5IO0 | Genus

Total Genus 45

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	45
sequence length	157
structure length	156
Chain Sequence	DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus	45
structure length	156
sequence length	157
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2016-03-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5io0A00

1OVNA 3APQA 3F6FA 4YAPA 1F6MC 7GSSA 1H75A 2ZCTA 4JU5A 2JACA 1X9WB 1GULA 3QDNA 2CAQA 1F3AA 4IBPA 3LXTA 1J0FA 5ECNB 3F63A 2DJ3A 4K9ZA 1EOGA 1WP0A 2I4AA 3DRNA 3GKNA 5KN1A 3HZ8A 2KHPA 3IRAA 1FG4A 5H5RA 1GSDA 3GTUA 1ZZYA 4ISDA 3Q19A 5G2ZA 5IIZA 3WGEA 3KXOA 1B9YC 1V2AA 2GT6A 2CV4A 1BX9A 1XXUA 3EYTA 1Z6MA 2LSTA 4KUNA 3TKRA 2CX3A 5JWOB 4H86A 1YKAA 2H73A 2XPEA 4L8EA 4L5OA 2WB9A 2C3NA 4EE0A 1GH2A 4PQIA 3VURA 3VPQA 1HNBA 2B7JA 1OE8A 2IN3A 5ECPB 3GX0A 2FCHA 2YWOA 1X5EA 4GCIA 3TB2A 5HFKA 1EZKA 14GSA 3CRUA 3G7YA 4NXIA 4O92A 4FYBA 3ZTLA 5LCZA 2HNLA 4NHWA 4HS1A 4PUAA 3PGTA 5GAND 5B7CA 11GSA 1UN2A 3M8NA 1VF1A 2LNTA 2MMAA 1GLPA 3NIVA 4O7HA 3KMNA 5IPHA 1XVWA 3RPPA 2IWTA 4OCFA 1M99A 1DBYA 1O8WA 1BEDA 2JL4A 1TJDA 2H76A 3F4SA 4MDCA 2FWEA 2MBSA 3GFKA 1HD2A 4XCSA 2EIQA 4MPGA 1TOFA 2YWIA 1XWAA 3ZIJA 4LL4B 3KMOA 2OE3A 5E4WA 5G1LA 3EMXA 3FR3A 4XS6A 4I5QA 4G9HA 4D73A 2E0QA 2OE1A 2V41A 3M9JA 3IAS2 3P8WA 3UVTA 4ZB9A 1XWCA 1AQWA 3DWVA 2E2GA 4MZWA 1GTAA 5IMVA 1XOAA 2JSZA 1WPIA 4NAXA 2R37A 4KW6A 4NMUA 2MMNA 3GUSA 1EWXA 2CQ9A 1YKCA 1Q98A 2OKAA 3G9BA 1NSWA 1BG5A 2GSSA 4ZBBA 1OKDA 3ZZXA 4X43A 1TRUA 2CT6A 3KCMA 3D22A 1EEMA 4HQZA 1OE7A 2VL2A 4HDEA 1DE2A 2N5AA 3QFAC 3A2WA 1JLVA 4TR1B 4TOPA 3TOUA 2AJQB 5GAPD 5EVOA 3EURA 2V6KA 3KEBA 2GLRA 3IA1A 5D9XA 2XBIA 2GVPA 2NVLA 2ON5A 1TDIA 1MDJA 1X9MB 1SJIA 2C0FA 2X8GA 4MP4A 4WF4A 2DJ2A 3UOMA 4QQ7A 4ZBDA 4IW9A 2HSYA 3NOFA 2V32A 1FB0A 5FWGA 4OFNA 2I1UA 1PSQA 5DALB 1TP9A 1QXHA 1GL8A 1AUCA 4DSSA 2FGXA 2H0HA 2LTKA 1SL1B 2HSHA 1O73A 3DIEA 2YNXA 2C1YA 6GSWA 2C0EA 2OJLA 1TU8A 1SD9A 4OO4A 1BQ7A 1SKWB 4KDXA 3BBYA 1ZL9A 3IXRA 4XS1A 19GSA 1T00A 3TKPA 3OR5A 1ZYQB 5L71A 1JLWA 2CAIA 4HJ2A 5IMAA 4E8EA 5GZZB 2LQQA 4NV5A 2CX4A 1O8XA 4POMA 3ZFBA 1A0FA 1FOVA 4DSSB 5IMFA 1O6JA 3HVVA 4MF7A 3FRCA 5C00A 4IQ1A 4AF2A 1ON4A 2OADA 3HDCA 3TRQA 1UC7A 5AISA 2E7PA 1JZRA 4PNFA 1MDKA 3EINA 4TN8A 4Z7XA 1XPVA 3A5WA 1A8LA 4GXZA 4KSMA 1OYJA 3C73A 1A2LA 1JHBA 3C7MA 4MPFA 1ILOA 3BD2A 1EGOA 2GZPA 2GQLA 3HHVA 1PKZA 4ILFA 3FEUA 1G6YA 5G31A 1BJXA 1VRSD 4KX4A 3N5OA 2LQOA 4MCUA 5EY6A 4CHSA 5ID2B 2TRXA 5JCUA 4G10A 1M9AA 2KOKA 2L4QA 5ECRB 2HT9A 5CRWA 3FKFA 5IMCA 1S3DA 2PGTA 2H1AA 3ED3A 1V9WA 1TU7A 3UBLA 3ZLPA 5ECQB 4CW9A 2FWHA 2AYTA 1UVZA 3KIJA 2X99A 4DSRA 1SK0A 1XFLA 3GRXA 2RIIA 1PL1A 3ME8A 3ZRDA 5JWRB 4ZB6A 2YJ7A 5B8BA 3F3QA 3SWLA 1PMTA 2C80A 2YN1A 4X0XA 3L78A 2OBIA 1EP8A 3M1GA 3ZVJA 2O87A 4IS0A 1GTIA 1SYRA 4X1UA 4LMWA 2LRNA 4WF5A 2DJKA 2LRCA 2CA8A 2AAWA 2RUEA 2GSQA 3HY2A 4HU9A 4ZILA 6GSSA 3GURA 2O7KA 2V1MA 2V2GA 3QMXA 3ZL5A 4IGJA 5F8BA 2IIYA 2YWNA 3D5JA 1W89A 3TGZA 3UIWA 4L0UA 3TRPA 2HFDA 1TRVA 3EE2A 2NTOA 3LQ7A 1K3YA 2H66A 2TIRA 1GWCA 1K3OA 1G0TA 1MD3A 5IMDA 2ALBA 4BWQA 4Q5QA 4KSOA 2VCQA 2FHEA 3TJBA 2H6YA 1Y6EA 4PGTA 2LEGA 3NZNA 2DJJA 5AN1A 3WD6A 2EIRA 2H6ZA 1K3LA 3WT2A 1PX7A 2H75A 3W8SA 3N9JA 1J08A 2O8VB 2HLSA 3ISOA 2GQKA 1WJKA 3Q18A 3J7Yk 1DUGA 3DXBA 2H71A 4JRRA 5GSSA 2GT5A 2VCVA 4Q5RA 3F4TA 4MH3A 2H8LA 1PGTA 2H30A 4TXOA 3FZ9A 2MYGA 3O6TA 5CREA 3LGCA 2A4VA 2GQMA 4JR6A 5JCGA 1YF0A 1GNWA 2L5LA 1OAZA 4TR4A 4I6XA 1AQVA 1TW9A 5DCHA 4JEDA 3FR9A 2IMEA 4K7NA 2KLXA 1S3CA 3EU3A 2IFQB 1R26A 2F9SA 3DGQA 3C1SA 1TXXA 1E6BA 18GSA 1YEXA 5G1KA 1IYHA 3K8NA 4ECJA 3ERGA 1I5GA 1C72A 2WULA 4MJCA 3HXSA 2QKEA 5DJLA 1G7EA 3DD3A 4TXOB 4F0BA 4K1FA 2PMTA 4GSNA 3IAM2 2AV4A 3ZITA 5FT3A 4ID0A 4HUAA 2BJXA 2HE3A 3U5RE 3BCKA 4RQXA 3R2QA 3AY8A 2M46A 1A8YA 4DEJA 1E2YA 3I69A 1OC3A 5AGYA 2DLXA 3FZ5A 3TOTA 4J2FA 1N2AA 1GSUA 3IBHA 5HR2A 2L59A 3MDKA 3P7XA 3APOA 2ZUPA 3VPTA 3FYGA 3L9VA 2CVDA 1OC9A 2KP2A 3MSZA 1CQGA 1O7UA 1XBSA 2QGVA 1FVJA 1R4WA 13GSA 4IN0A 1ACVA 5E59A 3H93A 6GSXA 1R5AA 3H1NA 4MLYA 2LS5A 2X8CA 2HZFA 4K7OA 2IMKA 3M3MA 2B1KA 1KBNA 1PA3A 22GSA 4GQFA 4ZXGA 1XVQA 2H74A 2PBJA 2VL3A 3KD0A 16GSA 2M72A 4PX1A 1GUMA 1OC9B 1K0MA 3VWWA 3HJMA 3RHCA 2C0DA 1AIUA 1Y25A 4HZ2A 5IOXA 2H19A 3QAGA 3QPMA 1QFNA 5D96A 2JZSA 4XS4A 4ULXA 1YJ6A 3QD9A 1M9BA 4ZBAA 1X5CA 1X5DA 5KEJA 1TTZA 2PWJA 2H1BA 4LA1A 2DSAA 4K6XA 4OMVA 3CRTA 3Q6OA 5HQPA 1Z6NA 3TJGA 2VO4A 1GTBA 2P31A 1YY7A 1WRYA 1SJ6A 3I6AA 1MTCA 1Z3EA 3LWAA 3A3TA 2GZZA 3TKSA 2DJ1A 1V58A 2KP1A 1G6WA 2OBKA 1F2EA 5J5NA 5ABRA 5DVBA 1XOBA 2A2RA 4POBA 4TR1A 1ZMAA 4XS4B 2HRFA 3DVWA 3TRXA 1PRXA 1WWJA 3VI5A 4CDOA 2LJKA 4KH7A 4EDZA 1U3IA 1B4PA 1RQMA 5EPFA 2X64A 3H4KA 1K0NA 4XTSA 5J9BA 4I2UA 3KH7A 4WKWA 3CSHA 2M80A 2ZNMA 3KZQA 5IMZA 1GP1A 4BA7A 4NWYA 2NDOA 1AAZA 1T4ZA 3VLNA 1T4YA 1ERVA 1T7PB 2VD0A 5DALA 1SL2B 2PERA 12GSA 4K0GA 2R6KA 3MNGA 3A2XA 4XRDA 1TK8B 2D2ZA 1B8XA 2H6XA 4HI7A 3M9KA 1FAAA 2DIZA 3FZAA 3TJJA 5COHA 1XW5A 4V2MA 3VWUA 4FYUA 4TR3A 3UL3A 1TI1A 1Q4JA 3LYPA 2H01A 4V2LA 2LKUA 5F06A 2FA8A 5CYYA 3FZ4A 2JZTA 2I3YA 3TJKA 3LFLA 1A0RP 2PU9C 5DAKB 3C8EA 1VF2A 1QMVA 4EL1A 3E9JB 4LLRA 1PN9A 5CAXA 3ERWA 1FW1A 2K9FA 1T3BA 5HR3A 3QAVA 4K2DA 5IO0A 3TKQA 4GSTA 4ZB8A 1DE1A 4N0ZA 5HR1A 3WGDA 2RLIA 2F8AA 4L0WA 1K0OA 3KP9A 2TRCP 1YEPA 4AJ8A 5D93A 1NW2A 2QSIA 3LYKA 1O85A 1HYUA 1QUWA 1U6TA 4IVFA 4GRFA 1EV9A 3ZFLA 5ECKB 5A4WA 10GSA 3F3RA 2YV7A 4TRXA 5F0GA 4BVXA 4OFTA 6GSVA 4KDYA 20GSA 5ID2A 4O32A 1ABAA 2HYXA 3F4RA 3FR6A 2B3SA 5H5QA 3IV4A 2VL9A 3TCOA 4EDYA 4FIWA 1EGRA 3FY7A 6GSTA 4N10A 3I43A 3IK9A 1TRWA 4PNGA 3DVXA 1GSFA 3SBCA 3RBTA 3G7JA 2PVOC 1Z7PA 2DIYA 5D9WA 4YQMA 4GF0A 2X8HA 3TKSC 2WGRA 1ML6A 4WR5A 3ZMLA 3GKMA 5ELAA 3VK9A 3C1RA 2LJAA 3US3A 3F0IA 1URMA 2FA4A 4MZCA 3GSSA 2WJUA 2YJHA 3U6VA 2YANA 4JR4A 4HZ4A 2FNOA 3JCML 5IO2A 1EV4A 3G7IA 3ZIVA 2ON7A 2GZYA 5EL8A 2L5OA 4TKYA 2VL2C 1HQOA 3IC4A 1M2BA 3QR6A 4PXOA 4V1Ap 1A2MA 4IJIA 4MK3A 1Z9HA 2YP6A 2CZ3A 5D8IA 3UBKA 2VM2A 4I2TA 1SK2A 4ZL9A 3H8QA 1T8EB 1KNGA 8GSSA 1ZCPA 5G5FA 2VOCA 2C3TA 5D9VA 2OACA 4WBJA 2DC5A 2B1LA 1XWKA 1K0CA 4NHZA 1USBA 1THXA 1GSSA 5CNWA 4OFMA 3LXZA 4ACSA 5HFIA 1V98A 3GH9A 4K7IA 1K0AA 2VAFA 1ERUA 4P3YB 3WGXA 3HYPA 5G30A 2VCZA 4DVCA 4NV2A 5CP1A 2OA7A 1M7TA 1TK0B 2VM1A 5ELGA 2N5BA 3KTLA 4IP1A 4HQSA 2CVKA 3IOSA 2H1DA 2YPMA 2FY6A 1TKDB 5D73A 3QFBC 5H5SA 5CRGA 1WIKA 1LBKA 3F6DA 3RHBA 2H1GA 3UMAA 4F9ZA 1BAYA 5JCWA 1YDKA 2CVBA 2VCWA 1M2AA 3VWVA 5LD0A 4BPYA 1NM3A 2IFQA 5ECLB 5A4UA 4AJ6A 3KJYA 1PKWA 1GSYA 2JSYA 1EP7A 1XCCA 3IPZA 2H72A 5KN2A 4WXTA 3ZREA 3VWXA 3GV1A 1SD8A 1XWGA 3TUEA 4WEYA 1AC1A 4TR0A 1Z5YE 3GHAA 1YF1A 3ZYWA 1N8JA 2MMZA 4HU7A 2A2SA 3WT1A 3UVHA 4AGSA 2IMIA 3W8JA 4JE1A 2YV9A 1R5PA 4RQRA 2HI7A 1VGLA 2RM5A 2GGTA 1TRSA 4Q5NA 3D21A 1SKRB 2FWGA 4TXVA 1JZDA 1PD21 4G19A 2FLSA 5ECOB 2FD3A 3GNJA 2XC2A 4FYCA 3LEFA 1ZGNA 1OKTA 2VLTA 3HCZA 1U88A 3CTGA 3APSA 1M2DA 1SJZA 1TK5B 3LORA 4GQCA 2CZ2A 1GSQA 5CRHA 3EWLA 3KP8A 1FB6A 2L6CA 1GSEA 2DMLA 4O5RA 2RM6A 4ECBA 3GKKA 3IR4A 4N11A 1WOUA 2F8FA 1F3BA 2YCDA 2J9HA 4OD7A 5A5KA 1QGVA 2AHEA 1V57A 3CYNA 2EIOA 2C3QA 4TW5A 2LJRA 4KAEA 5ECSA 9GSSA 3D4MA 3HZ4A 2IL3A 3C71A 1B48A 2GSTA 5A4VA 1A24A 1PX6A 3KGKA 3J7Yb 4ZIJA 4MJEA 3KH9A 2DJ0A 3O3TA 2I81A 3GN3A 2EC4A 3VI7A 1DSBA 1ST9A 2K18A 2JU5A 3HJPA 1HNAA 2GS3A 2HZEA 3W6GA 3GTUB 1NHYA 2B7KA 3GL5A 3DEXA 4KCEA 4RUVA 1JFUA 3FW2A 2P0GA 1ZOFA 4F82A 3M0FA 4MA9A 5F05A 2LV3A 1ZYEA 2AB6A 3KM6A 3LG6A 2VLUA 1F37A 3D6IA 1VF4A 1VF3A 3ERFA 4NPBA 2L4CA 2P5QA 3GL3A 1G7OA 4KDUA 3GYKA 2HZEB 4V2NA 1IYIA 1BYEA 2K8SA 4KE3A 2H0IA 2LRTA 1QQ2A 2C8UA 3CBUA 2PPTA 2R4VA 2VCXA 3RDWA 17GSA 1YZXA 1AXDA 2R5GA 3DKSA 2L6DA 3CSIA 2PUKC 3L0HA 2WZ9A 3MAKA 5HFGA 1WE0A 4EKZA 3HKRA 4F2IA 4BVYA 1SK1A 5DBQA 2WCIA 5ENUA 4POKA 4G2EA 1TI3A 3I9V2 2VD1A 1AW9A 4DSQA 4I97A 3ME7A 4K8MA 1X9SB 1SENA 4I8BA 2PVQA 1EOHA 4KGIA 5IPGA 5J3RA 3P2AA 5J9CA 3QAWA 4QL7A 2H0GA 3GKXA 5B6NA 1THOA 4ML6A 5DAKA 1V40A 1UA5A 3RPNA 4LMVA 1R7HA 1ERWA 1KEBA 2JADA 2J23A 4RI6A 4D73B 3GIXA 5CO3A 1XW6A 1S3AA 4OO5A 4IHUA 3GX8A 1U3AA 5GSTA 2GTUA 4MF6A 5DQYA 2E2MA 1MDIA 3A2VA 4LL1B 3HA9A 4E8HA 2VUPA 2WRTA 1YQ1A 2VCTA 4EC0A 4QL9A 3UAPA 4F0CA 2P5RA 3DMLA 4YH2A 1T1VA 3BOAA 2RUFA 3FK8A 3IK7A 4PURA 1B4QA 2ES7A 3L4NA 3BCIA 3HVXA 4JBBA 2F3MA 3GMFA 2XBQA 3EVIA 3HD5A 3PINA 3V1WA 1LJRA 4FO5A 4J57E 3GA4A 3IDVA 4N0VA 4WETA 2R3XA 5B6MA 2HRNA 2O85A 2WFCA 1O81A 4YQUA 1MEKA 1U87A 1SU9A 2DMMA 3BJ5A 5JWQB 1GUHA 4IQAA 1X0RA 4HEA2 4EUYA 2N5FA 2V6OA 2LUSA 1ERTA 2MZCA 3E0UA 3ZMKA 2IJYA 5DQSA 5AIXA 1LU4A 5IM9A 5INYA 2K8VA 4IKHA 3LSZA 3EMPA 1SKSB 2Z9SA 4GLTA 1KTEA 3TDGA 4N30A 1I9DA 2L57A 2BMXA 4BL7A 1B9XC 3GH6A 2F51A 4KCAA 5KN3A 4GWRA 4RI7A 3CMIA 2FWFA 5ECIB 5IOWA 2WDUA 3D4TA 3Q74A 1WMJA 3RAZA 5LNKe 4IELA 2YWMA 3P90A 2OE0A 5DJMA 4YAVA 1PQNA 4KA0A 1GTUA 2AUVA 3TKSE 2O89A 3UARA 1JZWA 2C4JA 1QK8A 1FO5A 3VFIA 3F9UA 4WR4A 4PUFC 1MD4A 5FHIA 4IP6A 4WBRD 1NHOA 4EVMA 3CSJA 4PQHA 4MJAA 1A23A 2B6MA 5B8AA 4XIHA 4ECCA 1FHEA 4PQ1A 5AIVA 2B5EA 1XIYA 2GDRA 4KB3A 4EF0A 4FH8A 2G2QA 2PN8A 4EXJA 1JZOA 4V1Ag 2YOIA 2QC7A 2MBTA 2IMDA 1FVKA 6GSUA 4AJ7A 2XHFA 2YZUA 3IHQA 1OC8A 4EO3A 5DDLA 3O76A 1M0UA 4MZBA 2G0FA 3E3EA 2C0GA 1RW1A 1F9MA 6GSYA 3WYWA 1J9BA 3EU4A 1AQXA 4HJMA 2B5XA 3GSTA 5DCGA 3KTBA 1Z7RA 2DBCA 1H4OA 4Q5FA 3MWHA 4JZQA 5HR0A 4YQVA 1GLQA 2KUCA 4TVEA 4J56E 2REMA 5F07A 3HVSA 2YZHA 2B5YA 5ECHB 4MF5A 2FUG2 3D0ZA 5KN0A 4GSSA 3PR8A 1A2JA 4HOJA 3L9UA 3EC3A 5IQYA 2LNSA 1K0DA 2H70A 3L9SA 2IPAA 3UEMA 3LJRA 1EEJA 3H79A 2R2JA 1SYXA 2VLVA 3CTFA 4MJBA 1HNCA 5CRDA 4ML1A 4MH2A 3UJ1A 4ZL8A 4OWYA 1XWBA 3IE3A 4OCEA 2K6VA 4XRAA 5G5EA 3PH9A 2BTOT 2WS2A 2XPDA 3QCPA 2I9HA 3TJFA 4POLA 2JZRA 4MABA 1K0BA 1XZOA 2MMOA 4GTUA 5J41A 4K0NA 3ZVJD 1CQHA 2GSRA 1PL2A 1XW9A 3QOUA 4KNDA 1W4VA 3DYRA 4F03A 1GUKA 5ECMB 3S9FA 3F8UA 3HJOA 2NBSA 5D9TA 2IMFA 2NPBA 4L5LA 1RK4A 4ECIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...

5IO0A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations