5IMZA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f7
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 51
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imzA00
1X9SB 11GSA 3QAGA 2LRTA 3FZ9A 4NHWA 4NWYA 3TCOA 1AIUA 3UARA 1MDIA 1YQ1A 2GZYA 1IYIA 1SJIA 5IM9A 5ECIB 5CRHA 2CX4A 5DJLA 2HSYA 1B4QA 1XOAA 2PPTA 3RHCA 2LJKA 3FKFA 3GTUA 1X5DA 3GA4A 2NPBA 1XWBA 5B7CA 1OE7A 3VPTA 1K3OA 4MPFA 4GTUA 3IXRA 2C1YA 4XHMA 2DMMA 2L6CA 1V2AA 10GSA 4TKYA 4IJIA 2F51A 1OVNA 2FCHA 3ZRDA 5D8IA 4TR3A 1ABAA 4QQ7A 3Q19A 1NM3A 4OFNA 4DSQA 2F3MA 1ST9A 1F2EA 2DJKA 1SJZA 2XHFA 1Z6NA 2XBQA 3H79A 4XTSA 3E3EA 2H0HA 3FW2A 5A4UA 2B7KA 1GTIA 5JWOB 2H75A 5CYYA 5GSSA 1Z6MA 2ALBA 5CP1A 4GQCA 1O8XA 4X0XA 3BJ5A 1T4ZA 3RBTA 5GAND 3F4SA 5EPFA 2C0GA 3TB2A 4MF5A 4ACSA 1EOHA 1HD2A 3WGDA 3DD3A 2MZCA 2HI7A 4RI6A 5JWRB 1M9AA 4KUNA 5D9TA 1GULA 3FR9A 4ECBA 1M2AA 1AAZA 1FHEA 3VWWA 1IYHA 6GSUA 1V40A 4H86A 4ZL8A 2V32A 4MMMA 5C00A 2EIOA 5DVBA 3U6VA 3WT2A 2GTUA 3ZFBA 2OA7A 2X64A 2C80A 4PGTA 4TXOA 3EMPA 1OC9A 1TRVA 2QC7A 1MDJA 1EEJA 4K6XA 1GUMA 5J9CA 4G10A 1TP9A 5H5QA 4JRRA 5ECSA 3JCML 2E2GA 2MBTA 3RPNA 5ECPB 3QD9A 4L0WA 2VIMA 3I6AA 4GWRA 6GSYA 3GYKA 4F0CA 4PURA 5J9BA 4JBBA 2L5LA 5IMAA 1KNGA 2CQ9A 4MJCA 1U6TA 2EC4A 3LORA 1XWCA 2H72A 2H76A 1EV9A 1DE1A 5E4WA 3BBYA 2IMFA 1NW2A 3ERWA 5DALB 4ZB6A 6GSSA 1T8EB 2GQKA 2VL2C 1S3DA 3L0HA 1URMA 1M7TA 3GKNA 4LMWA 3RDWA 2VD0A 3CRTA 1ERVA 5JWQB 3QR6A 1JZRA 1XW5A 1G0TA 2DJ0A 3BD2A 2K6VA 4I2UA 1WJKA 3IK9A 4HS1A 1OC8A 4ZILA 3FR3A 1GSSA 5G5EA 2OKAA 1TU8A 4N0VA 4I97A 1R5AA 1GSQA 2CZ3A 5JCUA 1Z7PA 1XWGA 1TOFA 1X5CA 4MDCA 5F8BA 4RUVA 1VRSD 2I9HA 2Z9SA 4YQMA 1YZXA 8GSSA 4E8HA 5DQSA 3A2XA 3G7JA 2AV4A 3GURA 4OCEA 2O89A 5ENUA 2MMNA 1GTUA 2V6KA 5FT3A 3TRQA 3L4NA 1ZMAA 4POBA 4J56E 1ZOFA 1X9MB 3FRCA 1BJXA 4OO5A 1TK5B 4PXOA 2L6DA 1XVQA 4IP1A 5IO2A 2VO4A 4FIWA 3TRXA 3F63A 4KH7A 2LTKA 3HZ8A 4D73A 2K8VA 2YANA 4EVMA 4BVXA 2PN8A 3GFKA 4OMVA 1SENA 2H70A 3WD6A 1X9WB 3KJYA 5ECQB 1TRUA 1MTCA 1GSUA 5ECOB 1H75A 1BG5A 3DVXA 2KOKA 4KDYA 3ME7A 1GTBA 4WF4A 3HVSA 4ZBBA 3UVHA 5IIZA 2YN1A 3G7YA 4EF0A 2WULA 5HFIA 2P0GA 4ML6A 4XS4B 1FAAA 3LWAA 1LBKA 4ZL9A 3W8JA 2R4VA 1H4OA 3HVVA 1B9YC 1WE0A 3IR4A 3GMFA 2H6YA 3EMXA 2OJLA 5ID2A 3WGEA 2PUKC 4FYBA 1O8WA 5HFGA 3HYPA 2JADA 3ZZXA 2GSRA 1BAYA 4IELA 1PA3A 6GSXA 2EIQA 3TOTA 4KDXA 4KGIA 4EXJA 2VD1A 5IMDA 1KBNA 1XXUA 4TVEA 1VGLA 2LRNA 3L9VA 2F9SA 2V1MA 2QKEA 1W89A 4O32A 5IPGA 5GZZB 4GQFA 3RPPA 2KLXA 4I6XA 2IIYA 2KUCA 1AQXA 1A2LA 4IBPA 3FK8A 4KAEA 4KE3A 2CVDA 2TRCP 2L57A 5A4VA 4CW9A 1WWJA 3ZLPA 2VCTA 3LSZA 1PKZA 2RM5A 2F8AA 2N5BA 3MDKA 2DJJA 1GNWA 3OR5A 1TU7A 2J23A 2P5RA 2LEGA 1JLVA 1XW9A 4HZ4A 1Z5YE 3D22A 4ZB8A 3A5WA 1AQVA 1QUWA 1SK0A 3DXBA 4ISDA 3CTFA 1EP7A 2YWNA 3MSZA 2WGRA 5ELAA 1SJ6A 2N5AA 3GIXA 5FHIA 1SD9A 3TJJA 3IK7A 3VURA 3ZIVA 1G7EA 2ES7A 3APSA 4F0BA 3VI7A 2DMLA 2QSIA 3TJKA 2P5QA 3G9BA 3PINA 4EO3A 1K3YA 3HKRA 4YH2A 1FOVA 2C0DA 3VPQA 3CYNA 4K2DA 2FD3A 2IMDA 4NV2A 1TRSA 4GRFA 5D73A 3D6IA 4MF7A 1TK8B 4E8EA 1S3CA 2A4VA 4F2IA 4KCAA 4KX4A 3LGCA 2HFDA 2FA4A 4KSMA 4OFMA 3D5JA 3J7Yb 3HZ4A 1WIKA 2DBCA 4ZB9A 3FYGA 5D9VA 1YF1A 1O85A 4TXVA 2VLVA 1FO5A 4TR1B 2ZCTA 4MK3A 1RQMA 2K9FA 2ON7A 3LYKA 1J9BA 9GSSA 4IHUA 4IJ3A 3GX8A 1ZL9A 3IV4A 4DSSB 1Q4JA 4BVYA 2RIIA 2VOCA 4JU5A 4PNFA 3LFLA 1K3LA 3DIEA 1Z9HA 3GN3A 2XPEA 1B4PA 4FO5A 1U3AA 3H93A 2IMEA 1SK2A 1YY7A 1E2YA 1PX6A 2GDRA 4GCIA 4Q5RA 2LJAA 4ZBAA 3I9V2 3QFAC 2L4CA 2FWEA 3IRAA 1OC3A 3HDCA 3ZVJA 2PMTA 4PUFC 5IMFA 1UN2A 2O7KA 2HE3A 4XRDA 3N9JA 5CNWA 1SU9A 2H19A 3IDVA 2FNOA 3HCZA 2KHPA 2K8SA 4CDOA 5DALA 2E2MA 2VL2A 2LQOA 1O81A 1ILOA 1GP1A 1U3IA 3TKQA 1W4VA 3C73A 4ZBDA 3TKSE 2B7JA 1YJ6A 1VF4A 3KM6A 2VCVA 5CREA 4IKHA 3KMOA 4JE1A 5LD0A 1GSFA 2V2GA 2C4JA 3CXGA 2CT6A 3CSJA 2YV9A 1R26A 3A2WA 1EP8A 1G6YA 5HQPA 2FA8A 1KEBA 3KH7A 5C04A 1JZWA 3ZVJD 2IJYA 2LUSA 3BCKA 3US3A 3RAZA 4N10A 3GL3A 1GSDA 5H5RA 3F8UA 5FWGA 2O8VB 1XWAA 2VL9A 19GSA 5D9XA 3VI5A 2CV4A 1NSWA 1TRWA 2KP2A 3QFBC 3R2QA 4TW5A 3ZREA 3IPZA 3QAVA 3WGXA 3GUSA 2LV3A 4F9ZA 4HI7A 4QL9A 4TR4A 1DUGA 5JCGA 3F6DA 2NBSA 4IVFA 2C3TA 4PQHA 4HZ2A 4P3YB 3J7Yk 2HZEB 3M8NA 5B8BA 1E6BA 3PH9A 3UVTA 2AYTA 3UMAA 1K0BA 1T1VA 5EY6A 4POLA 4MZCA 2C3NA 2HT9A 4PNGA 4KSOA 5JCWA 4HEA2 2YP6A 2X8HA 4XS4A 3LXTA 5G1KA 4MJAA 2MMZA 4GLTA 1TKDB 2ZUPA 18GSA 4AJ8A 1B8XA 2OE1A 4LLRA 1S3AA 2BJXA 5CRDA 4RQXA 5KN3A 2B5YA 3GL5A 3GX0A 1A24A 1A2MA 2AHEA 5AGYA 3UIWA 4PUAA 4N11A 3KTBA 3IA1A 1GUKA 1GSYA 3F0IA 1I5GA 5B8AA 2WZ9A 3DRNA 4GF0A 4AF2A 2FY6A 14GSA 5E59A 3MAKA 3DEXA 2FLSA 1M99A 3GTUB 2LS5A 4DSRA 3IBHA 2LSTA 4MP4A 2WFCA 3WT1A 1M0UA 3EE2A 3P2AA 3EINA 1V57A 4WBJA 4K7NA 1NHYA 1V98A 4FYCA 1QFNA 3SBCA 4NMUA 3ED3A 3FY7A 3NIVA 3DMLA 1XFLA 1GLQA 1YF0A 4HUAA 1XIYA 3QDNA 3KP8A 4I2TA 2OACA 5D93A 4XS6A 4KDUA 5IOXA 5AIXA 1Z3EA 2PERA 2H01A 5COHA 1G6WA 4IQAA 1GWCA 2FWHA 4MA9A 2H1GA 1K0DA 2V41A 3VFIA 2LJRA 2H8LA 3H1NA 4LA1A 3L9SA 4JZQA 1UC7A 2JACA 1WOUA 3D4TA 3UJ1A 2X99A 4IS0A 2XBIA 1EV4A 4RQRA 3C1SA 3U5RE 5HR3A 4PQ1A 4MCUA 1EWXA 2N5FA 1U88A 3KMNA 3KTLA 1MD3A 2R6KA 3QMXA 3WYWA 1YEPA 2IN3A 2PBJA 3KZQA 3UEMA 4GSTA 2DC5A 1SYRA 3KGKA 5ABRA 3D4MA 1TI1A 3FZ5A 3DGQA 5ECKB 4HQZA 1GRXA 1TXXA 1QXHA 1PN9A 4I5QA 4ECIA 1Y25A 1FVKA 2BMXA 4TR1A 2J9HA 5J5NA 1SL1B 3ME8A 3NZNA 2H6ZA 4XCSA 4NV5A 1XZOA 1O7UA 2H1DA 2LKUA 1K0CA 1M2BA 5DCGA 5L71A 20GSA 1XOBA 1R5PA 4DSSA 1AW9A 2JSYA 4NHZA 2XPDA 2REMA 3VWVA 1A8YA 3G7IA 3S9FA 4EC0A 7GSSA 2HLSA 3UOMA 1PGTA 2AB6A 1G7OA 3Q6OA 3QPMA 3LG6A 1A8LA 2FGXA 5IOWA 4AJ7A 2DJ2A 3MWHA 1T3BA 5ECMB 2VM1A 2I4AA 2LNTA 2NTOA 1X5EA 3FZAA 1EEMA 1U87A 4L5LA 2B1KA 4POKA 3ZTLA 2JZSA 3LJRA 2GSTA 2GQLA 1F37A 2R37A 3ERGA 4WEYA 4GSSA 2H66A 4HJ2A 3HHVA 3TRPA 2B3SA 1T7PB 4WR4A 3HJPA 2M80A 2X8CA 1SKWB 1T00A 1TK0B 1VF3A 3CSHA 1WMJA 5CRGA 3F4TA 4TN8A 4IGJA 1NHOA 4FYUA 1QGVA 1F3AA 3O6TA 5IMVA 4HDEA 3PGTA 4GSNA 1TI3A 5EVOA 4K7IA 4O7HA 4MF6A 2WRTA 4Z7XA 2L4QA 3C7MA 3KD0A 3CMIA 2H0IA 1Q98A 2GGTA 1JZOA 4WBRD 1MD4A 2PVOC 1X0RA 3APQA 5J41A 5J3RA 5DBQA 2M46A 2YWIA 5AIVA 2VLUA 4KNDA 2HNLA 3APOA 3D21A 3ERFA 1DBYA 3ZMLA 3IHQA 3SWLA 3QAWA 1K0MA 1VF1A 1ON4A 5IPHA 6GSWA 5GAPD 3F6FA 2I81A 1THOA 4ZXGA 5D96A 4O92A 5ECHB 1JHBA 3P8WA 1QQ2A 3W6GA 1EOGA 2VCWA 1AUCA 3IOSA 2PVQA 4K9ZA 3LXZA 2R5GA 4AGSA 5ECLB 2WS2A 1CQHA 2FWFA 4TOPA 2H0GA 2CVBA 3CTGA 2IMKA 3TJGA 1YEXA 2HZEA 2IL3A 4BL7A 5HFKA 2B1LA 4BWQA 2MMOA 2CX3A 1I9DA 5HR2A 1LU4A 2H1AA 4EL1A 1ZGNA 4KW6A 4DEJA 1XPVA 2A2SA 4I8BA 1B9XC 1FG4A 1GSEA 5G5FA 1HNBA 4OCFA 5CAXA 5G30A 4IW9A 3GH9A 3UL3A 4V1Ap 2R2JA 3DWVA 2OE3A 1OAZA 3GNJA 1EZKA 3D0ZA 4IQ1A 2IMIA 2JSZA 2VAFA 3LQ7A 4KA0A 4V1Ag 2PU9C 5KN2A 4Q5QA 2YZUA 12GSA 2HYXA 2MYGA 2YJ7A 2C0EA 1HNAA 1UVZA 1FB6A 3GRXA 4TR0A 2FHEA 2H74A 4OD7A 4IP6A 3HVXA 4WETA 4L5OA 3HJOA 4JR6A 1J08A 1O6JA 3HD5A 5H5SA 22GSA 1O73A 2L59A 2IPAA 3KP9A 5KN1A 4L8EA 2EIRA 3VWUA 3GKKA 1GL8A 4Q5FA 2OBKA 1SKRB 2MBSA 3ZFLA 3VK9A 4EE0A 6GSTA 1N2AA 2GVPA 2H71A 4WXTA 2IFQB 3IE3A 5DAKB 1BQ7A 1A2JA 2GZPA 4K0GA 2VUPA 1SKSB 4RI7A 1M2DA 5J4UA 4EKZA 4MJEA 3KXOA 1MEKA 1OYJA 5CO3A 1K0NA 4DVCA 3IAS2 3CBUA 3TKSC 1F9MA 3M1GA 2YPMA 3EVIA 1R4WA 2D2ZA 5DCHA 4MPGA 1PMTA 1JLWA 5A5KA 2TRXA 2NDOA 3M9JA 1XWKA 3CRUA 1TW9A 5D9WA 1OKDA 2YWOA 2E7PA 1WPIA 4HOJA 2YCDA 2H1BA 5EL8A 2B5XA 1C72A 3UAPA 2YWMA 2YOIA 2P31A 4HJMA 3M3MA 1K0AA 1R7HA 3KH9A 3EURA 5IQYA 3M9KA 1XVWA 4F82A 2QGVA 4LL1B 2E0QA 1ERWA 5DJMA 1N8JA 5IO0A 1GTAA 1DE2A 1BYEA 4WF5A 1BEDA 3Q74A 1ZYEA 2RLIA 2FWGA 2WB9A 3A3TA 2H30A 3I43A 4V2NA 2I3YA 2VCXA 5G2ZA 2GLRA 4CHSA 2V6OA 2F8FA 4BA7A 1VF2A 4IN0A 3L9UA 3A2VA 3ZMKA 2DJ3A 2IWTA 2DLXA 3LEFA 1YKCA 3TKPA 2AUVA 3TGZA 4XRAA 3BOAA 2X8GA 4LMVA 2GT6A 4ILFA 1GUHA 2CZ2A 2NVLA 2O87A 1F3BA 5GSTA 3E9JB 2BTOT 1QK8A 2OE0A 1PL1A 1B48A 2YZHA 2TIRA 2GT5A 3RHBA 2HZFA 1SD8A 4FH8A 1TJDA 3UBKA 2YJHA 3FZ4A 5LCZA 2VCQA 4G2EA 3EWLA 3PR8A 1AQWA 1ERUA 2GSQA 3KIJA 1SL0B 4WR5A 3GV1A 4O5RA 1PKWA 13GSA 4MABA 3EU4A 4F03A 1JZDA 1A23A 3ZL5A 2FUG2 1USBA 5F05A 1TDIA 3QOUA 2G2QA 2H6XA 2VM2A 2A2RA 4MH3A 3O3TA 3IC4A 2RUFA 2B5EA 2ON5A 2KP1A 1GNEA 3GSTA 1TTZA 3ZITA 2DIZA 2GZZA 1PL2A 4MZBA 4NAXA 3ZIJA 4WKWA 1JFUA 3M0FA 3GKXA 1PD21 2C3QA 3HJMA 4HU7A 2H73A 2O85A 2RUEA 1A0FA 5B6MA 4J2FA 4ID0A 1WP0A 1THXA 1WRYA 4NXIA 4TXOB 1OC9B 2DJ1A 2M72A 1LJRA 4MLYA 2OADA 2DSAA 3KEBA 4ULXA 1K0OA 1FB0A 3V1WA 5DDLA 5ELGA 1ZCPA 3GKMA 1EGOA 2HXKA 1RK4A 4EDZA 2PGTA 2B6MA 4PX1A 2LRCA 2CAIA 4OWYA 1AC1A 4YAPA 1CQGA 2G0FA 16GSA 1XW6A 3TDGA 5AISA 4XIHA 1ML6A 1Y6EA 1SK1A 3BCIA 3VWXA 1PRXA 1F6MC 5KN0A 17GSA 4ML1A 1PX7A 4ZIJA 3FR6A 3HA9A 5F07A 4JR4A 5HR1A 4K0NA 3DVWA 2C8UA 1OKTA 1BX9A 2WJUA 3F9UA 3EYTA 2JZRA 4X1UA 2RM6A 3VLNA 4N30A 4MJBA 1FVJA 5IMCA 4G19A 1QMVA 2ZNMA 3E0UA 5HR0A 2AJQB 3EU3A 4YAVA 4GXZA 4L0UA 2GQMA 3N5OA 4YQVA 1V9WA 3TJFA 4NPBA 1A0RP 4G9HA 4HQSA 4BPYA 1ERTA 5KEJA 3I69A 1XBSA 3EC3A 3MNGA 2I1UA 1ACVA 2MMAA 3IAM2 5ECNB 4ECCA 1T4YA 3AY8A 4AJ6A 3QCPA 4Q5NA 1ZYQB 1OE8A 2CA8A 2VL3A 4KB3A 4V2MA 1Z7RA 5ECRB 3CSIA 3HXSA 4YQUA 2L5OA 2JL4A 1HNCA 3DYRA 3TUEA 1SL2B 3HY2A 1KTEA 3C8EA 3Q18A 5G31A 5B6NA 1GLPA 4D73B 4EDYA 3ZYWA 5G1LA 4JEDA 3F4RA 3KCMA 3GHAA 2R3XA 2VCZA 5INYA 2HRFA 2C0FA 3C71A 4MH2A 1XCCA 2IFQA 5DAKA 1AXDA 2YV7A 3LYPA 3UBLA 3C1RA 4OO4A 1PSQA 3FEUA 2HSHA 2WDUA 3L78A 1DSBA 5A4WA 3TKSA 1YDKA 5AN1A 4ZL7A 2CVKA 1SYXA 2WCIA 1HYUA 1EGRA 4XS1A 5DQYA 4LL4B 5CRWA 4ECJA 4TRXA 3K8NA 1GH2A 2LQQA 6GSVA 2LNSA 3FHKA 5ID2B 1MDKA 4POMA 4X43A 4PQIA 4J57E 5F06A 4K7OA 5F0GA 4HU9A 1M9BA 1FW1A 4N0ZA 2CAQA 1HQOA 3F3RA 3H4KA 3TKRA 2GS3A 1RW1A 4QL7A 1YKAA 2VLTA 3GSSA 1PQNA 4MZWA 2K18A 3DKSA 2AAWA 2JZTA 1UA5A 2GSSA 1J0FA 3H8QA 4V2LA 3W8SA 2YNXA 4KCEA 3O76A 4BWSA 4EUYA 5LNKe 3TJBA 3P7XA 3NOFA 2PWJA 1V58A 4OFTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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