5INYA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f8
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 48
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5inyA00
4MCUA 2LKUA 3IC4A 1WP0A 1GH2A 1KNGA 5B8AA 4K6XA 4ZILA 2L5OA 2P0GA 4V2MA 2LRTA 2DBCA 5JWRB 2YOIA 3UMAA 5D9XA 4NMUA 2KHPA 2I1UA 1S3CA 1ST9A 3FYGA 1F37A 1XOBA 2GSQA 4BA7A 1FHEA 1PQNA 4KUNA 4YQVA 2O89A 3HD5A 3IK9A 3VLNA 4DSQA 2P5QA 4IN0A 5IO0A 4ZB6A 3VFIA 3TB2A 3TGZA 5ECLB 6GSTA 3A5WA 2GTUA 2VUPA 4HI7A 4MZCA 4EE0A 5LD0A 2TRXA 3KH7A 2YPMA 2H8LA 5J9CA 2IPAA 1AQWA 4G10A 1K0MA 4AJ8A 1SKWB 3RBTA 5GAPD 3ZZXA 3I69A 1OYJA 1F9MA 5DJLA 1TU7A 4HQSA 1XBSA 4Q5RA 5AIVA 4V1Ag 4N0ZA 5DVBA 1ZYQB 5C04A 5AN1A 3F3RA 2J23A 3RHBA 2A4VA 3O76A 4KCAA 2GVPA 1QGVA 1ZL9A 1W89A 3R2QA 1VF2A 3WT2A 3ZTLA 4AF2A 3QFAC 1GSEA 5ID2B 1FOVA 4MDCA 3UOMA 3LSZA 4EKZA 1BYEA 5KN3A 2B7KA 4K7IA 3IE3A 4WBRD 1GTBA 1CQHA 1YJ6A 4NHWA 5IMCA 2F8AA 3TRXA 5ECIB 5IMZA 1BQ7A 2XPDA 2VCVA 6GSXA 3TKRA 2HSYA 1T00A 3GH9A 4NV5A 1AQVA 3DVWA 5EPFA 1UA5A 1QUWA 4IS0A 1EEJA 3UVTA 4OWYA 1B48A 9GSSA 1F3AA 1TXXA 3CTGA 1FB0A 1FO5A 3F6FA 5CRHA 1SKRB 4D73B 3ZVJD 4X1UA 2DC5A 2M80A 2P31A 3O6TA 4LL4B 1KEBA 5ECKB 2IMDA 3BCIA 4F0BA 3ZITA 4FIWA 1SKSB 2FY6A 2JZRA 1OE8A 1SU9A 2EC4A 2WULA 3PR8A 3S9FA 2K6VA 5F06A 3F6DA 4N10A 1WE0A 5HR0A 2FWHA 1SYRA 2H1AA 5IPHA 5EL8A 3GSSA 4IP6A 3UL3A 3NZNA 6GSSA 1FVKA 1N8JA 2CZ2A 2VL9A 1OVNA 1YY7A 2YWNA 4GSSA 3KZQA 4OO4A 2B6MA 2YWOA 1PN9A 2DJJA 2IFQA 4KA0A 3APSA 5CYYA 4PNFA 3P90A 4XS1A 5ECNB 1ZOFA 4ZBDA 4V2NA 3IHQA 2ES7A 1RW1A 4F0CA 1BG5A 3HJPA 3TKPA 3CTFA 2D2ZA 4J56E 2DJ2A 5G2ZA 3BOAA 1Q4JA 4QQ7A 4Q5QA 22GSA 4K0GA 2C0FA 4E8EA 3HVSA 4JRRA 3TKSA 5ABRA 3CYNA 2VCZA 4JR4A 1TU8A 4I2UA 1V2AA 4XIHA 5AGYA 1YEPA 2AHEA 3D21A 8GSSA 1YZXA 2VLUA 3KJYA 4HU7A 1V40A 4POKA 3GV1A 3UEMA 4EDZA 2H19A 4K2DA 4NXIA 1LJRA 1DBYA 2PGTA 1WJKA 4GQFA 1SENA 2H0HA 2H6XA 2VCQA 5CO3A 3O3TA 3WGDA 1K3OA 4K7OA 5IM9A 4NWYA 3OR5A 4JBBA 1TW9A 1GSYA 3HVVA 2MMNA 1OC9B 2DLXA 5D8IA 1TI3A 1JZDA 4XS6A 1U6TA 4KB3A 2HT9A 2C0GA 3L9SA 1K0DA 1XWKA 1XW9A 3L4NA 3M9KA 1O7UA 4ZL9A 2IL3A 4RUVA 2IMIA 1GNWA 1AUCA 2CX4A 1TK0B 3GTUB 2OA7A 4K0NA 2VL2C 1TOFA 2BJXA 4ECCA 3BD2A 4ZIJA 1Z6NA 3DKSA 2RUEA 3ZREA 4L5LA 5HR3A 1ML6A 4ECBA 4DVCA 2V32A 5B6NA 2H0GA 2DJ3A 2RUFA 2G0FA 5IQYA 2WZ9A 4IBPA 3EURA 5KN1A 4GSTA 5AIXA 4XTSA 2IMFA 4RI6A 1YQ1A 2QGVA 4DEJA 5DAKB 5IPGA 2DJKA 1SJIA 2IJYA 3GNJA 1M2BA 2A2RA 3TKQA 2N5AA 5JCUA 5D93A 3GN3A 2H6ZA 4KAEA 1XWCA 1SK1A 2CZ3A 1BAYA 4HZ4A 3US3A 4MA9A 2YANA 4AJ7A 3FR9A 4LL1B 1G0TA 2IN3A 2V1MA 4ZBAA 1V58A 4I6XA 2XBQA 3H1NA 3D0ZA 2H72A 3IXRA 3KMOA 5IOWA 1SL1B 4OCEA 1NHOA 4IQAA 1QQ2A 4AGSA 3GL5A 3EMXA 1XVWA 1YF1A 3I9V2 1GL8A 2JACA 3FHKA 3FZAA 5F8BA 4G9HA 3VWUA 4CDOA 2YJHA 1K0NA 3IAS2 3M8NA 2HLSA 4XS4B 1T4YA 5B8BA 1YKCA 3IK7A 3SWLA 3MDKA 4GSNA 1R5PA 1TKDB 5DCGA 1ACVA 2F9SA 1JZWA 1OKDA 4QL7A 3ERFA 2WGRA 3KD0A 4FYUA 3ERGA 3UBLA 3Q18A 4DSSB 4TXOB 2B7JA 1M2DA 4TVEA 3WD6A 1TRWA 2PU9C 1A23A 1E6BA 2ON7A 4QL9A 3J7Yk 3M3MA 1A8YA 2DMLA 2K8VA 4JEDA 2KP1A 3LXZA 4K1FA 2O7KA 5H5RA 2I3YA 3W8SA 2F51A 1K3YA 3VI7A 20GSA 1O8XA 3F63A 1OC3A 4KDUA 3QAGA 4OFMA 2PN8A 4H86A 3EYTA 1ZYEA 2OJLA 1JLVA 3M1GA 1CQGA 2GQKA 1XPVA 4PQ1A 2H0IA 3C71A 1W4VA 3EMPA 4MK3A 4KGIA 3HJOA 4ZL7A 2H70A 1GNEA 3CMIA 1XIYA 2NDOA 4WKWA 2DJ0A 1EV4A 2VLTA 3HVXA 3QFBC 3QR6A 1E2YA 4OD7A 4PNGA 4L5OA 18GSA 2EIQA 2F3MA 2H74A 4K9ZA 1WRYA 4RQXA 4LMWA 3H93A 4HU9A 4TR1A 4BPYA 1U88A 1QK8A 4ECIA 3LG6A 1GUHA 7GSSA 1GTAA 5J3RA 3FZ4A 2L5LA 1PX6A 3GMFA 1A24A 2GDRA 2B1LA 3QMXA 4POBA 2LJAA 3DWVA 3GL3A 4L0UA 1ERWA 3WGEA 1ZZYA 1G6WA 1XXUA 3F4RA 2PUKC 4MJAA 4MP4A 3VPTA 4TXVA 1TRUA 3TJGA 1FVJA 1X9SB 2JL4A 1R4WA 2R2JA 3F3QA 1F6MC 2H6YA 3DRNA 2KP2A 4OCFA 1IYIA 5JWQB 5ECHB 3CSHA 4KX4A 2HE3A 2N5BA 1EGOA 3TCOA 1EP8A 3TJFA 5JCWA 3IA1A 1TDIA 4KSMA 2YP6A 2VCWA 1M9AA 2WRTA 2CAIA 2CA8A 2C3TA 5GAND 2BMXA 2XC2A 2YWIA 5CAXA 2HRFA 5DBQA 3DMLA 5DJMA 1SD8A 1I5GA 1OAZA 2GS3A 2WB9A 2GZYA 3CXGA 4N30A 2C0DA 1U3IA 1PD21 3VWXA 3HA9A 1YKAA 5E59A 3HZ8A 3KM6A 2LV3A 4J57E 4XRDA 3TOTA 3P8WA 2X8CA 4KDYA 5EY6A 2M46A 2FD3A 1TK8B 4O5RA 4PUAA 5HFIA 2C3NA 1AW9A 2YJ7A 4EUYA 3GH6A 4F9ZA 3LORA 2VCTA 4IHUA 3UIWA 3UVHA 5IOXA 1XW5A 3TRQA 1MEKA 3NOFA 1G7OA 1T3BA 5F0GA 1M99A 4F03A 3RHCA 1X9WB 1G7EA 5DALB 1XZOA 2AYTA 1T4ZA 4IGJA 4WETA 5EVOA 3VWWA 2RM5A 3D5JA 3C73A 5ECMB 2R3XA 2DJ1A 5COHA 5DCHA 2AUVA 2YCDA 4LMVA 4EF0A 3FZ9A 2CVBA 3KCMA 3F0IA 3PGTA 5ECQB 3LGCA 3D6IA 1MTCA 2C4JA 11GSA 1Z3EA 3KEBA 4X0XA 1B4QA 3P2AA 1F2EA 3IR4A 1O85A 1M7TA 3RPPA 5C00A 5DQSA 4FYBA 1EP7A 2JADA 2PVQA 2FWGA 4X43A 1BJXA 1ERTA 3APQA 1H4OA 2OADA 3WT1A 1KTEA 4GLTA 2N5FA 3IDVA 5CNWA 3VWVA 4HJMA 2GQMA 4IKHA 1O6JA 4JR6A 2YV9A 2HZEB 2C8UA 3DGQA 2Z9SA 3EC3A 1X9MB 3N5OA 3KTBA 1X5CA 4EXJA 3WYWA 2AAWA 2R5GA 3C7MA 1XWBA 2AB6A 5GZZB 4I8BA 2L57A 4V2LA 3KIJA 2IWTA 4PXOA 4YQUA 3M9JA 1O81A 1XVQA 4PQIA 2V6KA 3ERWA 1Z7RA 3IV4A 2LTKA 5J9BA 2JSZA 2AJQB 3E3EA 4F82A 4WBJA 2K8SA 4G19A 4GRFA 1HNAA 4ZB9A 4WF4A 2VM1A 2I81A 2JZTA 2OACA 1MDJA 3QCPA 3C8EA 2DIYA 1TI1A 2AV4A 4CHSA 10GSA 3VI5A 4HOJA 2X99A 3MAKA 4OFTA 4O92A 2DSAA 3IPZA 1OC8A 3APOA 3LQ7A 1J0FA 1YEXA 4WR4A 5JWOB 4MMMA 2R37A 1C72A 4GXZA 2FLSA 5ID2A 4XCSA 2FA8A 5ELAA 1A2LA 1EOHA 2OBKA 1THOA 2GZZA 3ZMKA 2H30A 2HZFA 2TIRA 2NBSA 2HXKA 4YH2A 2C3QA 3GKXA 1Z6MA 1T1VA 4PX1A 4O32A 12GSA 2FUG2 5CREA 3GA4A 2HRNA 2HYXA 19GSA 1OE7A 5GSSA 4ZB8A 1USBA 2EIOA 1WPIA 2K9FA 3FR3A 3F9UA 1B9YC 3HKRA 2CT6A 2O87A 1YDKA 1UN2A 4GTUA 4D73A 2RIIA 2C1YA 4IJ3A 2C0EA 2B5XA 4KW6A 3BCKA 1WMJA 1T7PB 3L9UA 1R26A 4JU5A 3U6VA 2VAFA 3UBKA 2HSHA 3L0HA 5G30A 1YF0A 2OKAA 1EV9A 4ILFA 2E2MA 1PKWA 2LRNA 3L78A 3ZVJA 1TJDA 1N2AA 4E8HA 3TJJA 3VPQA 3JCML 3A2XA 3FW2A 3ZFLA 4CW9A 1GUKA 4NHZA 3VURA 1K3LA 3G7YA 1WOUA 1ZCPA 3LJRA 3EVIA 1O73A 1QFNA 2H1GA 1R5AA 1JFUA 6GSVA 3HYPA 4AJ6A 2GGTA 3CRUA 4JZQA 3V1WA 1PL2A 2R4VA 2HI7A 1SK0A 2VD1A 5D9WA 4EO3A 2IIYA 1GULA 1URMA 3L9VA 1AC1A 1G6YA 4ML6A 3GX0A 1GSSA 1VF1A 2WFCA 3FY7A 4KCEA 1X5DA 3P7XA 3AY8A 3BJ5A 5ENUA 1OKTA 2MMAA 1VGLA 1QMVA 3FK8A 3QPMA 2VIMA 3DD3A 3G7JA 3KP9A 1K0BA 5KEJA 3A2VA 4I97A 4ZL8A 4TOPA 2GT6A 2NVLA 2H71A 2RLIA 2H01A 3H4KA 2FHEA 5JCGA 1BEDA 3F8UA 2YZUA 2PERA 3FR6A 2XBIA 4MJBA 2MYGA 1MD4A 4ID0A 2H66A 1NW2A 2LSTA 1EGRA 5INYA 1K0AA 13GSA 4POMA 3GYKA 3D4MA 4G2EA 4WF5A 3TUEA 3GSTA 3TKSC 1OC9A 4IP1A 4FO5A 5AISA 2IFQB 4MPGA 2DIZA 5ECPB 2GT5A 1K0CA 4GCIA 1FW1A 2G2QA 1ZGNA 2MZCA 4TRXA 2CX3A 2PMTA 1UVZA 3H8QA 1R7HA 4ACSA 2DMMA 3MNGA 3HY2A 3GTUA 2WJUA 4I2TA 5LCZA 4RI7A 3ZYWA 3LYKA 5HQPA 4MF5A 3CSIA 4EL1A 5ECSA 2FNOA 3CSJA 1A8LA 5D9TA 4BVXA 5FHIA 2CVDA 1EEMA 1J9BA 2L6CA 4MJEA 3UAPA 4BWSA 1H75A 1XCCA 1X5EA 1GLPA 1PSQA 1HNBA 2HNLA 2L59A 3GX8A 2JSYA 1SJZA 2GSTA 1HQOA 2LJKA 1ERVA 2REMA 5ELGA 3QAWA 2V2GA 2WS2A 2J9HA 2B3SA 4MPFA 3HHVA 1GTUA 3I43A 1B8XA 5E4WA 4BL7A 2VL2A 1Y25A 2GSSA 1PL1A 4Q5NA 2VLVA 4IVFA 4PQHA 4Z7XA 4WEYA 3PINA 1TP9A 5DAKA 1RQMA 1ON4A 4JE1A 3EINA 2YNXA 3ZIJA 1B4PA 4MJCA 4HS1A 1PGTA 4POLA 2PBJA 4LA1A 1GWCA 4J2FA 2A2SA 3KMNA 2EIRA 1S3DA 1V98A 1M9BA 1TRVA 1X0RA 4IELA 3DXBA 2ZCTA 1Y6EA 3H79A 5FT3A 3RAZA 2VL3A 4ZXGA 3TKSE 3IBHA 2L4QA 2P5RA 2MBTA 5KN0A 4YAPA 5G5EA 2B5EA 1GSDA 3RDWA 1SJ6A 2PVOC 3BBYA 2L6DA 3M0FA 2PPTA 3G7IA 3I6AA 3LYPA 2FWFA 3ZMLA 1DE1A 1AAZA 2YZHA 2LQOA 2H1BA 3ZFBA 2L4CA 4XS4A 5J4UA 2ZNMA 1FB6A 3GURA 3EE2A 3ISOA 3KGKA 5CP1A 3TOUA 2M72A 3QOUA 3FZ5A 2X64A 4TR3A 1I9DA 3LFLA 3W6GA 2YWMA 3ZL5A 1SYXA 3EU4A 1VRSD 5D9VA 3KP8A 2E0QA 16GSA 3GUSA 2C80A 1MDKA 3KH9A 4DSSA 1VF4A 2KUCA 4WXTA 2IMEA 1QXHA 4TXOA 5HR2A 4MF6A 1B9XC 4BWQA 4PURA 1EOGA 1Q98A 1V57A 6GSYA 1BX9A 2H75A 3GIXA 5HFKA 2LEGA 2LJRA 4K7NA 1GLQA 4OO5A 1IYHA 3SBCA 3IOSA 1DE2A 2LRCA 3CRTA 3MSZA 3IRAA 3C1RA 1A0FA 4MH3A 5IMFA 1GSFA 3TJKA 1V9WA 2WCIA 5D96A 4RQRA 1WWJA 2H73A 5G5FA 3FEUA 1JHBA 1F3BA 1SD9A 3Q6OA 4FYCA 1PKZA 1U3AA 1J08A 2JZSA 1HD2A 3EU3A 3A2WA 1S3AA 2ZUPA 5G1KA 5A4UA 2FGXA 3LWAA 1A2JA 2NTOA 5LNKe 3UJ1A 1AIUA 3TJBA 5GSTA 1RK4A 3J7Yb 3PH9A 1EZKA 5B6MA 2MBSA 2MMZA 3ME8A 1XFLA 3EWLA 1SK2A 4TW5A 2QKEA 5ECOB 2FWEA 2ON5A 3KXOA 1GSUA 4GQCA 1UC7A 4MZWA 3RPNA 1O8WA 3A3TA 2VOCA 2VCXA 4DSRA 1LBKA 3HXSA 4NPBA 1SL2B 4N0VA 1EWXA 1GRXA 2GQLA 2LNSA 6GSWA 1VF3A 4NV2A 4EVMA 2YV7A 3GFKA 5A4WA 2MMOA 2E7PA 2HFDA 4ECJA 4TR0A 1WIKA 1PX7A 2YN1A 3ED3A 4KH7A 5D73A 2VO4A 2PWJA 3LEFA 2X8GA 4V1Ap 3Q19A 2KLXA 2OBIA 5IIZA 2O8VB 2OE1A 4PGTA 3QD9A 1TK5B 2V6OA 4L0WA 2GLRA 5L71A 4HDEA 4Q5FA 2KOKA 1KBNA 5J41A 5HR1A 1A2MA 2I4AA 1FAAA 4KNDA 4TN8A 1NHYA 1NM3A 2H76A 4OMVA 1AQXA 2LS5A 1HNCA 4HQZA 5HFGA 1FG4A 1PMTA 1Z7PA 3E9JB 2LQQA 4MZBA 5IMDA 1LU4A 5J5NA 2RM6A 1K0OA 2I9HA 3QDNA 1M0UA 3GKKA 2B5YA 4TKYA 14GSA 2FA4A 4KSOA 3WGXA 4ISDA 4TR1B 2CQ9A 5G31A 2B1KA 4GF0A 3CBUA 4HZ2A 1GUMA 2QC7A 5A5KA 3C1SA 2QSIA 2H1DA 3G9BA 5H5QA 4KDXA 1TRSA 2IMKA 1M2AA 3W8JA 1ZMAA 4BVYA 1JLWA 3HCZA 1TTZA 2ALBA 4KE3A 4HJ2A 4EDYA 1GSQA 1PA3A 1Z5YE 5IO2A 3ZIVA 3DEXA 5B7CA 2E2GA 3GKMA 2CAQA 1XOAA 4LLRA 5DALA 5KN2A 4K8MA 5DDLA 3GRXA 4XHMA 1THXA 2V41A 4F2IA 3TRPA 2CV4A 2WDUA 4GWRA 5A4VA 5CRGA 4N11A 3HDCA 2NPBA 4FH8A 3KTLA 1MD3A 1ILOA 1DSBA 2R6KA 5CRWA 2VD0A 1Z9HA 4YAVA 4P3YB 1NSWA 3GHAA 1XW6A 5ECRB 3ZRDA 3VK9A 3GKNA 3IAM2 4OFNA 4ZBBA 4YQMA 2XPEA 3UARA 1JZOA 1A0RP 4L8EA 1U87A 1GP1A 3FRCA 4IJIA 3D4TA 5F05A 4O7HA 17GSA 3Q74A 5CRDA 2VM2A 1HYUA 2CVKA 2JU5A 2GZPA 5H5SA 2BTOT 3LXTA 1T8EB 5IMVA 4MF7A 4IQ1A 2XHFA 1DUGA 5FWGA 1ABAA 2HZEA 4HEA2 1XWAA 2OE0A 4ML1A 4ULXA 2GSRA 3MWHA 3F4TA 5IMAA 3FKFA 4PUFC 2LUSA 3D22A 2FCHA 4WR5A 2F8FA 3DYRA 5DQYA 3QAVA 4NAXA 3K8NA 3HZ4A 2O85A 4IW9A 4HUAA 6GSUA 1XWGA 4MABA 1MDIA 3N9JA 3ME7A 2X8HA 3F4SA 3DIEA 3U5RE 4EC0A 3TDGA 2K18A 1JZRA 1AXDA 1GTIA 3ZLPA 4TR4A 4XRAA 1PRXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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