5IPGA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure fft-butyl (hyperoxodized by t-butyl hydroperoxide)
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
156
structure length
154
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 43
structure length 154
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5ipgA00
1K0AA 1K3LA 3HJMA 2P0GA 3RDWA 4KSOA 2YV9A 5IPHA 3BCIA 3CSIA 5KN3A 2YZHA 4YQMA 4PXOA 3IK7A 1M2DA 1G7OA 3VWUA 3LWAA 3KM6A 3IOSA 2IMFA 7GSSA 2V41A 2XPDA 5CRGA 1WRYA 1QFNA 2XBIA 1S3AA 5A5KA 5G1KA 1PRXA 2CAIA 5ID2B 2C0FA 2QC7A 3IV4A 2VLUA 4V1Ag 2L6DA 3J7Yk 4KX4A 5ECQB 4PURA 3FY7A 1GSYA 1T7PB 1AAZA 2B5YA 4WBJA 3M9KA 4O32A 3DXBA 1NW2A 3K8NA 3Q74A 1BQ7A 1PL1A 2YWOA 4OD7A 2B6MA 3VI5A 1G6YA 2IL3A 5IOXA 1V58A 3GH9A 4NMUA 1UVZA 1O8XA 3GV1A 3HXSA 1XWAA 3WD6A 1TK5B 1FB0A 1MDKA 1ZZYA 1QGVA 2H1GA 3GTUB 4BL7A 3F8UA 4L5OA 2E2GA 1NHYA 2QKEA 5CP1A 1DUGA 2EC4A 2HNLA 3ZYWA 4GLTA 4F2IA 1Z6NA 1SJIA 3GL5A 4O92A 3QDNA 3BJ5A 1YEXA 3D4MA 3TKSC 1WPIA 2VCTA 1YKCA 3WGDA 1EEMA 2JACA 2GQKA 1N8JA 5HR0A 2H1BA 2E7PA 4HU9A 4MF5A 1AXDA 5AIVA 1K0NA 2JZSA 5CRWA 3C8EA 4KDXA 2GZPA 4MABA 1VGLA 1TXXA 2C3NA 1XWCA 2WFCA 3ZFLA 1WWJA 3PGTA 2AUVA 1MD3A 1YZXA 3TJKA 5G30A 1B9XC 4IJ3A 4OFNA 3IBHA 6GSXA 4ECBA 3UL3A 4NXIA 2OA7A 3GSTA 4IKHA 3HKRA 4I5QA 3L9VA 2YCDA 2H19A 3D22A 1GSQA 3DEXA 1E2YA 4ULXA 1XVQA 1A8LA 2GSTA 4HZ4A 3W8JA 5DJLA 1ON4A 2DC5A 4JBBA 2H1DA 1UN2A 3IAS2 1M2AA 4IVFA 4F9ZA 1Z3EA 2P31A 2PBJA 4IP1A 5D9XA 3NZNA 1ZL9A 3LXZA 5D73A 4NAXA 2YPMA 1XWKA 3VPQA 5GSSA 2FGXA 3PR8A 1BAYA 4AJ7A 1X9MB 4LL4B 4ISDA 3HA9A 1R4WA 4CHSA 1W4VA 1DBYA 1EV4A 5B8BA 1B48A 3P90A 3GSSA 3G7JA 2V32A 4TXOA 1U3AA 3FZ4A 2H70A 4EUYA 3LQ7A 3ZVJD 3A5WA 1OYJA 3GKKA 1X5CA 2H75A 2V1MA 4WEYA 1GSUA 3MSZA 3TB2A 4WR4A 1SD8A 2RUEA 2R6KA 1OVNA 1YKAA 2O87A 4EDYA 5DDLA 3EWLA 1QMVA 2X99A 3S9FA 2I1UA 2A2SA 1U3IA 4RQXA 1T3BA 2KP2A 2HFDA 4GSSA 2E2MA 3MWHA 5G5EA 4NPBA 1RK4A 2B7JA 3TKSE 4TR1A 1TK0B 3GL3A 2HRNA 3GRXA 1B4QA 3KIJA 2H0IA 3ME8A 1GH2A 1U88A 4I2TA 4PX1A 2PMTA 4WETA 2IMDA 1OC9B 4MF7A 4IGJA 2WB9A 2KUCA 3TCOA 3DYRA 3FR3A 4L8EA 2K8VA 3F63A 4J56E 2YWNA 4QQ7A 1TRWA 3GN3A 3MDKA 3TRQA 2I4AA 1K3YA 5ECHB 3GKXA 3VLNA 5ABRA 3QCPA 1V40A 2GZYA 2VD0A 2N5BA 2VO4A 1Z6MA 4HUAA 4X0XA 3GURA 2GQLA 2K6VA 5JWOB 4HS1A 3KZQA 2GSSA 1GUHA 2FD3A 2VAFA 1YY7A 2FHEA 4K6XA 4XRAA 1C72A 4JRRA 3SBCA 1GRXA 4TR0A 3KMNA 4JEDA 5FT3A 5ELAA 3A2WA 3H8QA 3LJRA 1UC7A 3BOAA 1FHEA 3FR9A 3M1GA 2LTKA 5GZZB 2IJYA 1PKWA 1SENA 2YWIA 1TJDA 3M0FA 1CQHA 1GSDA 1JZRA 2GGTA 1SYRA 1LU4A 3HJOA 3FYGA 1GULA 1M7TA 2GT6A 3R2QA 4DSSB 3FRCA 2R4VA 4PUAA 1PD21 4MCUA 3FZAA 1QXHA 2F3MA 2GQMA 3US3A 4JZQA 4MK3A 4HI7A 1XW9A 1TW9A 3QFBC 1FW1A 4GWRA 13GSA 3ISOA 4FYUA 3CTFA 3ZL5A 3IAM2 5ELGA 5DALB 5HR2A 4KDUA 1J08A 5GAPD 2FWHA 1AC1A 3DVXA 3RPPA 5AGYA 5B7CA 4CDOA 4ID0A 10GSA 2DIZA 2DIYA 4OO4A 1XWBA 3KMOA 2LQQA 2P5RA 2MZCA 4D73A 5JWQB 2AJQB 1BX9A 4GQCA 3A3TA 4POBA 3GMFA 4Q5NA 4ILFA 1J0FA 2EIRA 1SYXA 1X5EA 1MTCA 3EU4A 2CA8A 3ME7A 2EIOA 2DJ1A 1GTBA 2N5FA 4K7OA 4KNDA 2CAQA 2GSRA 4TKYA 2VD1A 1F37A 4ZL9A 2C3TA 4JR6A 4EF0A 4TOPA 1QQ2A 4EC0A 4KH7A 3I43A 2VCQA 3CYNA 1BJXA 2OADA 4WKWA 3MAKA 4YQVA 2J23A 1PQNA 4XS4A 1SL0B 2O8VB 4RI6A 1ERVA 1ERWA 4L0UA 2WRTA 5IOWA 4Q5QA 5LD0A 1K0BA 3FZ9A 5D93A 2FWFA 3MNGA 4AJ6A 1JLWA 2Z9SA 2OACA 4WF5A 3TKPA 4TVEA 4MPFA 1FVJA 5EL8A 2RIIA 3C1SA 2XHFA 3DIEA 2FWGA 4PUFC 2CZ2A 3UBLA 2CVDA 1OE8A 4MDCA 2CT6A 2B5EA 5IPGA 1A0RP 1TRVA 3IK9A 2JSZA 2PPTA 3KJYA 1PMTA 2HYXA 4V1Ap 4EE0A 4XRDA 4BWQA 1XVWA 3VWXA 2OKAA 3RPNA 1B9YC 2LJRA 1LBKA 2HSHA 4OCFA 2NPBA 2FUG2 4POMA 4HEA2 4XCSA 3WT2A 3ZREA 3QOUA 2KP1A 3IPZA 4PNFA 4TW5A 1I9DA 1XW6A 2VL3A 3IHQA 3PH9A 4LL1B 1JLVA 1X5DA 5GSTA 1NSWA 5HR1A 4KCEA 1JFUA 5EY6A 3TRXA 3HVVA 2IFQB 2ALBA 2JU5A 4KGIA 1B8XA 3QD9A 1GTIA 3KEBA 4KUNA 2DJKA 2PU9C 6GSTA 5JWRB 4PNGA 4HOJA 1PX6A 3APSA 4K8MA 2BJXA 1F9MA 2OBIA 2H72A 1FB6A 2C0DA 2AYTA 2DLXA 2RM5A 4KB3A 1HYUA 2G0FA 1PN9A 2RM6A 1WOUA 2HSYA 5ECIB 2KLXA 1TRUA 3F4RA 1M99A 4N0ZA 5HR3A 2FY6A 1TK8B 3TUEA 3F0IA 2F51A 5ECPB 5C04A 20GSA 1QK8A 3ZIJA 1F2EA 1EZKA 2OJLA 2MBTA 1TRSA 2O89A 1A23A 3RAZA 4PQ1A 3C71A 1GNEA 2GSQA 3EVIA 3EMXA 2AAWA 2GDRA 2X8HA 2R3XA 4WXTA 3N5OA 2DJ3A 3WGEA 1VF3A 1EOGA 4MF6A 2VUPA 4EVMA 2C8UA 1UA5A 2DJJA 3UEMA 5J41A 1V2AA 4F03A 1JZOA 5GAND 3HVXA 2H73A 5JCGA 1H75A 1YJ6A 4QL9A 4GSNA 2K9FA 2KHPA 2D2ZA 4MMMA 2H8LA 2ON5A 2FCHA 2GVPA 4FYBA 5AN1A 1ACVA 3LSZA 3CSJA 3UAPA 4MPGA 5JCUA 1HNBA 5KN1A 2DJ2A 1MDIA 5DQSA 1GTAA 5B6NA 3IR4A 1AUCA 17GSA 5HFKA 1SU9A 1MEKA 16GSA 2HXKA 2VCXA 1EGOA 5JCWA 4L5LA 3GFKA 3EU3A 4FO5A 3Q18A 5J5NA 1A2JA 3M8NA 1PX7A 4KDYA 1TDIA 4KAEA 4ZXGA 2FA4A 1CQGA 1GSSA 2WZ9A 5DAKA 2YNXA 3EC3A 4XIHA 2H6XA 3DD3A 2DSAA 1Y6EA 3ZMLA 3KTLA 4ECJA 1O6JA 4E8HA 5FWGA 4K7NA 2JADA 4ZB8A 1TI3A 1GUMA 4H86A 3GH6A 1R26A 4AF2A 5ECOB 3G7IA 2N5AA 5J4UA 1KBNA 1THOA 5IMFA 3H93A 4PQHA 4V2MA 4TRXA 5ID2A 4TXVA 2L6CA 1U87A 4CW9A 1V9WA 1TOFA 2B7KA 5E59A 4IW9A 9GSSA 3VWVA 3CMIA 3QFAC 2LKUA 1O73A 1ABAA 3ERFA 3E0UA 2B1LA 3GIXA 1N2AA 3A2VA 5LNKe 5F07A 3O6TA 3HCZA 2NTOA 4G10A 4MH3A 3DKSA 3TJJA 1EOHA 2MMAA 4MLYA 4G2EA 4OMVA 4J57E 1GP1A 2ES7A 2AHEA 19GSA 2HZEB 1SL1B 1XIYA 4NV5A 1H4OA 3GHAA 3GTUA 1GTUA 1HQOA 6GSYA 3L0HA 3FHKA 1KTEA 3L9UA 5A4UA 1GSEA 4JU5A 2LSTA 3TOUA 1OKDA 2HI7A 2GS3A 5IO2A 2ZCTA 1A0FA 4WF4A 5DQYA 1VF4A 1HNCA 2IIYA 1O85A 5CREA 1X9WB 4FH8A 1V57A 5H5RA 3WT1A 1F3AA 3ZLPA 1AQWA 5A4WA 1B4PA 1BYEA 4ZB6A 2VLVA 1W89A 4IJIA 5IQYA 2L4QA 3GX8A 4P3YB 4WR5A 5CO3A 3DRNA 2IMIA 4HDEA 2TIRA 2VLTA 2A2RA 5H5QA 22GSA 3TGZA 5DCHA 3UVTA 4OFMA 4G19A 4GXZA 3TJBA 1AQVA 2P5QA 3AY8A 3LXTA 5IMAA 2CV4A 4Z7XA 5IIZA 3CRUA 3I69A 1IYIA 2R37A 1T00A 4V2NA 2YOIA 4DVCA 3C7MA 3IC4A 5AIXA 5IMVA 2IMKA 2LUSA 4KA0A 4XS6A 2CZ3A 1YF0A 1PL2A 3F6FA 2PUKC 5E4WA 3PINA 4ZBAA 5DJMA 2YN1A 3QMXA 2VL2A 4DSQA 1X9SB 2K18A 5CNWA 4HQZA 4ML1A 2O85A 1M9BA 3D6IA 4EKZA 2L4CA 3V1WA 1NM3A 1LJRA 2ZNMA 4EDZA 4O5RA 4YAVA 2F8FA 1A24A 2LS5A 1J9BA 1ZYEA 4ACSA 2L59A 6GSSA 3FK8A 4N30A 2KOKA 4HJMA 2M46A 2OE1A 3W6GA 2VIMA 1OC8A 2G2QA 1A2MA 3UARA 4TR3A 1V98A 2C0GA 3ZVJA 3C1RA 1ST9A 4L0WA 2IMEA 3CSHA 4XS1A 3M9JA 4BWSA 1ML6A 4RQRA 1JZWA 3F3RA 2C3QA 4KCAA 5J9BA 3EINA 4ZL7A 1ZMAA 1QUWA 1A2LA 1DSBA 4GTUA 5G1LA 2VCWA 5G5FA 3U5RE 1K0DA 5EVOA 2I81A 14GSA 3ZFBA 2L5OA 1VRSD 4JR4A 2IN3A 2YV7A 2YZUA 2IPAA 2FA8A 1Q4JA 1AW9A 3TJFA 1IYHA 3D5JA 1TKDB 2PWJA 4ECCA 4F82A 3GNJA 3RBTA 2H0HA 4MP4A 4HZ2A 1GLQA 5KN2A 3HZ4A 4LMVA 2R2JA 3F3QA 3J7Yb 2VM2A 1FOVA 2NDOA 2VL9A 3KP8A 5ECLB 3EURA 1URMA 3M3MA 2JSYA 2LJKA 2DBCA 4MA9A 1MDJA 2F9SA 3IXRA 1KNGA 1OC9A 1K0OA 3CRTA 1XBSA 1BEDA 3L9SA 2MMNA 3G7YA 1ZCPA 2H1AA 1EP7A 4IQAA 2VCVA 5HFGA 4TXOB 4BPYA 3I9V2 3BBYA 3LGCA 4YQUA 5A4VA 3LFLA 2R5GA 1OAZA 4ZILA 2F8AA 1GNWA 1TP9A 4OWYA 4ZB9A 2TRXA 5F05A 5J3RA 3UIWA 3KGKA 1JHBA 4OO5A 1MD4A 1XFLA 2C4JA 2X8CA 2H01A 5B8AA 5HQPA 1OC3A 3TOTA 2LNTA 2M72A 5LCZA 3QAGA 2HE3A 5ECMB 2PVOC 2PVQA 3GKMA 2GTUA 2MMOA 3KCMA 3Q19A 3GUSA 1A8YA 4TR1B 3ERWA 3H1NA 4AJ8A 1XPVA 2H71A 3HHVA 1GUKA 5CRDA 5ECKB 3UMAA 1M0UA 1SL2B 1ZOFA 3G9BA 4ZL8A 1X0RA 2H0GA 1OKTA 4NHWA 1ZYQB 3CXGA 3LYPA 3BD2A 4ZBBA 1PGTA 2H74A 5F06A 3RHBA 2HZFA 2MBSA 4POLA 4TN8A 1FVKA 4ZBDA 3L78A 2A4VA 2QSIA 4G9HA 3C73A 4DSSA 5D96A 3KTBA 2PERA 3D0ZA 2HLSA 3GX0A 4KE3A 1HNAA 3FZ5A 4BA7A 2CQ9A 3TKRA 4RUVA 1XCCA 3EYTA 4XHMA 3EMPA 2M80A 3ZMKA 3HJPA 3NOFA 4I2UA 4J2FA 1WP0A 1SJ6A 1F3BA 5DALA 2YANA 2DJ0A 1SJZA 5ECNB 1GWCA 4BVYA 5D8IA 3APQA 2LQOA 4KSMA 1XXUA 1TU8A 3I6AA 3VK9A 2X8GA 2H6YA 5CYYA 2WCIA 4K9ZA 2H66A 2OE3A 3JCML 3RHCA 1GLPA 2B5XA 1PSQA 2C1YA 1T8EB 2X64A 2WS2A 2WJUA 4DEJA 1XOAA 1S3DA 1G6WA 1U6TA 5D9TA 2AB6A 2NVLA 2PN8A 1ERUA 1I5GA 3QR6A 2E0QA 1THXA 3VURA 1USBA 4IELA 6GSUA 3GA4A 2DMLA 1AQXA 3TKQA 3TKSA 1SKWB 4N10A 2MMZA 1Y25A 1PKZA 3ZTLA 3DWVA 5FHIA 4LA1A 4K7IA 2JZTA 5COHA 3P8WA 2CVKA 2WGRA 3VPTA 2OBKA 1FG4A 3HDCA 1YEPA 3UOMA 3W8SA 1FAAA 5IMZA 4GF0A 2AV4A 4PGTA 5F0GA 11GSA 3APOA 3P7XA 2HRFA 1S3CA 2FWEA 1GSFA 3HD5A 4MZWA 4GSTA 4PQIA 3Q6OA 2JZRA 3DMLA 5G31A 3FEUA 1M2BA 4MJCA 4I6XA 2I3YA 3VFIA 6GSWA 1TI1A 2B3SA 2BTOT 2GZZA 1F6MC 4NHZA 3UJ1A 3ERGA 2WDUA 1SKSB 2H30A 4D73B 2RUFA 2C0EA 3OR5A 3LG6A 2FLSA 2LRCA 1WMJA 2J9HA 1O81A 1O7UA 2H6ZA 1R7HA 3TJGA 4Q5FA 2XBQA 2JL4A 4Q5RA 3A2XA 2CX3A 2YP6A 1TU7A 3DVWA 1WE0A 4YH2A 1BG5A 5D9VA 1DE1A 5G2ZA 2CX4A 5H5SA 5DVBA 4F0CA 4IQ1A 3IDVA 18GSA 3DGQA 3ZZXA 1FO5A 3ZRDA 4I8BA 4NV2A 4OCEA 4K1FA 1ZGNA 4TR4A 2VCZA 2V6KA 4QL7A 4RI7A 5IO0A 1T4YA 4XS4B 1E6BA 1G0TA 3IE3A 4EXJA 3HYPA 3KXOA 4IP6A 1YDKA 1XZOA 1YF1A 2FNOA 4KW6A 4LLRA 5EPFA 2IWTA 5HFIA 2IFQA 4IBPA 5AISA 2WULA 1O8WA 5D9WA 2LRTA 1Z9HA 3VI7A 3ED3A 3LEFA 3CTGA 4IS0A 3WGXA 3O76A 1TTZA 2ZUPA 2GLRA 2QGVA 4MZBA 2VM1A 4HU7A 3F6DA 5KN0A 4N0VA 3WYWA 4HJ2A 3QAWA 6GSVA 1RW1A 3H79A 1SD9A 2O7KA 4ZIJA 3VWWA 4NWYA 1VF2A 1RQMA 3KP9A 5DCGA 3H4KA 5KEJA 4V2LA 1SKRB 4K0GA 3LORA 2VL2C 2ON7A 3TDGA 1M9AA 2TRCP 1JZDA 1XWGA 3CBUA 1PA3A 3ZIVA 1T4ZA 2HT9A 2LEGA 3FKFA 4OFTA 1K0CA 1Q98A 4O7HA 4X1UA 4FYCA 3UBKA 4X43A 2EIQA 4EO3A 1XOBA 2L5LA 4JE1A 1Z7PA 4E8EA 3QAVA 1SK1A 2PGTA 2I9HA 5B6MA 3UVHA 2REMA 4WBRD 4BVXA 4GRFA 1K3OA 4XTSA 1EV9A 5L71A 4AGSA 1SK2A 5ENUA 2CVBA 5ECRB 1ILOA 4GQFA 4K0NA 5ECSA 2V2GA 3LYKA 3FR6A 3GYKA 1Z5YE 4IN0A 4FIWA 3IA1A 4LMWA 1DE2A 1AIUA 3U6VA 4I97A 5IMDA 3BCKA 1HD2A 2B1KA 1SK0A 5IMCA 2YWMA 2YJHA 2H76A 2RLIA 4F0BA 4K2DA 2K8SA 5F8BA 2BMXA 2MYGA 3F9UA 3L4NA 4GCIA 1EWXA 4MJAA 4MJEA 2L57A 4EL1A 2LV3A 1ERTA 4N11A 4ECIA 4MJBA 4IHUA 3IRAA 1R5PA 1NHOA 3QPMA 3HVSA 2C80A 1WIKA 8GSSA 5CAXA 2LJAA 3D4TA 4HQSA 1Z7RA 2VOCA 1R5AA 3E9JB 1XW5A 2GT5A 5DBQA 1GL8A 1YQ1A 3TRPA 3EE2A 3E3EA 4YAPA 12GSA 3F4TA 3GKNA 3KD0A 3HY2A 4DSRA 1VF1A 2V6OA 1K0MA 2XPEA 3N9JA 2LNSA 4POKA 1WJKA 2NBSA 4MH2A 5J9CA 3FW2A 3P2AA 1KEBA 3F4SA 5CRHA 3D21A 3ZITA 1EGRA 2YJ7A 1T1VA 5C00A 5IM9A 1EEJA 3NIVA 3KH7A 1EP8A 3O3TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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