5B6MA

Crystal structure of human peroxiredoxin 6 in reduced state
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-6
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6mA01
1XIYA 2PVOC 3TJJA 3CTGA 4K8MA 2FWFA 4BWQA 2M72A 1A2LA 4NV2A 2GSTA 3RAZA 2L57A 2O87A 4K1FA 4OFNA 1TK0B 2VLTA 3IK7A 2QC7A 4TR1A 2H1GA 3TKSE 3F6FA 3H8QA 2PMTA 4IBPA 3BBYA 4K0NA 1K0DA 1AQWA 3EU4A 2R3XA 3OR5A 4KAEA 1S3DA 4WKWA 3HDCA 2XPEA 5DVBA 3LJRA 3VWWA 4F03A 4CW9A 5DJLA 2V41A 1LU4A 5DALB 1XBSA 3QAVA 3TCOA 2K18A 5A4UA 3DRNA 3ZZXA 5HR1A 5ELAA 2CV4A 4BPYA 5F06A 2V6OA 1X9WB 2LTKA 3H93A 3GKMA 3QDNA 1TRWA 2O7KA 3FYGA 1PQNA 4MPGA 4QQ7A 3M3MA 1A23A 4PQ1A 3UEMA 11GSA 4ZILA 2VD0A 2O85A 4MJBA 2QSIA 2CVDA 2FA8A 2F8AA 1OC9B 3Q6OA 3UVTA 1AW9A 1OC8A 1QUWA 3DXBA 4OMVA 18GSA 3LYKA 3GFKA 3MAKA 3VWXA 5IMZA 1HNCA 4DSSA 1ERTA 4WR4A 2BTOT 2L4CA 2V1MA 2OE1A 5ENUA 2AYTA 3TRXA 4PNFA 5JCWA 3A2VA 3IV4A 2R4VA 3M9JA 2IN3A 1V2AA 2R6KA 1YKAA 1SD8A 2F51A 1PSQA 2WFCA 1THXA 2YV7A 2H1DA 4Q5NA 1VF4A 1Z6NA 5IOXA 2YWNA 2FY6A 2H76A 2HRFA 2LSTA 3TB2A 4EC0A 2C4JA 4FYUA 4X0XA 2H71A 4NHZA 3QAWA 5DCHA 4MH2A 3W8SA 10GSA 1V58A 3IHQA 3GKXA 2GQMA 2H01A 2ES7A 2G0FA 4GTUA 2H66A 4YH2A 4L0WA 1IYHA 2C3NA 1WIKA 3HD5A 1JZWA 2DMMA 4NV5A 3DYRA 4F2IA 1PMTA 5CRGA 4RQRA 1PKWA 5D73A 2VM1A 4TN8A 4TXOB 3GV1A 1FG4A 4GQCA 3ZMKA 3GYKA 2JZTA 3EINA 1EOGA 3M8NA 4MA9A 2VUPA 1YEXA 6GSTA 2DSAA 3F6DA 4KNDA 3IDVA 3I6AA 4TOPA 1GTUA 2WRTA 4GQFA 4XRDA 1EGRA 4POBA 2PBJA 4EL1A 2PUKC 2NTOA 4HEA2 1UVZA 4MLYA 2TRXA 2P5QA 1GTIA 1M2AA 1EP8A 1M99A 3D0ZA 5LNKe 2YZHA 5ECKB 4N0VA 4AGSA 2HNLA 4BL7A 3TRPA 5HR2A 4ULXA 3ERGA 2IMDA 8GSSA 2VCVA 4MABA 5IM9A 2HI7A 1U6TA 1PN9A 1K3OA 4ACSA 5IMVA 1K0MA 1PL1A 3C7MA 3VPTA 4HJMA 1K0BA 4BWSA 5DDLA 5JWRB 4K9ZA 4K7OA 3BCKA 1T1VA 4AJ7A 3KP9A 4K7IA 5A5KA 1PKZA 1MDIA 2CX3A 5HFGA 4K7NA 5IMAA 2PU9C 3F3QA 4O5RA 2AAWA 3M0FA 2PN8A 3D21A 5ECOB 5GSTA 4YAPA 3A2XA 4XTSA 2YOIA 1OVNA 1M9AA 2ZCTA 1PA3A 1MTCA 1H75A 2KOKA 1WP0A 3HJMA 5DCGA 5EPFA 1Z7PA 4TRXA 1TOFA 2H0HA 3WD6A 1M2DA 2C0EA 1N2AA 1ZGNA 4MZBA 2ZUPA 1ZMAA 1U87A 4YAVA 2LV3A 3ZYWA 3AY8A 3D5JA 3ERFA 1EOHA 4BA7A 3TKPA 2MBTA 2IWTA 1NW2A 4YQMA 1B8XA 1VGLA 12GSA 1PGTA 4PNGA 2N5BA 4POMA 2LRTA 4ID0A 1FAAA 4EXJA 2AUVA 3F4TA 3KMNA 1GSYA 1USBA 1YZXA 2K9FA 1FB0A 4EVMA 4O92A 1AC1A 2RM6A 3IE3A 4HDEA 1FVJA 5DQSA 3ZVJA 4HU9A 3RPNA 2JSZA 4YQUA 2H6XA 2VCQA 3C71A 1ON4A 2XBQA 1GUHA 5IOWA 1PRXA 3F8UA 1T8EB 3M9KA 2MMZA 1BG5A 4MMMA 4OO4A 1A8YA 2FHEA 2MMNA 4XHMA 2IPAA 4ZIJA 3ZVJD 1YQ1A 2H70A 4F9ZA 2TRCP 3LXZA 4MZCA 2H1BA 3HHVA 1NHYA 3L9VA 2JZSA 4K0GA 3F4RA 4I5QA 1R5AA 1EZKA 3PR8A 1G0TA 3APOA 5D8IA 5GAND 5IMDA 4DEJA 2OA7A 3I43A 3FW2A 5ECSA 3APQA 1XWBA 1XW9A 1U88A 3ZRDA 3GX8A 4BVYA 2RLIA 1QQ2A 3KJYA 1XZOA 4IP1A 3ZFBA 3GL3A 4DVCA 2BJXA 2L6DA 3TKRA 3HZ4A 5AGYA 3RPPA 4ECCA 3RDWA 1YJ6A 3G7IA 1TRVA 2HRNA 2ON5A 1I5GA 1KEBA 1ACVA 1MD3A 1CQHA 4N11A 4IHUA 6GSSA 1XWGA 5B6NA 4XS4B 13GSA 5J4UA 4MCUA 1OAZA 1YKCA 1FOVA 3GL5A 4YQVA 4ZB9A 1AQVA 2J9HA 2H75A 3SWLA 3CTFA 5H5SA 2C3TA 3U5RE 5INYA 1NHOA 1E6BA 1J08A 1GL8A 5FWGA 2IMFA 2XC2A 1M0UA 1A8LA 5IQYA 1QMVA 4KCEA 2VCWA 1V9WA 1ZYEA 2JU5A 4RUVA 3UL3A 2P5RA 3FR9A 2B5EA 1HYUA 3KP8A 1TI3A 2OACA 3W6GA 1V57A 1RQMA 4ECIA 1B9XC 1XW5A 4ZBBA 5G5EA 4OO5A 4D73A 2MBSA 5ECLB 4IQ1A 3VWVA 3C8EA 4IVFA 4TR1B 1RW1A 1WRYA 2HE3A 1WJKA 3DKSA 4HUAA 3GTUA 2ZNMA 1HD2A 2IIYA 2M80A 2IL3A 3CSJA 2C0GA 1XWKA 3A2WA 3BOAA 1JFUA 2C1YA 2H0IA 2LJAA 1BJXA 3UBLA 1K3LA 1O73A 3EWLA 4GXZA 2B7KA 4WF4A 4MJEA 6GSUA 3ED3A 1EEMA 1SENA 2KP2A 2CAQA 3DVXA 1GULA 1V98A 1HNBA 1QGVA 4AF2A 2B1LA 3A3TA 2MMOA 3P90A 4PX1A 3M1GA 4K6XA 1F3BA 1TU7A 5CO3A 1YDKA 2DJ0A 3N5OA 2CZ3A 3TRQA 3EU3A 2AJQB 3TJGA 3MWHA 1R26A 3EMPA 3ZTLA 3J7Yb 1C72A 4G2EA 1J9BA 1SL0B 3F4SA 4FYCA 4KSMA 1UN2A 3F0IA 3LQ7A 3GKKA 2X8CA 3GH9A 1B9YC 3FZ9A 3E3EA 3UARA 2JL4A 4DSSB 1B4QA 2LEGA 3GURA 1SJ6A 3FKFA 2F8FA 3FEUA 3PINA 3HCZA 3KD0A 1SKSB 4WBJA 2REMA 4JR4A 3CMIA 2C0FA 2H1AA 3TDGA 1SKWB 3ZREA 3GA4A 7GSSA 3IA1A 2H72A 2YCDA 3HY2A 3Q74A 3UOMA 20GSA 1SK0A 4ECJA 4ML1A 4OCFA 1F6MC 1J0FA 3QCPA 5FT3A 3BJ5A 3UMAA 2X99A 1XCCA 5ECIB 2LNTA 1GTAA 2GSRA 3Q18A 3ZFLA 3GHAA 2FCHA 2N5FA 2EIRA 1R4WA 3F63A 1K0AA 3TUEA 5KN3A 4L0UA 5GAPD 1F9MA 1OE8A 2DIZA 4POLA 2NBSA 2VO4A 5B8AA 5DJMA 3WT2A 1W89A 4LA1A 4OCEA 2IMEA 2B1KA 5ECNB 1AQXA 1HNAA 2JADA 2YJHA 4JZQA 1GRXA 2YANA 3DD3A 1GSSA 4PQHA 4EE0A 4RI6A 5AIVA 5DAKA 3RHBA 1PL2A 2V32A 5F07A 2OBKA 3IAS2 1TKDB 3E9JB 4X1UA 3O76A 2YV9A 2I3YA 3HVXA 2A4VA 3VPQA 2IFQA 4IS0A 3L9SA 2XPDA 2VIMA 5J41A 3EYTA 1MDKA 3DIEA 3KEBA 3KM6A 2YPMA 3I9V2 1FO5A 1AUCA 16GSA 2QGVA 2EC4A 2WS2A 2B5YA 1WMJA 4G10A 1A2JA 2MYGA 2YJ7A 3IXRA 2DJJA 1GLPA 2E7PA 3ME7A 1H4OA 3CSIA 2DC5A 5G31A 3NIVA 2X64A 4F82A 1G7OA 1E2YA 1SD9A 3TGZA 4JBBA 2VCZA 2FNOA 3KCMA 2ALBA 5IO2A 3L4NA 6GSVA 4F0BA 2GZZA 1VF1A 4MPFA 1GUMA 2P31A 5KN1A 1TXXA 5IO0A 1K0OA 3KH7A 2H6ZA 2OADA 3HJOA 4GSNA 5B8BA 3KTLA 1X0RA 3ISOA 2G2QA 4AJ6A 3P2AA 4MZWA 22GSA 4NPBA 4OFTA 2B5XA 5D96A 2YN1A 1PX6A 3TOUA 1X5CA 2N5AA 4KE3A 4JU5A 1FW1A 5J3RA 2NVLA 3L0HA 5D93A 1TJDA 1EV4A 2LUSA 1CQGA 4Z7XA 1Q98A 5J9CA 5FHIA 3O3TA 4I2TA 3LXTA 1KNGA 2GDRA 4KUNA 2HZEA 5IPHA 1EWXA 1BQ7A 2I81A 3IRAA 3O6TA 1UC7A 3KTBA 3EVIA 4KH7A 4N30A 4GF0A 2L5LA 2OE3A 4ZL9A 1M2BA 1X5DA 4G9HA 3U6VA 4POKA 1F37A 2JACA 3BD2A 3GMFA 1SK2A 1LBKA 14GSA 2H0GA 3US3A 1ZOFA 3LSZA 3MSZA 4OD7A 3PGTA 2VCXA 1YF1A 1LJRA 2XBIA 4BVXA 1ILOA 1R7HA 1WOUA 1AIUA 1F3AA 2GS3A 2RM5A 5IIZA 2R5GA 4Q5RA 5C00A 4JEDA 1DUGA 4IN0A 1WE0A 4TXVA 3JCML 3QFBC 1Z5YE 3QAGA 1MEKA 4RQXA 3FRCA 4KB3A 4TW5A 2PERA 4HOJA 1ZYQB 1DE1A 3DEXA 1GP1A 4ZBDA 4KDXA 5H5QA 4MF6A 5B6MA 4ILFA 4PGTA 4I6XA 4EKZA 3FR6A 2LS5A 3VFIA 2FLSA 2C3QA 4IELA 2I4AA 1ERUA 2V2GA 4MP4A 5F05A 4EF0A 2GTUA 3RBTA 4QL7A 2H8LA 2VM2A 1EGOA 1G6WA 4G19A 5J9BA 1EV9A 4V1Ag 3GNJA 3WYWA 2HYXA 4ISDA 2VL2A 2AHEA 2YZUA 5HR3A 1B4PA 2H6YA 2FGXA 4ECBA 2H73A 3FR3A 4L5LA 1XPVA 1PX7A 2GGTA 3ERWA 5HQPA 3FK8A 5GSSA 2ON7A 2BMXA 4MF5A 1T4ZA 4P3YB 2VCTA 3UIWA 5ID2A 2OJLA 3DMLA 4TR3A 2LQQA 17GSA 4JE1A 5AN1A 3HVVA 1THOA 4TR0A 1O85A 1EEJA 2DMLA 2OKAA 1M7TA 3LGCA 5HFIA 1T4YA 1Z9HA 2Z9SA 3H4KA 5A4WA 1K3YA 2LJKA 1GSDA 2MZCA 1FB6A 4TVEA 2VLVA 5ELGA 3NZNA 2KLXA 4FYBA 3DGQA 1ML6A 3HJPA 4I8BA 2GVPA 3APSA 5DQYA 1EP7A 1BYEA 3HZ8A 1N8JA 2HLSA 3QPMA 3A5WA 2CAIA 1ZCPA 2JSYA 1XW6A 1ABAA 2D2ZA 4FH8A 3HVSA 2KUCA 4I2UA 2XHFA 1XWAA 2YP6A 2MMAA 5C04A 4TKYA 4J56E 4D73B 2O8VB 4RI7A 2C80A 3ZL5A 1O6JA 5ECQB 3GRXA 4X43A 3FZ5A 1MDJA 1GTBA 3Q19A 4E8HA 1B48A 3GTUB 3H1NA 3CBUA 3LEFA 1X9SB 1YF0A 5CP1A 2VLUA 3CYNA 2RUEA 5KN2A 2CA8A 2WDUA 2VL2C 3EC3A 1PD21 4MH3A 2AB6A 2VL9A 1M9BA 3HYPA 5CAXA 4NAXA 2VL3A 1ZL9A 4NXIA 2E2GA 6GSWA 3RHCA 2FD3A 2OBIA 4FIWA 2K8VA 3FZAA 2PGTA 4MK3A 1JLVA 2FWHA 3TKSC 2TIRA 4K2DA 1GSQA 2CZ2A 2IJYA 4JR6A 2B7JA 4OWYA 4MJAA 3LWAA 3D4TA 4LMVA 1QFNA 3EMXA 3MNGA 1JLWA 2FWEA 4DSRA 4O7HA 1G7EA 2FWGA 3HKRA 1GSEA 1A2MA 5CYYA 2DIYA 3HXSA 2IMIA 5DALA 5DBQA 1SL2B 2KP1A 1GUKA 5IPGA 5JCUA 1WWJA 3KIJA 1FVKA 5KN0A 4WF5A 3L78A 4E8EA 3TKQA 2HT9A 3CXGA 4CDOA 3D22A 3CRUA 3FHKA 1KBNA 3C1SA 1SL1B 1TU8A 1TK8B 5GZZB 3ZLPA 4PQIA 3KZQA 5EL8A 4LLRA 1GWCA 1OKTA 1KTEA 2F3MA 2O89A 2B6MA 1OKDA 4IW9A 2LRCA 4GLTA 4Q5QA 3KH9A 3GSTA 4NMUA 1XOAA 4IGJA 2RUFA 1OC9A 2DJKA 4LL1B 1ERWA 2DLXA 2LRNA 1UA5A 1OC3A 3GUSA 1VF3A 4H86A 4F0CA 4PUAA 1T7PB 2HZFA 4N10A 3LFLA 2V6KA 2GT6A 2I1UA 3S9FA 2I9HA 3KGKA 1SK1A 4HI7A 3QMXA 4KA0A 1OYJA 4IKHA 5E59A 2HSYA 1T3BA 1DSBA 4XIHA 2NPBA 5CRDA 1RK4A 2K6VA 4DSQA 3CRTA 4WXTA 2LNSA 5D9VA 4LMWA 4V1Ap 3IAM2 3UBKA 4GCIA 2GZYA 3G9BA 5DAKB 2GQKA 5ECRB 2H74A 3HA9A 3WT1A 4AJ8A 1GSUA 4HZ2A 1XVWA 3IBHA 4J2FA 3QR6A 4PURA 2LKUA 1O8XA 3R2QA 3P7XA 3ZIJA 2P0GA 1S3CA 4GWRA 5EVOA 2IFQB 4KW6A 1QK8A 4ZL8A 1GNEA 4HJ2A 5HR0A 1G6YA 5G30A 3J7Yk 4O32A 3ZIVA 2WB9A 3LORA 2YWOA 3BCIA 3DWVA 4V2NA 4XCSA 2JZRA 3CSHA 1S3AA 1R5PA 3WGEA 5A4VA 5ABRA 2CVBA 2WJUA 1A0RP 4XS6A 1ST9A 3QOUA 4IP6A 5D9XA 2A2RA 3GN3A 1O81A 4MF7A 3VI7A 3TJFA 2WCIA 3IOSA 5JWQB 1IYIA 3VK9A 2GT5A 4TXOA 2R2JA 3IK9A 4WBRD 4HS1A 5B7CA 2FA4A 2GZPA 6GSYA 1JZOA 4HQSA 1Z6MA 5E4WA 4Q5FA 1NSWA 3PH9A 2J23A 5JWOB 2DJ2A 3LYPA 1Y25A 5HFKA 2VAFA 4GSTA 3ZMLA 3GH6A 1BX9A 2C8UA 3GIXA 4PUFC 1OE7A 2HXKA 2DBCA 1AXDA 4PXOA 4EO3A 1YY7A 3V1WA 1U3IA 1K0NA 4KSOA 1XWCA 3TOTA 2PVQA 1ERVA 1MD4A 1SKRB 2VOCA 3W8JA 1I9DA 1TTZA 1WPIA 1XVQA 2HZEB 1XFLA 2M46A 4IQAA 2PPTA 4J57E 4NWYA 3H79A 2E0QA 5G5FA 3KMOA 4IJ3A 19GSA 5F8BA 4EUYA 3ME8A 4HU7A 1V40A 2DJ1A 2IMKA 2X8HA 4JRRA 4XRAA 5D9TA 3WGXA 5IMFA 1SJZA 1GSFA 4ZB6A 4GSSA 2L5OA 3UJ1A 1VRSD 1JHBA 4LL4B 5ECPB 3L9UA 1X9MB 4EDZA 1W4VA 2L4QA 3G7JA 3IPZA 4L8EA 1URMA 4V2LA 5D9WA 1DBYA 3DVWA 3TJBA 5IMCA 5G2ZA 3QFAC 4ZL7A 3FY7A 4KDYA 4ML6A 5EY6A 2R37A 2QKEA 1SU9A 3GKNA 3IC4A 3K8NA 3D6IA 5AIXA 4ZBAA 3LG6A 1T00A 2CQ9A 2GLRA 2NDOA 2FUG2 3WGDA 3D4MA 1TI1A 4OFMA 1SJIA 2DJ3A 3C73A 1TRSA 2RIIA 3QD9A 3VI5A 3E0UA 2A2SA 5CNWA 2WGRA 3F3RA 5L71A 3G7YA 2H30A 1XXUA 3TJKA 5H5RA 3UAPA 4MDCA 4TR4A 3F9UA 1NM3A 1Z7RA 4N0ZA 5LCZA 3NOFA 1JZRA 2GSSA 6GSXA 4IJIA 1DE2A 1GLQA 5G1LA 1F2EA 2OE0A 5ID2B 5KEJA 5CREA 2CT6A 2X8GA 3GSSA 1ZZYA 2HSHA 2LQOA 1QXHA 3VLNA 4KX4A 1K0CA 4V2MA 3TKSA 2E2MA 5AISA 4I97A 3GX0A 2EIQA 5ECMB 1TW9A 1A24A 3KXOA 4CHSA 2KHPA 5LD0A 4HZ4A 4L5OA 4ZB8A 2C0DA 2GSQA 1O8WA 2EIOA 2L6CA 4KGIA 3VURA 3MDKA 1TRUA 1Q4JA 1BEDA 3FZ4A 5J5NA 1O7UA 5COHA 1VF2A 2F9SA 2CVKA 4WR5A 9GSSA 3N9JA 2VD1A 4QL9A 4HQZA 5G1KA 1FHEA 2YNXA 1GNWA 4NHWA 3UVHA 2CX4A 1JZDA 2LJRA 1SYRA 5CRHA 4WETA 1X5EA 1TK5B 3I69A 2HFDA 3C1RA 4XS4A 1GH2A 1AAZA 4ZXGA 4FO5A 3SBCA 1YEPA 1TDIA 2L59A 4XS1A 5ECHB 1Y6EA 1U3AA 3P8WA 1BAYA 2YWIA 2H19A 5JCGA 2YWMA 3EE2A 5CRWA 1Z3EA 1SYXA 1A0FA 2WULA 3IR4A 3EURA 2B3SA 2PWJA 4GRFA 4MJCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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