5HQPA

Crystal structure of the erp44-peroxiredoxin 4 complex
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFEHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the ERp44-Peroxiredoxin 4 Complex Reveals the Molecular Mechanisms of Thiol-Mediated Protein Retention.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase/chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 181
sequence length 181
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hqpA00
2H0IA 2X8CA 1M7TA 5DALA 4V1Ag 4IHUA 2VL2A 2OADA 2FWHA 4LA1A 3M3MA 5JCUA 4TW5A 4KUNA 1ABAA 3E0UA 4WBRD 1GNEA 1XW6A 2PU9C 2FWGA 5J41A 4OFNA 5ELAA 2OACA 3KZQA 1HNBA 1PX6A 4MF7A 3C8EA 2WZ9A 3MWHA 2WRTA 5J9CA 3TOTA 2DMMA 3ZMLA 18GSA 5CYYA 1EP7A 1WOUA 4MH2A 4Q5FA 4I2UA 3KD0A 1PMTA 4ULXA 2CAIA 3DWVA 3QAGA 2H0GA 3G7JA 1TDIA 2GSRA 1BX9A 3LG6A 2B5XA 1G6YA 2GLRA 3ISOA 4NWYA 5IIZA 3CRUA 3F6DA 4MCUA 3LYKA 3N9JA 1AW9A 4N0ZA 1XZOA 1MTCA 1Y6EA 3LYPA 2CX4A 2LS5A 3GFKA 4FO5A 4Q5QA 1SYRA 2V6KA 5D9XA 3TJFA 3WGXA 3D22A 1JLVA 1LBKA 1JLWA 4L5LA 2LQQA 3M9KA 2H30A 1CQHA 5CRHA 3NOFA 2VUPA 4XCSA 3FR3A 3JCML 4PQIA 1OKDA 4MLYA 3VFIA 4ZBAA 5J9BA 4WF5A 1M2DA 1ST9A 4V2NA 4O5RA 9GSSA 4PNFA 1FW1A 5D96A 1TI1A 3HD5A 3TKSA 2HRFA 4YQUA 2GDRA 4ZB9A 4PUFC 1S3AA 1EV4A 4IP1A 3VPQA 2VLUA 3ZL5A 5B8BA 3C1SA 4GSSA 4WKWA 1GWCA 1G0TA 1THXA 3CBUA 2B1KA 2VL9A 1YF0A 2N5AA 1XWAA 5DDLA 3RBTA 1Q4JA 1TJDA 1X5CA 5J4UA 12GSA 5IMVA 3GSSA 1AQVA 2XHFA 3CRTA 1ACVA 5KN0A 3C71A 3ERGA 1K0BA 2OA7A 5CNWA 5GAPD 4AJ8A 5A5KA 1Z7PA 3TJKA 3MSZA 1O6JA 2MMOA 3L0HA 4EKZA 5ABRA 4L0UA 5G30A 1N8JA 1EWXA 1F3BA 3Q74A 3AY8A 4MMMA 1OVNA 2K6VA 2IL3A 3HVSA 2FUG2 3KMOA 1XW9A 2CZ3A 3BD2A 4NXIA 1ZOFA 2M46A 2PERA 2H1AA 3GH9A 4F0CA 3LXTA 4XTSA 2DJ3A 5B7CA 2KHPA 1T3BA 1AAZA 1F9MA 2GSQA 2JL4A 1W4VA 2L5LA 5DALB 4EXJA 4KDXA 1J0FA 1BEDA 5H5RA 2H70A 4RQRA 4X0XA 1PL2A 2NDOA 5B8AA 2BTOT 17GSA 1XBSA 2YZUA 5DQSA 4EO3A 2IMDA 3F4TA 3F3RA 5LD0A 3I69A 4JE1A 4MABA 1XFLA 3UOMA 1O85A 2R2JA 2VLTA 4TRXA 2LKUA 4K7OA 4XS1A 4L5OA 3ZZXA 3W8SA 1FHEA 5IM9A 5IMFA 4HU9A 3IRAA 1K3YA 3KXOA 4RQXA 3F8UA 1JZWA 3ME8A 4NMUA 1I9DA 5DJLA 4OD7A 3TKSE 2Z9SA 5DQYA 3VI5A 1YEXA 3H1NA 1G7OA 2B5YA 1XPVA 2V6OA 5AIXA 3M9JA 3GTUB 1SK2A 2JZSA 2F8AA 2LUSA 3C1RA 3QFBC 1FAAA 2QKEA 1OC9A 4V2LA 2LRCA 5CREA 2DJ0A 1V58A 5CRDA 5HR3A 1ERWA 20GSA 5EVOA 3A3TA 3UBLA 3ZFBA 1FB0A 3DGQA 1S3DA 2REMA 4ML1A 4EUYA 4NV5A 4TR4A 4IQ1A 4DSSA 3HZ4A 2GGTA 4ZL7A 1SENA 4NHZA 4POBA 2GS3A 2ON7A 2HZEB 4K0NA 2JADA 1EEMA 2A2SA 2XBQA 4QL7A 4CHSA 3VWUA 1VF4A 5IOWA 1VRSD 3M0FA 1SK0A 2HSHA 2FCHA 4HEA2 3L9VA 4ZB6A 2J9HA 1ERUA 5IOXA 3HYPA 2EC4A 4IJIA 4G10A 3GN3A 4IW9A 3WGEA 5ECKB 2C0FA 4TR3A 3WT1A 1GTUA 1O8XA 1AQWA 1WPIA 4IELA 3UJ1A 4GQCA 4MF6A 1XOAA 3FY7A 2OE3A 1GLPA 2V2GA 3FHKA 3DVWA 3ZLPA 5EPFA 1MD4A 1TRSA 4Z7XA 2VLVA 2P5QA 2QC7A 2I4AA 3FKFA 1M9BA 3APOA 4OFMA 5DVBA 4TR1A 1DSBA 1PRXA 3KH7A 1S3CA 1DE1A 5E4WA 1TKDB 2JSYA 1QMVA 3TB2A 2PBJA 2E0QA 1TI3A 3KTLA 4G9HA 2C3QA 3IR4A 1ZGNA 4GSNA 10GSA 5HQPA 5KN1A 4MPFA 1FB6A 2TRXA 4EE0A 3DKSA 2FA4A 1ZL9A 2F8FA 1LJRA 1PA3A 3QMXA 3Q19A 1JZDA 3H93A 3TKPA 3LORA 1XVWA 2YJ7A 5B6MA 2LSTA 3Q6OA 3GSTA 1F3AA 1J9BA 5DBQA 3BCKA 1YKAA 2NVLA 1SD8A 4F03A 2H75A 2HNLA 4PQ1A 3A2XA 1OAZA 2GQKA 4JR4A 2LNTA 4GWRA 6GSYA 4IBPA 4K2DA 4PXOA 2GZYA 2IMEA 4DEJA 4I2TA 3S9FA 4LL4B 2C0DA 2JZRA 1M9AA 3CMIA 1GNWA 1B4PA 3GKNA 1ERTA 2HYXA 1GTAA 3IK9A 1O7UA 2OJLA 2ALBA 4JEDA 1G7EA 1R4WA 2ES7A 1B48A 1OC3A 1OC9B 5D9WA 3UMAA 2FD3A 2FLSA 1OKTA 1BG5A 1G6WA 4POMA 4GF0A 3HXSA 4N10A 4J57E 3PR8A 5GSTA 1UA5A 2YANA 5A4UA 2O87A 3IBHA 3FZ4A 1FVJA 2LRNA 2PN8A 5IQYA 1FVKA 2M80A 2GQLA 1VF1A 2H8LA 2CZ2A 1FO5A 1R5AA 2IWTA 3I43A 4YAPA 4KCAA 6GSWA 4GTUA 2IFQA 2LQOA 1NHYA 1ZZYA 4K1FA 2P0GA 4WF4A 4RI7A 3DEXA 1Z3EA 2VL2C 3L9SA 4HQSA 1PGTA 5ECPB 5G5FA 3KGKA 1X9MB 4MP4A 2PPTA 2WDUA 4ZIJA 4J56E 3ZITA 1PN9A 2E2MA 4RI6A 4KCEA 1X5DA 1EP8A 3E3EA 2FWFA 5ECLB 5ECMB 1NM3A 3F4SA 3U6VA 2C0GA 3C73A 5ECNB 1T4ZA 1AC1A 1YJ6A 3IC4A 1TK0B 4TR1B 1USBA 3L4NA 1X9SB 1EV9A 3LWAA 5H5SA 4ZBBA 5JCGA 1XXUA 2A4VA 5CRWA 2XPDA 3IK7A 3KTBA 2ZCTA 5A4WA 2AB6A 1A8LA 3ZIVA 1GL8A 1YKCA 3CXGA 2AAWA 2FWEA 2VCTA 3ZVJA 1K0OA 4GQFA 1R7HA 2WULA 3KEBA 3EU4A 2IPAA 4XIHA 1EOHA 1AQXA 5KN2A 4OO5A 3F0IA 1TU8A 1GLQA 3DRNA 2AUVA 2CV4A 3GH6A 4KW6A 2NPBA 3EVIA 4K0GA 2GTUA 1TTZA 1XWBA 2FA8A 1AUCA 2J23A 3ZRDA 1O73A 4Q5RA 1QUWA 5ECOB 2VM2A 1U3AA 1PL1A 4XRAA 3VWWA 2VD0A 1MEKA 3TKSC 3ERWA 2H6YA 1HD2A 5DAKA 2MBTA 2B5EA 2ZNMA 2RM5A 5C04A 1KEBA 1NHOA 2MMZA 2X99A 4CDOA 3UVTA 1E2YA 5JCWA 4N0VA 3QD9A 4MPGA 2VOCA 1TW9A 3QAVA 1GH2A 3HKRA 2H6ZA 2B6MA 5DJMA 4ZB8A 2CVKA 2O7KA 2GT5A 2DJJA 2K8SA 1XOBA 1ML6A 4IN0A 4LMVA 1Q98A 3EC3A 1MDKA 3FYGA 2PVQA 2EIOA 2LEGA 2VM1A 2RLIA 2D2ZA 4F82A 4XS4B 5ECRB 5ECIB 3F3QA 5F07A 4OMVA 3W8JA 2IMFA 4WEYA 4AJ7A 4H86A 5HR0A 1VF3A 2YJHA 5AIVA 3VPTA 2NTOA 1A24A 3LSZA 1V40A 2F9SA 5KN3A 3TOUA 4YH2A 4N11A 4L8EA 4TR0A 3RDWA 3ZREA 2B1LA 2OKAA 1Z5YE 4TOPA 2LJAA 1XWKA 4PX1A 1GUHA 2CQ9A 1MD3A 1BAYA 4TKYA 3WGDA 1W89A 2ON5A 1VGLA 1ERVA 2GZZA 3VK9A 2V41A 4KGIA 5HR1A 2L59A 4ZL9A 2IJYA 2WB9A 1SK1A 2MYGA 4TN8A 3L9UA 3OR5A 4EL1A 3W6GA 2V1MA 3HA9A 4EVMA 3EINA 2YP6A 13GSA 3QOUA 4KH7A 3FZ9A 5F0GA 5D9TA 3IAM2 5B6NA 1THOA 3TJGA 4WETA 2PUKC 2WCIA 4MZBA 2X64A 1T8EB 4X1UA 3FZ5A 5ID2A 6GSUA 4G19A 1HYUA 2A2RA 4ZILA 1A8YA 1XW5A 2H74A 1VF2A 1LU4A 3G7IA 4ZL8A 14GSA 2IMKA 4YAVA 2MZCA 1ZYEA 5F8BA 4KNDA 2BMXA 2YN1A 2C4JA 4V1Ap 4OFTA 5DCGA 4ECBA 3EU3A 11GSA 2OBKA 4LMWA 2H6XA 5JWOB 4DVCA 1GRXA 2N5FA 1FOVA 2IN3A 5H5QA 3V1WA 3IA1A 1RK4A 3UEMA 2DLXA 4K8MA 3LXZA 5A4VA 1U87A 2IIYA 4JU5A 2QSIA 4JRRA 1K3OA 5IMAA 1PSQA 4IQAA 1T4YA 5DAKB 4HU7A 3TJJA 1M2AA 1A23A 3DMLA 1PX7A 1V57A 2VCZA 2C3NA 1T7PB 2DMLA 4G2EA 3FW2A 3H4KA 2RUEA 2CA8A 1WJKA 1IYIA 1TRVA 3IDVA 3E9JB 4TXOA 2K18A 3D0ZA 2C1YA 5G31A 4YQVA 3HVVA 5FHIA 4ZBDA 2H01A 2ZUPA 4MF5A 4ZXGA 1SYXA 5F06A 1QGVA 1K0NA 3GL3A 2VCVA 4E8EA 2VCQA 1TOFA 3MNGA 4GLTA 3KH9A 1SD9A 1ZMAA 2O8VB 3HVXA 7GSSA 4XS6A 2R4VA 4I8BA 4JR6A 4EDYA 2RM6A 2K8VA 1JHBA 2JZTA 6GSVA 5FT3A 3IOSA 3O76A 1WRYA 2CVDA 3GV1A 3EE2A 4O7HA 4AF2A 1DBYA 3QFAC 4ECJA 4KSMA 4JZQA 2KOKA 4BPYA 5LCZA 1T00A 2HXKA 1XWCA 4K7NA 4WBJA 3BJ5A 4FYUA 3KP9A 5G1LA 1SKSB 5D8IA 4XHMA 5IO0A 2PVOC 2B7JA 4NAXA 3SWLA 3EURA 1T1VA 2AJQB 2E7PA 2C3TA 2H0HA 3UBKA 1MDIA 4Q5NA 1O81A 3QDNA 3GKMA 4DSRA 1M99A 1B8XA 3U5RE 4BWQA 1GSSA 3FZAA 1YF1A 2R5GA 1SL1B 4ACSA 3ME7A 4JBBA 4LL1B 1TRWA 2G0FA 3VLNA 3WT2A 4TVEA 4KX4A 3HCZA 2X8HA 1M2BA 1I5GA 5J3RA 5ID2B 1QK8A 3IXRA 4YQMA 1Z9HA 4HUAA 2VL3A 3UVHA 2MMNA 3HZ8A 3M1GA 2O89A 1Y25A 2WS2A 3P8WA 1AXDA 1A2JA 2TRCP 5HFKA 4D73A 1GUKA 1F2EA 2VCWA 4MH3A 2R3XA 4KSOA 1Z7RA 4KDYA 1OYJA 2O85A 19GSA 4DSSB 1OE7A 4I97A 2HRNA 2KP2A 3US3A 3TCOA 2L4CA 4BL7A 2L4QA 2YCDA 4BWSA 2H1DA 4OCFA 2YWNA 2PGTA 1HQOA 1F6MC 3IHQA 4OO4A 2R6KA 1A0RP 2NBSA 3N5OA 2BJXA 3IAS2 4HI7A 3QR6A 3G9BA 1YEPA 4ECIA 3GNJA 3GX0A 1WP0A 1YZXA 3EYTA 3EMPA 2IMIA 2HLSA 1ZYQB 3M8NA 2HE3A 1M0UA 2GQMA 6GSTA 2XC2A 3GUSA 5AN1A 4NHWA 5D9VA 4FH8A 3FEUA 1R5PA 3TGZA 2F51A 2DSAA 4TXOB 1EEJA 2G2QA 3ZIJA 3TKRA 1NW2A 1ZCPA 1U3IA 3KJYA 1DE2A 4MJCA 1X0RA 5KEJA 3D6IA 4MZCA 2MBSA 3RPPA 2EIRA 4CW9A 3TRQA 1V2AA 3CYNA 2K9FA 2RIIA 3PINA 1SJIA 5G1KA 1HNAA 1SL0B 5HR2A 3VWXA 3TKQA 2X8GA 3HJOA 2GZPA 3ERFA 5IO2A 1OC8A 5D93A 2YV9A 1TK8B 3GTUA 3LQ7A 5ELGA 5JWQB 3DVXA 4EDZA 1N2AA 3BCIA 1EZKA 2C0EA 1PQNA 2JACA 1WE0A 3GL5A 3HDCA 3IV4A 2H1GA 2DJ2A 3Q18A 2MMAA 1HNCA 2XPEA 1URMA 2WFCA 4GXZA 1BYEA 2H73A 1KBNA 3FR9A 4HZ2A 1K0CA 2XBIA 3O6TA 2HZEA 2TIRA 3P90A 3D5JA 5EL8A 2DIZA 2M72A 1U6TA 3I9V2 3GIXA 2FY6A 1ILOA 3ZVJD 3MDKA 3ED3A 4KA0A 2YWMA 1WWJA 3CSJA 3BOAA 3GHAA 5D73A 1R26A 1X5EA 3FR6A 2F3MA 4K7IA 4MJAA 1GSUA 1XIYA 3VWVA 1K0MA 4AGSA 1TU7A 4IJ3A 4FYBA 2FHEA 3KMNA 1YDKA 2YPMA 4F2IA 3GRXA 1GUMA 3ZFLA 1V98A 3GKKA 3RAZA 4PURA 2I1UA 1C72A 4HZ4A 1KTEA 3H79A 4D73B 2WGRA 2HSYA 2I3YA 2H76A 4POLA 2H66A 2HZFA 3RPNA 1H4OA 4NV2A 3LFLA 5INYA 6GSXA 2OBIA 3A2VA 5G5EA 1SL2B 2YZHA 5IMZA 1E6BA 3KCMA 2I81A 3UIWA 3UAPA 3FRCA 3QAWA 1EGOA 1WIKA 2IFQB 1TP9A 2CAQA 2LNSA 4HQZA 1TRUA 5CAXA 1X9WB 1GSDA 2HFDA 1CQGA 4ILFA 1ON4A 2FNOA 1DUGA 2E2GA 3KM6A 3HJMA 3IPZA 4MA9A 3A5WA 3F9UA 3L78A 4ECCA 5EY6A 1O8WA 1U88A 3J7Yb 3D21A 5E59A 4GRFA 1TK5B 1SKWB 1K3LA 3LJRA 5C00A 3GMFA 2AYTA 3G7YA 1RW1A 2P31A 4O92A 2I9HA 3ZYWA 1NSWA 4GSTA 3DXBA 3DYRA 2JSZA 4QQ7A 2H19A 4OCEA 5ECSA 4ML6A 4ISDA 2P5RA 2B3SA 4IVFA 5GZZB 3GX8A 4X43A 3LGCA 1PKWA 2H72A 1A2MA 3C7MA 1J08A 3HHVA 1UC7A 3GA4A 2YWIA 1EGRA 2VCXA 3KIJA 4MJEA 2DJKA 5IMCA 3O3TA 1UVZA 2R37A 5F05A 3TDGA 1WMJA 4I5QA 2HI7A 4XRDA 4I6XA 2OE0A 2LTKA 3TUEA 2B7KA 4WR5A 1EOGA 4HDEA 3HJPA 4ID0A 4KDUA 1XVQA 4DSQA 3ZTLA 2EIQA 3WD6A 3J7Yk 2GT6A 1B4QA 3QPMA 3ZMKA 5AISA 2YNXA 4KB3A 1GSYA 1JZOA 4OWYA 3GURA 3K8NA 2CVBA 5FWGA 4AJ6A 1MDJA 5L71A 3QCPA 1JFUA 1XCCA 2AV4A 2L5OA 1BQ7A 3LEFA 3TJBA 4P3YB 3NIVA 5IPGA 4POKA 5DCHA 4HJMA 5G2ZA 1GSQA 4EF0A 4IP6A 2YV7A 3EMXA 1Z6MA 3APSA 3MAKA 3WYWA 1PKZA 1AIUA 2LV3A 1A2LA 2DBCA 5LNKe 2RUFA 1SU9A 4N30A 6GSSA 4BVYA 4PNGA 4IGJA 4J2FA 4FYCA 1A0FA 3EWLA 2OE1A 1B9XC 2KP1A 4HOJA 1V9WA 4NPBA 3IE3A 3F6FA 3F4RA 3TRXA 4E8HA 8GSSA 3NZNA 3CSIA 5ECHB 2CX3A 4QL9A 2C80A 1F37A 1QXHA 3KP8A 4WR4A 1KNGA 3BBYA 1GULA 4L0WA 5CO3A 1RQMA 4O32A 2HT9A 1FG4A 3FK8A 4HS1A 5COHA 1QQ2A 4K6XA 2AHEA 4PQHA 2VO4A 4KAEA 2LRTA 3GYKA 2VAFA 4WXTA 5AGYA 5HFIA 1QFNA 1K0DA 3R2QA 1SJZA 4LLRA 2L57A 4MJBA 1IYHA 3D4MA 1B9YC 2L6DA 1K0AA 3RHCA 5CRGA 3CTFA 4PUAA 4F9ZA 2YWOA 3D4TA 2DJ1A 1SJ6A 5JWRB 4MDCA 4F0BA 5GAND 22GSA 4GCIA 1UN2A 1PD21 5IMDA 3UARA 2VD1A 4TXVA 3UL3A 4KE3A 2GSSA 2DIYA 2KUCA 2FGXA 2VIMA 2L6CA 4IKHA 1XWGA 3CSHA 5ECQB 5IPHA 16GSA 2N5BA 3CTGA 2GVPA 2LJKA 3I6AA 1YQ1A 3SBCA 4K9ZA 4PGTA 3TRPA 3F63A 4EC0A 1YY7A 1GTBA 2DC5A 1BJXA 1GP1A 2PWJA 2YOIA 2LJRA 3DIEA 4HJ2A 3DD3A 1H75A 2V32A 2CT6A 3PH9A 4BVXA 1Z6NA 4RUVA 1GTIA 3VI7A 3APQA 4MK3A 2GSTA 2WJUA 5J5NA 4MZWA 4XS4A 4V2MA 2C8UA 5GSSA 5HFGA 1OE8A 4FIWA 5ENUA 4BA7A 1SKRB 3RHBA 3GKXA 3P7XA 2H1BA 2JU5A 1GSFA 1JZRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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