1V9WA 3GKXA 5JCUA 1J9BA 1XW6A 1XW5A 1KNGA 4IVFA 2EC4A 1OE7A 2IPAA 5G1KA 1WPIA 4KNDA 3CSJA 2AJQB 2VCTA 5CRHA 13GSA 2I9HA 2WULA 1AAZA 1GSDA 5ECKB 3ME8A 1O73A 2K8VA 1PL1A 1T7PB 4FYBA 4IP1A 4EC0A 1ACVA 1PL2A 3VPTA 1EEMA 2YV7A 2GLRA 2AUVA 1LJRA 3TB2A 4EO3A 3N5OA 1GWCA 5IOWA 3VURA 6GSUA 1AUCA 1K0DA 1TW9A 2DJJA 1V2AA 1KTEA 1O8XA 4QQ7A 3KGKA 3O6TA 4HU9A 4WR5A 1AQWA 2KUCA 2E2GA 3GKNA 4IHUA 2RUEA 2O89A 1OE8A 3IDVA 4IW9A 4LL4B 3LSZA 3IAS2 2H1DA 3EU4A 1K0MA 3GMFA 2GQMA 5F06A 1U87A 1EOHA 4NWYA 1QXHA 1GTAA 1SD9A 2HSYA 2QKEA 3MNGA 4LLRA 4KDXA 1F37A 4TR0A 3FR9A 4Q5RA 2HFDA 2OKAA 2DMLA 2LJRA 1GSEA 3V1WA 2F9SA 4HEA2 5DDLA 4BL7A 1X9SB 2GZYA 1LBKA 1Z6NA 2NPBA 3QOUA 1B4PA 5HFGA 4MJEA 5H5SA 17GSA 3TRPA 1EV9A 3F0IA 5COHA 5ECQB 1SU9A 2FCHA 2VCWA 2P0GA 1EGRA 3CSHA 4ACSA 1SJZA 2LQOA 2GDRA 3VWUA 4OO5A 2LQQA 2LS5A 4XS4A 1TU7A 5KN3A 1GSUA 5ELAA 3TJKA 2CQ9A 2I81A 2J9HA 4MK3A 4HZ2A 4HZ4A 2LJKA 1EEJA 3GL5A 1ST9A 3HJOA 1SL1B 2HZEB 4Q5FA 2V6KA 4YH2A 3M0FA 5KN0A 2RIIA 6GSTA 4ZB6A 3C8EA 2FWFA 3GKMA 3GL3A 3HJMA 4POMA 1QGVA 1HNCA 5F07A 2H71A 1A2MA 2A2SA 3IK9A 3C1RA 1YQ1A 2HZEA 1B9YC 5DAKA 4ZL9A 2H1AA 3M8NA 4ECJA 3WT1A 2A2RA 1BAYA 2DSAA 4ZXGA 4IJ3A 4X43A 3BJ5A 4L0UA 1RQMA 5F05A 1SKRB 1TRUA 3GIXA 2VCQA 3KP9A 2CZ3A 2YOIA 3FYGA 4FO5A 4LMVA 4ECIA 4EKZA 3IXRA 2WFCA 1N2AA 1ZZYA 1AW9A 2I3YA 4O32A 2WZ9A 4ZIJA 4IS0A 1NHYA 3C7MA 3MSZA 3FR3A 4JEDA 4RUVA 4F9ZA 2CVBA 4GLTA 3F8UA 3DIEA 3SBCA 1GSFA 1UN2A 1VGLA 1XWGA 5CO3A 3E9JB 5L71A 1OC8A 1MD3A 3MWHA 3TUEA 2REMA 1AXDA 2A4VA 3O76A 4TRXA 1GLPA 4F03A 2LUSA 4V2MA 1GNWA 3EU3A 1GSSA 5IM9A 3H93A 4HJMA 4OO4A 5DQYA 5EL8A 2H73A 5JCWA 3KP8A 1MDKA 1T3BA 3EWLA 2FA4A 3IBHA 2R4VA 14GSA 1BEDA 4DSRA 3D0ZA 1K0AA 1PX7A 2VL2C 3KIJA 4V2NA 3QCPA 3G7IA 4MJAA 6GSWA 5E59A 3FY7A 2LKUA 2VLUA 2H1BA 2VIMA 4JRRA 1X9MB 2H6ZA 2V41A 4WR4A 3C73A 3KH9A 2DJ2A 2NVLA 2C1YA 3CTGA 2JSZA 1WWJA 1E6BA 5CRGA 4Z7XA 1R26A 2L5LA 1XZOA 5B6MA 1TP9A 1G7OA 3TKQA 1S3DA 3GSSA 2B5EA 1YF1A 2HZFA 2C3QA 2OE1A 1JZWA 4YQMA 4HU7A 4MCUA 4K6XA 4X0XA 4OCFA 2GGTA 3QDNA 4N0ZA 1THOA 3HJPA 2E7PA 4PQIA 1OC9B 3QR6A 2XHFA 3Q18A 2LRCA 3HDCA 3R2QA 4ML6A 3HKRA 4IQAA 3APSA 3UMAA 4NMUA 3ERFA 2DJ0A 1PSQA 2VM1A 3CRUA 3WGEA 3H79A 2VCVA 1HNAA 2B6MA 3DVXA 1V57A 2IL3A 3DMLA 4BA7A 1OC9A 2DJKA 3APOA 1TI1A 1Z5YE 1TK8B 5IMAA 1FW1A 4HUAA 3WGDA 5GZZB 1F3BA 4PNGA 3KXOA 2YZHA 1R5AA 1K0NA 1A8YA 5AIXA 2MBTA 5HR2A 1XWKA 2MMAA 1OC3A 2TRXA 4GWRA 4I97A 2GZPA 1XW9A 1DE1A 1SL2B 5IMDA 3IV4A 2DMMA 2XC2A 3W8SA 1EV4A 1B9XC 2C80A 3F4RA 3L78A 1M2DA 3F63A 3A2WA 2C3NA 4MF7A 2R3XA 1QMVA 3A3TA 3DXBA 5KN1A 3EVIA 3GH9A 4I6XA 3G7YA 5D9XA 1NM3A 3ZTLA 2BMXA 2B1LA 3NOFA 4MJBA 3MDKA 4O92A 1MDIA 2H0HA 4ECCA 2MYGA 1YJ6A 2FWEA 1BYEA 1TDIA 3RHCA 4I5QA 2R2JA 4TR1B 1TOFA 1UC7A 4RI6A 5EPFA 3FEUA 3PR8A 3F6DA 2WJUA 4GQFA 1MEKA 2B5YA 4I2TA 5AN1A 3ZREA 5J3RA 1GH2A 1QK8A 2MMOA 2H72A 3RPPA 1U3AA 2CVDA 2D2ZA 1XIYA 2MMNA 3DWVA 4NXIA 1ERUA 4F0BA 1JHBA 5JWQB 3VI7A 1PRXA 4PNFA 2VOCA 1RK4A 1XPVA 3RAZA 3E3EA 2F8AA 2L4QA 3Q74A 1K3LA 5C00A 1TRWA 4TN8A 5J41A 3F9UA 4WETA 1Z9HA 1X9WB 3TKSC 2PBJA 3CTFA 4POBA 3FR6A 3ED3A 2OADA 5CP1A 2AHEA 4DEJA 1V58A 2PN8A 1ML6A 2IWTA 2CAIA 3ZMKA 3HVXA 3WYWA 4KW6A 2L57A 4XTSA 4FYUA 2DLXA 5C04A 1AQVA 2X64A 3ZIJA 5ECLB 3OR5A 5DCGA 1SKWB 3KZQA 2GVPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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