5IOWA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure ffcumene (hyperoxidized by cumene hydroperoxide)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
156
structure length
155
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 46
structure length 155
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iowA00
2WZ9A 1N8JA 2HXKA 2NVLA 11GSA 1JFUA 1XWGA 2PVQA 2MBTA 3IBHA 4ZB6A 3DVXA 3RPPA 1SYXA 4XS4A 1ML6A 3ERGA 4ZL8A 2DJJA 1K3YA 3L0HA 2OACA 5H5SA 4WR5A 1A8LA 4N10A 2YWMA 2C0DA 3FEUA 4OCFA 1OKTA 3FR6A 3KMNA 2G2QA 2M46A 1SKWB 5J9BA 3F0IA 2VCVA 1EOHA 3EVIA 1GTAA 3UOMA 3CTFA 3ZRDA 4KNDA 2GVPA 3ISOA 1PX6A 4Q5NA 1X5CA 2B5EA 2H01A 5E4WA 5CRGA 12GSA 2VO4A 2FWGA 1AW9A 2R5GA 5CREA 5ECLB 3GX8A 5G1KA 3FZAA 1HQOA 3V1WA 5KEJA 4NV5A 1PL1A 4NAXA 2D2ZA 1M0UA 2VIMA 5KN0A 1YQ1A 1G7EA 1IYIA 2C0EA 3QOUA 1WWJA 3HD5A 2OE3A 1R5AA 3DWVA 1VF3A 2H1BA 4YAPA 5ECSA 3M1GA 4XS1A 3US3A 2V6OA 4I6XA 1PA3A 3EURA 2GSTA 3ZIVA 1EGOA 4NHZA 5AGYA 2JADA 3EMXA 4IBPA 1Z3EA 4FO5A 1SYRA 4G9HA 4PGTA 5ENUA 2PVOC 3CRTA 5IO2A 5DVBA 4K9ZA 1T4ZA 1AQVA 3GH9A 1G7OA 2GDRA 2FCHA 1J0FA 4XCSA 2NDOA 2YZUA 1RW1A 3IRAA 2H74A 1U87A 1THOA 2XPEA 2MMAA 1GLQA 1DBYA 1WPIA 3FK8A 3QR6A 4K0NA 2LUSA 2CA8A 4NMUA 3GKNA 4TW5A 5AISA 3G7JA 3GA4A 5AIVA 1CQGA 3Q6OA 1K3OA 4WKWA 3DKSA 3P7XA 2GGTA 1OC9B 5HR2A 3HY2A 3UAPA 1M2DA 1KBNA 3M0FA 2VOCA 2KLXA 1TW9A 3IV4A 3IDVA 2LQQA 2RM6A 3ZFBA 4QL9A 4EKZA 4GRFA 5IMCA 4MA9A 5B6MA 1Z7RA 3KD0A 1TRVA 2H6YA 3KH7A 1XFLA 3KGKA 3VWXA 4HOJA 3F8UA 3KIJA 4K0GA 3RAZA 5IMFA 3BBYA 2H6XA 4L0UA 3KZQA 3VFIA 5A5KA 2XHFA 4GSTA 2OBKA 4PX1A 3L78A 4E8EA 3TRPA 3GFKA 4RUVA 2DJ2A 4KDUA 3LGCA 2HZFA 6GSYA 1GSQA 1A2LA 3GL5A 2I81A 4ECJA 4K7NA 1GUKA 2N5BA 1ACVA 3DGQA 2GZZA 2HFDA 2PWJA 4D73A 1K0AA 2MMZA 4JR4A 4N11A 2FY6A 1GWCA 4HU9A 4DSSB 5CRWA 2EC4A 1MDKA 3C1SA 4GF0A 2K8VA 3CSHA 3ZVJD 3WYWA 4TXOA 2FA8A 4HS1A 3KEBA 3NOFA 2AYTA 3FHKA 5ID2A 2A2RA 3Q74A 5A4UA 1F37A 2FA4A 2J9HA 4PUFC 1QUWA 2B7KA 1PGTA 4IQ1A 2C8UA 2H76A 5F06A 4MF6A 1BX9A 6GSTA 1A24A 3PR8A 3SWLA 1PRXA 18GSA 3H4KA 3RDWA 1XWCA 5J9CA 2C4JA 1EZKA 3Q19A 4HDEA 4O92A 2GZPA 5HFKA 1URMA 2DSAA 2CZ3A 3KM6A 3CSIA 3RHCA 4ULXA 3TKPA 1NW2A 1GSEA 1XPVA 2B1LA 4TXVA 1SKSB 3N9JA 3A5WA 4X0XA 3TKRA 2C80A 2XBQA 3TJGA 4EO3A 3G7IA 1TOFA 3IC4A 4WF4A 4PURA 3GHAA 3MWHA 4WBJA 1B48A 5JCUA 1K0CA 1S3AA 2R4VA 1BG5A 1OKDA 4ZBDA 1TRUA 3TGZA 2YZHA 5H5RA 1Z7PA 2HZEA 2PU9C 2AJQB 1FB6A 3NIVA 3H8QA 1YF1A 2WJUA 2LRNA 5KN3A 3P90A 2B5YA 2X64A 4IN0A 1JZDA 3H1NA 1HNBA 1PKWA 5INYA 3LXTA 3KTLA 4NXIA 17GSA 4L8EA 2C0FA 4TR4A 4AGSA 5DJLA 5CP1A 4IQAA 3KTBA 9GSSA 1EV9A 2WULA 1X9WB 4BA7A 2C3QA 2GT6A 2IJYA 2H1DA 3ME8A 4G10A 1GSUA 4RQXA 3E0UA 5D9VA 1PKZA 3UIWA 1UC7A 1JZRA 5J3RA 3FRCA 1PMTA 2X8CA 5ECOB 4MPGA 2MMOA 2H0HA 2FD3A 1B9XC 2I9HA 3A2VA 3WD6A 1M7TA 4ZL7A 4FYBA 3LWAA 3DMLA 1O81A 5A4VA 1SL2B 1R26A 1XW9A 5B6NA 1XBSA 4K2DA 3J7Yb 2K18A 1TI1A 2CT6A 5AIXA 3IAM2 3KMOA 1M99A 3L9SA 16GSA 1A2MA 1JZWA 1Y6EA 2HI7A 1F3AA 2FUG2 3HYPA 3BCIA 1GTBA 1AC1A 2YV7A 4Q5FA 3GH6A 2ZNMA 10GSA 4CW9A 3VI5A 3E9JB 5IM9A 5B8BA 4HEA2 3TKSC 1QK8A 4JZQA 4J57E 2VCZA 1MTCA 1T00A 4JR6A 1K0NA 1A2JA 1TI3A 4Q5QA 4JBBA 2L4QA 4X43A 1XW5A 2HSYA 3GSTA 1KEBA 5C00A 3GL3A 3UMAA 3ZL5A 5HFGA 2DJ3A 5D8IA 1J9BA 4HJ2A 1K0BA 2OADA 4V2LA 3F4TA 2H73A 3FR3A 2VM2A 2PN8A 4EDYA 1IYHA 3HCZA 1S3CA 4YQUA 2V32A 4IVFA 2E7PA 5DAKB 4MJAA 2V41A 4JRRA 5GAPD 3KJYA 3HZ4A 4ACSA 2VAFA 4LL4B 2AB6A 2P0GA 4NPBA 2WS2A 3TKSE 2WFCA 3GNJA 1I5GA 2C1YA 5IIZA 3MNGA 3TCOA 2L4CA 2MZCA 3NZNA 2JSYA 3HJPA 1PN9A 5J5NA 4OWYA 1EV4A 1XCCA 4POBA 3LJRA 3D21A 1BQ7A 3GTUA 4K6XA 1GNEA 5JWQB 2F9SA 2YOIA 2HE3A 2VD1A 4MPFA 2OA7A 4OO4A 4GCIA 4K1FA 3M9KA 1TK0B 3HDCA 1AUCA 2OJLA 4PNGA 1A8YA 4MZWA 4J2FA 2XPDA 3BCKA 1Z9HA 3EU3A 3RHBA 3TOUA 2HNLA 6GSSA 2VLTA 1YEXA 2TRXA 3A2WA 2LNSA 4FIWA 4AJ6A 1TRWA 2GTUA 1B4QA 2AAWA 4XS4B 1M2BA 4XHMA 6GSXA 3LG6A 4MH2A 3UBKA 3OR5A 4ILFA 1U88A 1ZYEA 4JU5A 5FT3A 4MZBA 4HUAA 1K0OA 2LKUA 3I6AA 1XVQA 4AF2A 3HJMA 5EY6A 3GKKA 2QSIA 4MJEA 4MF5A 2VM1A 4KUNA 4NV2A 7GSSA 5C04A 1UA5A 2REMA 4O7HA 3KP9A 3JCML 2PBJA 3CXGA 1ILOA 3LXZA 3GURA 4ZB9A 4PUAA 1X9SB 4WF5A 5ECIB 1VF1A 3F6FA 5CO3A 2A2SA 5GZZB 2JSZA 3ZZXA 4ZB8A 2KP2A 3HVXA 4XIHA 3F4RA 2N5AA 3DIEA 1SJZA 1Q98A 3APSA 4DVCA 3U6VA 2I4AA 4DEJA 1Y25A 5D93A 4ZXGA 4KSMA 4ZILA 3FZ9A 3IA1A 3SBCA 2RM5A 5D9TA 5GAND 3D0ZA 4DSQA 3MDKA 3ZFLA 4L0WA 4KDYA 4EDZA 2VCWA 4MLYA 2IL3A 4IJ3A 1V9WA 5COHA 2HRFA 5ECKB 3GRXA 2KHPA 3VURA 3ZVJA 3ZITA 2H6ZA 2LV3A 1SL0B 2PGTA 5ECPB 5EVOA 4HZ4A 2H72A 2G0FA 2IFQA 3S9FA 2M72A 1FHEA 4H86A 5ECRB 3IR4A 3W6GA 2IPAA 4I5QA 1G0TA 3APOA 1WE0A 1B9YC 2DIZA 3UVHA 4TR3A 4YH2A 4K7IA 2KP1A 4IJIA 1A23A 1EOGA 2VCXA 3IHQA 1SD8A 2EIRA 2QGVA 1FB0A 2OE1A 3CMIA 3GSSA 1WOUA 2LJKA 2ZUPA 2IIYA 4K7OA 2H19A 4AJ7A 5CYYA 3WGXA 2L59A 4FH8A 2C3NA 4MK3A 3FY7A 3VK9A 3KCMA 3GKMA 1F9MA 2CVKA 1W4VA 4OFNA 3QAVA 1THXA 2GSSA 1YF0A 1GLPA 3E3EA 2V2GA 1YKCA 3TUEA 1PL2A 4MF7A 3TRQA 1Z6NA 3KH9A 2H0IA 1HNCA 1AAZA 3IOSA 5IOXA 2JZRA 1ZZYA 3BJ5A 1N2AA 2DJKA 2YWNA 2B5XA 2L5OA 3WT2A 2O87A 4IELA 2VL3A 3D5JA 1FAAA 1BYEA 2DJ1A 1OE7A 1XIYA 3EINA 2JACA 1ERWA 1SKRB 4KSOA 3H79A 1G6YA 3IE3A 5G2ZA 3FR9A 2YWOA 5IMVA 2VL2A 3A3TA 3TJBA 1BEDA 2RUFA 4PQ1A 1AQWA 2IWTA 3ZYWA 3IAS2 3M3MA 4V2NA 5G31A 5KN2A 4KH7A 1ZCPA 2GS3A 3FZ4A 3D6IA 4GQFA 3G7YA 1G6WA 1O73A 4D73B 3HXSA 1XZOA 3K8NA 4KX4A 4IP6A 4OMVA 1ABAA 4ZBAA 2HT9A 4EF0A 3QD9A 5IO0A 4ML6A 4BVXA 3BOAA 5E59A 4O32A 1V57A 3UARA 4TXOB 2YJHA 2C0GA 2DIYA 2YANA 5ID2B 3C8EA 1QXHA 3FW2A 2YN1A 4PQHA 5F07A 5ECNB 1ZYQB 2DMMA 1GL8A 2CVBA 3F63A 3UEMA 2VCQA 2YV9A 5CRHA 1SK1A 1EEJA 1K0DA 2LNTA 3DEXA 2VD0A 4MZCA 1YJ6A 2GSQA 4AJ8A 3VWUA 4IKHA 4LA1A 1GULA 1T7PB 2V1MA 1GSYA 4QQ7A 3CYNA 4E8HA 2FWFA 1T4YA 3PGTA 3FKFA 2DMLA 1PSQA 2FGXA 3GKXA 4LMWA 2IMIA 2F51A 1AXDA 4IHUA 1LJRA 4XRAA 3QFAC 2WRTA 2LRTA 1SENA 2YCDA 4F9ZA 3QCPA 3O76A 2X8HA 3I9V2 4WXTA 3QAWA 4MJBA 2K9FA 2RIIA 3GYKA 3VI7A 4WEYA 2X8GA 1NM3A 2IMDA 2OE0A 3L4NA 3EYTA 5DBQA 3EC3A 2FWHA 3GUSA 2M80A 4KCAA 1MD4A 2HZEB 3TKQA 1A0FA 4TN8A 1WP0A 5G5FA 1AQXA 1XXUA 3WT1A 3GMFA 4IS0A 2FLSA 2I3YA 3VPTA 1TXXA 2L57A 4F0BA 5JWRB 3TKSA 3UBLA 2LJAA 5DQYA 2MBSA 4BL7A 4ZBBA 2EIOA 3AY8A 1YEPA 1K3LA 4OFMA 4I8BA 1BJXA 2E0QA 1WIKA 2RLIA 1VGLA 4WR4A 5DCGA 3W8JA 2LQOA 1Q4JA 4KDXA 1GH2A 3O3TA 2R3XA 4F0CA 3G9BA 2E2GA 2GQMA 5AN1A 3DRNA 4YQMA 2OKAA 3WGDA 2LRCA 2ON7A 3KP8A 1LBKA 1OAZA 2DBCA 4J56E 3VPQA 5DALA 4BVYA 2GT5A 5EPFA 2IMKA 1Z6MA 5JCWA 4POLA 5DAKA 1JLVA 3I69A 4QL7A 1JHBA 5J41A 3HVVA 2CV4A 3RPNA 1XWKA 2YJ7A 1O8XA 5FHIA 3W8SA 1MDJA 2AUVA 4ZL9A 1ZL9A 1AIUA 2MMNA 1GSFA 1OVNA 3N5OA 3M8NA 5F0GA 5LD0A 5CAXA 4MH3A 4HI7A 1MD3A 5ECQB 1H75A 3Q18A 1M9BA 4I2TA 3UL3A 1HD2A 4KA0A 4K8MA 4PQIA 1FG4A 3LORA 2O89A 5LNKe 4TOPA 3FYGA 2LJRA 2CQ9A 3DVWA 2H0GA 2DLXA 4OO5A 1FW1A 3A2XA 4OD7A 3C7MA 5B7CA 4TR1B 4HQSA 1F3BA 3L9VA 1B4PA 4RI7A 1X5EA 1UVZA 2H70A 1SJ6A 3QMXA 1SD9A 5JCGA 2FNOA 4JEDA 14GSA 2LS5A 4ISDA 2F3MA 2R37A 1O8WA 3C1RA 1TK5B 2F8AA 4V2MA 3LQ7A 3ERFA 4JE1A 5DJMA 4HZ2A 4NHWA 4MP4A 4EE0A 2DC5A 3PH9A 3C73A 22GSA 3D4TA 3ED3A 5IPGA 1E2YA 4YAVA 2C3TA 2LEGA 4KCEA 1GP1A 1SJIA 1PQNA 2IN3A 3CBUA 2B6MA 1XOBA 1F6MC 1RQMA 2A4VA 5G30A 1WMJA 2KOKA 4I2UA 5GSTA 2JU5A 3GIXA 5J4UA 1B8XA 1ZOFA 3ZMKA 4ID0A 2JL4A 2K6VA 3F3RA 3TJKA 1SK0A 3WGEA 4YQVA 3R2QA 1J08A 1W89A 3GTUB 4TVEA 5LCZA 4GQCA 2P5QA 2JZSA 6GSWA 5HR1A 4Q5RA 1SU9A 2LSTA 3LFLA 2CX3A 1QQ2A 4DSRA 3VWWA 1H4OA 2WGRA 1XW6A 3GV1A 5H5QA 1OC9A 5HR3A 4ML1A 5ECMB 4XRDA 3TJFA 2E2MA 1DSBA 2H66A 4OCEA 3QPMA 1ERUA 3F6DA 1GNWA 1RK4A 1R7HA 3BD2A 4IGJA 2H30A 2BJXA 1E6BA 4KGIA 2YP6A 1QGVA 3ME7A 3TJJA 1S3DA 2X99A 2R6KA 4IW9A 3U5RE 1EP8A 3P8WA 4L5LA 5D9XA 2PERA 2H71A 4MDCA 2NPBA 1ON4A 1T1VA 3TB2A 1X5DA 1XOAA 1XWBA 5D96A 3O6TA 4BWSA 3TOTA 3QFBC 2ZCTA 2QKEA 3UJ1A 2V6KA 1TRSA 2VL9A 1OC3A 3LEFA 4FYUA 4ECBA 2BTOT 2HRNA 1R4WA 1EP7A 5IPHA 3ZLPA 4G2EA 5IMDA 2F8FA 3LSZA 1V58A 3QAGA 5EL8A 4GTUA 1QMVA 3EMPA 4KB3A 3ZIJA 1EEMA 3F3QA 4EVMA 1OE8A 2OBIA 4DSSA 1TKDB 2LTKA 4ZIJA 1VRSD 1SL1B 3EE2A 5CNWA 1XVWA 4WBRD 4KAEA 3PINA 2GSRA 3IK9A 2P31A 4F03A 4V1Ag 1PD21 2IFQB 2EIQA 5DDLA 5KN1A 2N5FA 4TR0A 4F2IA 2O7KA 4EL1A 1TU8A 2NTOA 1EGRA 4POMA 1HNAA 2PMTA 4BWQA 3J7Yk 4GXZA 4GSNA 1BAYA 4LMVA 3UVTA 1LU4A 4N30A 1GUHA 8GSSA 5HQPA 1ZGNA 1DUGA 4X1UA 3CTGA 2BMXA 1CQHA 2H1AA 1ZMAA 1KTEA 1QFNA 3RBTA 4Z7XA 1OYJA 1C72A 1YY7A 1GSDA 4LL1B 1TU7A 4LLRA 3LYKA 5G5EA 5IQYA 2YWIA 2J23A 2MYGA 1VF2A 2CX4A 3IPZA 3TRXA 1V98A 2GLRA 20GSA 5GSSA 1M9AA 1FOVA 5A4WA 2ES7A 2R2JA 5ABRA 5IOWA 2H8LA 2B1KA 4MABA 4ECCA 1ST9A 1GUMA 2L6CA 3GX0A 1YZXA 2NBSA 4EC0A 2RUEA 1TK8B 4HU7A 1O85A 2P5RA 2WCIA 1X0RA 3HVSA 3APQA 1TJDA 1XWAA 3ZMLA 3HHVA 3ZTLA 1WJKA 1MDIA 6GSUA 6GSVA 1EWXA 2VL2C 4V1Ap 2ALBA 5B8AA 5G1LA 1JZOA 2WDUA 2I1UA 2YPMA 1KNGA 2L5LA 3C71A 2K8SA 3L9UA 2IMFA 2B3SA 2KUCA 4BPYA 1OC8A 2VLUA 5DQSA 4EXJA 5FWGA 4EUYA 1T8EB 4TRXA 3F4SA 4TKYA 2JZTA 2O85A 1GTUA 1MEKA 2GZYA 1GRXA 2GQKA 1U3IA 1U6TA 2IMEA 4G19A 4IP1A 4ECIA 2CAQA 4HJMA 2H1GA 5ECHB 2L6DA 1K0MA 3DYRA 3TDGA 2H75A 2CVDA 3DXBA 3CRUA 1X9MB 2HSHA 4RI6A 5F8BA 2FHEA 3HJOA 4CHSA 4CDOA 2QC7A 3EWLA 13GSA 4PNFA 1JLWA 3ERWA 1O7UA 3F9UA 1NHYA 3H93A 2O8VB 3IXRA 3ZREA 4KW6A 2XC2A 4MMMA 1UN2A 1Z5YE 3GN3A 3VWVA 3DD3A 2VLVA 5IMZA 2CZ2A 1I9DA 1WRYA 2WB9A 5DCHA 4GWRA 4NWYA 2TIRA 5CRDA 1PX7A 4L5OA 4GSSA 3MSZA 2XBIA 1ERTA 1O6JA 2FWEA 4OFTA 2HLSA 5HR0A 5IMAA 1GSSA 2ON5A 1TDIA 2B7JA 4FYCA 4PXOA 3MAKA 2VCTA 3HKRA 3HA9A 4N0VA 3KXOA 4I97A 5ELAA 4HQZA 4MCUA 1HYUA 3IK7A 1F2EA 2DJ0A 1TP9A 3CSJA 3LYPA 4P3YB 3QDNA 1A0RP 2CAIA 5D73A 5JWOB 2AHEA 1USBA 2PUKC 1FVKA 1FO5A 1DE2A 1ERVA 1M2AA 1YKAA 5F05A 4XTSA 4XS6A 4KE3A 2HYXA 4POKA 5HFIA 5D9WA 2TRCP 2VUPA 1NHOA 1VF4A 1DE1A 3I43A 4RQRA 2YNXA 3VLNA 3FZ5A 4F82A 1NSWA 2Z9SA 4GLTA 19GSA 1YDKA 2GQLA 4O5RA 4MJCA 1U3AA 4N0ZA 1V40A 4WETA 4TR1A 1V2AA 1SK2A 1T3BA 5L71A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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