5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
3OR5A 5IQYA 2FWHA 2TRXA 4ECJA 1OE7A 2H71A 4TKYA 3VI7A 1M99A 3KEBA 4MJEA 2XBQA 5IMVA 1Q98A 4HZ2A 1XZOA 1TJDA 2VCTA 4JZQA 1JZDA 1CQHA 3CSHA 4V1Ag 4RUVA 3APOA 5ID2A 5D9WA 4MZBA 3EMPA 4HJMA 2C0FA 3CYNA 4LA1A 3IA1A 5D9VA 1TU7A 3CSIA 4MF6A 2YOIA 4XTSA 2LTKA 3HHVA 3TGZA 3Q6OA 5JWOB 1MD3A 2DMMA 3P8WA 1J9BA 4EXJA 2LUSA 1Z3EA 3D0ZA 3UEMA 1MDIA 3DVWA 1BG5A 4G10A 1BEDA 1OC9B 2AHEA 3GX8A 2PMTA 4BWQA 2TRCP 4TXOB 1PGTA 3F0IA 5ECSA 2JZTA 5DJMA 3KJYA 2V2GA 1C72A 3C7MA 1XWAA 1TI3A 1XFLA 2YP6A 4DEJA 2C8UA 4ISDA 1Y25A 1ZZYA 4XCSA 2IMFA 3Q19A 4OO5A 5HR0A 1U6TA 2R5GA 3ZVJA 1PQNA 1VF2A 4LL4B 3JCML 4ECBA 3DD3A 4WF4A 2QSIA 5ABRA 5J9CA 4OCEA 3LFLA 3QPMA 1N2AA 2FA4A 1AAZA 2JSZA 1VF4A 1YEXA 4ZB9A 5JWRB 3GH6A 4YQVA 1K0OA 4WR4A 4XS1A 5E4WA 4K7NA 3EE2A 4RQXA 3F3RA 4V2LA 4HU9A 3L4NA 4WBRD 1XWKA 4BWSA 4HS1A 2OE0A 1Z6NA 4NAXA 4H86A 1B9YC 1EEMA 4L0WA 4OFMA 1FG4A 2VCZA 5B8BA 4OO4A 1JHBA 4KDXA 2TIRA 5ELGA 3E3EA 1B4QA 2NVLA 4K1FA 4MH3A 4KAEA 3QMXA 1MDKA 4JU5A 4TW5A 19GSA 2KHPA 1EP7A 3EINA 4GLTA 1S3CA 1V2AA 3QAVA 3W8JA 4EVMA 1QFNA 5JCUA 5EPFA 5DJLA 4HQZA 13GSA 3TOTA 3KD0A 1YZXA 5AGYA 1EOHA 4HJ2A 1S3DA 4NHZA 3CXGA 1GLPA 4WR5A 3GFKA 1GRXA 5H5QA 2H1DA 2CX4A 2LQQA 3KH9A 3BBYA 1FAAA 2I1UA 5G1LA 1SL1B 4ILFA 2KUCA 4NV5A 2KP2A 5GAND 3L78A 3J7Yb 3FW2A 5HR3A 2A2SA 1YEPA 3WYWA 2AV4A 3IK7A 1X9MB 2JACA 2VO4A 3GKXA 4TR4A 3FZAA 2MMZA 4ID0A 2YPMA 1SD8A 4EDZA 4J57E 2FGXA 4KCAA 1K3YA 2WZ9A 4KX4A 5IM9A 1OE8A 22GSA 4F82A 5H5RA 4OWYA 1NM3A 5ECQB 1SK2A 4FIWA 4KB3A 1O6JA 2A2RA 1M2AA 2QKEA 2V32A 3GHAA 1GL8A 1TRUA 2H1GA 5ECMB 4K7IA 3E0UA 4MH2A 2H72A 3MAKA 1GUKA 2F8AA 5B6MA 2GQLA 1SYXA 4KUNA 5D73A 4PNGA 4IBPA 2KP1A 1OC9A 2DJKA 4FO5A 1T8EB 3DMLA 4TXOA 2H74A 6GSSA 5FHIA 3NOFA 3P2AA 5AIXA 2PERA 5DQYA 1N8JA 3F3QA 5DALB 3GNJA 3LORA 4N0VA 2E2MA 2EIOA 3C71A 3GURA 1TU8A 5IMZA 4EKZA 4KE3A 3A5WA 3LQ7A 2GZYA 3ISOA 1TRSA 1E2YA 4POBA 1EEJA 2E0QA 1ERVA 1T4YA 1TP9A 3D6IA 4OFNA 1XXUA 1CQGA 3O76A 4TR0A 2AUVA 2GSSA 2ON7A 3H79A 4GSSA 1EGOA 1G6WA 5A5KA 17GSA 4GQCA 3GL3A 5J5NA 1OC8A 1BAYA 3FEUA 1TI1A 2BJXA 2PN8A 4HU7A 5F8BA 1VF3A 3ZMLA 1HQOA 1VRSD 2FCHA 2VL3A 2LS5A 3F4RA 2H6XA 3RHCA 2LRCA 1WJKA 4V2NA 2LQOA 3ZYWA 1WIKA 2GGTA 1SKSB 1OVNA 3NIVA 4CW9A 2H0GA 5LD0A 2NPBA 1K0MA 4KGIA 4G2EA 4I8BA 1E6BA 2GSRA 3HZ8A 1K0NA 4EL1A 4OD7A 5G2ZA 1URMA 2HNLA 1ST9A 2H1AA 4L8EA 5DVBA 4K8MA 3TRQA 3DXBA 1GSQA 1LJRA 5CO3A 2DJ1A 2IPAA 4Q5FA 2DJ2A 2ZUPA 3M9JA 2YWMA 2IMKA 5COHA 5AN1A 4G19A 4BVXA 4EUYA 3Q18A 2DIYA 2FY6A 1XW5A 3KZQA 3IPZA 3FY7A 1F37A 2I9HA 16GSA 4N10A 2IFQB 2CAIA 1NW2A 1TXXA 3LJRA 4O7HA 4N11A 1PN9A 2IIYA 4HEA2 1XOAA 1V57A 1V40A 3TOUA 5ECOB 3I43A 2LJRA 3PGTA 4L5LA 3UL3A 2M72A 2OBIA 2YJ7A 1M0UA 2MMOA 3BCKA 2LNTA 3GA4A 1HYUA 3ZTLA 4O32A 1GSUA 2CAQA 1KBNA 5ECRB 5F06A 5KEJA 1EWXA 3UVHA 5B7CA 2H66A 1Q4JA 3TJGA 3VPTA 1GWCA 2O89A 5G30A 2OE1A 3DGQA 1K3LA 2NTOA 4AJ6A 3PH9A 2OJLA 4YQUA 10GSA 3AY8A 2DJ0A 1O8WA 3HJPA 3QDNA 1GP1A 4Z7XA 3HY2A 4EE0A 4MPGA 5JWQB 4BVYA 2F8FA 2YN1A 5KN2A 1F6MC 1GTAA 3F4SA 1G7OA 4O5RA 1UA5A 1XIYA 1UVZA 1FB6A 3RPPA 1FVJA 1A2MA 1EV9A 2IMDA 2V6KA 5DALA 3GTUB 3GV1A 1ERWA 1FB0A 5CRGA 4F0BA 2J9HA 2H19A 4MK3A 5GAPD 4IP1A 4KW6A 1BYEA 1UN2A 4IJIA 5G5EA 1M2DA 4F2IA 3CMIA 3D4MA 3IDVA 4G9HA 2IMIA 3KGKA 4NMUA 5HQPA 2FWEA 1NHYA 3PINA 2DIZA 5IMCA 1FW1A 5IMAA 1X5CA 2OADA 3HVXA 1ACVA 2CX3A 5AIVA 1WMJA 2O87A 1KNGA 3KMNA 1EP8A 1MDJA 4X0XA 3A3TA 1V98A 2YWIA 1GTUA 1TOFA 2CQ9A 2GQMA 4I5QA 3KP9A 2XPDA 4OFTA 3QAGA 5F05A 2VCQA 2B6MA 1T7PB 2KLXA 2CT6A 2B5EA 1LBKA 3UBKA 2HRFA 2C0DA 2J23A 3BD2A 4ZBAA 4POMA 5F0GA 2JADA 4PGTA 4MJCA 1WOUA 4XIHA 2WFCA 1WRYA 1F2EA 2HLSA 5EY6A 1JZWA 5GZZB 3K8NA 4PUAA 3TKPA 3GIXA 4IVFA 4AJ8A 3CTGA 4BL7A 4K2DA 1VGLA 4PURA 3W6GA 1OKTA 2LV3A 3FKFA 1WWJA 3LYKA 1X5EA 5G1KA 1Y6EA 3TJFA 5DCHA 1W4VA 3G7YA 4DVCA 1BX9A 4IJ3A 2IFQA 1K3OA 2RUEA 3GRXA 5HR1A 3IOSA 5KN3A 5GSSA 3F6FA 4EF0A 1U88A 4WETA 3TJJA 3GUSA 1SL0B 4EO3A 4GCIA 2FLSA 2VLUA 4BPYA 4IN0A 4QL9A 3LG6A 1MEKA 1TTZA 3MNGA 2E2GA 1AXDA 1T00A 1Z9HA 2GQKA 4TN8A 1AQXA 2R6KA 3IAM2 4P3YB 1GNEA 2CZ3A 2L59A 4OCFA 4GTUA 1SL2B 3N9JA 3TKQA 2EIRA 1M9AA 2GSQA 3WT2A 3P90A 4NV2A 1H75A 2DLXA 2FD3A 4HI7A 1OAZA 2RLIA 4FH8A 4RQRA 2RM5A 2VAFA 1G7EA 2GT6A 4EC0A 5B6NA 5CRHA 5L71A 4V1Ap 3FYGA 1BJXA 3A2VA 5ECNB 4DSSA 4WBJA 2DBCA 3DYRA 3D22A 1X9SB 1R26A 3GTUA 3DWVA 1SJIA 1DBYA 3QFBC 5LNKe 3TJBA 2R2JA 3M1GA 3CTFA 3MDKA 5ECHB 3IAS2 4E8EA 4L0UA 3F6DA 1QMVA 5ECPB 4POKA 1Z7RA 1U3IA 2K8SA 1PL2A 3A2WA 1YKAA 4K6XA 5A4WA 3QOUA 4GQFA 18GSA 1OYJA 3IE3A 3U5RE 4MDCA 4WF5A 4IW9A 2WB9A 4KH7A 2MYGA 1R7HA 4JEDA 2C1YA 1U3AA 2C0GA 5ECKB 3M0FA 2GLRA 2L5OA 4ECCA 1XWBA 3VWXA 5HFIA 2M80A 2MMNA 1YF1A 1MTCA 1S3AA 1T4ZA 3EU3A 1X5DA 4I6XA 3FHKA 5IMDA 4GXZA 1EV4A 3ZIVA 4GSTA 4K0GA 4XS4B 2VD0A 1TW9A 2H01A 2IL3A 4IS0A 3ZLPA 2MMAA 3F4TA 3WGDA 2PBJA 2IN3A 3R2QA 1XW9A 3F8UA 2OACA 1LU4A 1AQVA 1GH2A 2R3XA 1A23A 2CVKA 4MZCA 3WGEA 4RI6A 5J4UA 3QR6A 5DAKB 5D96A 1QUWA 2H0HA 3C73A 4FYBA 5J41A 2ZCTA 3LXZA 2PWJA 1SJ6A 3LXTA 1GUMA 1A24A 1R5AA 3DVXA 3C8EA 6GSVA 5D8IA 5H5SA 1M9BA 1YDKA 2H76A 1RQMA 5IPHA 4HDEA 2GTUA 4XRAA 3UJ1A 2C3NA 5CRWA 4YH2A 1SKWB 1X0RA 1GULA 5D93A 3HYPA 2AJQB 1SENA 3ED3A 4LL1B 1A8YA 2OKAA 2HYXA 1YJ6A 3EMXA 1Z5YE 4TRXA 4MPFA 3HZ4A 2VCWA 2C80A 1RK4A 1DE2A 3TKSE 3KXOA 5HR2A 4F0CA 2H75A 2HSHA 1FVKA 2K8VA 3UVTA 1ERUA 1RW1A 3ZFLA 4TR1B 4I2UA 2L4CA 3LSZA 11GSA 1WPIA 3ZL5A 1K0BA 2X8GA 1T1VA 1DUGA 2HZFA 4JR6A 1JZOA 4ZB6A 2BTOT 3N5OA 1HNAA 2VCVA 4AF2A 4ZBDA 3TDGA 1AQWA 4J56E 3VWWA 1ZMAA 4D73B 1SKRB 1PX6A 3H8QA 1PRXA 2YCDA 2L6CA 4WXTA 4ZL7A 4K9ZA 2HRNA 4ML6A 4F9ZA 3RPNA 5ELAA 2K9FA 1A8LA 5CNWA 3KP8A 3QD9A 2FWFA 2MBSA 2RIIA 4E8HA 2HSYA 2R37A 4MMMA 3IRAA 5FT3A 5CYYA 2AB6A 1TRWA 4KA0A 1UC7A 2HXKA 5DDLA 4HZ4A 1IYHA 3P7XA 2OE3A 4ML1A 4FYUA 4PQIA 3IR4A 5FWGA 4NXIA 1G0TA 4XHMA 1YY7A 3GX0A 3LGCA 3TB2A 3RHBA 3EWLA 3KM6A 2G0FA 4ZXGA 1XWGA 2VD1A 2X8HA 2BMXA 4XS4A 2HT9A 5ENUA 4ULXA 3F9UA 4ZIJA 4PQHA 3VWVA 1PSQA 4MLYA 4KNDA 1HD2A 2VM2A 2C3QA 2H6ZA 2V41A 4DSRA 4JE1A 4POLA 3DIEA 3MSZA 3UMAA 4JBBA 4O92A 2I3YA 3CRUA 4GRFA 2M46A 2F9SA 2MBTA 2LRTA 1DSBA 1O7UA 4KSOA 2YZUA 2H1BA 4ZBBA 5EL8A 5J3RA 3KCMA 5DAKA 2B7KA 1M2BA 2X8CA 3L0HA 2C4JA 3GKNA 5CAXA 4IP6A 1ZYEA 3HCZA 3I69A 4NWYA 3G9BA 3VURA 1THOA 4N0ZA 2EIQA 2HFDA 4BA7A 3L9VA 2XHFA 3W8SA 1U87A 4ZL8A 1GUHA 1PL1A 2YANA 5IOWA 3M3MA 2L5LA 3WD6A 2EC4A 2H8LA 1EGRA 4ZILA 1A2JA 1HNBA 4MF7A 2WGRA 1O73A 1W89A 3O3TA 5D9TA 4MABA 3F63A 4GF0A 1Z6MA 6GSXA 2OA7A 1A0RP 2DC5A 4NPBA 1GNWA 4IGJA 2ON5A 3GKKA 1XOBA 3I9V2 2JSYA 5G31A 2B1LA 1ERTA 1EZKA 1K0DA 3A2XA 2DJJA 2YNXA 3TKSA 2B1KA 2YWNA 4TR1A 1TK8B 5CREA 5IPGA 4YQMA 3CSJA 2A4VA 4HUAA 3RBTA 2WRTA 1B8XA 2CVBA 2O8VB 3HVSA 3WT1A 2XPEA 2V6OA 3GMFA 4ZB8A 1FOVA 3ZIJA 3HVVA 1OKDA 1GSDA 2GVPA 3KTLA 4F03A 3U6VA 1O81A 3GSSA 4D73A 2GS3A 3GSTA 1GLQA 4I2TA 3EURA 2FNOA 3ZZXA 4CHSA 3QCPA 2N5AA 4N30A 3SWLA 2IWTA 3VLNA 5INYA 3GKMA 3E9JB 4RI7A 2DMLA 4HQSA 1JLWA 3UAPA 1QQ2A 20GSA 1GTBA 5IMFA 1JLVA 1XWCA 3ZRDA 4IQ1A 1BQ7A 3IK9A 2OBKA 3TUEA 1F9MA 1YKCA 2IJYA 1HNCA 4MJBA 3H4KA 2JU5A 4FYCA 2FUG2 4K7OA 4KCEA 3S9FA 4MP4A 1GSEA 1PX7A 4XS6A 1XVQA 3UARA 1USBA 2LKUA 3BCIA 3IC4A 1V58A 2HZEB 3WGXA 3M9KA 8GSSA 5KN0A 1O85A 3IXRA 4CDOA 3HA9A 2V1MA 4KDUA 4QQ7A 4PX1A 1GSYA 4QL7A 2GSTA 4MCUA 9GSSA 2L57A 2DSAA 2XC2A 2REMA 3D21A 5LCZA 5IO2A 1XPVA 3GN3A 1SK0A 3IV4A 2C3TA 1V9WA 3TRXA 2MZCA 3APQA 3EU4A 2CA8A 3DEXA 3G7JA 3MWHA 3FR9A 5J9BA 2O85A 2IMEA 1TK5B 3PR8A 14GSA 1ZCPA 5B8AA 1G6YA 2LNSA 3HJMA 4TVEA 3IBHA 2Z9SA 1QK8A 3DRNA 1SYRA 3HD5A 6GSWA 3NZNA 3O6TA 6GSUA 3HKRA 1GSFA 5A4UA 2YZHA 2X64A 5F07A 4X43A 3KIJA 5A4VA 2DJ3A 3FRCA 3FK8A 2VLVA 1K0AA 4GWRA 5DQSA 5HFKA 1KTEA 3DKSA 1DE1A 3APSA 3FZ5A 2GDRA 3ZMKA 4ACSA 2F51A 2ES7A 1NHOA 3Q74A 5JCGA 2L4QA 2H30A 1I9DA 1PKZA 2GZPA 4WEYA 1YQ1A 1M7TA 1EOGA 1ZL9A 2VL2A 4OMVA 3M8NA 5IIZA 4IKHA 2L6DA 4KDYA 4L5OA 3CRTA 2P31A 4XRDA 3BJ5A 1IYIA 3ME8A 1SJZA 5KN1A 3KH7A 4V2MA 2C0EA 4I97A 3C1RA 2WJUA 3CBUA 1SK1A 4PQ1A 4WKWA 4GSNA 1TKDB 4TXVA 1FO5A 3TRPA 1OC3A 3LEFA 4PNFA 4LMWA 1ON4A 5HFGA 3QFAC 1B48A 6GSTA 3EC3A 4AJ7A 1J08A 3VWUA 1T3BA 1A2LA 2B5YA 1ABAA 3ERWA 3QAWA 2CVDA 1ZYQB 1AUCA 4LMVA 4J2FA 2E7PA 1B4PA 2B5XA 2VM1A 2AYTA 2CZ2A 3H1NA 3GL5A 4ZL9A 1ILOA 6GSYA 3UOMA 1XCCA 2RM6A 2JZRA 3UBLA 5E59A 5DCGA 3TKSC 3ZVJD 5GSTA 4IELA 2D2ZA 2YWOA 2H73A 2PVQA 2QC7A 2P5RA 3BOAA 2PU9C 2LRNA 1TRVA 2VUPA 1QGVA 2K18A 2YV7A 3GH9A 3G7IA 3TJKA 2HZEA 3KTBA 3FR6A 5DBQA 1WP0A 3IHQA 1THXA 2I81A 3ERFA 2LJKA 3FZ9A 5ID2B 5ECIB 1GSSA 1A0FA 2O7KA 1MD4A 3ERGA 3L9SA 2VCXA 2B3SA 2FA8A 1PA3A 3H93A 2NBSA 1GTIA 2H70A 4IQAA 5CP1A 2NDOA 4DSQA 2XBIA 2WCIA 1JFUA 2HE3A 2JL4A 3I6AA 2P5QA 5G5FA 7GSSA 4JR4A 1I5GA 2LEGA 2YV9A 3C1SA 4ECIA 5ECLB 1F3BA 2K6VA 3RAZA 2PUKC 5CRDA 1VF1A 5C04A 3UIWA 1KEBA 1ZOFA 4KSMA 2N5FA 3TCOA 1XVWA 4MZWA 2X99A 3LYPA 4MJAA 5C00A 2GZZA 2I4AA 4EDYA 1R4WA 2ALBA 2CV4A 4K0NA 4X1UA 3VPQA 1NSWA 4Q5NA 1Z7PA 3RDWA 3ZREA 2F3MA 4AGSA 2VIMA 5EVOA 2VLTA 4MF5A 3FR3A 1JZRA 1PD21 3KMOA 1TDIA 2WS2A 1ML6A 3VFIA 2WDUA 2H0IA 3D4TA 2LSTA 1PKWA 1YF0A 2AAWA 2R4VA 4Q5QA 2VL9A 2WULA 2B7JA 2GT5A 2YJHA 3LWAA 1ZGNA 12GSA 2PPTA 3ZITA 1X9WB 4PUFC 5AISA 4TR3A 3FZ4A 5D9XA 3SBCA 1K0CA 1B9XC 2N5BA 2RUFA 3VK9A 2G2QA 1SU9A 4YAPA 3VI5A 2P0GA 3ME7A 2VOCA 1AC1A 4LLRA 1O8XA 1F3AA 3GYKA 5IO0A 2PVOC 1TK0B 3L9UA 4PXOA 4Q5RA 3HXSA 3ZFBA 2QGVA 2PGTA 1XBSA 2VL2C 5IOXA 4MA9A 1XW6A 2HI7A 3EYTA 3EVIA 4DSSB 1AW9A 1H4OA 1PMTA 5JCWA 4IHUA 3US3A 3V1WA 4NHWA 4HOJA 3J7Yk 1FHEA 4JRRA 2H6YA 4TOPA 3TKRA 1R5PA 4YAVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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