5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
2G0FA 5DAKA 1TK5B 3VFIA 2R3XA 2HNLA 1EGOA 5ECNB 2QGVA 1GSSA 3IBHA 4LMVA 5A5KA 2C0GA 3HHVA 2H0IA 4PUFC 1ZL9A 2H76A 2H71A 2CZ2A 2GZYA 1S3DA 4MZBA 5B6MA 5G5FA 1Z6NA 1BG5A 4X0XA 4HJMA 3R2QA 2TRCP 1M2AA 2VOCA 4ACSA 2IPAA 4XS4B 3C8EA 3WT1A 3CMIA 5IQYA 1GUHA 4V1Ag 3LFLA 4NAXA 4GRFA 1SKSB 2LS5A 1PL2A 4PNGA 1YF0A 5IMZA 1O6JA 1CQGA 2HZFA 3I69A 4HI7A 1JLWA 3VPQA 2LJKA 1SKRB 1BJXA 1B4QA 1EWXA 2KP2A 3ERWA 5A4UA 4WR5A 1B9YC 1SK0A 1ZCPA 1I5GA 3IK7A 4V2MA 3A5WA 2MMNA 4XRAA 4CHSA 3FR6A 2YWIA 3GV1A 1JLVA 3ZL5A 4PNFA 1MD4A 2FY6A 2MMAA 1TP9A 1AW9A 3H1NA 5J4UA 3LQ7A 3D22A 4MF5A 4IN0A 2EIQA 3VWVA 1Z3EA 3ERGA 4JBBA 4WETA 3UBLA 4GSSA 1O85A 2K6VA 2V41A 1HD2A 4ZBBA 2I9HA 3WGXA 2B5YA 4ML6A 3CBUA 3GRXA 2AJQB 3KP9A 4ZB9A 4MDCA 5DDLA 5IMAA 1TJDA 4CW9A 1OKDA 4G2EA 4LLRA 4AF2A 2H01A 1YQ1A 3TJJA 1SL0B 5DJMA 1TI1A 4IKHA 1PGTA 2L4CA 2HLSA 2BMXA 2GSQA 5CAXA 1M2DA 1EP7A 5G1KA 2IJYA 5LCZA 3QMXA 3K8NA 1TRUA 5ECOB 4GCIA 4IBPA 1AC1A 3TKSC 1QMVA 2LQQA 4ZBDA 3H79A 1AQXA 3ZYWA 4ZL9A 2J23A 4XCSA 4FYUA 1PD21 3KP8A 2FLSA 4Z7XA 1U87A 5LNKe 2DMMA 1B48A 6GSYA 1RW1A 2F9SA 2AHEA 4K6XA 2KUCA 4TXOB 5F06A 3IAS2 2X8HA 4HZ4A 4PXOA 5ECHB 4J2FA 3BJ5A 1ACVA 3FZ4A 3DIEA 1GSFA 2PMTA 4GSTA 2B5EA 3TOTA 5G5EA 1XZOA 3F8UA 4G10A 4GTUA 4RQRA 1K0AA 5CNWA 2PPTA 3ZFBA 3FW2A 4F2IA 3EMPA 3TGZA 5A4WA 5ID2B 1FB0A 1XOAA 3ZIVA 6GSUA 3F9UA 2VCQA 3VK9A 6GSSA 1EV9A 3S9FA 2IN3A 3ZMLA 2AAWA 4OWYA 3KH7A 3HKRA 1NSWA 4DSRA 4NPBA 2H74A 1U3AA 1Z6MA 2VCVA 3J7Yk 3DYRA 3VWUA 13GSA 2NBSA 4FYCA 4OO5A 4Q5QA 1FO5A 4P3YB 2H1AA 1Z7PA 2DJ2A 3APQA 1THOA 5IIZA 5J9BA 4K7OA 3ERFA 5IMVA 4F9ZA 1W89A 1GSYA 5D73A 3GSSA 1SK2A 2TRXA 4YAVA 1XPVA 2XPEA 3LYPA 3EINA 5J3RA 1M7TA 3MDKA 4JEDA 3QAGA 3N9JA 2RIIA 2LNSA 1WJKA 3FZAA 4KSMA 3ZIJA 1E2YA 2DSAA 4HDEA 2HI7A 4F0BA 3ZREA 3C1RA 5ECMB 1XBSA 4PQIA 5LD0A 1A8LA 4BWSA 5L71A 2DBCA 2GQKA 4ZBAA 4BA7A 1A2MA 4RUVA 1PKWA 4IQAA 4D73A 3C71A 3GKKA 3DWVA 5JWOB 4WF5A 3H8QA 4TR4A 4F82A 3HVVA 2PN8A 4OFNA 4JU5A 4POBA 5ECSA 3RDWA 2R6KA 2LRNA 3BD2A 4IW9A 1AAZA 11GSA 2LKUA 2FUG2 2HZEA 2BJXA 2ZNMA 2OKAA 1TRWA 1GTBA 2IIYA 3UIWA 2OE1A 3ME8A 5CRGA 3O6TA 1ZGNA 2C3NA 2YWNA 5ECLB 3GTUB 1XW6A 2XBQA 2PVQA 4HZ2A 4BPYA 1OC8A 4V2LA 4WBRD 1URMA 3LJRA 2CVDA 1X0RA 4EC0A 4EXJA 4CDOA 3SBCA 1GNEA 5EL8A 1OAZA 3W6GA 1EEJA 1K0BA 5JCUA 4K7NA 2DMLA 3D5JA 1F3BA 5EPFA 2CV4A 4K1FA 1Y25A 3G7IA 5GZZB 3GKXA 2FWFA 4MH3A 3FZ9A 2LRCA 4DSSA 2OA7A 2B6MA 2CX4A 3KIJA 2A2RA 3W8SA 3IDVA 1KNGA 2VO4A 2ZCTA 3TKSE 4IVFA 4IP1A 3Q18A 2O89A 4TW5A 3M3MA 4MF6A 2H6ZA 1OE8A 2PWJA 2E7PA 2JADA 5B7CA 1MDJA 3UBKA 1OKTA 1N2AA 3FRCA 3HJOA 4TOPA 3WYWA 2B5XA 2IL3A 1C72A 2PERA 1A2JA 1JFUA 4PQHA 5IPGA 3TUEA 1PKZA 2C0EA 1K3OA 3M8NA 5DALA 2IMEA 1DSBA 3VWXA 1MEKA 1ERUA 2PBJA 1ON4A 4XIHA 2YPMA 2JSYA 2OE0A 1TXXA 4HU9A 3ZLPA 2L6DA 1IYIA 3E9JB 1GLPA 1FB6A 4OCFA 3APSA 4I97A 3LWAA 3GUSA 2AV4A 4XHMA 2OE3A 2WZ9A 1TTZA 2PGTA 1M9BA 2EIRA 4KNDA 5DALB 1LU4A 2XPDA 2H75A 4KB3A 1GL8A 4POMA 1K3YA 1XWGA 4MCUA 2YZUA 5EY6A 2CT6A 5B8AA 1M0UA 1WE0A 2M46A 2H19A 5D9VA 5ENUA 2DJ0A 2IWTA 3WGDA 3IXRA 3FR3A 6GSXA 4WKWA 5G1LA 3QD9A 3I6AA 1GULA 2L5LA 4AJ6A 1SU9A 2WS2A 3LXTA 3F0IA 3DMLA 2H72A 2KP1A 1G0TA 4ILFA 3ZZXA 4PURA 3QR6A 3F3RA 5B6NA 1LJRA 1K0DA 1DUGA 4ZB8A 12GSA 4XTSA 3HJMA 5HR2A 5JCGA 1SD8A 3JCML 1KEBA 4FO5A 4V1Ap 3IR4A 4ZXGA 4HJ2A 4MLYA 3KD0A 3ZITA 2VCZA 1U3IA 1MDKA 2B7JA 2CQ9A 3C7MA 5H5QA 1TRSA 3TKRA 4K2DA 2GSRA 4O7HA 2P31A 5ABRA 3HJPA 1ILOA 5DAKB 4WEYA 2V6OA 5KN1A 3CXGA 3KJYA 2X8CA 1T00A 4MF7A 1XIYA 2YOIA 2YNXA 1QFNA 3J7Yb 4MK3A 3DD3A 3HYPA 5DJLA 4WF4A 1QQ2A 3F4TA 4WXTA 4KCAA 4XS1A 1Z9HA 5DBQA 1F6MC 5D9WA 2H8LA 2H1BA 3KXOA 4MPGA 5CRWA 2VLTA 1EP8A 4NXIA 4IP6A 4DSQA 4QL7A 3IC4A 3LGCA 2K8SA 2HXKA 3H4KA 1VRSD 3KTBA 2NTOA 2JU5A 3TDGA 2GGTA 4NHZA 5E59A 3QDNA 3TRQA 2I3YA 3C73A 2VL3A 4QL9A 4J57E 1EOGA 3DGQA 1DE2A 2YN1A 4LL4B 1SJ6A 2AYTA 3IRAA 1NM3A 3EMXA 3Q19A 4YQUA 1BEDA 4HOJA 2X64A 5HR0A 4KE3A 2KLXA 1USBA 5EVOA 3A2XA 1GP1A 3TKPA 4BVXA 1GWCA 1ST9A 4KSOA 1PN9A 3NZNA 4N10A 5H5RA 7GSSA 5ECKB 5IO2A 4TR1A 1TK0B 1YDKA 2FNOA 2LJAA 1HNBA 4MZCA 2KOKA 3KEBA 1ERWA 3N5OA 3MNGA 1WOUA 1X5EA 1TRVA 2REMA 4ZL7A 1ABAA 1XWAA 3RBTA 4PUAA 4HQSA 3ED3A 5IOWA 4KDUA 1R4WA 1F37A 2XBIA 4KH7A 2N5AA 4XS6A 3F3QA 2YJHA 3GX0A 1ZYEA 2LNTA 2FA4A 5IMDA 3O3TA 5C00A 3HXSA 2ALBA 2CX3A 5F07A 4ZL8A 1MTCA 2EIOA 4DVCA 1U88A 1F2EA 4EVMA 2FWGA 2FD3A 3IAM2 3KCMA 2VD0A 4KA0A 3GKNA 4KDYA 5G30A 1HQOA 3M1GA 3G7JA 5AIVA 3DXBA 5IOXA 3G7YA 5F0GA 5HFGA 2HT9A 4I2TA 1TU8A 1ERVA 4WBJA 2CAQA 2HE3A 1KTEA 1SJZA 1OVNA 4MMMA 4L0WA 5CYYA 1WPIA 1T4ZA 5KEJA 3QAVA 3ZVJD 5JWQB 1GTIA 5KN0A 1UVZA 2E0QA 2P5QA 1FHEA 1R7HA 3FK8A 1V9WA 2HFDA 2R4VA 2R37A 2O87A 3FR9A 3U5RE 1YJ6A 2JL4A 2GSTA 1A0FA 2YJ7A 3F6DA 2OACA 1PA3A 2VLVA 4O92A 3FEUA 3M9KA 3US3A 4IHUA 3L4NA 4NV5A 5DQYA 5IMFA 1NHOA 5AISA 2B1LA 1XOBA 4TR0A 3LXZA 1YY7A 4MH2A 3PR8A 3EURA 3HZ4A 4DEJA 2O85A 3FKFA 22GSA 1BAYA 2H0HA 4YAPA 1U6TA 1X9MB 2P0GA 4X1UA 2LUSA 2MBSA 4MPFA 2O8VB 4L0UA 4TXVA 4K0GA 3KH9A 1R5AA 1XW5A 1OE7A 3NOFA 4K7IA 4I2UA 4HEA2 1EOHA 4NHWA 4YQVA 3IOSA 2JZSA 4NV2A 1BQ7A 1JZDA 1H4OA 1XXUA 1DBYA 2PUKC 2E2MA 2QSIA 2JZTA 1J08A 4EL1A 3U6VA 1YEXA 1M2BA 1RQMA 1QGVA 3F4SA 3TJGA 1VGLA 3F4RA 3IV4A 3O76A 2ON7A 4E8HA 2VCXA 2NPBA 4OFTA 4D73B 2C0FA 1J9BA 4MJEA 4FH8A 3ME7A 2K9FA 3UVTA 3HD5A 1FVJA 1YF1A 3ZMKA 1UN2A 4E8EA 2RUFA 1V40A 4IQ1A 2H6YA 1TU7A 2B3SA 1GSUA 2HZEB 2PVOC 6GSWA 2CVBA 2WCIA 4RI7A 2GZPA 3EYTA 2RM5A 2E2GA 3GH6A 4N0VA 2GQLA 2VCWA 1OC3A 18GSA 3TKQA 4ECBA 2VM2A 1VF2A 2L4QA 5C04A 2DJ1A 4JR6A 3WT2A 3ZVJA 4ECIA 3TJBA 1BYEA 2DJ3A 1T7PB 4NMUA 4TVEA 4I5QA 1AQWA 2I4AA 3ZRDA 4EO3A 4YQMA 3ZTLA 5CO3A 8GSSA 5DCGA 1MDIA 1TDIA 4GLTA 4O5RA 2HSYA 3QFBC 4BL7A 3TCOA 4ULXA 1OC9A 5IO0A 1GRXA 1X5DA 3HZ8A 3MWHA 4L5LA 3P8WA 3EWLA 1XVWA 5HFIA 1F9MA 5IMCA 2H30A 5ELAA 4ZIJA 2AB6A 4DSSB 6GSVA 2YV9A 2V32A 3KMNA 2QC7A 2ON5A 1GUKA 5FWGA 4TKYA 2WDUA 3D4MA 3KMOA 4EF0A 2F8FA 3P2AA 1K0OA 3PGTA 3SWLA 3LORA 4NWYA 1N8JA 2WRTA 2FHEA 3RPNA 3PH9A 1Z5YE 2LJRA 4IGJA 1A2LA 3ISOA 3L0HA 1AXDA 2FWEA 5DVBA 1A8YA 2XC2A 5HQPA 4L5OA 3RHBA 2VLUA 2H0GA 4FIWA 2H1DA 1TK8B 1PL1A 2M80A 5JWRB 3GMFA 3V1WA 4I8BA 1AQVA 2C0DA 4GQCA 4JE1A 3CYNA 3KTLA 3IK9A 4X43A 4POKA 1SD9A 20GSA 2O7KA 2IMIA 4XS4A 16GSA 1GUMA 4F0CA 3I9V2 1PX7A 2J9HA 5D9TA 1BX9A 1GLQA 3IPZA 1VF3A 1G6WA 3EE2A 3KM6A 2FGXA 4MZWA 3QCPA 3A3TA 2MZCA 4GWRA 2A2SA 4RI6A 2VCTA 3ZFLA 1SKWB 1QK8A 3D6IA 2K8VA 2M72A 4F03A 2H66A 4K0NA 2HSHA 3FY7A 4ECJA 2R2JA 4OCEA 1SYXA 2C8UA 4Q5NA 2RLIA 1O81A 4V2NA 1O73A 5IPHA 1FW1A 1PX6A 14GSA 1IYHA 1AIUA 3VI5A 2B7KA 3QFAC 1Z7RA 1K0MA 3LYKA 4BWQA 3L9VA 5D8IA 3GL5A 1F3AA 3CTFA 5INYA 3I43A 2L5OA 3UJ1A 3EU3A 2VD1A 5IM9A 3GH9A 2GSSA 2C4JA 4O32A 1NHYA 1VF4A 2TIRA 1QXHA 3IHQA 2YANA 3TKSA 4LA1A 3BCKA 3IA1A 5GSTA 2N5BA 2VL9A 3UOMA 3APOA 2F8AA 4IJIA 4LMWA 3FYGA 5GSSA 2VL2A 1K0NA 4XRDA 3CRUA 4KX4A 2R5GA 2NVLA 1T4YA 5DQSA 3UMAA 4EKZA 4Q5FA 5COHA 1X9SB 1XW9A 5GAPD 3UVHA 1ZZYA 1J0FA 2GS3A 1YEPA 4ISDA 1SL1B 1T1VA 1PSQA 4RQXA 3GNJA 1FVKA 2IFQA 5FT3A 2FWHA 5AN1A 1EZKA 2MYGA 2JACA 2GZZA 1YZXA 4N0ZA 2DIZA 5G2ZA 1WP0A 2F3MA 4TXOA 4KW6A 1WRYA 2YV7A 4PX1A 2LRTA 2JSZA 3QPMA 5CRHA 4PGTA 4WR4A 4BVYA 3DKSA 4ZILA 3VURA 2LSTA 2P5RA 1FAAA 4IS0A 5HR3A 2GVPA 3VLNA 1JHBA 3GYKA 1DE1A 3VWWA 5CREA 3GA4A 2F51A 1XVQA 2VUPA 3M0FA 2LTKA 2MMZA 3A2WA 5B8BA 4ZB6A 1GTUA 3TOUA 3GSTA 4EDYA 2LEGA 3TB2A 1XWBA 1SL2B 1XWKA 2YWMA 2HRFA 1SJIA 2VL2C 4MP4A 3P90A 5ID2A 2IFQB 4KGIA 3M9JA 2I81A 2CA8A 3KGKA 5FHIA 4TR1B 2HRNA 3GN3A 1R26A 5J41A 4MJAA 5AGYA 1WWJA 2WB9A 1O8WA 5HR1A 2WGRA 4HQZA 2MMOA 4OFMA 3EVIA 2DC5A 3C1SA 2FA8A 1G7OA 3CRTA 17GSA 2D2ZA 5ECPB 4AJ8A 2LV3A 4JRRA 4OO4A 3L9UA 1XWCA 2VIMA 1V58A 1OYJA 1ZMAA 2C80A 4YH2A 2L59A 2WFCA 1GNWA 1FG4A 4H86A 1B8XA 3DVWA 5ELGA 1HNAA 1FOVA 3EU4A 1YKAA 3UARA 2C3QA 2B1KA 4IELA 2L6CA 4KUNA 4OD7A 3D21A 1SK1A 2RM6A 5E4WA 3FZ5A 2GQMA 3HA9A 3WGEA 3PINA 3L78A 4HS1A 2GT6A 1M99A 1A0RP 4MJCA 1TW9A 2Z9SA 1O8XA 3Q6OA 3GHAA 4MABA 9GSSA 2IMKA 2DIYA 2XHFA 3F6FA 2JZRA 4N30A 3GKMA 1JZRA 3KZQA 3VI7A 2HYXA 1V57A 5KN3A 2GLRA 5ECIB 2PU9C 2NDOA 4G19A 1K0CA 2X99A 3FHKA 1QUWA 1Q4JA 5DCHA 4AJ7A 4ID0A 3L9SA 3LSZA 2LQOA 1YKCA 2IMFA 2ZUPA 1GH2A 2BTOT 2I1UA 1S3CA 3G9BA 3VPTA 4GQFA 3UEMA 1T8EB 4Q5RA 3NIVA 3RPPA 5JCWA 2V1MA 19GSA 2YWOA 5ECQB 1THXA 3GTUA 4HUAA 2VM1A 5J5NA 4EDZA 3GFKA 3A2VA 1SENA 2V2GA 4GF0A 4OMVA 3TJFA 2RUEA 3D4TA 1GSDA 2EC4A 3CSIA 2MBTA 4J56E 2GTUA 3Q74A 4TN8A 2WJUA 1TI3A 3TRXA 3F63A 1K3LA 1UA5A 2DJKA 3IE3A 5F05A 1EEMA 4TR3A 4K9ZA 1GSQA 2A4VA 1NW2A 3HVSA 3QAWA 1KBNA 1TOFA 1ZYQB 5D96A 2VAFA 2H73A 3RAZA 4PQ1A 5D93A 3HVXA 2G2QA 1X5CA 5CP1A 2QKEA 1G7EA 2CZ3A 2YZHA 1B4PA 1V98A 1Q98A 1PQNA 3BBYA 1SYRA 3UL3A 5J9CA 1ZOFA 5H5SA 3W8JA 5AIXA 1WIKA 4K8MA 4FYBA 3HDCA 1UC7A 5A4VA 4I6XA 1HYUA 2YCDA 2CAIA 1CQHA 3UAPA 4AGSA 1WMJA 1MD3A 3CSHA 4HU7A 3AY8A 2AUVA 3HY2A 6GSTA 5HFKA 4IJ3A 1PRXA 2DLXA 1Y6EA 3GX8A 4KDXA 2N5FA 3DRNA 3BCIA 1ERTA 5G31A 2C3TA 1XCCA 1HNCA 2H6XA 4KAEA 1W4VA 4MJBA 4ML1A 3DVXA 4POLA 1A23A 1T3BA 4G9HA 4LL1B 2FCHA 2GDRA 2YP6A 3MSZA 4L8EA 4QQ7A 2IMDA 1H75A 3E3EA 2OBIA 2GT5A 3P7XA 1O7UA 4MA9A 3TRPA 3H93A 3CSJA 1XFLA 2K18A 1RK4A 3GURA 3E0UA 4KCEA 1E6BA 4N11A 3TJKA 2C1YA 1ML6A 1X9WB 3D0ZA 3RHCA 4TRXA 4EE0A 1A24A 1OC9B 1M9AA 2OADA 4JR4A 3QOUA 5KN2A 1LBKA 2OBKA 3GIXA 1GTAA 1G6YA 2OJLA 4GSNA 4GXZA 1VF1A 3LG6A 5F8BA 5ECRB 1B9XC 2KHPA 1EV4A 3BOAA 3EC3A 3GL3A 2ES7A 1TKDB 2CVKA 5CRDA 1JZWA 5D9XA 2WULA 3CTGA 3HCZA 3OR5A 3LEFA 1EGRA 1V2AA 3MAKA 4JZQA 1I9DA 1PMTA 2H70A 3WD6A 4EUYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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