5KN3A

Recombinant bovine skeletal calsequestrin, low-ca2+ form
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
GLDFPEYDGVDRVVNVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMDELILELAAQVLEDKGVGFGMVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSVYVFKGDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDDNKLIGYFKNKDSEHYKAYEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVSFVEAHKRSTLRKLKPESMYETWEDDLDGIHIVAFAEETDPDGYEFLETLKAVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFNIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of Post-Translational Modifications to Calsequestrins of Cardiac and Skeletal Muscle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calsequestrin
molecule tags Metal binding protein
source organism Bos taurus
total genus 101
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn3A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn3A02
5HFKA 3KZQA 2I3YA 3W8JA 1GSUA 2R37A 1FVKA 1EOGA 2L4CA 5ECOB 3O76A 4K0NA 4WETA 4HJMA 3LSZA 4K7OA 5D96A 4HI7A 2OA7A 1UVZA 1YEPA 3UJ1A 2L57A 1B9YC 1GSSA 1Z3EA 3TKQA 3I6AA 3QFBC 2H8LA 5J41A 2X99A 1X0RA 1TK5B 2PUKC 5IPHA 4KH7A 4HZ4A 2GT6A 1MD4A 1AIUA 2GSTA 5ECKB 1TK0B 4RI7A 3A3TA 4MP4A 4BWSA 2L59A 3DEXA 20GSA 4RQXA 4HU7A 1U3IA 3LXZA 4LL1B 4TR4A 4IW9A 3BCKA 1USBA 6GSWA 1Z5YE 2MMAA 2AUVA 4MZCA 2EIRA 4KE3A 1U87A 4PUFC 1NM3A 2H75A 4LMVA 4ZL9A 4RUVA 1M2DA 1O7UA 1WJKA 3C73A 5DJMA 1PX6A 1N8JA 1GUHA 2OADA 1E6BA 2GZPA 1K0AA 4XCSA 2KP2A 1QFNA 2TRXA 3EURA 2I1UA 3TUEA 1B8XA 1A0RP 1THOA 3HVXA 2YN1A 4BA7A 4DEJA 4OWYA 5LNKe 3W8SA 3UMAA 2DJ3A 1X5EA 3VLNA 3CBUA 1SK0A 4Q5NA 4BVXA 3UARA 2WGRA 2GS3A 1PKZA 3WGXA 2ZUPA 1HD2A 2V1MA 2PVOC 1ML6A 1V2AA 3L9UA 5DVBA 2VCXA 1JZWA 1VF4A 1OC9B 3S9FA 4H86A 1LJRA 3HJOA 3ZREA 4DSQA 3TJBA 1BYEA 4WR5A 4XS4B 3JCML 1XWGA 3HVVA 1PN9A 4IKHA 4PNFA 3TRPA 4LL4B 2LS5A 4JR4A 3P7XA 1GLPA 4KA0A 4JU5A 1F3BA 18GSA 3HKRA 4MJCA 4Z7XA 1SKWB 2OJLA 1PA3A 2BMXA 4MJAA 2GGTA 3KP8A 1JLVA 3RPPA 2WB9A 1AW9A 1T1VA 3GTUB 4EXJA 4ZBBA 2LTKA 2FNOA 3ZVJD 3GMFA 2PGTA 3UBKA 3EE2A 1BJXA 4KSMA 3ZVJA 3HXSA 3QAGA 2TRCP 2HI7A 4L5OA 1F37A 3EWLA 1Z6NA 2L6DA 4CHSA 2VCTA 2ON5A 4KAEA 4X43A 2LKUA 5DAKA 2WRTA 1I9DA 3NOFA 1JZDA 4TXOB 2L5LA 2HFDA 2C3TA 1ABAA 3TJJA 3IPZA 2LRNA 2PWJA 1QK8A 4LMWA 4ECCA 4OFTA 3J7Yb 4PX1A 3GSTA 3N9JA 2JSYA 4ULXA 3EMXA 2J23A 2VCWA 3HZ4A 1BEDA 2H71A 5IMZA 3AY8A 1O73A 1VF1A 3QAWA 2HRFA 1Y25A 1DBYA 5B6NA 3APOA 4V2NA 2CVDA 4K9ZA 3CSIA 1GNWA 1B9XC 5AIVA 2F8FA 3M1GA 2FWFA 1AQWA 1SK1A 2VLTA 1EV9A 1B48A 1FB0A 3VPQA 2V6KA 1RW1A 1GNEA 1PL2A 1NHYA 1ERUA 1S3AA 2N5AA 1K3OA 5GAND 4ECJA 4HUAA 2LRTA 5AIXA 5B6MA 1M2AA 4YQMA 4I2UA 3HHVA 2B7JA 4EF0A 3UBLA 1WPIA 4MF7A 2K9FA 4DSRA 3I43A 2L5OA 5DALB 1C72A 1R7HA 3ERGA 4EO3A 2X8GA 2DIYA 1PX7A 4FO5A 5EY6A 1O81A 2VL3A 1J9BA 1GH2A 4GSNA 5IMFA 4CDOA 3IAS2 2HRNA 3KTLA 4MABA 3QMXA 3DMLA 1PMTA 2KUCA 3F6DA 5E4WA 1ERVA 4JR6A 3G7YA 4J57E 2E2GA 2VCVA 1FO5A 4G19A 3BBYA 5KN1A 4TR1B 2M46A 1SL1B 3M9JA 2XBQA 2F9SA 1WMJA 2LJRA 1Q98A 5CRHA 4LLRA 3C71A 4I6XA 1WOUA 4L5LA 4F03A 3DRNA 4YAVA 5IO2A 3TRQA 1TDIA 3F6FA 6GSUA 3HYPA 3J7Yk 2DMLA 2JZTA 7GSSA 1AXDA 3WGDA 4POKA 2NPBA 4GF0A 4IQAA 3IHQA 2B7KA 4NV2A 1G0TA 3FK8A 4NXIA 1XWKA 1A0FA 2LRCA 1YEXA 4KUNA 3LGCA 4ZILA 4MA9A 2P31A 3NZNA 2DC5A 4BL7A 1G7EA 1SL2B 1OC9A 5EPFA 4V1Ap 4ML6A 4ZB6A 4XS4A 4QL9A 3LQ7A 1X5DA 5A5KA 4YAPA 3M3MA 1GTIA 2RM6A 5EVOA 3PR8A 4WF4A 3CSHA 2GZZA 3MSZA 3E3EA 2YPMA 3H1NA 3F4SA 2V6OA 1TRVA 1UN2A 3IBHA 1V40A 2PU9C 1T4YA 1K0OA 3DWVA 1GSEA 3QD9A 3KM6A 4YQUA 3DGQA 5HFGA 4TXVA 1G7OA 2WFCA 2IIYA 3GTUA 4HU9A 4XTSA 1RQMA 6GSXA 2A4VA 1SKRB 1IYIA 2PPTA 2K8SA 1OAZA 3L0HA 2LJAA 4EC0A 1ON4A 5D9XA 2K8VA 3LXTA 2GQLA 1H75A 2LNTA 2YJHA 2R6KA 1B4QA 2HSYA 4TXOA 2IPAA 1MDIA 3CMIA 4XS1A 3UL3A 1M9AA 1YKCA 3R2QA 2YZUA 2NVLA 2O85A 1AQXA 4WXTA 1GTBA 1EGOA 1XW5A 5KEJA 5A4VA 1J08A 2VD0A 3V1WA 3SBCA 4I8BA 4J56E 1E2YA 4G2EA 1PL1A 5IPGA 2HYXA 4PQHA 2H1BA 3QFAC 5CRWA 2DJ0A 2R2JA 3L4NA 4MH2A 1LBKA 1TK8B 4HEA2 1UC7A 2VOCA 3ERFA 3M8NA 4GQFA 2MYGA 2H66A 2B5XA 2RLIA 3GV1A 2YNXA 3KEBA 3C8EA 3TKPA 4EDZA 3VWVA 3DKSA 2H76A 4N0VA 4WBRD 1HNBA 5LCZA 2FD3A 3GIXA 2J9HA 4ZB8A 3US3A 5CP1A 5D93A 3P8WA 4AJ7A 4OFMA 4BWQA 2YJ7A 5DJLA 3ZMLA 3DVWA 3F63A 1JZOA 1X9MB 2HLSA 2CX4A 2AB6A 3QR6A 4EDYA 4F0BA 3EVIA 5DALA 5A4UA 1XIYA 5DQYA 10GSA 1GULA 3A2XA 4RI6A 2DJ2A 5HR1A 2X8CA 2GQMA 3P2AA 4MK3A 1WP0A 1WE0A 1FB6A 3L9VA 1R5PA 1DUGA 2IJYA 1SYRA 4ISDA 1JLWA 5IMCA 2A2SA 2FHEA 4KB3A 3GA4A 3RBTA 2TIRA 2IMKA 4TR1A 2EC4A 4V2MA 1T7PB 2AHEA 5CO3A 2PN8A 2Z9SA 4L0UA 5ECLB 4DVCA 3KIJA 2WDUA 1TOFA 3GH6A 1X5CA 4HQSA 3GL3A 5HQPA 5DBQA 2A2RA 4MCUA 1XCCA 3GKNA 1T00A 2GDRA 5ECPB 3IC4A 5LD0A 2MMZA 5ELAA 4KCEA 1DE2A 5IQYA 3DIEA 1DE1A 4MJEA 3D22A 1F6MC 3FKFA 4BVYA 1TRSA 1K0BA 3DXBA 3KH9A 3UOMA 1YQ1A 4O5RA 3GUSA 1V57A 2H01A 4Q5QA 2QSIA 3VI5A 3M9KA 2D2ZA 3H93A 1AUCA 2MMOA 1G6YA 4G10A 2E0QA 5G5EA 2VCZA 1GRXA 4F2IA 19GSA 3D4MA 4O7HA 1AQVA 1M0UA 4L0WA 2RUEA 4FIWA 4AF2A 2B6MA 1MDJA 4NV5A 4EUYA 4GTUA 2VLVA 2YWMA 4KSOA 4P3YB 3TGZA 1XOAA 3UEMA 3VWUA 5J9BA 2GZYA 2H1GA 3HZ8A 3ZLPA 2VD1A 2LNSA 5JCUA 4D73B 1WIKA 5B7CA 1Z9HA 2B5EA 2IMEA 2VAFA 3LWAA 3FY7A 2C0DA 2GT5A 2OE3A 1JFUA 5H5RA 2YWOA 1XWAA 2FY6A 1AAZA 3IK9A 5IIZA 1X9SB 3ZZXA 3WGEA 2JACA 5H5QA 1YY7A 4KX4A 3TDGA 4Q5RA 2C1YA 5G5FA 3IK7A 3HY2A 1VGLA 4K7NA 1G6WA 2FLSA 4OCEA 3ERWA 3GKKA 3VI7A 2QGVA 4ZL8A 2PMTA 3C1RA 3CSJA 4AJ6A 3D5JA 2REMA 3O3TA 2GTUA 2MBSA 4GSTA 2YZHA 3G9BA 1JHBA 2CVBA 2L6CA 1O8WA 1K0MA 2K6VA 2OE1A 3L9SA 3G7JA 4Q5FA 2N5FA 1A2MA 5C04A 1XWBA 22GSA 1WWJA 3HJMA 2LQOA 2GSQA 3FZ5A 1O85A 5HR2A 2HNLA 2VIMA 4QQ7A 4PURA 2B3SA 1RK4A 4JZQA 1GUMA 4GRFA 1VRSD 2FWEA 2YANA 1GUKA 2M72A 2B1LA 2H6YA 5F0GA 4XIHA 1EEMA 3HJPA 3FR9A 2MMNA 3OR5A 2NBSA 1PGTA 2IL3A 4IELA 3MWHA 12GSA 2FWHA 3C7MA 1Z7RA 3KCMA 3BOAA 1O8XA 3EU3A 3I69A 1XXUA 2CVKA 4NHWA 4ZXGA 1FG4A 3BJ5A 4BPYA 3MDKA 4XRAA 4MF6A 2JZRA 4OO5A 3HVSA 4ACSA 3PINA 1ZYEA 2ZCTA 3GL5A 3FW2A 1SKSB 2C4JA 1XOBA 3IOSA 3K8NA 4GXZA 2DBCA 1EV4A 1TI1A 5KN0A 5JWOB 4HJ2A 2DMMA 3U5RE 3F3RA 5B8AA 2B5YA 4NWYA 3EYTA 3ME7A 1B4PA 4WBJA 3TOTA 1A8YA 2F8AA 2LSTA 1H4OA 2ON7A 2OBKA 3GKMA 3WT1A 3QDNA 1FVJA 2WULA 1LU4A 2E7PA 1K3YA 4IS0A 5AGYA 1EEJA 1ACVA 2IFQB 3CRUA 4OCFA 3WD6A 5JWQB 16GSA 5FT3A 2XPEA 5ECMB 3CTGA 1ERTA 4HDEA 2VL9A 3HD5A 2LQQA 5G30A 1M99A 1A24A 3NIVA 3IAM2 5FWGA 1SL0B 2YWNA 2BJXA 4WKWA 4LA1A 2FGXA 2IN3A 1GTAA 3GKXA 1GTUA 1V58A 1K0DA 3GHAA 3D4TA 3LORA 2P0GA 2CAQA 1WRYA 4D73A 3GN3A 3ISOA 2FCHA 3GNJA 5G1KA 4NPBA 4IP6A 4PXOA 6GSSA 2R3XA 3TKRA 4O32A 1HNCA 2CT6A 1ZOFA 3VPTA 3UAPA 2YWIA 2HZEB 2C0EA 2JZSA 14GSA 4DSSB 1TXXA 3F0IA 4EKZA 3TKSA 2MZCA 5IMVA 2O7KA 3ZMKA 3H4KA 4V1Ag 4MPFA 2CA8A 2H74A 3RHBA 1MEKA 1KEBA 4EVMA 2XC2A 1AC1A 3EC3A 1TKDB 2FWGA 4MPGA 2V41A 3PGTA 1Q4JA 1NSWA 2K18A 3TKSE 2VL2C 1KNGA 5FHIA 11GSA 2RM5A 4HQZA 4N30A 5C00A 3ZITA 5H5SA 5IMDA 5EL8A 2QKEA 2GSRA 5ENUA 1OYJA 2VO4A 1OKTA 4NHZA 4JBBA 2HE3A 4PUAA 3F4RA 5DDLA 2C3NA 3LFLA 5JCWA 1U3AA 1K0CA 3GURA 3VURA 1EP7A 2DJ1A 1PRXA 4L8EA 1ZZYA 5JCGA 1T3BA 2BTOT 2CV4A 5GSTA 3ZL5A 1MD3A 3GSSA 3QCPA 1GP1A 4J2FA 3TCOA 3N5OA 1GL8A 5ABRA 2WS2A 2EIQA 1XVWA 3GH9A 1N2AA 4XHMA 5GSSA 3E0UA 5IOXA 4TVEA 3U6VA 1T8EB 1PKWA 4JRRA 2VM1A 1XFLA 1Y6EA 2P5RA 1J0FA 1K0NA 5F07A 2H0IA 3CYNA 2JU5A 4KCAA 4PQIA 5JWRB 3ME8A 2AJQB 1BX9A 4F82A 5ECNB 4KDXA 2DJJA 1ZCPA 1GSDA 2IWTA 5ECQB 2H0HA 2FA8A 4ECIA 2IMDA 3D21A 4JE1A 3GRXA 5ELGA 2N5BA 2VLUA 5G31A 4O92A 4ID0A 4KNDA 2IFQA 4MLYA 3Q74A 3QAVA 1F3AA 4MJBA 1SK2A 4IJ3A 1XBSA 1ZMAA 4GSSA 4E8HA 1OVNA 2HSHA 1SYXA 1CQHA 3VK9A 3KTBA 3ZTLA 1CQGA 2AAWA 4MF5A 1YF1A 5J3RA 2DJKA 5D9TA 4EL1A 2YCDA 5GAPD 5D73A 2QC7A 2IMIA 3W6GA 3EU4A 1URMA 2AV4A 5ID2B 2CAIA 5GZZB 13GSA 1SJZA 3ZIJA 4ILFA 1GLQA 3Q19A 1TI3A 2EIOA 3FZAA 1W4VA 3P90A 5ECIB 3RHCA 5IOWA 1OC8A 2KLXA 5DCHA 5DCGA 1K3LA 2C0FA 2HZEA 2H73A 1ZGNA 4DSSA 1S3CA 3DYRA 1OE8A 4FYCA 3APQA 4TOPA 3IA1A 2H1DA 1SD9A 5E59A 3LG6A 1DSBA 2YV9A 2OE0A 3HCZA 4HZ2A 3MAKA 2O89A 3E9JB 3HDCA 5CRGA 3DVXA 4HOJA 4PNGA 1EP8A 2HZFA 2CX3A 2C0GA 1UA5A 2MBTA 2HXKA 1I5GA 4POMA 3IR4A 5D9WA 3KJYA 5CRDA 1PSQA 4ECBA 4TR3A 2CQ9A 4I5QA 3KXOA 5HR0A 4IP1A 4IVFA 1S3DA 2JADA 3KP9A 3FYGA 2O87A 3QOUA 5D9VA 5CYYA 4K7IA 1SENA 1Z6MA 3TRXA 4YH2A 2VM2A 4F9ZA 2YOIA 3LYPA 5G2ZA 4MZWA 2HT9A 4FH8A 1NW2A 1GSFA 4MZBA 2GVPA 3I9V2 3TJFA 2NTOA 2H6XA 4YQVA 4NMUA 1XVQA 4F0CA 3UVTA 3ZRDA 3M0FA 1OC3A 4WR4A 1QGVA 1VF3A 3CRTA 1NHOA 4POBA 3RPNA 4K8MA 4PQ1A 6GSYA 1TW9A 4K0GA 3IRAA 4X1UA 5F05A 4ML1A 2LV3A 4XS6A 2C80A 5HR3A 1JZRA 1V98A 1YF0A 1Z7PA 3TJKA 3TB2A 4OFNA 5INYA 1QUWA 1R5AA 3ED3A 2I9HA 1XPVA 5AISA 1FAAA 3D6IA 2GQKA 5COHA 1XZOA 2ALBA 1OE7A 4TN8A 4K6XA 1THXA 2DLXA 2V2GA 1TRWA 4IBPA 1ZL9A 1XW9A 2H1AA 1YZXA 4N11A 1M7TA 2P5QA 2PERA 2XPDA 4V2LA 1ST9A 2WZ9A 3TOUA 3IDVA 5ECSA 3ZIVA 2GLRA 1BQ7A 3FR6A 3TJGA 1BG5A 5J5NA 2R5GA 2RIIA 4I2TA 5CAXA 4MDCA 2JSZA 4GLTA 2AYTA 4I97A 2IMFA 2M80A 4GWRA 2I4AA 2R4VA 4AGSA 1EOHA 1KBNA 1KTEA 6GSVA 1SJ6A 1V9WA 6GSTA 1FHEA 2V32A 3BCIA 9GSSA 4IQ1A 1ERWA 3IE3A 3RDWA 2XBIA 3FHKA 4JEDA 4KDYA 1XW6A 2H70A 4IHUA 1A2LA 1W89A 3UVHA 1ILOA 2CZ3A 4OD7A 4AJ8A 2NDOA 5DQSA 5L71A 3FRCA 4IN0A 3QPMA 5KN3A 1GSYA 2KP1A 1HQOA 3KMNA 5A4WA 5ID2A 1HYUA 3GFKA 1A8LA 2GSSA 3G7IA 1TJDA 5G1LA 2OBIA 1SD8A 3BD2A 1SJIA 4TRXA 3LEFA 2O8VB 1MTCA 4WF5A 2VL2A 1X9WB 2YV7A 2KOKA 4XRDA 1R26A 3DD3A 2F3MA 5F06A 3UIWA 3PH9A 2FUG2 4TW5A 3O6TA 1F9MA 4E8EA 3FEUA 3IXRA 2PBJA 4TR0A 4ZBDA 3F3QA 1GSQA 2WJUA 4MH3A 3FZ4A 1XWCA 1PD21 3H8QA 2LEGA 5IO0A 2DSAA 4MMMA 1HNAA 2H0GA 3EMPA 5ECRB 4EE0A 1TU8A 2DIZA 4ZBAA 3GYKA 4PGTA 3A2WA 5KN2A 2C3QA 1YJ6A 3F4TA 3ZFBA 4NAXA 2G2QA 4RQRA 4HS1A 2LUSA 2OACA 2FA4A 5IMAA 3D0ZA 5CNWA 2H72A 1M2BA 3WT2A 1IYHA 2PVQA 1EWXA 1T4ZA 3VWWA 8GSSA 3RAZA 1O6JA 1EGRA 4ZB9A 1YDKA 1U6TA 1GWCA 4QL7A 3H79A 3A2VA 2OKAA 2C8UA 2G0FA 3KH7A 2JL4A 1A23A 2RUFA 3FZ9A 1TP9A 2X8HA 4IJIA 1TRUA 1M9BA 1EZKA 4TKYA 3KGKA 2VUPA 4OO4A 5CREA 1A2JA 2CZ2A 3SWLA 1F2EA 17GSA 2LJKA 4K2DA 4ZIJA 2H6ZA 5AN1A 1OKDA 1TTZA 1YKAA 2XHFA 5ECHB 1R4WA 2KHPA 2X64A 3IV4A 1QMVA 1ZYQB 4POLA 2WCIA 3KD0A 3ZFLA 2ZNMA 4KW6A 5D8IA 3GX0A 2YP6A 3APSA 4G9HA 2F51A 4OMVA 4FYBA 1MDKA 3GX8A 5HFIA 3F8UA 2E2MA 3F9UA 3VFIA 4IGJA 4CW9A 1QQ2A 3Q6OA 1BAYA 1PQNA 2I81A 5F8BA 1U88A 3EINA 5B8BA 3L78A 4KDUA 1VF2A 3FR3A 1QXHA 3HA9A 1FW1A 3CXGA 2L4QA 3WYWA 2ES7A 2H30A 3MNGA 4ZL7A 4GCIA 2H19A 4K1FA 4N10A 5DAKB 3A5WA 2B1KA 3TKSC 5J4UA 4X0XA 5IM9A 4FYUA 5J9CA 4GQCA 3LYKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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