5ID2B

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HPMVMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 54
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2B00
1M99A 4WEYA 3HDCA 2LRNA 2A2RA 5IM9A 1GSQA 3DIEA 2H0HA 2GQMA 2XPEA 5CAXA 1U88A 1SD8A 2YCDA 3HXSA 4XRDA 1SKSB 5ID2B 4HJ2A 3P7XA 2H1AA 2H66A 3D0ZA 2H1DA 4JEDA 2ALBA 4MPFA 5FHIA 1PGTA 2FGXA 5B6MA 4JU5A 4IN0A 1T3BA 1NHYA 1T8EB 3HD5A 3M9KA 5ELGA 1B8XA 2WCIA 4FH8A 5JCWA 2H30A 3WT1A 5G1KA 2OA7A 2EIRA 3GRXA 3H93A 5ECRB 1SJZA 2FCHA 3TKSE 2WJUA 5G1LA 3EC3A 3DD3A 3APQA 1T4YA 1V9WA 1MDJA 2YZHA 2NBSA 5CREA 4V1Ag 5DAKB 4BPYA 4MZCA 5AISA 3KGKA 4OCFA 2HZFA 5JCUA 5J3RA 2LEGA 5C04A 1A0FA 2K9FA 3TCOA 1QK8A 3TKRA 3FEUA 2NPBA 2HRNA 6GSSA 1B4QA 1OKDA 2N5BA 3ZYWA 1BQ7A 5A4UA 2YANA 1BG5A 1M2BA 2ON7A 2LNSA 1EZKA 3SWLA 1M0UA 3VK9A 4OCEA 3LGCA 3BBYA 5ECQB 5DQYA 1R4WA 4TR1A 5HFKA 3ZMKA 2DC5A 3UVHA 1VF4A 2CA8A 1GTIA 3ISOA 5EVOA 2A2SA 5H5QA 4MDCA 3ME8A 3H4KA 4EVMA 3G7JA 2EIQA 2NVLA 1GSFA 4K2DA 2GTUA 1XBSA 2CAIA 4AGSA 3DXBA 2GSRA 4K9ZA 5FT3A 4RQRA 3H8QA 3TKQA 4BVYA 5KN1A 3HZ4A 3GURA 1Z9HA 4PURA 1YF0A 2IN3A 4Q5QA 3KCMA 1F37A 3FHKA 2N5AA 2L4CA 4ACSA 1V57A 3O76A 1DE2A 4DSSA 4ZL8A 1LU4A 1G7OA 5ELAA 2AJQB 1WIKA 4LMWA 4ECBA 3WT2A 1OC8A 2H73A 1Y6EA 2C8UA 5H5RA 4I5QA 1NSWA 5E59A 1FB6A 1ZYQB 2L6CA 4G10A 4PGTA 2HRFA 2H75A 1ERTA 4KDXA 1U6TA 2CVDA 4WR4A 2LSTA 3HVSA 3IAS2 2R6KA 5KN0A 4QL9A 4OFMA 2CQ9A 3IA1A 4KW6A 4LMVA 2K8SA 4XRAA 5F06A 3GX0A 3ZVJA 1T00A 3C73A 3GIXA 3MDKA 5H5SA 5B6NA 2HSHA 2IPAA 2VL2C 1EOHA 2MBSA 3US3A 5HFGA 4K6XA 4PXOA 2KHPA 3KIJA 4K0NA 1USBA 2GSQA 4XS1A 3HJMA 4ILFA 1OYJA 9GSSA 1V2AA 5DAKA 1A8YA 3EVIA 1KEBA 3M9JA 4BWSA 4P3YB 1SJIA 4V2NA 1XWKA 5LD0A 2GSTA 4HJMA 2N5FA 4JR6A 4V2LA 5E4WA 1ABAA 2HT9A 4KE3A 1CQGA 2AHEA 1JZRA 2XPDA 2B1LA 2WS2A 2C0GA 3PGTA 1G6YA 6GSXA 2VD1A 3KXOA 2B5YA 4L5LA 4TR0A 4I2UA 5HQPA 2LV3A 3LEFA 3IBHA 5EY6A 1F2EA 3F6FA 4OO4A 1XW9A 2DMLA 4MF6A 1SL2B 1AIUA 3UMAA 1PX7A 1G6WA 2VCWA 1THOA 3CTFA 1LBKA 2QSIA 1A2LA 2DMMA 3A3TA 1NM3A 4HQZA 2IL3A 3H79A 2LRCA 3G9BA 5J9BA 3ZIVA 3TB2A 3GN3A 1M9AA 3D21A 2X64A 2YWIA 5IOXA 1F3AA 3KZQA 3S9FA 4IQAA 1GSEA 3Q6OA 4MH2A 2C3NA 1PN9A 1YF1A 1SKWB 1I9DA 3L9VA 4MABA 3TDGA 2DIYA 3QAVA 2I3YA 4G9HA 5A5KA 4ML1A 1S3DA 2IMEA 2FWGA 3FR3A 6GSTA 4XS4B 2I9HA 4K7OA 3R2QA 2VCXA 4HQSA 4E8HA 2HI7A 3GL3A 5AGYA 4EDYA 1GSUA 3GL5A 4ZB6A 1TK8B 1TRSA 3GH6A 4FYCA 4RI6A 2AYTA 4RQXA 4LL1B 3CSHA 12GSA 1TJDA 1EEJA 4LL4B 4HEA2 5ECIB 4OFTA 3IDVA 2YV9A 4MZBA 1ERWA 3GSSA 4EF0A 5G5FA 1LJRA 3HVXA 3QAWA 4EKZA 4IP6A 3KEBA 1X5EA 3F4RA 1WRYA 2RM6A 1O6JA 4YQVA 4EXJA 4DSRA 3ZREA 2GT6A 3L78A 2LQQA 5IPHA 2H6YA 1GNEA 1Z7PA 1YY7A 4K7IA 1I5GA 3C7MA 4TXVA 3GHAA 4N11A 4KSMA 2WZ9A 1JLVA 1H75A 4I8BA 4PQIA 3EU3A 4IJ3A 4NV2A 5B8AA 3VWXA 1O85A 4QQ7A 3FK8A 1F9MA 1OE8A 2KOKA 4IS0A 2LQOA 1Z7RA 5D93A 4ECIA 2RLIA 1J0FA 2YWNA 3GKKA 1XWAA 4PQHA 3IRAA 1RW1A 2CZ3A 4KA0A 2H8LA 3EURA 3KP9A 1N2AA 1MDIA 3APSA 4MJCA 2F8AA 2YJHA 2G2QA 5GAPD 1WJKA 1SK1A 1GUHA 4JRRA 4Q5FA 4Z7XA 1K3YA 2P31A 2H72A 1PL2A 1DSBA 1JFUA 3QMXA 2CVBA 3D22A 3N9JA 4DSQA 2AV4A 4KUNA 2FA8A 4I2TA 5EPFA 1O81A 1FO5A 3LORA 3D5JA 2XBIA 2O89A 3AY8A 2MMOA 1VGLA 2P0GA 2H74A 2CX4A 2YOIA 3GTUB 1THXA 3U5RE 1K0CA 2BJXA 4POLA 3UL3A 3VI5A 1WPIA 1GUMA 2C0FA 4X43A 4MMMA 3L9SA 1YDKA 2HNLA 1PA3A 2DJ1A 1QFNA 2AAWA 4MCUA 2PN8A 4DSSB 5J4UA 4KCEA 2MYGA 3E3EA 4BA7A 1B9YC 3ERFA 2C4JA 3IPZA 2OE3A 4HUAA 4PX1A 3LSZA 2VM2A 4KGIA 2IMIA 5L71A 1XW6A 7GSSA 4TR3A 3ZZXA 1M9BA 1YQ1A 2LUSA 2GSSA 2YP6A 4HOJA 5ECSA 2M72A 3TUEA 2WGRA 3Q19A 1VRSD 1VF2A 6GSWA 3WD6A 4E8EA 3IOSA 3WGDA 2VOCA 1NW2A 5IIZA 5CNWA 5JCGA 2EC4A 4WBRD 2R5GA 3FR9A 2B7KA 4OWYA 5CRDA 2VCZA 3VLNA 3FR6A 3QFBC 3U6VA 3UBKA 5DVBA 1SK2A 11GSA 1YKCA 1TI1A 4KH7A 4FYUA 1OKTA 1ZMAA 4TXOB 5CP1A 4POKA 22GSA 4O7HA 3I9V2 3TJGA 3RBTA 1T4ZA 1BEDA 4LLRA 5ECOB 3L4NA 2QKEA 4O32A 5D9WA 3C8EA 3QDNA 2HXKA 2E7PA 1YZXA 1DUGA 2FY6A 5IO0A 2F8FA 3J7Yb 3F4TA 4K1FA 3ZLPA 1EV4A 1AUCA 3DYRA 5F07A 2LRTA 2WB9A 2V32A 2B1KA 1V98A 2H6XA 2H71A 2OBIA 2YJ7A 1ZCPA 2GLRA 1MTCA 5ECMB 3APOA 1MD4A 4AJ6A 2P5RA 2HFDA 3RHBA 2VM1A 5IMFA 2YV7A 3GTUA 2NDOA 3EE2A 1FVKA 3HJOA 3J7Yk 3CSJA 3W8JA 1XOBA 4G19A 3KH7A 5CRGA 4YAVA 3C1SA 1YEPA 1ZZYA 4D73A 3NIVA 1Q4JA 3HCZA 1ZL9A 1S3CA 3NOFA 4KSOA 4ZBAA 2FNOA 3CRUA 2HLSA 1DBYA 4TKYA 5J9CA 1HQOA 5IMDA 1QQ2A 8GSSA 2B3SA 1M7TA 6GSUA 2C80A 4WKWA 1MEKA 3BCIA 3P90A 5IO2A 1GSDA 1EP7A 5AIVA 4HI7A 1B48A 4J56E 5CO3A 4ECJA 4CDOA 1N8JA 4ID0A 1YEXA 3UJ1A 3LG6A 4MH3A 4JZQA 4PUFC 4K0GA 1OC9A 1FVJA 4PQ1A 4MJBA 2HYXA 4GLTA 2L4QA 1A2JA 2BMXA 3KP8A 3WGEA 2JZRA 4WXTA 3KTLA 3QOUA 1AC1A 2OACA 1SL1B 5GAND 1Z6MA 4I6XA 5DCHA 2WFCA 2DJ3A 3M0FA 3HA9A 1E6BA 3IV4A 3TJFA 1EEMA 3LXZA 3F9UA 4PNFA 2O87A 3RPPA 18GSA 4TXOA 1GL8A 3FW2A 1V58A 1URMA 2H1BA 1TRWA 4XCSA 6GSYA 2IFQA 2QC7A 1QUWA 4ZL7A 3O6TA 4IW9A 2C3TA 1TOFA 3VI7A 2GS3A 4X1UA 3DWVA 4FIWA 3TRXA 4CW9A 3LWAA 1AAZA 5IMVA 3VWWA 2XBQA 3FZ5A 4F9ZA 5HR2A 2I1UA 2YWOA 1MD3A 2JL4A 1GULA 4PNGA 1PL1A 4GRFA 2C1YA 4O92A 3TGZA 1BX9A 5ECLB 4ML6A 3NZNA 3SBCA 2VL3A 1A2MA 5EL8A 2C3QA 1GUKA 4GQCA 1M2AA 4KDUA 2EIOA 2F3MA 17GSA 5DJLA 3D4MA 3F0IA 2WRTA 3GKXA 3KJYA 4GF0A 3HJPA 3F6DA 5JWOB 4TVEA 3TOTA 2PUKC 4N0ZA 5G2ZA 4Q5NA 3RPNA 3DEXA 3UAPA 2KUCA 1WMJA 2H19A 3FY7A 1XIYA 4JBBA 1W89A 3ERWA 1PRXA 4NXIA 4K7NA 3DGQA 3IK7A 3GNJA 3LQ7A 4WF4A 1X5DA 4TW5A 1A0RP 5F05A 2I4AA 3EYTA 1K0OA 2RIIA 4K8MA 4H86A 2HSYA 1ST9A 1VF1A 2YZUA 4TN8A 2GQLA 4MLYA 5D9XA 5ECNB 2JSZA 3QD9A 3GSTA 1PD21 1WOUA 1A23A 1HNCA 4OMVA 2V2GA 3M8NA 4AJ7A 5G30A 5IOWA 2VCVA 4I97A 2E2GA 2JACA 2HZEB 10GSA 2V41A 2B7JA 1HNAA 2L59A 4F2IA 1OVNA 3Q18A 4GXZA 2DJKA 2JZSA 5IMCA 1ML6A 1K0DA 1PX6A 5ECKB 5J5NA 2JU5A 1FOVA 1O73A 2MBTA 2YN1A 1F6MC 2GVPA 4WR5A 2K6VA 2REMA 1TRUA 3QCPA 3ZMLA 3W6GA 2P5QA 1CQHA 3M1GA 4NWYA 1JZDA 4L0WA 1TK0B 3BJ5A 4NHZA 2DIZA 2IWTA 4J57E 1Z5YE 2XC2A 1GLPA 1GSSA 2O8VB 16GSA 4BL7A 3M3MA 4MF7A 3IK9A 1R5AA 3G7IA 1G0TA 2VLTA 4ZBBA 5GSSA 3ZFBA 2OJLA 1Y25A 3K8NA 5C00A 3MSZA 1NHOA 2L6DA 4KAEA 2L5LA 2FA4A 1TRVA 4L5OA 2R37A 3CYNA 4ISDA 3W8SA 2GT5A 1SYXA 3ZVJD 2IMKA 2DJ0A 3LFLA 1VF3A 2PVOC 4TRXA 4NV5A 4HZ2A 1A24A 5F8BA 1GH2A 4EO3A 2JSYA 2PMTA 3DKSA 1GTAA 4EL1A 2O7KA 2ON5A 2CAQA 3DVWA 5IQYA 1SKRB 1QXHA 1H4OA 1RQMA 5D9VA 4MP4A 2VCTA 1QGVA 4KCAA 4ZBDA 2L57A 2R3XA 3A2VA 4NPBA 4KDYA 2JADA 3UVTA 3F8UA 2LTKA 3HKRA 5ENUA 2KP2A 3LYPA 3MNGA 1J9BA 1XCCA 3G7YA 4D73B 2VO4A 3DRNA 2H76A 1KTEA 2KP1A 2O85A 2LNTA 5GSTA 2HZEA 1GRXA 5DALA 3C71A 1XXUA 4AJ8A 1JZOA 2MMNA 3IAM2 1BYEA 3KMOA 3O3TA 1PKZA 4N30A 2V6KA 4ZB8A 1ZOFA 4F82A 1TXXA 5AN1A 3VPQA 2G0FA 1OC9B 5B7CA 1K3OA 3CBUA 4IKHA 2OADA 3GUSA 1E2YA 2IJYA 5JWRB 1TKDB 2PU9C 1AXDA 3HHVA 2VCQA 4RI7A 3HYPA 1U87A 5HFIA 5D73A 2ES7A 3TKSC 1EOGA 1X9SB 2AB6A 2OE0A 2R4VA 2NTOA 3F3RA 3BD2A 2K18A 4GSSA 4G2EA 1SYRA 1FAAA 2V6OA 3PINA 1FB0A 1PKWA 2DSAA 2FD3A 2IFQB 2K8VA 4N0VA 3L9UA 3GX8A 2V1MA 1GNWA 1XVWA 4MJEA 2VD0A 4LA1A 1SD9A 5B8BA 1MDKA 1B4PA 1XOAA 3BCKA 1B9XC 4IJIA 1A8LA 4O5RA 2X8HA 2X8GA 3GKMA 5CRHA 3UBLA 3VWVA 1ERVA 5ECHB 3GMFA 5G5EA 3MAKA 2PERA 1X0RA 3QR6A 1EV9A 2YNXA 3IE3A 3F63A 1TTZA 2RUEA 3VPTA 1Q98A 4YAPA 3FYGA 1FHEA 2MZCA 4HU7A 4OFNA 3RDWA 2MMZA 1T1VA 1UVZA 1FW1A 4HS1A 3CRTA 4HU9A 1SL0B 4Q5RA 2DJ2A 4MF5A 1XWBA 2B5EA 3WGXA 1Z6NA 4ZIJA 4GQFA 4X0XA 1ON4A 2MMAA 1OE7A 1SENA 1K0BA 2AUVA 5KEJA 1IYHA 6GSVA 5HR1A 1R5PA 1TK5B 4L8EA 1W4VA 3P8WA 5DQSA 4RUVA 4IGJA 1GLQA 1HNBA 2FUG2 2LJRA 1ZGNA 2IIYA 1S3AA 4XTSA 5A4WA 1M2DA 3KM6A 1PQNA 1DE1A 1K3LA 1TU8A 2GQKA 4TR4A 2E2MA 1UA5A 1HYUA 1JHBA 3EU4A 3FRCA 1XZOA 4KNDA 5KN3A 2JZTA 3TKPA 4GTUA 2B6MA 3IHQA 4ZB9A 2YPMA 2F51A 2VUPA 5KN2A 2M80A 4V1Ap 5ID2A 3GFKA 1AQXA 3MWHA 4POBA 2TIRA 2VAFA 4GSNA 2WULA 4IVFA 4EC0A 3VFIA 1SJ6A 1FG4A 2PGTA 1GWCA 1UN2A 1TU7A 4JR4A 4XIHA 1AQWA 3TJKA 3E9JB 5G31A 2VLUA 1XWCA 3V1WA 1HD2A 3EWLA 2PPTA 2XHFA 2HE3A 2H70A 1SU9A 2FHEA 2RM5A 3EMPA 2CV4A 2H1GA 4ZILA 3Q74A 1QMVA 5IMAA 1JLWA 1RK4A 3F4SA 5JWQB 1AQVA 1O7UA 1YJ6A 2CT6A 4F0CA 3C1RA 1XVQA 2IMFA 4JE1A 1G7EA 1R7HA 3I69A 5ABRA 4CHSA 3HVVA 4XHMA 1WP0A 1AW9A 3P2AA 1KBNA 2DJJA 2ZUPA 2PBJA 5DDLA 5CRWA 3VURA 2KLXA 3GH9A 5IMZA 1XW5A 1R26A 1YKAA 5DJMA 1O8WA 4WBJA 3GA4A 2DLXA 19GSA 3QPMA 1BJXA 1ERUA 4DVCA 1EWXA 3TKSA 1EGOA 3OR5A 5ECPB 4GCIA 1KNGA 1UC7A 3FKFA 2H6ZA 3RAZA 4NMUA 4V2MA 4WF5A 2BTOT 3EMXA 3H1NA 2Z9SA 3KMNA 2CVKA 1TP9A 3CTGA 5HR0A 3VWUA 3FZ4A 4FYBA 1ACVA 3A2XA 3F3QA 4IBPA 1GSYA 2CZ2A 5F0GA 2FLSA 1X9MB 4POMA 4BVXA 2C0DA 2L5OA 4DEJA 4ZL9A 4EDZA 1J08A 4EE0A 1TI3A 2YWMA 4ULXA 4FO5A 3TJJA 5COHA 3ZITA 2M46A 2TRCP 4L0UA 3CSIA 3FZ9A 5D8IA 4YQUA 2H0IA 4ZXGA 3WYWA 3N5OA 4MJAA 1X5CA 5A4VA 2FWEA 3LJRA 2X8CA 4BWQA 1TDIA 2OKAA 1ILOA 3ZRDA 2LKUA 4TOPA 4MK3A 3TRPA 2R2JA 4F0BA 1V40A 1C72A 3LXTA 5DALB 2LS5A 4KB3A 5D96A 3HZ8A 2F9SA 1WWJA 4OD7A 5INYA 2VL9A 5CYYA 3ERGA 4WETA 4J2FA 4QL7A 1X9WB 3GV1A 4NHWA 3TRQA 3E0UA 2ZCTA 2D2ZA 1K0MA 1F3BA 4YQMA 4IHUA 5LNKe 4HDEA 2PWJA 1XPVA 2WDUA 3KH9A 3L0HA 3ZL5A 2C0EA 2GGTA 2VLVA 4KX4A 3JCML 2GZYA 2LJAA 2OE1A 4XS6A 3ZIJA 2FWFA 3UIWA 3D6IA 1K0AA 2CX3A 3ZFLA 1IYIA 4IELA 1U3IA 2X99A 1OAZA 5J41A 3UEMA 2ZNMA 1XWGA 4IQ1A 3DMLA 1TW9A 2I81A 2A4VA 2VIMA 4GSTA 4AF2A 3EINA 13GSA 2DBCA 3ZTLA 5IPGA 2B5XA 5DCGA 5GZZB 1O8XA 4MZWA 3KD0A 1WE0A 3ME7A 14GSA 3BOAA 2IMDA 3I43A 3QAGA 3RHCA 2FWHA 5HR3A 3UOMA 4PUAA 4ECCA 3KTBA 2VL2A 1OC3A 3CXGA 1BAYA 1GTBA 3GYKA 1EGRA 2RUFA 2E0QA 3UARA 1GP1A 4TR1B 3PH9A 1XFLA 1T7PB 3DVXA 2J9HA 3CMIA 3TOUA 3QFAC 4MA9A 1PSQA 1GTUA 3FZAA 2H01A 2LJKA 1EP8A 2GDRA 4MPGA 4NAXA 4YH2A 2QGVA 3LYKA 1PMTA 4GWRA 5AIXA 4EUYA 1SK0A 3PR8A 2H0GA 3IR4A 4IP1A 2J23A 3TJBA 5D9TA 2OBKA 4HZ4A 2GZZA 3D4TA 5FWGA 2PVQA 1JZWA 20GSA 3IXRA 1K0NA 4F03A 1U3AA 3GKNA 5DBQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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