5HR0A

Crystal structure of thioredoxin e101g mutant
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKGFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin
publication title Structural variability of E. coli thioredoxin captured in the crystal structures of single-point mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hr0A00
3GFKA 2CA8A 1QQ2A 4F0CA 1K3YA 3RHBA 4MJCA 4AJ6A 4MJBA 2GDRA 5FHIA 1X5DA 2DC5A 4MZCA 2IJYA 3ZMKA 3L78A 2FWGA 2H1BA 4X1UA 6GSYA 5GAND 4YH2A 5H5SA 5C04A 3HXSA 1GSDA 1UN2A 3FY7A 4EVMA 3F6DA 2IMIA 4N11A 3QAVA 4LL4B 20GSA 4OWYA 2PPTA 1OKTA 3TDGA 1A2MA 1THOA 4OO5A 1K3OA 1ZCPA 5F05A 2O87A 3PINA 3WGXA 4FIWA 2N5AA 1AW9A 2ZUPA 4EUYA 2OADA 1GSUA 4QL7A 3P8WA 1BAYA 3L9UA 5F0GA 1GLQA 4ZBAA 4GXZA 4V1Ag 4LA1A 3ZYWA 3I9V2 4K1FA 4TRXA 3KCMA 2VIMA 1SYXA 4BA7A 4PUFC 4KSOA 1YEPA 1TK5B 1PRXA 4F2IA 1TRUA 3VLNA 4AJ8A 1U3AA 1AAZA 1GLPA 2C8UA 1GWCA 2GSQA 5E59A 4FH8A 1G7EA 1YF1A 4Q5RA 4I6XA 1EV4A 2VCZA 3L9VA 4K6XA 3I43A 3IXRA 5D9VA 4WBJA 1EOHA 1UC7A 1T00A 2VCWA 3MDKA 4MDCA 4OO4A 2YV7A 5A4UA 2YANA 1GH2A 5KN0A 1NW2A 3P2AA 4WBRD 3FR6A 3UMAA 4KE3A 4NMUA 1OYJA 5GZZB 1E6BA 5IM9A 2H6ZA 5EPFA 1XVQA 2PU9C 5J9CA 1XOBA 1MDKA 2D2ZA 4WF5A 4HS1A 5J5NA 4HQZA 2DJ2A 4KH7A 4HI7A 4K8MA 3F4RA 3F9UA 2YZUA 2F51A 2IMFA 3GN3A 4PQ1A 3F0IA 5G5EA 3CSJA 3GV1A 5GSSA 3KIJA 4NWYA 2NDOA 3EINA 3HVXA 2V6OA 2L57A 1EEJA 4N0VA 2KOKA 5DDLA 1PL2A 1B8XA 3VWWA 3GKKA 4HU7A 1X0RA 4TR1B 2OBKA 2YZHA 2DSAA 4WXTA 1SL1B 2VD1A 5AN1A 2CAIA 4I5QA 1F3BA 1ILOA 1EOGA 3QAGA 3KD0A 4RUVA 3DIEA 2MMNA 3Q74A 2B7JA 4KDUA 4FO5A 2OACA 2HZEA 3W6GA 2VL2A 1MD4A 2F8FA 3KH9A 4MZWA 2H1GA 2CX4A 2JADA 1R5PA 1O8WA 2JSYA 1A2JA 6GSXA 4KCEA 3TKPA 4L8EA 5IMZA 1V40A 2B5XA 1I9DA 3F3RA 2AB6A 5C00A 3ZZXA 3CTFA 2MMZA 1FB0A 3UARA 4OCEA 3L4NA 3IPZA 2DJ1A 2H76A 4JE1A 2PVQA 4KX4A 3LSZA 2GLRA 2M72A 3GX8A 4XTSA 1FHEA 3D4TA 4MPGA 3ZFLA 4ECIA 1AQWA 3F4SA 1WPIA 1TI1A 5D96A 2DLXA 2GT5A 3GUSA 2TRCP 1TK8B 3TJJA 3EC3A 5IOWA 3SBCA 4MF6A 3CMIA 4DSSB 3IAM2 4KA0A 1OVNA 1HQOA 1ZYEA 4BWQA 2DJ0A 4JR6A 5LCZA 3J7Yk 2B1LA 1UVZA 1A24A 5J3RA 1T4ZA 3F4TA 2ZNMA 2HT9A 5IQYA 4RQXA 3KP8A 1MD3A 1SD8A 5JWRB 1RK4A 1Z3EA 3Q18A 1ERUA 1Q98A 1F2EA 3A3TA 4TXVA 4IN0A 1AQXA 3IV4A 2PN8A 4DSRA 3FW2A 3UVTA 3BCKA 1WWJA 13GSA 4ID0A 17GSA 5ABRA 3KM6A 4L0WA 2L4CA 5KN1A 2HSYA 3E3EA 4NXIA 3NZNA 2H0IA 2HLSA 1VF3A 3M3MA 3GURA 5G5FA 3EMPA 4MLYA 4ZBDA 5G30A 3M8NA 2WRTA 3D22A 3UEMA 2VCTA 2L5OA 4MJAA 5J41A 2H71A 3HVSA 3DRNA 1WOUA 4JRRA 2MMAA 2LNTA 1OE7A 2FA8A 2AAWA 4XIHA 3MSZA 1M0UA 2VCVA 1HNCA 3P90A 1GTAA 5EVOA 3VI5A 2RM5A 3QMXA 4K7NA 2GZPA 1ZZYA 3KMOA 4LLRA 1S3CA 3PR8A 4POKA 3ERWA 2AV4A 1M9AA 3VWVA 3LEFA 3EVIA 16GSA 1GULA 1W89A 3TKSE 1EZKA 2VL2C 5ELGA 1GSEA 3C73A 3GL5A 3ZTLA 1ZOFA 1I5GA 5DQYA 2GQLA 4IELA 2IN3A 4V2NA 2LS5A 1C72A 1Z9HA 2IIYA 5LD0A 1B9YC 1SK2A 1PGTA 2X64A 4IVFA 5ID2B 4IHUA 4YAVA 2WGRA 3SWLA 2AJQB 2IMEA 1USBA 3H93A 2FHEA 2MBSA 2HXKA 4XS4A 5JWQB 1LBKA 1XBSA 1FVJA 1A0RP 2L4QA 3ZVJD 1SK1A 5DJMA 2B5YA 3F63A 4G2EA 3LORA 4ZL7A 1SENA 3P7XA 3LQ7A 1U6TA 1HYUA 3A2XA 1RW1A 3GX0A 1V58A 3IBHA 2MZCA 2J9HA 1QGVA 1V9WA 3HJMA 2VCXA 4O32A 1SJ6A 3KGKA 1EWXA 4GSTA 2VOCA 5B7CA 4MABA 2GZZA 1O73A 2OBIA 3UBKA 4IP1A 3QAWA 1TU7A 2XPEA 3APOA 4JEDA 3O6TA 3ZVJA 1O8XA 5DALA 2I1UA 1M7TA 3GIXA 5FT3A 5DVBA 1ON4A 3KZQA 2YPMA 2A2SA 2LQQA 5D9WA 2P0GA 4GSNA 2YCDA 5IMVA 2GGTA 2LJAA 2LRCA 3RDWA 3LGCA 4K7IA 3RHCA 5KN3A 1NM3A 1TI3A 2WULA 5AIVA 1XW6A 1X9MB 3LYKA 2C3QA 5A5KA 1WJKA 3G7IA 2VL9A 1JZOA 3GSSA 4EKZA 5LNKe 5IPGA 4TVEA 1O81A 2AUVA 3H1NA 1WP0A 3TKRA 2YWMA 5FWGA 1S3AA 3GSTA 2ZCTA 4G19A 3TCOA 4GSSA 2H75A 4POBA 5HR0A 5D9TA 1GUHA 4Q5QA 3O76A 1X9WB 1V57A 1XWBA 1YJ6A 4JBBA 3TOTA 2F3MA 3U6VA 3LG6A 4QQ7A 5E4WA 2B6MA 4NAXA 3EWLA 2H0HA 1XWAA 3FYGA 1TP9A 3EU3A 4NPBA 3IOSA 1H4OA 3D21A 4I8BA 3FZ5A 1GUMA 1UA5A 4GQFA 2KLXA 2FCHA 3CSHA 3EMXA 2IMDA 1B4PA 3CRTA 5IMFA 4EXJA 2FA4A 4EDYA 4F0BA 4NV2A 3CBUA 1SKRB 2L6CA 2M80A 1AC1A 1YKCA 3R2QA 1N8JA 4HJMA 4ZL9A 1M99A 2F9SA 2H0GA 2RUFA 3HD5A 2OJLA 2VLTA 4IJIA 1PKZA 4J57E 12GSA 4FYUA 2DMLA 1TK0B 4ML6A 3TJGA 4LMWA 2O8VB 3WGDA 1XOAA 4TXOB 3DEXA 5GSTA 2C0GA 4ILFA 4CDOA 2KP2A 5EL8A 3BJ5A 4GQCA 3L0HA 4TOPA 2HI7A 2GT6A 3TRXA 1GRXA 1YDKA 4YQUA 1J08A 4WKWA 4IW9A 2P5RA 4O92A 3FEUA 3QD9A 4XS4B 4EL1A 2RUEA 1X9SB 1JZRA 2LNSA 4KCAA 1OAZA 4O5RA 2HYXA 2N5BA 3W8JA 1DE2A 3M1GA 2X99A 5DAKA 4XCSA 3QR6A 1ZMAA 3IC4A 2HZFA 5F06A 2XC2A 1EGOA 3HZ4A 3GKMA 1O7UA 4OFMA 1XIYA 5HR3A 1PX6A 4HU9A 3DD3A 4MH2A 3VPTA 1ABAA 3RPPA 1V98A 3ZFBA 2QKEA 2EIQA 4GCIA 2JU5A 1TRSA 3J7Yb 4MCUA 5IO2A 3ISOA 4YAPA 4RI6A 4ZBBA 5J4UA 2C80A 1KTEA 1YKAA 2B1KA 4XS1A 5J9BA 1SKWB 1PKWA 4PGTA 2BMXA 1QFNA 2YWNA 1ACVA 1KEBA 2IFQA 3IRAA 5COHA 3GRXA 1J0FA 4KUNA 1SU9A 2ON7A 19GSA 2X8GA 3DVWA 2IL3A 3KXOA 3M9KA 5B8AA 1RQMA 1BG5A 2R3XA 3UBLA 5ECRB 1T4YA 1K0DA 3HZ8A 1GSSA 2E7PA 2RIIA 4ZB9A 2HNLA 2F8AA 2VCQA 3FHKA 3F8UA 4K0NA 4L0UA 2X8CA 4ZL8A 3GKNA 3LXTA 3D0ZA 2Z9SA 2QGVA 3VFIA 3HKRA 3RAZA 4CHSA 1KNGA 4DEJA 2YJ7A 1YY7A 2IMKA 5IOXA 4XS6A 1Z7RA 3TOUA 1DE1A 1OC8A 3IA1A 1K3LA 5B8BA 2LJRA 4PQHA 3E9JB 2VUPA 2GQMA 1F9MA 1GP1A 2LUSA 3DGQA 3CTGA 4H86A 1BX9A 3FKFA 4IJ3A 3IE3A 1JFUA 1A2LA 1FB6A 2R37A 2WB9A 5CYYA 2N5FA 2H72A 3TKSA 4ZB8A 3LJRA 3GYKA 6GSTA 1HD2A 2YN1A 3DYRA 3EE2A 4I97A 5AIXA 3AY8A 5CNWA 4NHZA 14GSA 3BD2A 1T8EB 2GSSA 2B3SA 3HYPA 2DJJA 1Z6NA 4MP4A 4X43A 3KEBA 1DBYA 1F6MC 3A5WA 5KEJA 3IK9A 2GSTA 3TKQA 3ZREA 2EIRA 3ME7A 3N9JA 1K0AA 2OA7A 1PL1A 3GKXA 3L9SA 4ECJA 8GSSA 4OFTA 3TUEA 1SD9A 1YEXA 1W4VA 2H70A 4Z7XA 1JLVA 3PGTA 2JSZA 5ECKB 1Q4JA 6GSSA 3DVXA 3DMLA 3APQA 3CXGA 4HJ2A 3G7JA 4JU5A 2JZTA 2CZ2A 2KP1A 3GMFA 4N0ZA 3LFLA 2VD0A 4EO3A 4TR0A 3G9BA 5DQSA 2O89A 3KMNA 3D6IA 1XZOA 2VLUA 3N5OA 2OKAA 2WZ9A 3D5JA 2PWJA 3ZRDA 2J23A 4HUAA 2C4JA 4Q5NA 1SYRA 4AGSA 4NHWA 1B4QA 5IMAA 5DAKB 1EEMA 2P31A 4HQSA 4OCFA 4POMA 5CRDA 2K9FA 1PQNA 2VAFA 3A2WA 2PVOC 1PX7A 3CSIA 11GSA 3O3TA 5A4VA 1Z5YE 5CRGA 1NHYA 2BTOT 2WCIA 2H66A 2G0FA 2NPBA 3H4KA 2K6VA 1HNAA 3G7YA 2GS3A 1AUCA 1K0BA 3FRCA 2C3NA 2V32A 4FYBA 5GAPD 5ECQB 3HCZA 4LL1B 1EV9A 1K0MA 2YV9A 3DKSA 3Q6OA 3TJBA 2XBIA 3VWUA 1Z7PA 1TRVA 2KUCA 2HZEB 4IGJA 2IWTA 3RBTA 1FOVA 2IFQB 1S3DA 3GTUA 1GSFA 2TRXA 4Q5FA 2AYTA 2MBTA 1OE8A 5ECOB 4N10A 1Y25A 7GSSA 2CV4A 1YZXA 3VI7A 5HQPA 1KBNA 5INYA 3PH9A 4ULXA 2OE1A 5CAXA 2NVLA 1XPVA 4EF0A 3W8SA 2FLSA 1BQ7A 1G6YA 2NBSA 3IDVA 2M46A 2L6DA 1OC9A 4F82A 1AIUA 3K8NA 4XHMA 1EP8A 4TW5A 4MF7A 2I9HA 1XW5A 2X8HA 5ECIB 1PSQA 2XPDA 3C7MA 3TJKA 2CAQA 5IMDA 2HFDA 5A4WA 2H19A 4EC0A 1K0NA 4HOJA 5DCGA 2RM6A 4AF2A 1V2AA 3C8EA 5ELAA 2DMMA 1TU8A 3US3A 4IBPA 2B7KA 2R5GA 2R2JA 3IAS2 18GSA 3FK8A 3I6AA 4FYCA 5CRWA 4TR4A 4BPYA 1BEDA 1TDIA 1K0CA 1M2BA 3IHQA 1H75A 4D73A 3NOFA 1VRSD 3MAKA 2PGTA 3F3QA 3LYPA 3FZ4A 1JZDA 1GTUA 2FWEA 2IPAA 1NHOA 1GTIA 4KB3A 2QC7A 4RQRA 2FGXA 4YQMA 4MA9A 5JCUA 1IYHA 1R5AA 4BVXA 4KDYA 2PBJA 4KW6A 5CRHA 3KTBA 4DSSA 4KDXA 1SJIA 2K8VA 4PX1A 3MWHA 4K9ZA 2HRNA 2LQOA 2O85A 3GNJA 2WS2A 3QFAC 3TJFA 3QOUA 5G31A 5ECHB 3FR9A 4WEYA 1GUKA 1CQGA 4MK3A 2CX3A 4K2DA 3M9JA 1Z6MA 1THXA 4TKYA 3U5RE 2H1AA 4I2UA 3GA4A 4TN8A 3KTLA 9GSSA 4WETA 3MNGA 1QUWA 1SK0A 5D8IA 1FG4A 1BJXA 1T1VA 2YWOA 3WT1A 1O6JA 4OFNA 3UJ1A 1QMVA 2JZSA 4QL9A 1LU4A 3BCIA 2E0QA 4WR5A 5F07A 1WIKA 2YJHA 3D4MA 4ZB6A 1O85A 1TW9A 4X0XA 3ZLPA 2V2GA 1B48A 3C71A 3H8QA 4GLTA 4DVCA 2LJKA 4KNDA 3CYNA 1PA3A 1OKDA 2V6KA 1GTBA 1R4WA 5ECNB 5D93A 2H1DA 2CQ9A 3FR3A 4MZBA 1JZWA 2I4AA 2O7KA 2VM1A 3ERGA 4GWRA 5ECLB 3Q19A 5G1LA 1XXUA 1XWKA 1XW9A 3F6FA 4EE0A 2GTUA 4ACSA 4G10A 3GL3A 5IIZA 5IMCA 4V1Ap 2GQKA 3GTUB 3GHAA 4WR4A 2R6KA 2H6YA 3BOAA 1Y6EA 4PNFA 5ECSA 1JLWA 4HZ4A 3ERFA 4BVYA 3WGEA 4G9HA 1X5EA 2HRFA 2YOIA 1EP7A 2LKUA 2VO4A 2H6XA 3VPQA 3LXZA 2R4VA 2H01A 5DALB 3UVHA 1DUGA 1GSYA 5G1KA 4E8EA 4CW9A 1OC9B 5ID2A 2E2MA 3HY2A 4N30A 2FWFA 4JZQA 3DWVA 1XFLA 4IQAA 3HA9A 1FO5A 2C3TA 2ES7A 2LRTA 1GNEA 3TB2A 3VK9A 2PERA 4DSQA 4MMMA 5CREA 1X5CA 2AHEA 3M0FA 2I81A 1SL2B 1R26A 4HEA2 1GSQA 1SJZA 4PQIA 1U88A 1WE0A 2FNOA 3HJOA 5ENUA 3I69A 3APSA 3TRPA 1LJRA 1TTZA 3FZ9A 2LV3A 4J56E 5JCWA 4F9ZA 5HR1A 1R7HA 3HDCA 5HFKA 2OE3A 4D73B 3ZIJA 4IQ1A 1VF2A 2PUKC 4EDZA 1FAAA 3A2VA 1A23A 3WYWA 3RPNA 1G7OA 4XRAA 3V1WA 4J2FA 1ZL9A 2ON5A 5KN2A 1TRWA 2GSRA 2H74A 2TIRA 2REMA 4BWSA 3ME8A 3OR5A 1AQVA 2FUG2 4IS0A 4MF5A 1ML6A 1YQ1A 5B6NA 3C1SA 5AGYA 1URMA 2YP6A 1G6WA 4GF0A 1OC3A 3ZL5A 2RLIA 1XWCA 5HFIA 4L5OA 1ERVA 1B9XC 2C0FA 4E8HA 2E2GA 1IYIA 5D73A 3EU4A 4OMVA 2OE0A 2H73A 2I3YA 5D9XA 2GZYA 1XWGA 2HE3A 2CT6A 1SL0B 1WMJA 3JCML 3QFBC 3GH6A 4AJ7A 3QCPA 3VWXA 4P3YB 2DJ3A 4I2TA 1VGLA 3H79A 4KGIA 2L59A 2LRNA 2DIYA 6GSWA 4ECBA 4WF4A 1VF1A 1T3BA 2XBQA 1MDJA 5B6MA 1ST9A 2B5EA 1PN9A 5CO3A 2GVPA 1DSBA 4XRDA 1K0OA 3C1RA 2WFCA 2WDUA 2C0EA 4ZXGA 3TGZA 2HSHA 22GSA 3IR4A 5EY6A 4ZILA 2FWHA 4TR3A 4V2LA 6GSUA 3HJPA 1SKSB 4K7OA 2YWIA 3ZMLA 1PD21 5AISA 4V2MA 1QXHA 1AXDA 1MDIA 2L5LA 2LTKA 2V41A 1FW1A 5DBQA 1F37A 1J9BA 3ED3A 3EYTA 3FZAA 1TOFA 3E0UA 10GSA 4PUAA 1G0TA 3GH9A 5CP1A 3KJYA 1QK8A 4GRFA 1ZYQB 1MEKA 4MPFA 5G2ZA 3WT2A 1NSWA 1A0FA 4PURA 2QSIA 3NIVA 4HDEA 4YQVA 4LMVA 4ECCA 2ALBA 6GSVA 4TXOA 2EIOA 2DIZA 3DXBA 2MMOA 2H30A 1WRYA 2DBCA 4ML1A 1U87A 2CVDA 4PNGA 1ZGNA 1XVWA 4L5LA 2JACA 2WJUA 1M9BA 5ECPB 1A8LA 3ZITA 1E2YA 4F03A 1ERTA 2P5QA 3QDNA 2VL3A 5HFGA 4PXOA 1YF0A 5H5RA 1PMTA 1M2DA 2A4VA 5IPHA 1TKDB 4RI7A 2KHPA 3UOMA 3TRQA 3LWAA 2G2QA 1XCCA 2CVBA 3TKSC 4NV5A 2EC4A 3HHVA 1MTCA 2C1YA 1TXXA 3BBYA 2K18A 3HVVA 5DCHA 3UAPA 2CVKA 2LEGA 3ZIVA 5HR2A 1M2AA 2C0DA 3KH7A 1GL8A 1U3IA 5DJLA 2JZRA 3QPMA 2BJXA 2VM2A 5ECMB 2LSTA 3WD6A 2K8SA 2V1MA 2DJKA 1TJDA 4GTUA 5JCGA 4ZIJA 1A8YA 3KP9A 3UIWA 4TR1A 5L71A 4BL7A 4K0GA 1ERWA 1VF4A 1F3AA 2JL4A 1JHBA 1T7PB 4JR4A 2H8LA 1HNBA 4KSMA 4HZ2A 2FY6A 2XHFA 2A2RA 3S9FA 5JWOB 3IK7A 2VLVA 4O7HA 1FVKA 3VURA 5F8BA 5IO0A 1GNWA 2PMTA 4MH3A 1N2AA 4POLA 5H5QA 2MYGA 1BYEA 4IP6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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