5IMVA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f6
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imvA00
2KP1A 3Q19A 1X5EA 2VO4A 4LMVA 3IAM2 4EUYA 2O85A 2HZEB 4ZXGA 3GSSA 3F6DA 4J2FA 1U88A 3VWXA 5HR1A 2DIYA 1ZYEA 1AC1A 3ZMLA 2X64A 5A5KA 1HNAA 10GSA 1W89A 5AGYA 3I6AA 3D21A 1FOVA 4KB3A 1Z6MA 2GQLA 3HJMA 2H76A 2C0DA 2VCVA 3ED3A 3GKXA 5DALB 1SJZA 1Z5YE 5CRWA 3WGXA 3EMPA 4L5OA 1JZOA 1PRXA 2RUEA 4NXIA 3APSA 2H1DA 5J3RA 4JE1A 3ZZXA 2L6DA 3HZ8A 4X1UA 3V1WA 4NV2A 3TUEA 4F0BA 4K8MA 1A0RP 4DEJA 2VD0A 1HQOA 2RUFA 3TJFA 3A5WA 4E8HA 1PKZA 2H71A 4HS1A 2YCDA 3H79A 3GV1A 3TJGA 5DJMA 4ECCA 2JSZA 1TTZA 1K0NA 4WBJA 5LNKe 1SL2B 2C3NA 3D4TA 2B7KA 3ERFA 1GULA 3FY7A 2H72A 4WETA 1F37A 3I9V2 5KN3A 1XVQA 3P90A 4TR0A 1TP9A 2ZNMA 1HNBA 4ZBBA 2H70A 5ECRB 5AISA 3ZIJA 3IXRA 2EIQA 1XZOA 1YY7A 3KTLA 5HFKA 4OO5A 3GH9A 1VF3A 7GSSA 1SK1A 1K0OA 2GSTA 2K18A 3QAWA 2RM5A 3ERWA 3GL3A 1EWXA 2YWMA 2I1UA 2V1MA 4G9HA 2MZCA 2MBSA 1TW9A 1QXHA 4POKA 1GUKA 2H73A 4Q5NA 1ST9A 2FHEA 4GSNA 1M9AA 4TKYA 1B9XC 1JZRA 2PERA 5G30A 4WF5A 3APOA 1EEMA 1GSEA 1EEJA 3RHBA 1BAYA 1EOHA 4I8BA 3WGEA 1S3CA 4PX1A 2H1GA 1T1VA 1MDKA 3HD5A 3FW2A 4D73B 2H1BA 6GSTA 2F51A 2LQOA 2WCIA 3GSTA 5INYA 18GSA 2KOKA 2VD1A 5HR2A 4FYCA 2YZHA 5DAKA 3IK7A 2J23A 3D6IA 1AXDA 3GUSA 1VF4A 4GSTA 4ECIA 1N8JA 3L9VA 4LLRA 3L0HA 4HJ2A 4MJCA 2JZTA 3ZREA 3CSHA 1T7PB 3ISOA 4EKZA 3C1RA 3FZAA 4MPFA 4HZ2A 16GSA 4JRRA 1PL1A 2NDOA 2FWEA 4XRAA 2P5RA 4AJ7A 5KN1A 4TW5A 2N5BA 1FB6A 5GSTA 2C3TA 2M80A 5J41A 2LV3A 3D4MA 4FYBA 1U3IA 2YV9A 1KBNA 1A23A 4FYUA 3ZVJA 1YKAA 4N11A 1EV9A 3HY2A 3ZIVA 1OAZA 1WIKA 1BJXA 2A4VA 3VLNA 2A2RA 3IK9A 5G5FA 2V2GA 3UARA 3EU4A 2LKUA 2QC7A 4KUNA 4L5LA 2B5XA 4KE3A 4K0NA 1QUWA 4MF5A 5L71A 1F3BA 4ECJA 4K7OA 5CO3A 4I2UA 1BQ7A 2QKEA 4GCIA 3H4KA 4OFTA 4WR4A 5DDLA 2REMA 4X43A 4HQZA 2F8AA 2VCWA 3OR5A 4PNFA 3IOSA 4I6XA 1NHYA 4MABA 3KEBA 3WT2A 2I3YA 4RQXA 1EGRA 1JFUA 1MDJA 1SKWB 5ELGA 5JCWA 2B7JA 3DVWA 2C0FA 4EDYA 1F6MC 4HEA2 4AJ6A 2DMLA 1IYIA 3QR6A 1BEDA 1GH2A 5EL8A 1JHBA 5ECOB 3CTFA 3CSIA 13GSA 2IIYA 1XWCA 5JWRB 3VI7A 3FZ4A 2GT6A 3HZ4A 3TJKA 3HHVA 1A8LA 1SD8A 4BPYA 5A4VA 3PR8A 3W8JA 3RBTA 2F8FA 5HFIA 3EU3A 2PMTA 2ES7A 3L9SA 2L57A 3KP8A 3G7JA 3M9KA 1OKTA 4HU7A 2L5OA 3MAKA 5CRHA 1BYEA 4ML1A 1G7EA 1ZZYA 2H30A 1T00A 2OJLA 4N10A 4K1FA 4MZBA 4DSSB 4QL9A 4GSSA 4BWSA 4XS4A 4E8EA 3FZ5A 3ZLPA 4BA7A 4IJ3A 4IS0A 1TK0B 2P5QA 1S3DA 2PWJA 1XWAA 3M9JA 3LWAA 2RLIA 1IYHA 1SK2A 2KHPA 2VM2A 5B8AA 4XRDA 3G7YA 3EURA 6GSVA 4PUFC 1XW5A 4MJEA 3BBYA 3BD2A 1YJ6A 3DEXA 1NM3A 5F0GA 2X8HA 3LYKA 1J0FA 4PQHA 1U87A 2TRCP 4XHMA 1O8XA 3GH6A 2EC4A 3IC4A 2IMEA 4F9ZA 2CT6A 2H19A 2E2MA 3ZRDA 3TRPA 2OE3A 4TR3A 3GMFA 2AUVA 1X0RA 2JZSA 1X5DA 3UL3A 2IFQB 4JR6A 1ZOFA 3TOTA 4NHWA 3F9UA 3G9BA 1T4YA 4ILFA 2R3XA 4Q5QA 1GNWA 5AIVA 1WE0A 3ZVJD 4YAPA 2YOIA 2K8VA 4JU5A 4RI7A 3DWVA 1EP7A 2WZ9A 2JL4A 3GTUB 5G1KA 1ML6A 1N2AA 1M2BA 2HZEA 2JZRA 20GSA 2GSRA 4ZBAA 2M46A 4PUAA 1MD4A 2C0GA 3KMOA 3C73A 1GSSA 3F4TA 3GYKA 3KH9A 3TKQA 4XIHA 2LS5A 1J08A 3LFLA 1M2AA 5ECSA 2DLXA 2OE1A 3KZQA 4YAVA 3QFAC 2VLVA 4EXJA 4GTUA 3TKRA 5DALA 1DUGA 2B5EA 1FVKA 1KEBA 4V2NA 6GSWA 1ACVA 2WFCA 2XHFA 1ERVA 1XWBA 2YWNA 4HI7A 3UMAA 5ECNB 2H0IA 4LMWA 1R4WA 3DIEA 1MDIA 1QGVA 2CA8A 5FT3A 2H8LA 4XS1A 5IPGA 3A3TA 2I4AA 3P8WA 3TJBA 1XW6A 4TXOA 3I69A 3QPMA 1GWCA 3NOFA 2GZYA 5A4UA 3A2XA 22GSA 3GX0A 5ID2A 3D22A 3KP9A 4HDEA 5IMVA 3LEFA 4KSMA 1E2YA 3TDGA 4Z7XA 2LRTA 4WR5A 2PVQA 1XWKA 2L6CA 4BVYA 3VPTA 2GGTA 4ZB8A 4HU9A 4KDXA 5B7CA 3HVSA 4ZL9A 1M0UA 1U3AA 4KH7A 5JCGA 3MSZA 3E0UA 4Q5RA 5G31A 3M0FA 1VRSD 3F4SA 1VGLA 2OE0A 5ECHB 1LU4A 1FVJA 6GSSA 2AJQB 4KCEA 3TJJA 3L4NA 3TKSE 5CYYA 5JWOB 1OC3A 3CSJA 4IHUA 3H1NA 2CZ3A 4AJ8A 2GTUA 1K3OA 1VF1A 5CRDA 2B5YA 1FHEA 1NSWA 5J9CA 1YF1A 2OADA 3DD3A 2V32A 1FG4A 2CVDA 2P31A 1AW9A 1A2MA 1Z6NA 1G0TA 2GQKA 4MA9A 1F3AA 2GQMA 4TR1A 4L0WA 1W4VA 8GSSA 1SYRA 2B6MA 5CREA 4NV5A 2JSYA 2CQ9A 1Z7PA 1URMA 1TKDB 4MP4A 1NHOA 1JZDA 3UIWA 4MH3A 3MNGA 4BL7A 2VCXA 4H86A 2IMFA 1OC9A 1HNCA 4OWYA 2VLUA 3PGTA 1FO5A 2KLXA 5CP1A 1SD9A 1T8EB 1OC8A 2FA4A 2O89A 1TRSA 4KX4A 4WF4A 2OBKA 4MMMA 4MZWA 2YWIA 1GLQA 5KN2A 4AF2A 2IJYA 4IQ1A 4EE0A 5IO2A 3TGZA 6GSUA 4Q5FA 1GUMA 1X5CA 3MDKA 2CAQA 1TRWA 1ZYQB 5IM9A 2YJHA 2HLSA 1ZCPA 5D8IA 2J9HA 1BX9A 3L78A 3IDVA 1JZWA 4OO4A 5IMFA 4ZL7A 4BWQA 2LJAA 4ACSA 2X8GA 1V2AA 4K7IA 9GSSA 3EYTA 1ON4A 1DSBA 3H93A 2LTKA 2MYGA 2H0GA 4KDYA 2MMNA 3ZFLA 1EZKA 2OA7A 4IVFA 2HRFA 4F2IA 4KSOA 4ID0A 1TK5B 1AIUA 4ZILA 1Y25A 2H75A 1R5PA 2V6OA 2L4CA 5ECKB 1FAAA 2WJUA 1RK4A 3MWHA 2BMXA 2GZPA 3UBKA 3ERGA 4IJIA 2JADA 5HFGA 1LJRA 5DQYA 3FRCA 4NPBA 5ECQB 1KTEA 1YZXA 3J7Yb 5D73A 4DVCA 2DJ2A 2GDRA 3TRQA 4O32A 2R6KA 2PUKC 3WYWA 2JACA 3NIVA 2HT9A 2AV4A 3EWLA 4MK3A 3A2WA 5CRGA 3VWWA 2VCQA 3KD0A 3GKMA 4FIWA 3HDCA 1Q4JA 1G7OA 1O8WA 3UOMA 12GSA 3UJ1A 4DSQA 3HYPA 5F05A 2FWGA 1WP0A 5D93A 1H75A 2DJJA 5D9XA 5DCHA 5H5SA 4GLTA 1TOFA 5CAXA 1AAZA 4TRXA 3C8EA 4K9ZA 6GSXA 3PH9A 5IOWA 1HD2A 2ZUPA 2ALBA 4QL7A 3DKSA 1GP1A 4KCAA 4CW9A 5HR3A 3FHKA 3N9JA 3K8NA 4ZL8A 3UVTA 4GQFA 3RAZA 1RQMA 2H01A 1SU9A 4DSSA 4EC0A 5ECLB 2F3MA 1THXA 2YP6A 2M72A 1Z9HA 1GUHA 5ECPB 2I9HA 2CVBA 4YH2A 3HVVA 2LNSA 4GWRA 1O7UA 4JEDA 3KXOA 2K8SA 1XPVA 4XS6A 3EVIA 1PGTA 2C80A 5H5QA 3D0ZA 4F03A 14GSA 1JLVA 1ILOA 1B9YC 4IKHA 2FUG2 1I5GA 2YWOA 2LRCA 4GRFA 3FZ9A 3FR3A 5ELAA 1PX7A 1B48A 1GTIA 4GF0A 2JU5A 1QMVA 2R4VA 3HVXA 4KW6A 4K6XA 4QQ7A 2VM1A 1K0MA 3VWUA 5DCGA 4MF7A 1XIYA 2N5FA 1O81A 2N5AA 2HZFA 2LUSA 1EOGA 5IMZA 4MJBA 2MMOA 1PD21 2CV4A 1A2LA 4O7HA 2HI7A 1YF0A 4CHSA 4V1Ag 3TKPA 2DIZA 2CX4A 5EY6A 4HJMA 3S9FA 1AUCA 1T4ZA 4XCSA 5DBQA 5J9BA 5F07A 2VOCA 4LL1B 3GA4A 5B6MA 3GURA 2C3QA 1GL8A 1CQHA 3D5JA 2VLTA 4WXTA 1MTCA 2DBCA 3F3RA 1EP8A 4CDOA 3EMXA 4TN8A 3IHQA 3F0IA 3GRXA 2VL2A 5J4UA 3P2AA 2K9FA 2IMDA 4WEYA 3FKFA 2E2GA 3KJYA 4KDUA 1R7HA 3IR4A 1GSDA 5FHIA 2A2SA 2PU9C 2LEGA 6GSYA 2FY6A 3CBUA 4MDCA 2FD3A 5IPHA 2IPAA 1T3BA 2FNOA 2GLRA 3DXBA 3O3TA 1WMJA 3BCIA 4L0UA 3Q6OA 2V41A 3IRAA 4XS4B 2ZCTA 1OE7A 3EE2A 4MJAA 1DE2A 1Z7RA 4IGJA 2CAIA 2QSIA 1ZGNA 2L59A 1PMTA 2WRTA 4FO5A 2GSQA 4FH8A 1OKDA 4ISDA 4PXOA 3WT1A 1H4OA 11GSA 1S3AA 3UAPA 4ULXA 1R26A 3BOAA 1E6BA 4J56E 4POBA 1M99A 5COHA 1QK8A 5EPFA 2B1LA 4MLYA 2R37A 4RQRA 1DE1A 3F6FA 4O92A 4AGSA 3BJ5A 3DMLA 2WB9A 1O73A 4EF0A 3IA1A 3KIJA 4OFNA 5GSSA 3FR9A 2TRXA 5DJLA 3TB2A 4J57E 4YQMA 2DSAA 1R5AA 2HE3A 2GVPA 3A2VA 1TJDA 2LRNA 2YZUA 5IIZA 2FA8A 1K0CA 1K3YA 1G6YA 4DSRA 1BG5A 4HOJA 3W8SA 1YQ1A 1HYUA 2XBQA 2WGRA 4POLA 1XCCA 4KAEA 2MBTA 4I97A 1GSUA 2LNTA 1V58A 19GSA 5D96A 3VWVA 2L5LA 5AIXA 3RPPA 1YKCA 4OCFA 4WKWA 2C0EA 3F8UA 1SL1B 3TKSA 4POMA 2ON7A 1UVZA 3LSZA 3ZYWA 4PQ1A 2RM6A 2AHEA 1TXXA 3UVHA 4LA1A 3VFIA 4EL1A 4IQAA 4V1Ap 4ZB9A 5GAPD 3KCMA 3CYNA 4X0XA 3C7MA 5B6NA 1GSYA 5LD0A 3LJRA 1RW1A 3HJPA 3APQA 2P0GA 3GKKA 2MMZA 1C72A 1Q98A 4OD7A 1F2EA 4K2DA 1QFNA 3ZTLA 1PN9A 2VCTA 2HSHA 3G7IA 4NWYA 4HZ4A 2PN8A 1UN2A 2KUCA 2VCZA 4OFMA 3LXTA 2OBIA 3VURA 3CRUA 4IELA 3LXZA 2LJKA 2H1AA 4TXOB 1X9SB 4JR4A 4L8EA 5ENUA 4KGIA 3TOUA 1GTUA 3LYPA 5DVBA 2NPBA 3FEUA 5ID2B 5ECMB 1WJKA 3JCML 3R2QA 1F9MA 3SBCA 3QCPA 3UBLA 1WPIA 3ZFBA 3W6GA 3I43A 2NTOA 4D73A 4EDZA 1Z3EA 1USBA 4GQCA 4IP1A 2GT5A 5LCZA 1GSFA 4ML6A 3IBHA 3SWLA 1ERTA 3ZMKA 4HQSA 3FR6A 3M1GA 4ZB6A 3E9JB 3U5RE 1JLWA 2VL9A 1X9MB 1YDKA 3LQ7A 1SK0A 1U6TA 2OACA 2YANA 2H6XA 1PKWA 2DJ3A 3TKSC 2HYXA 3NZNA 2QGVA 3ME8A 3H8QA 2G2QA 2WS2A 5ABRA 3LORA 5B8BA 1PSQA 3N5OA 1TU7A 4EVMA 2DMMA 2CX3A 3QOUA 2E0QA 2EIOA 3HJOA 5G1LA 5G5EA 1K0BA 1G6WA 4OMVA 1TI3A 2YV7A 2VAFA 3GHAA 1TK8B 1X9WB 3EINA 3DVXA 4TR1B 1B8XA 2BJXA 5FWGA 2XPDA 2OKAA 2HFDA 2B3SA 2H66A 1FW1A 4EO3A 1V98A 2ON5A 1OC9B 2R5GA 2DJ0A 1Y6EA 3IAS2 1V40A 3VPQA 3F63A 1WWJA 4N0VA 2IWTA 3M3MA 2AAWA 1A24A 2LQQA 3ZL5A 4YQVA 5CNWA 4YQUA 5EVOA 3FK8A 2AYTA 4MZCA 1GSQA 5DQSA 4V2MA 3PINA 1M7TA 5D9TA 4NMUA 1UC7A 2HNLA 3QMXA 2LSTA 3GKNA 2NVLA 1GRXA 5KEJA 5F8BA 4G10A 4MH2A 2LJRA 1MD3A 3DYRA 4V2LA 5IMAA 3Q74A 1A8YA 2VIMA 3F3QA 3GL5A 1SENA 1B4QA 3QDNA 5E59A 5AN1A 2H74A 5JWQB 2HSYA 4N30A 5KN0A 1AQWA 4PGTA 2E7PA 1AQVA 2BTOT 2IMKA 2O7KA 4TR4A 4N0ZA 3EC3A 1O85A 3LGCA 3IE3A 2DC5A 2PGTA 5DAKB 5D9WA 1PQNA 3RHCA 3CMIA 4MF6A 1PL2A 2VL3A 5J5NA 4JBBA 1B4PA 1CQGA 2L4QA 5A4WA 5IO0A 1FB0A 2O87A 5IQYA 3AY8A 2G0FA 5GAND 2KP2A 4G19A 1GNEA 4OCEA 2FCHA 4TOPA 1A0FA 2MMAA 3CTGA 1TRUA 3L9UA 3HA9A 2FLSA 1WRYA 4F0CA 1NW2A 1ERWA 4WBRD 2VUPA 5HQPA 4MPGA 3IPZA 2FWFA 1PX6A 3UEMA 3WD6A 1EGOA 1O6JA 2CZ2A 1XOAA 3CRTA 3P7XA 2X8CA 2GSSA 4TXVA 2WULA 1VF2A 1K0DA 5ECIB 2PVOC 2GS3A 2YNXA 2HXKA 2CVKA 4LL4B 3VK9A 1M9BA 1A2JA 2K6VA 4IP6A 5E4WA 1ERUA 1XXUA 3ME7A 2IFQA 2Z9SA 1UA5A 2F9SA 4XTSA 4PURA 1GTAA 4NHZA 2YN1A 3C71A 3QAGA 4I2TA 1YEXA 5IOXA 3M8NA 5IMDA 2C4JA 3C1SA 1SL0B 1OVNA 1M2DA 4RUVA 1TU8A 3QFBC 2XBIA 3US3A 2H0HA 4GXZA 1SKSB 1GLPA 3GTUA 5D9VA 2EIRA 4K7NA 2IL3A 4IN0A 4KA0A 4TVEA 4PNGA 2PBJA 1XFLA 2FGXA 3KM6A 2C1YA 2PPTA 3TRXA 1TRVA 4BVXA 5H5RA 3F4RA 3HKRA 3Q18A 4O5RA 1OYJA 2IN3A 1ABAA 3DGQA 1TDIA 3HCZA 3E3EA 1V57A 1J9BA 2XPEA 3IV4A 1XVWA 5C00A 1OE8A 3TCOA 1I9DA 1QQ2A 3HXSA 1THOA 1XWGA 4RI6A 2YJ7A 1EV4A 2V6KA 3O6TA 1WOUA 2HRNA 3KMNA 3KTBA 2AB6A 2B1KA 4NAXA 3GIXA 1SJ6A 1YEPA 17GSA 2DJKA 2FWHA 3RDWA 3FYGA 4KNDA 2H6ZA 1PA3A 1K3LA 1LBKA 1SJIA 4F82A 1XOBA 5GZZB 3LG6A 1ZL9A 2D2ZA 2IMIA 2RIIA 2NBSA 2H6YA 5JCUA 3BCKA 2C8UA 3GNJA 2XC2A 2WDUA 4ECBA 1GTBA 1AQXA 1XW9A 4HUAA 1V9WA 3U6VA 4K0GA 2O8VB 4IBPA 5IMCA 3QAVA 3KH7A 3CXGA 3KGKA 1DBYA 2GZZA 3DRNA 5G2ZA 2I81A 2R2JA 3O76A 5HR0A 2DJ1A 2TIRA 1MEKA 4P3YB 3GX8A 4ZIJA 3ZITA 4JZQA 1TI1A 4MCUA 4PQIA 1K0AA 4IW9A 3RPNA 3GFKA 1SKRB 5C04A 3QD9A 2YPMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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