5B6NA

Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in sulfinic acid state
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
221
structure length
220
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-6
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 220
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6nA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6nA01
5HFKA 1G6WA 1GULA 2VIMA 4KX4A 2JZTA 1UVZA 2GSRA 4L5OA 2N5BA 1KNGA 4MH2A 2PGTA 1N2AA 3GMFA 2VCQA 1TK5B 1S3DA 5KN3A 4K1FA 5H5QA 3EVIA 1TJDA 5B7CA 2FA4A 3D21A 2CVDA 2IMFA 4ZL7A 5HR1A 5IQYA 4PQ1A 4MZCA 3BCIA 1M2BA 5ID2B 1TI3A 4MK3A 2WFCA 3MNGA 4JR4A 4MJAA 2C4JA 2H01A 4WF4A 2OE1A 17GSA 5JCWA 3ZL5A 1C72A 1T4YA 2VCXA 3IRAA 4F2IA 4POBA 3KGKA 1USBA 1BJXA 1AQVA 1OYJA 3TKSA 5AIVA 1XW6A 5IO0A 2LNTA 1SJZA 1TU7A 4AJ7A 1MDKA 1LBKA 3VLNA 4ID0A 3ZITA 2P0GA 2MZCA 1YKCA 3LXZA 3TJBA 4LL1B 2HE3A 3ZREA 1YJ6A 2FWHA 1XWKA 2B3SA 3E0UA 3O3TA 3H4KA 4OO4A 1XWAA 4KW6A 1THXA 2V6KA 3L9UA 2GVPA 3IAM2 2YWIA 3K8NA 2D2ZA 1JLWA 1Y6EA 3QDNA 1EP7A 4TW5A 2O85A 5A4UA 5ECMB 2RIIA 4NMUA 3FR3A 2DJ0A 3H79A 4MCUA 3H1NA 4TN8A 2O87A 1HNAA 2B5EA 3CRUA 1XWGA 1TRWA 1Y25A 2CAQA 3ISOA 1NSWA 2FHEA 1FHEA 3GNJA 3IE3A 3TGZA 2LTKA 4Q5NA 5EVOA 2M46A 4Q5RA 4N0VA 3MAKA 4ZIJA 2OACA 4MA9A 3GSTA 2B6MA 2GGTA 1GTAA 3GIXA 1YKAA 2VCTA 2H0IA 2AJQB 4G10A 4MLYA 1SK2A 2P5RA 3ZYWA 2HSYA 2HFDA 1ZYEA 2E2MA 3WGEA 1E6BA 4HI7A 2LJRA 3C1RA 6GSVA 2HI7A 3DRNA 4I5QA 1GSEA 2NDOA 1AQXA 3G7YA 3ZZXA 5DALA 3ERWA 1EGRA 4ZB6A 4ML6A 3IA1A 1S3AA 1M2DA 4NHWA 5GAND 1AW9A 2L5LA 4MPFA 3L78A 3A3TA 4L8EA 3G7JA 3G9BA 4BA7A 5B6MA 4OWYA 5GSTA 1TK8B 1K0MA 3E3EA 2GSQA 3CYNA 1FVJA 2LEGA 4WETA 3SWLA 1VRSD 1GTUA 1KEBA 2HLSA 5KEJA 1PX7A 2IMIA 4DVCA 3M1GA 5ECLB 5IPGA 4MP4A 1O81A 1BX9A 2L5OA 2CAIA 4XRAA 3TOUA 3ZVJA 2VD1A 4YAVA 3P8WA 3RAZA 1JZRA 3US3A 2H19A 1SKWB 4CDOA 1EOGA 2CX4A 2YWMA 5B8AA 2I3YA 1XW5A 4N11A 4ECBA 4MJBA 5INYA 2XHFA 2YV9A 2RUFA 5D9XA 2H30A 2R3XA 2B5XA 3TJKA 3CSIA 2YWOA 4IHUA 4WEYA 4DSRA 2L4QA 2K18A 1SKRB 2J9HA 3I6AA 5AIXA 4F0BA 1AAZA 1GUMA 3IK9A 2H72A 1TXXA 6GSUA 2VD0A 2C1YA 2P5QA 1FB0A 2YJ7A 2KUCA 3CMIA 2CZ3A 3ERFA 4PUAA 3HD5A 3TB2A 3HCZA 4KE3A 1PKWA 4BVXA 1XCCA 4POKA 4N30A 2EC4A 4Z7XA 4D73A 2F8FA 2IMKA 4WF5A 4PGTA 4NWYA 2VO4A 3D6IA 2F8AA 1F9MA 1GLQA 4TR1A 2HNLA 3IDVA 3VI7A 2YANA 2B1KA 3CTFA 2YJHA 4K6XA 3GX8A 4ECCA 3KCMA 2ES7A 2R4VA 3FR9A 14GSA 4EVMA 3IR4A 3GHAA 5IMCA 2HZEB 2O89A 5EL8A 2MBSA 2VLUA 1XWBA 2L4CA 1VF3A 3LGCA 5G2ZA 4PQIA 2CT6A 1K3LA 3RBTA 3QFBC 2FWEA 5IMZA 1HYUA 2I1UA 2VUPA 2WRTA 5G1KA 2C8UA 3FZ5A 5CRGA 1PL2A 4ACSA 1O8XA 3Q19A 1Z3EA 5D9VA 2PMTA 4K8MA 3HYPA 4G19A 2VCZA 3BCKA 3VI5A 4QL7A 1V98A 3TKSE 3M8NA 5CYYA 1A24A 4G2EA 5JWQB 4NXIA 4F82A 2ON5A 4TR4A 6GSTA 5ECIB 1K0AA 2LQOA 2VM1A 2H6ZA 2RM6A 1GWCA 5IMDA 2A4VA 5ID2A 3A5WA 3LFLA 2L59A 1A23A 2WZ9A 1J9BA 1PGTA 1I9DA 3IHQA 1GH2A 4HU9A 2VL2C 1O73A 4GQFA 3Q18A 4V1Ag 2GQLA 1MD3A 4ZB8A 1T4ZA 1X5EA 1NM3A 1KTEA 4ECIA 1J08A 1ILOA 1GSYA 1J0FA 2MMAA 4KNDA 4HQSA 1MEKA 1S3CA 1TP9A 4JR6A 1YEPA 2OE3A 4MF5A 1GP1A 1GTBA 3LYPA 3QAGA 2GT6A 2GSTA 3TRPA 4ISDA 3DGQA 5GAPD 3E9JB 1U3IA 3ZLPA 1WPIA 3APOA 4TVEA 4X0XA 2AHEA 3F8UA 3GRXA 3IC4A 2C3TA 2KLXA 1A0FA 2YWNA 4LLRA 3APSA 5AGYA 1TRSA 2AB6A 1HNBA 2DLXA 2WDUA 1XZOA 4QQ7A 4BPYA 2KOKA 1SD9A 2GTUA 1GSSA 2DMMA 4I2TA 1ML6A 3EU4A 1K0NA 4TXOA 3O76A 4FIWA 2REMA 4MMMA 2HZFA 2G0FA 10GSA 4V2NA 3EMPA 4LMWA 2H0GA 1VF4A 1GUHA 1U3AA 1JZOA 2X8GA 1F6MC 3DXBA 3DYRA 1PA3A 1JLVA 4DSQA 3PGTA 2H73A 2N5FA 4AF2A 1WMJA 4ZILA 4IW9A 4I97A 1ZGNA 2VAFA 3MWHA 1KBNA 1M7TA 4ML1A 4IJ3A 3WGXA 1R5AA 2H74A 4J2FA 1PMTA 1G0TA 1E2YA 3I69A 2EIRA 4HJ2A 3LWAA 3KM6A 1X5CA 5DVBA 5ABRA 3PINA 13GSA 3FRCA 2I81A 2IPAA 1M9AA 4ZBAA 5IOWA 3D4MA 1TRUA 4DEJA 1V58A 4OFNA 1HNCA 2GDRA 2IL3A 3U6VA 4OO5A 2VLVA 2JL4A 2K8SA 3HA9A 1HD2A 4ILFA 4KA0A 1MTCA 4GWRA 3KTLA 3ZIVA 5D93A 2DJ3A 3IV4A 2PN8A 1ZCPA 2MBTA 3FKFA 3NIVA 1SJ6A 5D96A 5G5EA 4PQHA 1A2JA 1PSQA 2X99A 2H75A 4NHZA 4GSNA 1TDIA 2PVQA 3UEMA 1A2MA 5D73A 2YP6A 5B8BA 2CZ2A 5IO2A 1Z7PA 3FYGA 3QAVA 4FH8A 3GSSA 1A8LA 2C3QA 1ERTA 5JWOB 1V57A 2H1AA 2DSAA 4K9ZA 1XFLA 5G31A 1OKTA 1XVWA 3HZ8A 2VM2A 1AIUA 4MJCA 6GSWA 2XPEA 1YF1A 1CQGA 4EKZA 1XBSA 2JZRA 1SU9A 3F4RA 2PWJA 1EEJA 4OMVA 4IN0A 5J41A 3WT2A 2FA8A 4ULXA 3VURA 4POMA 1WE0A 4O32A 5ECSA 4TKYA 6GSSA 3GTUB 1EWXA 2ALBA 2B1LA 2R2JA 2LUSA 1X5DA 2MMOA 4YAPA 4WBJA 2XBIA 4DSSB 4MDCA 4FYUA 1T3BA 4L0WA 2NTOA 2WGRA 2FUG2 3EINA 1JZDA 4V2LA 1ZL9A 5E59A 4WXTA 2AUVA 2KHPA 1ERWA 1UC7A 3UVTA 3W8SA 3EC3A 3ZRDA 3VPQA 3HVVA 2OA7A 1ZOFA 3P7XA 1M2AA 2H1DA 3KP8A 2H71A 5AN1A 1RQMA 5J9BA 3TRQA 2BJXA 2MYGA 4XHMA 4HOJA 2B7JA 5H5SA 2EIQA 5CRWA 3GKXA 4E8HA 1XW9A 3GUSA 5JCUA 3ZMKA 2YNXA 3J7Yb 5HFGA 11GSA 1GNWA 3A2XA 1DSBA 5ECNB 1R5PA 1FAAA 4BL7A 3PH9A 2DJKA 2FWFA 4GCIA 4F0CA 3WT1A 2A2SA 2JADA 1AUCA 2C0DA 3C8EA 3M0FA 4KCEA 2GQMA 5DCGA 3ZFBA 4V2MA 3WYWA 1K0CA 2YOIA 3D0ZA 3KMNA 5FT3A 1WOUA 1ON4A 4ZBBA 2FLSA 2R6KA 3HXSA 2V2GA 4GLTA 5JCGA 3W6GA 3L9VA 1GNEA 4XTSA 3UVHA 4CW9A 4POLA 4X1UA 2E2GA 1GL8A 2KP2A 2QC7A 1BYEA 2V1MA 5B6NA 2OE0A 2YZUA 1FW1A 3GKNA 4HJMA 4IKHA 3H8QA 5DJLA 1FG4A 2GSSA 5CAXA 3FZ9A 4Q5FA 2DMLA 2E7PA 3F6DA 1EZKA 4GXZA 3P2AA 1H75A 1X9WB 1FO5A 3KJYA 1THOA 2VCVA 4G9HA 3HJOA 4IP1A 1R7HA 3Q6OA 3EWLA 1SENA 3R2QA 4WBRD 1EV4A 22GSA 4KB3A 1F2EA 4ZL8A 3PR8A 2OBIA 4TXVA 2YZHA 3EMXA 3F0IA 5F8BA 4F9ZA 2CX3A 3GA4A 4EDZA 2OBKA 4RQRA 4L0UA 4J56E 4EL1A 3F4TA 1B9YC 1M99A 5H5RA 1U87A 1K0BA 4RQXA 2DJ2A 3KMOA 3QOUA 2X64A 1UN2A 5D9TA 2MMNA 4I2UA 2YV7A 1ZZYA 2TRXA 2FY6A 2LQQA 1OE8A 3TUEA 19GSA 4FO5A 3DKSA 1GLPA 2LS5A 4LA1A 5HQPA 1OC9A 4GQCA 2X8CA 3KP9A 3LXTA 1U88A 1Q4JA 3Q74A 3IOSA 1OAZA 5JWRB 1Z9HA 3DMLA 1V2AA 5J4UA 5F06A 1X0RA 4MJEA 3IPZA 2LKUA 4L5LA 3TOTA 5DCHA 6GSYA 3H93A 2IMEA 4I6XA 1DUGA 1SYRA 4WR5A 5A4VA 7GSSA 1GSQA 2BMXA 4OFTA 5J3RA 3TJJA 4XS1A 4YQMA 1ZMAA 1QXHA 1FVKA 3F63A 2NPBA 1YY7A 4RUVA 4RI7A 4JRRA 1K3YA 5HR2A 3WD6A 3GH6A 2DIYA 3C73A 2RLIA 3FK8A 5C00A 1A8YA 5DJMA 3BOAA 4HEA2 4TR3A 1K0DA 3F4SA 3F9UA 2OADA 2O8VB 2WB9A 2K9FA 5FHIA 1EP8A 3EE2A 1V40A 5CRHA 3KZQA 2IN3A 18GSA 3HKRA 4TOPA 2ZCTA 4XS4B 3HJMA 2C0EA 2HSHA 4K7OA 3QAWA 3OR5A 3CTGA 4HS1A 5GSSA 3GFKA 4YH2A 1W4VA 5DBQA 3ED3A 2BTOT 1PX6A 1M9BA 2J23A 3TJFA 1OC3A 2VL2A 4HZ2A 5J9CA 3F6FA 1WWJA 5ECQB 3D4TA 5ECHB 1GUKA 1B9XC 2LRNA 4HUAA 2H76A 3CXGA 2JSYA 3FEUA 3QR6A 2B7KA 3QCPA 3GTUA 9GSSA 5IMVA 3UJ1A 4O92A 2XBQA 2LJAA 4IJIA 4GTUA 1YQ1A 4AJ8A 1DE2A 3O6TA 4TR0A 1I5GA 5AISA 1HQOA 3SBCA 3KH7A 2FNOA 4PURA 2DJ1A 3C7MA 3UIWA 4OCEA 4GSSA 2IFQB 2LV3A 2QGVA 1EV9A 3DEXA 2CVBA 4ECJA 5CNWA 1G7EA 2PPTA 3RHCA 5C04A 1WP0A 2LNSA 1T7PB 2ZNMA 3FHKA 3GKMA 1R4WA 3CSJA 1PL1A 4YQUA 4EXJA 2DC5A 3HJPA 4E8EA 1T1VA 1GSFA 3LSZA 3GL5A 4PNGA 4O7HA 4EUYA 4EC0A 2JACA 3TKSC 1B4PA 2B5YA 3DWVA 2CQ9A 2WJUA 1XPVA 2HXKA 2TIRA 4K0NA 4ZXGA 4IP6A 1M0UA 1URMA 1VF2A 4HZ4A 2GZYA 3I43A 3VWWA 1OVNA 5CP1A 4O5RA 2EIOA 1FB6A 2ZUPA 1JFUA 1NHYA 1PN9A 3F3RA 1N8JA 2R5GA 1SKSB 3TJGA 1QUWA 3IK7A 4PNFA 3KEBA 1G6YA 4JE1A 4MH3A 5F0GA 3JCML 2JSZA 3HY2A 4X43A 1H4OA 1OKDA 3CSHA 2WS2A 2VLTA 3UAPA 3IAS2 1V9WA 4IVFA 1XOBA 3FZ4A 1MDJA 1ST9A 4CHSA 4N10A 3DVXA 1YF0A 3VWUA 12GSA 3TKRA 4GSTA 3RHBA 4GRFA 1ERVA 4PXOA 4KDYA 3GURA 1G7OA 1TW9A 2WCIA 1IYHA 2H1GA 4OCFA 4HDEA 3KH9A 3CRTA 1B4QA 5ENUA 4WR4A 4JZQA 1DBYA 3IXRA 5EY6A 2LRCA 1Z6MA 2TRCP 2H6YA 4MZBA 2FWGA 2O7KA 3FY7A 2C0FA 2M72A 2FCHA 3A2WA 4KH7A 4KDXA 1VF1A 2ON7A 1PQNA 3LORA 5DQSA 1BEDA 3MSZA 5COHA 3HVXA 1QFNA 1B8XA 3ZMLA 5CO3A 4F03A 3EURA 1QK8A 5IM9A 1MD4A 1TKDB 4BWSA 5D8IA 5IMAA 1VGLA 2HYXA 3NZNA 1TOFA 1AQWA 4MZWA 2F3MA 4OFMA 1SK0A 1SL2B 2HZEA 1DE1A 3C1SA 3S9FA 2VL3A 4ZB9A 3APQA 2RUEA 4IS0A 4HU7A 2QKEA 1UA5A 1YDKA 1TRVA 2LRTA 3LG6A 3KIJA 1IYIA 2PU9C 4TXOB 2Z9SA 3KXOA 1GRXA 3TKQA 4BVYA 5DAKB 4KUNA 3ZVJD 1PD21 3TCOA 5A4WA 3VFIA 5DQYA 1TI1A 3G7IA 4LMVA 5ELGA 2C80A 1Z7RA 2VOCA 4OD7A 1W89A 3FR6A 2DBCA 5KN2A 5IPHA 1TK0B 4XRDA 1XIYA 2AV4A 3ERGA 5DDLA 1AC1A 4I8BA 5EPFA 2H70A 5G30A 2K8VA 3U5RE 3C71A 1EOHA 1F3BA 3FW2A 4KCAA 1OC8A 4IGJA 1NW2A 1SL1B 3N5OA 3HVSA 3LEFA 3CBUA 2RM5A 2N5AA 2CA8A 20GSA 5ECOB 2F9SA 3UARA 5G5FA 4EDYA 3ME7A 2L6DA 2HRNA 3TKPA 1RW1A 3L0HA 1Z6NA 3KD0A 5GZZB 3UL3A 5HFIA 2OJLA 1Q98A 2GQKA 2DJJA 4XS6A 4NAXA 2P31A 5FWGA 4JBBA 1SD8A 4V1Ap 3RPPA 1O6JA 2K6VA 3HZ4A 5HR0A 1WJKA 4BWQA 1O7UA 3J7Yk 4MF7A 5HR3A 1BAYA 4XS4A 4FYCA 4IQ1A 4PX1A 4YQVA 4NV5A 1SL0B 1Z5YE 5KN1A 1AXDA 2WULA 1YZXA 4P3YB 1F37A 3BJ5A 3N9JA 2MMZA 1ACVA 2IIYA 3F3QA 6GSXA 5A5KA 1B48A 4JEDA 2VL9A 1R26A 4WKWA 3BBYA 4KSOA 1JHBA 5LCZA 2H1BA 3RDWA 2CVKA 1BQ7A 4LL4B 3ZFLA 2I9HA 3D22A 3VWXA 1PRXA 2YPMA 3GV1A 3I9V2 4HQZA 3GN3A 2V6OA 4FYBA 2IFQA 2A2RA 3L4NA 2GLRA 1T00A 4AGSA 3UMAA 2YN1A 5E4WA 1JZWA 3L9SA 3MDKA 3ZTLA 4K2DA 2YCDA 1YEXA 3QPMA 16GSA 3GKKA 5IOXA 2AAWA 5DALB 1LU4A 3FZAA 4K0GA 1K3OA 4IBPA 5F05A 3WGDA 1NHOA 5IIZA 2PUKC 1X9SB 1LJRA 1ERUA 3LQ7A 1SJIA 2HT9A 3GYKA 2FGXA 4H86A 1XWCA 3BD2A 1XVQA 2GZPA 3QD9A 4TRXA 1EGOA 3AY8A 1XOAA 3LYKA 5KN0A 3VPTA 4QL9A 4KAEA 4MABA 4NPBA 2F51A 1XXUA 3VK9A 2V32A 3NOFA 4XCSA 4EE0A 1A2LA 3V1WA 5ECPB 3RPNA 2H8LA 3M3MA 3ME8A 2DIZA 3UOMA 1K0OA 4K7NA 1PKZA 4AJ6A 3QFAC 5CRDA 5IMFA 5LNKe 4ZBDA 1GSUA 2NBSA 2L57A 2E0QA 2X8HA 3GL3A 1TU8A 2XPDA 5CREA 5L71A 2H66A 4IQAA 3UBLA 5F07A 1SYXA 4JU5A 4ZL9A 2M80A 2R37A 4KSMA 2OKAA 2PERA 2VCWA 1GSDA 3IBHA 1BG5A 2GZZA 3TRXA 4IELA 2C3NA 2L6CA 4EO3A 2AYTA 3VWVA 1QQ2A 3GX0A 4KDUA 2PBJA 4J57E 4K7IA 2IWTA 5LD0A 2PVOC 2JU5A 2XC2A 3M9KA 2LJKA 2GT5A 2FD3A 4PUFC 1U6TA 3DIEA 1A0RP 4Q5QA 5G1LA 2IMDA 1F3AA 1TTZA 1MDIA 5ECRB 4EF0A 5ECKB 3KTBA 3P90A 5ELAA 4D73B 2HRFA 3LJRA 1ABAA 2V41A 2I4AA 1QMVA 3W8JA 1WRYA 1T8EB 4TR1B 4DSSA 4N0ZA 2C0GA 5J5NA 4GF0A 3M9JA 3ZIJA 1X9MB 4MF6A 1O8WA 2G2QA 1RK4A 4NV2A 3EU3A 1EEMA 1GTIA 1FOVA 2CV4A 2QSIA 2GS3A 2IJYA 5D9WA 1OE7A 1QGVA 2LSTA 3EYTA 4KGIA 4MPGA 3D5JA 4RI6A 8GSSA 3GH9A 3QMXA 5DAKA 1O85A 3HDCA 2KP1A 4XIHA 1WIKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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