5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
4MJAA 2YWMA 4IQ1A 2VUPA 3ZFBA 1M99A 4GSSA 3EMXA 5IO0A 1B4QA 2MYGA 4GCIA 4L5LA 3O76A 4ZB6A 3TKSC 1S3DA 2FA8A 2EIQA 4LL1B 5ECNB 2L57A 3HXSA 2J23A 4AGSA 5DAKA 2RLIA 2HYXA 3M3MA 2LJAA 2F8FA 3WYWA 3FKFA 4WBJA 2YJHA 1VRSD 2HXKA 4RQXA 2L4CA 2XBIA 3IHQA 2VLVA 2L6CA 3HVVA 1TRSA 5J41A 3GL3A 2PERA 1JZOA 1YKCA 4AF2A 3VURA 5CAXA 3P90A 2HT9A 1DSBA 4TW5A 4GLTA 3ZMKA 1ERWA 5CRHA 4E8HA 2G2QA 5HR2A 18GSA 5ELAA 5JWQB 4MF5A 1ZYQB 4HQSA 1V40A 5FT3A 3C1RA 5INYA 3US3A 1N2AA 1SD9A 5IPGA 2DSAA 2DJJA 1GTBA 4OMVA 5CRGA 3FZ4A 1A23A 1GSFA 1WRYA 4WXTA 5B8BA 5E4WA 1XIYA 2B6MA 3ZRDA 1EV4A 3MWHA 4MPGA 4N30A 2NPBA 5D9TA 4WR4A 1GL8A 3VLNA 4I5QA 4Q5NA 1BQ7A 2IMEA 3VK9A 1T7PB 2R3XA 3LWAA 4G19A 4XS6A 1U87A 3HZ4A 1K0NA 1KTEA 3E0UA 1K0OA 5GSTA 1XWGA 1ON4A 3SWLA 4Z7XA 5H5RA 3HJOA 2L5LA 1Y25A 2BMXA 1GP1A 1TXXA 3TJKA 3IXRA 4XS1A 1A8LA 3D22A 3KM6A 4PGTA 1KBNA 2CV4A 2M80A 3KCMA 1G6WA 1W89A 2HZFA 1SL1B 4RI6A 4ZBDA 1O7UA 3QD9A 3QPMA 1TU7A 5IM9A 4NHZA 4BA7A 1YY7A 1J08A 1GSEA 2GVPA 2CAIA 4N0ZA 2WGRA 1K0BA 1VF1A 2WJUA 2HLSA 5JCUA 3HJMA 3J7Yb 1K0MA 2VM2A 2OE0A 1GUKA 2H01A 2R4VA 10GSA 1K0AA 2ZCTA 4TXVA 4IS0A 2BJXA 2H73A 4OO4A 1ERVA 3EC3A 4Q5FA 5DAKB 2K8VA 2H1GA 3QFAC 1C72A 1AIUA 2H76A 5ECQB 2H66A 4FYBA 3H8QA 1V98A 5IMFA 2B1KA 5FHIA 2ON5A 1QQ2A 1FO5A 1QFNA 4KCEA 1IYHA 1FVKA 1A0FA 3BCKA 1GSDA 2GSTA 4G10A 3VI7A 4DSSB 2MMAA 1EGOA 1PL2A 1YJ6A 3GKNA 3DIEA 4IN0A 5DJLA 5J4UA 3M0FA 1O8WA 4KCAA 3GFKA 3F4TA 1U3AA 4X1UA 2YV7A 1F3BA 3GUSA 4J2FA 4KW6A 4IELA 1Y6EA 4HS1A 2MMOA 3O3TA 3F3QA 1SJ6A 4KDUA 2IMFA 2H72A 1ZOFA 4G9HA 4V2MA 2BTOT 5IMVA 1Z3EA 4KDXA 4ZL8A 1Z5YE 2YP6A 2N5FA 4QQ7A 3VWUA 1SK0A 3MSZA 4OD7A 2DMLA 5A4VA 1Z9HA 2FWHA 1R4WA 1XVWA 1K3OA 1SJZA 3DKSA 4HDEA 3D21A 1M0UA 3EURA 2EIRA 4IJ3A 2KP1A 1DE1A 1MD4A 1O85A 4K2DA 1GTAA 5J3RA 1H4OA 2WZ9A 3HYPA 3QR6A 5IQYA 2ALBA 1X9WB 2YANA 2M72A 2PVQA 3BCIA 2F9SA 2R6KA 1WPIA 4O32A 2C0GA 4I97A 4EKZA 1X0RA 5DCHA 3GSTA 2DBCA 2TIRA 4GSNA 2HNLA 3DVXA 2WCIA 2IMDA 1JFUA 1PQNA 4GSTA 4ACSA 4K7OA 2DC5A 4EXJA 2JZRA 3F6DA 5G5EA 4PQ1A 3RHBA 3CMIA 4KNDA 3KP9A 2GT6A 3DGQA 2VD0A 12GSA 1OC9B 4YH2A 2DLXA 3EVIA 3WD6A 1X5DA 4X43A 2C0EA 3LYPA 1QK8A 3GA4A 2IPAA 2MMZA 3HHVA 5J5NA 1H75A 4KSMA 5J9CA 4L5OA 4PNFA 2VCTA 5DALB 2I4AA 2K9FA 4HEA2 1TI3A 1Q98A 3IAS2 3KH7A 4MABA 1EEJA 3JCML 2YWNA 3HZ8A 2WFCA 3TJFA 2CA8A 2FNOA 1PD21 7GSSA 4X0XA 4PNGA 1XWAA 2I9HA 1F2EA 4YQMA 4ILFA 1IYIA 4NPBA 4NXIA 2E0QA 1ZCPA 1Z6NA 2GS3A 1XWBA 1UVZA 1TK8B 2PN8A 4MH3A 2OBKA 3UBLA 3C8EA 2DJ0A 3UVHA 1SU9A 3G7JA 2VCVA 2PBJA 3GRXA 4YAVA 1O73A 1XBSA 2VIMA 4GF0A 1T4ZA 2B5XA 1BAYA 4WKWA 3CTGA 1RW1A 4MMMA 3F63A 2B5EA 1TDIA 2I3YA 5DJMA 2HSYA 1TJDA 1U3IA 1XOAA 5IOXA 3LSZA 3UL3A 5LCZA 1MDKA 2V2GA 2FHEA 4N0VA 1OE7A 3U6VA 2NBSA 2LS5A 4OCFA 1F3AA 3OR5A 4KDYA 5DBQA 3KIJA 1TRVA 4KH7A 1FOVA 2CVBA 2OA7A 3GKXA 1O8XA 2VCXA 1GH2A 4O92A 4DSRA 1PA3A 4AJ8A 3C7MA 1K3LA 2GSRA 3DWVA 1GLQA 2VCQA 1A2LA 3CSIA 4IHUA 4MF6A 3GH6A 1M9BA 1S3CA 1PX7A 3ME7A 2KP2A 5FWGA 6GSWA 2JADA 4WETA 2C1YA 3GX8A 4CHSA 3RPNA 2OE3A 2YNXA 4KE3A 4TR3A 3ZTLA 8GSSA 2GLRA 3HVSA 3GIXA 4HU9A 4WF4A 5C00A 1TKDB 4F2IA 1SJIA 2CQ9A 2P5QA 1X9MB 4V2LA 3TKRA 2K6VA 2D2ZA 3KP8A 5HQPA 2QGVA 2RIIA 1URMA 2LJKA 5H5QA 3WGEA 5IMZA 2VLUA 5IPHA 3KMNA 1O81A 4IW9A 1GUMA 4OFMA 4TN8A 4OO5A 1TTZA 3LFLA 4HZ4A 3L4NA 3TRQA 2YCDA 4I2UA 3GMFA 2CVDA 2PU9C 1NHOA 1OC8A 3MDKA 3U5RE 5CRWA 1SL0B 2VM1A 2JACA 3DD3A 3FHKA 3QOUA 4KUNA 3EU3A 2YZUA 1EP7A 3F8UA 1YQ1A 1MDIA 4FIWA 1R7HA 2K18A 4F0BA 5LNKe 3KZQA 4MH2A 2H1DA 3TKSA 1DBYA 2N5BA 4BL7A 4V2NA 4J56E 1AXDA 4ZXGA 3W6GA 4NHWA 5IMAA 3G7IA 1ABAA 2QC7A 4ECJA 5A4WA 4DSSA 2R2JA 2X64A 4POMA 3UIWA 4NMUA 1GULA 5DVBA 3VFIA 4CW9A 5IOWA 2TRCP 1JZRA 1I5GA 4K7IA 3ERFA 4BVYA 3W8JA 3A3TA 4BWQA 1X5CA 2FGXA 5D8IA 2Z9SA 4RQRA 3A2WA 2H1BA 5G1LA 4F9ZA 1XFLA 1PKWA 5KEJA 4EC0A 1GNEA 1RQMA 1AW9A 3E9JB 2DJ2A 2HI7A 2VCWA 2FLSA 1DE2A 2K8SA 5ECSA 3ED3A 3IAM2 4HQZA 3IV4A 3NOFA 2O87A 4YAPA 4K8MA 1HNBA 4PUFC 4KA0A 1VF4A 4TR4A 3ZFLA 22GSA 4D73B 5DQSA 4XRAA 1SKWB 3FEUA 3FZAA 3L9SA 2HRNA 1ILOA 2A2SA 3IA1A 5JCWA 1TOFA 1TRWA 2H74A 1BYEA 4XIHA 2LUSA 2WRTA 1AAZA 3L9UA 3WT1A 3N5OA 3F3RA 1XXUA 2IN3A 2GQKA 2WB9A 2F51A 4LMWA 4MLYA 3APOA 4ML1A 3DMLA 3GH9A 1AQXA 5CO3A 3CSHA 4MZCA 5G5FA 2KOKA 2ZUPA 2AB6A 1OC9A 2NVLA 3QCPA 1GNWA 2GQLA 4ECIA 4LMVA 4N11A 1BEDA 4LL4B 4OFNA 4K7NA 1Z6MA 1JHBA 1NHYA 2KHPA 4EDYA 3KXOA 2JSYA 3RBTA 3EYTA 1XWCA 1EOGA 3PH9A 3C73A 5DALA 4K0NA 1K0DA 5EVOA 2L6DA 13GSA 3ZYWA 2VL2C 2MBTA 3TDGA 2WDUA 3GL5A 2H19A 2NDOA 4G2EA 1GRXA 1WWJA 1MEKA 2FWGA 1T1VA 1E6BA 1SD8A 1A2MA 1AQVA 2KLXA 4OCEA 3DEXA 5EY6A 5F07A 4ZB9A 3WGDA 1EWXA 3E3EA 2M46A 3ZZXA 3DYRA 3RAZA 2ZNMA 3PINA 2JSZA 6GSSA 1THXA 2R5GA 1FG4A 1LJRA 2CZ3A 3VPTA 5L71A 1Z7PA 4ZBAA 1LU4A 2YPMA 3I69A 3KTBA 3CXGA 3EINA 3LXTA 1HD2A 2X99A 4ML6A 4RI7A 3FK8A 3L78A 4K9ZA 1PSQA 1ST9A 3FZ9A 3I9V2 5AGYA 2E2MA 1GSSA 1SYRA 3BBYA 4NV2A 4TRXA 2O85A 2V41A 1WOUA 3IRAA 3LGCA 19GSA 1FAAA 4V1Ag 4FO5A 1UA5A 2AV4A 2OADA 3A5WA 1FB0A 2H0GA 6GSUA 4XRDA 2OJLA 1NSWA 2GDRA 2VAFA 4TOPA 1GSYA 1V58A 2VL9A 3UAPA 2CT6A 4ZL7A 4Q5RA 1CQHA 1XZOA 17GSA 2GQMA 3TJJA 4JR4A 3IC4A 1FVJA 1EP8A 2GGTA 2LSTA 4FYCA 5CREA 5B6NA 2C0FA 3QDNA 4OWYA 3ZMLA 5ECKB 2H71A 4RUVA 5D96A 2FUG2 3CYNA 5ECRB 5ABRA 1Z7RA 3M9KA 5ECIB 1YF0A 1QMVA 1R5PA 4ZILA 1TW9A 4LA1A 3QAVA 4ECCA 2NTOA 1XW9A 4MJBA 5JCGA 3D5JA 2AHEA 1XWKA 1XCCA 2YN1A 4IKHA 1THOA 1WP0A 6GSTA 5HFGA 2B7KA 3TJBA 5F06A 2HFDA 3APQA 2C3TA 6GSYA 2KUCA 2RM6A 1ERUA 2H1AA 4MJCA 3FZ5A 2H8LA 5AN1A 4AJ7A 2VCZA 1M7TA 3IK9A 2YV9A 2OKAA 2LQQA 4K6XA 6GSXA 2EC4A 4GQCA 2JU5A 3QFBC 3GNJA 1PRXA 3GN3A 4KX4A 1G7OA 4HJMA 5GSSA 3N9JA 4EVMA 5D9VA 1MTCA 1O6JA 4IP6A 3HDCA 4ISDA 5H5SA 3W8SA 1B8XA 1F37A 2HRFA 1B4PA 3UJ1A 14GSA 2YOIA 2LNTA 5EL8A 3APSA 3UOMA 5ECHB 1QXHA 1A8YA 16GSA 4JU5A 3DXBA 1SKSB 3NIVA 4MDCA 2FY6A 2GT5A 5GZZB 3GKMA 4E8EA 1HYUA 4EE0A 2O7KA 2IL3A 3BJ5A 3QAGA 1TP9A 1SENA 3H1NA 3AY8A 5IMDA 3F4RA 1OKDA 1PN9A 5KN1A 2DJ1A 3M1GA 2VL3A 3NZNA 3I43A 3FRCA 5A4UA 1KEBA 1B48A 4GRFA 2F8AA 1MD3A 3KH9A 1J9BA 3C71A 2LTKA 4IQAA 3ZLPA 4I2TA 2C4JA 3WGXA 4ECBA 2IFQA 5HR3A 2LEGA 3GTUA 4N10A 2RUFA 2EIOA 2AJQB 1FHEA 1CQGA 4ZBBA 4EL1A 3TRXA 1NM3A 4HI7A 1EOHA 4MPFA 3ERWA 4K0GA 3ZIJA 1KNGA 5IIZA 3QMXA 2LJRA 2GSQA 3EMPA 2P31A 1NW2A 1A24A 2H6YA 5KN2A 4KAEA 4D73A 3H4KA 5AIXA 4HZ2A 3O6TA 1T8EB 2OE1A 2JZTA 3EE2A 3KJYA 2L59A 2HSHA 4TR0A 5ECMB 4JR6A 3HA9A 3HCZA 1W4VA 4XTSA 2RUEA 3MAKA 4KSOA 3UMAA 2B1LA 4J57E 2P5RA 1TK5B 5DCGA 4PXOA 3P2AA 4IGJA 5IMCA 4MZBA 3D6IA 4PQHA 1G7EA 3A2XA 4F03A 3CBUA 3VWWA 1T4YA 1N8JA 3BD2A 2VLTA 2XC2A 2YWIA 1GSQA 2H6ZA 5JWOB 3FY7A 3RDWA 3IR4A 1R26A 4BPYA 1A2JA 4L8EA 1JLVA 5DQYA 1V9WA 1ZYEA 1EGRA 3D4MA 1K0CA 1YEPA 4GTUA 2CX4A 4NAXA 1U88A 4PQIA 5HFIA 5JWRB 1PKZA 2HE3A 2V1MA 1V2AA 4EUYA 4TR1A 6GSVA 3FW2A 1U6TA 3L0HA 3Q18A 1M9AA 2E2GA 3DRNA 4MJEA 4CDOA 3GV1A 3UVTA 4KB3A 4DEJA 2WS2A 2JZSA 3GX0A 4IVFA 1K3YA 2LRCA 5ECOB 3IK7A 3EWLA 2CX3A 4ID0A 3TKQA 3GSSA 2IFQB 2V32A 2HZEA 1JLWA 3GTUB 1V57A 2O89A 1R5AA 1T3BA 4YQUA 1S3AA 3G7YA 5A5KA 2DMMA 3F9UA 5G30A 5AISA 2CVKA 5J9BA 3Q6OA 2FWFA 2J9HA 3IPZA 4QL7A 1OE8A 4MA9A 3VPQA 1ERTA 3GYKA 4PURA 5B6MA 1USBA 2MBSA 4DSQA 2WULA 3FR9A 1UC7A 2B3SA 2MZCA 2LKUA 2H75A 4HU7A 1HNCA 5ELGA 1TRUA 1OVNA 3HVXA 1XOBA 3GURA 3ZREA 4MK3A 3V1WA 2PVOC 1A0RP 2I81A 3M8NA 1ZGNA 3VWXA 1EZKA 3ZL5A 1F9MA 2IMIA 20GSA 4TKYA 3A2VA 1WJKA 3FYGA 2AYTA 2GTUA 2MMNA 1FB6A 2YZHA 5D9XA 4L0WA 3KGKA 3LQ7A 2X8HA 3M9JA 5COHA 4POLA 2H30A 1HQOA 1GLPA 5ID2B 4ZB8A 4WBRD 4TXOB 1PX6A 2IIYA 2PWJA 2IWTA 2DIZA 3RHCA 1BX9A 5LD0A 2JL4A 2DJ3A 1UN2A 3R2QA 2A2RA 4NV5A 1WIKA 2TRXA 3LORA 4O7HA 1SK2A 5HFKA 3ISOA 2PUKC 2V6OA 1PMTA 1RK4A 3LG6A 2FWEA 5AIVA 2GZYA 5ECPB 3IBHA 4P3YB 4TR1B 1ML6A 2H0HA 3VWVA 4JE1A 4F0CA 1QUWA 1OAZA 1I9DA 5GAND 1J0FA 3TOTA 1BJXA 2VL2A 2PGTA 5KN3A 5G2ZA 1QGVA 4HJ2A 3CRUA 3GHAA 2H6XA 3CTFA 4JZQA 1M2BA 4BVXA 2R37A 3TJGA 3K8NA 1ZZYA 1TK0B 3SBCA 2HZEB 1SL2B 4MZWA 4WR5A 1GSUA 1OKTA 3VI5A 2QKEA 5F05A 3S9FA 2GZPA 3KD0A 2V6KA 3WT2A 1SK1A 3G9BA 1VF3A 1DUGA 1VF2A 3HY2A 3IDVA 3KEBA 2YWOA 1E2YA 3GKKA 5KN0A 5ENUA 4JRRA 4F82A 5CNWA 2LRNA 4V1Ap 2C80A 1GUHA 3FR6A 2QSIA 4JBBA 3LXZA 1AQWA 3IOSA 1YEXA 1XVQA 3H79A 3TCOA 1JZDA 5D93A 4POKA 5ECLB 2FCHA 2N5AA 3ZIVA 5CRDA 1AC1A 2C3QA 4MCUA 4AJ6A 3P8WA 4LLRA 3TUEA 2F3MA 2LRTA 1GTIA 3J7Yk 2C8UA 3KMOA 4OFTA 4KGIA 5CYYA 4IP1A 4K1FA 3Q19A 1XW6A 4IJIA 4ZIJA 4YQVA 2IJYA 2XHFA 1EEMA 3MNGA 2VO4A 3D0ZA 2GSSA 3D4TA 1ZL9A 2OBIA 4POBA 3TKPA 2CAQA 1WE0A 4XCSA 2DIYA 5G1KA 4H86A 1X5EA 2X8GA 1XPVA 2VD1A 3QAWA 4IBPA 4I8BA 2O8VB 5HR0A 2PMTA 2I1UA 3TB2A 9GSSA 5C04A 1F6MC 3RPPA 2GZZA 3C1SA 3EU4A 1VGLA 1MDJA 1PGTA 3ZVJA 3LJRA 2A4VA 4FYUA 3ZITA 1G6YA 2XBQA 1X9SB 5D9WA 2REMA 1EV9A 1SKRB 4Q5QA 2AUVA 3PGTA 3F0IA 2G0FA 2LQOA 1Q4JA 4XS4A 3UEMA 4ULXA 1PL1A 1M2AA 3TOUA 2LNSA 2DJKA 1OC3A 1TU8A 2PPTA 4XHMA 1GTUA 5DDLA 5F8BA 2OACA 3LYKA 3KTLA 3HD5A 4NWYA 3TGZA 4O5RA 2B7JA 1HNAA 4GXZA 4GQFA 5HR1A 3TRPA 3ZVJD 3P7XA 4BWSA 4HOJA 4GWRA 2ON7A 2P0GA 1YZXA 3PR8A 4EDZA 5B8AA 3I6AA 3ERGA 5CP1A 3HJPA 1AUCA 4I6XA 2ES7A 1B9XC 4FH8A 2CZ2A 2FA4A 3ME8A 4L0UA 4EF0A 1XW5A 2FD3A 3FR3A 2AAWA 3H93A 3F4SA 3DVWA 1YKAA 3L9VA 4QL9A 2B5YA 4MP4A 2L5OA 1JZWA 11GSA 1FW1A 1GWCA 5GAPD 1SYXA 2VOCA 1M2DA 3UBKA 4JEDA 1LBKA 5B7CA 5G31A 2L4QA 5E59A 3CSJA 4EO3A 1BG5A 2C0DA 3BOAA 4PX1A 1G0TA 1YF1A 4DVCA 2XPEA 3HKRA 2E7PA 3LEFA 2IMKA 4MF7A 5F0GA 1B9YC 4WF5A 5D73A 1T00A 1OYJA 4PUAA 1TI1A 3CRTA 3F6FA 3IE3A 3TKSE 1ZMAA 4WEYA 1WMJA 4ZL9A 2C3NA 2X8CA 3Q74A 3UARA 4TVEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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