5IMFA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f5
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 50
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imfA00
4ZL7A 3KD0A 2HNLA 5HR2A 1M2AA 2H8LA 3GYKA 2G2QA 4F2IA 3EMPA 1ZL9A 3HDCA 2VCZA 3WT1A 2EIRA 4N0VA 3JCML 4PQHA 2TRXA 2HSHA 3GHAA 3GTUA 2NTOA 4GF0A 4IJIA 2H66A 1X9WB 4KB3A 2L6DA 1FVJA 1WOUA 2HRNA 4HOJA 4YQVA 3U5RE 3DMLA 2B6MA 1JLWA 1Z7RA 4POMA 3MDKA 1A2LA 2H0HA 3I43A 2VL2A 5JWQB 3TKRA 3UBKA 1G0TA 1DSBA 2WS2A 3A2XA 1OVNA 1XW6A 5DBQA 4O92A 4FYUA 5ID2B 2FA4A 1PN9A 1PQNA 5L71A 5CP1A 4EF0A 4TVEA 3E3EA 1ERUA 1SJ6A 3VPTA 3MWHA 4JR4A 3CSJA 2MMZA 4KH7A 1YKCA 3LEFA 3ZFLA 2DBCA 2P5QA 2H01A 2GSRA 1B9XC 4G19A 4I5QA 2HSYA 1TTZA 2DJ0A 3KIJA 5DCHA 4AJ6A 2PWJA 3HKRA 5IO0A 2OJLA 2Z9SA 3CBUA 3IBHA 4PNFA 1XWGA 4MF6A 4I2TA 5KEJA 2LJKA 4Q5FA 1Q98A 2I4AA 4IELA 4GCIA 1EP8A 4ZBBA 3ZRDA 1VF1A 1YZXA 5ECQB 1GNEA 3TJJA 1GLQA 2A2SA 1BX9A 3ME8A 5CO3A 2I81A 3E0UA 4CW9A 1XWAA 2KP2A 4MDCA 1H75A 2MMNA 4ZB8A 5D93A 2CVBA 4IW9A 2A2RA 2K6VA 1X9SB 1OC9A 3APSA 4YH2A 6GSUA 2X8CA 2DIZA 3VK9A 1O8XA 1J0FA 5DALA 1SL1B 2EIOA 1JHBA 1TK0B 2ZCTA 2DSAA 3TKSE 3W6GA 4J57E 2LV3A 3TJGA 2RUFA 3EWLA 4DEJA 4HQZA 4MMMA 4ZL9A 2HZEB 4KCAA 3Q74A 3QDNA 3KTLA 4Q5RA 4DSRA 3D21A 2YZUA 2X99A 2BMXA 2YWOA 2FNOA 3I69A 3H79A 1SK1A 2C0GA 1GSYA 4IN0A 4MF7A 3UAPA 3EU4A 5B8AA 3GIXA 1JZDA 5KN0A 4K8MA 1TRVA 3L4NA 4LA1A 5IMZA 3GA4A 4KNDA 1ERWA 3FR3A 11GSA 1XPVA 3KXOA 5GAPD 2IFQA 1J08A 1A8LA 4IGJA 3TOTA 2GQLA 2G0FA 3KEBA 2R5GA 4ZILA 4LLRA 1CQGA 3F6DA 3HD5A 3EURA 19GSA 4IP6A 4GWRA 5DJLA 1FO5A 1XWBA 1KEBA 2XBQA 3Q6OA 4OFMA 4L8EA 4ZXGA 1THOA 1NW2A 2LEGA 1FG4A 2K18A 1CQHA 3CTGA 5GSSA 2CVDA 3RHCA 2L5OA 3C1RA 4EVMA 4OD7A 2C3TA 3DWVA 1U6TA 2MBTA 2A4VA 2H75A 2C8UA 4HQSA 1OE7A 1ZYEA 3FZ4A 4TR4A 4K6XA 2VCVA 1DE1A 1DBYA 3D0ZA 2OBIA 3ZMKA 3CTFA 2CVKA 4ECCA 4NV5A 2JL4A 2RM5A 2NVLA 3Q18A 2C0EA 1B4QA 3C71A 3HJOA 3TB2A 1K0OA 5IIZA 4MABA 5EVOA 1T4ZA 1SK0A 3IPZA 1F3BA 1TRWA 1TU8A 1IYHA 1U88A 2O89A 1UC7A 1YKAA 4NHWA 3L9UA 3TKPA 2YWNA 1RW1A 3D4MA 2YN1A 3KZQA 3H4KA 3GKXA 1EP7A 3FYGA 2YJ7A 5JWRB 1FOVA 4MPGA 5ECSA 2DJ2A 4O7HA 5B6MA 2PU9C 4RI7A 2YV7A 3BD2A 3DD3A 5IPGA 3L9SA 1WMJA 2H6YA 1GSDA 1RQMA 2LNSA 3HYPA 2GT6A 1OC3A 5JCGA 2PERA 2L59A 3WT2A 2AHEA 3PH9A 2E7PA 4KSMA 1A24A 2H6ZA 1XXUA 3SBCA 3DKSA 2KUCA 3LYPA 3F3RA 1O8WA 2O8VB 13GSA 5G2ZA 5IM9A 1O7UA 3PINA 3VURA 5GAND 1MD3A 1SU9A 3F4TA 3WD6A 2M46A 1FB0A 2OE1A 5IQYA 3RPNA 3GX0A 3IAM2 18GSA 3IA1A 4ECIA 2B7JA 3OR5A 1GUHA 1FAAA 2LTKA 3IDVA 2YCDA 2LS5A 1LBKA 1SYRA 1T3BA 2FCHA 5CAXA 2LKUA 5DALB 2K9FA 2H76A 3EC3A 4QL7A 1MTCA 3C1SA 5D96A 1K0BA 2YWMA 4N11A 3HVVA 1YEPA 4KAEA 2RM6A 1TXXA 3LGCA 4OFTA 2H73A 3ZREA 1YDKA 2GLRA 4G2EA 1AIUA 4XS6A 5IMVA 2LRCA 5JCWA 4LMVA 2DIYA 2IJYA 4ZBAA 1TU7A 1N8JA 4WXTA 3RBTA 2H0IA 1SYXA 4Z7XA 1W89A 3SWLA 5GSTA 1DE2A 1X5DA 3VI5A 1NHYA 2BTOT 2HT9A 3FRCA 3VI7A 5COHA 5B6NA 3QD9A 3VFIA 4D73A 1TDIA 4IQ1A 3TJFA 5IOXA 1FW1A 3HHVA 3TJBA 4XS1A 4KX4A 4WF4A 1GSSA 2MMOA 2WDUA 5JWOB 2RLIA 2L4QA 1Q4JA 2ALBA 2WGRA 1EEMA 2IFQB 2VL3A 3UVHA 1SJZA 2YWIA 4ECJA 5EL8A 1PA3A 5B8BA 4ISDA 5ELAA 4HZ2A 1GTBA 2FWEA 3L78A 1TI3A 1YF1A 2HZFA 2LUSA 3GUSA 3UIWA 4XHMA 1EV9A 1O6JA 3TGZA 1GSFA 2H1DA 4HU7A 2I3YA 2ON7A 3F9UA 3RAZA 2XHFA 3HVXA 1GSQA 4IBPA 5ABRA 3A2VA 2H1AA 4KUNA 3BOAA 3F3QA 4BPYA 2QC7A 2CV4A 3ZTLA 3GFKA 4PXOA 5CREA 5DDLA 4F9ZA 4L0WA 3MAKA 2KLXA 3IOSA 2GZYA 4HDEA 2OE3A 1N2AA 3I6AA 4MJBA 1NSWA 5ECHB 4G10A 4KDYA 5C04A 5G30A 4AGSA 3VWXA 3FEUA 4V1Ap 2PN8A 2VLTA 1HNAA 3L0HA 1SKRB 2DMMA 4HJMA 2FUG2 2GQMA 1AW9A 3GMFA 3U6VA 4K0NA 3L9VA 3LQ7A 2IMEA 4AJ7A 1M0UA 1K0MA 1M2BA 4JR6A 2E2MA 3A5WA 3ZITA 3HZ8A 1ERVA 1QQ2A 1URMA 2L4CA 4E8HA 3KH7A 2M72A 2JZSA 2YJHA 1XBSA 2EC4A 1Z3EA 2I1UA 7GSSA 1LJRA 2CAQA 1B48A 1OAZA 1I5GA 1HNBA 3P7XA 1YF0A 5G1LA 4NWYA 5DQYA 2PGTA 3GL5A 3ISOA 1V58A 5E59A 2L5LA 4XCSA 4F03A 2LJAA 2O7KA 4J2FA 1XOBA 4ACSA 4POLA 2PUKC 4K7OA 2FWFA 4LL4B 4V1Ag 3CMIA 1AXDA 4V2MA 4MPFA 4WR4A 5KN2A 3TRQA 4FIWA 2N5BA 2J9HA 5LCZA 1O73A 1TK5B 4PGTA 1GTUA 5HR0A 2OACA 5ECKB 4WETA 3G7YA 1M7TA 17GSA 1M2DA 2GGTA 1GNWA 3F0IA 1K3YA 2X8HA 4L0UA 4FO5A 1AQVA 2LJRA 1S3DA 3WGXA 2PPTA 4KA0A 4KDXA 4L5OA 4MJCA 3LSZA 2VCTA 3HCZA 3O76A 3UVTA 3EYTA 4TOPA 2H71A 3WYWA 2N5FA 4RI6A 3LORA 4X0XA 2V1MA 3F6FA 2K8SA 5IMAA 2B1LA 3VLNA 2VM2A 4IJ3A 5FHIA 2WFCA 1TK8B 1C72A 3LFLA 4ULXA 5ELGA 3VWUA 2IWTA 1T4YA 3G7IA 3C8EA 3HY2A 3DYRA 3ZMLA 4D73B 2VO4A 1WE0A 3RPPA 1PX7A 1YEXA 4ILFA 6GSSA 2L57A 4XS4B 2JU5A 1GUMA 1ERTA 3GNJA 3BJ5A 2LRNA 2IL3A 2IMFA 4NAXA 1PGTA 4O5RA 4DSSA 1E6BA 2LQOA 1RK4A 3C73A 2J23A 1R4WA 2IMDA 4K1FA 1T8EB 3APOA 5H5SA 1BG5A 3ED3A 4TR0A 3QMXA 1VF3A 1A0RP 2AYTA 4PNGA 2M80A 3IC4A 2E0QA 4MH3A 1B4PA 3DVXA 1J9BA 2B5YA 2F3MA 3CSIA 1JLVA 1XFLA 4WKWA 4MZWA 5AN1A 4GXZA 1GP1A 2VD1A 4IP1A 1AC1A 3BBYA 4MH2A 2ON5A 4POKA 4WBJA 4MJAA 4GSNA 5HFGA 1VRSD 2R3XA 2VL9A 4JU5A 5B7CA 2ES7A 2VLUA 2V6OA 4K7IA 1AUCA 1X0RA 1M99A 1V2AA 5CRDA 3GH9A 1GULA 2H72A 4PQIA 1A2MA 3GKKA 2XPDA 1X5EA 5D9VA 1NHOA 2IIYA 1FHEA 4OCFA 1WRYA 5LNKe 3RDWA 1V98A 1M9BA 3TUEA 1O81A 5H5QA 3US3A 4MLYA 5HQPA 3FR6A 2B5EA 5J3RA 4ZIJA 2GZZA 2JADA 2K8VA 4QQ7A 1ACVA 4P3YB 1PL2A 2AUVA 3ZZXA 1X9MB 1T1VA 3GTUB 4N10A 1ST9A 2CQ9A 2C80A 3G9BA 1EOGA 3DEXA 1F2EA 3EE2A 4WF5A 4BL7A 1BYEA 5DJMA 4HU9A 4LMWA 1Z6NA 4H86A 4IHUA 3BCKA 4GSTA 4L5LA 3ME7A 3F4SA 3TRPA 1PMTA 2RUEA 4ZB6A 2R37A 4TXOA 1G6WA 3HJPA 5GZZB 4E8EA 2VM1A 1TW9A 4BWSA 1EEJA 5ECLB 4HI7A 3D22A 3TKQA 3HXSA 2GSSA 4TRXA 8GSSA 2CZ2A 5A5KA 4GTUA 12GSA 4XTSA 1ZOFA 2EIQA 4KE3A 2WZ9A 3CYNA 4I8BA 4KW6A 6GSYA 3AY8A 2PBJA 1R5PA 3DGQA 3QPMA 1JFUA 3GH6A 4EXJA 5D9WA 2JSYA 3EMXA 3N9JA 1XW9A 4HZ4A 3QAGA 1ON4A 1PD21 4N0ZA 2WCIA 1V40A 1K0DA 2B3SA 1SD9A 2VUPA 4TW5A 2DLXA 5A4VA 1EWXA 1SJIA 1OC9B 3M0FA 3ZIJA 2H74A 1H4OA 3DVWA 4TR3A 1Z5YE 1U3IA 4OMVA 4XRAA 3FHKA 4JZQA 4G9HA 1EZKA 2TRCP 1XWCA 1AQXA 5AIVA 3LYKA 3FZAA 5ECRB 2YZHA 4EC0A 3TOUA 2HLSA 4YAPA 5EY6A 2KP1A 1XWKA 4QL9A 4GRFA 1PL1A 1QMVA 1XCCA 5CNWA 5DQSA 4DSSB 1ZCPA 5HR3A 3ZYWA 1Z7PA 1V9WA 2JZRA 3GRXA 1HQOA 4HJ2A 2OKAA 3C7MA 3IE3A 1SKSB 1GRXA 4FYBA 4JEDA 1HD2A 3FW2A 4I2UA 1K0AA 1GTAA 2IMKA 4ZBDA 4GQCA 4F0CA 3LWAA 4MA9A 3UJ1A 4POBA 5CYYA 3KM6A 3O3TA 3IRAA 3V1WA 2P5RA 1SKWB 1G7OA 2DC5A 2B1KA 5INYA 4GQFA 2H1GA 4ZB9A 2WJUA 1VGLA 3DIEA 3GX8A 2REMA 4F82A 2V2GA 3IK7A 2MMAA 4EO3A 2CX4A 1SENA 3D4TA 2C4JA 1UVZA 4IQAA 1Y6EA 4N30A 5D73A 3K8NA 4MK3A 2LRTA 1SL0B 3M9KA 3R2QA 6GSVA 5IMFA 1QGVA 4GLTA 3S9FA 4IVFA 4LL1B 3M3MA 4ID0A 3GL3A 1F6MC 4X43A 4HEA2 2GVPA 2B7KA 2QGVA 3BCIA 4NHZA 5J41A 4TR1A 1XOAA 2V41A 5F05A 3ZIVA 2KOKA 2H6XA 4EKZA 3EINA 3KTBA 1MD4A 3HA9A 20GSA 1WP0A 2BJXA 4I97A 1ZGNA 4KSOA 5D9TA 2HI7A 3H93A 4MF5A 1BJXA 2F8AA 2MYGA 4TXOB 3P8WA 5JCUA 1A2JA 5ECMB 1KBNA 5LD0A 3APQA 3IAS2 2H30A 1KTEA 5F07A 1O85A 1XVWA 3D6IA 1OKTA 1FB6A 4KDUA 3FY7A 5AISA 1IYIA 3FZ5A 5D9XA 4EDZA 2FA8A 4JBBA 2CT6A 2X8GA 2JZTA 1AAZA 3GURA 4PUAA 2HFDA 2JACA 2IMIA 4OO5A 4FYCA 5CRHA 4TKYA 3QOUA 2V32A 3J7Yk 2IN3A 10GSA 2PMTA 3UOMA 2C1YA 1VF4A 4HUAA 1AQWA 2GT5A 5C00A 5D8IA 4RQRA 5F0GA 4RUVA 2MZCA 5A4UA 2PVOC 3QAVA 3TRXA 3M9JA 2ZNMA 1ML6A 2QSIA 3ERFA 1GH2A 4AF2A 5AIXA 4OFNA 1F37A 4OO4A 3P90A 2GZPA 4ECBA 3CSHA 5IMDA 5ECOB 1Z9HA 3M8NA 1WIKA 3ZVJD 2H0GA 2GS3A 3P2AA 1FVKA 2CZ3A 2GTUA 1ILOA 4HS1A 2VIMA 3IXRA 4TXVA 3TKSC 1OC8A 2DJJA 2LQQA 1WWJA 3EU3A 5DAKA 1YY7A 3M1GA 4NXIA 1SK2A 3QFBC 3W8JA 1TRSA 4O32A 4BWQA 4NMUA 2GQKA 1GTIA 3UL3A 3MSZA 2GDRA 4F0BA 2R6KA 5ECPB 1WJKA 5F8BA 4YQUA 4PQ1A 5J9CA 2I9HA 2C3NA 3ERWA 5DCGA 5G5EA 2OADA 4BVYA 1BEDA 1SD8A 3ZLPA 2DJ1A 3TCOA 1X5CA 3KGKA 4TN8A 4CDOA 9GSSA 2VCWA 1G6YA 4WR5A 1TI1A 1S3AA 4ZL8A 1QXHA 1BQ7A 3CXGA 1Z6MA 5KN3A 1F3AA 1DUGA 1W4VA 2NBSA 1G7EA 2DMLA 5FWGA 5AGYA 1PSQA 1ZMAA 2O85A 1JZOA 4BA7A 4WEYA 1PX6A 2FWHA 3F63A 1K3OA 1TP9A 4NV2A 2DJ3A 3QFAC 5CRWA 3GKNA 4TR1B 2IPAA 2MBSA 3DRNA 5FT3A 2V6KA 1USBA 4WBRD 1OE8A 2YANA 4EE0A 4K0GA 1GL8A 3MNGA 4V2LA 1B8XA 2YNXA 4ML1A 1PKZA 1GWCA 1TJDA 2F8FA 1OKDA 3HVSA 2CAIA 2H19A 2WRTA 3LXZA 3NZNA 1NM3A 4FH8A 2NDOA 3KP9A 4V2NA 5G5FA 3RHBA 3FKFA 4K7NA 2OA7A 1HYUA 2E2GA 2OBKA 2D2ZA 3TKSA 3GKMA 4RQXA 2F9SA 3HJMA 6GSWA 1XVQA 1Y25A 2AAWA 5F06A 1SL2B 2LNTA 2XBIA 4JRRA 1TRUA 2YP6A 1QUWA 1EGRA 1PKWA 5A4WA 3A2WA 2B5XA 1K0NA 3HZ4A 2RIIA 5CRGA 1TKDB 3WGEA 2OE0A 1YJ6A 3J7Yb 6GSXA 2L6CA 3KMNA 5HR1A 1K3LA 3PR8A 3LG6A 3ZL5A 2HRFA 2JSZA 3I9V2 1JZRA 2FLSA 1ZZYA 1U87A 4OWYA 2YV9A 2FHEA 4J56E 4X1UA 4JE1A 1MDJA 1E2YA 1PRXA 4KCEA 1EOHA 1UN2A 4MJEA 5H5RA 1QK8A 1YQ1A 4BVXA 2YPMA 4DSQA 1R5AA 2R2JA 2WULA 5ID2A 3TDGA 3UMAA 1GSEA 5J9BA 1JZWA 3QAWA 1BAYA 2X64A 2FWGA 5KN1A 2VD0A 4EL1A 3CRTA 1V57A 3F4RA 3IV4A 1F9MA 2QKEA 5J5NA 5IO2A 3FZ9A 2F51A 2CX3A 4ML6A 1EV4A 3PGTA 2ZUPA 2C0FA 1ABAA 3UEMA 5DAKB 1XIYA 3KH9A 2HXKA 4XIHA 4CHSA 1THXA 4EDYA 1M9AA 4Q5NA 3VWVA 1T00A 2HE3A 1VF2A 3LXTA 3QCPA 1WPIA 3W8SA 2GSTA 4DVCA 3O6TA 2P0GA 2HYXA 4KGIA 1R26A 3KCMA 2C0DA 1UA5A 4MCUA 1TOFA 5J4UA 2AB6A 2LSTA 3N5OA 1I9DA 1HNCA 5EPFA 5ECIB 5G1KA 5HFKA 4XRDA 3FR9A 1EGOA 1QFNA 1A23A 3GV1A 2VLVA 2H70A 3NIVA 4NPBA 2N5AA 3D5JA 3KMOA 2DJKA 2C3QA 1T7PB 2WB9A 4PX1A 3NOFA 5IPHA 3KP8A 4PUFC 2AV4A 2FD3A 3QR6A 1GUKA 2VL2C 22GSA 2FGXA 1XZOA 3FK8A 2KHPA 2H1BA 3ERGA 3IHQA 1S3CA 2VOCA 2R4VA 2VCQA 5IOWA 4XS4A 2AJQB 2TIRA 2XC2A 1KNGA 3H8QA 2HZEA 1U3AA 1A8YA 14GSA 3F8UA 1GLPA 1OYJA 4PURA 3VWWA 16GSA 1B9YC 5G31A 3LJRA 2GSQA 3IR4A 1ZYQB 6GSTA 2CA8A 3E9JB 3G7JA 4K9ZA 4YAVA 3GSSA 3TJKA 4Q5QA 5ECNB 2NPBA 3GSTA 4IKHA 4MZBA 3CRUA 2FY6A 2O87A 4AJ8A 2VAFA 3UBLA 4MZCA 1R7HA 3ZFBA 5DVBA 4IS0A 3KJYA 3VPQA 3UARA 5IMCA 2YOIA 2XPEA 4K2DA 3A3TA 2PVQA 4EUYA 4I6XA 5E4WA 4GSSA 1MDIA 3DXBA 2VCXA 1MDKA 4OCEA 4MP4A 1LU4A 4YQMA 1A0FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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