5J9CA

Crystal structure of peroxiredoxin asp f3 c31s/c61s variant
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
GLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEDKGEITASGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVSSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
publication title The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords peroxiredoxin Asp f3
total genus 48
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j9cA00
2VCTA 5B6MA 4OCEA 1YF1A 2C0EA 3TOUA 1AIUA 2KHPA 3BJ5A 2ON5A 2VLUA 1LU4A 2P5RA 3HY2A 2REMA 5H5SA 3GURA 2DJ3A 1T4ZA 1U87A 2YJHA 3IBHA 4LL1B 1PGTA 1QK8A 4NPBA 4ULXA 4V2LA 4AGSA 1G6YA 1KTEA 2O8VB 3DMLA 4OFMA 5ABRA 2CX4A 4FYBA 4JZQA 2HZFA 2QC7A 4N0ZA 3ZIVA 4HU7A 2LNTA 1B4PA 1K3LA 4XS6A 4ISDA 3D6IA 5F05A 3BBYA 3E3EA 1F3AA 1SYXA 2AUVA 4MMMA 2CAIA 2FCHA 3ME8A 1X9WB 1OE8A 4ZIJA 4PX1A 4TR1A 11GSA 4AJ7A 3WD6A 1GTUA 2DJ2A 3UEMA 4ECCA 5LNKe 3I6AA 4BVXA 2B7KA 2H1DA 2V6KA 2RIIA 2WZ9A 3LYPA 1V58A 1SJZA 1XZOA 1TDIA 2RM6A 2VCXA 2H6YA 4MF6A 3IPZA 2YP6A 4GSTA 4K7OA 1HYUA 3IHQA 5F0GA 2X64A 3GN3A 4EKZA 1V98A 3QFAC 1QMVA 5CO3A 1ON4A 4QL9A 3M9JA 2TRXA 1XWCA 4IW9A 1EGOA 4Q5NA 3D5JA 2IPAA 3ZRDA 1K3OA 1NSWA 4YH2A 1CQGA 4MZCA 3WT1A 2HRNA 3RPPA 1M9AA 3V1WA 3F8UA 1A0RP 2EC4A 2VO4A 3SWLA 5IO0A 3QAWA 3PINA 4PQHA 2H71A 5CYYA 4HQSA 1K0AA 4ACSA 2Z9SA 4AF2A 4L5LA 2HXKA 2HZEA 4MK3A 2LRTA 1OC9B 2WRTA 3GKXA 1AQXA 1BAYA 3QAVA 3QFBC 3A2WA 1THXA 2WJUA 5AIXA 2CA8A 5JCUA 3IXRA 3HA9A 2YWOA 2H76A 1XVQA 3LG6A 4WBRD 3C71A 1ABAA 20GSA 4HUAA 2XPEA 4HJ2A 2FA4A 2GLRA 2M46A 5C00A 3ZITA 3KMNA 2LJKA 3ZVJA 3GA4A 1PKWA 3GNJA 5ECMB 3BCIA 1OAZA 1GTBA 5B8AA 4DSRA 1PSQA 2WCIA 4AJ6A 1BEDA 4NHZA 5G30A 12GSA 2N5FA 4POKA 2E2MA 5CP1A 1BG5A 3D22A 5DCGA 1GUHA 4WKWA 2EIQA 4HQZA 4TR1B 2PERA 3TJBA 1ST9A 2F51A 1K0DA 2VL3A 3GV1A 4MDCA 4XS1A 1FO5A 4I6XA 1GSUA 4YAPA 2GT6A 1N8JA 1OKTA 2AV4A 1MD4A 3LSZA 2CZ3A 5HR0A 2OE3A 3LORA 2HFDA 2JSZA 4I8BA 4LMVA 3EYTA 1UA5A 2B5XA 1V40A 2HE3A 3TKQA 3TCOA 4PQIA 3HD5A 1JZWA 3IRAA 3WYWA 5FT3A 4MA9A 1U3IA 1TTZA 6GSTA 2DMLA 2IMDA 4YAVA 4PNGA 3J7Yk 3KIJA 1GSYA 2VUPA 1K0MA 1O81A 4K7IA 3TKPA 4P3YB 1XW6A 2F8AA 3LJRA 1LJRA 2I9HA 2M72A 1M9BA 2IMEA 5B6NA 2HZEB 1ILOA 2O85A 3KD0A 1ERVA 2OE1A 3ED3A 2IMIA 4GCIA 5EY6A 3HJPA 2WS2A 4EDYA 5H5QA 5DCHA 1O8XA 4GTUA 4TR4A 4ZB8A 2LS5A 4TXOA 2VIMA 4PUAA 2I1UA 3TKRA 4BVYA 4POBA 3TJFA 4OO5A 2ZNMA 3CSJA 1HNCA 1NHOA 3CSHA 3UIWA 3GKNA 4TRXA 3KCMA 4L8EA 2FNOA 1GSQA 4IGJA 3FY7A 1H75A 2O87A 1QXHA 1FOVA 4HU9A 2WB9A 1R7HA 2L4QA 2GQMA 3DXBA 1SL1B 4XTSA 5ECKB 1A2JA 1PRXA 3U5RE 4MJEA 4V1Ag 2VCZA 2WGRA 1WMJA 1Q4JA 1U6TA 5IOWA 1AQWA 5IM9A 1V2AA 1HD2A 2GSSA 3VI7A 2AYTA 3I9V2 3IR4A 2MMNA 4IHUA 3OR5A 4YQVA 1M2BA 3QR6A 2OE0A 1PX7A 1VF1A 1QFNA 2I3YA 3HJMA 1K0NA 2XPDA 4IVFA 1HNAA 3MSZA 3HVSA 3U6VA 1URMA 4ML6A 3DD3A 3FZAA 1F6MC 1OKDA 1MDKA 3ZFLA 2H0GA 2NDOA 2CVKA 4XIHA 3HYPA 2C3QA 2AAWA 1BJXA 1M99A 4EO3A 2LQQA 1JLWA 3GUSA 1F9MA 2RUFA 4POLA 5DVBA 3ZLPA 2LTKA 2E0QA 3L9VA 3IE3A 4HDEA 4TOPA 4WXTA 4IQ1A 4O32A 2VOCA 3G7YA 3L4NA 4IS0A 5GAPD 2QGVA 4NAXA 4PQ1A 1K0CA 4ZILA 19GSA 3VWVA 2QSIA 2H19A 4HZ4A 4KA0A 1PD21 3CSIA 3PGTA 4POMA 1SKSB 3KTBA 2FD3A 1TI3A 2H72A 2C0DA 4ECJA 2MMZA 5CNWA 1S3DA 1XWKA 2DIYA 1EEMA 2ES7A 3G9BA 3W8JA 4XRAA 4F2IA 3HCZA 2NTOA 1SU9A 2PPTA 1XBSA 4OO4A 4WR5A 3NZNA 2FWGA 1SENA 1JZOA 1AUCA 4TXOB 3R2QA 5J4UA 2X8HA 2WULA 2RM5A 1Z7PA 4O5RA 3CRTA 3J7Yb 1AW9A 4MCUA 5HFKA 1I9DA 2B1KA 2PWJA 2YN1A 4G9HA 2FA8A 1VRSD 3I69A 1SJ6A 2O7KA 1YY7A 5DALA 3M1GA 2K8VA 2V2GA 1TU7A 4DSQA 1UVZA 3A3TA 3CBUA 1FVKA 2IL3A 3RBTA 4XS4A 1XWGA 3WT2A 4CW9A 2PN8A 1WPIA 3CYNA 4KAEA 5ECOB 1GTAA 5CREA 1WWJA 1DBYA 4LA1A 3FK8A 4PUFC 1TK8B 1GULA 2FGXA 3TOTA 2DJJA 5ECSA 5A4UA 2DJ0A 2HLSA 4BWQA 4ZL8A 3F4TA 3F63A 3VFIA 2VLVA 3FZ4A 1HQOA 4O92A 1O7UA 3DEXA 4IP6A 3FHKA 6GSXA 3TGZA 4KUNA 2J9HA 3FR3A 1JFUA 1ZMAA 1PA3A 5A4VA 3Q6OA 1FW1A 4TN8A 3IA1A 1XVWA 5ECNB 4KDUA 3RHBA 3DYRA 3IV4A 2NPBA 1QUWA 3UMAA 1KBNA 1TP9A 5ID2A 3ZFBA 3HHVA 1ZGNA 5AISA 2H01A 2DBCA 3CTGA 2J23A 2V1MA 4G10A 4FH8A 2H6XA 2XC2A 1FAAA 1NHYA 1MTCA 3CMIA 1T00A 2OA7A 3L9SA 2H73A 2JZSA 3N9JA 1EWXA 2PVQA 6GSVA 1XW9A 4EC0A 3ZL5A 2MBTA 4K7NA 4RI6A 1G7EA 2FY6A 3TDGA 3MNGA 1OC3A 5DJMA 1SD8A 3UL3A 9GSSA 1USBA 1T8EB 8GSSA 3C8EA 1CQHA 2FWFA 5DJLA 3P90A 2HSHA 2P5QA 5E4WA 5DALB 2IN3A 5ELGA 4I2TA 3VPTA 2VCVA 2QKEA 2VLTA 3C1RA 5F07A 7GSSA 2DMMA 2H1GA 3IOSA 3GH6A 3C1SA 4XS4B 4GSNA 3QDNA 16GSA 4IJ3A 3DVXA 3WGEA 2LUSA 2VAFA 4KB3A 2TIRA 5KN1A 2ALBA 1PKZA 1K0OA 1X5DA 4KGIA 2VL9A 5IMVA 2L6DA 3L0HA 2GZPA 5ECQB 2H74A 5G2ZA 5KN2A 2VD1A 4GF0A 1R5AA 4FIWA 2VM2A 3E9JB 2YWNA 2DLXA 1GWCA 2DIZA 1VF3A 4K6XA 4GWRA 3KTLA 2BMXA 1GLPA 4N11A 5JWQB 1YKAA 2GS3A 4Q5QA 4MF7A 5FHIA 1GP1A 2L4CA 3DGQA 5EVOA 3ZZXA 3QMXA 1X0RA 2DJ1A 2AB6A 2C80A 2H0HA 4BL7A 2NBSA 1AC1A 2B6MA 22GSA 2L6CA 4WETA 3F3QA 5ID2B 3M0FA 2YWMA 1RK4A 2KP1A 4PXOA 1MEKA 2H1AA 1EP7A 5IOXA 2GT5A 1A23A 1XIYA 5ECPB 1S3CA 1RQMA 5HQPA 4HI7A 1GUMA 3BOAA 4ZL9A 3GIXA 1MD3A 1AQVA 3APOA 5FWGA 3TJKA 5IMZA 1X9SB 3KH9A 1ERUA 2N5AA 1SYRA 3ZREA 4E8HA 2PGTA 4WR4A 3HVXA 5HR1A 1O73A 3NOFA 3LQ7A 3NIVA 2YPMA 4RQXA 2X8CA 4EXJA 2HRFA 1B4QA 3H8QA 10GSA 3US3A 2LNSA 1QGVA 1H4OA 4DSSA 14GSA 1ACVA 3TB2A 2R5GA 2TRCP 2H30A 4KE3A 1OC8A 4DEJA 1WE0A 4QL7A 2B3SA 2GQLA 2FHEA 4K1FA 3LYKA 1GH2A 3FRCA 4HOJA 3EU4A 3EU3A 4G19A 2XBIA 3HXSA 1FG4A 2FWEA 2IWTA 2KUCA 3D4TA 1T4YA 2L5OA 4TW5A 1GRXA 1GLQA 4J56E 3EINA 3QD9A 2MYGA 2YJ7A 2X8GA 3TJGA 1K0BA 1U3AA 5C04A 3GSTA 2ZCTA 5JWRB 2YV9A 5DAKA 3D0ZA 4ML1A 1VGLA 17GSA 5G5EA 3UVTA 1LBKA 1A2MA 1NM3A 4ECIA 5B7CA 4JR6A 1TRSA 3GKMA 1PMTA 2CVDA 1R5PA 1AXDA 2I4AA 5ELAA 2FUG2 1BX9A 3ISOA 4JRRA 3ZMKA 2HI7A 6GSWA 4PGTA 4K0NA 4AJ8A 3EVIA 5F8BA 4EE0A 3ZIJA 4IP1A 1M2AA 4NV5A 1TU8A 1X5CA 4RQRA 4BA7A 2BTOT 3HZ4A 2L5LA 5D9VA 3JCML 3P8WA 2OKAA 3KMOA 4HEA2 3C7MA 1ERTA 3K8NA 3C73A 1WJKA 1Z7RA 4TR3A 3L9UA 3FR6A 2GSRA 1A2LA 3KH7A 2GDRA 1YF0A 5GZZB 5J3RA 1SKRB 1PL1A 2LRCA 3EE2A 4I2UA 2JACA 2OBKA 3IDVA 1S3AA 4MLYA 3EC3A 5H5RA 1F37A 5IPHA 1IYIA 3KEBA 2RLIA 1B48A 4IBPA 5COHA 2DC5A 1TK0B 4KH7A 3GYKA 1TRVA 3VWXA 4F82A 1GSDA 1N2AA 2IJYA 3ME7A 5CRDA 3CRUA 4NWYA 4ZBDA 4DSSB 2YOIA 4L5OA 4TXVA 5LCZA 4TKYA 2HSYA 2VL2A 4IJIA 4DVCA 3BCKA 2BJXA 1EOGA 2C0FA 5G5FA 3M3MA 4RUVA 1M2DA 2E7PA 1FHEA 3IK9A 1THOA 5IMCA 5GAND 1DSBA 4KDXA 3VWUA 2LKUA 2PMTA 2LJRA 5JCGA 3IAM2 2CVBA 3F4SA 3TKSA 4ID0A 5J5NA 13GSA 1EP8A 4ZL7A 2AJQB 2KLXA 3DWVA 2H70A 3O6TA 2MMAA 3CTFA 3QOUA 1Z5YE 5DAKB 5B8BA 1E6BA 4KDYA 1XFLA 2VCQA 3VLNA 3TRXA 1U88A 3CXGA 5KN3A 4N0VA 1W89A 4EDZA 1SKWB 1RW1A 4GQCA 2YZUA 1W4VA 3KJYA 4EVMA 2HT9A 4HJMA 4ZB6A 4KSMA 2IIYA 3GL3A 1XXUA 4PNFA 3DKSA 4GLTA 2C3NA 5D9TA 3FEUA 4OCFA 4TVEA 4K9ZA 4KNDA 3RAZA 5J41A 5DQYA 2OBIA 4FO5A 2P0GA 3EWLA 2XBQA 3Q19A 2JZTA 5IIZA 3GHAA 3PH9A 2R4VA 2HYXA 4IN0A 1EZKA 3RPNA 5G31A 4TR0A 2N5BA 5D73A 3TKSE 4CDOA 1UC7A 3UVHA 3TRPA 1DUGA 2AHEA 1UN2A 1OYJA 5HFIA 4X0XA 1E2YA 5J9BA 1XW5A 1ZOFA 3IK7A 1OE7A 1R4WA 2H1BA 4MP4A 1TRWA 1Y6EA 1PN9A 2FWHA 3F4RA 2JZRA 2KP2A 1J08A 1SD9A 3A2VA 2KOKA 1Q98A 4Q5RA 5INYA 1X9MB 4GSSA 2C8UA 1AAZA 4XHMA 2C3TA 1SK1A 2YWIA 1DE1A 3ERFA 3TUEA 2CAQA 5ECLB 2CQ9A 3ERGA 4OFNA 1EV4A 2D2ZA 4ILFA 1T7PB 4BWSA 5IPGA 2K6VA 5D96A 1SL0B 3ERWA 4KW6A 2IFQA 1WIKA 1ERWA 3E0UA 4YQMA 4ZBBA 2LEGA 2GTUA 4JR4A 2PUKC 1XWBA 4NXIA 4NMUA 4WEYA 4N30A 5IMFA 4JBBA 3ZVJD 2WDUA 3AY8A 1WRYA 3M9KA 4J2FA 2JADA 2H0IA 1KEBA 3D21A 2LRNA 2K8SA 1TRUA 2GSTA 1WP0A 1DE2A 5HR3A 5CRGA 2M80A 3VURA 5CRWA 4MJCA 4MABA 3KXOA 3WGDA 5A4WA 1GSFA 2HNLA 2F3MA 3HVVA 1KNGA 3EMPA 2H8LA 2VL2C 2A2SA 2MZCA 4KSOA 1B9XC 3UJ1A 2L57A 2LJAA 3F3RA 5IO2A 1V9WA 2C0GA 3M8NA 4HS1A 1QQ2A 3O76A 3RDWA 4V2NA 3TKSC 2A4VA 3DRNA 1GNEA 3GRXA 3MWHA 4E8EA 1Z6MA 2CT6A 2DJKA 2C4JA 5F06A 1HNBA 2G2QA 4ZBAA 2H75A 2CZ2A 1NW2A 3EURA 4MPFA 1FB6A 5KEJA 2YCDA 3GFKA 4N10A 4OFTA 2R6KA 1K3YA 4K2DA 5D9WA 1VF4A 5DDLA 2LSTA 1ZZYA 1M0UA 3DIEA 1WOUA 3APQA 3IC4A 4KCAA 3GKKA 1X5EA 3F6FA 5AIVA 5D8IA 4O7HA 2B5YA 2H6ZA 1TOFA 4WF4A 1YQ1A 4LMWA 4OD7A 3S9FA 2IFQB 2XHFA 1TI1A 3DVWA 3F9UA 4MZWA 3VPQA 4H86A 2JSYA 3LWAA 4GRFA 4YQUA 1Y25A 1SK2A 4FYUA 2JU5A 3FW2A 1PQNA 1GUKA 4MJAA 3KZQA 5IMDA 3I43A 1XPVA 2H66A 3H79A 3P7XA 1O6JA 2ON7A 2LQOA 5JCWA 3GMFA 5L71A 3MAKA 1F3BA 4XRDA 4L0UA 4V2MA 1G0TA 1XOAA 1A8LA 4D73A 1EOHA 4EF0A 3TRQA 5IQYA 1PX6A 2VD0A 1TK5B 1V57A 4NV2A 2F9SA 3G7IA 5DQSA 1O85A 3VWWA 1JZDA 1I5GA 1TXXA 2L59A 1JZRA 3LFLA 1XCCA 2F8FA 1YEPA 3QAGA 1FB0A 2PVOC 4PURA 5HFGA 4JU5A 3HDCA 2GSQA 3FZ9A 1BYEA 2OADA 5JWOB 2EIOA 5ENUA 4I97A 1FVJA 1XWAA 1TKDB 3VK9A 5A5KA 5GSTA 3UBLA 2GZZA 1MDIA 1JLVA 5CRHA 2FLSA 4MF5A 3LEFA 1IYHA 3GTUA 1GNWA 3PR8A 2MMOA 3H1NA 3G7JA 1JHBA 5GSSA 2B7JA 1MDJA 3IAS2 2G0FA 4QQ7A 3VI5A 4EL1A 4LL4B 4KX4A 1A8YA 2RUEA 4KCEA 2PU9C 2C1YA 2V6OA 3LGCA 3HZ8A 2NVLA 5D93A 4GXZA 4K0GA 2GGTA 4ZB9A 5IMAA 5G1LA 2IMKA 4V1Ap 2GZYA 4Q5FA 5EL8A 1Z3EA 4OWYA 1A0FA 4MH2A 1A24A 2IMFA 3KGKA 1TJDA 4NHWA 1J9BA 1PL2A 2K18A 1ZL9A 3W8SA 3D4MA 1GSSA 3A5WA 1SK0A 2V32A 4IKHA 2GQKA 1T3BA 5AN1A 3GX8A 2YZHA 1EEJA 1G6WA 4WBJA 3RHCA 3FZ5A 3HJOA 3GSSA 5AGYA 1VF2A 2WFCA 2JL4A 2O89A 1GSEA 4LLRA 5G1KA 3UARA 2MBSA 2PBJA 3W6GA 4IELA 6GSUA 4I5QA 2OJLA 4WF5A 4X43A 4F9ZA 4CHSA 1F2EA 3ZMLA 3O3TA 4HZ2A 1G7OA 1C72A 1YDKA 3N5OA 4D73B 1B9YC 1M7TA 4G2EA 3ZYWA 2I81A 3H93A 1YKCA 1EV9A 3GH9A 5EPFA 4BPYA 2CV4A 2R37A 4X1UA 4J57E 1Z9HA 1T1VA 5ECHB 4MZBA 5ECIB 3APSA 4ZXGA 1ML6A 1SJIA 1ZYQB 3LXTA 3QPMA 18GSA 3FR9A 4Z7XA 1EGRA 6GSSA 1ZYEA 4MJBA 5LD0A 4MPGA 3SBCA 2V41A 5KN0A 4F0CA 3H4KA 4IQAA 4OMVA 1SL2B 4F0BA 5DBQA 3LXZA 3KP8A 4FYCA 5E59A 1Z6NA 2ZUPA 3GTUB 3KP9A 5CAXA 2VM1A 3A2XA 2DSAA 1B8XA 3KM6A 1GL8A 3HKRA 1OVNA 1YZXA 3Q18A 3UOMA 4F03A 1ZCPA 2B5EA 2R2JA 2VCWA 1TW9A 5ECRB 3GX0A 4ECBA 4MH3A 3UBKA 3BD2A 4JEDA 4GQFA 1YEXA 2R3XA 3EMXA 2YANA 4RI7A 2YNXA 2P31A 1BQ7A 1J0FA 1O8WA 5D9XA 3TJJA 2OACA 2CX3A 2A2RA 1YJ6A 2LV3A 1GTIA 3Q74A 3FKFA 2YV7A 2X99A 4JE1A 1XOBA 3P2AA 4EUYA 6GSYA 5J9CA 4L0WA 3FYGA 2K9FA 4K8MA 5HR2A 3L78A 2B1LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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