5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
3GKXA 1MD3A 4EF0A 4HUAA 1KEBA 4NWYA 2V6KA 3TCOA 4XS4A 1TOFA 1MEKA 2EIRA 4GSNA 2QKEA 1ACVA 2I4AA 1TI3A 4L0UA 1PL1A 2CX3A 1GSSA 2YZHA 4NHZA 2H6YA 3KZQA 1TW9A 1GSQA 18GSA 5J41A 3TKSA 2DJ1A 2GQKA 1XIYA 3WYWA 5EVOA 3VPTA 4EO3A 1R5PA 4F03A 2H1AA 3Q6OA 3H1NA 1O85A 3HJOA 4NXIA 4J56E 5FT3A 3ZVJD 4ECJA 5HFIA 3MAKA 2O89A 1TRVA 1AC1A 2FCHA 1YF1A 2XPEA 2NDOA 6GSYA 5F07A 1S3AA 3LXTA 2GZZA 4MZCA 1G0TA 19GSA 3ZMKA 3BCKA 1V2AA 4HQZA 2EC4A 2Z9SA 3VWUA 6GSWA 2B5YA 4IP1A 3P90A 1K0NA 2RUEA 2F8AA 1R4WA 3GFKA 3LXZA 2IWTA 5IPGA 4DSSA 1M7TA 5D9VA 3MDKA 3MSZA 2L59A 1OC9A 2F8FA 2H8LA 3F0IA 3P2AA 4K0GA 3N5OA 1B4PA 1HYUA 1K0AA 2KP1A 3DGQA 3QAVA 3GKKA 2CA8A 3F6FA 2HI7A 1QK8A 5IMZA 3NZNA 1XW5A 3L9SA 2G0FA 2M46A 1ZYEA 3HDCA 4DEJA 2JZSA 5ECQB 1EEJA 3FZAA 3DXBA 3ZLPA 2PWJA 16GSA 2R4VA 1SKRB 1T4ZA 3APOA 3FK8A 1YJ6A 1ZZYA 2IMFA 1AAZA 5C00A 1XOBA 1B4QA 1ON4A 5HR1A 3GX8A 2K8VA 2WB9A 3TKSC 1MDIA 3LFLA 4LL4B 3RPPA 2JL4A 4OD7A 4GQCA 3KCMA 4K7IA 2D2ZA 2OJLA 2QGVA 3CSHA 3LWAA 1HNAA 2HZEA 4HJMA 2CQ9A 1RQMA 5EY6A 5FHIA 4JU5A 4IELA 2HYXA 2MMZA 2IL3A 2FA4A 2XC2A 4MZBA 4HDEA 4MPFA 3PR8A 3SWLA 2H71A 1OYJA 2QC7A 1WPIA 2JU5A 3D4TA 2BJXA 5B8BA 3WT1A 1AW9A 3UBKA 4HQSA 3TJJA 1SJIA 3LYPA 4ID0A 5CRWA 4MJCA 2H19A 1Y6EA 3HJPA 4FYCA 3GRXA 2V1MA 2VCZA 3FZ5A 5IM9A 2N5FA 4OFTA 2XBIA 2IIYA 3FKFA 1TDIA 2MBTA 3O3TA 1OC3A 1GL8A 2B3SA 2JSYA 5J9CA 3LGCA 3VI7A 1M2DA 4OFNA 1XOAA 3V1WA 1YKCA 5ECKB 3LG6A 2DJJA 1E2YA 4AJ6A 2L4CA 2VCVA 3TKPA 1LJRA 2C0FA 4KCAA 2IJYA 4QL9A 2H1BA 2X64A 3KP8A 3UVTA 2IFQB 1JHBA 1ZL9A 4YQUA 2VAFA 1PL2A 3P8WA 2ES7A 3CTGA 2LJRA 5G1LA 1A8LA 1F2EA 2LS5A 1Q98A 3FR9A 2LEGA 3QPMA 3L4NA 4IW9A 3F9UA 1EP7A 1O81A 4HZ2A 1JZOA 1IYHA 1VRSD 3ZITA 1WJKA 1SYRA 5IIZA 2H0GA 1ERUA 4YAPA 1DBYA 2VL9A 3HYPA 3I69A 1F3BA 4O32A 2H76A 4IBPA 4F0CA 3KEBA 3CRUA 5G5FA 4XS1A 4AJ7A 3KH9A 3L78A 1HNCA 3TKSE 2ZUPA 2HZFA 4NPBA 1SL0B 2JACA 12GSA 2A2SA 1WP0A 3GV1A 4CHSA 2FHEA 3C7MA 5GZZB 1TI1A 3QD9A 3ZVJA 4GQFA 1T8EB 1W89A 5IMVA 1O6JA 1EZKA 1A0FA 2L4QA 1K3LA 4MJBA 5AISA 3NOFA 2V41A 1VF2A 3IHQA 1UA5A 1K0BA 4RQRA 4TVEA 4MDCA 4KH7A 2GSQA 1X9WB 3QAWA 3UAPA 1EV4A 1A2LA 1FO5A 2LJAA 1QUWA 2O7KA 3A3TA 1XVWA 4ZL8A 3QFBC 3GX0A 1XCCA 2MMOA 2R37A 3GL5A 1WMJA 4X43A 3R2QA 2DC5A 2GS3A 2YCDA 1YEXA 1GTUA 2P31A 2FGXA 2H1DA 1Z3EA 2LV3A 2DJ3A 2L5OA 2YN1A 5IPHA 2LTKA 4OO5A 5F05A 3Q74A 3ZYWA 4GF0A 1FAAA 5HQPA 2C4JA 4EDYA 3Q19A 3FZ9A 2R6KA 2GSSA 3G9BA 3DVWA 3UOMA 2M80A 4HI7A 2OE1A 5A4VA 4ILFA 3G7JA 1PMTA 1R5AA 2GVPA 4ZBAA 3BBYA 2XBQA 3MNGA 1ERTA 2CVDA 1GRXA 2XPDA 4OCEA 4EUYA 2OE0A 4RI6A 2K6VA 1LBKA 4GTUA 5H5SA 2C3QA 4YH2A 3FYGA 4WEYA 2GQLA 1J0FA 3LORA 2FLSA 3H8QA 2OBKA 3HVXA 5EL8A 1SJZA 5AGYA 2A2RA 4TR1B 3H4KA 1JZDA 5KN2A 3IAM2 2O85A 5B6MA 1ML6A 1ERWA 2REMA 3HZ4A 3DD3A 3HA9A 4ML6A 5D9TA 1U3IA 1TK8B 3ZFLA 2X8GA 3IDVA 3RHBA 3EINA 3FRCA 4XTSA 3WD6A 2OE3A 1R26A 5JCGA 3H79A 3BJ5A 1X5CA 3M9KA 4AF2A 1FW1A 4KX4A 3KTLA 5IOXA 2LRNA 4JRRA 3IA1A 5EPFA 2YWOA 2YV7A 1PRXA 4CW9A 2L5LA 4Q5FA 3GNJA 1VF4A 3QCPA 4DSRA 4XS4B 3C1SA 3KMOA 2OBIA 4IS0A 1J9BA 1EV9A 1U88A 4IN0A 3PH9A 3ED3A 4L5LA 2ZCTA 3VWVA 3TJKA 3KMNA 4ML1A 4HS1A 2JSZA 4TXOA 3L0HA 1GSDA 2GSTA 2VL2A 5G31A 4P3YB 4E8HA 4I2UA 4OCFA 3ME7A 3IPZA 5DAKA 1V9WA 1XW6A 2PVQA 4ZB8A 4TOPA 3HD5A 3RDWA 3TKRA 1DUGA 1NM3A 4JR4A 3KP9A 3D21A 5D93A 3IXRA 4K9ZA 1F9MA 1T00A 1GTIA 5HR3A 2ON5A 3GTUB 3A2XA 2HE3A 1X5EA 2WDUA 1S3DA 1C72A 3IOSA 5D96A 5DJLA 1FHEA 4MJAA 3DVXA 1HD2A 2HRFA 4ZL9A 1Z9HA 5J3RA 1XWGA 3BD2A 5GSTA 3CYNA 3GUSA 1NHOA 4HOJA 5A5KA 3CRTA 4MCUA 1THOA 2CVBA 2AHEA 4POKA 1U87A 3GTUA 4DSSB 2IMIA 4KSMA 4BWQA 4DSQA 4XRAA 1K3YA 10GSA 4PNFA 1M0UA 4EKZA 1PKZA 2GZYA 3ZRDA 1TXXA 3EVIA 1OC9B 4LMVA 1X5DA 4ECIA 1ZYQB 1B9YC 2F3MA 3TJGA 2WS2A 2YWIA 5HFKA 3TDGA 1HNBA 1DE2A 2EIOA 1TK5B 1YY7A 4WETA 2GT5A 2XHFA 2I1UA 2CAIA 1UC7A 2GGTA 1ILOA 3UL3A 3M3MA 4IJ3A 1TKDB 3GL3A 4FH8A 2LUSA 4N0VA 2KOKA 2VL2C 1ZGNA 2DMMA 1G6YA 2CAQA 2FWGA 2X8HA 3F3QA 3TB2A 2MZCA 1XXUA 2TRCP 1A0RP 1BYEA 4MF5A 3QMXA 14GSA 2GQMA 4GSSA 4XRDA 4ZIJA 1YKAA 1AXDA 2HZEB 2IMEA 1S3CA 3VFIA 3UEMA 2BMXA 6GSTA 5ID2A 1AQVA 3EU4A 1G6WA 4HJ2A 3CSJA 1Z7PA 3DYRA 1F37A 1TK0B 1EEMA 5ECRB 3EMPA 3HJMA 4GWRA 4TXVA 3VK9A 5JWOB 4N10A 1VGLA 1T7PB 1IYIA 3FY7A 4WBRD 2FWEA 3WGEA 1QXHA 2CT6A 3CSIA 4J2FA 4IGJA 1O8WA 1PN9A 5AN1A 3A5WA 4HEA2 2C1YA 1XW9A 1W4VA 3HHVA 5DALA 2OKAA 5HR2A 1X9SB 1TRWA 2LJKA 4IJIA 4EC0A 1XWBA 5GAPD 2YWMA 5DQYA 2KP2A 3M9JA 2EIQA 4JR6A 1ZMAA 4KCEA 2CVKA 5JCWA 3M8NA 3EURA 11GSA 4KNDA 4MZWA 1AUCA 2VLVA 3LEFA 1BX9A 2FUG2 3DMLA 2H73A 1ZOFA 3W6GA 1U6TA 1GUMA 2LQQA 2V2GA 1SKWB 4BA7A 5D9WA 4JEDA 4K8MA 5CRGA 2L6DA 4L5OA 1PX7A 3LQ7A 4V1Ap 1E6BA 1R7HA 2MMAA 2YOIA 4J57E 5L71A 22GSA 2C3NA 4NAXA 1SU9A 3F4TA 4Q5QA 2K8SA 1M9BA 1YDKA 5CO3A 2MMNA 4ULXA 5H5QA 3EC3A 5IO0A 3KGKA 2K9FA 2E7PA 3APQA 1SL2B 4PUAA 4Z7XA 4F2IA 3KD0A 1OKDA 3RHCA 1M2AA 3F63A 3GIXA 2RUFA 1USBA 3I6AA 3P7XA 4OFMA 1TU8A 2CZ3A 5G2ZA 4LA1A 3KJYA 2ZNMA 4HZ4A 4TR4A 4YAVA 4HU9A 2LRCA 1SKSB 4PURA 3GA4A 5ECSA 1VF1A 2HLSA 2H70A 3C73A 2DJ0A 5CRDA 5ECOB 1T4YA 2X99A 4QQ7A 2OACA 4BL7A 4GXZA 2ALBA 4XHMA 3W8SA 5DCGA 1SK2A 5HFGA 5HR0A 1JZWA 3GKNA 4RQXA 2DBCA 4KAEA 4QL7A 4IP6A 3VPQA 4IVFA 3IE3A 3IR4A 1HQOA 3GSSA 4KDYA 2GTUA 1VF3A 1EGOA 2V32A 5D8IA 2QSIA 3VWXA 3IK7A 1V98A 3IK9A 2LKUA 3W8JA 4F82A 3DIEA 1Z5YE 2KUCA 2FY6A 1BAYA 4I6XA 4FYBA 5DVBA 3TRXA 1H4OA 3A2VA 4OMVA 1G7EA 6GSUA 3F3RA 2CZ2A 2RLIA 3S9FA 4KB3A 2LQOA 4YQVA 1SJ6A 4K7OA 1XPVA 4MF6A 3A2WA 2B5XA 3ZMLA 2PVOC 2YZUA 4G10A 5DQSA 4FYUA 5COHA 4WKWA 3GH9A 20GSA 1FB6A 3AY8A 2IMKA 4Q5NA 4OO4A 2P5RA 2R2JA 1FOVA 1XBSA 4KUNA 3H93A 4IHUA 3RAZA 1ABAA 3E0UA 2K18A 2B1KA 5AIVA 2B6MA 3FR3A 1B9XC 1O73A 3L9VA 2P5QA 1OKTA 5C04A 2B5EA 3CMIA 1TP9A 1O8XA 3K8NA 4EE0A 3GURA 4E8EA 3D0ZA 2MYGA 4PX1A 4WF4A 5CRHA 3F4RA 1K0MA 5DBQA 3BOAA 1A8YA 5CP1A 2IN3A 5FWGA 3F4SA 3ZREA 4O7HA 4L0WA 4MMMA 2VCQA 4GCIA 4D73A 1CQHA 2WFCA 5IQYA 4RI7A 3N9JA 2TRXA 2DSAA 3HXSA 1EOHA 3KM6A 3C8EA 2JZTA 5F06A 5JWQB 3UIWA 3ERFA 5ECIB 3GKMA 3NIVA 4LMWA 2LNTA 2F9SA 2GZPA 3TOUA 3FEUA 3GMFA 5E59A 3G7YA 4V1Ag 4I97A 2FNOA 1RK4A 3SBCA 4TXOB 3EU3A 5J4UA 2DLXA 2VCTA 2B7JA 1MDJA 4BPYA 1F3AA 2H01A 4ECBA 1YEPA 4PUFC 1G7OA 2O8VB 4AJ8A 1TRUA 3F6DA 1M99A 5DAKB 3KH7A 1MD4A 1DE1A 5D9XA 4KW6A 3LSZA 4O5RA 2CV4A 2YJHA 3HVVA 1K0CA 4N0ZA 4TN8A 3ZFBA 2LNSA 5IO2A 3VLNA 1MTCA 4MABA 1OE7A 2A4VA 2I3YA 3VWWA 2H6ZA 3HZ8A 1MDKA 3EE2A 5F0GA 3QDNA 2LRTA 1PSQA 3C1RA 1PGTA 5CNWA 2YANA 4GRFA 2VIMA 4PNGA 2PMTA 2E0QA 4GLTA 2ON7A 3UMAA 5J5NA 4K0NA 2WRTA 5JWRB 4ZB9A 3RPNA 2B7KA 4KDXA 1GULA 1WOUA 9GSSA 4X1UA 2AJQB 2WCIA 3ZTLA 4TR0A 3OR5A 5ECHB 5KN3A 3D22A 2L6CA 2RM5A 3I9V2 5IMAA 4K1FA 5B6NA 1NHYA 3APSA 4F9ZA 1KTEA 3TJFA 1U3AA 4NV2A 2X8CA 5G5EA 3WGDA 1EWXA 5CREA 1THXA 1YQ1A 3TOTA 1EOGA 1QQ2A 3BCIA 1WE0A 1OC8A 1A24A 2C8UA 2RM6A 2HXKA 4XCSA 3UJ1A 2AUVA 1F6MC 1GNEA 2FWHA 2FA8A 1PKWA 2H74A 1BG5A 1O7UA 4JBBA 1K3OA 4WR4A 3MWHA 5IOWA 1V57A 2H1GA 4K7NA 3ERGA 4LLRA 4YQMA 5GSSA 5KEJA 2FD3A 2VL3A 1KNGA 8GSSA 2V6OA 3QFAC 2VM2A 1AIUA 5ECPB 2YWNA 4ZXGA 1T1VA 1OVNA 5ID2B 2GSRA 5ECNB 1BJXA 3TRPA 3I43A 2PU9C 4MJEA 2NVLA 1FB0A 1FVJA 4WXTA 5DJMA 5INYA 3G7IA 3WT2A 1ZCPA 1SL1B 1YF0A 1GTAA 4G2EA 4KDUA 1BQ7A 5F8BA 3TRQA 2DJ2A 1DSBA 2YV9A 5DALB 3L9UA 2PGTA 4G19A 2VLUA 3ISOA 1X0RA 4MH2A 3U5RE 4EVMA 3LYKA 7GSSA 2H72A 4ISDA 1XFLA 4ZBBA 2G2QA 2M72A 2HT9A 1T3BA 3HKRA 4MF7A 3QR6A 5E4WA 2DMLA 2F51A 3FZ4A 1GNWA 3VURA 3FHKA 2VCWA 1GLPA 1LU4A 4PGTA 1UN2A 2WULA 2YNXA 1V58A 1PA3A 1TRSA 5G30A 3GSTA 5H5RA 2PERA 4KSOA 5IMCA 5B8AA 2AAWA 4LL1B 2TIRA 13GSA 2C3TA 4PQIA 1SD8A 4JZQA 3WGXA 1OE8A 3DKSA 3F8UA 2H66A 1AQXA 3EYTA 1V40A 2C0DA 4MLYA 3LJRA 1JFUA 5LD0A 6GSXA 2HFDA 1XWAA 3HY2A 4I5QA 17GSA 4EL1A 1XVQA 4TRXA 2L57A 1KBNA 1SD9A 2MBSA 4WF5A 1PD21 4V2LA 5J9BA 3ZL5A 3GHAA 1FG4A 4ZILA 1A23A 4KA0A 1SENA 1XWKA 3E9JB 2AB6A 2NPBA 5ECMB 4N11A 4NHWA 1PX6A 3EMXA 3M1GA 3D4MA 5CYYA 1ERVA 5KN1A 3TJBA 1QMVA 5A4UA 3KXOA 4PQ1A 2VO4A 4CDOA 4V2MA 1M9AA 1Z6NA 4KE3A 3O76A 3DWVA 2GLRA 4HU7A 4ZBDA 3M0FA 4N30A 5AIXA 1I9DA 4FIWA 2PBJA 3C71A 2H75A 3GH6A 2WZ9A 5LNKe 2VLTA 3TKQA 1B48A 3VI5A 2JZRA 5G1KA 3TGZA 4AGSA 1JZRA 2VD0A 2IPAA 4NMUA 3O6TA 4ACSA 4POMA 4I8BA 2N5AA 4Q5RA 5LCZA 4K2DA 2WJUA 2NBSA 2IFQA 3IV4A 2P0GA 2DIYA 2VOCA 3HVSA 4MH3A 5B7CA 1NW2A 1QFNA 1BEDA 4I2TA 2CX4A 1XZOA 3Q18A 3IRAA 4IKHA 4XS6A 3J7Yk 2DJKA 2R3XA 1N8JA 5JCUA 4PQHA 4POLA 1SK1A 1EP8A 2HSYA 2H30A 1EGRA 1CQGA 6GSSA 5KN0A 2H0IA 3KTBA 2I81A 2VD1A 2C0EA 3IC4A 1I5GA 4FO5A 1GLQA 4MP4A 1GP1A 4GSTA 3CBUA 4EDZA 2KLXA 5ELAA 2C80A 3DEXA 1RW1A 4MK3A 4ZB6A 5D73A 1B8XA 4NV5A 2GT6A 4PXOA 1Z7RA 2YP6A 1QGVA 1SYXA 2FWFA 4JE1A 1WRYA 3JCML 1Z6MA 1GWCA 3HCZA 1K0OA 5ABRA 1ST9A 2LSTA 1N2AA 1GUKA 3ME8A 3CTFA 1GSUA 4TR3A 3QAGA 5CAXA 1M2BA 2AYTA 4H86A 5GAND 3KIJA 2VCXA 2C0GA 3ZIVA 6GSVA 4O92A 1PQNA 4X0XA 1YZXA 3E3EA 3FR6A 2E2MA 5A4WA 1TU7A 4F0BA 3PGTA 3UVHA 2IMDA 4D73B 2WGRA 1A2JA 2R5GA 3D5JA 3IAS2 4DVCA 1Y25A 2E2GA 5DDLA 4V2NA 3ZZXA 2J23A 5ELGA 1GTBA 3CXGA 3UARA 4WBJA 4IQAA 1A2MA 4BVXA 1URMA 5ECLB 2B1LA 4RUVA 1AQWA 2HSHA 4TW5A 3IBHA 3RBTA 1SK0A 1J08A 4G9HA 2O87A 1JLVA 5IMFA 2NTOA 2GDRA 1X9MB 1WIKA 3D6IA 3GN3A 2KHPA 1TTZA 1GSEA 4KGIA 2YJ7A 2YPMA 1UVZA 3TUEA 2PPTA 3UBLA 5DCHA 2H0HA 1K0DA 2AV4A 2RIIA 4ECCA 1GSFA 1OAZA 4EXJA 4XIHA 3J7Yb 4IQ1A 4L8EA 4POBA 4MPGA 2HNLA 4BVYA 3US3A 2OA7A 3QOUA 2H6XA 1H75A 4TR1A 1Q4JA 2DIZA 2I9HA 3DRNA 4K6XA 3U6VA 1JLWA 1XWCA 1TJDA 4OWYA 2VM1A 4MA9A 1NSWA 2OADA 2J9HA 1GUHA 1GH2A 3ZIJA 2HRNA 2BTOT 5IMDA 3EWLA 1WWJA 3ERWA 4WR5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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