5IMAA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f2
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 48
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imaA00
4NWYA 3ZMLA 4D73B 3EWLA 4YQMA 4RI7A 3KCMA 3QOUA 1K0BA 2HYXA 4EDZA 3WT2A 2VCVA 3HZ8A 4IBPA 4HU7A 5ECKB 3IHQA 3FR9A 1KBNA 1HNAA 4HOJA 5GZZB 4NV2A 2B5YA 4F03A 1G6YA 2O8VB 4XIHA 3TJJA 4DSQA 4XRDA 3M9KA 5G5FA 2C4JA 2M46A 2HRFA 5LD0A 1G0TA 4KE3A 3GNJA 1PGTA 5J4UA 1TK8B 2VM2A 1V2AA 5CNWA 3O76A 2N5FA 1TI3A 3BCIA 2JSYA 1A8YA 2K9FA 2R2JA 4MH2A 6GSYA 4LL1B 1UC7A 1SD9A 3D4MA 3HXSA 4ZB9A 3IAS2 4MPFA 1ZOFA 2AAWA 1IYHA 5KEJA 3RDWA 2L59A 5HR2A 2C3NA 4G10A 3ZL5A 4TR1A 3ZIJA 3J7Yk 4NAXA 2VAFA 2VD0A 2O87A 2GSSA 3CYNA 1T7PB 3HD5A 2FWEA 3RPNA 1Z6MA 3GSSA 2LQOA 5IMDA 2WDUA 2PVOC 2EIQA 4WEYA 1BEDA 4D73A 3I6AA 4MJAA 5CP1A 1S3AA 1Z7RA 2ON7A 2L4CA 3VI7A 1JZDA 2X8CA 1AQXA 1EP8A 4ZL7A 3KMOA 3TJGA 1TI1A 4V2LA 3D5JA 2K8SA 3UEMA 4FO5A 3H93A 2CX3A 2K18A 2OADA 3PH9A 2DIYA 4G19A 4I2UA 2IJYA 1SK1A 1GSEA 4TR4A 1A0FA 4MH3A 3BJ5A 1PN9A 3M3MA 3MWHA 4GXZA 3BOAA 1OYJA 3C1SA 3IA1A 3EYTA 4BPYA 3KJYA 1M7TA 3CRUA 1G6WA 1XVQA 1FB0A 1XZOA 4KDXA 1K0OA 4HZ4A 2B1LA 2YANA 5JWOB 4WETA 1QXHA 2I1UA 1GWCA 1O81A 3LG6A 5B6NA 2GGTA 1OAZA 3UMAA 4TRXA 4PQIA 1I9DA 1A23A 1W89A 3G7JA 1ST9A 4HUAA 2L5LA 2IMIA 5CRWA 1HQOA 1XIYA 3W6GA 3F0IA 1O6JA 3RHBA 5C04A 3RAZA 2PBJA 2X64A 3TOTA 1PA3A 3KEBA 4FIWA 1EOHA 1S3DA 2R3XA 1GSSA 4V2NA 3KH9A 4ZL9A 3F3QA 5FT3A 2DJKA 3IXRA 4ECCA 4BA7A 2MBTA 2YJHA 17GSA 3L78A 2C3QA 3GKMA 1MDJA 2AHEA 5E4WA 4IQ1A 2H0HA 3I9V2 2BJXA 2FWGA 2LV3A 2CT6A 2H1GA 2R4VA 1PX6A 3N9JA 1TU7A 4KH7A 2LSTA 3GA4A 1TRWA 1A24A 4IGJA 2OJLA 2GTUA 2DSAA 1YKCA 1GLPA 1B4PA 3LWAA 1OVNA 4FYCA 1F3AA 4GSTA 2NVLA 5L71A 3G9BA 2I4AA 3APOA 2WZ9A 4KNDA 5CREA 4POLA 1FW1A 4O92A 2LUSA 3HCZA 4V1Ap 2L5OA 2E2GA 4AJ8A 4GTUA 2F8FA 2H0GA 3KGKA 4KSMA 1DUGA 2C8UA 4KDYA 2OBKA 1U87A 3H1NA 2IMFA 1XWKA 3U5RE 2JZRA 3KD0A 1EV9A 1WPIA 4O5RA 3G7YA 2O7KA 6GSWA 4I8BA 2O85A 2QKEA 4FH8A 3F4TA 1H75A 4OFNA 1OE8A 1DBYA 2MBSA 2OE0A 1TW9A 1TTZA 3DVWA 1GULA 4X43A 4BWQA 3D6IA 2L4QA 3IRAA 3DD3A 5ENUA 2TIRA 2OA7A 3F8UA 1MDIA 1QMVA 4HU9A 9GSSA 2HI7A 3APSA 1LBKA 1AQVA 1BJXA 4P3YB 4GWRA 1YF0A 3TRPA 4KSOA 4YQVA 2D2ZA 2CZ2A 1O7UA 4K7OA 5FHIA 3KTBA 2M72A 2V41A 4MF5A 1GLQA 3FKFA 2CVKA 4ID0A 3Q19A 5J9BA 2GT5A 2B7KA 5G1LA 1TJDA 1PKZA 2XHFA 4ECJA 1V9WA 3DGQA 2C0DA 4GCIA 1M99A 3GRXA 2PMTA 4PQ1A 1GL8A 2H70A 3C7MA 3A2WA 1Z3EA 3E9JB 3FZAA 3CMIA 1QQ2A 4L0UA 5G2ZA 5LNKe 2YV7A 1ERVA 4MJBA 3VK9A 3TDGA 3FZ5A 4J57E 2N5AA 2YN1A 3CRTA 3VURA 1K3YA 5G1KA 2GZZA 2VD1A 5FWGA 4LLRA 4ZB8A 3H4KA 2JZTA 5ECHB 2C3TA 3ED3A 4N10A 4IJ3A 1TDIA 3Q74A 3SBCA 3I43A 3IC4A 2IN3A 1Z7PA 4DSRA 1SL1B 1B9YC 4K6XA 3VWXA 1ZZYA 3TKRA 4IJIA 2L57A 2RUEA 3J7Yb 1OKDA 4K7NA 1YJ6A 11GSA 4MF7A 3VWVA 4F0CA 4POKA 5IOXA 2JL4A 1SD8A 4IHUA 4KDUA 1XWCA 1T00A 2F51A 1TKDB 1O8XA 3HDCA 3UJ1A 3WGXA 2GT6A 1LU4A 3W8SA 4IKHA 2HXKA 1R4WA 3M0FA 3GX0A 1H4OA 4NV5A 3TOUA 2MZCA 4HZ2A 3QPMA 1XPVA 3TJKA 13GSA 3GN3A 5COHA 3ZTLA 3MNGA 1K3LA 4WXTA 3DXBA 5HQPA 2HLSA 1YZXA 4K0NA 2F3MA 2Z9SA 6GSSA 3NOFA 4V1Ag 3P90A 2X8HA 3GKXA 1ERWA 4TXOB 2LJKA 2VCXA 3F4RA 3CBUA 3D4TA 5D9WA 2YP6A 2CAIA 3KXOA 1JZRA 4NHWA 5IMFA 3ZVJD 5B8AA 4IP1A 2I81A 2VCTA 2PPTA 4Q5QA 3QFBC 3GV1A 4WF5A 2QSIA 2LKUA 4LL4B 3VI5A 3F9UA 1SKRB 2CZ3A 2DBCA 3E0UA 3GMFA 2FNOA 4KAEA 3CTFA 3EVIA 4WR5A 1FAAA 5HR3A 3VFIA 1EEJA 3GFKA 2YZHA 5IPHA 1XOBA 4H86A 3EE2A 1NHOA 2VCZA 1AQWA 5DAKA 3DWVA 2MMNA 3HVSA 2LRCA 2H0IA 5CYYA 5DALB 1NHYA 3ZIVA 3CSJA 2JZSA 2XBQA 3UOMA 4MP4A 3GX8A 2JU5A 1GSFA 2VCWA 3GKNA 3WYWA 4WBJA 4PNGA 5J9CA 3FEUA 4TXOA 1M0UA 3F6DA 4GLTA 3PR8A 4BL7A 1QUWA 1SKSB 2L6CA 2OE1A 1T4YA 4EXJA 3D22A 2IWTA 1GTBA 4YAVA 2DMLA 3PINA 2VL9A 5EY6A 2VO4A 1THOA 5DBQA 1X9MB 3GIXA 2HZEB 4NPBA 5E59A 2ZUPA 1B9XC 3A3TA 5JCUA 2CQ9A 2FLSA 16GSA 2V6KA 2AJQB 1EGRA 1ILOA 4OCEA 5IO2A 2CA8A 2NBSA 1GSDA 3VLNA 3GH9A 4YH2A 4EUYA 3AY8A 1KEBA 4J2FA 4NHZA 4KUNA 1ACVA 5AIXA 4POBA 3DKSA 3C8EA 2A2SA 5F0GA 1GRXA 1OC8A 3TJFA 2I9HA 4K9ZA 5D93A 3DYRA 1J08A 3MDKA 5DALA 1TRVA 1O85A 1Q98A 2XBIA 2XC2A 2DJ0A 4PUAA 1EGOA 3KTLA 1K0NA 1R5AA 5ECPB 4X1UA 4AGSA 1PL1A 3NZNA 7GSSA 3EC3A 1GH2A 4PQHA 1N8JA 3ZFLA 3EU4A 3CSHA 3ZREA 3ME8A 1URMA 2C0EA 3UARA 2WS2A 1O8WA 2P31A 3FZ9A 4XTSA 3LXTA 1B48A 3FW2A 5B6MA 5G30A 4ISDA 4F0BA 3EMPA 3ME7A 2GS3A 3RHCA 5IMAA 2FGXA 2CVDA 3WD6A 2YNXA 2MMZA 2ZNMA 1PL2A 1LJRA 1WMJA 4RQRA 1GTAA 3GL5A 3IE3A 2KUCA 1X9WB 2VIMA 2HZEA 4MLYA 3APQA 5GSTA 5DJMA 2VL3A 5DCGA 1RK4A 1AXDA 5IOWA 4QQ7A 2FA4A 4HJ2A 2PN8A 2H66A 5ABRA 4IP6A 4HS1A 4BVXA 3C73A 1YEXA 4GQFA 3VWUA 1EV4A 2M80A 2KLXA 4JR6A 3TCOA 3F63A 2E2MA 5D73A 1K0MA 1TRUA 1YQ1A 2YWIA 5AISA 1BYEA 4EKZA 1U3AA 5J5NA 2NDOA 2YWOA 1AAZA 1M2DA 1G7EA 1WIKA 1MTCA 1A2LA 1YDKA 4GSNA 5HFKA 2B5EA 3D0ZA 4KGIA 2H6YA 2J23A 5F06A 2H01A 2PUKC 1GTUA 1XW9A 4EDYA 1PRXA 2YPMA 4ZBDA 3FYGA 2X8GA 2A2RA 4WKWA 5D9TA 4XS6A 1FG4A 1ZGNA 1ZMAA 1JLWA 4IS0A 4XS4B 2RM6A 4LMWA 6GSXA 3ISOA 4K1FA 3U6VA 3LJRA 1M9AA 4MCUA 5ELAA 3E3EA 1XW5A 1XOAA 2AYTA 3N5OA 2LRNA 3BCKA 4MF6A 2GQMA 1MEKA 4JRRA 3TKSE 1FOVA 3KZQA 4X0XA 1NSWA 3P7XA 3EINA 4O7HA 3ERFA 4IVFA 2PU9C 4YQUA 4TN8A 2TRCP 3DIEA 4IN0A 3WGEA 2HE3A 1MD4A 2MYGA 4TR3A 1XCCA 5ECIB 5KN2A 1RQMA 4QL7A 2KP1A 4PX1A 3QMXA 5CRGA 5JCWA 3HA9A 1Y25A 2WB9A 4MPGA 2C80A 4XRAA 2KHPA 4ULXA 3CXGA 4OO5A 18GSA 2VOCA 2H8LA 2LJRA 2RLIA 3QAGA 1V40A 5IM9A 3W8JA 2MMOA 4YAPA 4DVCA 1F6MC 2RUFA 3IK9A 4MJCA 10GSA 3HJPA 2H71A 1V98A 2H72A 5B7CA 1UN2A 4G2EA 4XS4A 4ZIJA 1PD21 2X99A 2G2QA 5HFIA 2HFDA 4CW9A 3IR4A 2LTKA 4KA0A 5H5QA 5F05A 4Z7XA 1ZL9A 4TOPA 3QAWA 1OKTA 4Q5NA 4N0VA 3GYKA 1V58A 4N0ZA 5CAXA 2IL3A 4I97A 1Q4JA 3KP8A 4Q5FA 1F2EA 2VM1A 5H5RA 2ALBA 1UVZA 4AF2A 2GLRA 4BWSA 3ZLPA 3ERWA 3TKSC 3L9UA 3UIWA 1SKWB 4WR4A 2BTOT 1SYXA 3IK7A 4L8EA 3LSZA 4RQXA 2IPAA 2AB6A 5CRDA 1ML6A 2K6VA 3TUEA 1AW9A 2VCQA 4XS1A 2PGTA 2WJUA 1DE1A 1VRSD 2G0FA 2YJ7A 1SU9A 1YY7A 1YEPA 1A0RP 4HQSA 4ML6A 3BD2A 2R37A 2YWNA 1SYRA 2AUVA 2LEGA 5CO3A 5IPGA 2VL2C 4N11A 5EVOA 1SJ6A 1WJKA 5DQYA 2OKAA 2QGVA 1TXXA 4PURA 3GKKA 5AN1A 3L4NA 2CV4A 1JLVA 5AIVA 2FY6A 1CQGA 5D8IA 3MSZA 1F9MA 3IPZA 1EZKA 4OWYA 1SL2B 1X5DA 1SENA 3KMNA 1TK0B 1DSBA 1ABAA 2HZFA 2V6OA 1K0CA 4L5LA 4ILFA 5INYA 4MZCA 1E2YA 4ZILA 1X5CA 4HDEA 4WF4A 4RI6A 2WULA 3WT1A 3TJBA 3BBYA 3LGCA 1V57A 2NTOA 2DMMA 4K2DA 4HI7A 1GTIA 2YCDA 4GSSA 5A4UA 4EE0A 1GUMA 3CTGA 2XPEA 2YZUA 2VLTA 2LNTA 2PVQA 2WGRA 5ECMB 1AC1A 3HJMA 5B8BA 1QGVA 5EPFA 4I2TA 4I5QA 4MK3A 4PUFC 1PSQA 2DJ2A 4TR1B 5ECQB 3UVTA 2JSZA 5J41A 4OFTA 2A4VA 1PKWA 1AUCA 20GSA 5DQSA 4MA9A 4JU5A 1KNGA 4Q5RA 4OO4A 2H1AA 1JZOA 4HJMA 1XXUA 2FHEA 2DJ1A 3VPTA 3LYPA 2H1DA 4ZBBA 2VUPA 4TW5A 3TB2A 2HNLA 2P0GA 2IFQB 1UA5A 3GUSA 4F2IA 5IIZA 1BG5A 2CVBA 1BX9A 1RW1A 3WGDA 3MAKA 4JR4A 4OCFA 2ES7A 1Z6NA 3GURA 1E6BA 3HJOA 1F3BA 4EL1A 2EC4A 2HT9A 1U6TA 1PX7A 3QR6A 4I6XA 1T1VA 2GSTA 3TRQA 2GZYA 4V2MA 1VF2A 2V1MA 2B1KA 4L5OA 4N30A 3IDVA 3ZMKA 1JFUA 1IYIA 4MJEA 2IMEA 1XBSA 5IMCA 3I69A 1T8EB 3FHKA 5F07A 4TR0A 5EL8A 2WCIA 4OFMA 3ZYWA 2DC5A 3EMXA 1I5GA 2KOKA 1ERTA 2YWMA 1THXA 1BQ7A 2K8VA 1GUKA 3L9VA 3OR5A 5D9VA 5DDLA 3FR6A 5J3RA 1SJZA 3ERGA 4EC0A 2EIOA 19GSA 2L6DA 4EVMA 1EWXA 3L9SA 2LS5A 3HZ4A 4BVYA 5ID2B 1TRSA 4L0WA 1AIUA 1R26A 3L0HA 4ZL8A 2IFQA 1GNWA 4KX4A 4XHMA 3FY7A 5AGYA 3UVHA 3DVXA 1HD2A 4KCAA 1JHBA 4KW6A 1A8LA 1TP9A 1GNEA 2H74A 3ZRDA 1GSUA 3S9FA 2H73A 2PWJA 1NM3A 3NIVA 2FUG2 4EO3A 5GSSA 3SWLA 1X0RA 3QAVA 2C0FA 4F9ZA 4OMVA 2ZCTA 4K0GA 4ZBAA 1K3OA 2DLXA 1WOUA 5A4WA 4TVEA 3TKQA 4DSSB 2YV9A 1XWAA 1M9BA 2N5BA 2R5GA 1FB6A 2GSRA 1QFNA 2J9HA 5F8BA 2DIZA 2C0GA 2NPBA 3ZVJA 3FZ4A 5DVBA 2H6XA 5GAPD 5G5EA 2E0QA 2EIRA 2P5QA 1JZWA 3HY2A 4AJ7A 1TOFA 4FYUA 5JWQB 5DJLA 2H75A 1DE2A 3C1RA 5ID2A 3Q18A 3QCPA 2CX4A 1SK2A 3HYPA 2B5XA 1ERUA 4ECIA 3ZITA 3KP9A 5JCGA 4GRFA 4ECBA 1HNBA 4ZB6A 1OC3A 2OE3A 1FVKA 1K0AA 5ECNB 2B7JA 3ZZXA 3RPPA 4J56E 2REMA 3HVVA 3LQ7A 3QD9A 4MZBA 1J9BA 2B3SA 2C1YA 5A4VA 3GSTA 3D21A 5IMVA 3KIJA 3HVXA 1O73A 3UAPA 2HSHA 4CHSA 4TKYA 4IELA 2GQLA 1VF4A 4RUVA 5C00A 1EOGA 3DEXA 3P8WA 3VPQA 2AV4A 3DMLA 3M1GA 3Q6OA 4DSSA 4MDCA 2DJ3A 4KCEA 1M2BA 3IBHA 4LA1A 1K0DA 4FYBA 3O3TA 4JBBA 1BAYA 2FD3A 1B4QA 1ZYEA 3TGZA 3LXZA 3C71A 1XWGA 3GHAA 3TKPA 2H19A 3M8NA 3GH6A 3V1WA 4E8HA 4HQZA 1A2MA 3FRCA 1GSQA 4ML1A 3JCML 2GSQA 1KTEA 6GSVA 8GSSA 3UBKA 3DRNA 5ECRB 4PGTA 5HR1A 2GZPA 3A5WA 4LMVA 4MMMA 3LORA 2IMDA 1YKAA 2PERA 2BMXA 1FO5A 4F82A 5ELGA 1XWBA 4POMA 1HYUA 1SJIA 4IQAA 1S3CA 1M2AA 2HRNA 4E8EA 3US3A 2VLVA 5KN0A 2V2GA 1OC9B 3UL3A 4NMUA 2OBIA 4O32A 4IW9A 1B8XA 5ECSA 2H1BA 2ON5A 2I3YA 2P5RA 2LQQA 2GQKA 1FHEA 2O89A 2RIIA 3EURA 3ZFBA 1PQNA 4PNFA 2F8AA 1A2JA 1C72A 5A5KA 3VWWA 12GSA 4JE1A 2CAQA 1W4VA 4XCSA 3RBTA 1ZCPA 2H30A 3P2AA 5CRHA 1NW2A 4PXOA 5JWRB 1GSYA 4ACSA 14GSA 3GTUB 4MZWA 5KN1A 2XPDA 4GF0A 3LEFA 1USBA 1HNCA 1GUHA 6GSUA 4HEA2 3K8NA 1R7HA 2OACA 1SK0A 5ECOB 5GAND 3FK8A 2LRTA 4ZXGA 2IIYA 1X5EA 5KN3A 1TK5B 1T3BA 2QC7A 2F9SA 3LFLA 2R6KA 2H6ZA 1T4ZA 2LJAA 5IO0A 5DCHA 3KM6A 3H8QA 3G7IA 1N2AA 3R2QA 3TKSA 1U3IA 4WBRD 4K7IA 2E7PA 4EF0A 4JZQA 1J0FA 1WE0A 4K8MA 5G31A 2B6MA 3IOSA 5H5SA 1FVJA 2FWHA 1CQHA 1X9SB 2RM5A 2WFCA 1Z5YE 2DJJA 1OC9A 2JADA 2H76A 3A2XA 1XVWA 5IMZA 1U88A 3TRXA 2TRXA 3M9JA 1R5PA 4JEDA 3F4SA 2JACA 3IAM2 5D9XA 3O6TA 2VLUA 4QL9A 2VL2A 4KB3A 5D96A 2LNSA 3UBLA 1XW6A 4NXIA 1OE7A 3H79A 1GP1A 3GTUA 1YF1A 5ECLB 2KP2A 3FR3A 4G9HA 4MABA 3A2VA 2GDRA 2YOIA 1PMTA 1QK8A 1XFLA 1TU8A 3HKRA 1VF3A 5HFGA 3KH7A 4TXVA 2HSYA 3F3RA 2FCHA 5DAKB 1SL0B 2FA8A 5HR0A 3GL3A 1EP7A 4GQCA 3F6FA 3QFAC 4CDOA 6GSTA 1VGLA 3PGTA 4OD7A 5IQYA 5LCZA 2GVPA 3CSIA 2V32A 3IV4A 2FWFA 1Y6EA 3HHVA 22GSA 1MD3A 1EEMA 3LYKA 1MDKA 1WWJA 1G7OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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